3TELA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and manganese ion
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPADAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule keywords Cps2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
total genus 129
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3telA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3telA01
2Z8FA 4IO5A 3RGYA 5KDTA 1IUDA 3QK6A 1MXXA 4ZDMA 5B70A 3OXNA 4RY1A 5ISUA 3T96B 5AE4A 3DLNA 1CE2A 2THIA 4EQ7A 1TFAA 1FQFA 1US5A 2HAVA 4F1YA 1YCJA 4N07A 4POXA 3PUZE 4DLDA 2DVCA 3VFJA 4KYEA 3TMGA 3TAJA 3HHFA 1R9LA 4POWA 3IR1A 1IXCA 3D4GA 3V5AA 1A8FA 2ONSA 1EZOA 4MBPA 4UA8A 4R75A 1Q1KA 2RCAA 1P1QA 3SESA 3UK4A 1RYXA 3MQ9A 4RXLA 4H8IA 1MM7A 3U94A 2HXWA 3S9NC 4WKMA 3TFLA 4F31B 1B4HA 2H25A 3GBAA 3KFMA 3M8UA 4JSOA 3A3CA 4KHZE 1ZBMA 3PPOA 3C34A 3Q27A 3F11A 3OKZA 1P1OA 1Y3NA 2ZXTA 4NF6B 3K0VA 2NOOA 3M3LA 4PQJA 3S2VA 1OQHA 3BFUA 1NL5A 1ZJLA 3PGFA 1FTLA 1SYIA 2UVGA 3FV1A 4DCYA 1Z7ME 3I3VA 2OBGA 3WAFA 4QFNA 1AMFA 3PPRA 1L5TA 5JEIA 3KJTA 2H99A 4GFRA 4OFJA 5J1DA 1DTGA 3E13X 2Z23A 4FE8A 4ESWA 4EQBA 3SKPA 1LGBC 3FJMA 3IOWA 3T9HB 3EHSA 3VXBA 4U22A 2H5YA 2XXTA 5DVIA 2UXAA 1NNPA 1QUIA 5TPAB 3MWBA 1A8EA 1P1UA 3FUZA 4KFQA 4P0IA 4PFUA 1Y4TA 1D4NA 4O3BA 4Z0IA 4YKJA 3BKIB 3RTFB 3AXFA 2O51A 1VFEA 3DELB 3KZGA 4XIGQ 3RPWA 4Q5TA 4H1XA 3IJXB 4G8MA 1URDA 3QIMA 1ELJA 1N04A 4BDQA 4QFKA 1NKXA 3M3FA 3U72A 5I2KA 2ZYKA 1IZ1A 3CIJA 4U23A 1OIBA 2I4CA 4YZZA 2GFEA 1MQDA 2V25A 4MF3A 4Q30B 3THIA 4K3FA 3UGWA 2PVUA 4M4GA 4BLAA 5IAIA 5CM6A 1OVTA 3FGSA 4H5GA 3TTKA 4GVOA 5JTYA 3FXQA 4ELPA 2PT2A 3TPAA 3QSLA 4R6KA 3G3KA 4F3GA 3K4UA 4HCYA 1XHYA 3V8XB 4LZ7A 3TELA 4RNSA 2RCBA 1MY2A 2VP1A 3K2DA 1IXIA 2ABHA 5TP9A 3EF7A 4YKPA 1NNTA 3Q25A 4OESA 5CMKA 2CZLA 2F35A 3JYRA 4OETA 5H8QB 3EQ1A 2Q2AA 3FASA 2WKYA 1Y4CA 4F1UA 2FA7A 5HM4B 1B7ZA 1JVXA 2F6GA 1LAFE 1TT1A 5L9OA 4ZZAA 3FVKA 3O28A 3RN8A 3G3FA 1YTVA 4XTCQ 5DVJA 2F78A 1ANFA 3ZSFA 3T93B 1OLCA 4XXUA 5I2KB 2Y7WA 