3TELA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and manganese ion
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPADAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule keywords Cps2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
total genus 129
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3telA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3telA01
3K1PA 3OEKA 1M5EA 4GQOA 3PPNA 1H45A 1VSOA 3CFZA 4YICA 4U1OA 4OYVA 3B7DA 1JW5A 2VHAA 2UVIA 1B51A 3IAZA 2XXIA 3JV9A 2YLNA 3IO4A 1NFTA 4RXLA 3I5OA 4GD5A 3EPEA 3PUXE 2O84X 1P99A 2GHBA 3FV2A 1IXCA 4F2OA 3KN7A 2Q8JA 1TT1A 3M8UA 5FTHA 3C36A 4NEDA 1UTHA 1JW1A 4ONYA 3O28A 4GLIA 4RPOA 4NF4B 3DLNA 1ZMGA 1B5JA 5I58A 3TTNA 3OEMA 4I9DA 1PEBA 2Z8FA 2HFBA 5KZTA 2DWAA 4ISUA 3DP4A 1LFGA 1MY2A 1IITA 1H44A 3TAJA 3UORA 2REJA 4DXBA 2XXWA 2RCBA 3VLUA 2REGA 4OEUA 4E0XA 3KSJA 1R9LA 1A40A 4FECA 3OWQA 3BKIB 2R71A 1FCKA 4C0RA 2RCAA 4JWOA 3RT6B 5I56B 1L5TA 4P0GA 4ZS9A 1BTJA 3UK4A 3E13X 3FATA 1CB6A 1OVTA 2D21A 2ONSA 3W15C 4XKRA 3TCFA 3FASA 4YAHX 2HZKA 4LUBA 2I49A 4FEBA 3R26A 4QFLA 3T66A 3SETA 1WDNA 4OERA 5TPAB 4F3SA 2G93A 5FHOA 1SYHA 2XD2A 3U8QA 2CMOA 1N3WA 3H03A 4R9GA 1JVXA 2V84A 2V3QA 1MH4A 2M8CA 1AMFA 1ZJLA 4WEPA 2O1MA 4K3FA 1DTZA 4IO4A 2DWHA 2PBWA 1Z7NE 4YB7A 2XX7A 1YPNA 4IO5A 1OMPA 3PUWE 1N7XA 5KCJB 1N0TA 4MH5A 1FTLA 5BWJA 2F7BA 4IGRA 2P0SA 1XVYA 2Q89A 4KPTA 3W9WA 3CFXA 1EZPA 1B05A 3IOWA 4OMBA 3RLFE 3TQLA 4Q0CA 3VVEA 1OLCA 1DOTA 4OWDA 4IO6A 1M5DA 4RNSA 4ELQA 3E9XA 4KYEA 4MLQA 3JZJA 5HM4B 1MPDA 4PFTA 3KJTA 1M5CA 2UYFA 3KSXA 5CMBA 4X9TA 1MY3A 3HV1A 4KD5A 2UXAA 4GXAA 3G3JA 4QSDA 1MXUA 3KFMA 3VV5A 3OMBA 4F31B 4QSCA 3FZVA 4R6HA 1Y1ZA 1B0HA 3SEUA 3FV1A 2YPNA 3SDFA 3RPWA 3HPIA 1LCFA 1B5HA 3LSFB 1D4NA 4ESXA 1FQBA 1XS5A 4R6YA 1A8EA 3KOSA 5I2KB 4BLAA 4JWYA 3I6VA 2XD3A 2OK2A 4IY6A 1SI1A 4AQ4A 3TCHA 1O7TA 4NF4A 4Z7EA 2XX8A 1SVXB 4DE8A 1QKAA 3TMGA 1N7WA 4TLMB 4OENA 3NROA 1MXYA 3GBAA 3U72A 1B1HA 4WKMA 1MQDA 5ISUA 3MC2A 1NKXA 1B58A 3B6TA 3Q25A 2IA4A 3TQWA 3O9PA 1WVJA 2VGQA 5I57B 1LB8A 4XKQA 1AOVA 