2KHOA

Nmr-rdc / xray structure of e. coli hsp70 (dnak) chaperone (1-605) complexed with adp and substrate
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
IIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGTFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFDELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Solution conformation of wild-type E. coli Hsp70 (DnaK) chaperone complexed with ADP and substrate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock protein 70
total genus 181
structure length 600
sequence length 600
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 2khoA06
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2khoA05
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2khoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2khoA04
2DPNA 2YJEA 2P9NB 2P9LB 1J6ZA 2FLOA 4R5IA 2YHYA 1U6ZA 1D4XA 1DKYA 2E1YA 2W41A 3UB5A 3A8YA 3LDNA 4F9OA 3CJBA 4H03B 1GLEG 2A41A 2IVOA 2ZGZA 4EIAA 2I7NA 2QWMA 4FOIA 1RGIA 1NGJA 1YVNA 1KXPA 2P9SB 1DG4A 5FPNA 2GUPA 4Z94A 4EZQA 1NLVA 4Y0WA 4BGAA 3MN7A 3CQXA 4WYBA 1NMDA 2WINM 4H5VA 2V51B 3FGUA 2ASPA 3IUCA 2V52B 3BF3A 4FWNA 3ID8A 4BRHA 3MN9A 4IZ9A 4CD1A 5JMVA 3GOIA 3L0QA 1GLCG 3C7NB 1CZAN 2YCHA 4B1WB 5AQIA 4PL7A 2HF3A 4E81A 1P8ZA 2CGKA 5AQJA 4EZXA 4BRLA 1TYQB 3JS6A 2D4WA 4H0XB 2OP6A 2QWRA 4CZKA 5AR0A 3VPZA 1Q5LA 4BVPA 3DOBA 3ZX0A 4F00A 4R5GA 2IVNA 3ENHA 4BQZA 4BRIA 3O4WA 4BC3A 4ISFA 3WT0A 3ENOA 1NGAA 2D0OA 4A2BA 4BR4A 5AFUA 1HPMA 4NO7A 4RWTA 4B1YB 1JCFA 3QBXA 4AM7A 1ATNA 4H0PA 4BC2A 5AQFA 3O1WA 1GLDG 2KHOA 3P4IA 4MLHA 3VENA 4EZNA 1ZC6A 1SQKA 1G99A 5AZIA 4WV5A 3FZLA 4QS8A 5LY3A 3O8MA 2P9LA 4FWRA 3WEEA 3D2FA 3WQTA 2YI1A 3DXKB 2NRHA 3VERA 1BO5O 3DQGA 2E2PA 3SK3A 4EFHA 3LM9A 4HWIA 3UE5A 2GTDA 2BPRA 1H1VA 2GEMA 1Z05A 3SJHA 3BP8A 3KVGA 3QDKA 4EZYA 4EZUA 5EX5A 3D7EO 3QBWA 3GDQA 2PBDA 3LM2A 1MDUB 3R9PA 1U2VB 3FZMA 4HTLA 4K42A 3ZEUB 3R8EA 2HOEA 3CIPA 3RSEB 