2KHOA

Nmr-rdc / xray structure of e. coli hsp70 (dnak) chaperone (1-605) complexed with adp and substrate
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
IIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGTFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFDELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Heat shock protein 70
publication title Solution conformation of wild-type E. coli Hsp70 (DnaK) chaperone complexed with ADP and substrate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Chaperone
total genus 181
structure length 600
sequence length 600
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 2khoA06
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2khoA05
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2khoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2khoA04
4H5RA 2ZGZA 4JWEA 1QQMA 3J8AA 5AQYA 1K8KA 2P9PA 4FWQA 3UE5A 4BR2A 4IO8A 3FFKB 3R9PA 3QFPA 1GLFO 2A40A 3H46O 5AQFA 2F9TA 2PAVA 3DPOA 3H0XA 3M3ZA 1HPMA 1EQYA 3LDNA 2ASPA 5EOYA 2OP6A 4Z94A 5AZJA 3BF3A 4WYBA 3H45C 1IG8A 3P4IA 3N8EA 4BROA 4H0VB 4BRKA 3UB5A 3FGUA 4FWSA 4BRCA 2YHWA 3VENA 3EKUA 3WUHA 1QQOA 1T44A 3WXLA 1X3NA 4ISGA 3T4AG 1QHAA 5KQDA 1XC3A 3CJ7A 3BEXA 5JLFA 2FSNA 4BR7A 4C23A 2YI1A 4BC2A 3VGKA 5FPMA 1HJOA 1U00A 4CJ7A 4K43A 3MCPA 4M7YA 3M6GA 4PL8A 3DQGA 3DOBA 4WQ5C 3A8YA 4JD2B 3C0BA 4RTFD 1NGBA 2VWBA 3WXJA 1J6ZA 3ULEB 3A5OC 5BPMA 3HZ6A 4BRFA 3GL1A 3D2FB 5BRDA 5EVZA 2FSJA 3CQYA 3O1BA 4BC4A 2E2QA 1HX1A 4MO4A 3SMPA 4BRAA 2A5XA 2Q31A 4EZRA 4EZSA 3U4LA 2UYTA 5EXWA 4R5GA 2E1YA 4QS9A 1TYQB 1NGHA 4EZZA 4H5WA 2J4RA 2ZF5O 4FPBA 2F9WA 1CKRA 5BN8A 2H3GX 4CZJA 5BPLA 2IVPA 5JMVA 5AQJA 4A2AA 2A3ZA 1D4XA 3BUZB 3D2EA 2HF3A 4JNEA 5AQXA 3BF1A 1C0GA 5E26A 4JHDB 5AQUA 2P9KA 4EZPA 3JS6A 3DXMB 3U9ZA 5BPNA 4A2BA 1GLLO 3WEEB 2QWOA 2KHOA 2YJFA 4EZXA 1DKZA 1BG3A 1NGCA 3O4WA 3VEVA 5EX5A 2P9NA 3FZFA 4NB4A 3C7NA 1BPRA 3ATUA 4JNFA 3DJCA 5AFUH 1BWFO 4K41A 2PBDA 4FWRA 1BA1A 2ZWHA 3A5MC 3CIPA 2Q0RA 4QS7A 3VEZA 3ZETA 3WXKA 3DXKB 3AARA 1R59O 2FLOA 3VGLA 4MLHA 3MK6A 3MN6A 1BO5O 3T48A 2D0PA 4AM7A 1SAZA 2A42A 1DKYA 1HKCA 1V4TA 4IXCA 4BRPA 4F00A 5E84A 1HKBA 4F01A 1HUXA 4EZWA 4I6MA 1T6DA 3H1QA 