4AZHA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTNLEGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGLKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 163
structure length 421
sequence length 421
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azhA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azhA01
1MW2A 2PWDA 1XSJA 1W9PA 5FD0A 2E3ZA 3M7SA 3AMDA 5I3DA 1UH2A 2RGLA 1C90A 4URIA 1V6UA 4PYSA 3SCQA 1NOFA 1HVQA 1R8LA 2OLHA 2VX6A 2VZTA 1V03A 1WO2A 2XPKA 2A3BA 1E6NA 3O9NA 3A6OA 3U57A 4GI9A 5E6ZA 1SMAA 2VL4A 3WD1A 1JZ2A 1G01A 3WQWA 4IUGA 4AIUA 2WMHA 4DWSC 5M5DA 1W91A 3EYPA 1VAHA 1CGWA 2CETA 4ZFMA 7CGTA 3AFBA 5LA1A 1UR8A 2CBVA 2D22A 1M7XA 4JHOA 5ABHA 2WXDM 2WCGA 4L4OA 2WB5A 4MNMA 3EMCA 4DM2A 2W62A 3WDQA 3WUEA 2J8GA 3PTMA 2G3JA 3WD2A 3BSGA 5HPOA 1GOOA 3MKKA 3VMOA 2EEXA 1I1WA 3GM8A 3PZGA 1JZ5A 1UKTA 3IJ8A 1FH7A 3UEQA 1ISYA 4HPHA 1HJWA 1KCKA 4PMQA 3WUBA 5D4YA 1W32A 3VIJA 1SFSA 4GQRA 3GXMA 3VD4A 4Z2GA 1GJUA 3AZTA 3L4UA 3THCA 1TVPA 4CD6A 4PMNA 1UD4A 1QNPA 1UZ4A 1QBAA 3TTSA 1G5AA 1UKSA 2EO7A 2UWFA 3RPMA 3MO4A 2AAAA 3AICA 5AYIA 5FL1A 1FP9A 2QMJA 1B3ZA 4W86A 2F2HA 2W66A 1DEDA 1KWKA 1JYVA 3VKKA 2BY1A 1GQKA 4PCSA 1Q4NX 3MV01 4CVUA 2BVTA 4M8UA 1KWGA 4AD4A 3WF4A 2YDRA 3CH9A 4KRUA 2E8YA 4UFJA 3WF0A 3VMNA 2TAAA 2OSWA 2W61A 4W88A 3DECA 3L4ZA 5KZ6A 1UR0A 1OINA 4JCLA 3BAWA 4XV0A 1WE5A 2XWDA 5I6SA 1EIBA 5C70A 1LLOA 1HKIA 4Q22A 4U3AA 1RD6A 3SCSA 1L0PA 1JZ7A 1JDAA 1JF5A 1LL7A 4W85A 3VIMA 2D3NA 2PBGA 3GNRA 4ZXLA 1TUXA 1C93A 2DH3A 4TX8A 4RL3A 1J0JA 1K9TA 1KXQA 4J3XA 2J7CA 1XGZA 4AZBA 1HX0A 5HBFA 4NRRA 2E9LA 3IK2A 2ZX6A 3K4DA 5E0CA 3AS2A 4A3YA 2D1ZA 2IXUA 1HJSA 3OGRA 1QW8A 4CCCA 1EQPA 4CCEA 4ZXOA 3ZQ9A 1W3LA 1UYQA 5DF0A 3PZTA 2W4XA 2E8ZA 1E6SM 3ZOAA 2WBGA 3LPGA 4P7OA 1L8NA 4ACZA 3EMZA 4PRWA 2NT1A 4DWSA 3L2LA 2CERA 3II1A 3G6MA 2F61A 4EKJA 1PAMA 4M82A 1W1PA 2PWFA 3CPUA 3K46A 3OA5A 4N42A 4PBGA 1FOBA 3MSDA 4QP0A 1D2KA 5A2AA 