3TEPA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and magnesium ion
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPRDAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CPS2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 125
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3tepA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tepA01
1Y3QA 5L8DA 2X26A 2XXPA 4JXIA 4DCXA 1VFEA 4G8MA 4TLLB 3MZBA 3SETA 1VFDA 4O3CA 4FORA 3KJTA 2ZYKA 4FAJA 3TCFA 4AB5A 4G68A 2PYYA 4U4SA 3UP9A 3MUQA 2F6GA 1TFDA 3V8XB 4NWCA 2O69A 2I58A 3C4MA 3N6UA 3R6UA 3T9XB 1LAGE 1LBCA 5AA2D 1SYHA 4F1VA 3FD3A 5CBSA 1DMBA 1ZBMA 4NWDA 1MXWA 4LONB 2XX7A 4QHQA 3H4ZA 2R6GE 4OETA 4H65A 2UVHA 2D21A 2RKMA 4LZ8A 5EHMA 1B0LA 4LUBA 1FQCA 3K1MA 1ELJA 3TFLA 3KEIA 2DWAA 4RPOA 1SYIA 1B3EA 1O7TA 1WODA 4JSDA 1OIBA 3RQTA 4EXKA 1N7WA 3VXCA 3EF7A 3ECRA 4NF6B 4BDOA 4YMAA 3OO7A 2DYXA 4OXVA 3FVGA 1MY3A 4FJPA 4E0XA 1TFAA 4NTLA 1CB6A 3IB1A 2HXWA 1Q35A 3FV2A 4IO3A 4NF4A 3MJNA 5H8HA 4ISUA 3CI8A 5JK4A 4G68B 3L6GA 1URGA 3G3KA 4QRZA 2THIA 4RXLA 3H6UA 1ZJLA 2I49A 3TTMA 3O6HA 5AA4A 3FJMA 1QKAA 2A5SA 4ZEIA 4F3PA 1OQHA 4U21A 1I6AA 2OWTA 4EF1A 1QW0A 5HPQA 3OSQA 3HPIA 4F3BA 4GF8A 3UN6A 5I56A 2G29A 5TPAA 4P0GA 1P99A 1POTA 3U1OA 2AYSA 4EDPA 3PUYE 2Y7KA 5H8FB 1VE4A 1DTGA 2VOZA 2HAVA 3G3JA 1CE2A 1P1OA 1ANFA 4U4XA 1B4HA 5IKBA 2FA7A 3KFMA 3SDFA 3PV0E 2OZZA 4U23A 3IAZA 4UACA 2F7AA 4QF9A 3OKZA 3FUZA 1JETA 3CR9A 3KZGA 4DCYA 5H8HB 1Y1MA 5JTYB 3HSTA 3MP6A 3OO6A 4NMYA 2ZNSA 3VFJA 1J1NA 1FW0A 2GFEA 3PMVA 5K2YA 5BUUA 3FJGA 3QYTA 4C1UA 3EHSA 1PB8A 1JEUA 2VHAA 3IOWA 5AA4B 3EQ1A 3IL1B 1SQYA 3SKPA 2YPNA 4H67A 3LC8A 1OVBA 1A7LA 1ZLQA 2DE4A 2F8DA 4EQBA 5KDTB 3PUWE 4GL8A 2F6PA 1NMUA 1MM7A 4OESA 4DE8A 5I56B 3H6VA 2DWJA 3H06B 3GLBA 1OLAA 4IO4A 5I2KA 4IO2A 2X7PA 1B6HA 4ZEKA 2I0BA 4ELOA 3E9XA 3O97A 3U93A 3IJXB 3UA8A 3V89B 3OEMA 4DDDA 2F7CA 4YAHX 2I48A 3LSXA 4R6KA 1BTJA 3BFTA 5CBRA 1R9QA 3S4UA 1LFIA 2D3IA 3IX1A 4QSEA 5TU0A 3B6WA 2BJJX 4F3SA 1XVYA 2QRYA 