3TEPA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and magnesium ion
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPRDAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords CPS2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 125
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3tepA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tepA01
1IZ1A 2PYYA 4QSDA 5EYFA 2O51A 5AA2A 3VVFA 4BDMA 3MWBA 3PUVE 1AMFA 3H6TA 1XVXA 1II5A 1URDA 3HHFA 4AQ4A 2Z22A 1B51A 5I2KB 3G7WA 4I8CA 1D9YA 5KDTB 5DVJA 3KSJA 1FTKA 2Z8DA 2UYFA 2O7IA 3OXNA 4EQBA 1B0LA 4R9GA 3RT8A 4ESXA 4HTGA 3MP8A 2I49A 4KD5A 4I62A 1ELJA 4KYEA 3BKIB 1MXXA 4P0IA 1GTKA 3KEIA 2DWJA 3K2DA 3TCFA 3S9LC 1GGGA 1ZU0A 2XXHA 1A8FA 2QS2A 3FJ7A 3CI8A 2V84A 2NOOA 2CZLA 2BJJX 4JB7A 1FQDA 3K1NA 2FNCA 4XTCQ 3O97A 4E0WA 1EZOA 1MS7A 5FTIA 2Y7IA 2DVCA 1BIYA 4EQ9A 4IGRA 4XKPA 2DSFA 2F36A 2B65A 3R7XA 2PT1A 4U4XA 1IITA 1I6QA 4LZ7A 2E1SA 4F19A 3GZGA 3GLBA 4YICA 4JDFA 2ONKE 1A54A 4YB7A 3LSXA 4ZS9A 4F1UA 1UTBA 4R2FA 4F39A 5BWJA 2I48A 4XKRA 3FJGA 3G3KA 1LB9A 3TODA 4G68A 1A40A 3PU5A 4JWOA 3ZKKA 1B52A 4G8NA 1DPPA 4XKQA 2VD3A 1B5JA 5AE4A 1N84A 3M3KA 1Y20A 1EU8A 3S9EA 3OSRA 5H8FA 1MH4A 3N26A 2H4IA 3QFIA 5ITOA 5FHNA 5FHMA 3G3IA 4OWDA 2WKYA 2V3TA 4U22A 3MJNA 4KHZE 1UTBB 4HCYA 2D3IA 3RPWA 4JSDA 1EH3A 3WAEA 4OQOA 4G68B 3FV2A 2HZLA 4OXVA 3FXQA 4U1ZA 5AA3A 4YKJA 1FQFA 1OMPA 3CFXA 1LFIA 3IJOB 3PPQA 4GD5A 3IB0A 1MXVA 1LAFE 2V93A 1B3EA 4MLQA 3IX1A 5H8FB 4DZ1A 3LSWA 4P11A 1A7LA 4DCXA 2OLBA 2HZKA 4FEDA 3EHSA 3E4RA 1FQEA 4KPTA 1AH5A 2X26A 3CG3A 2GFEA 2XX9A 4BLAA 1A8EA 1OVTA 1LAXA 2QMWA 2UYEA 1N3XA 4IO7A 1S50A 3Q29A 4QFOA 4LONB 3MC2A 3C31A 3IB2A 2G29A 2RKMA 1SDXA 3C9HA 2F35A 4F1YA 2OJTA 3RY3A 4EXKA 3MEJA 2O6AA 2Z8FA 4KCDA 1LAGE 1MQHA 4BDLA 3GBAA 1BKAA 4OYVA 4G8MA 4H67A 4F3PA 1B0HA 4NF6A 3F11A 2A5TA 5ISUA 1JW5A 3KOSA 2HEUA 4ZEBA 1H3DA 3PPOA 3V89B 1GVCA 2ZMBA 2XX7A 1N0TA 3QUFA 1NL5A 5AA4B 1US5A 4IO6A 1P1QA 3P7IA 4DE9A 1JEVA 4YKIA 4FJPA 1N04A 3IO6A 