2KHOA

Nmr-rdc / xray structure of e. coli hsp70 (dnak) chaperone (1-605) complexed with adp and substrate
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
IIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGTFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFDELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock protein 70
publication title Solution conformation of wild-type E. coli Hsp70 (DnaK) chaperone complexed with ADP and substrate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 181
structure length 600
sequence length 600
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 2khoA06
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2khoA05
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2khoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2khoA04
4O5FA 1JCFA 1U2VB 1YXQA 3WEEB 3RSEA 2VWBA 5AQUA 1ATSA 1QZ5A 3VESA 4B1WB 3U9DA 3O80A 4FWLA 1JCEA 1WOQA 4WQ4A 3L4IA 1HUXA 4H0XB 3QMLA 3VGKA 3LDPA 2P9IA 2DPNA 4K42A 2E2QA 2A5XA 3ULEB 3DOBA 4BRNA 4EZPA 4BRMA 1ZBSA 3QBWA 2P9KB 1DEJA 3DPOA 1GLLO 1YVNA 5AR0A 5AQQA 2E2NA 1K8KA 2QWNA 1TUUA 5AQYA 3T47A 1MWMA 5E84A 3LDLA 3VF4A 2GEMA 2P9UA 4MO5A 1T44A 3LDOA 1KAZA 1TYQB 3EL2A 2V7YA 4A2AA 3WT0A 2QFFA 2YJFA 2ZGYA 2QWQA 2BUPA 3SJHA 3A5NC 1HJOA 1E4FT 5AZIA 3FLCO 3P4IA 3ZEUA 1X3NA 2Q1NA 4MLEA 4FPBA 4EZWA 4CZGA 3FZLA 4BRIA 4QS7A 5AQZA 1LOTB 4H6IA 3T4AG 1SQKA 4BRQA 2D4WA 4CBWA 2BTFA 1KAXA 2EWSA 4BQZA 4MO4A 4BGBA 3FR0A 2V7ZA 4ISFA 3MDQA 2ASOA 4HY9A 4BG9A 2ZWHA 2E2OA 3W3DA 3CETA 3DXKB 4FWSA 4R5KA 1U2VA 3H45C 2GELA 3WEEA 3ZETB 2P9SB 3ATVA 1XC3A 4JWIA 5AQNA 1DGKN 3TU5A 3VGMA 5AFUH 4A61A 4DCHA 1CZAN 4WV7A 5CE3A 1YUWA 1U00A 1X9JA 3BF3A 3IFRA 4FWQA 4EZXA 1QQMA 2P9NB 3FGUA 2Q2RA 1HPMA 1Q5LA 2ASMA 4H0VB 1ATNA 4EFHA 2NZTA 3BEXA 3VETA 5JLHA 3T46A 2KHOA 5AQGA 3F9MA 3ULEA 2QW9A 3ATUA 1TUYA 2QM1A 4FWKA 4H0YB 2P9KA 4JWEA 4IZ9A 4JD2A 1JCGA 1OKJA 3I8BA 1Y64A 4JWDA 5EXWA 4BR0A 5KPZA 5LJWA 2W41A 3LDNA 4RWTA 3VPZA 4B1UB 4M63C 4E81A 4BC3A 1NLVA 1YAGA 4EZYA 2A42A 3UKRB 4AM6A 3IMXA 5TKYA 3CJCA 3AAPA 3W0LA 1TYQA 2QWMA 2E20A 4BR9A 3LL3A 3FZKA 1SAZA 1U6ZA 1GLAG 1SZ2A 4PKHA 1HLUA 1GLBG 4IWVA 4R5IA 5BPMA 3MN7A 4CBUA 2A3ZA 