2KHOA

Nmr-rdc / xray structure of e. coli hsp70 (dnak) chaperone (1-605) complexed with adp and substrate
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
IIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGTFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFDELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Heat shock protein 70
publication title Solution conformation of wild-type E. coli Hsp70 (DnaK) chaperone complexed with ADP and substrate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Chaperone
total genus 181
structure length 600
sequence length 600
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 2khoA06
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2khoA05
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2khoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2khoA04
3RSEB 2P9PB 3MDQA 4LC9B 3VGMA 3ENHA 3H0XA 3H45C 3VEOA 4H5VA 3H1VX 1BA0A 3OHXM 3DPPA 1YXQA 1HKBA 3A5NC 5KPRA 4EAHD 1J6ZA 1ZXOA 1TUUA 1QQOA 1Z6RA 3TPQA 1JCEA 5AQKA 3M1FA 4PL7A 3LDNA 3FR0A 4H0OA 4RTFD 3FLCO 4CZLA 5FPMA 3D2EA 4WQ4A 3FZKA 3A5MC 2QWRA 5EY4A 2A40A 1NBWA 3CQYA 3UKRA 5BRHA 3MN9A 5AQJA 1IJJA 2D0OA 2GTDA 4BRAA 3CQXA 3UB5A 1MA9B 4EIAA 2BPRA 3R9PA 4QS9A 4R5LA 3KVGA 2NLXA 2P9IA 2V52B 5AZJB 4K41A 2QWNA 1Q5LA 3HZ6A 4BRNA 5JLFA 2QM1A 5BPNA 4IZ9A 4BVOA 5AQZA 3LL3A 3VF6A 3QBXA 1S22A 2P9KA 1NGEA 4H5WA 4M7YA 2QWOA 1GLAG 3MN5A 4H0VB 4FWRA 2P9SB 1XQSC 3O6WA 5FPNA 3VGKA 1QHAA 1BUPA 4EZTA 3AAQA 3UKUA 3G25A 2CGJA 1K8KB 2ZGYA 4WQ4C 3EKSA 4IWVA 4GY2B 2F9TA 3VETA 4JNEA 4HY9A 5KQ8A 3IDHA 3FZMA 1RGIA 4ISEA 2FSNA 2E20A 3U9DA 1BA1A 1IG8A 1BPRA 5KQDA 3AARA 2A41A 4BGBA 1TYQA 2PAVA 3EO3A 4EZWA 2P9LA 1Z05A 3WEEA 4IO8A 2IIRA 1GLFO 4BR2A 5AQPA 4BREA 3F9MA 4FWNA 4BQLA 4JWDA 2E2NA 4FWMA 1NGCA 3MN7A 1BOTO 1YAGA 2YCHA 4JN4A 3D2FB 5BREA 1BU6O 3N8EA 4XH4A 4EZOA 3A8YA 2GEMA 4ISGA 5EOYA 3EKUA 4PO2A 3H1QA 2Q1NA 3O1BA 5ADXH 1U6ZA 3CETA 1KAYA 5AQOA 2CGLA 5ADXA 4EZZA 3SK3A 4WV5A 1JCGA 2QXLA 1NMDA 3GOIA 1KAZA 2NZTA 1BWFO 2ASOA 3GG4A 2BUPA 1WOQA 1DKGD 3HM8A 4FWPA 4Y0WA 1NGIA 4FSVA 2Q31A 3LDOA 2E88A 5CE3A 4HTLA 1BG3A 2WUSA 4K42A 4PKHA 4DHYA 1ATSA 2DPNA 3T4AG 3A5OC 4JHDB 3W0LA 4EFHA 1DKXA 3ZX0A 