1ZYLA

Crystal structure of hypothetical protein yihe from escherichia coli
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
SAFTFQTLHPDTIMDALFEHGIRVDSGLTPLNSYENRVYQFQDEDRRRFVVKFYRPERWTADQILEEHQFALQLVNDEVPVAAPVAFNGQTLLNHQGFYFAVFPSVGGRQFEADNIDQMEAVGRYLGRMHQTGRKQLFIHRPTIGLNEYLIEPRKLFEDATLIPSGLKAAFLKATDELIAAVTAHWREDFTVLRLHGDCHAGNILWRDGPMFVDLDDARNGPAVQDLWMLLNGDKAEQRMQLETIIEAYEEFSEFDTAEIGLIEPLRAMRLVYYLAWLMRRWADPAFPKNFPWLTGEDYWLRQTATFIEQAKVLQEPPLQLTPMY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a novel prokaryotic Ser/Thr kinase and its implication in the Cpx stress response pathway.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Escherichia coli
molecule keywords Hypothetical protein yihE
total genus 93
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1zylA02
1.20.1270.170 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 1zylA03
3.30.200.70 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1zylA01
5D9HA 4S31A 3QYWA 2UZVA 4IM2A 4RJ7A 2VWXA 1REKA 5FLFA 3D9VA 1XBAA 4R8QA 4EQUA 4FT0A 5CTPA 3BHTA 3AGLA 5T3QA 4ACHA 4CNHA 5HE3A 4PDOA 1YI6A 5IDNA 4FIEA 5G6VA 3G6HA 3QKKA 5EG3A 5FM3A 4Y8DA 4I4EA 2JKQA 3OT3A 4ZTHA 1E9HA 2CLQA 3H0YA 3LQ8A 4HNFA 5CQWA 4DHFA 5A46A 1GNGA 2YLFA 4AGUA 2V5QA 4W9XA 3FY0A 4WKQA 5FXQA 5B2LA 4FNZA 4PPBA 4IH8A 3OUKA 3CQUA 4CTBA 5CAOA 4NIFB 4L67A 1U54A 3NIZA 3W16A 3GVUA 5CLPA 2XYNA 4WRGA 4MKCA 3HLLA 3ENMA 3OEZA 2ACXA 4L3PA 2X4ZA 3VUHA 1CKJA 4CEGA 3GP0A 3OXTA 4IX5A 1JSUA 2QOKA 1JKSA 3MWUA 5TO8A 5JZJA 3ZFXA 4XHKB 2XKFA 2VTOA 2JDRA 2BFYA 2O5KA 3IDPA 4PWNA 3WZDA 5IU2A 2BTSA 2E9PA 2J51A 2Z2WA 3MW1A 3IW8A 4KIKB 3ORKA 4QP4A 2XIRA 3O17A 2OH4A 3D0EA 3PSDA 3WIKA 3QTRA 2X81A 3R00A 4BZNA 3SW4A 3W2CA 1WVYA 1GIHA 2OJIA 2I0EA 4AAAA 4QMMA 4OW8A 2J6MA 2UVXA 1PW2A 4FK6A 3UZTA 3E3BX 2AC3A 1FGIA 3KXXA 2PL0A 4C34A 5BVWA 5HIBA 4ASEA 3S3IA 1ZOEA 4B0GA 1T45A 5AEPA 5LVPA 3VS4A 3TNWA 4F65A 3JUHA 2PVFA 2ZYBA 4JRVA 4WNOA 4BWXA 3AC8A 5LVOA 2ZAZA 4I0RA 2DUVA 3WF6A 5C1QB 3O0GA 3IGGA 2YJRA 3ANRA 5IA2A 4BDFA 4YTIA 5AUYA 4BIBA 4D4SA 3CE3A 5T68A 3C0IA 3KXZA 4PPAA 5BPYA 