3TFLA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
371
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPRDAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords CPS2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 129
structure length 371
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3tflA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tflA01
5CBSA 3KN8A 2O1MA 1B3LA 3K6XA 4YMAA 4OENA 5EHMA 2P1SA 3MBPA 4POWA 4JWOA 3UA8A 3ILTB 3VFJA 3T22A 1BLFA 3C33A 4QSEA 3KSXA 3TDJA 3L6GA 1IZ1A 1USYE 1MQJA 3TCGA 3D4CA 3QUFA 3MZBA 3D4GA 4ZEFA 2G29A 2DOJA 4GQOA 5ITPA 1SD3A 4OFLA 3N5LA 1SW1A 3UORA 4EF1A 3ILUB 1MQDA 3IOVA 2GRVA 4OEUA 3EHUA 1XVYA 2HAUA 1MH3A 1D9VA 4DE8A 4OEVA 3SEVA 3LSLA 2G93A 2QJEA 2ESNA 3UIFA 3LSFB 2DE2A 1OMPA 4EF2A 4AQ4A 4F29A 2ONSA 1QUIA 1JETA 4XKNA 5TPAB 4YB6A 4M1VA 4RK9A 3KJ7A 3MVYA 3C36A 2ZYOA 5CBRA 4ESWA 1RKMA 4F1UA 4RYAA 1TWYA 2VP1A 3RLFE 5I84A 4YKKA 4IO6A 2YJPA 2H5YA 3GBBA 2QMXA 1DMBA 2WKYA 3HV1A 5B7DA 3K6UA 1GTKA 1YCJA 3EQ1A 1GR2A 3E3KA 4THIA 1S50A 2DVCA 2B3BA 4NF5B 3H6UA 2VGQA 4H0WA 4ZECA 1FTJA 3TFLA 2RCAA 5KDTB 1QUKA 4OTEA 2Y7WA 5B70A 1Y1MA 1HSJA 2DYXA 3V89B 5AA2D 1OVTA 4I8CA 4KPTA 3RN8A 3W9VA 4ZE9A 1US5A 2Q2AA 2XXPA 3IK6B 3FJ7A 1AL3A 1D9YA 4GWOA 5L9OA 1SBPA 3M3KA 1LCTA 1F9BA 1II5A 3PV0E 4PFTA 1FTMA 4R2FA 2RF1A 1XHYA 2Z8DA 2F97A 2R9JA 1JQFA 3U92A 4DE9A 4DIGA 3TAJA 2AL5A 2UVGA 5HM4B 2DXRA 2PT1A 5DVFA 1A7LA 3FUZA 5AA2A 3MP8A 4G8HA 4IGTA 3K1PA 2DVZA 5CRYA 2F6PA 3A3UA 3FV2A 3MQ9A 1B1HA 3PUVE 3RNNA 3H3GA 2OZZA 3FXUA 4OQOA 1POY1 1Y9UA 1PC3A 3TTNA 1Y4CA 4ZEIA 1H43A 1Y4TA 3VVEA 3T9HB 4POXA 3RTFB 3I3VA 5DTBA 2Y7PA 1QJMA 4PFUA 4BDOA 1VFDA 2O69A 1FW0A 4UA8A 2XD3A 3SEUA 2YLNA 3VV5A 1MY1A 2RC9A 3FVNA 1NKXA 4OETA 5H8SA 4ZEKA 2DSFA 2XX8A 5TPAA 2RINA 2F7CA 3JYRA 3N6UA 1WVJA 2QRYA 1S9TA 2OBGA 2F5XA 1MXWA 4WEDA 1Y3NA 1B7ZA 3TQLA 1P1OA 3TCHA 1LCFA 4E0XA 3BBRA 4OBMA 4EXLA 4RPOA 3O66A 4PP0A 4OXVA 1A8EA 