3Q28A 2GHAA 2XXPA 3T9HB 3E4RA 3NXHA 3S9LC 2B3FA 3TYHA 1AL3A 1J1NA 4OHNA 1MQHA 3V5AA 1MY0A 1PDAA 3KBRA 4NTLA 2Y7RA 1D9VA 4R2FA 3IB2A 3PUYE 4YKPA 1B6HA 5TPAA 1XOCA 3Q27A 3IOVA 2F8DA 1OIBA 1TFDA 1IXIA 4PFUA 3EHSA 5L9SA 1N84A 4H8JA 2UVGA 4JWXA 4RY1A 5L9MA 1GGGA 4ZE9A 5I84A 1AIVA 4JDFA 1JNFA 1MXXA 1Y3NA 3EHTA 3DELB 4ELRA 5KCJA 1OVBA 3MZ1A 2H25A 4GL8A 4JSOA 3LSXA 3M3FA 1USYE 1TXFA 4O3CA 5I59B 4G68C 4OZ9A 1JEUA 4U22A 2I3WA 3K02A 2FYIA 1XC1A 5DYHA 4EQBA 1OQHA 5ICTA 2F5XA 3N94A 1B3GA 3KGCA 1EU8A 1Z7ME 1P1NA 1BP5A 2ONRA 3PPRA 4GRKA 1DTGA 1VR5A 4FEDA 4LZ5A 5AA4B 3QYTA 5H8NB 1JW4A 4YKIA 3TTMA 1GV8A 5FHMA 1QULA 4U4XA 3JYRA 5EYFA 2ZMBA 3QFIA 4IO3A 4PP0A 4BDMA 2ZNSA 2A5SA 1PBPA 1LGBC 4YB6A 3MWBA 3KJ7A 4QFNA 4Z0IA 1A54A 4GVOA 1NL5A 4U21A 3RQTA 5I2KA 3TTKA 4ESWA 3IR1A 2AL4A 4DZ1A 3OKZA 2R9JA 2HAUA 3RUMA 1FQAA 3MP6A 2NWJA 2CZLA 2DYXA 2F78A 4LA9A 4QFKA 5L9OA 3VLWA 1D3KA 1SQYA 2DVZA 5HBCA 4DCYA 3R6UA 4OXVA 2O68A 1JVYA 3FXRA 1NMUA 3WAFA 4YKKA 4R74A 5CRYA 1BLFA 1NH7A 1UTBB 3CR9A 3S9EA 1POY1 4QRZA 1XHYA 4WXJA 3UP9A 5TU0A 1H3DA 5I2NB 1FTMA 1HSJA 4M1VA 4R9FA 1B7HA 4L17A 4DE9A 3BBRA 3N6UA 2QPQA 5K2XA 4THIA 2Y7PA 4G2ZA 3T9XB 4F39A 3IO6A 4FIMA 2UVHA 5J1DA 1MPCA 4NWCA 3VXCA 2D3IA 2F7CA 3FVGA 3QXMA 4ZZAA 4HCYA 3KN8A 3W9VA 3PMWA 3N6TA 1S7YA 4FATA 4MF3A 3PMVA 1CE2A 4KYSA 3LUYA 1LLSA 1NNTA 3KG2A 3K4UA 3QUFA 1FQFA 4ZECA 4UACA 4YMBA 3PGFA 1ZIUA 4YU0A 4DIGA 3H7MA 3LSLA 3TZAA 4FE8A 2Q88A 2O69A 4HCWA 2XXQA 4RJZA 5CMCA 3H06B 3UA8A 1RYOA 2AL5A 3OO9A 1SYIA 1DMBA 4G77A 1Y3QA 1LFHA 1LAFE 1PB7A 5AE4A 5CMMA 4KFQA 2VD2A 4OESA 4G8HA 4QF9A 1B2HA 1A55A 2RINA 2I48A 4KCCA 5AA4A 5FHNA 5H8NA 2OLBA 4Q5TA 3KZGA 3K6UA 1URGA 2RKMA 1SW2A 4DDDA 3FJMA 2Y7KA 3FXUA 3TELA 4OEVA 2P2AA 5CC2A 4TQUQ 4NF5B 3TKDA 3MUQA 2ESNA 5EHSA 3TFLA 1LBCA 2O1LA 2DWJA 5KDTB 1Q35A 5LOMA 2ZYOA 4YB5A 3HO7A 2I4CA 3ODBA 4JXIA 4NF6B 1JEVA 4LP2B 5EHMA 4ND9A 3IX1A 1Y4TA 1US5A 2UYEA 3G3KA 2I0CA 3SEVA 2O51A 4H5GA 2DXYA 1I69A 3K6WA 4NF8B 3G3IA 1HSLA 4MFIA 3MZBA 4E0WA 4EF2A 2F97A 1ZLQA 4Q30B 3P7IA 3IL1B 2QS2A 3DP8A 4F2QA 3HN0A 