3LCDA 1YWNA 2X2MA 3BYMA 3C4WA 3D7TB 4QYFA 3UNZA 3H9RA 3ZLWA 4TYEA 3SC1A 4QQTA 4O96A 2ONLC 3AXWA 4FIJA 5FEDA 4DH1A 4LI5A 4O0WA 1GJOA 4U3ZA 5DR6A 2ITZA 4ONAA 4E6AA 4XH6A 3NW7A 2B9IA 3ENHA 2WEIA 4AE9A 1M7QA 4MD8E 3TEIA 5D7AA 3IW7A 2XEZA 3HV3A 2H96A 3QD2B 3RHKA 3ZRKA 4DEAA 1DM2A 1TQPA 4I21A 3W2PA 5L3AA 4NKSA 1KE8A 3RVGA 2GFSA 4G16A 4FUXA 4OTWA 2BROA 2BUJA 3GC9A 3ORTA 3PPJA 2C5NA 4DH5A 2GNFA 2OZAA 2CJMA 4MBJA 4RIWB 1YXUA 5DFPA 5ACBC 4FV8A 4XG7A 4CCUA 4DBNA 5E1SA 4Z16A 2QLUA 5IA5A 3U51A 3VBVA 3DPKA 4F9AA 3UGCA 4QMOA 3OCSA 1PXJA 3F3ZA 3LXPA 2O0UA 4DEHA 2BVAA 3MA6A 2VO0A 4D2RA 4C35A 2QR8A 3GFWA 2WHBA 3PJ3A 1G3NA 2NRYA 4ITIA 4OT6A 3AD4A 2NRUA 2PK9A 4FUYA 5BVDA 4YO4A 4FKGA 2RF9A 3B8RA 2QOCA 3RPVA 3QQKA 1CM8A 2I1MA 4GUBA 1K3AA 5HVKA 1XWSA 4D4VA 4JG6A 5A4QA 4G6OA 4YJTA 5D10A 5HHWA 5CSHA 4ACMA 3UOLA 5GJGA 2XNGA 3EQHA 4GRBA 4NM5A 4W8DA 4U7ZA 4P5QA 2WMBA 5CSPA 3PSCA 5JKGA 1XBBA 4YO6A 4KIQA 5EW9A 4MBIA 4ALWA 4RX5A 2R3GA 3VS1A 4BZDA 1SYKA 4M67A 3FSFA 5BVKA 5L2WA 3Q53A 4R3RA 2JDTA 1TVOA 2OFVA 2HZ4A 3PY0A 2WTIA 4H3BA 4CQEA 2UZTA 2W5HA 3DB8A 4FTCA 5AAGA 3MGYA 4YC3A 5AP5A 5L8KA 4I5HA 4XP3A 1Q8WA 3EFJA 4NJDA 5JT2A 2HENA 3OY3A 4DCEA 3F3UA 5KMMA 4KBKA 4FI1A 3KRXA 4QMZA 5L2QA 4JBPA 4C3RA 4NTSA 4AZWA 3BKBA 2OJJA 3WZJA 4LM5A 3R8LA 2BILB 2QONA 1XKKA 1ZARA 2UVYA 4AW5A 3A4OX 5DNRA 4L42A 4E4NA 1BUHA 3KEXA 4RQVA 4EEVA 3MH0A 4E6QA 3JVRA 1I44A 5LMBA 4RSSA 1ZYJA 4X3JA 4KBCA 5KZIA 2UZWE 2VX0A 1VYZA 3ZRMA 1SVGA 1ZWSA 2E9UA 4DTKA 4B99A 3KRWA 2WMXA 5CASA 4ZEGA 1MRUA 3D5WA 5HZNA 3BEGA 2KULA 1RE8A 3QCQA 4Y83A 4YJVA 3AC2A 5KNJA 5LVMA 3RCDA 2ZV2A 1BKXA 1WBTA 3EQCA 4HCVA 3F2NA 2OFUA 4RJ3A 4DYMA 4EOSA 4K33A 3LM5A 4X6QC 3ZHPC 5CEQA 1XH4A 4DLJA 1R39A 3VJOA 3OWKA 1ZYCA 2X9EA 2A0CX 4FTKA 1M7NA 4E4MA 4CZUA 4DEDA 4Z3VA 2H9VA 3HMIA 3R22A 2G1TA 1YXTA 4QD6A 3GGFA 4O0VA 4RIOA 4IZYA 5IMXA 3EQBA 3ZSGA 1H1SA 3PZHA 5IISA 4AW2A 3V8TA 1G5SA 3BBTB 4CLIA 2HK5A 4MAOA 5K4JA 1H0WA 2W1DA 4DGGA 3QCSA 2HYYA 1U4DA 3TT0A 3FXXA 3CKWA 4OUCA 4I93A 2SRCA 3GCVA 3OF0A 3RI1A 2R7BA 3QCYA 4TY1A 3UMWA 4F4PA 3SW7A 4AFJA 4Z55A 3NEWA 4MF0A 1UNGA 4FVQA 