The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
|
sequence length |
177
|
structure length |
177
|
Chain Sequence |
TTGQMPATSSLVDLLHHPLRWRITQLLIGRSLTTRELAELLPDVATTTLYRQVGILVKAGVLMVTAEHQVRGAVERTYTLNTQAGDADHDGVDADRLRTMFTVFVAGVGGHLDQYLEREQIDPLADGIAFRQTALNLSDEELAEFLTAFGEFLAPYVAHSPAPDRTRRVLSTILIPD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
molecule keywords |
Putative uncharacterized protein
|
publication title |
The crystal structure of a functionally unknown protein Kfla_6221 from Kribbella flavida DSM 17836, CASP Target
rcsb |
source organism |
Kribbella flavida
|
molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
total genus |
44
|
structure length |
177
|
sequence length |
177
|
chains with identical sequence |
B
|
ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2012-07-19 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF12840 | HTH_20 | Helix-turn-helix domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain | ||
Mainly Alpha | Up-down Bundle | Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 | Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YO5 C; 1TBX A; 2GXB A; 1TTY A; 4LLL A; 4ETS A; 3HHH A; 1R7J A; 4M74 A; 5HVQ C; 3B02 A; 3M8E A; 2NNY A; 3NRV A; 3E3V A; 3VOD A; 3C7J A; 2MC3 A; 3ZMU A; 4M9S A; 4UXN A; 1FP2 A; 3KET A; 1W5S A; 3DQV C; 1FBU A; 2WC2 A; 4ENK A; 2DPD A; 3E97 A; 1MJ9 A; 4KIC A; 5L3D A; 1R1T A; 5ED4 A; 5BOX A; 1KYZ A; 3TDU C; 1G3Y A; 4KMU X; 4CGZ A; 5FD6 A; 2HDC A; 1D5V A; 2LSO A; 2K27 A; 4LD5 A; 1GHC A; 2IA0 A; 1SAX A; 4EJT A; 2G9W A; 2ETH A; 1FNN A; 2STT A; 4IRG A; 4NQW A; 3KLN A; 2E1N A; 1MDM A; 4MTD A; 3SFZ A; 5D5W B; 4H0E A; 1Z05 A; 3E5X A; 2HS5 A; 4BHB A; 3U1D A; 3BJA A; 4CXF A; 1BI1 A; 1FYL A; 4IRI A; 5KVR A; 1HKT A; 1W7P D; 1V3F A; 3I64 A; 1YFH A; 5HDG A; 3KP4 A; 2EJR A; 2DO7 A; 5L3F A; 2HOE A; 2ZJ2 A; 1F1Z A; 2HTS A; 5ICE A; 3BP8 A; 5AIQ A; 2M8E A; 2HWV A; 4N9H A; 3PQK A; 3O3K A; 3J81 Z; 2QBY B; 4HDV A; 3B73 A; 2Q0O A; 3F21 A; 5D4S A; 2O03 A; 3WG9 A; 4LB5 A; 4M9Z A; 3FXU A; 3M7G A; 2OQR A; 1CGP A; 1XMA A; 5L3G A; 1S8N A; 3MAJ A; 2PI0 A; 2JTV A; 5TJJ A; 2IT0 A; 3F8M A; 4HYE A; 3FXQ A; 2O6G E; 4UVB A; 1Q1H A; 1KU3 A; 4EJV A; 4KNY A; 2IRF G; 5LGT A; 2YX4 A; 1P2F A; 2W84 A; 3N4M A; 