4H8VA 2D23A 3SURA 4PMDA 2CITA 4B15A 1J0HA 5JBEA 1A47A 3K4AA 1U30A 3BSHA 1KR0A 3AS1A 3GNOA 3AISA 4H04A 2DPEA 3AIRA 4J3UA 4ZE5A 3NDYA 3CHDA 4E8DA 1C8YA 3AS3A 2WCSA 1Q6FA 4TOQA 3VMPA 3TTQA 5A6MA 3AHVA 2BXZA 4J28A 5JIWA 1AQ0A 1ESWA 4AD3A 4RE4A 3VD7A 2XSAA 5JIPA 1NARA 3T0AA 4UQBA 3T2OA 5KEZA 1C3FA 2RGMA 3AS0A 1E0VA 3L4YA 3BC9A 2V3DA 1ISWA 1CXEA 1GOMA 3KZSA 1Q6EA 1PX4A 2VNCA 3PZUA 1G9HA 3CUHA 5C8BB 1VFMA 4LGXA 3N9KA 3W24A 4W5ZA 3LPFA 5A8PA 1US3A 3UERA 1OT1A 1WAWA 5BXPA 6CGTA 5A6SA 1UWQA 2CKSA 4HMDA 2CXGA 2GUYA 3VGDA 4JZ5A 3CIVA 4H8UA 4YHEA 3L4WA 5A6BA 4XZBA 2XM2A 4TVDA 5E9AA 3WH5A 1UQYA 3ARSA 1JGIA 2PBOA 1X6NA 4BF7A 2J75A 1OWQA 2XM1A 5GNYA 1R87A 2XUCA 4U5KA 2ZICA 1JYWA 3ZMRA 1EDQA 1BLIA 3F4VA 4JIEA 1US2A 4J7RA 1FH8A 2WHJA 4MJ2A 1WDPA 4BCEA 2W63A 2XVPA 3NDZA 2JFEX 3FAWA 4GINA 1GORA 3BCFA 4AWEA 1KQZA 3O6AA 4TTUA 2VRKA 3KL3A 3K8LA 4PN2A 3NUKA 1OIMA 1H2JA 2PWHA 1JIBA 2UY2A 3A4WA 5CPSA 5ECUA 3KL5A 4V27A 4DM1A 3A4XA 1FHDA 4FLOA 1XCXA 3M46A 4UQEA 2ZX9A 3AZRA 2QF8A 4M29A 1WDRA 3AZSA 2CBIA 1MWOA 4R27A 3UG5A 4HZ7A 1QHPA 1CZ1A 3BAKA 3CUJA 5BXRA 1E6ZA 4L4PA 2ZUVA 5IHSA 3WD3A 1E0WA 1OT2A 4N0RA 4JFTA 4HMCA 3OLEA 3ARPA 2VO5A 4WLCA 5GPRA 5A6KA 3CHCA 4W93A 2VTFA 1GONA 1B2YA 1CNVA 4GPNA 3SCVA 3VIIA 2YL8A 4QCEA 3ECQA 3VU2A 4AMCA 4Z2LA 3SCRA 1DP0A 2J4GA 3T08A 2QV4A 1UD8A 1DWFM 2VR5A 2CHOA 1GZJA 1EOMA 5CG0A 4JFSA 1BYAA 2WSKA 1RP8A 3CHEA 3PZNA 2DEPA 1QNQA 2XIIA 4V28A 4DUXA 2X0YA 1EO7A 1GNXA 1MQQA 1QHOA 3VIKA 1FFQA 4W8AA 2D24A 4JKMA 4PTMA 5EBAA 3W27A 1E1FA 3EDFA 1UWTA 2ZWZA 2WZEA 4AXNA 3VVGA 1TR1A 3BAJA 1UD5A 3F5JA 3CZLA 8A3HA 1BQCA 4AZ7A 2VI0A 3ARYA 1B3YA 1R86A 1ZB5A 1JI2A 3I3DA 5I77A 5ABGA 4P8VA 1HXJA 1E4LA 2ZOXA 4WSKA 1HP5A 4KH2A 3VD3A 3A47A 4UOQA 2W5FA 4MNKA 1E72M 4E8CA 2WKGA 1NWTA 4QLLA 3OLDA 1WPCA 4TVCA 5BXTA 4GKLA 2JEPA 3AIVA 4U2YA 2FGZA 3L4VA 2BNJA 1OCQA 1CLXA 4CD8A 1XCWA 2G4FA 3OIHA 1CGVA 1BG9A 1LG2A 3WQ5A 1QI2A 1PX8A 3O2LA 2XJ7A 2ZUMA 3ZJKA 