3L6HA 3SDFA 4U1ZA 3FVGA 4F2QA 1O7TA 4NWCA 3UP9A 1UTHB 2OWTA 4GD5A 1DTZA 4Q0CA 5KZTA 1LB8A 4NF5A 1GV8A 4RNSA 2LAOA 3CIJA 2F7BA 3TTRA 1LAGE 1MPDA 5L8DA 1XC1A 4G8MA 2ZYMA 3OMBA 3QXMA 3HHGA 2XX9A 3U72A 4LVQA 2I0CA 1MY4A 1LGBC 3JV9A 3RUMA 3PGFA 2Y7IA 1B05A 3B6QA 4U22A 4R9FA 3RT8A 2I6EA 3PMXA 2GHAA 3TQWA 3USDA 5TU0A 3NROA 1TFAA 4GIZA 3TMGA 1JVYA 2O84X 4H1XA 3PUWE 4KFQA 4G68C 3HPIA 4YKPA 3V5AA 1Q35A 5KCJB 4OERA 2KLFA 4GF8A 4Q5TA 1BTJA 1IXGA 4KD5A 1P1QA 4DXBA 3EPEA 1NH8A 1XOCA 3R26A 4ZZEA 1ZKBA 3TKDA 1H3DA 5FHOA 4F3BA 3TTKA 3WAFA 3N26A 1LSTA 2H25A 3JZJA 3P7IA 3W15C 4JWXA 5I59B 3CFLA 4HCYA 3DP6A 4IY6A 4QF9A 4U1OA 5DEXA 2B3FA 1ZTYA 1UIUA 3M3FA 2Q88A 3DP8A 5K2YA 4GOTA 1NFTA 3MPLA 4YU0A 3Q27A 1Y1ZA 5DYHA 4LQ2A 2DXYA 4Q8RA 4P0IA 1FQCA 3S2VA 1TFDA 4R6KA 1URSA 3G3KA 2QMWA 3OOAA 3RGYA 1LLSA 3FIRA 2GFEA 4X48A 1LAHE 2D3IA 1M5EA 2A5TA 3KG2A 1MQHA 1OQHA 4QFPA 3VDFA 1NMUA 4EDPA 4H5FA 3GLBA 5ICTA 3S9LC 3TUSA 3O9PA 1A55A 1VR5A 2XXTA 4TLMB 1ZJLA 1UTHA 5ITOA 1UTBA 4LATA 3MC2A 4QSDA 3Q26A 3MJNA 2XXHA 1OLAA 3MUQA 2XD2A 3UGWA 4NTLA 2XXVA 3KOSA 1SI1A 5F1QA 3FV1A 5HBCA 1T0KA 1N7XA 3PPQA 3Q29A 1IXHA 3KOTA 1MG1A 3T9UA 3G3GA 2HZKA 4AB6A 1GVCA 4YB5A 4U4XA 4O3AA 4HCWA 2XXXA 2Z23A 4KHZE 2XHDA 3T9VA 2HXWA 2RCBA 3ODBA 1MH4A 2X7QA 3MZ9A 4N13A 2PMSA 1MQIA 5AA2B 2V3TA 3DELB 4OFOA 4XIGQ 2R6GE 3UN6A 1QUJA 3H03A 5KCJA 3LUYA 4QFNA 1H45A 2Z8FA 1RYOA 2W7YA 4F22A 4LQ5A 3THIA 2QS1A 2NVUB 1PB7A 1B52A 5H8QB 1B3FA 1MS7A 3QSLA 1OVBA 4H8IA 4YICA 3OWQA 2AIXA 1B46A 2O1LA 2H9BA 2P0SA 2P2AA 3ZKKA 5I59A 1MM6A 3SESA 3FZVA 3IOUA 3MEJA 4KI0E 5I58B 1ELJA 2DS9A 4ELPA 4FJPA 5LOMA 1MQGA 3IJXB 4U23A 4YB7A 4OVJA 2OJTA 5I56A 4I62A 4H67A 1LAFE 4KR5A 1O63A 4OWDA 4FAJA 2O68A 1DOTA 1FTOA 5AA4B 1FCKA 1CB6A 2DE3A 3QK6A 4O3CA 2ALUA 4IO3A 3K6VA 2PVUA 3KN7A 2ANJA 1MPBA 4GL8A 3O2AA 1AIVA 3C9HA 1SW2A 2XXQA 3KZGA 2X26A 1MY2A 1QW0A 3QIMA 2FNCA 3FVKA 4BDNA 3H6VA 3N94A 3HN0A 3CSGA 3TEPA 1SDXA 1N3XA 3SEXA 