3TEPA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and magnesium ion
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPRDAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule keywords CPS2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
total genus 125
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3tepA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tepA01
1QUKA 1EZ9A 2HAUA 4ELPA 1LBCA 4KHZE 4F39A 3IB0A 1MXUA 1US5A 3B6QA 2PMSA 4EXLA 3AXFA 2XXPA 2DE3A 5K2XA 1IZ1A 4IGTA 4ESWA 4FJPA 1J1NA 3N26A 4F3GA 4F1UA 4G77A 4JWXA 4THIA 3MZ1A 2QS2A 1JEUA 4QF9A 4XKPA 2Q8JA 4NF6A 1A54A 4GXSB 3SKPA 4QSDA 1XVXA 3PUVE 2QPQA 2D3IA 3S9EA 2XXRA 5L9OA 3O66A 5JK4A 1B5IA 1IXGA 1JW5A 3IOTA 4KD5A 3UGWA 3TTRA 2DXYA 4YMBA 3IB2A 1MXWA 2VGQA 1B4HA 4MLVA 1TT1A 2G29A 4F3BA 4R9FA 3K02A 3B7DA 4GRKA 1MQJA 1B32A 2Q2CA 3TKDA 1JW1A 5DTBA 1AIVA 2PT1A 3NROA 3DLNA 3JZJA 1EU8A 2ANJA 3EHTA 3FVOA 2I58A 2H9BA 4X48A 3SESA 3C4MA 3M3FA 5TP9B 4ELRA 4ZEDA 1AMFA 3KN3A 1B3LA 4N6PA 4P0IA 4OYVA 3PUYE 2FA7A 1DOTA 4JDFA 1QKAA 4XKRA 1HSJA 4ZS9A 3K6WA 1DTGA 1Q35A 1NMUA 5I2KA 3TMGA 2RC7A 2GFEA 1MPCA 4ZDMA 4QFPA 5I59A 1IQ7A 4QFNA 4ZECA 3U93A 4UA8A 3FVKA 2M8CA 4YKKA 2PVUA 1NNFA 3FGSA 5I2NB 3FASA 1F9BA 1B58A 3FZVA 2F7BA 3MEJA 2DVZA 2O1MA 4X1DA 4ESXA 3C9HA 2Y7PA 5ISUA 1ZLQA 2GRVA 2Q2AA 1O64A 4F31B 1PEBA 3TCGA 3K1MA 1P1WA 3FXRA 3E13X 3GLBA 3Q29A 3CFZA 3S9NC 4QSEA 1I6AA 2F34A 4G68B 1MPDA 3UN6A 3H6UA 4IY5A 3WAEA 2QS3A 4RXLA 1USYE 3T9VA 1MPBA 2REJA 3TODA 3DM0A 1YPNA 1JQFA 3O6HA 5KDTB 3N94A 3OO9A 3G3KA 1D3KA 1URSA 3K6UA 4M1VA 3R26A 2I0CA 5I57B 3SEYA 3H03A 2Z8EA 1ZTYA 5CBRA 3PUXE 4RPOA 4G2ZA 1B4ZA 2F8DA 5H8FB 4RA1A 4DXBA 1H76A 2AIXA 2LAOA 2I49A 3OKZA 2F35A 4C1UA 4R2FA 4ECFA 4POWA 1JVYA 3DP8A 3L6HA 1DPEA 4RJZA 5I59B 5AA3A 3O97A 4XTCQ 3FV1A 1N84A 1CE2A 3CSBA 4GLIA 3VDFA 1B51A 4EDPA 1L5TA 3S9MC 3DP6A 1P1OA 5DEXA 5B70A 2Y7RA 3CG1A 1MY4A 3ONMA 2XXQA 3IR1A 4EQBA 4R75A 4ELQA 1ANFA 1Y3NA 2XXTA 1US4A 5H8QB 1SDXA 3TTNA 2QMXA 2XX7A 2NWJA 1M5FA 2F78A 3M8UA 1MM6A 1EZPA 1Z7NE 3MPKA 1SW4A 4TQUQ 