3L6QA 2BUPA 4JWIA 3AY9A 4XH1A 2P9LA 5AFUA 2GEMA 4H0XB 2A6AA 2A41A 4BRHA 4CZGA 1OKJA 3CETA 2GWJA 4QS8A 5AQHA 4FL9A 2YCHA 4JD2A 5B8HA 5KPZA 1U2VA 2QWPA 2QM1A 3QICA 5AQSA 4WQ4A 4JN4A 3ULEA 4B1VA 4GNIA 3VF6A 2V7YA 2QWNA 2QW9A 3I8BA 4B1WB 4R5LA 5AQPA 3SJHA 3LDQA 2D4WA 5CE3A 2E2PA 3LL3A 4H5NA 3CQXA 1MWMA 1S22A 3IFRA 3O6WA 4H03B 4H0TB 3GOIA 4DCHA 5KQ8A 3SK3A 3GE1A 2CGLA 3O80A 3VEWA 4B1UB 1YVNA 4CBUA 4H0PA 1H1VA 3WQTA 4BRGA 4NO7A 3FZKA 2GWKA 4EZNA 3JXUA 4FPAA 5AZIA 3OHRA 5TKYA 1ATRA 5ELZA 4E81A 1Q18A 5ADXH 3VETA 4BQZA 4BREA 4BVOA 4FWLA 4GY2B 3EO3A 2E88A 4CZIA 1BDGA 3VEXA 4O5FA 4JWCA 3LDOA 1TUYA 3CERA 4XEIA 3VGMA 5AQZA 4HWIA 4CI6A 5BN9A 3KZBA 2HF4A 2V52B 3EZWA 3ID8A 2VYPA 4LC9B 1DKGD 1E4GT 1GLBG 4YDUC 2P9IB 2AP1A 2GTDA 2OANA 4EIAA 4O8KA 3VF2A 1NGGA 3A0IX 3DXKA 1BU6O 5ADXA 1ZXOA 3QDKA 5AQKA 4FWNA 2P9SA 1GLDG 3W0LA 1GLEG 1DKXA 1RFQA 1KAXA 1SZ2A 1G99A 2Q97A 3ZEUB 2CH6A 2QWQA 4WQ5A 5BR9A 3CJBA 3HM8A 1BOTO 2FF6A 4K42A 3QNJA 3MN9A 1S3XA 1CZAN 3I33A 4CBWA 1NBWA 2Q1NA 3L4IA 2GELA 1JCFA 3TPQA 2BTFA 5KPTA 3CJCA 1NGIA 4B1YB 2QXLA 2Q36A 4WV7A 3QMLA 3G25A 4EFHA 5AQWA 4XH5A 4BVPA 3SLCA 3ZX2A 2P9UB 3QB0A 5BRHA 1GLCG 2BPRA 4XH4A 3UKRB 1KAYA 3IMXA 5AQNA 4CZLA 2FSKA 2E1ZA 3FLCO 5AR0A 2D0OA 3M1FA 3VESA 3L3OM 3CI5A 3IUCA 4HYBA 3DAWA 4BRNA 3ZX3A 4PKHA 3L0QA 4CD1A 4EHUA 4KBOA 4H6IA 2W41A 4K25A 3U9DA 5LJWA 3T49A 4BRLA 4EZYA 2ASOA 4IWVA 5F0XA 2QWLA 4FOIA 1NGFA 3GBTA 3MMVA 2YJEA 4BR0A 3CJ9A 1C0FA 1ATSA 1MWKA 4AM6A 1NGDA 4E1JA 2QFFA 3A5NC 3O1WA 3UKUB 1RDWX 1ZBSA 2QWRA 3W3DA 3LDLA 3MDQA 3IDHA 3FZLA 4CD3A 5JLHA 4CZFA 3R8EA 3A5LC 3MN5A 2YHXA 3D2FA 4BR9A 4L3QA 3CJAA 2ITMA 5AQIA 3FZMA 2Q0UA 4CZKA 7HSCA 5F1XA 1DG4A 2EWSA 3R6MA 5EY4A 4PKGA 4PKIA 4PO2A 2YHYA 3RSEB 3VPZA 3ZEUA 5FPDA 1XQSC 3VERA 5I9EB 1T6CA 3HSCA 4HTLA 2P9KB 4BGAA 4WV5A 4BRIA 1TYQA 3AAPA 1DGKN 1WUAA 4EZTA 2CGJA 3CJ1A 1MA9B 2NLXA 3O8MA 4BG9A 3KVGA 4R5JA 3FZHA 3HBTA 1GLJO 4RCHA 1YAGA 2P9NB 3FR0A 5LJVA 1SQKA 3C7NB 2P9UA 4JHDA 3DXMA 3UKRA 3EL2A 3H6EA 2VCPA 2NZTA 3GG4A 3WEEA 4FWPA 1XUPO 3QBXA 3ZETB 5KPRA 2IIRA 3VEYA 2D1KA 3H3OB 3QFUA 2E2NA 5AQLA 4ISEA 4PL7A 4EZQA 4EZOA 3DWLA 2IVNA 3LM2A 2NRHA 3BP8A 1LOTB 2E20A 2WUSA 1V4SA 1QQNA 1HLUA 4BR5A 3WQUA 4A61A 