3B6WA 1MDP1 2H99A 1LFGA 2I0BA 2F6GA 3MW0A 2Z22A 4MLVA 4PETA 1JW5A 1SVXB 4EUOA 4GXSB 1PBQA 1QVSA 1I6BA 1HSEA 3PMVA 4PE5B 3KSJA 4QFLA 3FATA 3ZKLA 1DSNA 5H8FB 4FEDA 3VVDA 1XT8A 3GBAA 1R9LA 3IOTA 4GVOA 3EN3A 2RC8A 1P1NA 2CMOA 3KFMA 1N7WA 4BDLA 3U93A 1SI0A 2XXWA 5FTHA 4ISUA 4U2RA 4OHNA 2ZXTA 3U1OA 4QRZA 3O6HA 4G2ZA 1B0HA 1MY0A 3K4UA 3A3CA 3OEKA 3MP1A 5DVIA 4NEDA 3IJOB 5DEXB 5H8QA 5TP9A 3RTWB 5ICQA 4NF4B 3PPPA 4ZDMA 1JW1A 4X1BA 5CMKA 1PEBA 2O51A 4R6YA 3KBRA 4GXAA 3CSBA 2Q8JA 2Q9TA 1ZBMA 2QS3A 1B5IA 4C0RA 3K1MA 3ZSFA 3W9WA 3PPOA 3IL1B 1J1NA 2NWJA 4N6PA 1QULA 5L9MA 4TQUQ 2V3QA 4F1YA 4GLIA 2FYIA 2CZLA 3VXCA 4IO5A 3WAEA 5I58A 1B4HA 3VLUA 1LBBA 2YPNA 5IKBA 3U8QA 1A8FA 2A5TB 1N0TA 4DXUA 4NMYA 3EHSA 3RQTA 1B3HA 1NH7A 3TZAA 1B1XA 2B65A 4PQJA 1MXYA 5AA4A 1I6QA 5EHSA 1O64A 3V83A 1MXUA 3FGSA 4AB5A 1UTBB 5ELVA 2UVJA 2I3VA 1B4ZA 1M5CA 3C34A 5BWJA 1LFHA 1IXCA 3OO9A 4OZ9A 4Z0IA 2O7UA 3H7MA 2UXAA 4JXIA 2UYEA 4R74A 2HCAA 1SQYA 2H4IA 3T96B 1EH3A 3KN3A 1DPPA 1M5DA 1NNTA 5FHNA 1R6ZA 4RJZA 2NOOA 4ZEDA 1MXVA 4FECA 3TCFA 4U4SA 1WODA 4I1DA 4NWDA 1KWHA 3TODA 4EQ7A 4F3PA 2XXRA 4F1VA 1YAEA 3O29A 3VXBA 5IAIA 2FA7A 3KGCA 2F34A 4Z7EA 3E4RA 4F2OA 3MVXA 4TLLB 4RA1A 5H8FA 3DP4A 2ZYNA 5HPQA 1VFEA 3PD9A 1IITA 1S7YA 1B3EA 4KYDA 3M8UA 5M2VA 3CVGA 1QKAA 1VSOA 3G3FA 5CI5A 5I2KB 3MVWA 4WEPA 3BFTA 1B58A 4RXLA 4KCCA 3S9NC 2ZYKA 1XS5A 1ATGA 2X7PA 3K2DA 3GZGA 1DTGA 2OWSA 4NF4A 3U94A 3OXNA 1MXZA 3MPKA 1JEVA 2A5SA 2GHBA 1B51A 4LA9A 4XKRA 5I56B 4IB2A 1OIBA 4F18A 4LONB 1B0LA 2V3UA 1B5JA 1B32A 1LBCA 2F7AA 4JSDA 3RY3A 3CR9A 5DVJA 4JSOA 2R71A 2REJA 3BFUA 4N07A 2OCUA 4GFRA 4OYVA 3HO7A 4OESA 3CFZA 2DWAA 2XX7A 4IO2A 4WXJA 4F31B 3ZS6A 3E9XA 4G68A 3FJGA 4XKQA 3IO6A 4DLDA 4R73A 4JBZA 4M4GA 3H4ZA 2ONKE 4KQPA 3C35A 1B9JA 4R75A 2BJJX 5F7VA 2F35A 3IR1A 4BDRA 3EF7A 4IGRA 4ZZAA 4TOZA 2V84A 3C4MA 4PFWA 1IEJA 4O3BA 1TXFA 1EU8A 5CM6A 1H76A 2HZLA 4MLQA 5AA1A 4QFKA 3H06B 3H6WA 3G7WA 3I5OA 4EQBA 