4LQ2A 4IO7A 3IB2A 1H45A 3SEXA 1MPBA 1PBQA 3G7WA 1P1WA 1URSA 3LSFB 4FEDA 1SW5A 4DE9A 3OO9A 4E0WA 3MVYA 4KYDA 3A3UA 4MFIA 2F5XA 1EU8A 2RCAA 3TDJA 4GRKA 4OVJA 3T9HB 1ZMGA 4FATA 4ZEDA 1B9JA 4XKRA 4HS7A 2I3WA 5DTBA 4IB2A 4DXCA 3KN3A 4XKNA 2REGA 4G8HA 4RYAA 4HW8A 5TP9A 1B1XA 4QSCA 4PFWA 2I0CA 3H3GA 4FECA 1LSTA 3HHFA 2VD3A 1DPPA 2VP1A 1ZKBA 4KCCA 3O9PA 5DVJA 4AQ4A 1AH5A 4FEBA 3KOSA 1M5EA 2Y7IA 2F34A 2QPQA 2Q2AA 3CFXA 2O84X 3V5AA 1MH4A 1B40A 2DSFA 2NOOA 3PPNA 2O68A 3CIJA 3H6WA 4OZ9A 3VV5A 3MW0A 4I9DA 1B4ZA 3TQWA 4IY6A 1MS7A 1MQHA 3PGFA 3FIRA 3DP8A 1Z7NE 4R9FA 3PD8A 2DXRA 2XXHA 1LAXA 4YICA 1OMPA 4IO6A 4R72A 3VVEA 5TP9B 1GR2A 4GFRA 1LBBA 2XXQA 3DP6A 3MVXA 2H5YA 2XD2A 4YMBA 3FXUA 4RNSA 2V3TA 4OQOA 4AB6A 2A5TB 1IZ1A 2YLNA 1N84A 2RCBA 2H4IA 1B7UA 4GOTA 4R6HA 1YPNA 4UA8A 3Q27A 1B0HA 4G2ZA 2DWHA 1O63A 2Q9TA 3N6TA 3ZS6A 3DM0A 3MQ9A 3K6XA 3OXNA 2G93A 1Y4CA 3I6VA 2ONKE 3SEUA 2VGQA 2FNCA 4H1XA 1MRPA 2RC7A 2H25A 2RC9A 4I8CA 2OJTA 1MXVA 4BDQA 3UORA 4MLQA 5B7DA 3KSJA 2Z8DA 3N5LA 4ZZAA 4R73A 4NF6A 1N3XA 5A5XB 3PD9A 3K2DA 3WAEA 3I3VA 3H6TA 4EF2A 4F22A 3QIMA 3TMGA 2UVGA 4G4PA 2Q2CA 3UK4A 1Y3NA 3T96B 4LVQA 1LCFA 2AL5A 3KN7A 2F7BA 2QS4A 1H44A 1N04A 2DS9A 1R9LA 3TZAA 1JVXA 3TODA 3U94A 2ALUA 2XXIA 4N07A 3O66A 3Q25A 4O3BA 4BDLA 1I6BA 3MBPA 4X9TA 4U1OA 5ICTA 3N94A 3PPQA 3F11A 4DLDA 5CMBA 1MQIA 5I2NB 1II5A 4GVOA 1D9YA 3S9EA 2XX8A 2ABHA 1NNTA 2RC8A 2DVZA 1NFTA 2CZLA 5H8FA 4R2BA 5DEXA 3CFZA 2P0SA 3OD7A 1EZOA 1YAEA 4H0WA 2H98A 3IOUA 2ONSA 1NNKA 4QFOA 3RPWA 2V25A 1XOCA 4XKPA 5FHNA 4DZ1A 2HEUA 3HN0A 3PUXE 4DXBA 2WKYA 1GV8A 3KG2A 3S2VA 1BIYA 4YU0A 4U1ZA 5HM4B 1XT8A 3PUZE 5JTYA 1A99A 1DTZA 3G3GA 5FTHA 4RK2A 3PMWA 3TTLA 3TTRA 4BDMA 5KCJA 3LSWA 1MQGA 4QFNA 4R9GA 2I4BA 3SEYA 3VLWA 5DT6A 3R7XA 1FQAA 3NROA 3Q26A 4G8NA 4Q8RA 3D4CA 3EHUA 4OHNA 3CSBA 5EHSA 5KDTA 1B7HA 3M8UA 1P1UA 3B6TA 2VD2A 2HZLA 2O6AA 2Y7PA 3OOAA 1Y9UA 3T66A 2O7UA 2DWIA 4PP0A 3VLUA 2DOJA 5DEXB 5AA1A 4IY5A 4R2FA 1OQGA 4NF5B 2Y84A 4KFQA 4EQ7A 3FJ7A 3LSLA 4RY1A 