1QHAA 3OHRA 1NGDA 1NGHA 5AQYA 4FO0A 4RCHA 1E4FT 4H5WA 4FWPA 3ZETA 2QXLA 1E4GT 2FSNA 4IXCA 2P9IB 1NM1A 3CJ1A 5AQLA 2A42A 4H0OA 5FPMA 1RFQA 2CGJA 2AA4A 2Q2RA 3DJCA 3SMPA 4CZLA 2P9SA 4FWMA 3HZ6A 1DEJA 1KAYA 2V7ZA 3HBTA 3W0LA 3QMLA 2HMPA 4DB3A 1Y64A 4H5RA 4JNFA 3VEYA 3A5NC 2QFFA 2QWQA 1V4TA 3A0IX 5BRHA 2Q36A 4BG9A 4BRQA 5BREA 2QM1A 5BR9A 5FPDA 5BPLA 3F9MA 2Q0RA 2VYPA 1SAZA 4A2AA 4CZJA 3AY9A 4ISEA 3UKRA 1CKRA 2BUPA 4WQ4C 5CE3A 3CHWA 3O08A 5AQXA 4EAHD 1WUAA 3GG4A 4EHUA 5AQSA 5KQ8A 4QS9A 3WXJA 5AQPA 2IVPA 4JHDA 4B1XB 4R5LA 5AQZA 1HUXA 4FWOA 4YDUC 3VETA 4CBXA 4H0VB 5KPRA 3B8AX 2QWNA 4BR9A 3VOVA 3H45C 3HSCA 3VEOA 4H6IA 3R6MA 2P9UA 4NB4A 3TU5A 5E84A 3KHYA 4CD3A 3M6GA 2ZGYA 3KZBA 1TUYA 1WOQA 3DWLA 1LCUA 3O1BA 1JCGA 1Z6RA 2Q97A 5BPNA 2P9UB 3JXUA 2A5XA 4XH5A 2PAVA 3T48A 1QZ6A 3A5MC 1T6DA 3IDHA 3MMVA 1XC3A 5F0XA 4H6HA 5AZJA 1V4SA 1SZ2A 3HM8A 2F9WA 1GLAG 4FSVA 2BTFA 2V7YA 4CZHA 2VCPA 3L4IA 1BUPA 1GLLO 3EO3A 5AQWA 4CI6A 4BC4A 1DKXA 3MN6A 4FPAA 4EZTA 3AAPA 3FR0A 2YHXA 4MO5A 3ULEA 4JNEA 2YHWA 3H1QA 4O8KA 2P9KB 3GE1A 3LDLA 4LC9B 5F1XA 1X3NA 4J8FA 4CZIA 4BRCA 2AP1A 4B1VA 3QNJA 3VGMA 4B1UB 4I6MA 4BR7A 4K43A 3VGKA 4CZFA 2HF4A 2QWLA 3QFUA 3J8AA 4XH1A 5AQTA 4JWCA 3M1FA 3VESA 3DAWA 4IJNA 1C0FA 2ASMA 4RTFD 1BU6O 5AQHA 2NLXA 2J4RA 4BRGA 1BPRA 4EZWA 5AQOA 3BF1A 4H0TB 4BRFA 4EZZA 1QZ5A 1NGIA 3CETA 1GLBG 5AQNA 2VWBA 4M63C 4QS7A 3D2FB 1DKGD 3FE1A 1ZBSA 4WQ5A 5BRDA 4BR0A 2E88A 3BUZB 4BG8A 3IMXA 3DPQA 4I6MB 3U9ZA 1HKBA 1DGKN 3O5BA 4FWKA 4CZEA 1QQNA 4JN4A 2GWJA 4PKIA 2QWPA 2GELA 3ZX3A 2FXUA 5JICA 5LJWA 2ZF5O 3ATVA 3C7NA 3A5OC 3D2EA 2OANA 5EY4A 1T44A 1NGBA 4WV7A 1MWKA 5KPTA 3CI5A 1ESVA 2ITMA 2FF3B 3MK6A 1T6CA 1DKZA 1YAGA 4BC5A 3VGLA 4H0YB 5EXWA 3SMSA 3FFKB 3CQYA 5AQMA 4BGBA 5TKYA 2QW9A 3UKRB 1TUUA 4CZMA 1Q18A 1IG8A 4FPBA 4BQLA 3DXKA 3O6WA 1BA1A 5BN8A 2YJFA 3VEWA 3N8EA 3VF2A 2Q1NA 4JHDB 4A61A 2UYTA 4BRNA 3ZX2A 1GLJO 3DXMB 5BPMA 3WXIA 4FL9A 5BN9A 1IJJA 