2W40A 2Q97A 4FPAA 2V51B 5AZJA 2P9UA 2KHOA 3IFRA 3QB0A 4BG8A 1GLJO 3VEZA 2ZGZA 4R5IA 1T6CA 2PBDA 4FPBA 3WT0A 4BRDA 1G99A 3BF1A 5AQVA 3QICA 4WV7A 2CGKA 3CJBA 5B8HA 2AP1A 4EZQA 2IVNA 4BRIA 2ASMA 2A42A 3CJ1A 4K25A 4WQ5A 3FE1A 3VERA 3L0QA 2P9SA 3DPOA 1HJOA 3C7NB 4R5GA 4M63C 4JD2B 3A0IX 3CHWA 5JLHA 2F9WA 1KAXA 4IJAA 2QWPA 4NO7A 4R5JA 1SAZA 5AZIA 1GLCG 1QQNA 3LDQA 3ENOA 5BPMA 3J8AA 3VF4A 1NGAA 1DKZA 2Q36A 4Z94A 1LCUA 2A3ZA 3ZX3A 3MN6A 5AQMA 4DQ8A 4ISFA 5TKYA 3LM9A 3GDQA 4PKIA 4BQZA 3U9ZA 5EVZA 3ULEA 4BRHA 4CZIA 3ZX2A 3P4IA 1NLVA 4E81A 3SMPA 1ZC6A 4H0YB 3EL2A 2YJFA 2J4RA 3I8BA 3SJHA 4B1ZA 4I6MA 3B8AX 1ATRA 2IVOA 3T46A 2VCPA 1U00A 4F9OA 1NGDA 2EWSA 1JCFA 1NWKA 3UE5A 2YHXA 1HX1A 2E1YA 1H1VA 2CH5A 4QS7A 4WQ5C 4YDUA 4CZJA 3VEVA 3QFPA 2HMPA 4BR5A 2OP6A 3EN9A 5LJWA 3HI0A 3DJCA 4MLEA 3FGUA 4BRFA 4B1YB 4KBOA 4EZPA 3R6MA 3VESA 3IMXA 4CZMA 4H6HA 4FO0A 1NGJA 1R59O 3CERA 3QMLA 4FOIA 3WXKA 5AQWA 1HKCA 4FWOA 4FOEA 4NB4A 4B9QA 3D7EO 4CBUA 3FZFA 2P9NB 1OKJA 4F00A 4JHDA 3L4IA 2Q2RA 3T48A 3H46O 1EQYA 1BO5O 1X9JA 4H0TB 4BR7A 4H0PA 3VENA 3GE1A 4IJNA 1NGBA 5JICA 5F0XA 3GBTA 4EZUA 4YDUC 5BRDA 2IVPA 3FZHA 4BR0A 2I7PA 3RSEA 2P9PA 3DXKB 1XC3A 4XH1A 1GLEG 5AQSA 3LDLA 4R5KA 1RDWX 5AQGA 3H6EA 3AAPA 3C7NA 1GLDG 4RCHA 4JD2A 3D2EB 3JS6A 2UYTA 4EHTA 3FZLA 3O4WA 4GNIA 4MLHA 5JMVA 1U2VB 2E2OA 1GLBG 1Y64A 4O8KA 4EZVA 4BRQA 2WINM 4L3QA 1DKYA 4A2AA 2W41A 4BGAA 3QNJA 4CBXA 2P9IB 4BC5A 1Q18A 4E1JA 3MMVA 2D0PA 3SLCA 1P8ZA 2E1ZA 3WQUA 5LJVA 3DQGA 4B1VA 4FWKA 3L3OM 1KXPA 5AQQA 2YHYA 1YUWA 5AQXA 4JWIA 4EZYA 2ASPA 5I9EB 1D4XA 4F01A 4QS8A 5BRFA 5AFUH 3T47A 3S41A 1C0FA 2FSKA 1ESVA 1NM1A 4PKGA 2GWJA 2A5XA 4WYBA 5AFUA 3FFKB 5F1XA 1QZ6A 1X3NA 4DCHA 4CJ7A 3CI5A 4B1XB 2VWBA 4BRPA 1RFQA 4BC2A 4JAXA 1E4FT 2YI1A 4AM6A 4H5RA 3U8XA 3O1WA 5FPEA 4FWSA 3TU5A 4BC4A 1K8KA 2V7ZA 5LY3A 1NGGA 2D4WA 5ELZA 4CZEA 3DXMB 5EX5A 2QW9A 1HUXA 3U4LA 4PL8A 5KPTA 4FWQA 3LDPA 1BDGA 4EZSA 4IXCA 3I33A 3JXUA 2NRHA 4EZXA 1SQKA 3WXJA 3VOVA 4CD1A 2FF6A 3VEWA 4CBWA 2FF3B 4RWTA 4BRGA 4M7XA 2FLOA 3O8MA 3A5LC 2QWQA 4HWIA 3BP8A 2BTFA 3HTVA 4XEIA 1XUPO 3DXKA 4B1UB 1S3XA 1TUYA 2VYPA 3ZETB 3D2FA 5AQYA 2Q0RA 3GL1A 3BF3A 5BN9A 4BC3A 3ID8A 1ATNA 4FWLA 3LM2A 2HOEA 4H6IA 