4ATLA 2ZXBA 4MTVA 3TP4A 4AZCB 2XWEA 2OYLA 1VB9A 1H0GA 1BGGA 3M6DA 3VDAA 2OSYA 4ATWA 3SCPA 1S46A 1NP0A 2Z1SA 1V3IA 3PZQA 4HP5A 2PF0A 4J3WA 3AHZA 4A4AA 4B9YA 4BA0A 2WSPA 2YA1A 5AYBA 1UKQA 3PN8A 4OZOA 2BVDA 5D9OA 2XFYA 2V38A 2JALA 3MV11 3VTRA 5M17A 4JKKA 2BY3A 2OZNB 1KXVA 1QBBA 2GK1A 1XD1A 1Q6CA 4WK9A 3MMDA 1IV8A 1DHKA 1SMDA 2FGLA 1UA7A 2YDQA 3PTQA 4PMXA 3ZM8A 1P6WA 2VOTA 3WY1A 1F4HA 1OGGA 4WSJA 1V3KA 4CKQA 4D6EA 2YL9A 2WPGA 2X1IA 3ALFA 1E71M 6TAAA 1CGUA 3AHYA 1N82A 3W82A 2XVNA 2BS9A 5D9MA 5LA2A 1KFWA 3AYSA 3UR8A 2J7DA 3PZIA 3WDJA 1UR9A 2FHBA 3SUWA 1QW9A 3TONA 3N17A 4HU8A 5FCZA 1B0IA 5BRPA 4UNIA 5EFFA 1E4MM 1EA9C 3GXDA 4JL1A 8CGTA 1JD9A 4W89A 4CU8A 1CGYA 1QNOA 1PX3A 3AYRA 5HNNA 4MDOA 1EOKA 3RJXA 4M81A 1XRVA 1WZMA 3POHA 3B9EA 2WANA 3W4RA 1B1YA 2NT0A 1PIFA 3SCUA 4GIAA 3HU7A 1OIFA 4HTYA 1CLVA 1TVNA 1E6QM 2J62A 5AY7A 5BYWA 1J10A 3BH4A 4AZIA 4QLJA 2VZVA 5BCAA 2UY3A 1H1NA 3ARVA 4W8BA 1GCYA 4UQDA 1VENA 1E6XM 1GVIA 1BYCA 2WWCA 1OM0A 1Q6GA 1VBRA 5DT5A 5DO8A 2YLAA 3VO0A 1O7AA 1FFRA 2ZX8A 1WZKA 1TZ7A 3LPPA 1KBKA 1M53A 1QI3A 4OIFA 1TA3A 3MSGA 1HKJA 1NWRA 3AIBA 3WN6A 3ZSSA 3MANA 4GI8A 4UFIA 5BRQA 3AI0A 2GSJA 1EXPA 3EDJA 3ZT6A 1V08A 2OYMA 4XB3A 1VFFA 3WDRA 1Z32X 4U33A 4Z2KA 3VPLA 5ABFB 4JFWA 3LMYA 4XUYA 2VX4A 2XVLA 1E0XA 1DWAM 4C7GA 2ZXQA 1JYXA 3AHXA 4QLKA 1JFHA 3APGA 1G94A 4YHGA 4OUEA 1BVZA 3ZT7A 2VQUA 2ZX7A 2GDUA 1TCMA 5IHRA 4CCDA 3MUIA 4BQ2A 4AY1A 1UQZA 4NSBA 4Y7EA 2QLYA 5C71A 1ZU8A 4LYRA 4R5EA 3SUVA 2QPSA 3GXIA 3IANA 3WELA 2J7BA 3GBDA 3AXXA 3CUIA 3AOFA 2FH8A 3WF3A 4J3VA 3VDCA 3T2PA 4CN6A 4HOWA 3SUSA 3WL0A 3WQ8A 2XTKA 4PTWA 2WCAA 2DT2A 2J7GA 2WVVA 1M03A 3TA9A 2GJXB 2PI6A 1PZ3A 2WLYA 5CZKA 1ZJAA 2YOCA 1C92A 2VCBA 3BAXA 3N04A 3UCQA 1QHZA 1E55A 3ARXA 3ARRA 4B9ZA 1V02A 5D8WA 1J0YA 4WKHA 4DUVA 1QOXA 2DQXA 4U3CA 1H4PA 5I79A 5HXMA 1MW3A 5HPCA 2ZIDA 3POCA 5I78A 2XVGA 3DHUA 4UQ9A 1KR1A 4PTVA 1U33A 1QI5A 1C8XA 1V3MA 3IJ9A 2EPNA 3FXYA 4ATDA 1D7FA 