2KHOA

Nmr-rdc / xray structure of e. coli hsp70 (dnak) chaperone (1-605) complexed with adp and substrate
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
IIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGTFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFDELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Solution conformation of wild-type E. coli Hsp70 (DnaK) chaperone complexed with ADP and substrate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock protein 70
total genus 181
structure length 600
sequence length 600
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 2khoA06
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2khoA05
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2khoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2khoA04
4FWQA 1KAZA 1GLEG 3EKSA 4IWVA 5KPTA 3J8AA 4FWSA 5AQFA 1Z05A 4H6IA 2P9SA 4H0YB 4JAXA 2IVOA 4CZKA 3DXMA 4H0XB 4B1ZA 4MLEA 3ZETB 1HUXA 3VEXA 2VWBA 3AY9A 4CD3A 4QS8A 1J6ZA 3DAWA 2FF3B 1DEJA 4R5IA 3ATVA 3SK3A 1YAGA 3P4IA 2Q2RA 4Y0WA 2CH5A 3T46A 1TUUA 4EZZA 2P9LB 2A41A 2WUSA 3A5NC 1QQMA 3M6GA 4IJNA 1C0FA 1T6CA 3GOIA 3DXKB 5EOYA 4A2AA 2FF6A 1HX1A 5AQJA 3HM8A 4FWLA 4EZQA 3FZMA 3QICA 3DPQA 1LCUA 4BQZA 3IMXA 3LM2A 3FR0A 3WT0A 3D2FA 4F00A 4K43A 3CJ9A 2P9LA 1QQOA 3CJ1A 5ADXA 4PL8A 5CE3A 1DKXA 1XC3A 4FPAA 2GELA 4AM7A 4FO0A 2YI1A 4B1XB 3FZKA 1D4XA 3UKRA 1KAXA 4BRKA 4PO2A 4DHYA 1NGFA 3LDPA 4BR5A 1YXQA 3F9MA 1QZ5A 3O5BA 5JLHA 4BG8A 1JCFA 1GLCG 1BA0A 3VPZA 2GTDA 4JWIA 3VESA 2I7PA 4BC3A 4CBXA 3UKRB 4BRCA 3L6QA 5AQNA 4E81A 1BU6O 3VEVA 2AP1A 2P9IA 1BG3A 3VOVA 3C7NB 1SZ2A 4PL7A 4H0OA 3OHRA 3UKUA 2CGLA 4EZSA 2BUPA 3O8MA 2E2OA 3LDQA 4BGBA 2A5XA 1KAYA 5KPZA 4HTLA 1JCEA 3B8AX 4BVOA 3GL1A 3JXUA 2ZWHA 3W3DA 4BC2A 1BA1A 4MLHA 1GLFO 2CGKA 4BROA 3C7NA 4BR0A 4EIAA 1JCGA 1V4TA 3A5LC 2ZGYA 4MO4A 3UKUB 4CZIA 2BTFA 3UE5A 5AR0A 1K8KB 1YVNA 2E1ZA 4BR9A 3H1VX 2IIRA 4BREA 5BRFA 3O4WA 3CI5A 1U2VB 5FPEA 4IO8A 4EZRA 2KHOA 2QWLA 4HY9A 5AQHA 3FE1A 2V52B 5AQUA 3EO3A 1U00A 1GLBG 5B8HA 2FXUA 4NO7A 1GLDG 2QWPA 1K8KA 4EZUA 1MA9B 3GG4A 1HKGA 4CD1A 4CZGA 2D4WA 4R5LA 1Q5LA 3VF2A 5EY4A 1P8ZA 1WOQA 5EXWA 5BREA 1NGDA 5AQWA 3DOBA 5JICA 