1N7XA 3HV1A 1UIUA 3FXQA 2Q88A 4Z7EA 1FTOA 3G3FA 2NVUB 4PQJA 3QSLA 4KD5A 1MPDA 3H7MA 1L5TA 3JYRA 1LAFE 5KCJB 2XXXA 5H8SA 4YB6A 1IUDA 1B5JA 1B51A 2PVUA 3W9WA 4MH5A 1NKXA 3IORA 1JQFA 2XXUA 2I6EA 3MZ9A 1B3GA 1GGGA 4DXUA 1IITA 3THIA 4QSDA 5ELVA 1S9TA 1XHYA 2E0SA 1MG1A 3ONMA 3SEVA 3IK6B 1POY1 1SD3A 3QFIA 2RINA 5KZTA 1A54A 2Z23A 3SEWA 2LAOA 2QMXA 4HTGA 1GVCA 3U8QA 1SI0A 4U22A 1AMFA 1N76A 1ZU0A 2QJEA 4I62A 2D5WA 3MPLA 2ZYOA 3TAJA 3FGSA 3LR1A 3JV9A 4OYVA 1LAHE 1B32A 5CM6A 3C9HA 3ZSFA 3MP8A 3TPAA 3FATA 3IOVA 3TCHA 2DVCA 4O3AA 2NWJA 5AA2A 2B3FA 2PX1A 3C33A 5ITPA 4ONYA 2F97A 1MY0A 3KJ7A 4KYEA 3TELA 3G3IA 3RTFB 3USDA 2QS2A 3T22A 4NE4A 4KI0E 3PMXA 2KLFA 4ZEBA 3VVFA 2ONRA 4GQOA 2GHBA 1H43A 3K6UA 3Q29A 1DSNA 3TCGA 1MXUA 2V3UA 4FE8A 4YB7A 3T9VA 2QSXA 1IIWA 1B46A 3E13X 3OMBA 2A5TA 1HSLA 1QVSA 5HBCA 5EYFA 3O29A 3KBRA 5LOMA 2NUVA 3O28A 3T9UA 4BLAA 3GZGA 1NH8A 1MPCA 3LBSA 4YKKA 3K02A 5CRYA 2RF1A 2PBWA 1UTBB 2ESNA 4GL0A 1GTKA 2QS3A 3BKIB 4Z0IA 4ELRA 4Q0CA 3DELB 4PFTA 1ZTYA 3RT8A 5F1QA 5K2XA 1LB9A 2DE3A 3MC2A 2XD3A 5AA2B 1R6ZA 1MY1A 3ILTB 5A5XA 5I58B 4WEDA 1Y4TA 3PE5A 1FQBA 5B70A 3K4UA 3QAXA 4YZZA 3U92A 5I59B 1B3FA 3IOTA 3TQLA 1PDAA 3JZJA 2XXWA 4ESWA 3OELA 1SI1A 4NEDA 1OLCA 3VDFA 3FV1A 1SVXB 4N13A 1SBPA 3R26A 2ZXTA 5AA3A 2ZNTA 4IGTA 2XXRA 3T93B 2HZKA 5ITOA 1Y20A 1B3HA 1WVJA 3L6HA 3E3KA 2CMOA 2NXOA 3I5OA 2OWSA 1UQWA 3OENA 4OFLA 4XXUA 4QFLA 2UXAA 4LQ5A 3KGCA 2OK2A 4KPTA 1QKBA 5I2NA 1S7YA 3K1PA 1QUKA 4H8JA 3FVOA 3PPRA 1M5FA 3DP4A 1AOVA 4XKQA 1QJMA 4LZ7A 4EXLA 3UGWA 1USYE 1YCJA 2HAUA 2FYIA 2V93A 1PEBA 3MZ1A 3HHGA 3WAFA 4TOZA 5DVFA 2B3BA 4Q5TA 4POXA 1TT1A 1RKMA 2UVJA 5DYHA 4ZS9A 1JW5A 1P1NA 4HCYA 3RLFE 2H99A 1VR5A 1MY4A 1XVXA 2X7QA 2Y7RA 5L9MA 4LATA 1NL5A 1A40A 1A55A 2ZYMA 1LGBC 4RPNA 4H5GA 3C36A 2UYEA 4F2QA 4OTEA 1AL3A 3C32A 4IGRA 3PUVE 4KR5A 3RT6B 1B1HA 1MM6A 4OMBA 2QS1A 1SW2A 3B6QA 4NF8B 4OBMA 4K3FA 1QUJA 4YB5A 3S9NC 2HCAA 1B7ZA 1SDXA 4JBZA 3G3HA 3MP1A 5L9SA 1ATGA 2GRVA 4QFPA 3RNNA 1WDNA 2IEEA 3QUJA 