4C23A 4H03B 1QZ6A 2Q31A 2ITMA 3S41A 5JICA 4BRFA 2FSJA 3UKUB 3G25A 2Q0UA 3CJ7A 3R8EA 2Q36A 4A2BA 3D7EO 1NGEA 4J8FA 5FPDA 4BRAA 3HTVA 3J8AA 3GE1A 4M7YA 4CZEA 4CBXA 3QNJA 1NGIA 3BUZB 2GWJA 2F9TA 1BA1A 5AQFA 3DXKA 4F01A 1ESVA 3ZETA 3QICA 2Q97A 4H5RA 4A62A 4BRDA 3HI0A 2P9NA 2UYTA 3SMSA 3VGLA 4EZZA 5ADXA 2VYPA 3HBTA 1BWFO 3I33A 4PO2A 3CJBA 3R9PA 5BREA 3KVGA 1QHAA 5EX5A 2QWPA 4CD1A 3MMVA 4IJAA 4M7XA 4QS9A 5AQHA 3EZWA 3EO3A 3GL1A 5I9EB 2NLXA 4L3QA 3VEWA 3ZX0A 4H0PA 4CZLA 3IUCA 1HX1A 2PAVA 4FO0A 1D4XA 4FWNA 4BRPA 3UKRA 3WXKA 2A40A 1NGGA 1ZC6A 5AQOA 1Z05A 3ZX3A 2OP6A 4H5VA 3WQUA 3H1VX 2J4RA 5AQKA 2AP1A 1NBWA 4GY2B 3LDQA 4XH4A 4B1ZA 5F0XA 1BA0A 2P9PA 3WXIA 3SLCA 3DQGA 2BPRA 4IXCA 4BC4A 4H5TA 4K41A 2CGJA 1E4GT 1V4TA 5BN9A 3C7NA 3CJ1A 4EZSA 1NGAA 4DHYA 1RFQA 3A8YA 3C0BA 2PBDA 4I6MB 3DXMB 2AA4A 4FPAA 1DKXA 3QDKA 2GTDA 2YCHA 5KPRA 3D2EB 3D2FB 2QWRA 4QS8A 3WXLA 4R5JA 2E1YA 2P9LB 3KZBA 5BN8A 4H0OA 3O4WA 3FZFA 4BQLA 5KQDA 3A5OC 4PKGA 2GWKA 1CKRA 3LM9A 4BC2A 4EZRA 3O1BA 2D0PA 2I7NA 3SMPA 4JNEA 1X3MA 4EAHD 4BVPA 1C0FA 1S3XA 1NM1A 2A6AA 5FPMA 3O5BA 1QQNA 4EZVA 3H6EA 2E88A 4FSVA 4WQ5C 3RSEB 2WINM 4H6HA 1XUPO 4B1VA 4BRKA 5BR9A 5ELZA 1MA9B 2VCPA 3EKSA 3MN6A 5AQRA 3H3OB 1DKYA 1RGIA 4F9OA 2I7PA 1Q18A 2V52B 5ADXH 2IVPA 4BRCA 5AQJA 2CH6A 5AQIA 5JMVA 3CQXA 4F00A 3CERA 3EN9A 3R6MA 3HZ6A 4KBOA 2FSKA 4K25A 3WQTA 2QWOA 2FXUA 3CI5A 1EQYA 1GLFO 4YDUC 1BPRA 2P9UB 5B8HA 2V51B 1V4SA 4IO8A 4CZHA 3H0XA 5AQMA 3MN9A 2FF3B 4JHDB 3HSCA 1ZXOA 4PKIA 4EZNA 1HKBA 3O1WA 4K43A 2YHWA 4FWPA 1BOTO 4BG8A 2ZGZA 3MK6A 3VOVA 3FZHA 1XQSC 2CH5A 3CHWA 5EOYA 3VEOA 4NB4A 1NGBA 5F2RA 2E8AA 2P9SA 2P9LA 1NMDA 4H5WA 3GG4A 1BO5O 2HF3A 4EZUA 3GDQA 4WQ4C 4CZJA 4BREA 4HYBA 4YDUA 4O8KA 2ASPA 4R5LA 1BUPA 1LCUA 3SK3A 5BRFA 2HOEA 3AARA 3L0QA 5FPNA 2YI1A 4BRHA 3UE5A 4R5GA 3L3OM 2YHXA 3VENA 4BVOA 4JAXA 4DB3A 1WUAA 4FL9A 2Q0RA 1NWKA 3GBTA 3CQYA 5E26A 3VEXA 5AQVA 3LM2A 4ISEA 4JNFA 2H3GX 3DAWA 1BG3A 4ISGA 4CD3A 3ENOA 3O8MA 2A41A 2FSNA 1KXPA 3FZMA 4FWOA 5BRDA 5LY3A 1NGHA 3DWLA 1BU6O 3BF1A 3BP8A 3DPQA 4HWIA 1ATRA 5BPNA 3VF6A 1BDGA 2WUSA 4CZKA 4JD2B 4IJNA 5EVZA 5AQTA 1NGFA 1DG4A 1IG8A 3M3ZA 3O6WA 4WYBA 3KHYA 3UB5A 2CGLA 1IJJA 3H1QA 4EZQA 5AQWA 