2OANA 3DPPA 3DPOA 4R5JA 2P9KB 3UB5A 4RCHA 4K41A 1NBWA 1WUAA 2J4RA 2P9NB 3RSEA 1U6ZA 3CJAA 2A40A 1IG8A 3QB0A 4H0TB 2P9UA 4PKIA 4C23A 4O5FA 4RTFD 4BRDA 1RFQA 3BP8A 4JN4A 4CI6A 5F2RA 1NGBA 3C0BA 2F9TA 3EZWA 4I6MA 1BWFO 1NWKA 2GUPA 3T4AG 2H3GX 1ATRA 3A5MC 3JS6A 3M1FA 4BRIA 4MO5A 5ADXH 2P9PB 1DKYA 4EZYA 4BC5A 3AAPA 4YDUA 1LOTB 4YDUC 3H3OB 3I8BA 4FPBA 4EHUA 4EZTA 2D0OA 3A8YA 4CZJA 3GBTA 1NGGA 2YHXA 3SMPA 2QWOA 5F0XA 5JLFA 4H5VA 3BEXA 4H5NA 3I33A 3WXIA 1GLJO 2A3ZA 4EZVA 4H5TA 5BPNA 1HLUA 5AQGA 2CGJA 2YCHA 3MN9A 4IXCA 5AZJA 3AAQA 3VGMA 4BG9A 5AQZA 4EZNA 3VGKA 1Z6RA 1ZBSA 4QS9A 4L3QA 3R9PA 5AQPA 1T6DA 4CZEA 2QWRA 4XH5A 2FLOA 1ZC6A 2QWQA 5AZJB 3D7EO 4BR7A 1S3XA 3BF3A 3WQTA 3ZX0A 4HYBA 1KXPA 4EFHA 3ZX2A 3HBTA 3LDNA 3O80A 3DXMB 4BRLA 4EZXA 1CKRA 3LDLA 4BC4A 4CJ7A 3HZ6A 4LC9B 4XH1A 3WUHA 5JMVA 1DKGD 1QZ6A 3CJCA 3QDKA 1DKZA 2HOEA 4NB4A 3L3OM 1OKJA 4WV5A 3QFUA 4XH4A 1RGIA 1X3MA 4M7XA 4BRFA 4H5RA 3VEWA 2QWNA 4H0VB 3VEZA 4JNFA 1IJJA 4M7YA 5TKYA 5F1XA 3LDOA 2Q1NA 3U9DA 4EZWA 3TU5A 4B1YB 1MWMA 3O1WA 3QBXA 2YJEA 1HKBA 2AA4A 4Z94A 4DQ8A 5I9EB 2V7ZA 2NRHA 1NGIA 3VENA 4IJAA 5ELZA 3SJHA 3DQGA 1BDGA 1NGHA 2D0PA 5EX5A 1NMDA 3G25A 4GNIA 3EL2A 3CJ7A 4AM6A 4H03B 1ESVA 2GWJA 2E2NA 3WXKA 3CJBA 5BPMA 4DB3A 4HWIA 1T44A 3T49A 4RWTA 1SAZA 4K42A 4CZFA 4PKHA 1ATSA 2E2QA 4B1WB 5AQTA 1DGKN 4H6HA 3TPQA 5AQRA 3FFKB 3CERA 4EZPA 3MMVA 3IUCA 3SMSA 1GLAG 4JWDA 2E8AA 5AQKA 3VF4A 3HI0A 4B1VA 2PAVA 1CZAN 1MDUB 7HSCA 3BUZB 4R5KA 2QWMA 2VCPA 4FWKA 3DJCA 3GE1A 2PBDA 3VF6A 3DWLA 3WXJA 1BPRA 4PKGA 3VETA 3SLCA 3EN9A 4JWEA 2YHYA 4EHTA 5AFUH 1XUPO 2GWKA 2VYPA 2QXLA 3HSCA 1U2VA 5BR9A 3CQXA 3KVGA 4WV7A 5BPLA 3H3NO 3MN6A 4BVPA 3QMLA 3CIPA 3T48A 2OP6A 3CETA 2ASOA 2QM1A 1Y64A 1HKCA 3DXKA 4CZHA 4FWRA 1X9JA 3HTVA 4XEIA 5KQ8A 4ISEA 5BRDA 3ULEA 5KQDA 1NGEA 3D2FB 4FWNA 4WQ5A 3FZHA 3ENOA 4BR2A 4BRMA 3O1BA 3W0LA 2E88A 1GLLO 3T47A 1HJOA 3QNJA 4A61A 2ASPA 4KBOA 1SQKA 1V4SA 4BRPA 3RSEB 5AQLA 5AQQA 4FOIA 3U8XA 3ULEB 4B9QA 2F9WA 5AQXA 2EWSA 4BGAA 4EAHD 2NLXA 5BN9A 3H46O 3R6MA 1NLVA 4M63C 2A6AA 2W40A 4BRAA 1DG4A 3VEOA 2P9IB 4GY2B 3VGLA 5LJWA 1ZXOA 2V51B 3VEYA 2P9PA 4DCHA 3A5OC 2E1YA 2NZTA 4BRGA 1NGJA 4B1UB 2Q0RA 1EQYA 3L4IA 2FSNA 2D1KA 