5E84A

Atp-bound state of bip
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
606
structure length
606
Chain Sequence
b'SEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGAFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSVGGTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Close and Allosteric Opening of the Polypeptide-Binding Site in a Human Hsp70 Chaperone BiP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 187
structure length 606
sequence length 606
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-10-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 5e84A05
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 5e84A04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5e84A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5e84A01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5e84A03
2GWKA 5E84A 3BP8A 4IWVA 4DB3A 4M63C 5AQSA 4BC2A 5AQFA 3L6QA 3ZETB 2A40A 4F9OA 2FF6A 2W41A 3QFUA 4CBWA 2CH6A 3BF1A 4EZOA 4JHDA 1SZ2A 2V51B 4CZEA 4BRNA 2AA4A 4MLHA 4M7YA 4O5FA 4BRIA 3FGUA 4RWTA 1ESVA 1SAZA 4JWCA 4WQ5A 3CETA 3VEWA 3H1VX 4Z94A 1MWKA 1E4GT 3CJ1A 1LCUA 2GTDA 4BC5A 4BRFA 4BRHA 5KQ8A 3T47A 2FLOA 1NGCA 4EHUA 3BF3A 1S22A 4XH5A 2BUPA 1H1VA 3WQTA 3ULEA 4F01A 4BVPA 1DKGD 3FE1A 3FZHA 2P9PB 3I8BA 3I33A 4MLEA 2IVPA 3VETA 4B1WB 4BRPA 3LDLA 1QQNA 3ENHA 3R9PA 4WV7A 4BQLA 4E1JA 1U2VB 1NBWA 3IDHA 1QQMA 3TPQA 3VEYA 3WT0A 1GLAG 3WXJA 3CI5A 3DPQA 1BA1A 3UKRB 2YHWA 5ADXH 1NGDA 4JD2B 2F9TA 4QS7A 3JXUA 5AQQA 1RDWX 3T48A 2BTFA 3DXMA 4BR9A 4EZWA 5BN8A 1BO5O 1NGEA 4BC4A 3R8EA 3QB0A 2ASOA 4CD3A 4J8FA 5BPMA 1NGJA 3CJCA 5FPDA 1TYQA 2IVNA 4FWPA 1NLVA 4EZXA 4IJNA 4FWSA 4H6IA 3DPOA 2PAVA 5AFUA 1X9JA 4BRCA 4EAHD 4C23A 1G99A 4JHDB 3T49A 2CGKA 1QQOA 4H5RA 3C7NA 4YDUA 3MMVA 1S3XA 3T4AG 3CERA 1X3MA 4JN4A 3W0LA 4BR4A 4I6MA 5I9EB 3U9DA 1BU6O 2E2PA 3ID8A 1NM1A 5LY3A 4ISGA 3DPPA 4R5KA 3F9MA 3AAQA 3LDPA 3EN9A 1YAGA 5ELZA 3SLCA 2QWQA 4K25A 3LM2A 4CZIA 3D2FA 4EZUA 3ULEB 3QBWA 5JLHA 4BGBA 3LDQA 1GLEG 2GELA 4R5IA 3FZFA 1BOTO 1NGHA 1KAXA 5BRDA 5JICA 3SMPA 2AP1A 1NMDA 3SMSA 4B9QA 1GLBG 4F00A 3O1BA 4BQZA 5LJVA 3VEZA 2H3GX 4AM6A 3VEOA 2P9PA 3DAWA 2V52B 4MO5A 4IZ9A 3EKUA 3DXMB 4R5LA 