4AZIA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
415
structure length
410
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGWYFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 164
structure length 410
sequence length 415
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4aziA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aziA01
2FH8A 5A69A 4AZBA 4IPLA 4AEFA 5F7UA 3DECA 3OGVA 3CLWA 4AWEA 2ZXBA 1BPLB 1B30A 1GHRA 2XYLA 4Z2HA 3EDDA 1LL4A 1ECEA 2O92A 4UQCA 2GUYA 3N17A 3WD3A 3WDPP 3UESA 2VNCA 2E40A 2PWGA 4UZSA 1W1YA 1VBRA 1SFSA 3PHAA 1VFFA 3OGRA 4NI3A 4AD1A 1GOWA 3T0DA 3MUIA 2WVSA 4DUXA 3WDQA 5A6BA 4B3KA 3MV11 3WQ8A 4NSBA 2OO2A 3ZQ9A 1ZS2A 1J0IA 4J7RA 3ARPA 3BC9A 3SCRA 4A3YA 4FZOA 3DYMA 5GPRA 2E4TA 5A3HA 4D6EA 1XH2A 3VGHA 1EOKA 3HU7A 1US3A 3AMLA 3EDEA 5A8MA 2CXGA 4AYSA 1R87A 1W1TA 3DYPA 4J28A 1H0GA 1K6AA 1I1XA 2WK2A 1AQMA 3GXMA 2VX4A 1BSIA 1SMDA 2BVYA 1QHPA 1JAKA 2ZOXA 3ARSA 2F8QA 1GNXA 3WF4A 4JFUA 1GOOA 1V6UA 1KGXA 1BF2A 1JYWA 2DT0A 3S6TA 1OT1A 2VCCA 2NW0A 3ARRA 3SCPA 2CPUA 1NWUA 3W29A 1OM0A 1BAGA 4UZUA 1GHSA 3SCVA 4M1RA 4PSPA 5DMYA 1C8QA 4CD8A 4KGLA 1UUQA 3PN8A 4HA3A 1HL8A 3UR7A 4F79A 5DFAA 4B9ZA 5M5DA 3IAQA 4URIA 3B9AA 1E40A 2GSJA 3O9NA 1WCGA 2W61A 1B3WA 2WHLA 1BVZA 1KQYA 2WMFA 3T0AA 2WXDM 3GNPA 3AHZA 4D6HA 1VJZA 4J3XA 3CZ8A 4QAWA 8CGTA 2W63A 1IT0A 2C7FA 4AIEA 1H2JA 2JF6A 3U57A 3GXIA 3D5HA 2GK1B 1M53A 3AOFA 1WB0A 4OOUA 5JBEA 3N12A 5CXPA 2CCRA 1EDTA 1A47A 4F9JA 1E1FA 1VJSA 2A3HA 2YLLA 4AZCA 3ZJ6A 4UOQA 1H0IA 3L2LA 4ML4A 1FP8A 1D7FA 3B8SA 1L8NA 1TA3A 1DWAM 2DIJA 3BH4A 2JIWA 3U5UA 4NRRA 4CU6A 1J9YA 1CGXA 2Y8VA 3WF0A 5CSYA 4BQ3A 5GQBA 2D20A 1OGBA 3B9EA 1HJUA 3NDYA 3WNNA 4JFTA 1NWTA 3WN6A 1TR1A 4GO8A 2ZUUA 2CIPA 3QOKA 1E56A 1JZ6A 5I0DA 3BCFA 2QHAA 5CGMA 2JFEX 3AXXA 1W1PA 2VZOA 2WMHA 4ZFMA 1V6WA 1Q6GA 1C91A 1A3HA 2DH2A 5D9NA 3AHXA 3GYCA 4AD3A 1KR0A 1F4HA 3DHUA 2NT0A 5C71A 1B3VA 3RCNA 1E6SM 3AS1A 4AD2A 4AY1A 3K4DA 2GJXA 3CUJA 3PTQA 1XV8A 1G01A 4AMCA 1H5VA 4J3SA 2WHKA 3IJ7A 1EHNA 1EO7A 4W88A 4GQRA 4U3AA 5GNXA 1O6IA 2QV4A 4W86A 1V08A 4AZ5A 2WVVB 1BYBA 2J8GA 1J0HA 3G6MA 1US2A 1KCKA 4QLLA 4AEEA 2WAGA 4IM4A 