4AZ7A

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
433
structure length
433
Chain Sequence
NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGWYNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDLNRYTAESVTAVKEAEKAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQETVNNLTLT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 171
structure length 433
sequence length 433
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4az7A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4az7A01
1J0HA 1PIGA 4J27A 2IXUA 2J79A 4QAWA 1JFHA 2D24A 3ALFA 5CGTA 1BPLB 5D9OA 3J7HA 1K6AA 1JI1A 1V02E 4H04A 1UG6A 5JBFA 1ISZA 1RP8A 2PI6A 2OO2A 1OGGA 3WEOA 3HU7A 4JFWA 2WLZA 3DYPA 2WMIB 4M81A 3I3BA 3WBAA 1FHDA 1ZS2A 3S2CA 2ZX7A 2GJPA 2FDMA 3A4WA 4CGTA 1OIMA 4W85A 3WL1A 4ACZB 2ESCA 2X0YA 5I5RA 5JBDA 3VD3A 4AD3A 2D0HA 2VT0A 3ARWA 2W61A 1KBKA 1UKPA 3EYPA 1JNDA 1E6RA 4U3CA 1WPCA 1KQYA 2YL8A 1J0ZA 2YA1A 3T08A 2DSZA 1V6VA 2WZHA 4DM2A 2J8FA 2WMGA 3OBAA 2E4TA 5I2UA 2O9OA 4H2CA 3B8SA 2QPSA 2ZX5A 2VZOA 1CXEA 4GZIA 3RMEA 1LJYA 3AHVA 2WHLA 3T0BA 3WKZA 1E1FA 1GONA 2XFFA 4OJYA 2V3EA 2Y2WA 5A94A 1B3ZA 3AROA 2D0FA 3PTQA 3VGHA 3FXYA 4ZE4A 4LYPA 1J11A 1V08A 3WSUA 3ARPA 2CNCA 2BVDA 1CYGA 2WYSA 3VO0A 1GJWA 3KWXA 3NDZA 2JFEX 3WQ8A 3CHDA 1D3CA 2VRQA 3ZO9A 2ZX9A 1JD7A 2GJRA 3M7SA 3TA9A 3L4VA 3VIPA 4AZ7A 3ZJ6A 3AYSA 3W26A 2WC4A 4YHEA 2J8GA 3VOCA 4DUWA 4MNLA 2ZWYA 4PTMA 2YBTA 3AIEA 2NW0A 2VOTA 1KGUA 1IZKA 3DHUA 4S3JA 5JIWA 4AD5A 1QI4A 2UY2A 1UZ4A 1GQKA 2ZX6A 3K8KA 1JZ7A 4LX4A 3SCNA 1WAWA 2XHYA 4XB3A 5CG0A 1VFMA 3CUFA 5A69A 3L2MA 1UD2A 4R27A 2G3NA 4AZCB 4UOJA 5HNNA 3E1F1 4MNKA 5FL1A 1J0IA 3WDQA 1QHZA 2WHKA 1TE1A 1E6SM 1L0PA 3BCFA 4PUDA 1VB9A 4EAMA 2DEPA 3NIYA 3VDHA 3N13A 3VVGA 4D6FA 3AICA 2VO5A 3ZJ7A 3BAKA 4FZOA 3LPFA 1UWTA 4CVWA 2ZUSA 5LA1A 4W87A 4JCLA 3SCVA 