4EFHA 2Q0UA 3FZMA 3VEVA 3MN5A 4Y0WA 4DHYA 4LC9B 3JS6A 4QS8A 1WUAA 4WQ5C 4HWIA 4BR2A 4FWKA 1TYQB 4EIAA 2IVOA 3AARA 4DQ8A 3VEXA 4BRAA 3WUHA 3QFPA 3DJCA 3LM9A 4O8KA 2Q97A 5E26A 2J4RA 2VYPA 1V4TA 2QWRA 1C0FA 3DWLA 4BG9A 4BRQA 1HKCA 5AQOA 3FFKB 5EY4A 1RFQA 4DCHA 3C7NB 4H0YB 1HKGA 4M7XA 3O08A 4ISEA 2QWMA 2YHYA 5EXWA 1JCFA 4HTLA 4I6MB 1IJJA 5AQJA 1ZC6A 2CGJA 2ZF5O 1QHAA 4IXCA 2A42A 2FF3B 4K43A 2E1ZA 4CZHA 3D2EA 3BUZB 3D2FB 4CJ7A 4EHTA 2D4WA 3FLCO 3U4LA 5FPNA 5AQTA 1LOTB 4BVOA 4BRDA 2P9LA 3TU5A 3HZ6A 4H5NA 4FWNA 2ZGYA 4FWOA 4CZFA 5F2RA 4FOEA 3CIPA 4WQ4A 3LL3A 4AM7A 2FSNA 1RGIA 1K8KA 5AQLA 3FR0A 4H6HA 4CD1A 1NGIA 5AQGA 3EKSA 3GDQA 4PL8A 3CQYA 3LDOA 4JAXA 4EZZA 3GOIA 2FSKA 2NRHA 3GBTA 5AZIA 1QZ5A 3L4IA 4H0XB 4QS9A 3UB5A 5BRFA 3IMXA 5BREA 1SQKA 3QNJA 2E2NA 3A5OC 3HBTA 2E2QA 3U9ZA 4PKGA 1TUUA 3ZEUA 1ZBSA 2GWJA 5KPZA 4FWMA 4JWIA 3A5MC 4BR7A 4CZJA 3HSCA 3B8AX 3VF6A 1U6ZA 2DPNA 1DKYA 5B8HA 3D2EB 2QM1A 4BRGA 3VF2A 2E88A 1IG8A 2P9LB 3O6WA 2HF3A 1KAYA 5AZJA 3UE5A 3IFRA 4GNIA 5EVZA 1KAZA 4BR0A 3QBXA 1Z6RA 4WV5A 2HOEA 3HTVA 4FOIA 4H5WA 1U00A 1BA0A 1GLLO 3AAPA 3MN9A 3VPZA 1K8KB 1ATRA 4FWQA 4H0OA 1DKXA 4NB4A 1GLFO 2QWOA 4EZSA 3RSEA 4H0PA 4WYBA 3VENA 3CQXA 1NGAA 2V7YA 3DXKA 1P8ZA 4FO0A 4CZGA 5FPMA 4JWDA 2A5XA 2QXLA 3A5LC 3M6GA 5AZIB 4KBOA 3SJHA 2ZGZA 3R6MA 3S41A 2P9KA 4FSVA 5AQRA 2HF4A 4PKHA 7HSCA 3O1WA 2P9IA 3LDNA 3CHWA 4A61A 3QDKA 1BWFO 1HLUA 3GE1A 2A6AA 3MCPA 3ZEUB 5KPTA 4RTFD 1JCEA 3IUCA 3VOVA 4H5TA 4NO7A 5ADXA 3CJBA 3DQGA 2YCHA 3MN6A 4XH4A 1Q18A 1GLCG 2E20A 4GY2B 2Q2RA 5AQYA 4XH1A 4BG8A 1MDUB 4BRLA 3AY9A 1NWKA 1TUYA 4BRMA 2E1YA 2P9SA 4PO2A 3OHRA 5AZJB 3O5BA 2I7PA 4B1VA 3P4IA 4R5GA 1Z05A 3H46O 2YHXA 2D0PA 2NZTA 4HY9A 5AQPA 5JLFA 4HYBA 2EWSA 1YXQA 1DEJA 2W40A 2NLXA 5KPRA 4K41A 1ATNA 3M1FA 2FSJA 3RSEB 4EZVA 3O4WA 3L0QA 3N8EA 4JWEA 1XUPO 5AQIA 3DXKB 2OP6A 5AQNA 2FXUA 2GEMA 5BN9A 1T44A 3SK3A 4L3QA 3WEEA 4A2AA 4H0VB 3EZWA 3ATUA 4H5VA 4CBXA 1CKRA 3VGMA 2P9KB 3QMLA 4YDUC 4FPBA 1MA9B 4FL9A 1D4XA 2P9IB 4JNFA 4IJAA 2PBDA 3VESA 4R5JA 4MO4A 4BC3A 1DG4A 1T6DA 1R59O 3UKUA 1C0GA 4FPAA 5BR9A 4CI6A 3ZX2A 1YUWA 3FZLA 1ATSA 2QFFA 2YJEA 3CJ7A 2P9NA 1MWMA 2E8AA 4RCHA 1Y64A 5EOYA 1HKBA 5BRHA 1NGGA 2HMPA 3FZKA 