3UKUA 3CJ9A 1H1VA 4JHDA 3ID8A 3H3NO 4FWRA 1KAYA 1R59O 4XH1A 4PL7A 2ZF5O 3M6GA 2QWLA 2CGKA 4XH5A 4BR2A 4BROA 4B9QA 4Y0WA 5AQSA 2QXLA 3GOIA 1DKGD 1P8ZA 2E2PA 3IDHA 4LC9B 4BRLA 2E1ZA 5AZJB 3CJAA 3T48A 3EKUA 4FOEA 4BR7A 5AQLA 3VEVA 2D1KA 4EZTA 3U8XA 2FF6A 4BGAA 3A0IX 3A5MC 3QB0A 1HKGA 2IVNA 3O08A 5EY4A 4MLHA 2YJEA 3JS6A 4GNIA 5AQPA 4H5NA 4CJ7A 1NGCA 1GLCG 3N8EA 4AM7A 4CZFA 4EHUA 3TPQA 1NGJA 3VEYA 4NO7A 5FPEA 3ENHA 5BRHA 3FE1A 3FFKB 1GLDG 4WV5A 1Z6RA 4FOIA 4JN4A 1T6CA 5KQ8A 2HF4A 3VEZA 1T6DA 4CZMA 3M1FA 1QQOA 1G99A 3QFPA 2P9IB 4RTFD 4BRGA 5KPTA 4CI6A 5BPLA 4JWCA 4XEIA 4PL8A 2YHYA 3MCPA 1RDWX 1MWKA 3WUHA 5LJVA 1K8KB 3JXUA 3QBXA 1HKCA 3B8AX 4EHTA 3DPPA 1GLJO 4WQ5A 4DQ8A 1MDUB 3HM8A 3CIPA 1S22A 3T49A 4EZOA 5F1XA 4I6MA 3MN5A 2W40A 3DJCA 3DXMA 2IIRA 3OHXM 5JLFA 2IVOA 4Z94A 2NRHA 3AY9A 3D2EA 1C0GA 1GLEG 3U4LA 4EIAA 2OANA 3D2FA 1DKZA 2GUPA 5AZIB 2HMPA 3ZEUB 3H46O 4H0TB 3A5LC 5AFUA 2P9PB 4HTLA 3ZX2A 4E1JA 3L6QA 5AZJA 3U9ZA 4B1YB 3WXJA 3VERA 3C7NB 2D0OA 3OHRA 4CZIA 1NGDA 4RCHA 4BR4A 3QFUA 4BR5A 2F9WA 4FWMA 3AAQA 4BC5A 5AQXA 7HSCA 1J6ZA 2FLOA 3VF2A 4B1XB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4X65K 1U45A 1DQ7A 1U2VB 1O1WA 3TSPA 1YXQA 4CGDA 4CJ4A 1XMOK 2RPIA 2E6MA 4BE2A 3CD6N 3SYVA 4ZTFA 5AQUA 1N6QA 3CM5A 2GA9D 2NRRA 4DR2K 3SI6A 3MEDA 4M45A 3O80A 3BUIA 3MEGA 1VQ7N 1UA1A 4KIKB 4WQ4A 3O3GA 3L4IA 3VGKA 4ATMA 1BHLA 3I55N 4FZSA 5FRMA 3R2VA 2P9IA 1K9MO 2E2QA 1RILA 3CMEN 3DOBA 3OYKA 3CFOA 2RHKA 3KLGA 1EP4A 5JS2A 3J7AP 3DPOA 1WB9A 4LF5K 1TQTA 4RW9A 5GINA 1DJTA 3KJVA 3KLIA 5E84A 2X78A 2F8TA 1N33K 1NK5A 3BZKA 1TV6A 1JLCA 3HXMA 1TQVA 3LDOA 3OA9A 1TYQB 2V7YA 4A2AA 3UIQA 4FJHA 4CFCA 2QFFA 1U47A 2KFZA 2XY5A 2ND0A 3VQBA 1WSEA 1E4FT 2C1IA 1K6YA 1YIJN 3ZEUA 4N41A 1RDUA 3FD9A 1C0UA 1BRZA 2Q1NA 1TK0A 4CZGA 1UWBA 4WCEL 2BH1A 1WT7A 2D4WA 1BIUA 1KAXA 2EWSA 3OYEA 1X1PA 3VQ9A 3CC2N 4BG9A 2F7RA 4IW0A 4CEDA 4HUFA 2E2OA 2PZSA 5C5BB 4FWSA 4R5KA 1UAXA 5FLXO 1I6GA 3LWMA 2A7TA 1XC3A 2YBRC 3ULDA 3NHGA 3TU5A 4DCHA 5CE3A 3C65A 3AVMA 3SAHA 2YL6A 3D4YA 4EZXA 5FLEX 1Y97A 1VK0A 4B9SA 3IS9A 4O4GA 2YIAA 2NZTA 1XHZA 1C56A 4HE7A 2D0BA 5J2QA 3HAJA 2P9KA 3KKRA 4IZ9A 1KVCA 3HL8A 3TAMA 1WDZA 1GOBA 3AO3A 4BC3A 