2XXVA 4G68C 4ZE8A 1EZ9A 3HO7A 2UVIA 3E4RA 4NF5A 3IO4A 3PU5A 4EUOA 3AXFA 1FCKA 1TXFA 3QK6A 3OWQA 3K6WA 4KQPA 3K1NA 2PT1A 3VLVA 3W15C 3OEKA 2P2AA 5CMCA 1RYXA 2PMSA 2PT2A 3B7DA 5IAIA 1D4NA 1US4A 2GH9A 4I1DA 4X1BA 3RY3A 2Q89A 2ZYNA 4MBPA 4WXJA 4GD5A 1MXZA 4JWXA 3KOTA 4LZ5A 4GIZA 4X1DA 2W7YA 4GXAA 4F18A 4L17A 3V83A 4OEUA 3OO8A 5I84A 3GBAA 4TQUQ 3K00A 1I6QA 3TTNA 3MEJA 1JW1A 1US5A 4RJZA 3RGYA 4ECFA 1PB7A 1AIVA 3IB0A 4BDNA 1MDQA 3U72A 4G77A 2I4CA 1O64A 3P7IA 4ELPA 1A8FA 1IQ7A 1BLFA 3RTWB 2R71A 1R1NA 3O6GA 1A8EA 4OENA 4F1YA 3QUFA 4JSOA 4H6DA 3FXRA 1JNFA 4WKMA 1IXHA 2DXYA 4ZDMA 3SERA 4ZZEA 2Z22A 4OFOA 1M5BA 2HQ0A 2B65A 4THIA 1B52A 3UIFA 3A09A 5CMKA 4ELQA 4Q30B 1Q1KA 4GWOA 3M3KA 1H3DA 4NF4B 3TKDA 1PC3A 4OWDA 4MF3A 4GLIA 5CC2A 5JEIA 3HCQA 1EZPA 3LUYA 3C35A 4C0RA 4JDFA 3K6VA 3ODBA 1IEJA 4YKIA 2V3QA 1ZIUA 3OSRA 4ESXA 5FTIA 3C31A 2OBGA 4M4GA 4U2RA 3D4GA 3ZKLA 5H8NA 4H8IA 2Q8JA 1Y1ZA 5TPAB 1N0TA 1Z7ME 4X48A 2DQVA 4KHZE 5I57A 1TWYA 1I69A 4POWA 5J1DA 2XX9A 1BP5A 4F39A 4PFYA 1DPEA 1B5HA 2AIXA 2Z8EA 1VSOA 1XC1A 1UTBA 2ZNUA 2ANJA 1JEVA 5CMMA 4F31B 3GXAA 1B3LA 1PBPA 4OERA 5ISUA 1Y3PA 2QMWA 3SESA 3DLNA 3N26A 1XS5A 3MVZA 1B2HA 3FVNA 3IR1A 4BDRA 2GHAA 1LLSA 2V84A 5I58A 1T0KA 1F9BA 3FVKA 4F3GA 4FIMA 1LFHA 3K01A 4GXSB 4PE5B 1D3KA 3CFLA 3ILUB 3BFUA 2M8CA 2XXYA 5I59A 3M3LA 2OLBA 4LA9A 3CG1A 5M2VA 1B58A 2UYFA 1EH3A 1USYH 1PB9A 3CG3A 3TUSA 2Y7WA 1S50A 1FQFA 1LFGA 3MVWA 5H8NB 2DE2A 5BWJA 1MDP1 3EPEA 2HFBA 5I2KB 1YTVA 4H5FA 4LP2B 3A3CA 4ZEFA 1OVTA 3TEPA 5I57B 3TYHA 4ZECA 3C34A 5H8QA 5FHMA 3VXBA 2F36A 3CRBA 1FQDA 4IO5A 1MQJA 3IO6A 3K0VA 5L9OA 1NNPA 4PFUA 2O7IA 1IXCA 2F78A 1JW4A 3MAMA 2O1LA 5DVIA 3TTKA 3EHTA 1FTMA 3Q28A 2O51A 1IXGA 2QL3A 4XIGQ 1FTJA 4JWOA 4KCDA 4R74A 3QXMA 1MXYA 3M3FA 3EN3A 3RN8A 4R6YA 4ZE9A 3FZVA 4JWYA 4YKJA 5FHOA 4QFKA 1BKAA 4TLMB 3KSXA 2XHDA 1MY2A 1URDA 3S9MC 4HCWA 1D9VA 1UTHA 3MPKA 4DIGA 3VVDA 2P1SA 1KWHA 4RK9A 4OEVA 2DP8A 3CSGA 4XTCQ 1HSEA 2I3VA 3CVGA 1MH3A 5ICQA 1IXIA 4P11A 4KYSA 4YKPA 3W9VA 