4H8IA 4ELOA 2Y7IA 5M2VA 3MEJA 3CSBA 4GWOA 2NXOA 4PETA 4DLDA 3R7XA 1MDP1 3IB0A 3RTWB 2XXVA 4C1UA 3O6HA 1FTJA 1UTBA 1LB9A 4R6KA 2V3UA 4KHZE 2XXRA 3B6WA 3PD9A 3C33A 3G3GA 3H4ZA 5TP9B 1DPEA 1GR2A 5I2NA 4IGTA 3VFJA 3MW0A 1A99A 1B5IA 2FA7A 3C31A 3CSGA 4O3AA 3T93B 3THIA 3VVDA 2XXYA 3EQ1A 5DVIA 3SESA 1GTKA 2V3TA 4ZZEA 1A8FA 3GZGA 3BFTA 4YKJA 5AA2D 4POWA 1QKBA 3MJNA 4OFLA 4U2RA 4U23A 1R6ZA 1P1WA 3FUZA 4F3GA 1B9JA 5B70A 4EF1A 1GVCA 3D4CA 4JBZA 3E3KA 1LBBA 3RT8A 3HHGA 3MVZA 4ZEKA 2DS9A 4G4PA 4ZDMA 1QUIA 1MDQA 3FJGA 5CMKA 2I0BA 4OQOA 1MM6A 1XT8A 3T9VA 1VFDA 3SEYA 3IJOB 3T22A 1FQEA 3ZKLA 3KEIA 5I56A 3PD8A 3U93A 2H4IA 3CG1A 5H8QB 2RF1A 4G8MA 2ZXTA 1EZ9A 1Y3PA 2I6EA 1ZU0A 1N04A 2F7AA 4LZ7A 1QJMA 2VD3A 3V8XB 1OLAA 4NMYA 4H67A 1YTVA 1YCJA 4LONB 3U1OA 3O6GA 1VFEA 3K2DA 2Q2AA 4AB6A 3OO8A 1B0LA 1N76A 4PFYA 1MXZA 5CM6A 4EXLA 5I58B 2NOOA 4QFOA 2YJPA 1SW4A 4BDNA 4NF5A 1T0KA 2PMSA 1MQIA 4BDLA 2Z8EA 4OBMA 5KDTA 1H76A 1IXGA 4ECFA 1ZBMA 2OWSA 3FIRA 4XXUA 4QFPA 1I6AA 4NF6A 4X1DA 1MQJA 3N26A 1Y9UA 2QRYA 3MP1A 4YMAA 2HCAA 3RTFB 3V89B 5JEIA 1MS7A 1FTOA 4N07A 2GH9A 3MP8A 5DEXB 4OFJA 4BDQA 2F35A 4NF8A 3FD3A 4LQ5A 2ANJA 2B3BA 3KN3A 1LSTA 2PVUA 3A09A 3PE5A 1UQWA 4H0WA 4I8CA 3OO7A 1R9QA 5JK4A 1Y4CA 4R75A 3OSRA 4ZE8A 2KLFA 2UVJA 1B1XA 3RN8A 3IK6B 4C1TA 2QJEA 1B32A 3ONMA 3PPQA 1FTKA 3HHFA 3IJXB 1IUDA 3K6VA 1B40A 5IKBA 3OOAA 3CFLA 5TP9A 2ZYMA 4P11A 5A5XB 1MXVA 2R6GE 4OFOA 4ZEIA 2G29A 4F22A 2H98A 3IB1A 4KCDA 2O7IA 4PQJA 3I3VA 3ECRA 3GLBA 3TDJA 4QHQA 1POTA 4QSEA 2ZYKA 1WODA 1B3FA 3GBBA 2QMXA 3FJ7A 2DE3A 1SW5A 3RNNA 4OTEA 2PT1A 2D5WA 3SEXA 3ILUB 2AYSA 1KWHA 3O2AA 2THIA 3MVYA 1I6BA 4UA8A 4EXKA 4GIZA 4LATA 3H6TA 3K6XA 5ELVA 1XVXA 3G7WA 1B4HA 2HXWA 5I57A 3S9MC 2DVCA 5H8FB 3O6IA 3UGWA 3L6HA 4MLVA 5H8QA 1P1UA 2HAVA 5F7VA 2DE4A 3S4UA 3CI8A 4F1UA 1PB8A 4R73A 1I6QA 1PC3A 1IZ1A 1BIYA 3RY3A 4F1YA 1H43A 4H1XA 4IO7A 1IXHA 1DPPA 1B7ZA 3VE1B 5ITPA 2B65A 3A3CA 1R1NA 4YZZA 1B3LA 3LC8A 2QMWA 1RKMA 4FJPA 4RK9A 4AB5A 4U4SA 4ZEBA 2H9BA 2RC9A 3U94A 4F3BA 5JTYB 3FVOA 5AA3A 3OSQA 2V93A 2GRVA 1MY4A 1NNPA 