4G68C 1NNTA 2OLBA 3Q25A 2XXWA 4LVQA 4ND9A 1P1UA 1B05A 2DOJA 4NE4A 1URDA 3EF7A 1N76A 1B3GA 4TLMB 2UVJA 4F22A 2E0SA 1MXYA 1MDP1 2B3BA 3MVWA 3O6IA 2FYIA 4TOZA 1IITA 3CVGA 3CRBA 1A8FA 4DXUA 3PD9A 5I56A 2Z8FA 2ZNUA 4OEUA 5F1QA 3CI8A 4NF4A 4LQ2A 1MXZA 3E9XA 5HBCA 1B6HA 5CMBA 4MLQA 2W7YA 2O84X 4GVOA 5EHSA 2UVGA 2F6PA 3QFIA 4FAJA 4ZEBA 4JXIA 1B0HA 4WEDA 4QFLA 4QFOA 2DS9A 5BWJA 2F7CA 5EYFA 2PBWA 1LAGE 4LQ5A 1SD3A 4AB6A 2DXRA 3TQWA 4NWDA 3C33A 4NEDA 2V25A 2I4CA 2XX9A 4IY6A 4GXAA 1M5EA 4G4PA 3I5OA 2R71A 4KFQA 5FHNA 1POY1 2O7IA 1FTKA 1SBPA 2OJTA 1B7HA 4MF3A 4XXUA 2E1SA 1LFIA 4KYDA 4DCXA 3C36A 1LSTA 3OEKA 4Z7EA 4U1OA 3UA8A 1M5DA 1Y20A 1LCFA 5H8SA 1JVXA 1LLSA 5ICQA 3A3CA 2REGA 1H43A 3VVFA 3THIA 1D4NA 3FXQA 3JYRA 2B3FA 4GD5A 1SW1A 4NF4B 5L9MA 2O69A 2HZLA 3MC2A 3W9VA 1A8EA 2P2AA 4Z0IA 5KCJB 5AE4A 4H65A 4QFKA 4X9TA 4QHQA 1JNFA 4I62A 5DVFA 3A3UA 3PPNA 4U21A 3HCQA 3USDA 2YPNA 3FJGA 1RKMA 4MBPA 3N5LA 2VD3A 3OEMA 3A09A 3PMXA 4Q5TA 4GL8A 4F2OA 5TP9A 4WXJA 3G3FA 3IAZA 4WEPA 3MJNA 2QJEA 3KSXA 2UXAA 2ONSA 4ZE8A 1MXXA 2UVIA 2ONRA 5TPAB 1UIVA 1FQDA 2DSFA 3C35A 1UTBB 1NH8A 5AA1A 3G3IA 5I2NA 4R9GA 2RF1A 2DQVA 2DP8A 3GXAA 5JTYB 2Q89A 3ZSFA 1USYH 4YAHX 1H44A 3VVEA 1PB9A 3SEWA 2Z8DA 3U92A 4JB7A 3KJ7A 1TWYA 4OBMA 3ZKLA 1P1NA 5TU0A 2DVCA 4KI0E 3PPRA 2HXWA 1R1NA 5I84A 3DP4A 4XIGQ 4G68A 4OETA 4OXVA 4R2BA 3IB1A 1QW0A 4U23A 4LATA 1ZU0A 3PPQA 3R7XA 4U4SA 1OQGA 5CRYA 4JSOA 2Q9TA 3H6VA 3EHSA 3RNNA 2F36A 1H45A 4QRZA 5KDTA 1ZKBA 4ZE9A 3SERA 4UACA 3UIFA 3OWQA 2PYYA 3IORA 4YB5A 1FQEA 4FORA 1MY3A 4ONYA 1DMBA 1VFEA 4PFWA 5I57A 3LC8A 4RNSA 2P0SA 3G3JA 4E0XA 4GWOA 2Y7KA 3PGFA 3C31A 1OVBA 3IOWA 5H8FA 4OWDA 3CR9A 4OVJA 3ZKKA 3CSGA 3U94A 3OELA 4YKIA 1IUDA 1YCJA 2PT2A 3H6WA 1DPPA 2ZYNA 1T0KA 1MH3A 1SYHA 3H06B 3V8XB 3LSFB 5CMMA 3OOAA 3K00A 5AA2B 2ZYMA 2G93A 4P11A 1MQHA 4R6KA 2R6GE 2F97A 1Y4TA 3CFXA 4OEVA 1AOVA 4OFJA 2DE2A 4U22A 3K6XA 4GIZA 5B7DA 4F19A 1I6BA 5H8QA 5EHMA 2RCBA 1EH3A 4RY1A 2ZMBA 3IL1B 3N6UA 3VXCA 3RT6B 3E3KA 4R73A 2AL5A 2DWHA 3MZ9A 1PBQA 4NWCA 1FTLA 2XD3A 2AYSA 1ZMGA 2Z23A 2D21A 