1OVBA 5CMCA 5ELVA 1LGBC 1IXHA 3VVDA 1M5BA 2HQ0A 4QFPA 1B3FA 2B3BA 4DXUA 3VXCA 4QSEA 3FVKA 4PETA 1TXFA 3VFJA 2A5TB 2PT2A 1SBPA 1NFTA 4BDRA 3W9VA 1MXUA 3FASA 1M5CA 1NNKA 1JW4A 1LCFA 3CFZA 3CFLA 1MQIA 1XT8A 2M8CA 3L6HA 4Q5TA 3TCHA 2DQVA 1B3LA 5DT6A 3FATA 2AL4A 1FTJA 5HBCA 3G3JA 3G3FA 4FEBA 4F22A 3O6IA 1FTMA 1XHYA 2ONSA 3HN0A 2FA7A 3RT6B 4IB2A 1MPCA 4TLMB 2DWAA 3EPEA 3FV1A 3O28A 5AA1A 5HM4B 3KSXA 3FZVA 5CBSA 3WAFA 3R26A 3QIMA 3MPKA 3USDA 2W7YA 4MFIA 3H06B 2OBGA 3OOAA 1PEBA 3ZSFA 2H9BA 3C36A 3S2VA 4G2ZA 4JBZA 3VDFA 1B3HA 3MZBA 5J1DA 3UK4A 2I6EA 4ONYA 4U21A 2NXOA 2XXXA 3H6VA 2F97A 3O29A 3IR1A 1B9JA 3IOWA 2XXRA 3HO7A 1POTA 3QK6A 1SW2A 2ZYNA 2PVUA 1SQYA 2Q8JA 2R9JA 3GXAA 1FQCA 2XXPA 2I4BA 4DE8A 4YB6A 4OETA 1RKMA 3QUJA 3B6TA 3BFUA 4NMYA 1LAHE 5K2XA 2F7AA 4OHNA 1ZTYA 4YKPA 5ICQA 2UVGA 1GV8A 2H98A 3DM0A 2YLNA 4FE8A 2RC9A 1UTHA 4Z0IA 1R9LA 5I2KA 4X9TA 2RCAA 2O68A 3Q28A 1Y4TA 1OQHA 1ATGA 3K6WA 3CRBA 4X48A 5FTHA 3MVWA 3ECRA 3CIJA 5DVIA 1N7XA 3FVOA 1A99A 3SESA 5B7DA 2QSXA 4MBPA 3RLFE 3QXMA 3I3VA 2ZYOA 3O6HA 4RA1A 1MRPA 2DP8A 3S9MC 4GL0A 3OO9A 3W15C 1QUJA 3TELA 3K1MA 1UTHB 2FYIA 3SETA 5CM6A 1ZMGA 1MY0A 1Y1ZA 2ZNTA 3MZ1A 1FTLA 4QFLA 1M5DA 3MPLA 4NE4A 1DTZA 4H5FA 4OFOA 1B4ZA 2ONRA 1CE2A 3OO8A 5I2NA 3H4ZA 4ECFA 3IB1A 2X7PA 3PD9A 2Z8EA 4EF2A 2YPNA 3CSBA 3C32A 1IEJA 3N6TA 2VP1A 1YTVA 2ZNSA 4ELPA 4FIMA 3MAMA 2PX1A 4GVOA 2Y7PA 3JV9A 3H03A 4OEUA 1SI1A 4IO3A 3FXUA 4BDNA 1WODA 1HSEA 1B05A 2O1MA 5DVFA 3M3FA 4MH5A 1JQFA 2UVIA 4AB6A 4ZEFA 2V3UA 5TP9B 5I2NB 3TTKA 1MM7A 3OEKA 4R2BA 1BLFA 1B32A 4OBMA 4TQUQ 2O84X 4I1DA 3RGYA 5ICTA 4ZEIA 1SVXB 4FECA 1B58A 3UA8A 3ZS6A 4ELRA 3V5AA 2DWIA 4GWOA 1AL3A 2D5WA 3T9HB 1N76A 4GF8A 3OO6A 3T9UA 4RXLA 4KQPA 3D4GA 2Q2AA 4Q0CA 3VLUA 4RPNA 3G3GA 4YU0A 1P1WA 1Y3NA 1DSNA 1USYH 3TMGA 1FW0A 2QS3A 2RC7A 2QS4A 4GL8A 2DS9A 2P2AA 4H1XA 1LB8A 1OLAA 4ND9A 1YPNA 2F6GA 3AXFA 3MVZA 1ZJLA 4H6DA 5A5XA 1Y3PA 4OZ9A 1B7UA 1NKXA 2OWTA 5I57A 5H8HB 1MY3A 3A3UA 5L9SA 2V3QA 4F2QA 1OQGA 4IY6A 3S4UA 2F7CA 