1B3HA 3A3UA 3USDA 2Z8DA 3HCQA 2IEEA 4P0IA 4M4GA 3G3HA 4RA1A 1SDXA 4X1BA 1FW0A 2X7PA 5H8SA 4DXUA 4BDRA 2BJJX 1FQDA 3L6GA 4GXSB 2X7QA 5I59A 1S9TA 3S2VA 1MY1A 3S9NC 1BKAA 1PB9A 2XX9A 2GFEA 3FXQA 5ITOA 1QVSA 3ZS6A 5DEXA 3UN6A 3G3FA 4XIGQ 4H5FA 5IAIA 3K1NA 2ZYNA 2QS4A 4LQ2A 4I1DA 3FVNA 3TPAA 5L8DA 4F18A 1SI0A 2F6GA 4ZEFA 2LAOA 3H6WA 3Q26A 4PFWA 2OCUA 4F19A 5AA2B 2I58A 4G68B 3BFUA 2OJTA 4RK2A 4POXA 4RYAA 2F36A 1TWYA 3U92A 1P1QA 5AA1A 5CI5A 2W7YA 4DCXA 3O29A 3O66A 3MPLA 2RC7A 2HEUA 1QUJA 4XKPA 5A5XA 1URDA 1USYH 2OZZA 2HZLA 2ZNUA 1II5A 3PMXA 3H3GA 1PBQA 3SEWA 5B7DA 5ICQA 1UIVA 4EQ7A 2DE2A 1O63A 3EHUA 3H6VA 3V83A 3AXFA 5DT6A 4KYDA 3PPOA 5H8HB 3IOUA 3VLVA 3VXBA 1B7UA 1O64A 3PU5A 3LR1A 2XXUA 3C32A 1P1OA 2DXRA 2XXTA 4EDPA 2I3VA 2VP1A 1ATGA 4TLLB 3OENA 3F11A 2PT2A 4H65A 2DWIA 3QAXA 1MXWA 3T96B 2PX1A 5H8FA 1A7LA 1B46A 1MQGA 4BDOA 4I62A 2A5TB 5HPQA 4N13A 1MRPA 2NUVA 1HSEA 2Y7WA 1B52A 2XXHA 4GL0A 4EQ9A 5K2YA 4NWDA 3N5LA 1ZKBA 2AIXA 4U1ZA 1D9YA 3MAMA 2PYYA 4KQPA 3MVWA 3QK6A 3K00A 1AH5A 2VOZA 3TODA 3D4GA 1ELJA 4HS7A 4MBPA 3QIMA 3TTRA 4EUOA 3QSLA 3VDFA 4O3BA 1Q1KA 3WAEA 3CIJA 5JTYA 3OD7A 4ZEDA 1IIWA 3Q29A 3K01A 1YAEA 3EN3A 1DSNA 4KR5A 2RC8A 5DTBA 3SKPA 1JQFA 4N6PA 2Y84A 3ZSFA 2ONKE 3VVFA 1QW0A 3C4MA 3CG3A 2I4BA 1MM7A 3CVGA 1US4A 1LAXA 2E1SA 3C35A 4LVQA 5DVFA 3C9HA 5F1QA 2X26A 3MZ9A 3K0VA 1F9BA 3TCGA 2DOJA 3OO6A 4RPNA 2F6PA 3TEPA 3DP6A 1URSA 3HSTA 3RGYA 4KI0E 2V25A 4OETA 5FTIA 4GF8A 3CRBA 4FORA 1MG1A 3FGSA 1UTHB 2DP8A 3PUVE 1OQGA 1JETA 5AA2A 4LZ8A 2Q9TA 4G68A 1N3XA 3MBPA 3OELA 2P1SA 1ANFA 2QL3A 3T9UA 4DXCA 2OBGA 4Q8RA 1ZTYA 1FQCA 3ILTB 3TUSA 1B4ZA 3TTLA 4HTGA 1Y20A 3MVXA 3QUJA 1EH3A 3H6UA 3KOTA 1MH3A 3PUZE 2QSXA 3IORA 4IO2A 5CBSA 4HW8A 2H5YA 3EF7A 1UIUA 2XHDA 3K1MA 4R2BA 4IB2A 4F29A 4XKNA 2F34A 5H8HA 3FVKA 2QS3A 4IY5A 2O7UA 2QS1A 1LFIA 1SD3A 1LCTA 2WKYA 3SERA 2H99A 3MQ9A 1S50A 1QUKA 1NH8A 4H6DA 4PE5B 5CBRA 2NVUB 3LBSA 4GOTA 2XXXA 2HQ0A 1TFAA 2ZNTA 1SW1A 1NNFA 4FAJA 2Z23A 1RYXA 3UIFA 1MPBA 4G8NA 2ALUA 1EZOA 4ELPA 1LAGE 2DSFA 2A5TA 2DQVA 1VE4A 1M5BA 1IQ7A 3ZKKA 