5DD8 A; 1EV7 A; 4LG0 A; 3BZ6 A; 3GLX A; 4AWX B; 3F8B A; 2IVM A; 2XGX A; 3T8R A; 1I27 A; 3FM5 A; 3ULQ B; 1HXD A; 1X3U A; 3CDH A; 3DV8 A; 2FNA A; 3V8K A; 4ZYG A; 2IA1 A; 2XAJ A; 4WF2 A; 4G7H F; 3V8J A; 3WU0 A; 3OOP A; 4FT8 A; 3WTY C; 2CQK A; 2KIF A; 3GYH X; 1JHH A; 4YFK F; 1T0F A; 2Z3Y A; 2PLY A; 1UST A; 3HRM A; 2OU2 A; 4B8X A; 3JW4 A; 4R79 A; 1UB9 A; 2R7F A; 4LK1 F; 3M1E A; 1WI9 A; 4G7Z F; 2MA3 A; 5H20 A; 1ZN2 A; 3ZN0 A; 5CLS A; 4XSX F; 3WGI A; 4I0B A; 3I59 B; 1K78 B; 3SHF A; 3CUQ B; 4HQE A; 2O8X A; 4RGS A; 4LB6 B; 5CVI A; 4CYD A; 2VBW A; 3E6M A; 1TW2 A; 1WQ2 A; 5LGU A; 3I71 A; 2QQ9 A; 2H6B A; 2VOD A; 4G9Y A; 2YU3 A; 1TQP A; 1HW2 A; 5E1X A; 1A04 A; 5HS8 A; 2JRT A; 2V1U A; 3GZ5 A; 2EFO A; 2AXL A; 2DLL A; 5DDG A; 1ZLJ A; 5L3C A; 3WTV C; 3O2P E; 3F6O A; 1ZG1 A; 4KYW A; 2MLG A; 2EV5 A; 3P7N A; 2Q8K A; 4DNC A; 5EEH A; 3KFW X; 3IC7 A; 3E5U A; 3K9T A; 4BHP A; 3P9C A; 4LFU A; 2UWM A; 3EYY A; 2M30 A; 2Q2E A; 2P5K A; 2F5E A; 3U9G A; 4ZZL A; 1R58 A; 3WOD F; 3CUO A; 1CF7 B; 1H9G A; 4O3M A; 1T38 A; 2QQA A; 2HZT A; 1MKM A; 2LNB A; 4Y17 A; 1YTY A; 1ULY A; 4MQV A; 5AON A; 1P92 A; 4KN7 X; 1IN7 A; 1FPQ A; 1IN6 A; 2JSC A; 3M8F A; 3Q9S A; 5DCM A; 1P4W A; 4HLX A; 1XSX A; 4O5V A; 4M71 A; 1H0M A; 4XLP F; 3DFG A; 3K0L A; 1ZRC A; 4AIK A; 1HSJ A; 2R7D A; 2YX7 A; 4HW0 A; 3H92 A; 1P4A A; 2PQ8 A; 3LQQ A; 5JHU A; 3ZMS A; 2IP2 A; 3R61 A; 3WTX C; 2W25 A; 3FHZ A; 2EFW A; 2MLK A; 3TO6 A; 3GFM A; 3TDZ C; 1YLF A; 5L3B A; 1AWC A; 2HQN A; 4S05 A; 1S29 A; 3RI4 A; 5DEQ A; 4QWQ A; 2PJP A; 1B1B A; 2PMU A; 1BBY A; 2K4B A; 2DK8 A; 2EV6 A; 5DCF A; 1STZ A; 3C18 A; 5ICG A; 4L5I A; 3IHU A; 4Y15 A; 1ZAO A; 3COA C; 1BI0 A; 4RB2 C; 4I02 A; 4RB3 C; 1XN7 A; 4HA8 A; 4BH9 A; 2HKO A; 4GO1 A; 4FX4 A; 3PFI A; 4Y13 A; 2IW5 A; 1KU9 A; 3LA3 A; 3GUD A; 1QBJ A; 2OQG A; 1LQ1 A; 1XGS A; 2BEO A; 2H94 A; 2VXZ A; 2WTE A; 1O3T A; 3HHG A; 1G3S A; 4UHT A; 4U7D A; 3V7R A; 2A61 A; 4UVC A; 4I09 A; 1FT9 A; 3WTU C; 2P7C B; 4A5N A; 2YR2 A; 1DPU A; 4LMY A; 3KZY A; 3IWZ A; 4HF2 A; 4UNO A; 3N97 A; 1ZG5 A; 4IVN A; 1RUO A; 1RZ4 A; 1BC7 C; 1FBQ A; 2ZKZ A; 6PAX A; 3QAH A; 3EET A; 2AS5 F; 4JBA A; 2F5D A; 4U0W A; 1HQC A; 2ZCW A; 2VBZ A; 2CW0 F; 2FU4 A; 4WXC A; 4IRH A; 3TQN A; 2PN6 A; 1XGM A; 2BGC A; 2DU9 A; 2D2W A; 3WTZ A; 3IL2 A; 2DQL