4QFLA 2DYXA 3A3UA 3TCGA 4DXBA 1WVJA 3OEMA 5H8HB 5I59B 1B7HA 2XXHA 3IK6B 3K6XA 2O68A 3VLUA 1JEUA 4OWDA 4YU0A 4LZ8A 1NNFA 5CMMA 4AB5A 4U1ZA 5JTYB 3PU5A 5BWJA 1Y9UA 3LSLA 4ZE9A 4GXSB 1SW2A 3G3JA 4RPOA 1SQYA 2ESNA 3HN0A 3TZAA 3VE1B 3H7MA 2X26A 1LBBA 4PFTA 4ZE8A 1F9BA 4OVJA 4TQUQ 1PB9A 3S9MC 1O7TA 1MPDA 1B46A 2F7CA 5TP9B 3OSQA 2F8DA 1SW5A 2QS3A 3OSRA 2F7AA 2NUVA 4KQPA 2I48A 2REGA 3HSTA 2ZNSA 3MBPA 1NNKA 1B3HA 3MP6A 1ZMGA 3TTLA 3MP8A 1USYH 3TEPA 1S9TA 3OO8A 2PMSA 3D4CA 4IO3A 2Z8EA 2GH9A 1UIUA 5AA4B 5I2NA 2P1SA 4F18A 2R9JA 3PUXE 2ONKE 1Q35A 3TQWA 2QL3A 1XC1A 3LR1A 1FQAA 1ZU0A 2R6GE 1MY4A 5ICTA 2XX8A 1QKBA 5I56B 4ZEBA 4R6HA 3CFLA 3KJ7A 3PUYE 3Q28A 3QFIA 5I58B 3KGCA 4GXAA 2DWAA 4NTLA 3MVZA 3O6HA 3RT8A 3C33A 1LBCA 4PE5B 3LC8A 1N0TA 1MH4A 4RK9A 4I9DA 4QFOA 3FATA 4GIZA 1B0HA 3OMBA 4JBZA 3CFXA 1B1XA 3SEUA 2DS9A 3RQTA 2F34A 2G29A 3PMWA 1SW4A 4L17A 3PPPA 1MM6A 3PD9A 1Y1MA 1MXVA 4EF1A 1LLSA 1H45A 1FW0A 4NF6A 1PB7A 3ONMA 4DZ1A 4ZECA 5I84A 4FORA 5DYHA 3PUVE 4LATA 5ITOA 1S7YA 1NH8A 4GL0A 2ONRA 4LA9A 3IAZA 1IXHA 1NH7A 2DWJA 4NF5B 2E0SA 4LP2B 4KD5A 1SBPA 4OYVA 5FTIA 5I2NB 1PBQA 2Y7RA 3SETA 4G4PA 3K1MA 2XD2A 2V3UA 2XXRA 5CMBA 4WEDA 1H43A 3FXRA 4F1VA 4YICA 1Y3PA 1QUJA 2NWJA 2GHBA 1B7UA 4ZEFA 2QS2A 3MAMA 3OO6A 4ISUA 2D3IA 3O66A 3R6UA 3ZKKA 5TPAA 1NFTA 1POY1 1N76A 2OJTA 1UTBA 3T22A 3ECRA 3U92A 4Z7EA 1ZLQA 3OEKA 4ZEKA 3R7XA 1H76A 3W9VA 3SERA 1OVBA 1POTA 3VXCA 3V89B 1AL3A 2XXXA 1MH3A 3FD3A 3IB0A 3IB1A 1B9JA 1IXGA 3OD7A 2XXIA 5H8FB 2F97A 2DE2A 3ZS6A 4H65A 3O6GA 3UN6A 3G3GA 1N3XA 4WEPA 3IO6A 4OZ9A 5AA3A 2RC7A 4WXJA 1LAXA 3TQLA 1B52A 2ZNTA 4NE4A 4E0WA 3N6UA 4U1OA 3PE5A 3LUYA 4I8CA 4BDRA 4RPNA 2HCAA 4OENA 3N5LA 3CG3A 4OEVA 3TTNA 5F1QA 3DM0A 3TYHA 2I3VA 1WDNA 4EXKA 5FHOA 4G68C 2DSFA 4PFWA 4FIMA 1OLAA 1N7WA 4OFLA 1GTKA 3KN8A 1B4ZA 2XHDA 3K02A 4R72A 3GBBA 2YLNA 3OO9A 3K1NA 3C4MA 3K01A 1UTBB 3MVXA 1URSA 4QSEA 5FHMA 1Z7NE 5H8QA 2PYYA 4LQ2A 1SD3A 4FEDA 2XXWA 2A5SA 4GWOA 5ICQA 4YB5A 4DCXA 4U21A 3MPLA 5FTHA 4DE9A 2OLBA 3R26A 