1UH3A 3AMGA 3BAXA 3VGBA 4ATLA 1CGVA 5BXSA 4UQ9A 1SFSA 2YOCA 4WF7A 4CN6A 2WWDA 2WHJA 5A8QA 1FFRA 1E5JA 2ZUTA 3NJ3A 4B15A 4D71A 3W27A 3PZOA 5HBFA 5ABGA 4ZXLA 2WM0A 3WNKA 2C8NA 4BF7A 3W4RA 4CN1A 4IUGA 2ZUWA 3L4UA 1KXHA 2JEQA 4U5IA 3WMBA 1R85A 4U33A 1ZBWA 1E3XA 7TAAA 1KCKA 3ZR5A 2F61A 4CD5A 2WC7A 4BQ3A 4D6IA 2CBUA 1V3LA 3QOKA 4D6JA 1BYCA 4UFJA 1PAMA 5F7UA 1CDGA 4ATDA 3BAJA 1BFNA 4WIWA 2O92A 4PYSA 1HF6A 1OD0A 1OCQA 3ARTA 3K8LA 1HJSA 3I3EA 2XUCA 2BV9A 4YN5A 4E4PA 2EO7A 1H0GA 4N42A 2WC3A 2WHMA 1DP0A 3N18A 3TP4A 4U2ZA 5DEZA 1WDSA 3AIQA 1LLOA 1GOIA 5A3HA 5DO8A 1X6LA 3FHAA 3VD5A 3GYCA 1XGZA 4JFTA 3WD0A 1OSEA 1E6QM 4JIEA 4P8VA 2VX7A 1HJXA 1CLXA 4UQDA 1HP5A 4W7VA 5BXTA 2WVUA 2NSXA 2PC8A 1UWUA 3M6DA 3ARSA 3POHA 4CU6A 4W8LA 1CXKA 3AQUA 3AXXA 2G3JA 3LPGA 1VBRA 4JCMA 1FOBA 3CHFA 3O6AA 2GUYA 4DWSD 4Z2LA 2YA2A 1KGXA 1CGTA 3PZIA 3GXDA 1JIBA 1KXTA 2CHOA 3K8MA 3AFBA 1Q6CA 1FFQA 1CGYA 1J9YA 4CU8A 4MB1A 4IPNB 1QNRA 1NWTA 4J3VA 3GDBA 3N17A 3RILA 3WNNA 1CGWA 5IFTA 1ITXA 2UY3A 3WUBA 1QNQA 1MWOA 3TOPA 3WH8A 3VKKA 4GINA 4KRUA 1W9VA 4W84A 2XVPA 3N9KA 2OLHA 1VRXA 2Y4SA 3K4DA 1H2JA 3VD4A 3IK2A 2W66A 3FHQA 3DYOA 1PPIA 2WZIA 2WBGA 2YLLA 4W89A 4R5EA 3AHTA 1NOUA 1QHOA 1NP0A 2YL6A 1EDQA 3VNYA 1EA9C 1CXIA 2GJXA 2PF0A 1ZB5A 1AVAA 2WMHA 2ZE0A 3GM8A 4DWSA 2J7BA 4M82A 3BAIA 1NWSA 1UKSA 3CTTA 4CD8A 3BSGA 1R7AA 2VZTA 2VRJA 5I79A 4F79A 1E70M 4V28A 5BRPA 2XFRA 2D1ZA 4GZJA 1GQIA 1L8NA 2XPKA 2W67A 3LMYA 3WY1A 3VNZA 1W2PA 2VCBA 3N11A 1US3A 5A6AA 4J3UA 3A6OA 5I78A 2CYGA 1UZ1A 1YQ2A 2CXGA 3CZKA 3W24A 2BY1A 2W92A 1TA3B 1MYRA 4MTVA 3AXIA 3GNOA 4LXFA 4J3WA 4D6GA 3A4XA 4D6EA 8CGTA 4CD4A 2BY3A 1V3MA 5BXPA 1UH4A 3W82A 3MANA 2GFTA 4JFSA 4PCTA 4C7FA 1M03A 2WCGA 3AOFA 3PZQA 1VEMA 1HJQA 4QFUA 1HX0A 2F2HA 4PEEA 3GZAA 1UR2A 2J74A 2EJ1A 1KQZA 3BMWA 1ZU8A 2XWDA 1R7OA 4GO8A 1LQ0A 6CGTA 1EGZA 1J0YA 