3FD3A 1QULA 4JWYA 3VLVA 1PDAA 1R6ZA 3G3GA 1M5BA 2XXHA 5H8HB 2F5XA 3H3GA 2O51A 3SETA 3B6WA 3Q27A 2Y7IA 1UIUA 3KFMA 3LSXA 5AA4B 1MY2A 4BDNA 2H99A 3VE1B 1XOCA 3Q26A 3TCFA 4G8HA 1B46A 3UORA 5IKBA 2XX8A 2OBGA 4OFOA 2NXOA 4ZEKA 2I3WA 3MW0A 4DDDA 3U1OA 1NNKA 5K2YA 2UYFA 3FXUA 2RKMA 1FTJA 2ONKE 1OMPA 4BLAA 4EQ7A 2RC8A 4ZEIA 2YJPA 1LAFE 1MS7A 1B52A 3T22A 3CG3A 5DYHA 1B7UA 1GTKA 3KSJA 1P99A 2RINA 2XXUA 4BDRA 1HSLA 3SEUA 1I69A 3IJXB 1LCTA 4Q8RA 2H25A 3KGCA 4LZ5A 3H6TA 3ILTB 3PD8A 2O1LA 4FEBA 3OENA 1B5HA 2CMOA 4Q30B 3PUWE 2H4IA 4U1ZA 5KZTA 5FTIA 3OO6A 4U4XA 1N0TA 1BKAA 4PE5B 1N3XA 2QRYA 4KPTA 4DE9A 1B9JA 4ZZAA 4NTLA 3HN0A 1R9LA 5CBSA 1QVSA 3VXBA 2I3VA 2DYXA 3PU5A 3O28A 2X7QA 2F6GA 4HS7A 4LZ8A 4OESA 4DLDA 4FE8A 1B3FA 4KCCA 1NL5A 1LGBC 3FV2A 4I8CA 3MWBA 2XXXA 4KR5A 4G8NA 2V3TA 5KCJA 3GBAA 3O2AA 4LZ7A 2CZLA 3M3KA 3NXHA 3K2DA 1UTHB 1HSEA 3FJ7A 2VHAA 4R72A 2ZYKA 3PUZE 1LB8A 3FIRA 4YB7A 2D5WA 4TLLB 2HEUA 3DELB 1MDQA 5CC2A 1PBPA 1XT8A 5JEIA 2OWSA 2VOZA 1WDNA 1P1QA 3O6GA 1MQGA 1VSOA 4N13A 2RCAA 2WKYA 5TPAA 1B1HA 4F1YA 2NUVA 5DT6A 1B5JA 1UTBA 2HQ0A 2HFBA 2Y84A 5JTYA 1DSNA 1TFAA 1Y9UA 3T93B 3C34A 4NF5B 3RQTA 4EQ9A 3VV5A 1A40A 3KOTA 3TCHA 4RK9A 3MPLA 1FQBA 3SDFA 4FEDA 3B6TA 4O3CA 5DVIA 1FTMA 3MVXA 1KWHA 3T66A 1FW0A 4KYSA 3TPAA 4IO6A 3SEVA 2IEEA 4ZEFA 4NF8B 1NFTA 1PC3A 1SW2A 5BUUA 3HSTA 3HPIA 2OCUA 5CMKA 1ZJLA 2ZYOA 5CI5A 4H0WA 1PB7A 5FTHA 1XC1A 1ATGA 3EPEA 1S9TA 3TAJA 5A5XB 3VLWA 3I3VA 2F7AA 2BJJX 4JWOA 1MH4A 4PFYA 4IGRA 2VD2A 3OO7A 1FQCA 1IEJA 4R74A 5H8NB 3MVZA 1YAEA 3H4ZA 3GZGA 4I1DA 1Y3PA 1MQIA 4IO7A 3RN8A 5FHOA 5L8DA 3PPPA 3N6TA 4EF2A 1LBBA 2P1SA 3E4RA 4XKNA 3SEXA 3CIJA 4RK2A 2DWJA 2V3UA 1BIYA 3VFJA 4F29A 4IO2A 3OO8A 3LSLA 4YB6A 4YZZA 4AQ4A 3IO6A 5I58B 5AA2A 1R9QA 1SI0A 4GOTA 3I6VA 3EQ1A 1GVCA 4YKJA 4MH5A 3MP6A 4HCWA 3LUYA 3UK4A 2DWIA 4H5FA 1B3HA 4FATA 3K01A 2A5TB 3FJMA 3T9HB 1QKBA 3ODBA 3TYHA 1JETA 2V93A 3ZS6A 4F3PA 3V89B 4F1VA 3ILUB 2HAVA 4IO5A 3RY3A 3EN3A 1BLFA 4OENA 1B40A 2H5YA 3QXMA 4U2RA 1POTA 1SVXB 3MP1A 3OSRA 2ESNA 5H8HA 1A7LA 1PB8A 3VLUA 2Z22A 4DCYA 