2FF3B 4I6MB 1HKGA 2P9LB 4FWMA 4MO5A 4MLEA 4EAHD 1BUPA 3LM9A 4CZEA 3FE1A 1RGIA 1KXPA 4BG8A 3DPQA 1U2VB 5JICA 4HY9A 1JCGA 1ESVA 4YDUA 1NGJA 2V51B 1NGAA 4FOEA 3VEOA 2E2OA 5LY3A 3UKUA 3F9MA 1QZ5A 3EKSA 4H6HA 1NM1A 4FO0A 3KHYA 3B8AX 4DB3A 2QWMA 1K8KB 1JCEA 1DEJA 2IVOA 2P9PB 3OHXM 4CBXA 1ATNA 1Z6RA 5FPEA 2ASMA 2CGKA 3H1VX 3T47A 1Q5LA 4M63C 2Q2RA 3VOVA 4DQ8A 5BREA 5AZIB 2WINM 3O08A 4H0YB 1Z05A 5AZJB 1NMDA 1WOQA 3ENOA 1QZ6A 4CZHA 3RSEA 4JAXA 2I7PA 4BC5A 1IJJA 3D7EO 1BA0A 3O5BA 3VF4A 4EZUA 1YXQA 2DPNA 3ENHA 3MN7A 5AQGA 4IZ9A 4B9QA 1X3MA 2I7NA 4IJAA 1NWKA 2E8AA 4B1XB 4BGBA 5AQVA 1YUWA 3QBWA 1Y64A 2GUPA 4FWOA 4H0OA 3SMSA 4FSVA 2CH5A 3LDPA 4EHTA 3GDQA 4ISFA 5FPNA 2ZGYA 5AQMA 1MDUB 2AA4A 4H5VA 4BR4A 4B1ZA 4FWKA 3TU5A 4Y0WA 3AAQA 4RWTA 3CHWA 3WT0A 3DPPA 2P9SB 2FXUA 4M7XA 4J8FA 1ZC6A 2HOEA 2W40A 4BRDA 4WQ4C 2P9IA 4IJNA 3EN9A 5AQTA 3H3NO 4BRMA 2V7ZA 4BQLA 5AQOA 4R5KA 5AQRA 3HI0A 4R5IA 1KAZA 1NGEA 1X9JA 4BC3A 3ATVA 1P8ZA 3D2EB 2HMPA 3ZX0A 4DHYA 1GLAG 1U6ZA 4EZVA 1NLVA 4BRQA 4H5TA 5F2RA 5AQQA 3U8XA 4JWDA 4CZMA 1LCUA 1TUUA 3WXIA 3S41A 3T46A 4F9OA 5BRFA 3HTVA 1E4FT 4A62A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JKZA 4H5RA 2ZGZA 1IKXA 3J8AA 3PO4A 2P9PA 1M90O 4IO8A 5E41A 1AHOA 1GLFO 1ZBLA 3LPUA 1EX4A 4CGGA 2ZE2A 2F9TA 2PAVA 2E3FA 3DPOA 3I04A 4CEFA 4CF1A 4LF6K 3M3ZA 3HOTA 2ASPA 3BY5A 5EOYA 4E72A 3E66A 1W9MA 1BIUA 3H45C 2E4LA 3UB5A 3PO5A 4E1MA 1X3NA 3BK3C 3T4AG 1QHAA 3BVVA 3THWA 4X62K 1P0AA 5DMRA 1QX1A 3CCUN 5JS2A 3PSFA 3NH1A 2KZZA 4ATMA 4J2BA 3VQCA 1HJOA 1O7DB 4K43A 3F73A 2F18A 3M6GA 3U6FA 3CYMA 4CEDA 3DOBA 2WONA 4HHTA 3A8YA 4E3SA 4LFCK 4RTFD 2XY5A 1X04A 2F1BA 2VWBA 2O0I1 3A5OC 5BPMA 3SQ4A 1JXBA 3OVNA 1YITN 3D2FB 3O1BA 1HX1A 1BISA 4BRAA 1TKDA 2Q31A 4OPAA 1W2BM 3HP9A 1SL2A 5EXWA 2LT8A 4ICLA 2E1YA 4QS9A 3ZCMA 4KYPA 4HUFA 1QE1A 1BQMA 4KREA 4EZZA 1NPIA 4H5WA 3O9RA 4FPBA 3LPTA 1IH7A 5BN8A 2UXCK 2IVPA 3SAGA 1ASVA 2YNHA 4JKGA 4A2AA 4FJJA 4XJXA 4DUZK 1U4BA 1NJXA 3B52X 5A2QO 3AVLA 5KGWA 3DLRA 3VMFB 3KOYA 4JHDB 1RT2A 2RAIA 4EZPA 2P9KA 5KGXA 4BEBA 4CF9A 4HCBA 3QIOA 2HBLA 4NCGA 3RMAA 3LLLA 5HP1A 2KHOA 4EZXA 4V19S 3O4WA 1M1KO 5EX5A 4E1NA 3AA2A 2KTQA 2PBDA 1UGLA 4ID5A 3I0SA 2ZWHA 3A5MC 4QS7A 