5AA2A 2Z22A 4EQ9A 2QS1A 1B32A 3NXHA 1FTKA 1SI0A 1EZ9A 1AIVA 3MVWA 1VE4A 4N6PA 2H4IA 1TXFA 2XX9A 4HS7A 4QHQA 1M5CA 5H8NA 1BP5A 3H6UA 4X1DA 4RYAA 2F36A 5H8HA 5I59A 4LUBA 3Q29A 2Y7KA 3HV1A 3MW0A 4YMBA 3TCFA 1SYHA 4TLLB 4XKNA 3O2AA 1P1NA 4ZEIA 2DVZA 3O97A 3OOAA 1DPPA 1MQIA 4KCDA 3KSJA 3TKDA 1M5BA 3T9XB 5DEXB 3VLVA 1BKAA 3W15C 1D9YA 1R6ZA 3KEIA 2RF1A 3DP8A 4GLIA 1JW1A 3TUSA 2O1MA 3H06B 4P11A 3EHTA 1I6BA 3K1PA 3DP4A 5CRYA 4FATA 3MZ1A 5A5XB 4ZEDA 2A5TB 2Y7PA 3FXUA 5JK4A 2F7BA 3H6VA 3CRBA 5L9SA 1EZPA 2ZYOA 1USYE 2D21A 2CMOA 2NVUB 5CBRA 1JQFA 3E4RA 3H4ZA 3FZVA 2DP8A 1LSTA 4OBMA 5AA2B 4C1TA 3S9EA 4ECFA 2O7UA 3TDJA 3QUJA 1JW4A 5AA4A 3B6QA 1GVCA 2Q8JA 3IX1A 5H8NB 2QPQA 2AYSA 4R2FA 2QSXA 2DE4A 3O9PA 1B5JA 1D3KA 3L6HA 4JDFA 5I56A 5EHSA 4TOZA 3GXAA 1FQBA 2HAUA 4GL8A 2V93A 5I58A 1MY3A 1AOVA 2IA4A 2AL4A 2F5XA 3JV9A 2AIXA 1CB6A 3IORA 4GD5A 4AB6A 1MRPA 2R71A 1PEBA 4IO7A 1YPNA 4F22A 3BBRA 4AQ4A 2QRYA 1B05A 4X9TA 1PB8A 1WODA 4UACA 2V3TA 4NF8B 2UYEA 2OCUA 3LSFB 4FECA 1I69A 4PETA 3KG2A 2I58A 3KN3A 1Y20A 2V3QA 3USDA 4QSCA 4OMBA 3SDFA 1LB9A 5CMCA 2HZLA 3TCHA 3KSXA 4R9FA 1JNFA 1VFDA 2DWIA 4IO6A 3CVGA 3K6UA 1FQDA 4OEUA 4JWYA 4U4XA 2QMXA 2YJPA 3V83A 2UVIA 2RKMA 2X7PA 1UTHA 4H0WA 1HSLA 4R73A 4LONB 2ZMBA 4NF5A 3QAXA 5KCJA 3FJ7A 4F3BA 4FAJA 2I0BA 2LAOA 4XKQA 4ZS9A 1XS5A 4YB7A 3BFTA 4JWXA 4THIA 3KOTA 3MPKA 3MVYA 3CSBA 3O29A 3O6IA 4IO4A 4KI0E 2KLFA 5TU0A 4HW8A 1XVXA 3Q26A 1SDXA 2V84A 3RLFE 4KYSA 4DXUA 2IEEA 1B3LA 4OQOA 4ESXA 2H98A 1FTJA 1B0LA 5BUUA 1MG1A 2OWSA 1B58A 3G3IA 5F7VA 4TLMB 4ELOA 2I0CA 4GRKA 1B5IA 4FJPA 1S50A 4NF4A 1N7XA 4BDLA 3MUQA 1XVYA 4IY6A 1MY0A 3MJNA 4IO2A 2XXQA 3UP9A 2FNCA 3MP1A 5H8FA 2DXYA 4O3CA 1FCKA 3T9UA 3LSWA 3NROA 3VLWA 2O69A 5KZTA 1B3GA 5L9MA 1AH5A 3PPQA 4FEBA 4NWDA 1MXWA 4DE8A 2OZZA 4OTEA 4H67A 1UTHB 5H8SA 2VD3A 3G7WA 2VHAA 2VOZA 1B40A 3HCQA 2GRVA 5KCJB 4F3PA 2XD3A 4EDPA 4G8HA 3CI8A 3U1OA 1FQEA 2OK2A 4F3SA 1MQGA 4MH5A 2VD2A 2I49A 1GR2A 2O6AA 5I57B 4IY5A 3G3HA 3PPNA 4BDOA 4JWOA 3ILTB 2ANJA 5DVFA 