4LZ5A 1SYHA 5DYHA 4O3AA 2HFBA 3MP1A 5L9MA 1M5EA 4XIGQ 3MUQA 1RYOA 5KZTA 2OCUA 4FATA 3V83A 3BFTA 2ZYKA 4KI0E 2ZNUA 3U72A 4GXSB 3SEVA 5CBRA 1B5HA 4HS7A 3KJTA 3MBPA 1B3GA 2NVUB 4GXAA 1SW5A 3KJ7A 4F3SA 4QRZA 4OERA 5A5XB 2DE4A 5I57B 4QSCA 1DTGA 3HCQA 5AA4A 1BTJA 4PE5B 4NF4A 3V8XB 5I59A 4IY5A 4JXIA 3K6VA 4NF5A 3PMXA 3K4UA 4WEDA 2AYSA 2OWSA 3VV5A 5LOMA 1GR2A 5CC2A 3LR1A 2I58A 1MH3A 2O7UA 3TZAA 4WEPA 3HV1A 4EF1A 1R6ZA 1QVSA 5IKBA 2Y7KA 2AIXA 1H43A 2ZYMA 3KBRA 3THIA 3TTLA 3OSQA 1B46A 4ISUA 4U23A 4GFRA 3K00A 5I56A 4NF4B 5I59B 3TAJA 5KCJA 1O64A 2A5SA 3LC8A 1FTOA 4NF5B 3FVNA 3QSLA 2G93A 3M8UA 3OO7A 1LLSA 1MQDA 3FGSA 4R74A 1B1HA 3FIRA 1MG1A 3PPPA 4QFKA 1Y9UA 2B3FA 5H8SA 1D3KA 3DP8A 2OK2A 1MY2A 1B7ZA 2YJPA 4HW8A 3NXHA 1TWYA 1FQBA 2QRYA 1TFDA 3D4CA 4ZZEA 3U8QA 3IOTA 4F31B 1US4A 3RTWB 5I56B 3T93B 1Z7ME 1EZ9A 3HSTA 3PD8A 5KCJB 2DWHA 1YCJA 3CSGA 3H3GA 1DOTA 1QKBA 2I3VA 3PUZE 4RNSA 2HXWA 1SYIA 4EXLA 4X1BA 4ELOA 4IO5A 1R1NA 1JVYA 1OLCA 5H8QA 3JZJA 4RK9A 4G4PA 2DXYA 1Y3QA 4U2RA 1IUDA 1MXWA 4UACA 1MPDA 4LQ5A 1YAEA 3K6XA 4MLVA 5L8DA 1JVXA 4C0RA 2DE3A 1EZPA 4I9DA 3FUZA 4X1DA 5H8NB 4MF3A 3MW0A 3KN7A 1CB6A 2DXRA 4THIA 4BDOA 3MVYA 5H8QB 1LSTA 4ZE9A 4R73A 3ZKLA 4UA8A 1Y1MA 2H99A 1JNFA 4M4GA 2QJEA 3IO4A 2RINA 1DMBA 4LATA 3K01A 3DP6A 3TPAA 4NTLA 5DEXB 2F6PA 2GRVA 3EHTA 4OESA 4YB5A 3KN3A 4DIGA 4BDQA 1AIVA 3TYHA 3U94A 2KLFA 4XKNA 1ZLQA 4G77A 1I6BA 1L5TA 1I6AA 3TDJA 1IXCA 3E13X 1Y4CA 5F7VA 2Q89A 1MDQA 3TFLA 1P99A 1Q35A 2QS1A 2O1LA 4PQJA 5CMMA 3SEWA 2F5XA 1S9TA 4ZE8A 5JEIA 3GBBA 4E0XA 4XXUA 1P1OA 2I0BA 3Q26A 3MVXA 1KWHA 1R9QA 1D4NA 2VD2A 4OENA 1SW4A 4HCWA 1H76A 4YAHX 5CMKA 4C1UA 3K02A 1B7HA 3SEXA 3JYRA 1B1XA 3UN6A 2P1SA 5AA2D 3M3LA 1P1UA 4ZZAA 3H6UA 1ANFA 4PFUA 3N94A 3OMBA 4ESWA 1HSLA 4RJZA 3SKPA 1JEUA 1O7TA 3KZGA 3MP6A 3TCGA 1MM6A 3A3CA 2IA4A 2XHDA 4U1OA 4Q8RA 1H44A 2H5YA 4KYSA 4ELQA 5EHSA 3LBSA 3B6QA 5ITPA 2O69A 1WDNA 3TTRA 4F3BA 4N6PA 1A55A 4WKMA 1NMUA 5TPAB 3TTMA 2Y7WA 1XVYA 3KOTA 2XD2A 4GLIA 1SD3A 2P0SA 2PMSA 