3VEZA 2QXFA 4G6QA 3VGLA 4QOZB 4FW1A 5HBMA 3TANA 1SAZA 4E7JA 2A42A 1CZBA 1DKYA 4DQRA 3C6TA 4B9UA 3K57A 3F9KA 2Q13A 1HNWK 3CMEN 1CHZA 2VGMA 2HHQA 1LAWA 1B7DA 4CJRA 3JSMA 4M42A 2BUPA 4JWIA 1XNRK 4XH1A 3A2FA 1SKSA 3SYVA 4IOAL 2A41A 2B3CA 3DLKA 2E3GA 2YLLA 3CQ8A 1OKJA 2GWJA 4QS8A 5AQHA 5B8HA 5KPZA 4Z4FA 3J7AP 1UWBA 4NXMK 2KFNA 4IDKA 3DX3A 5FLXO 5AQSA 2RF2A 4IM0A 3CC2N 2WBNA 4KKOA 2QWNA 1T3VA 3I8BA 4LF8K 4R5LA 2IOCA 2IDOA 2OCEA 2VQEK 2E2PA 3U3YA 1E3MA 4AVMA 3IFRA 4H03B 4DCHA 2Z1JA 2DTUA 4YOVA 4B08A 4GV9A 1U04A 3AGKA 1C56A 3NGIA 3A98A 2WYHA 1ZYQA 4CGIA 3TTCA 1QWNA 4Z4CA 3ZT0A 3KAWA 3CW4A 4AHVA 5TKYA 1ATRA 5HLFA 3B6PA 4FK0A 3D50A 2DFHA 3TARA 2EX3B 4DTMA 2Z0NA 4NYFA 1TQVA 4FLTA 5D3GA 1T7EA 4CZIA 4AZGA 5HRPA 3M8RA 2LJ7A 4CHYA 4O5FA 2OPSA 3ENBA 1RBVA 1SU7A 2NNWA 3I01A 1VQ7N 1X03A 4LD0A 1REVA 5BN9A 1WLJA 3G0ZA 3SQ0A 3EZWA 5HROA 3CC4N 3ID8A 2VYPA 1DKGD 4J2DA 2P9IB 2AP1A 1MJGA 4O8KA 3BUQA 1NGGA 3DXKA 1KCFA 2YV0X 2W00A 3WNFA 1C0TA 2P9SA 3O9QA 1RBRA 2QI2A 1KAXA 4Z4GA 3OK8A 1GNLA 3KHWA 2QWQA 5C5BB 4M3WA 4B3SK 4OLBA 1I4TA 2FC0A 3I33A 1NBWA 2Q1NA 2YC1C 3ZT2A 4G1QA 2BTFA 1NG9A 3HRGA 2ZJPL 3V4IA 3ABHA 1NGIA 2QXLA 4LFBK 3G25A 1JLBA 5AQWA 1TQUA 4CGJA 2O8CA 2P9UB 1GLCG 3UKRB 1KVBA 2UXDK 1VSHA 1KFDA 2W6KA 3IMXA 3ER9B 4ELUA 2E1ZA 3FLCO 3VESA 1GOAA 3CI5A 4WFNL 1RTHA 4HYBA 2XO7A 4BRNA 4RW9A 3V9ZA 3K2PA 1R0AA 3O4QA 3SUPA 1SU6A 4H6IA 3OYGA 1L3UA 3AVBA 1EP4A 1LAVA 2P51A 4IWVA 3BUDA 1BK8A 4DKWA 1XMOK 1ZBIA 3GBTA 3HXMA 2OYQA 1IV0A 4BR0A 4CF2A 2E6LA 1MWKA 1RDAA 3KK7A 3QINA 4Y1CA 1RCHA 2PY6A 4GV6A 1RDWX 2ETJA 4JLHA 1RT3A 3DRPA 1XC9A 2C08A 1SEGA 3DRRA 4YOXA 3IDHA 2HHSA 1HWWA 2GBZA 3FZLA 4CHZA 4CD3A 1JQKA 1T7BA 3NHGA 2YHXA 4F2RA 3DLGA 4L3QA 4E3CA 1YT3A 2JWKA 4CEQA 4CZKA 4KHUA 4PKIA 4PO2A 2YHYA 3U3GA 1VSDA 4JI7K 2X3VA 1XQSC 3VERA 4CJEA 3DOLA 4Z4HA 4KHNA 4BGAA 4C1NK 4E89A 1TYQA 4OGEA 2CGJA 3ZSXA 3LWMA 2EFKA 2I61A 1S1TA 4BG9A 3KVGA 4NCAA 3SUOA 2LM0A 1HYZA 4DV2K 3ZYYX 2OTLN 4E19A 1SQKA 5FDLA 3DXMA 3EL2A 1C0MA 1WB9A 2NZTA 1KV0A 3SV3A 4FWPA 4KHWA 1XUPO 4NQIA 1P90A 3ZETB 5CYQA 4X65K 3OYHA 2GUIA 1HRHA 2D1KA 4Z0UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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