3RT6B 1B2HA 1RYOA 3K00A 2F6PA 3HHGA 4QSDA 3SEVA 3UORA 5FHNA 4DDDA 4R6YA 4GQOA 1MPCA 1XT8A 3B6TA 2Q88A 1ZKBA 5EHMA 1BTJA 1T0KA 2P2AA 3RUMA 3IO4A 1A40A 4NF4B 2HFBA 3GLBA 1PC3A 3VVDA 3C31A 2ALUA 3VDFA 1MXUA 1DPEA 1RKMA 4Q8RA 2W7YA 3UIFA 3CSGA 2PBWA 1B6HA 3IOVA 4DIGA 3H03A 4LVQA 4HCWA 3MZBA 4IB2A 4QRZA 2ZNUA 3C32A 4U4SA 1I6QA 3FIRA 2QMWA 5EYFA 5KDTB 5CC2A 2UVJA 3FJGA 4MLVA 4EF2A 3ODBA 4GOTA 3UA8A 4G77A 2HEUA 1EU8A 3IB2A 3VVFA 1O63A 1OQGA 2Y84A 1LAHE 1NMUA 4G68A 4QF9A 2UYFA 5CBSA 4X1BA 1J1NA 3N94A 1ZTYA 3QUFA 4KR5A 2I3WA 3IL1B 5DEXA 2B3FA 3SEWA 2PX1A 1FQCA 4PFYA 4RK2A 3S9LC 3H6TA 5B7DA 3JZJA 4OXVA 5M2VA 2G93A 1FTMA 2QS4A 1MPBA 1YAEA 4R9GA 2UVHA 4X48A 5A5XA 4BDMA 2A5TA 2DXRA 1P99A 2REJA 2HQ0A 3ILUB 3C9HA 4H5FA 1B1HA 1LB8A 4KYDA 2XXPA 4YKIA 1QUKA 1N3WA 4NEDA 3C36A 4E0XA 3VV5A 4F2QA 4DXCA 3EPEA 1H44A 3TODA 1M5DA 3C35A 4O3AA 2Z8DA 5CI5A 2QJEA 2Y7IA 5ITPA 5AA2D 1O64A 3QYTA 1QW0A 3RY3A 3OELA 1A54A 1B3EA 1OMPA 1HSEA 4OERA 4IGTA 1JETA 1DTZA 3IOUA 3RNNA 4I62A 4JXIA 1HSJA 4M1VA 5K2YA 3MEJA 3HPIA 3T9VA 4C1UA 3PD8A 1VSOA 3I5OA 1H3DA 4G68B 3PMXA 3KN7A 3U93A 1QULA 1B5HA 4F19A 4XKRA 2M8CA 1A55A 1JEVA 1UIVA 2RC9A 1GV8A 2P0SA 5HPQA 4MLQA 4NF8A 1US4A 1LCTA 1JW5A 2OWTA 1LCFA 1D9VA 2O1LA 1MDQA 4JB7A 1ATGA 5DTBA 2AL5A 1DOTA 2DQVA 3L6GA 2BJJX 2FYIA 4RJZA 3WAEA 4ND9A 4NMYA 3E3KA 3TTMA 2I4BA 2VGQA 2Q2CA 3N6TA 4I1DA 3N26A 1URGA 3QXMA 2XXYA 2GHAA 3B6WA 1IQ7A 1VR5A 1PBPA 1TWYA 1XOCA 4F29A 3PMVA 5L8DA 4C0RA 2B65A 3E9XA 1PDAA 2RINA 4BDNA 2XXUA 4LZ5A 4ELRA 1B3FA 3T66A 4N13A 4G8NA 1BLFA 1R9QA 3U8QA 4MFIA 3OENA 1KWHA 3CG1A 4H8JA 3EHUA 3B7DA 4EUOA 4H6DA 2RC8A 3MZ9A 4GF8A 1M5FA 1TFDA 3SEXA 5K2XA 3FVGA 2Q9TA 1II5A 1GGGA 1BIYA 1P1WA 2PT1A 4PP0A 2I6EA 2X7QA 2ZYMA 2Q89A 3IJOB 2H9BA 3OO7A 3PUWE 3KBRA 3MC2A 3FVOA 3RTWB 4R2BA 1QKAA 3P7IA 1IITA 3CFZA 4YB6A 1DMBA 4G2ZA 4NWCA 3FV2A 3S4UA 2DE3A 5AA1A 4KCCA 5IKBA 3H6WA 3H3GA 1UQWA 1IIWA 1SVXB 1LFIA 4HTGA 2DOJA 1MXYA 4JSDA 3IOTA 3ZKLA 1EH3A 1SW1A 3K6VA 3PV0E 1QVSA 2E1SA 1N84A 3HO7A 