4NF8A 1LCTA 5TP9A 3OENA 4PFTA 4NWDA 1HSJA 5AA2B 2ESNA 4C1TA 4F3GA 4Z7EA 3G3HA 3MQ9A 3KG2A 3HHGA 2XX8A 4LQ2A 2XXQA 1ZBMA 5F1QA 3LSFB 1QULA 3CVGA 4QF9A 3RQTA 4H0WA 4R9FA 3FJMA 3PMWA 3A09A 3IOVA 4R6KA 2F7BA 3T22A 1Z7NE 1UIUA 3NROA 4NF8B 1I69A 1MY1A 4AB5A 3ILUB 4R6HA 4F29A 1NNFA 3Q25A 2QPQA 1NNTA 4DXCA 5FHOA 3KGCA 4YZZA 5H8HA 5L9OA 1JW1A 1FQAA 2GH9A 3SERA 4QHQA 2UVJA 3PGFA 2ANJA 3EF7A 2DE2A 3O6GA 1URSA 3O66A 2XD3A 3VLVA 4JWYA 1NH8A 2Q9TA 3VXBA 1PB9A 3H7MA 4LP2B 3PPRA 4TLLB 3OKZA 3CR9A 4OMBA 1IXGA 3T96B 4FORA 2NWJA 3I6VA 2ZXTA 3TQLA 5JK4A 3BBRA 3I5OA 3QAXA 4NEDA 3FVGA 3K0VA 4H8IA 1PC3A 2THIA 3IOUA 4EQ7A 4OEVA 4JSOA 2D21A 4M1VA 4RY1A 4RK2A 3VE1B 2GHAA 3C34A 3K1PA 1SI0A 1MXZA 4OTEA 1PBPA 3S9NC 2DVZA 4U4SA 2V25A 2XXYA 3E3KA 4ZECA 1TFAA 4ZEKA 2QL3A 1NNPA 3U92A 5BUUA 1MQJA 1MXYA 4O3BA 1UQWA 3T9XB 1IXIA 3C35A 4K3FA 1ZKBA 4EDPA 3VLWA 3VVEA 2Y84A 4YMAA 3PUWE 4O3CA 1POY1 3SEYA 4F18A 1IQ7A 3UORA 3TUSA 3L6GA 4LA9A 3B6WA 1B4HA 1PB8A 4TOZA 3RTFB 2QMXA 2XXIA 4H5GA 4OFLA 2H25A 1JETA 3DELB 4OFJA 4P0GA 2PBWA 4LZ8A 1PDAA 1QW0A 1IIWA 1RYXA 2XXUA 3IK6B 2REJA 2Z23A 3IAZA 5B70A 1XOCA 4GRKA 2REGA 3TEPA 3DLNA 4DXBA 1S7YA 3PV0E 2RF1A 3UP9A 3LUYA 4R6YA 3PE5A 3PPNA 4N07A 4DDDA 4POXA 5DTBA 1F9BA 2F78A 2X7QA 1PBQA 5CRYA 4PFWA 1QKAA 3CG1A 4KFQA 4RPOA 1QUIA 3FXRA 3H6WA 5TU0A 5JTYA 3T66A 1M5FA 3DP4A 1SW1A 4LUBA 5K2YA 3U1OA 3OWQA 2DOJA 4QFNA 5HPQA 3EHUA 4H65A 3O2AA 4L17A 4KR5A 2IEEA 2UVHA 1UIVA 2XXTA 1B5IA 2AL5A 2NUVA 1URGA 4NF6B 2CMOA 3O9PA 3UIFA 3ONMA 1MQGA 5M2VA 3C4MA 1PB7A 3R6UA 3EQ1A 5H8NA 2RC8A 3N5LA 3Q27A 4N13A 3C33A 2Q88A 3SDFA 2R71A 3IL1B 3UGWA 4DCYA 4F1VA 5JTYB 3HPIA 1MPBA 1TT1A 4RYAA 2E0SA 2R6GE 4EUOA 4YMBA 1O63A 1LBCA 4PP0A 3ODBA 3PMVA 5EHMA 1VR5A 3MZ9A 4FAJA 4GOTA 3PUXE 3RN8A 3QYTA 3B7DA 3LSLA 1Q1KA 4NWCA 1QJMA 5DEXA 4G68C 4JWXA 1LBBA 1VFDA 1QUKA 5I84A 4IGTA 3OEMA 2I0CA 4IO4A 3N6UA 4Q30B 4OVJA 4LVQA 1N3WA 4ZEDA 4POWA 2Y7RA 2LAOA 2Q2CA 4DLDA 4WXJA 1N7WA 2ALUA 4GIZA 4KYDA 1USYE 4PFYA 3T9VA 2VOZA 1B2HA 2VGQA 