3WXIA 5AQKA 2BPRA 3H3NO 4E81A 2Q31A 2V7ZA 4PKIA 3WXKA 3VF4A 3A8YA 4BROA 5AQMA 3VGLA 4CZKA 3DOBA 2P9UA 1GLDG 2P9SB 2E2OA 1KXPA 3W3DA 4B1XB 2D1KA 2ASMA 3WXLA 1E4FT 3HM8A 1X3NA 2A3ZA 3T46A 4EZYA 2GUPA 4A62A 5FPEA 5JMVA 3KVGA 2QWNA 1NGFA 1WOQA 2CGLA 3M3ZA 5AQHA 4CZMA 2YJFA 4B1UB 1BPRA 3HI0A 4BGAA 4EZQA 2Q1NA 2KHOA 3VGKA 1Q5LA 3H45C 3WEEB 1EQYA 3EL2A 2IIRA 1BDGA 5EX5A 3C0BA 1BG3A 1GLJO 2VWBA 3H6EA 1JCGA 3H0XA 2Q0RA 1HJOA 1V4SA 2ASPA 2F9WA 1XQSC 4FWRA 3ZETA 4JNEA 2UYTA 3GG4A 2VCPA 3UKUB 3H1QA 4CZLA 5BPLA 1DKZA 1HUXA 5AQWA 5CE3A 1J6ZA 4BREA 3EO3A 3ZX3A 4PL7A 4H0TB 1BUPA 5AQVA 3U8XA 2D0OA 2P9NB 1HPMA 1DGKN 2ZWHA 3CJ9A 4EZTA 4IO8A 3KHYA 2OANA 4H03B 5TKYA 2Q36A 2YI1A 1ZXOA 4BRKA 1QZ6A 4FWLA 4WQ4C 3KZBA 2WINM 4CBUA 1T6CA 3O8MA 3H3OB 5LJWA 2P9UB 2I7NA 3O80A 1NGBA 3MDQA 4B1YB 2QWLA 4ISFA 2A41A 5AQZA 4A2BA 3J8AA 5KQDA 3GL1A 4EZNA 3MN7A 3BEXA 2CH5A 1U2VA 3CJAA 4EZRA 3VERA 2ITMA 5AQXA 3QICA 3UKRA 1OKJA 3G25A 3L3OM 4XEIA 2WUSA 4JD2A 5AFUH 5F1XA 5BPNA 5AR0A 4K42A 3OHXM 2QWPA 1CZAN 3WQUA 3D7EO 3ATVA 4EZPA 5F0XA 3ZX0A 2QW9A 3A0IX 4BR5A 3ENOA 5AQUA 3MK6A 1HX1A 3A5NC 1YVNA 1XC3A 4B1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E84A 5AQFA 3L6QA 4NXMK 3DX0A 4FLXA 4G9ZA 2Z0VA 1HJRA 1TAQA 2FF6A 1UA1A 2W41A 2X74A 3QFUA 3V9SA 1J53A 2F18A 1RT5A 2YNIA 3E66A 4FM0A 4IWOA 3QNNA 1RDAA 3TTCA 4O0IA 3O3GA 4HCBA 2ND0A 1YTAA 2AA4A 4BRNA 3CYGA 3FGUA 4BWMA 3NH0A 1DTTA 4WQ5A 5CE3A 1MWKA 1LCUA 4BC5A 4BRHA 1OVYA 4W5RA 1TV6A 4DTJA 2FYVA 4AHRA 1BCOA 3ULEA 2HBJA 3WQTA 3RRGA 2GBZA 4E7KA 4CEDA 3SAFA 4MLEA 4BRPA 3LDLA 3QIOA 1EKEA 4QS7A 4KB1A 1A5WA 4DSKA 2BTFA 3K9KA 1BO5O 3CCSN 4CFCA 1A5XA 3AA3A 1K73O 1I4LA 4BC4A 3R8EA 1KLNA 3NVMA 4J8FA 3C95A 3N4QA 3IG1A 3AA4A 4CW7B 3HOTA 4IW0A 4F3OA 4FWSA 3DPOA 3OYEA 4E72A 2EFKA 4B9VA 4EAHD 3V1RA 4CEFA 1G99A 2CGKA 2UXDK 3MMVA 3RWUA 3CERA 3AVGA 4JN4A 2X3XA 4CGDA 1RT1A 3U9DA 3LWMA 2E2PA 3ID8A 4ISGA 3DPPA 2NUBA 1Q8IA 3SLCA 4KHPK 3LANA 2FBVA 4DR4K 4K25A 4QOZB 3THYA 1HNWK 2RF2A 1HNXK 2W42A 4BE1A 2YL9A 2YKNA 3FZFA 4UDXX 1BOTO 1YI2N 1KAXA 5JICA 3CAZA 3TAFA 4DMNA 1NMDA 3SMSA 1IG9A 2YL5A 4IOXA 3ENBA 4GW6A 5JVHL 4FJIA 3VEOA 1WSEA 2P9PA 4AZ5A 3RMAA 3THWB 2G8UA 4DFPA 4CJEA 3JS6A 3MCAB 4WQ5C 3NVKA 