A; 2MH9 A; 1R36 A; 3GWZ A; 2IPQ X; 3L2C A; 2NS0 A; 5IT3 A; 3CO7 C; 2XAG A; 4IF4 A; 4M72 A; 4AD9 A; 4KT5 C; 3HRT A; 2OA4 A; 4EGY A; 5D5X B; 3RJP A; 5LRS A; 2RKH A; 4CDG A; 3V7S A; 3T1B A; 1SFX A; 5FLX K; 1SFE A; 2A3S A; 1K7A A; 4EM1 A; 2HGC A; 2FF4 A; 1DDN A; 3QU3 A; 3Q5F A; 3TO9 A; 3OV8 A; 1HW5 A; 1QQI A; 3RTR A; 2BV6 A; 3GFJ A; 1O7F A; 2DI3 A; 2XKP A; 2H09 A; 4KN4 X; 2DPU A; 4U88 A; 2XIG A; 2HR3 A; 3MZY A; 2Z9O A; 5H6R A; 3GFI A; 1T6S A; 4HDU A; 1FX7 A; 5H6Q A; 4UV8 A; 5ILU A; 2RQP A; 3DEU A; 1S6L A; 2P8T A; 2RGV A; 4L0Z B; 4EJU A; 4ZH4 F; 2VT3 A; 1IRG A; 1BN5 A; 2KJC A; 1WKM A; 4A0Y A; 2STW A; 5HDN A; 1EH8 A; 2EA2 A; 4ZZD A; 1YG2 A; 2GIV A; 1ZRE A; 1SMY F; 1I1G A; 2F5F A; 2ESN A; 1R00 A; 3LST A; 4IXA A; 3DXJ F; 3DF8 A; 1MZB A; 2FRH A; 3L7W A; 2QUF A; 4IPA A; 4YG2 F; 2P6S A; 3MCZ A; 1F4K A; 4YFX F; 3ZP5 A; 3E5Q A; 1JE8 A; 1USS A; 3MFK A; 1ZLK A; 2ZME A; 3T0Y A; 4ENJ A; 2LKP A; 2VT2 A; 1J2X A; 2UXX A; 3SXY A; 1QNT A; 3R6S A; 1KQ0 A; 3GEZ A; 3CUQ C; 3WGH A; 2VBX A; 3K2Z A; 3I53 A; 5ICF A; 3HRS A; 2M1B A; 2F2E A; 2UXN A; 3RPQ A; 4L18 B; 2WWY A; 3KP2 A; 3RIR A; 1QO0 D; 1L3L A; 3D5L A; 1FYM A; 3W6K B; 3ZQ7 A; 2OBP A; 2JPC A; 3BJ6 A; 3HIF A; 1OKR A; 4UVA A; 3FF5 A; 3ERE D; 2D1V A; 5J6X A; 5K5O A; 2XRO A; 1IXS B; 5E1Z B; 3CTA A; 3F6V A; 1T2K A; 1L0O C; 1YW7 A; 1OMI A; 1XDS A; 4HV6 A; 2KRF A; 4GYI A; 4ZYH A; 3ZMD A; 2NAZ A; 2NRA C; 3FMR A; 1OR7 A; 3T5X A; 4UV9 A; 2C6Y A; 4HF1 A; 3P9I A; 5D6E A; 1XB4 A; 4L0Y B; 2RN7 A; 3QOP A; 4EGZ A; 2BBY A; 3GZ6 A; 1XSD A; 3FWE A; 1ZG3 A; 2ZBK A; 2LF8 A; 3FZV A; 5E1W A; 2XAQ A; 2HKX A; 3G73 A; 2HTJ A; 2FBI A; 2LF7 A; 5FLX Z; 3DKW A; 5D8L B; 1UHW A; 1Z91 A; 2XVC A; 1HKQ A; 1Z7U A; 1EH6 A; 4AIH A; 4EM2 A; 4GCV A; 3FMQ A; 3SZT A; 1XCB A; 2ESH A; 4CZZ A; 4U0V A; 1G3W A; 4F7Z A; 3K69 A; 2OAZ A; 4PDK A; 2RNJ A; 2QEN A; 1WWX A; 3D0S A; 2FMY A; 2Y0M A; 4ON0 A; 3I54 A; 3CO6 C; 2A69 F; 5HDK A; 2QBY A; 5HLH A; 2EV0 A; 1W5T A; 2DFI A; 4KIB A; 2VC1 A; 2PMH A; 4OIN F; 2DTR A; 1F5T A; 1J9I A; 2DQR A; 3JAM K; 2D45 A; 1T39 A; 1C0W A; 5LEK A; 4PCQ A; 3MQ0 A; 1V4R A; 4OIP F; 2GWR A; 2PBI A; 4I2O A; 2EK5 A; 3GX4 X; 2NYX A; 1QZZ A; 2JT1 A; 4BNC A; 3KP6 A; 4EM0 B; 3WTT C; 3ZMT A; 2KKO A; 4JK1 X; 5DD4 A; 1F9N A; 5J8C A; 4BHC A; 2XUB A; 4KFC