3JV9A 1N04A 3KJTA 2V84A 4H5GA 1URGA 3R6UA 1RYOA 2ZNSA 2NVUB 1XHYA 3FUZA 5AA4A 3P7IA 3C32A 1FTOA 2ZNTA 1IIWA 3OMBA 1SW5A 3O29A 3KN8A 3S4UA 2X7PA 5HPQA 5LOMA 2XXVA 4H6DA 4IO4A 4E0WA 3D4GA 3KOSA 4R6HA 2NOOA 2A5SA 4KQPA 3T9XB 2XXIA 3U8QA 4DIGA 3G3HA 4R6YA 3ECRA 1VE4A 4EUOA 2ZXTA 2YLNA 1GR2A 1OIBA 4ISUA 3MBPA 1MG1A 3OXNA 2I4BA 2OZZA 4FIMA 1S7YA 4POXA 5ELVA 5ICTA 1UQWA 1Y1ZA 2GH9A 3QAXA 3RPWA 4QSCA 5L9SA 1N3WA 2X26A 3K0VA 2B65A 4NF6B 3K4UA 1O63A 2Q88A 1OLAA 3V5AA 4O3BA 1B3EA 3TELA 1IXHA 5AA2D 1SI1A 4GF8A 1MQDA 3TFLA 4O3AA 3RTWB 4H8JA 4OERA 1Y1MA 1D9VA 4IO3A 1NH7A 1WODA 4YU0A 3LR1A 2HZKA 3IJOB 3MVYA 1D9YA 1FQFA 4RYAA 1BP5A 2V3QA 3OSQA 4IB2A 2GHBA 3FATA 4OMBA 1UTHA 3BBRA 3TTLA 3BFTA 3TEPA 1MRPA 1GGGA 1Z7ME 4WKMA 1H3DA 5I2KB 5HM4B 4BDQA 1CB6A 4OTEA 1B2HA 3KZGA 4K3FA 1S50A 3TZAA 1IXCA 5DVJA 4HW8A 4BDMA 1Y4CA 4LONB 4H1XA 4PFUA 3FVNA 5CMCA 3WAFA 2Y7WA 3L6GA 2PX1A 1O7TA 2I0BA 3HV1A 1JEVA 4NMYA 2QMWA 3OD7A 4OFLA 4C0RA 4NF5A 3TTMA 1QUIA 5ITPA 3RTFB 1LFHA 1EZOA 2O68A 3QUFA 4GQOA 1OVTA 1LB9A 1FQAA 3BKIB 1ELJA 1II5A 1LFGA 4L17A 3MZBA 3W9WA 2O6AA 4EF1A 1N7WA 2QS1A 1AL3A 1OLCA 1TXFA 3TQLA 3CFLA 3BFUA 3KG2A 3MAMA 1RYXA 4EXKA 4FECA 3MUQA 4BDLA 3QYTA 2XXYA 4NF8A 1QUJA 4GFRA 2UVHA 2HCAA 4AB5A 4F2QA 1LAHE 1NNPA 4PP0A 1BTJA 4PQJA 4C1TA 2DWAA 3RUMA 1LAXA 5A5XA 4YMAA 4P0GA 2IA4A 2QSXA 3LBSA 4ELOA 1MM7A 3T96B 3K6VA 3FVGA 1B7ZA 1A99A 2OK2A 5H8NA 1MY0A 1VR5A 2KLFA 4F18A 3Q28A 4YICA 2DE4A 4DXCA 2VP1A 4JBZA 3PMVA 3PMWA 1XS5A 5FHMA 3K1PA 4HCYA 4PFTA 1SQYA 2QS4A 4LA9A 4RPNA 3HHGA 1QJMA 1SYIA 2I6EA 5F7VA 1IXIA 1VFDA 2AL4A 3VVDA 3K1NA 3IOVA 3QUJA 5DEXB 3PV0E 3QIMA 3H7MA 4GL0A 5I58A 3S2VA 4JSDA 4XKQA 1M5CA 1A55A 3RT8A 3S9LC 4DZ1A 1ZBMA 1OQHA 5CM6A 1TFDA 4YKPA 2FNCA 3PPOA 3M3LA 3EHUA 3T9UA 3IX1A 1MY1A 2XD2A 1MXVA 2RC9A 3GBBA 3LSWA 2A5TA 3KN7A 4DE8A 4OHNA 4LP2B 4X1BA 5M2VA 3PE5A 3HO7A 3QSLA 3UP9A 3U72A 2O7UA 5ITOA 3D4CA 3G7WA 3TDJA 4H67A 4LUBA 3HHFA 1Y3QA 4ZZEA 1XVYA 2GHAA 4F3SA 1B1XA 4PETA 4Q0CA 5J1DA 4N07A 2ALUA 5I56B 1NKXA 4I9DA 3MQ9A 4KYEA 4HTGA 1WVJA 3QK6A 4M4GA 1B0LA 3KEIA 