4C1UA 4DDDA 1Y3PA 3O6GA 4UACA 4JDFA 4FE8A 3K01A 4MH5A 2Q2CA 4LZ7A 3C31A 4ELQA 4G77A 3R7XA 3FVOA 1UQWA 4YZZA 2Z8EA 3IX1A 1EZ9A 5I2NA 2DWJA 1IXIA 3FD3A 1R1NA 5TP9B 4H65A 1SYIA 5JTYB 3T9XB 5JEIA 1OQGA 2VOZA 3QFIA 4LZ8A 5I2KA 2XXYA 2PX1A 3MP6A 2PT2A 2F8DA 4XXUA 1SW4A 4EQ9A 1FQDA 4P0GA 1YPNA 5CMMA 4BLAA 3UK4A 4H5GA 3PU5A 3IO4A 4NE4A 1L5TA 3MZ1A 4R72A 3S4UA 4ZEBA 4U21A 4IY5A 5CC2A 3FJMA 1R9QA 2XXIA 3OELA 1BP5A 2D21A 4Q30B 3K02A 5AA3A 1Y20A 2GH9A 2I4CA 4IO4A 2V93A 4G4PA 2DWHA 2I4BA 1A40A 3LSXA 1Q1KA 1OLCA 1D3KA 3PE5A 4BDQA 3IB2A 5I57B 2UYFA 3C32A 1ANFA 1FTKA 1LAXA 2F78A 4PFYA 1N84A 1A99A 1URGA 3HSTA 5A5XB 1JNFA 3O6IA 2DWIA 1VE4A 1B2HA 4KYSA 2QS4A 3SEWA 3H6TA 4IO7A 3CG1A 4ZS9A 3B7DA 2QL3A 2IEEA 5H8HB 1YTVA 1B7HA 3DLNA 2PBWA 3FXQA 4MBPA 4RY1A 1ZLQA 4OMBA 4ECFA 3O97A 3G3IA 1SYHA 2QPQA 3IORA 2I3WA 2DE4A 5H8NA 4GRKA 1FQEA 3QAXA 3K0VA 3OO8A 4ELRA 1BIYA 4FIMA 4DZ1A 3CFXA 2V25A 4FEBA 2NUVA 4MF3A 3EHTA 4R2BA 4YAHX 2ONRA 4JWYA 4XTCQ 3CI8A 1IQ7A 2AL4A 4GL0A 3F11A 3SETA 1IIWA 1XVXA 3LSWA 1IUDA 4NF8B 1MPCA 1URDA 4ESXA 3PPNA 3OENA 3TYHA 1FQAA 4YMBA 1I6AA 2Q89A 1B7UA 3ONMA 4X9TA 3S9EA 4ZE8A 1N76A 4FATA 3IAZA 4R6HA 1HSLA 3FXRA 4DCYA 1PB8A 4YKIA 2E0SA 1JVXA 1MDQA 2HFBA 2I49A 3N6TA 1M5FA 1QKBA 5JTYA 2I48A 2ABHA 1WDNA 4R9GA 5L9SA 2THIA 3SKPA 2ZNTA 3RT6B 4EXKA 4RPNA 2XXUA 3K1NA 4DCXA 3G3HA 3I6VA 1B3GA 3K6WA 4XKPA 1MY3A 3HHFA 3Q28A 4C1TA 2O6AA 4LUBA 3PPRA 3Q25A 3RPWA 4NF6B 3LR1A 2VHAA 1AOVA 4F19A 2RKMA 1NNKA 2RC7A 1D4NA 1Z7NE 5FHMA 1NNPA 3FASA 4F3SA 2HQ0A 4DXCA 2M8CA 4BDMA 3T93B 4I9DA 3AXFA 3E13X 5CMBA 2REGA 1GGGA 3OSQA 3PD8A 3IOWA 4X1DA 4G68B 3A09A 1P99A 2NXOA 2E1SA 4ND9A 5I57A 2AYSA 3PUXE 2QSXA 1A54A 3TTMA 3GXAA 3TTLA 3M3LA 5A5XA 3HCQA 4ELOA 1PB9A 4H8JA 1FQFA 1ZMGA 2HAVA 4MFIA 1PDAA 1JEUA 4E0WA 5H8HA 2VD3A 1USYH 2VD2A 4JB7A 3VLVA 3PMWA 3T66A 5KDTA 4K3FA 3OO6A 2QS2A 3DM0A 3K00A 3ECRA 1B5HA 1LFIA 2Y7KA 3SERA 3NXHA 3IB1A 2ZMBA 2I58A 3VVFA 1MXXA 2OLBA 