3GNPA 1D7FA 2BXZA 2EPLX 4UCFA 2ZUMA 3GH7A 3PZMA 1EHNA 2X2YA 3II1A 1UKTA 4MB4A 4XV0A 5HPOA 1EH9A 2B31A 2XJ7A 2XVKA 1FHLA 1TUXA 2VCAA 1H11A 1XCWA 1ZBCA 3AMDA 1PX3A 4WJXA 1R8LA 1E6XM 4Z2KA 2WSPA 3W81A 2BHUA 2ZUVA 5CSUA 4HPGA 1XD0A 2YL9A 3NCOA 5IXEA 2QMKA 3L4TA 3O2LA 4UNIA 1UH2A 4Q22A 4CCEA 2WVTA 3PZTA 1E9LA 4UOQA 1TCMA 3AJ7A 3THCA 5EB8A 3UG4A 1BYDA 4UFMA 1QNOA 3ZT7A 4KMQA 2WCAA 4IPLA 5I6SA 3PTKA 1E0VA 2J25A 1VFUA 1HP4A 2VX4A 2VTFA 3WNOA 1UQYA 1UR4A 3VIOA 1IV8A 1W1PA 2J4GA 4GXPA 2VZSA 1BGGA 3FN9A 3VIMA 5AC5A 3KL3A 1O6IA 4H8HA 5I77A 2PWFA 4YHGA 4F66A 2VX6A 2BFGA 2VJXA 1CLVA 4AZ5A 2YLAA 3CHCA 4MB3A 3EBVA 3SIMA 2NT1A 1VAHA 1E5NA 3SCWA 4NRSA 2YDQA 1LL4A 4N0RA 2DQXA 4FLRA 1WKYA 2OSWA 4B16A 1NM9A 1HIZA 3G6MA 3CBWA 1JD9A 2DPEA 4UR9A 1XH0A 5CGMA 3EDFA 4HA4A 1SMAA 2X0HA 3UG5A 3MS8A 3RJYA 1GW1A 4GI8A 4WKFA 5ABHA 4Z2HA 3FW6A 4BQ4A 1HKJA 1VJZA 4XZWA 3L4XA 3SCPA 3CZGA 3ALGA 1UD5A 3W29A 3WUFA 2W5FA 1PIFA 4OOZA 1E1EA 5IFPA 1GVIA 3QHNA 3AS1A 3GH4A 3QOMA 3WH6A 1DHKA 1U33A 4MJ4A 4MAZA 1WZKA 3CO4A 1PJ9A 4BA0A 5CXPA 4D1JA 1NWRA 3ZSSA 2JALA 2GVYA 4AISA 1BHGA 4CCDA 5EMYA 1GQJA 1MQRA 1EXPA 1W32A 3SUSA 1HL8A 1V0NA 1OM0A 2W63A 8A3HA 3CZEA 1BG4A 4DUVA 1QI2A 3ARRA 3AIBA 1XHGA 2QMJA 1GOQA 3AZSA 3HMCA 2G3MA 3KE0A 5I0DA 2ZXAA 1JZ5A 1HL9A 3RDKA 4Q7NA 1JG9A 3L2LA 5A8MA 1GOOA 1XSJA 4AY1A 3BXWA 4OBSA 4PCSA 4YPJA 1CTNA 4JKMA 2OZNB 3BMVA 5C70A 1CNVA 1QI5A 5CPSA 4WLCA 1JZ2A 1GVYA 3CHEA 1UWRA 4QDMA 1E71M 4PN2A 4OIFA 3VX1A 5BYWA 3WH7A 1UR0A 4U5KA 2CHNA 5CLWA 2DT3A 1HT6A 2WB5A 2PWGA 4PMDA 1VENA 2EEXA 3T2QA 4UQCA 5DT7A 2WCSA 3EDKA 1EHAA 1IT0A 4RE3A 3WDPP 1CWYA 2W4XA 3N12A 1XSIA 1GJUA 3AYRA 1US2A 2YIHA 3ARVA 3SCTA 4JL2A 1PZ3A 2CCRA 2YA0A 3WUEA 4PTXA 2VZUA 4NZCA 3VD9A 1E4IA 2VX5A 3CPUA 5EFDA 4AZBA 3D5HA 1UUQA 1LL7A 2WBKA 1DWIM 4L4PA 2WZEA 2WVVB 3HJEA 1W1VA 2C0HA 4X0NA 1WDRA 