A; 4G6Q A; 2HEO A; 2M5W A; 3KLO A; 3EDP A; 3E6B A; 5LEJ A; 2FBH A; 2HYF A; 3BPV A; 4LLN A; 2MH2 A; 2FBK A; 3GO5 A; 3M9A A; 4EJW A; 2GAU A; 2K86 A; 5K5R A; 1B6A A; 4R8H A; 1NHA A; 4U0Y A; 1R5H A; 4WWC A; 1GVJ A; 1G3T A; 5J8F A; 1LDD A; 3FMS A; 3HSF A; 2OZU A; 4WXD A; 4WK8 F; 5DV5 A; 3BRO A; 1FBS A; 1ON2 A; 5FO5 A; 4LLG F; 1IN5 A; 2ZO4 A; 1UCR A; 1YQA A; 5FD5 A; 3LWF A; 3E6D A; 5D8K B; 1RI7 A; 2DBB A; 3I59 A; 1K78 A; 1E17 A; 5CVJ A; 3CUQ A; 5D4R A; 1TQI A; 1J75 A; 4HX4 A; 3IWF A; 1BC8 C; 1I5Z A; 1ZAR A; 4XLN F; 5IT9 K; 1BI2 A; 3BWG A; 3F72 A; 3WE2 A; 3RDI A; 2VBY A; 3FXR A; 3ZPL A; 2LDU A; 2BE5 F; 2DK5 A; 1KQ9 A; 5L3E A; 3H3Z A; 5TRD A; 3QP5 A; 1G6N A; 3GF2 A; 4A6E A; 2ACJ A; 4HV5 A; 4BAY A; 3EUH A; 1FLI A; 3JSP A; 3QRF F; 1QGP A; 1W7P B; 1Z6T A; 4DQ2 A; 1P4X A; 5CVR A; 1GXP A; 5LHH A; 1SD6 A; 1E2X A; 3HSE A; 2Z99 A; 1CF7 A; 4MNU A; 1K79 A; 5HS9 A; 5JI6 A; 1HW1 A; 3F8C A; 1YS6 A; 4N0B A; 1D8K A; 4GGG A; 2QVO A; 3DP7 A; 4IJA A; 1TLH B; 3LAJ A; 2E1C A; 2RDP A; 3L09 A; 1OYW A; 4G7O F; 1HBX G; 2RC4 A; 3IRR A; 1FY7 A; 3J80 K; 2FE3 A; 4WXH A; 2X4H A; 1HST A; 5K5Q A; 2PFB A; 4NB5 A; 2GXG A; 3F8N A; 2QLZ A; 4MQ9 F; 2GA1 A; 1J0R A; 2B0L A; 3HSR A; 1KA8 A; 4Q4Z F; 3KP7 A; 1BJA A; 1WSU A; 2L4A A; 3V7C A; 1FZP B; 3KEQ A; 4TV7 A; 1K6O A; 1LEA A; 1SD7 A; 2G7H A; 4QLC U; 1QPM A; 1J59 A; 1IZ1 A; 1XMK A; 4IHT A; 4P9F A; 1KYW A; 4M6X A; 3EQL F; 1JGS A; 1LEB A; 1PP8 F; 4MEX F; 3R0A A; 2MD5 A; 4I98 B; 2H6C A; 4EV0 A; 2VE9 A; 3PQJ A; 3JAM Z; 3IKV A; 4EVI A; 2F5C A; 2P7V B; 5JVT A; 2W85 A; 1ZRF A; 5A2Q K; 4KIG A; 3HOS A; 1DPR A; 1I6X A; 3WE3 A; 4XBF A; 2CGP A; 2ZNY A; 2DT5 A; 2V1X A; 4RB0 A; 1MDM B; 1U78 A; 4PGG A; 3RKY A; 2O3F A; 4IHS A; 1DUX C; 1WRJ A; 4G94 A; 1I1S A; 3QPH A; 4OU0 A; 2R3S A; 1HKS A; 2RVC A; 4HZF A; 4KUM A; 4HAM A; 2CG4 A; 4AIJ A; 3RKX A; 1ZHF A; 4RAY A; 3P9K A; 2X0L A; 1BIB A; 3VEP A; 2VE8 A; 4FHT A; 1UFM A; 2KIM A; 4RGX A; 4D0P A; 4PZJ A; 1BI3 A; 3KZZ A; 1Y0U A; 3MZH A; 3ECO A; 4CIC A; 5F64 A; 5HLI A; 5E8I A; 4EQQ A; 1SD4 A; 4KDP A; 2EFN A; 4ENM A; 5HOO A; 2XAF A; 3SQN A; 4MGR A; 2WV0 A; 5IT9 Z; 2A6H F; 2CWE A; 4HF0 A; 2QQB A; 1O3S A; 4OOI A; 1U2W A; 3VFZ A; 3Q9V A; 2CFX A; 3I0T A; 2V6C A; 4LG0 B; 1BOA A; 1FSE A; 3FX3 A; 1GXQ A; 1J7K A; 5ILS A; 5LHI A; 2