4CZGA 4EHUA 1U2VA 3VEXA 4HYBA 4BG9A 3AY9A 4BRCA 3CJCA 3W3DA 5AQLA 4JNFA 1V4SA 3O08A 4EZNA 3DOBA 2E2QA 1QZ5A 1C0GA 2E2PA 2CH6A 2YJEA 3QFUA 3WQTA 1CZAN 4CD3A 2ZF5O 1YVNA 3WXIA 2P9UB 3DWLA 2Q0UA 2OANA 4EZRA 3ATVA 4CZFA 3IUCA 1HLUA 3CJ9A 3ZEUB 5FPDA 1T44A 1V4TA 2AA4A 3MK6A 3BUZB 5KPZA 3M6GA 1T6DA 4CZKA 3BEXA 1MWKA 2YHWA 3R8EA 1CKRA 4BRMA 1DEJA 4A2BA 3VEYA 4C23A 1NGFA 7HSCA 5AZIB 4J8FA 3HBTA 3CIPA 2E8AA 3VGLA 5BR9A 4JWEA 4CZHA 1MWMA 4H5TA 5EXWA 1WUAA 2QFFA 3DXMA 4H5NA 2GELA 4CI6A 3ULEB 3UKRB 1X3MA 3DPQA 2V7YA 1NGHA 5AR0A 2HF3A 4I6MB 2GWKA 4DB3A 3KZBA 3O5BA 5AQFA 2QWMA 1DG4A 4B1WB 4MO5A 3C0BA 2QWLA 3HSCA 3MCPA 4XH5A 3WXLA 5AQIA 3H3OB 3EZWA 3CJ7A 4JWCA 4A62A 4BR9A 5AQRA 4BRLA 4K43A 5AQHA 3DAWA 3OHRA 3VPZA 3ZETA 4BVPA 2P9KB 2ZWHA 3CJAA 4BROA 4A61A 3KHYA 5F2RA 4O5FA 3H3NO 3UKUB 5AQTA 2HF4A 3T49A 2H3GX 2FXUA 5E26A 4H03B 3VF2A 4BRKA 5AQUA 4FL9A 2A6AA 1GLLO 3QBWA 3M3ZA 1MDUB 2ITMA 2GUPA 1E4GT 3SMSA 1LOTB 1HKGA 4MO4A 5BN8A 3QDKA 4AM7A 1SZ2A 1TYQB 4H0XB 4BR4A 2P9LB 2FSJA 3O80A 2P9NA 2I7NA 1HPMA 1ZBSA 1DGKN 5E84A 5AQNA 1QQMA 3WEEB 5BPLA 2D1KA 3ZEUA 3L6QA 3WUHA 3ATUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9PB 3KLHA 4IO9L 4JI8K 3MDQA 2YLLA 3H0XA 3ENHA 4CGDA 1D9DA 2I61A 3H1VX 1Q8IA 3CCVN 3DPPA 3F7WA 3HVTA 3A5NC 3RRHA 4EAHD 1NK7A 4IFVA 1C55A 1QQOA 3HYFA 4DS5A 3TPQA 4BDYA 1JCEA 1VAZA 4CZLA 4RTFD 3I55N 3CCLN 5FPMA 2ZM6K 3D2EA 2KBKA 1A5WA 2JNSA 2WONA 3LALA 1CXQA 1NBWA 3C94A 3CQYA 2NRVA 4ILIA 2YIAA 2D0OA 1TKDA 2HHQA 1BIZA 4LH4A 4W5NA 3NHGA 3CQXA 2ZJQL 3SF4D 4AKVA 4EIAA 1WSGA 4FJ5A 4O5BA 2V52B 5AZJB 3EY1A 2PYLA 4C8LA 4JKFA 3HZ6A 4EZ6A 2QM1A 3AVMA 1LAWA 1YJWN 1S22A 4H5WA 1BCMA 4KHYA 4FLTA 4FK2A 2YNFA 3MN5A 2WYHA 1UGLA 1XQSC 2P9SB 4MQ3A 4IKFA 4EZTA 2QI2A 3UKUA 4LF9K 2ZGYA 2E6MA 4DS4A 4AEIA 4IWPA 4JNEA 5KQ8A 1X9SA 1VSJA 3IDHA 3KOWA 1RGIA 4ISEA 3KK2A 3RTVA 3L3VA 1C0TA 4YORA 1BA1A 1N4NA 4DTJA 2G8VA 2NRXA 3IS9A 1LWEA 2ZJPL 4IOAL 2P9LA 4BY9C 4HCCA 1JXBA 4IO8A 1DT9A 3C6HA 4OKEA 4BREA 2DFHA 1T7EA 5IWAK 1NGCA 1YAGA 4HVJA 5FLEX 1TKZA 4HUGA 3QNOA 2IS3A 4XH4A 4EZOA 2QKBA 3CM5A 4F4KA 2GEMA 3G9GA 4DSFA 1L3TA 1W9MA 5EOYA 3OW2M 1HR0K 3N4QA 1VHXA 4PO2A 1RT6A 1M1KO 3GKUA 4YOTA 3M5RA 5ADXH 1NKEA 