3PV0E 2FNCA 2OWTA 4X48A 4GFRA 3MPKA 1SBPA 4F1VA 3PPPA 2O6AA 4F3PA 3C34A 2Q2CA 3GXAA 1IEJA 3OXNA 4OVJA 4XTCQ 4R72A 3LSWA 2ABHA 4WEDA 3IOTA 4TOZA 3O97A 1Y1MA 1B3EA 1LAHE 2Z22A 2E0SA 5DVJA 3B6QA 3M3KA 4JSDA 3DM0A 4NE4A 1M5FA 5BUUA 3M3LA 1NNKA 4JB7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PUAA 3K1PA 3OEKA 1AU7A 1M5EA 4GQOA 3RYDA 3PPNA 1H45A 2WIUB 1VSOA 3CFZA 4YICA 4U1OA 4OYVA 4MJOA 4JQDA 3B7DA 1JW5A 2VHAA 2BNOA 2UVIA 2XCJA 1B51A 3IAZA 2XXIA 4P9KA 4PTKA 3JV9A 2YLNA 3IO4A 1NFTA 4RXLA 3I5OA 4GD5A 3EPEA 3PUXE 1FPJA 1NV2A 2O84X 1P99A 2GHBA 3FV2A 3IFCA 1LBWA 4GWXA 1CQTA 1IXCA 4F2OA 1PNRA 3KN7A 3TRBA 3DNVB 2Q8JA 3A9YA 1TT1A 3M8UA 5FTHA 3C36A 4NEDA 4MCTA 3UWPA 1UTHA 1JW1A 4ONYA 3O28A 4GLIA 4RPOA 4NF4B 3DLNA 2BJCA 4ER5A 1ZMGA 1B5JA 5I58A 3TTNA 3OEMA 4I9DA 4J1XA 1PEBA 2Z8FA 4OANA 2HFBA 5KZTA 2J7WA 2DWAA 4ISUA 3DP4A 4NAPA 1LFGA 1MY2A 1IITA 3ME5A 1H44A 3TAJA 3UORA 2REJA 1NV1A 4DXBA 2XXWA 3G7DA 2RCBA 4FN3A 2REGA 4OEUA 3VLUA 1DK4A 4E0XA 3KSJA 1FPGA 1R9LA 1A40A 4FECA 3GZDC 3OWQA 3BKIB 2R71A 1FCKA 2PXPA 4C0RA 2RCAA 4JWOA 3RT6B 5EYGA 1L5TA 5I56B 4P0GA 1FBGA 1OSLA 4X4EA 1JFSA 4ZS9A 1BTJA 3OQMA 3UK4A 3LUZA 3E13X 3FATA 4PFIA 1CB6A 1OVTA 2D21A 2ONSA 3W15C 4XKRA 3TCFA 3FASA 2GQ1A 4YAHX 1RPEL 2HZKA 2WEFA 4LUBA 2I49A 2OFYA 4PFRA 4GX6A 2WUSR 4FEBA 3R26A 4QFLA 3T66A 5ET5A 3SETA 1WDNA 4OERA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NNF A;  4FAJ A;  2Z23 A;  1RYX A;  3UIF A;  1MPB A;  4G8N A;  2ALU A;  1EZO A;  4ELP A;  1LAG E;  2DSF A;  2A5T A;  2DQV A;  1VE4 A;  1M5B A;  1IQ7 A;  3ZKK A;  3PV0 E;  2FNC A;  2OWT A;  4X48 A;  4GFR A;  3MPK A;  1SBP A;  4F1V A;  3PPP A;  2O6A A;  4F3P A;  3C34 A;  2Q2C A;  3GXA A;  1IEJ A;  3OXN A;  4OVJ A;  4XTC Q;  4R72 A;  3LSW A;  2ABH A;  4WED A;  3IOT A;  4TOZ A;  3O97 A;  1Y1M A;  1B3E A;  1LAH E;  2Z22 A;  2E0S A;  5DVJ A;  3B6Q A;  3M3K A;  4JSD A;  3DM0 A;  4NE4 A;  1M5F A;  5BUU A;  3M3L A;  1NNK A;  4JB7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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