2FA2A 3WYXA 3A7HA 3QHRA 4D1XA 2JEDA 3PWYA 2XK6A 4M69A 4L45A 4C38A 4DEBA 5ETIA 2ESMA 3F2AA 3KULB 4YZDA 5JN2A 5I3RA 3QTIA 4FTOA 3KXHA 3NAYA 1MQBA 3R9NA 2YDKA 5AV4A 4CSVA 3AC4A 4FX3A 3NCZA 3R1SA 3WARA 2VX1A 1Q99A 2W4OA 2JITA 4F64A 3OFMA 2ZDTA 2NPQA 3P4KA 4K8AA 4OLIA 4U44A 2JKKA 1WBVA 3PY1A 2RL5A 5HNIX 2CCIA 4FKUA 3TTIA 1H8FA 1Q8UA 3DK3A 4A7CA 4FZFB 1WAKA 4WT6A 3UYTA 3NUPA 4GK3A 3VULA 4I6BA 3ACKA 2BAQA 2C0IA 5CSXA 4C4JA 5DGZA 3QRTA 2RFNA 3FWQA 3LM0A 3QUDA 4NM0A 4GFMA 4DFYA 1YW2A 1ZMVA 3QFVA 2BKZA 3FLQA 4PMTA 1XO2B 4GFGA 4CMTA 5DG5A 4D58A 3OMVA 3RCJA 4F1TA 1JKTA 4QYGA 5EYCA 3FZTA 4HJOA 4FKRA 4BKZA 2UW8A 3Q60A 5E91A 4E6DA 5BUIA 4UALA 2P55A 2VGPA 3BGPA 4M14A 3FZOA 4I4FA 1BX6A 3LFDA 4KBAA 4IWQA 2PVYA 4BGQA 4GVJA 4WHZA 4D2SA 5FRIA 3UG1A 5IEVA 3ZLXA 4EBWA 5F95A 3WF5A 4ZY5A 1E1VA 3CLYA 3UYSA 5JK3A 4MYGA 5IMEA 5L6OA 5DN3A 4AZVA 5EM8A 4N0SA 3DFAA 4GG5A 2XNPA 1UWJA 3U4WA 2Y0AA 3VN9A 3NNUA 3WBLA 4BCGA 2DYLA 3FZ1A 5L2TA 4XP0A 3UVQA 2HZ0A 4H36A 3PJ8A 3MTLA 2PWLA 4X3FB 2ITTA 2B9HA 3LCTA 2UW9A 4LOQA 1R3CA 4YZNA 3TZ7A 5LMAA 3PVUA 5EOLA 3UMXA 4QQCA 2GU8A 4AA5A 1QPJA 4LGGA 2PY3A 4PF4A 4YZMA 4AZEA 1TQIA 5LCJA 3D4QA 4QMPA 5M55A 1WMKA 4LYNA 5CYIA 5JFVA 3R1NA 3RPYA 1ZZLA 3VRYA 3MB6A 4FT3A 4R1VA 1PXPA 5AJQA 5EI8A 4AFEA 4DGNA 5EW3A 4UN0C 5I0BA 5HBEA 2G15A 2C0TA 4AOJA 2PVKA 3AT4A 2F4JA 3Q4TA 3G0FA 3QAME 3SAYA 5DRBA 3LFBA 4ERKA 4J8NA 3UOJA 3BPRA 4BWPA 4TYHA 2AC5A 2XIKA 5HO7A 3ORXA 2CGUA 3PIZA 4G6NA 4HPTE 4JQ7A 3L8XA 5GZ8A 3S00A 4GSBA 3UQCA 4U8ZA 2XM9A 5K3YA 4RA5A 4FTJA 4L7FA 3CP9A 3FBVA 4I5MA 4D2VA 4V0GB 4FA2A 2YCFA 3GCUA 4ZTMA 2ZMDA 1WFCA 4AGDA 3EL7A 2WZJA 5HE1A 4QPMA 5EK7A 1V0PA 2O8YA 2ZJWA 4JIAA 3F3WA 3BGQA 3BBWA 4U43A 1ZRZA 1EH4A 4M8TA 4WNPA 4S32A 4A9SA 3DQXA 3QUPA 3DY7A 5LXMA 3KN5A 3QL8A 4YR8A 1KSWA 5TOZA 5DH3A 2VTSA 3OWJA 3QQJA 4GT3A 4M12A 5EI6A 3NW5A 3UIUA 3GQIA 1Z9XA 1QL6A 4W4WA 5EYDA 3Q6UA 4B8LA 5DR9A 3BLRA 3P9JA 1UU9A 3ETAA 4AT3A 4IB3A 1RJBA 5J7HA 4FT7A 2Q0NA 5EHOA 5FD2A 3PFQA 5IA3A 2QI8A 3O8UA 4DN5A 5FM2A 3PVWA 3ZYAA 2C3LA 1B39A 1O6KA 3OUNB 3AC1A 3E8CA 4MX9A 3UNJA 3LVPA 5IA0A 2YABA 