4YDUA 4CBWA 4FWQA 4A62A 5AZIB 3D2EB 4CBUA 2A3ZA 2FF6A 2ASOA 4M7YA 1GLFO 4BRMA 5KPZA 3DPOA 1ATSA 3RSEA 5AFUH 5ADXA 2GWKA 3LDOA 1HKGA 3EN9A 4BVOA 2E2OA 3ULEB 4EZRA 3W3DA 4WQ5C 5AQGA 2P9KA 3FZKA 3QB0A 3LDQA 3WXLA 1XQSC 1LOTB 1NBWA 2ZWHA 4PKGA 4E1JA 3LL3A 3EL2A 4WQ4A 4IWVA 4IO8A 4KBOA 2IIRA 1HKCA 5B8HA 1S22A 1K8KA 3ZEUA 3CJCA 4H5TA 1S3XA 3EKSA 4BR5A 2F9TA 4L3QA 2D0PA 4CZGA 2E2NA 1JCEA 3ATUA 3L6QA 4F01A 3G25A 4JAXA 4B9QA 4ISGA 3WEEB 3WXKA 7HSCA 1HJOA 3I33A 3QFPA 3EKUA 3FZFA 2A6AA 3CERA 3VEZA 4BRDA 2NZTA 4R5JA 5I9EB 3VEVA 3TPQA 5FPEA 1X9JA 4C23A 4BREA 4AM6A 3L3OM 3WQUA 4JWDA 5JLFA 3FZHA 3LDPA 1MWMA 1OKJA 5LJVA 4EZVA 1NWKA 4JWIA 1C0GA 5ELZA 5AQQA 3WUHA 1YXQA 2P9PB 2D1KA 5AZJB 3CJ7A 3H3NO 2H3GX 4BRAA 3H6EA 3VF6A 4DHYA 3O80A 3VF4A 1YUWA 4PL8A 1BOTO 4MO4A 3VEXA 3GBTA 3HTVA 4M7XA 4FWSA 5AQUA 2FSKA 1XUPO 3U4LA 4DQ8A 4BRKA 4EZOA 2E2QA 4H5NA 3U8XA 2QWOA 3SLCA 3CJAA 3FLCO 3ZETB 1NGEA 4EZPA 4JD2B 3CJ9A 2P9IA 3T47A 5EOYA 1BDGA 3QICA 3T49A 3H46O 1NGCA 4JD2A 2FSJA 5E26A 5AQVA 2E20A 2CH6A 2EWSA 4CJ7A 4R5KA 1QQOA 3S41A 3HI0A 3H1VX 1ZXOA 4K41A 4XH4A 1HLUA 4EZSA 2WUSA 4DCHA 1KAZA 2CH5A 3C0BA 3AAQA 4O5FA 1MA9B 3I8BA 4HY9A 2E8AA 3T46A 4XEIA 1KAXA 4BROA 1BA0A 1U2VA 5BRFA 5AQRA 1QQMA 4MLEA 2Q0UA 4PKHA 1NGGA 4B1ZA 4GNIA 1RDWX 4BRPA 2P9NA 3EZWA 4PO2A 4GY2B 5JLHA 1BG3A 1TYQA 1U00A 3A5LC 4JWEA 5AQKA 3U9DA 4IJAA 2A40A 3DPPA 1ATRA 3BEXA 4HYBA 3MDQA 1R59O 1HX1A 3IFRA 2P9PA 3MCPA 3UKUA 3DXMA 3H3OB 2E1ZA 4FWLA 5ADXH 3AARA 5F2RA 1NGFA 1BWFO 1EQYA 2CGLA 5EVZA 3UKUB 3M3ZA 4FOEA 3MN5A 4K25A 4BR2A 3T4AG 3GL1A 4EHTA 2I7PA 1X3MA 3OHXM 1K8KB 5KQDA 2W40A 2Q31A 3H0XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DPNA 2YJEA 2P9LB 1J6ZA 2FLOA 4IWOA 2W41A 4CHZA 3K5MA 3K5LA 3O3FA 1T8EA 1AYJA 4E7HA 3L4QA 2FICA 4DU1A 4C8OA 4FOIA 1C0TA 1RGIA 2P5OA 5C10A 3PO4A 1DG4A 1T3VA 3Q7BA 1SS6A 3ZT3A 1J5EK 4A59A 4EZQA 4E7LA 2NRZA 3MN7A 2A1SA 5C15A 4KKOA 1NMDA 2WINM 4H5VA 