3CFRA 3Q84A 5ADXA 4KPYA 4WV5A 1XWLA 1VQNN 4DTPA 4BNEA 4CFBA 4FWPA 4Y0WA 4JRPA 1NGIA 2E88A 3HSTB 4HTLA 3BUQA 4DSKA 4IFEA 3W0LA 4B3MK 3TAMA 3AVNA 3ZX0A 4DV2K 1RT1A 2EX3B 4BG8A 3BVVA 3P83D 4LH5A 3SCXA 1NK4A 2GX9A 3T3FA 1G15A 3DLRA 2RN2A 5B8HA 3CJBA 2XRIA 4UAFE 5C12A 2AP1A 4EZQA 4FJJA 1DTQA 4WQ5A 3FE1A 1RTHA 4DV7K 2BDPA 3ZSRA 4CJUA 4B9UA 1HJOA 2DFEA 4RW6A 3C7NB 3OYLA 4FLXA 4DV3K 3PIOL 2O8CA 3A0IX 3OYCA 3ENBA 1OH8A 4HR1A 2F9WA 3I8DA 4Z4GA 4R5JA 4DG1A 1RT2A 3LDQA 3VF4A 3DYAA 2LSNA 3S3NA 2E2FA 2A3ZA 5K14A 3JSMA 3OBWA 4UQGA 1U47A 3L8BA 1FJGK 4PKIA 2JWLA 4BQZA 3ULEA 1L3UA 3AO4A 3ZT1A 1Q82O 3ZSVA 1NLVA 1SN1A 3SMPA 4JKBA 3EL2A 2OPQA 3I8BA 3SJHA 2D4CA 4W5TA 4KH4A 3E9LA 4K8ZA 3KOXA 1ATRA 2IVOA 4M41A 3T46A 3B53X 4J2DA 4FZZA 5CY0A 4E0DA 4MDBA 4DV1K 3T19A 3OS2A 1Q9XA 3C6AA 3V6DA 1KFDA 4JK9A 3K5OA 2QTDA 3VEVA 4BR5A 1TKTA 3AVCA 3HI0A 4BRFA 3FGUA 4B1YB 5DM7L 2Z1IA 3CERA 1R59O 4CHOA 3D4YA 4BWMA 3PLAA 2Q3SA 4FWOA 4V1DC 4BEBA 3TAPA 1KQSM 3D7EO 3THYA 4HE7A 1U49A 4M3UA 3FZFA 3OYAA 2P9NB 1R33A 1UWBA 3T48A 4LY7A 3CCMN 1LW2A 3PY8A 4OLAA 3L3PA 1BO5O 4BR7A 4CHQA 5HRPA 4B9VA 3K57A 1L3SA 1TK5A 2YI8A 1HTYA 3SJJA 2MN5A 3CVRA 1S6QA 4BR0A 2I7PA 3V9XA 4DV4K 2ATQA 2F8SA 1BRZA 4KAZA 1RDWX 3H6EA 5CYQA 1BL3A 3CW4A 1WSEA 3D2EB 3I01A 4B3TK 2IC3A 4GNIA 5JMVA 3R3LA 1U2VB 2N69A 1YT3A 1HYSA 1OVYA 1Y64A 2RE2A 1T7AA 1OH7A 2Z0VA 4GW6A 4AF1A 1RTJA 4BRQA 3L56A 4A2AA 3J81O 4JKCA 3J7ZO 1BGXT 4BGAA 1UA0A 3QNJA 1I4TA 1Q18A 3DOKA 1P8ZA 5LJVA 4FWKA 1OA1A 1O13A 1RDAA 5E41A 1VSFA 5CY4A 4JLHA 4JWIA 1TQWA 4F01A 4QS8A 5BRFA 1HNZK 4JI6K 3T47A 3ISNC 2WTUA 2FSKA 2F1AA 1ESVA 3I56N 4KI4A 2ETJA 4PKGA 1J5OA 2F4VK 4ZTFA 4IG3A 4BRPA 4E1MA 4ILHA 1E4FT 1WSIA 3TARA 1VSDA 1VSLA 5HRSA 3SAFA 1FKPA 2FBVA 3O3GA 2V7ZA 3KP1A 2QKWA 1MU2A 3DX0A 2QW9A 3LZJA 3BZCA 1VSMA 2MI7A 3LDPA 3SUOA 3I33A 3JXUA 3QE6A 2NRTA 1HYVA 4CD1A 2WYIA 1BQNA 1VQKN 4BRGA 2FLOA 1BHLA 3BY5A 3O9QA 3KIOA 3C6TA 3E7UX 2EFLA 3HTVA 3DXKA 3SYVA 3AO5A 1TKXA 1S3XA 3IRXA 3V9SA 1HNWK 3D2FA 4UDXX 5AQYA 3GL1A 2HNDA 3BF3A 4LSLA 1ZYQA 3A98A 1I39A 3ID8A 4G1QA 3QEWA 4I2PA 3UITA 3HAIA 3ZT4A 2HOEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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