2BY0A 2ZUWA 1JYNA 4JFUA 1YHTA 4W7VA 1PEZA 1UWIA 5EMYA 1KCLA 5I24A 2CEQA 4QCFA 3BAYA 2V3EA 3WNNA 5I0DA 1ODZA 5CPTA 1HVXA 3KL0A 4UOZA 3PBGA 1E73M 3E1F1 4M1RA 3EDDA 1TE1A 1XV8A 5FIPA 1H0IA 3K1DA 3HJEA 1VEPA 2X0HA 4WIWA 3ARZA 2J8FA 3WL1A 1UR2A 1VBUA 1HIZA 2JF7A 2XYLA 1J18A 3VGHA 1CPUA 4DWSD 3ZT5A 1ZS2A 4M24A 4ZE4A 2ESCA 1C91A 4D1JA 2E4TA 1G1YA 1W2VA 4X9YA 2J7FA 2CNCA 4ZENA 2YLLA 1E1EA 4P8WA 1BGAA 4HA3A 3BXWA 3WENA 2FH6A 2WM0A 2QHAA 2X09A 4KGJA 4UZUA 3WF2A 5EFDA 2J74A 1UKPA 1QI4A 3RM9A 1CTNA 3VIOA 2CYGA 1FHLA 4CD4A 4CVWA 2OWXA 3CZJA 1HJQA 2WVUA 1E3XA 4D6GA 5E70A 4LYPA 3CZEA 2DGAA 3AXHA 3AMKA 1HP4A 1E4IA 3S6TA 4BQ3A 4HOZA 1CXFA 2NSXA 2ZXAA 2W67A 2BY2A 1J9YA 5E09A 2WAGA 3RM8A 1J01A 4NI3A 2BVYA 4OOUA 2YIHA 3WH8A 4KMQA 4GZEA 3UR7A 4AW7A 4D1IA 4FZPA 4P7RA 3OBAA 3WH9A 3QGVA 4B16A 2YL6A 2QPUA 3NYDA 1MXDA 1V0MA 1BAGA 1VFUA 2BHZA 1EH9A 4QFUA 3SCTA 1H11A 2DSKA 1C7TA 3RJYA 1UHVA 3S2CA 4U31A 1W2PA 1OSEA 1E3ZA 1ZBVA 3VNYA 3VIPA 2FHCA 3GNPA 4P8XA 4B3KA 2XFRA 3ARWA 3ZJ8A 1M04A 5LYRA 4P7NA 1JZ4A 4F79A 4AISA 4U5IA 3CZKA 3ZIZA 2WHKA 2YJQA 2EPKX 1BYDA 5A6BD 4MB1A 4JAWA 1ISVA 2O9RA 1NOWA 2VURA 2IXVA 9CGTA 2UY4A 1WDQA 2CHNA 3CZGA 4CN4A 1BYBA 1OD8A 2VQTA 3DYMA 1GQLA 1LWHA 2YBUA 4KGLA 1CXIA 2V3GA 3WFZA 2J47A 2A3HA 1GQIA 2XIBA 2Z1KA 3N18A 4D71A 2WC3A 3CBWA 4IPLA 1OD0A 4TUFA 1ISXA 5A3HA 1NOUA 2C8NA 1IT0A 3QHNA 1NM9A 4MAVA 1GQJA 1C7SA 4RE3A 3LPOA 2DIJA 1E4NA 4Z2HA 4U2ZA 2DSWA 2PMRA 1M01A 1GVYA 1J0KA 4YPJA 3N1AA 2J7HA 3MUZ1 1BSIA 1MVYA 2WWDA 5FKYA 3OZOA 3WDHA 1MXGA 1XHGA 3I3BA 4C7FA 4LPCA 1HN1A 2WLZA 1B30A 3GH4A 4MPKA 4S3KA 2WZHA 2XGBA 1ODUA 3PZ9A 2V5CA 3WNKA 3OGSA 1JFXA 4MB3A 3WNLA 5BROA 4WF7A 2WNWA 3NCOA 2CKRA 4W87A 5A69A 2O9PA 1BPLB 1V0NA 2PWEA 2JNKA 5TD4A 1CWYA 4GZJA 3VGFA 5A8QA 2VC9A 3AXIA 3SCWA 5A6JA 3BMVA 4HU0A 4PMUA 5DMYA 3WIJA 3BLPX 1H49A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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