4E81A 3HPGA 2E5LK 1YAGA 1B9DA 3UKRB 1U4BA 4MDAA 5TKYA 3WNFA 4GMJB 3SBGA 1VNBA 2K35A 4M3ZA 4FK2A 3DRPA 4OPAA 3KK7A 1M1KO 4PKHA 4GKJK 1HLUA 1OH5A 1NU0A 3SAFA 4CJVA 4IWVA 3KAVA 3RMBA 4OKJA 3MN7A 4CBUA 4F3TA 1GNTA 4DTSA 2D56A 4JKCA 3VN5A 1K73O 5M1OA 3V9WA 4F4KA 3QEWA 3CJ7A 3KD5E 3D7EO 5FPDA 2Q12A 3SUQA 3J8AA 3S9HA 3I8DA 4ZTJA 3ZSYA 1NGIA 3BUZB 4M3WA 3BUQA 3EEQA 3SQ1A 3RR8A 4BACA 4Z4FA 4F01A 2JWKA 3ZETA 1OMYA 4UADE 1RDAA 3MXMA 1RNHA 2FBYA 3OYMA 4DTRA 4OLBA 4DR6K 4C8NA 4MQ3A 3C6UA 3THXA 2F1BA 4CHOA 3HOTA 1UPXA 3PX0A 2VYPA 1W9MA 1YVUA 3R9PA 3I0RA 5EX5A 2LJMA 3V9ZA 4GW6A 4DV3K 4B3OA 2QWPA 4CD1A 3NF9A 4QS9A 2HNYA 3OYDA 1DT9A 3EO3A 2BANA 1GPTA 2NLXA 4R79A 3G6EN 4L3QA 3VEWA 4NYNA 1IKXA 3IUCA 1HX1A 2PAVA 5EU7A 1X9WA 5D3GA 5HROA 4NYFA 1VSKA 4JLHA 4OJRA 3WXKA 2A40A 4B9NA 3CV5A 1ZBUA 4HVJA 1Q82O 4UAEF 1IKYA 3ZX3A 2E4LA 2OP6A 3CC4N 1JLFA 4YY3K 4YOVA 2J4RA 5AQKA 4G9ZA 1NBWA 1B3CA 1HJRA 4CEZA 2DTUA 5KRSA 3ZEDA 5DM7L 4F2SA 2O8EB 4IFEA 4H8KA 1BA0A 2P9PA 3SLCA 4OKEA 2BPRA 2LKBA 3AV9A 4H5TA 3MX5A 4K41A 4FJ7A 3CYMA 3CJ1A 1BISA 3C7NA 3VQ5A 4EZSA 3PX6A 4DHYA 1S72N 3C0BA 2OBLA 1T8EA 4MDBA 1JXBA 1FH3A 1REVA 4FPAA 3LPUA 3TAPA 3CCUN 3SQ0A 4FJNA 3V1OA 1WWNA 5FRNA 1E9VA 4RW4A 3B6PA 3K5MA 2G8HA 2P9LB 3KZBA 3KK3A 3A5OC 4PKGA 1VQMN 3CPEA 1HYVA 1BQMA 4U67L 4UDXX 4KIKA 4BC2A 3T69A 4EZRA 1WSFA 3QERA 1OH6A 2OW7A 2I7NA 1D9DA 4AHTA 2RF2A 3MWPA 4BVPA 3SUOA 2N66A 1S3XA 2A6AA 2YILA 1QQNA 2A1SA 2FYVA 1HRHA 2F7QA 4WQ5C 3RSEB 3L2UA 2WINM 4H6HA 1TQUA 3DMJA 2X3VA 1HWWA 1FXXA 2UUCK 4DKWA 3H3OB 1DKYA 1NNEA 1RGIA 4YNQA 3BGRA 2V52B 4BRCA 4JI2K 2PFUA 3TWHA 3BVVA 3D6RA 2KKZA 4F00A 3CFRA 3QINA 3HSTB 1N34K 1M90O 4K8XA 3ZSWA 4AAZA 3CI5A 4DFPA 1EQYA 1GLFO 2VG7A 3NGYA 2MI7A 3VTHA 3F9KA 3MN9A 1LQ7A 4JHDB 1ZXOA 3G71N 4DV6K 1S9GA 3MK6A 3BVUA 5KGWA 4B9VA 5EOYA 1ZBLA 1TI5A 2V0OA 1R0AA 2ELBA 1NMDA 3BY5A 3R3LA 4JK7A 4E0DA 4AB0A 4Q0BA 3AGRA 2JNKA 3LZIA 4FZZA 4JK9A 4YDUA 3KIOA 2ASPA 1NJWA 1LCUA 2YKTA 1CXQA 3SK3A 2OCEA 1VQ8N 2HOEA 1KSPA 1ZU3A 4BRHA 4IDHA 5C15A 2YHXA 4CEEA 1IKWA 4JAXA 1T03A 5MLCQ 1NWKA 5E26A 4JS4A 1QWNA 1I6FA 1HTYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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