2AL4A 3S9LC 1LB8A 2H9BA 2XXTA 3RUMA 2OCUA 3BBRA 1NNFA 3GBBA 4N6PA 1M5DA 4MLVA 2ZMBA 1RYOA 3O6IA 4OFJA 2R9JA 3IJOB 1B05A 4NF8A 4PETA 5H8QB 4ND9A 1B5IA 4R75A 1FQEA 1MQDA 1HSJA 4RA1A 1DOTA 2F35A 2YJPA 3FASA 1FTLA 4JB7A 2REJA 1FTKA 4F1UA 1M5CA 1P1QA 3ZKKA 1QUIA 1LCTA 1N3WA 1NH7A 4C1TA 2Z8FA 5CI5A 1QULA 4WEPA 3NXHA 1SW4A 4F29A 5F7VA 4P0IA 4M1VA 1UIVA 3MWBA 4F2OA 3KN8A 1MXXA 3H03A 4F19A 3PPOA 5AE4A 1H76A 2E1SA 1JVYA 3O2AA 2O1MA 1UTHB 3VE1B 4EQ9A 1SW1A 2IA4A 3PPPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Y3QA 5L8DA 3ME5A 4GWZA 2X26A 2XXPA 4JXIA 4DCXA 1VFEA 4G8MA 4TLLB 5F24A 3MZBA 3SETA 5I5PA 1VFDA 4O3CA 4FORA 3KJTA 2ZYKA 4FAJA 4PU3C 1ZS4A 3TCFA 4AB5A 4G68A 2PYYA 4U4SA 3UP9A 2L5VA 2F6GA 1TFDA 3MUQA 3V8XB 4NWCA 2O69A 2XI8A 1JH9A 2I58A 3C4MA 4NGUA 3N6UA 3R6UA 2CEYA 4EKIA 3T9XB 1LAGE 1LBCA 1AU7A 5AA2D 1SYHA 4F1VA 3FD3A 1DULA 2XWOA 5CBSA 1DMBA 1ZBMA 4NWDA 1R69A 4EQZA 1MXWA 4DI3D 4X4CA 4LONB 2XX7A 4QHQA 3H4ZA 2R6GE 4OETA 4H65A 2UVHA 2D21A 2RKMA 4LZ8A 5EHMA 1B0LA 4LUBA 1FQCA 3K1MA 1GT0C 4JVIA 1ELJA 2HCNA 3TFLA 3KEIA 2DWAA 2ZZVA 4RPOA 1SYIA 1B3EA 3LUZA 1O7TA 1WODA 4JSDA 1OIBA 3RQTA 4EXKA 1N7WA 3VXCA 3EF7A 4Z5HA 3ECRA 4NF6B 4BDOA 1IMCA 4YMAA 3DNVB 5ET5A 3OO7A 3F51A 2DYXA 4OXVA 4YBAA 3FVGA 1DBZA 1EYJA 2LLVA 1MY3A 2IU7A 4FJPA 4E0XA 1TFAA 2KPJA 2IVBA 4NTLA 1CB6A 3IB1A 4GWUA 4XFEA 2PXUA 2HXWA 1Q35A 3FV2A 4IO3A 4NF4A 1FBFA 3MJNA 1E3OC 5H8HA 4ISUA 3QWGA 3CI8A 5JK4A 4G68B 3CHGA 2JVLA 2XXAA 3L6GA 1URGA 3G0TA 3G3KA 4QRZA 2THIA 4RXLA 3H6UA 1ZJLA 2I49A 3TTMA 3O6HA 5AA4A 2BJIA 3FJMA 1QKAA 2PPXA 2LYPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3MWB A;  4F2O A;  3KN8 A;  4AS5 A;  1SQ8 A;  1MXX A;  2VPO A;  3H03 A;  4F19 A;  3PPO A;  2XXK A;  5AE4 A;  4GWW A;  1H76 A;  4YAR A;  2E1S A;  1JVY A;  2AXV A;  3O2A A;  2O1M A;  1UTH B;  3VE1 B;  3BDN A;  3FYA A;  4EQ9 A;  1SW1 A;  2IA4 A;  3PPP A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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