2QL3A 1YTVA 3RGYA 1FCKA 3TUSA 5IAIA 1Q1KA 4OZ9A 1N7XA 3TTKA 1JW4A 1DTZA 2ABHA 2H98A 4G8MA 3IO4A 3O9PA 4MFIA 4BDOA 2THIA 2OWTA 3KBRA 3W15C 3IK6B 3MP8A 1ZIUA 1GV8A 2XHDA 4H8IA 1AH5A 4KCDA 3V83A 2I48A 1I6QA 3F11A 3IOUA 2UYEA 3RLFE 4OQOA 2R9JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QUKA 1QQAA 1EZ9A 4LN5A 2HAUA 4ELPA 3R1FA 1LBCA 4KHZE 4F39A 3IB0A 1MXUA 1US5A 3B6QA 2PMSA 4EXLA 3AXFA 1FTAA 2XXPA 2DE3A 5K2XA 1IZ1A 4IGTA 4ESWA 5GAHi 4FJPA 1J1NA 3N26A 4F3GA 5IZ3A 4X4GA 4F1UA 4G77A 4JWXA 4THIA 3MZ1A 2QS2A 1JEUA 4QF9A 4XKPA 2Q8JA 4NF6A 1A54A 4GXSB 3SKPA 1FBGA 4QSDA 3IFCA 1XVXA 3PUVE 1YSEA 2QPQA 2D3IA 3S9EA 2KPJA 3G7DA 2XXRA 4Z58A 1IMEA 5L9OA 3O66A 5JK4A 4I40A 4OA4A 1B5IA 1IXGA 1JW5A 3IOTA 4KD5A 3UGWA 3TTRA 2DXYA 1Y9QA 4YMBA 2ICPA 3IB2A 4HE1A 1MXWA 2VGQA 1LCDA 1UXDA 1B4HA 4PDDA 3NZLA 1DW9A 4MLVA 1TT1A 2G29A 4PE3A 4F3BA 4R9FA 3K02A 3B7DA 4GRKA 1MQJA 4IR8A 1B32A 4PFRA 2HCSA 2Q2CA 3TKDA 2IV1A 1JW1A 5DTBA 4NF0A 1AIVA 2PT1A 1RZRD 3NROA 3DLNA 3JZJA 1EU8A 2ANJA 3EHTA 3FVOA 2LYPA 1JFSA 2I58A 2KEJA 2H9BA 4X48A 1ZZBA 3SESA 4Q2JA 1ZAYA 3C4MA 3M3FA 5TP9B 4ELRA 4ZEDA 2XXAA 1AMFA 3KN3A 1B3LA 4N6PA 5ET8A 4P0IA 4OYVA 3PUYE 3QF3A 2FA7A 1DOTA 4JDFA 1QKAA 4XKRA 1HSJA 4ZS9A 3K6WA 4XFEA 1NV5A 1DTGA 1Q35A 4N8YA 1NMUA 5I2KA 4PAKA 3TMGA 1IMAA 2RC7A 2GFEA 1ZZ9A 1MPCA 4QFPA 4ZDMA 5I59A 1IQ7A 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 2GHA A;  4F3S A;  1B1X A;  4PET A;  4Q0C A;  5J1D A;  4N07 A;  2ALU A;  5I56 B;  1NKX A;  4I9D A;  3MQ9 A;  4KYE A;  4HTG A;  1WVJ A;  3QK6 A;  4M4G A;  1B0L A;  3KEI A;  2QL3 A;  1YTV A;  3RGY A;  1FCK A;  3TUS A;  5IAI A;  1Q1K A;  4OZ9 A;  1N7X A;  3TTK A;  1JW4 A;  1DTZ A;  2ABH A;  2H98 A;  4G8M A;  3IO4 A;  3O9P A;  4MFI A;  4BDO A;  2THI A;  2OWT A;  3KBR A;  3W15 C;  3IK6 B;  3MP8 A;  1ZIU A;  1GV8 A;  2XHD A;  4H8I A;  1AH5 A;  4KCD A;  3V83 A;  2I48 A;  1I6Q A;  3F11 A;  3IOU A;  2UYE A;  3RLF E;  4OQO A;  2R9J A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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