3ZFYA 4BDIA 4JX3A 4WOVA 4FKLA 3II5A 4MXYA 5CI7A 1YDSE 3EQDA 1F5QA 2VWBA 5KMJA 5D12A 4FTUA 4Y73A 4AQCA 4PL3A 1YDTE 4A9UA 2HY81 4JJRA 4E26A 3E62A 3TNHA 4NM7A 3S95A 3VAPA 3KKVA 4EOQA 3H9OA 3KFAA 3KL8A 3SXSA 3MSSA 1P4OA 1WBWA 5CT0A 1IG1A 1SZMA 5AUXA 3R7OA 4EOMA 2YA9A 4II5A 3ZEPA 4I6HA 2RGPA 5DE2A 4NCTC 4XV9A 4QMWA 4S34A 1OKZA 1Y8GA 4KS8A 3B2WA 2WOUA 5M4IA 3QTZA 4IZ7A 3WF7A 1Q61A 3IECA 5DRDA 4BCNA 4F0GA 4KSQA 3V5PA 5CAVA 3I7BA 4YJRA 5KKRC 1M14A 2HAKA 2J50A 2BHEA 2VTJA 4BN1A 3PP0A 4NIFA 3TNPC 4IAFA 3G2FA 4R3PA 5IH4A 3AGMA 3EN6A 3FMDA 2R4BA 1O6LA 3NCGA 4IBMA 1KE5A 4YPDA 2WQEA 3SQQA 2Y9QA 1OMWA 3O8PA 3U6IA 2KTYA 3A62A 3MFUA 4FTTA 2UW7A 3QA0A 3C0HA 4YTHA 5HD7A 3SOCA 4DEIA 5DMZA 3F3VA 5DOSA 3ZLYA 3LZBA 2CGXA 2G2HA 3QRJA 2O64A 3GB2A 3GUBA 3Q9ZA 4FGBA 4KIKA 3CY3A 2Z7QA 4KAOA 4UMUA 2WIPA 2XKDA 3S4QA 3BEAA 2VWIA 4XV1A 1PXLA 3TV4A 3W55A 4S33A 3VUMA 1BL6A 4ZLZA 2PUUA 2IJMA 4FG7A 3U87A 3KXMA 3MJ2A 4TPTA 1P5EA 4JG7A 5HIDA 3C13A 5AV0A 4U0IA 2Y4IB 3FZSA 3E92A 2E9VA 4RIXB 5I4NA 2W5BA 4BYJA 5I5ZA 3PIXA 5J1WA 3FXWA 3PG1A 3FMJA 3PUPA 4PP7A 4FKTA 3RINA 4DFNA 3TV7A 4BCMA 4J1RA 2ZM1A 4R3CA 5H8EA 2HW7A 3RK5A 4CYJA 3LQ5A 4DGLC 5AUUA 1ZZ2A 3GC7A 2F9GA 3MH3A 3RMFA 3UP2A 4ASZA 5BVOA 2PVJA 3R6XA 3QYZA 5HGIA 3A8WA 3LCKA 2PTKA 4BC6A 1YHSA 1GOLA 4PMPA 5AM7A 2EXCX 1H26A 3MS9A 5FBNC 3ZC6A 5KHWA 4M84A 4FTNA 3C0GA 3QQFA 2W05A 3D7TA 2J0JA 4XJ0A 5AP1A 3KN6A 2VWVA 1KE9A 3I7CA 3OHTA 3VHKA 3Q9XA 4GVAA 4HGLA 5ANDA 3MB7A 4ZAUA 5AIRA 5BMSA 2CGVA 3QQHA 3UIBA 2F2CB 1YRPA 5CI6A 4C4IA 2W1GA 5JMSA 4GIHA 4I92A 3ZDUA 4MTAA 4NUSA 5AR8A 2XUUA 1KWPA 4FSNA 4L8MA 4BCQA 4FT5A 3C50A 3TKHA 4C8BA 4IWDA 3O7LD 4Z9LA 5J5TA 3P7AA 4XG3A 3GQLA 3TG1A 3V6RA 2GCDA 3LXNA 4F99A 3CPCA 3C4XA 4EI4A 4W4YA 4RIWA 2J9MA 4QYEA 4UMQA 2WTKC 2YAAA 4JVGA 2XB7A 4MXCA 2O65A 4IVBA 5A4TA 4MVFA 2P2HA 4YP8A 4YURA 1PXIA 4RC2A 3FPMA 4ZTRA 3E8EA 3QXPA 4EYMA 3QLFA 5TKDA 4YC6A 3PYYA 4PTCA 1ZMWA 3EYHA 3FUPA 2XNNA 4ZTLA 5HTCA 3ZXTA 1RW8A 2QOOA 2R3QA 5D7VA 4OR5A 5EM6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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