3A0IX 2QW9A 4JNEA 1YUWA 2A42A 2ZGZA 5FPDA 5AZIA 3M3ZA 2CH6A 2BPRA 3QBWA 4BRHA 1NGAA 1X3NA 4FWMA 1ATNA 4WQ4C 4WQ4A 4BR4A 3IDHA 3OHXM 5E26A 3MN5A 4CZMA 5BN8A 5E84A 1E4FT 2ASMA 1TUYA 3VERA 4FSVA 1S22A 4FWOA 5AZIB 1H1VA 1Q18A 2YHWA 3MDQA 5LJVA 1C0GA 2E20A 1BOTO 3FLCO 3MN7A 3WXLA 3FZFA 1RDWX 2Q97A 1NGCA 3IFRA 3U9ZA 4CZLA 4BRNA 3KHYA 1QHAA 3AARA 3O08A 2GEMA 4JWCA 3FGUA 3MK6A 2HMPA 4H0PA 4H5WA 3ZX3A 5AQYA 4WQ5C 4ISGA 4J8FA 4BRQA 5AQSA 2DPNA 2E2PA 4BQLA 3H0XA 5FPNA 2P9KA 2YJFA 1XQSC 3QFPA 4IZ9A 1NM1A 3D2EB 4R5GA 4F9OA 3ID8A 3ATUA 2P9NA 2Q0UA 1BO5O 4CBWA 5LY3A 3KZBA 3WEEB 2P9UB 1TYQA 4EZOA 3FZLA 3GDQA 2I7NA 3H45C 3O6WA 3CHWA 5AFUA 2Q36A 3H6EA 4A62A 5AQIA 3BF1A 4WYBA 2UYTA 3D2EA 4I6MB 4JD2A 4QS7A 2QFFA 4JHDA 3WEEA 1BUPA 2ZF5O 3LM9A 1TYQB 3ZEUB 2Q31A 1R59O 3N8EA 2HF4A 3MCPA 1HPMA 4FOEA 3R8EA 5AQOA 2FSJA 2ITMA 4JD2B 1QQNA 2W41A 4FL9A 3ENHA 4CBUA 3LL3A 4JHDB 5BRHA 4FWPA 3CQYA 3S41A 1MWKA 2IVNA 4ISFA 4O8KA 4A2BA 5FPMA 3H1QA 3ZEUA 1G99A 2IVPA 2WINM 2V7YA 3WQUA 2P9SB 5AQVA 3L0QA 4E1JA 2FSKA 3ZETA 5KPRA 4F01A 2HF3A 1E4GT 3U4LA 3EKUA 5EVZA 4K25A 5AQMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O4NA 4KREA 3RMBA 4AAZA 1GLEG 5KTQA 2GMOA 5AQFA 5JVHL 3DXMA 4DS5A 2W00A 4MLEA 3AY9A 4QS8A 1E1DA 4DR2K 2FF3B 3RRHA 2OYQA 4R5IA 4ID5A 1YAGA 5CY0A 1I3AA 4DTJA 4KHQA 4B3TK 4DV5K 3TTDA 4C1NI 2CH5A 4HCCA 3M6GA 1EXQA 1JXEA 1C0FA 5SWMA 3CFPA 1SL1A 1ILYA 3VN5A 2W42A 4CJ3A 5CR4A 4BY9C 5EOYA 2FF6A 5AQJA 3SBGA 3HM8A 3KD5E 3EY1A 4AHUA 4BQZA 3L4QA 4Z4GA 3E9PA 3D2FA 4F00A 2P9LA 4ELUA 3O3NB 3B51X 1DKXA 1S6PA 1XC3A 4FJMA 2GBZA 4I2PA 4BRKA 5KRSA 4PO2A 4JI0K 3THWB 4KO0A 3O9UA 4AZCB 3N4QA 4BR5A 5FRMA 1YXQA 4FVUA 3O5BA 4PHTX 4DLEA 1GLCG 5C5BB 4E7IA 2YI9A 2GTDA 2N69A 4CW7B 4Z4EA 1K8AO 4BC3A 4BRCA 4CHNA 3VEAA 1BU6O 3VEVA 4E7JA 1YTUA 1Z25A 1BG3A 1OMYA 4M41A 3C7NB 1KVCA 1DT9A 1S1XA 4PL7A 3OHRA 3BUPA 3SQ1A 4EZSA 1ZU3A 2BUPA 4Q0BA 1ZVGA 2LI7A 4BGBA 1IO2A 5KPZA 4KPYA 3JXUA 1A5XA 2ZWHA 4FW1A 5C15A 3PSMA 2HSTA 4EIAA 2A1SA 4BROA 3VA3A 1BRZA 1V4TA 3A5LC 4NXNK 5GAEP 3C6HA 1SU6A 3UE5A 4JI4K 1T1TA 1NKEA 1YVNA 3H1VX 4BREA 4KI4A 3TANA 2KQ2A 3CI5A 1U2VB 3QERA 4DSLA 1RTDA 2HHQA 4AVMA 3FE1A 2V52B 4WF9L 4FJJA 4NO7A 1ASVA 