2FHCA 1MW1A 1C90A 3L4YA 3CIVA 3WF0A 1I75A 3WMCA 2NT0A 1W3JA 2YDSA 4WKAA 1JI2A 1E6NA 1MQQA 4PMNA 1ISXA 1MFUA 3GXFA 3U7BA 2D3LA 3PBGA 1GNXA 1C93A 1K9DA 5M17A 4Z2JA 1H09A 4EANA 1JYWA 1GOMA 2XG9A 4JKLA 3VINA 1VJSA 2J7GA 2X8RA 2O9TA 2HISA 2XVGA 4KGJA 1H41A 3WBEA 3PZNA 1OIFA 2ZXBA 3TTOA 3WEZA 3DECA 3QHMA 4AD0A 1CXLA 1QOXA 1UKQA 4JFVA 2PWDA 2HVMA 4JKKA 3WNLA 3WQWA 1ZBKA 1GHSA 2CIPA 1FH8A 1W3HA 1HJWA 1C91A 1E43A 5ABFA 5FD0A 4FLQA 3GXIA 1C3FA 2VZVA 5BCAA 5A8PA 4CU7A 6TAAA 1CXHA 2VL4A 1W1TA 1ZL1A 4ZEPA 5ABEA 1GORA 1OD8A 1OT2A 4KWUA 1LL6A 3CZ8A 2ZWZA 1CXFA 4TOQA 3CUGA 3SCRA 4M29A 4GKLA 1HKIA 3OLIA 3N15A 2D0GA 1CIUA 4JFUA 3BLKA 1KFWA 4HZ7A 2RGMA 5ECUA 5E9AA 1E0XA 1B3XA 1CGXA 1A3HA 3AIUA 3VTRA 1MXGA 2JEPA 5CQ1A 2DT0A 3AZRA 4Z2GA 1B2YA 4D6CA 5D4YA 1F4HA 2Y8KA 3MUY1 1AQ0A 1WB0A 4WSJA 4A3YA 1SMDA 3FNDA 3WIJA 3OLEA 2XIBA 1JDDA 4X9YA 4LYRA 4U3AA 7A3HA 2RGLA 5AYIA 1CECA 4P8WA 2E9BA 3OG2A 2BY2A 2XGIA 1ZJAA 1RPKA 4Y7EA 4M24A 3K1DA 4CKQA 3SCSA 2QPUA 3K46A 2JIEA 1V3JA 1TR1A 3AXHA 4F9JA 3UR7A 2G3IA 5GQBA 4RE2A 4P7LA 5HXMA 1RP9A 3UCQA 2IXVA 5I23A 2EPNA 5BRQA 5A6SA 3A47A 1U2YA 3W37A 1BG9A 3SURA 1WZAA 4EE9A 3WEMA 2JE8A 1V0KA 3WMSA 1NP2A 1TMQA 4XX6A 4LQ1A 3T2OA 4GPNA 4PMRA 2J47A 1V03A 5EBAA 3RM4A 1FP8A 1TZ7A 4QLJA 1NOFA 1H4PA 1G1YA 3VIHA 3ARXA 3IANA 3U7VA 1C92A 1DWHM 3VMNA 5CPTA 2ZOXA 4HA3A 4OOUA 2O9RA 4GZEA 5GNYA 4IM4A 3AMLA 4JHZA 1NOWA 2VQTA 1UYQA 3OA5A 5I3DA 3SUVA 3CUIA 1UD4A 4A4AA 3B9DA 3JUGA 2J7DA 2YL5A 2WANA 1QI0A 3RPMA 2VR5A 3B9EA 2JNKA 1E0WA 4LYQA 2J75A 2CEQA 3RM9A 5CPQA 4D72A 2J62A 1MFVA 1CZ1A 2IUZA 2Z1KA 4PMZA 5EFFA 1XCXA 1A47A 2PWEA 4TVUA 4H8UA 4W5UA 3VMOA 2OSYA 4AIOA 2G41A 4FMVA 3GNRA 1FH7A 2UY4A 3S6TA 1V6XA 3T0AA 4GQRA 3RCNA 5IHSA 1OB0A 4JAWA 2BHYA 2V3GA 1EO5A 3EMZA 2ZICA 2J7CA 3ZM8A 1CENA 3WH5A 1C7TA 1JZ4A 5KEZA 3AIVA 3AMCA 3PZUA 1M7XA 3GBDA 1W9UA 