1NH7A 3E9XA 5CMBA 3TQWA 2F8DA 3IORA 4G8HA 2UXAA 3PUYE 1VFEA 3FD3A 5IAIA 1H45A 2HAVA 3RUMA 2F34A 1P1NA 1MDP1 2ABHA 1J1NA 3OELA 1LFHA 1T0KA 5I58A 4ZDMA 2VHAA 1WVJA 1VSOA 2I4CA 1VE4A 2XXVA 1B6HA 1LFGA 3ILTB 4KCCA 3RNNA 4GQOA 1MY4A 4R75A 2RCBA 4R72A 3KFMA 1XS5A 1BP5A 3W9WA 2GHBA 2HAUA 1OIBA 1ZIUA 5CI5A 2HCAA 3KN8A 2DYXA 3IJXB 1FCKA 2I3WA 3EN3A 4YKKA 3K6UA 3SEUA 4IO2A 5I58B 3TTNA 4F2OA 3TKDA 1B40A 1XC1A 1DPEA 5TPAA 3OD7A 4H8JA 5KDTA 1AOVA 1D9VA 3U93A 2OZZA 2XXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IZ1A 1NEQA 2PYYA 4QSDA 5EYFA 4N6KA 2O51A 4GX6A 4J1XA 1DBZA 5AA2A 3VVFA 3HZIB 5F24A 4BDMA 3MWBA 3PUVE 1AMFA 3H6TA 1XVXA 4AS5A 1X57A 1FPDA 1II5A 1URDA 3FBPA 3HHFA 3ZHIA 4AQ4A 2Z22A 1FBDA 1B51A 5I2KB 4PAKA 4X04A 3G7WA 4I8CA 2OX3A 1D9YA 2WYKA 5KDTB 5DVJA 3KSJA 1FTKA 4N8GA 2Z8DA 2UYFA 2O7IA 3OXNA 4EQBA 1B0LA 4R9GA 3RT8A 4ESXA 4HTGA 3MP8A 2I49A 4KD5A 4I62A 2XXKA 1ELJA 4KYEA 3BKIB 4QXDA 1MXXA 4P0IA 4I6UA 1GTKA 3ISPA 3EUSA 1ZZ7A 3G0TA 2DWJA 3KEIA 3K2DA 3TCFA 3S9LC 1GGGA 3A9YA 1ZU0A 2XXHA 1A8FA 4IR8A 2QS2A 2LYJA 2LYPA 1FRPA 3FJ7A 3CI8A 2V84A 2NOOA 2CZLA 2BJJX 4JB7A 1FQDA 3K1NA 2FNCA 4XTCQ 3O97A 4E0WA 2FIXA 1EZOA 1MS7A 5FTIA 2Y7IA 2DVCA 4H46A 1BIYA 4EQ9A 2DDKA 4IGRA 4XKPA 4OVPA 2DSFA 2F36A 2B65A 3R7XA 2PT1A 4U4XA 1IITA 4HE1A 1I6QA 4LZ7A 2E1SA 1RDXA 1NERA 4F19A 3GZGA 3GLBA 3RZZA 4YICA 5I5PA 4JDFA 2ONKE 1A54A 4YB7A 3LSXA 4ZS9A 4F1UA 1UTBA 1OCTC 2KZ8A 3PXPA 4R2FA 4F39A 1FPKA 1PNRA 2I48A 4XKRA 5BWJA 3FJGA 3G3KA 1LB9A 3TODA 4G68A 1A40A 4GWYA 3PU5A 4JWOA 3ZKKA 1B52A 4G8NA 4F8DA 1DPPA 4XKQA 2VD3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3SEU A;  5EQA A;  4IO2 A;  5I58 B;  1S7E A;  2CZK A;  3TTN A;  4F2O A;  3KC0 A;  3TKD A;  1B40 A;  4HXV A;  1XC1 A;  4LN5 A;  1DPE A;  5TPA A;  3OD7 A;  4H8J A;  2Y5K A;  5KDT A;  1AOV A;  2VT5 A;  1D9V A;  3U93 A;  4ER3 A;  2OZZ A;  3G7D A;  2XXW A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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