1U45A 4R79A 1XNQK 1HQUA 3PLAA 4YORA 4FJIA 2HBJA 1K8KA 1WSIA 1HKGA 2ZM6K 4IBNA 2NY9X 3VQEA 1GPSA 2YBRC 1IBMK 3OYNA 2Q3SA 1KRPA 3UIQA 3VQBA 1OH7A 2D0AA 1TV6A 1OAOA 1P90A 2P9NB 4EP4A 2LT8A 3DLBA 1TL3A 1KC8O 3HAIA 5C25A 1S1TA 4PKIA 4C23A 3CM6A 4RTFD 4FW2A 3T7ZA 2WC9A 4KTZA 3QEWA 3E7RL 2JGUA 3BP8A 4JN4A 3CFOA 1NGBA 2DY4A 3DMJA 3EZWA 4I6MA 1BWFO 3HRGA 5ADXH 3R2VA 2KLAA 4HUGA 3TAFA 4IOCL 3AAPA 3H3OB 4FPBA 1ZBHA 1ZFUA 1OA1A 4EP5A 3A8YA 4E7LA 3SNNA 4B3SK 1Q8IA 3NH1A 2NRTA 3SMPA 5JLFA 3O9TA 4KTQA 4LF9K 2D5RA 3I33A 3K57A 2F4VK 4FJHA 1C6VA 2NRVA 2OZNB 3HPHA 3P83D 5HL7L 5BPNA 5AQGA 4NYNA 2F1BA 3O3GA 1HPZA 3VGMA 4IM3A 1VQ7N 3M8SA 3QWEA 5C42A 2VG7A 1NKCA 4FJ7A 4L3QA 1XHXA 2VGNA 4CESA 3LANA 2XY7A 1GNLA 1LW0A 2FLOA 1VQKN 2QWQA 4IEEA 1KCFA 3B53X 3LP0A 1S3XA 4GV3A 1AHOA 4HYBA 1I6GA 4FVMA 1EWQA 4EFHA 1FKOA 3LDNA 3Q0KA 1CKRA 3LDLA 3OJSA 1IKVA 3AO4A 4OPHA 4XH1A 5JMVA 3D0PA 3J80O 3PSFA 2V0OA 4U7BA 1T8EA 2G8IA 4DWIA 3QFUA 5KRTA 1RGIA 1X3MA 3D45A 4BRFA 4O55A 4H4MA 3T19A 1QE1A 4EZWA 2HB5A 1RT1A 1VSJA 5J2QA 3TU5A 4B1YB 1C0TA 3O1WA 2FICA 2YJEA 2HHVA 3ABHA 3VTHA 4E72A 3NHGA 4ZTJA 3B6PA 3OYMA 4DU1A 5I9EB 3NCIA 3CMAN 4F2RA 4BNEA 2YIPA 2C08A 3VENA 4KRFA 1X9SA 4IJAA 4J2DA 3SJHA 4GKKK 3DQGA 3ZCMA 4CJ5A 4OO1J 4LFBK 1NGHA 1NMDA 1POIA 3EJUA 3G25A 4OLAA 2GWJA 2E2NA 4FLVA 5BPMA 2B3CA 4HWIA 3T49A 4AHRA 3M8QA 3THXA 5JVGL 4DTUA 1SAZA 3KWGA 1C1AA 2JNSA 2WTUA 3KJVA 2E2QA 5AQTA 3RRGA 4AKVA 1DGKN 2LKBA 3QIPA 4WE1A 2A7TA 3CERA 4ILHA 3LP1A 3CCLN 1GLAG 1KLNA 2E3FA 3DX1A 3O9SA 3L2VA 1NK5A 4AHSA 3I55N 2X5CA 1C1BA 3EEQA 3KLHA 4BEBA 1NNEA 2C1GA 4DF8A 3DJCA 2ZXQA 3VF6A 3F9KA 5CYQA 4FJXA 3NF9A 4FLUA 3AVGA 3EN9A 2E2FA 3GI7A 2FBYA 4M45A 4EHTA 4DQSA 1CZ9A 4FM3A 1XUPO 3L2WA 2O8EA 3LALA 3CQXA 4WV7A 3H3NO 3OYCA 3T48A 1BCOA 1E3MA 3WNEA 4RW7A 1Y64A 2G8KA 1R5EA 3KP1A 4OKJA 4XEIA 3CCJN 2O4IA 1OA0A 1ASWA 4ISEA 5BRDA 3AVBA 1TQSA 2F7TA 4UADE 1I4LA 4LH5A 3V9SA 3D2FB 1VSFA 4ILGA 3G71N 1Q86O 1Q9XA 1LV5A 4FLZA 1JQKA 1UOCA 4FJNA 3O1BA 2ITGA 4CJPA 1JL2A 3D51A 3SOGA 4KHWA 3MWTA 1V4SA 1W0HA 4FOIA 4AZCA 1YF5L 3I0SA 4B9MA 1RBSA 2F9WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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