3TTYA 1EQCA 1MXDA 3AS0A 1V02A 3NDYA 3WFLA 2Q8XA 3KEHA 3AHXA 1FA2A 4PSPA 1ISWA 1W9XA 4MNJA 2VI0A 2D20A 4AD4A 4HU0A 4OUEA 4D6HA 5M3WA 1V0MA 1G94A 3UR8A 1XV8A 3MSDA 3WFZA 1DWGM 1OGBA 3MUZ1 3GTNA 4PMUA 1JYXA 4KGLA 3ZIZA 3O9NA 3OB8A 3ARZA 1CBGA 1KGWA 4UOZA 3WD3A 2WK2A 3SUTA 1JGIA 1ECEA 3QGVA 1Y7VA 1I1WA 3N04A 3OIHA 2ZXDA 2V3DA 4ACZA 3FY1A 4MDOA 1FP9A 3AI0A 3NSXA 5DF0A 4ZENA 4FLOA 1Z32X 2BHZA 5D9PA 1VIWA 1XD1A 3VDBA 1WDPA 2F8QA 1NH6A 3WQ4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1TEL A;  2WMF A;  2Y7F A;  1BYB A;  3DUG A;  3ES7 A;  1F3W A;  4JL1 A;  4URI A;  4M8U A;  4EAY A;  4IPP A;  3WQO A;  1Q63 A;  3VM5 A;  3NYD A;  4L4M A;  3QQW A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 1J0H A;  1PIG A;  4J27 A;  2IXU A;  2J79 A;  4QAW A;  1JFH A;  2D24 A;  3ALF A;  5CGT A;  1BPL B;  5D9O A;  3J7H A;  1K6A A;  1JI1 A;  1V02 E;  4H04 A;  1UG6 A;  5JBF A;  1ISZ A;  1RP8 A;  2PI6 A;  2OO2 A;  1OGG A;  3WEO A;  3HU7 A;  4JFW A;  2WLZ A;  3DYP A;  2WMI B;  4M81 A;  3I3B A;  3WBA A;  1FHD A;  1ZS2 A;  3S2C A;  2ZX7 A;  2GJP A;  2FDM A;  3A4W A;  4CGT A;  1OIM A;  4W85 A;  3WL1 A;  4ACZ B;  2ESC A;  2X0Y A;  5I5R A;  5JBD A;  3VD3 A;  4AD3 A;  2D0H A;  2VT0 A;  3ARW A;  2W61 A;  1KBK A;  1UKP A;  3EYP A;  1JND A;  1E6R A;  4U3C A;  1WPC A;  1KQY A;  2YL8 A;  1J0Z A;  2YA1 A;  3T08 A;  2DSZ A;  1V6V A;  2WZH A;  4DM2 A;  2J8F A;  2WMG A;  3OBA A;  2E4T A;  5I2U A;  2O9O A;  4H2C A;  3B8S A;  2QPS A;  2ZX5 A;  2VZO A;  1CXE A;  4GZI A;  3RME A;  1LJY A;  3AHV A;  2WHL A;  3T0B A;  3WKZ A;  1E1F A;  1GON A;  2XFF A;  4OJY A;  2V3E A;  2Y2W A;  5A94 A;  1B3Z A;  3ARO A;  2D0F A;  3PTQ A;  3VGH A;  3FXY A;  4ZE4 A;  4LYP A;  1J11 A;  1V08 A;  3WSU A;  3ARP A;  2CNC A;  2BVD A;  1CYG A; 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