4P0GA 4QFPA 3I6VA 1MXZA 4YKKA 4F39A 1MS7A 3OWQA 3LBSA 1Y3QA 5ELVA 4KPTA 5DT6A 2ZYNA 3A09A 1I6AA 1R1NA 4Q0CA 4ZZEA 2YPNA 5I57A 3W9WA 3DP6A 5LOMA 4F2OA 3CR9A 4U2RA 1DSNA 3FVNA 4OHNA 5HBCA 3SEYA 1MY1A 2DWHA 2XX7A 1MQHA 2NXOA 4OFOA 4ELQA 4YMAA 3GZGA 1M5EA 4RA1A 1A7LA 3TTRA 4LQ5A 1LFGA 3EN3A 1JVYA 2XXVA 1SI1A 1FTOA 1Y1ZA 3VVEA 1B51A 3K6WA 1MQJA 1MDP1 2HZKA 1QJMA 4IGRA 4ONYA 4EXLA 1LAGE 1ZIUA 4YAHX 2B3BA 1LFHA 3LSXA 1IEJA 4XKPA 1A99A 4R74A 3KOSA 2D5WA 2O84X 3M3KA 2O7IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z8FA 4IO5A 1BDIA 1HF0A 3RGYA 5KDTA 1IUDA 3QK6A 1MXXA 2PFYA 4ZDMA 5B70A 3OXNA 4X4CA 4RY1A 3RYDA 5ISUA 3T96B 5AE4A 3DLNA 1CE2A 2THIA 3B7HA 4JCYA 4EQ7A 3KC1A 2A6CA 1TFAA 1RPEL 5ESYA 1FQFA 1PRUA 1US5A 2HAVA 3GYYA 1NUYA 1RDXA 4F1YA 5DTMA 3LISA 1YCJA 4N07A 4POXA 3PUZE 3MLFA 4DLDA 2DVCA 3VFJA 4KYEA 4PAFA 1FPKA 3TMGA 3TAJA 4GWWA 4EZIA 2PXKA 3HHFA 1R9LA 4POWA 3IR1A 1IXCA 3D4GA 3V5AA 2QVVA 4DI3D 4ER7A 1A8FA 4YG7B 2ONSA 2KR0A 1EZOA 4MBPA 3UFDA 4UA8A 4R75A 2EF8A 4JVDA 1Q1KA 2RCAA 1P1QA 3SESA 3UK4A 1RYXA 2Y5LA 3SCFA 2D5VA 3MQ9A 3SCHA 4RXLA 4H8IA 3MSTA 2PUCA 3LFPA 3FXBA 1MM7A 4PCDA 3U94A 3DNVB 2HXWA 3S9NC 2L5VA 4WKMA 3TFLA 4F31B 1B4HA 2H25A 3GBAA 3KFMA 3M8UA 4JSOA 4PGPA 3A3CA 2FBPA 4KHZE 3JXCL 1ZBMA 3PPOA 3C34A 3CLCA 3Q27A 3QWGA 3F11A 2P3VA 4XEQA 3OKZA 2Q8MA 1P1OA 1Y3NA 2ZXTA 4NF6B 4JCXA 5GAHi 2NOOA 3K0VA 3M3LA 4PQJA 3S2VA 1OQHA 3BFUA 1NL5A 1ZJLA 3PGFA 1CJGA 1FTLA 1SYIA 2UVGA 4GQMA 2IVGA 4I6RA 3FV1A 4DCYA 1Z7ME 1FPEA 2BNMA 4PDHA 4MJOA 3I3VA 2OBGA 3WAFA 1DK4A 4QFNA 1AMFA 1DULA 3PPRA 4I6UA 1L5TA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1UXD A;  1NV2 A;  4EXL A;  1LAG E;  2FIE A;  1ZIU A;  3E78 A;  4YAH X;  2B3B A;  1X2L A;  1LFH A;  4FBP A;  3L1P A;  2H8R A;  1AWB A;  3LSX A;  1NV6 A;  1IEJ A;  3SX0 A;  4XKP A;  1A99 A;  4R74 A;  2L1P A;  3KOS A;  2D5W A;  2O84 X;  3M3K A;  2O7I A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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