5K2XA 1M5BA 1TT1A 1FQBA 3MAMA 1Y3QA 1PBPA 1EZPA 1B6HA 4F3GA 1MRPA 4OFJA 4LZ5A 5JK4A 1BKAA 5EYFA 5I2NB 4KYEA 3R6UA 3MVZA 4H6DA 2HEUA 1I69A 3S9MC 5FTIA 3OO7A 1H44A 1RYXA 3BKIB 1POTA 4NF8A 2H98A 4HW8A 2PYYA 3CRBA 1LB9A 3QUJA 3SEYA 1AH5A 4ONYA 3MWBA 4RK2A 4QFOA 3QYTA 3G3JA 2IA4A 1SW5A 1US4A 5BUUA 4F39A 2Y84A 1ZU0A 4HTGA 1B40A 1NL5A 1P1WA 2UVIA 3VLWA 1UIVA 3IB0A 1FTLA 5ISUA 4QSCA 3CG3A 3V8XB 3TELA 2DP8A 4KCDA 2D5WA 2OK2A 3LC8A 4HS7A 1ZIUA 5CMCA 4YKJA 3OD7A 4NF6A 1Z7ME 1N3WA 3PUYE 1N04A 4FORA 4LP2B 2ZNSA 3KJTA 2DQVA 3VE1B 2O7IA 2ZNUA 3OEMA 5DT6A 1DPEA 2Y7RA 3LBSA 1CE2A 1EZOA 3B6TA 3O28A 4QHQA 3PUZE 2F36A 4G8NA 3OSRA 3TPAA 4P11A 5J1DA 1JW4A 3OKZA 3KEIA 1AMFA 4L17A 4WKMA 2UVHA 5AE4A 1NNFA 5H8NB 1P1UA 1MM7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CBSA 3KN8A 2O1MA 1B3LA 3K6XA 4YMAA 1FPBA 4OENA 5EHMA 2P1SA 3MBPA 4IVZA 4POWA 4JWOA 1LBZA 2HXRA 3UA8A 4WVLA 3ILTB 3VFJA 4PTKA 4N17A 3T22A 5DSXA 1BLFA 3C33A 4N4UA 4QSEA 3KSXA 3TDJA 3L6GA 1IZ1A 1USYE 1MQJA 3TCGA 2VT5A 1BDIA 3L1PA 3D4CA 3QUFA 3MZBA 3D4GA 5IZ3A 1LQCA 4ZEFA 2G29A 4PU3C 2DOJA 1FJ9A 4IWRA 4GQOA 2JJKA 5ITPA 1SD3A 1LCCA 4OFLA 2PXUA 1QQAA 1ZZ7A 2AW6A 3ZPXA 2IVBA 3N5LA 1SW1A 4G61A 3GUUA 3UORA 4EF1A 3ILUB 3QWGA 1MQDA 5DW8A 3IOVA 2GRVA 2QVRA 4OEUA 3EHUA 1XVYA 2HAUA 1MH3A 1D9VA 4DE8A 4OEVA 3SEVA 1NV3A 3LSLA 2AUWA 1OSLA 2G93A 2QJEA 1FPLA 2ESNA 1GT0C 2PUEA 3HFUA 3JXDL 3UIFA 3LSFB 2DE2A 1OMPA 3O9XA 4EF2A 4AQ4A 4F29A 2PPXA 2ONSA 4O8BA 1QUIA 1JETA 4XKNA 4GWZA 5TPAB 4YB6A 4P3LA 4M1VA 4MNIA 5I7IA 4PGNA 4RK9A 4AS5A 3KJ7A 4EZIA 3MVYA 4PBHA 3C36A 2ZYOA 5CBRA 1WETA 4PC9A 4MIJA 4ESWA 1EYJA 1RKMA 4F1UA 4RYAA 1TWYA 2VP1A 1FBDA 1R69A 3RLFE 5I84A 4YKKA 4IO6A 3QF3A 2YJPA 2H5YA 3GBBA 2QMXA 1CNQA 1HQ1A 1DMBA 2WKYA 3HV1A 5B7DA 3K6UA 1GTKA 3CHGA 1YCJA 3EQ1A 2PFZA 1GR2A 3E3KA 4THIA 1S50A 2DVCA 4PF8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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