1T8EA 1ASWA 4LSLA 4HTUA 4EIAA 4C8KA 3AARA 3VEXA 5SZTA 5CR4A 3TSPA 1YJNN 2F7RA 1UA0A 3LM9A 5J2QA 3N4PA 1G15A 5SWMA 1RNHA 2ALWA 3NH2A 1YTUA 2QI2A 2E6LA 3AVMA 3C7NB 4M7XA 1HKGA 2QWMA 4HHTA 4OLBA 5EXWA 4DQRA 3VQ9A 3MECA 3BUBA 5AQJA 4OJRA 1ZC6A 2ZF5O 1VQ8N 4IDKA 4O44A 1M1KO 3Q84A 1GN9A 4CZHA 3D2EA 3J7ZO 1SL1A 3U4LA 4FJ7A 1LOTB 4IDHA 2P1JA 4BVOA 1EETA 3O3OB 1GNLA 4KTZA 2ND1A 4IFEA 1XMQK 3DX4A 2PFUA 2XY5A 3THXA 4MDAA 3LL3A 4AM7A 3K5NA 3OYMA 4NLBA 3AGRA 5C24A 4H6HA 1EWQA 3RV1A 1IBLK 1JLAA 4CD1A 5KI6A 1IKXA 3LDOA 1BISA 4JAXA 1KVAA 3O9UA 3LMFA 2NRHA 2ZD1A 4O8UA 1L3VA 3L4IA 4JK8A 4QS9A 1QTMA 3IMXA 4HUFA 3QNJA 4OKEA 3P31A 2PYLA 3HBTA 1I3AA 1TKXA 1KFSA 2WFBA 1TUUA 3ZEUA 4MQDA 5KPZA 1RDUA 3BUPA 4FWMA 2RKIA 4BR7A 4CZJA 2YIBA 1UPXA 1FXXA 3AO3A 5EU7A 4BDYA 1VSFA 1L3UA 3MXJA 3SAHA 3KWGA 1NK8A 3KD5E 1SL0A 1C0UA 4JI5K 1CLQA 3LP3A 2IS3A 3O6WA 1VRTA 1SU8A 2JNKA 4KREA 4ID5A 4DV2K 4GNIA 1YF5L 4YOVA 5CYQA 3QBXA 2HOEA 4H5WA 4B9TA 1JL2A 3AAPA 3L2RA 3VPZA 4B3RK 1DKXA 3F9KA 2VG7A 1B92A 2YLAA 4EZSA 4W5NA 3OYNA 3F7WA 4WYBA 1T03A 4V19S 3LP1A 4I1QA 3WNFA 1X9WA 4CZGA 4ICLA 1VQKN 3CFPA 4KBOA 3VN5A 2P51A 4FJLA 3SCXA 3NGIA 7HSCA 3O1WA 1RTDA 1LWCA 3PUFA 1OH5A 4JLCA 1C0MA 4LFBK 1HYSA 1VQ4N 4X62K 4KI4A 4H5TA 3BUDA 4FM1A 5FROA 3OYJA 4BY9C 2OYQA 3QLHA 4M45A 4IFYA 2KFNA 4DTMA 3MN6A 4A5BA 3JYTA 4AHVA 1Q18A 1GLCG 3DM2A 4C1NI 5AQYA 4IWPA 4JKCA 1MDUB 3B6OA 3QNIA 1NWKA 4ID1A 4BRMA 2XY7A 3KAWA 3C65A 1UAXA 4R5GA 1WAFA 3OWGA 3DDGA 5JLFA 3IS9A 2NLXA 4AZBA 4X66K 4EZVA 3TAEA 3L0QA 1SKSA 3N8EA 4E0DA 2LM0A 2FXUA 5D3GA 5BN9A 1T44A 1MJGA 3LAMA 4L3QA 3WEEA 4CJRA 2OPSA 4I9QA 3VQEA 4O0JA 4CBXA 5HRPA 2P9KB 4DV6K 4PA1A 1S1UA 3LALA 4DV0K 2HB5A 3RPMA 1EP4A 4DV4K 4JNFA 3CCRN 4OGEA 3K9JA 3VESA 4R5JA 4BC3A 4CHPA 3NHGA 3QETA 4CJUA 1Q9XA 4MDBA 3ZSYA 5JENA 1S1VA 3OYLA 4CI6A 4B9UA 4CF2A 3FZLA 1ATSA 1Q81O 3I8DA 1C1BA 4RCHA 1Y64A 4ILHA 4B9LA 3VQDA 1X9SA 4DYLA 3M8PA 4C8OA 4KKOA 5AQKA 3SV4A 1NMNA 4JI6K 3VF4A 1WSIA 4BROA 3B51X 3L2UA 1IO2A 4AHUA 1GLDG 2P9SB 4DWIA 1TK5A 1KXPA 4DV3K 4CJ3A 2XHBA 2ASMA 3WXLA 1X3NA 3SUPA 4EZYA 5T7BA 4GVEA 3NMUA 4CF8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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