2V51B 3FGUA 2O8BA 3AVIA 2ASPA 3K59A 4FWNA 1BIUA 2OZNB 4LY7A 5JMVA 3G10A 1GLCG 1CZAN 4QAGA 2HF3A 2F7PA 2CGKA 3CYGA 2VGNA 2HVIA 1DLOA 4BRLA 3CC4N 1YIJN 2BE2A 3JS6A 2OP6A 4AZBA 3O9SA 3C6HA 4CFDA 1VQ5N 4IOCL 4BRIA 1EKEA 3OJUA 5KTQA 1R33A 4KTZA 5HRRA 5AFUA 4NLBA 5I3UA 1WSIA 3ISNC 1B3CA 1FH3A 1VSIA 2LJ7A 5KGXA 4BC2A 3Q84A 3O1WA 4LF5K 2Z8YA 1TV6A 1I6GA 3AA3A 1U47A 1ZC6A 1W2BM 1N32K 1CXQA 1P00A 3FZLA 3ZSYA 4E7IA 3I2WA 2XY8A 3CCLN 1NH5A 1JL1A 4OKJA 1NOZA 4X62K 2F7TA 3DXKB 3RVCA 1C1AA 2JGUA 4CF8A 1R0AA 5FIGA 2JWKA 3M8QA 4O4GA 1EWQA 5A2QO 1I4DA 3LM9A 2GTDA 1POIA 1Q81O 2YHAA 1D5AA 4HR1A 4AH9A 2GEMA 3MXIA 4UAEF 1CLQA 4GVMA 4DLGA 4OPHA 4F3OA 3VQDA 1M1KO 4DR5K 3R9PA 1U2VB 1TAUA 4K42A 3KKSA 3VQ6A 4AHUA 1QQCA 3A2FA 3G71N 1LQHA 3KD1E 1NGDA 4CF9A 3NCIA 1WSJA 3ZSOA 1RT7A 2B3CA 2RAKA 3DOKA 1RTIA 1LWCA 4B9NA 4FWPA 4N47A 1KC8O 1RDAA 1E4GT 1NJXA 2FSNA 2P9IB 1VQ7N 1BI4B 1MJGA 3BUBA 3DJCA 2G2KA 4IW0A 3TANA 4CE9A 3L3UA 4EP4A 4W5OA 3VEBA 2V7ZA 1S6QA 3W0LA 3QMLA 3P31A 4ZHRA 3PO5A 4J2DA 2QFFA 2QWQA 2E3FA 2KBKA 4WFBL 1RTJA 2R7YA 3O3HA 5HRNA 4E72A 5BPLA 3E7UX 3UITA 1S1UA 3OY9A 4A2AA 2Z1JA 3MCAB 2YLAA 4KI4A 4N76A 3CCQN 1CKRA 4B3OA 5CE3A 2O4GA 3ZT1A 5AQXA 4EAHD 3OTOK 2IOCA 1K9MO 4R5LA 4FWOA 1HUXA 3G6EN 4CBXA 5GINA 1U49A 2QWNA 5DK5A 4BR9A 1N34K 3HO1A 1DQ7A 4CEZA 3CCUN 2P9UA 3OVNA 4FM3A 3M6GA 3OA9A 2RAJA 3P5JA 4DR1K 1TUYA 3O1BA 1QX1A 4E1MA 5C24A 3IKMA 4DV3K 4FLUA 1IKXA 1RT6A 3KJVA 1YI2N 2PZSA 1QZ6A 1X03A 3QNIA 3BUQA 2HHXA 4H6HA 4DWIA 3KWIA 3IAYA 4CHQA 4DLEA 4WE1A 4X65K 1JXEA 1P0AA 3L4IA 3HP9A 1GLLO 1E9VA 5AQWA 1BMRA 5KRSA 4M0MA 1C1BA 1NK8A 3DYAA 4DU4A 2IDOA 3AAPA 2YHXA 3PX6A 3CG7A 3HXMA 3H1QA 1RBSA 3LDLA 5F1XA 4J8FA 4C8MA 2Q3SA 3CKDA 4FLVA 4BRCA 2AP1A 3DRRA 1LV5A 3KC6A 1RT3A 4ICLA 1K73O 5M1KA 3CVRA 3QNJA 1IO2A 3D6RA 3VGMA 1WB9A 3NGZA 2QKBA 3PLAA 1B92A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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