4DUWA 2RGMA 2WBKA 3CIVA 1M04A 3ZOAA 5D8WA 2YDQA 4CU8A 1V3HA 2F2HA 4U31A 2XGIA 4ZXLA 4TXEA 2X2YA 4W8LA 1K9FA 3FHAA 1GZJA 4HOWA 1LG1A 1JI1A 2OWCA 4TVCA 4Z2LA 3MUZ1 1UKSA 4ACYA 6CGTA 2WZEA 2WB5A 3GDBA 7TAAA 3CTTA 2G3MA 4YHGA 1QI2A 2RGLA 5BYWA 2DT3A 4GKLA 4QCEA 1GCYA 4PTWA 3IK2A 2WZHA 5AC5A 3MANA 1LQ0A 1HF6A 4GQQA 1JDDA 5AYBA 2DSVA 2WKGA 5I6SA 2WZIA 2ZWZA 4L4PA 4MNJA 4J3UA 3SCUA 1UR2A 2WMIA 4YHEA 2WSPA 3UR8A 1KXHA 3MS8A 4DWSB 1JIBA 2FHBA 2ZXDA 4ATLA 2WMGA 1CTNA 4AC1X 3U7VA 1ESWA 1R7OA 4CUCA 5CZKA 1OGGA 1BGAA 4EANA 1WO2A 1OD0A 5A6SA 2XIBA 2D22A 3AHVA 1ZJBA 1KB3A 3CZLA 3WUBA 2XIIA 2ZUMA 2EPNA 1QPKA 4CVWA 3T2PA 1W9PA 4IPNB 4ZXOA 5A8QA 1HJXA 1XH0A 1KXVA 1JFXA 4MPKA 4W7VA 5A95A 1E4MM 1NARA 4P7LA 4E2OA 2CBIA 3KL5A 3WH7A 1BYDA 3RMEA 4AZ7A 1WKYA 6A3HA 1BVNP 2CNCA 5HOSA 2CBVA 3VM5A 1E1EA 1B31A 4LPCA 1PJ9A 1HT6A 1UD4A 1J18A 2PWDA 4GO9A 1JD9A 5AYIA 4UQEA 2UY5A 5D9OA 2XSBA 3CUHA 1GQIA 1E6QM 5BXSA 3MKKA 1XYFA 1JYNA 1UD2A 4UTFA 3I3BA 1GVYA 3W0KA 4IISA 2C0HA 3CMGA 4CCDA 4KRTA 3OBAA 3K8KA 2NT1A 2VR5A 4V27A 3MSDA 4M80A 3AJ7A 1HX0A 1G94A 2W92A 3WMCA 1MWOA 4MB4A 5A6JA 1V6XA 4U5IA 4H8UA 3FY1A 2V3GA 1V3LA 3AS3A 5EFDA 3WQ4A 5DEZA 1KWKA 2WCSA 1V0KA 3GZAA 3SIMA 4AIUA 2XM1A 3PZNA 2D0HA 1WZAA 4RL3A 4C7GA 1V0MA 3WMBA 1LLOA 3K46A 3TA9A 2VC9A 3SCOA 2OYKA 1CIUA 1KCLA 4W93A 3AHYA 3VD3A 5FOOA 3U5YA 4TVUA 4UFJA 2QF8A 3BAYA 3WUFA 1Q6EA 3SUUA 3VGEA 2BY2A 4M56A 4UCFA 1QI3A 3IAPA 2A3CA 2WNWA 2ZUNA 2XWDA 4X9YA 4AW7A 3SUTA 1UD6A 1C7SA 2VUYA 2GJPA 2QLYA 2WWDA 3WH5A 4L4OA 1OIMA 4GXPA 1EGZA 2IUZA 5BXTA 3AQUA 2ZX5A 5CLWA 4C7FA 3GXFA 3N9KA 1EA9C 1PBGA 3ARVA 2BHZA 3THDA 4A3HA 3RIKA 1UR9A 4KH2A 5ABFA 1O7AA 1E4IA 3WQWA 4UFMA 4IUGA 2ZX8A 2WVUA 1W3JA 1CXLA 1QHOA 2VRQA 2PWHA 1V6YA 1IZKA 1DWFM 3VX1A 3PZMA 2YBUA 1WZLA 4PCTA 4LYQA 1JGIA 2J75A 1WDSA 4AD5A 4NRSA 3SCNA 3VGGA 3HMCA 1X6LA 4RE3A 2Y8KA 4UFKA 5LA2A 2DIEA 5BROA 3VNYA 1BYCA 1VAHA 2JF7A 2WC3A 2XVLA 2DT2A 4HTYA 1UA7A 5C70A 2BS9A 1C93A 3BAXA 5E9AA 4WF7A 1ZL1A 1JDCA 1WZMA 2JEQA 1GOMA 3B9DA 3W81A 2AOSA 2Q8XA 4M82A 1E0XA 3WSUA 3E1F1 3AFBA 1QNQA 5FIPA 3ZT5A 4R27A 1JL8A 2YIHA 2X0HA 4BQ4A 5ABHA 4AZ6A 1W32A 1JZ8A 3II1A 3AICA 5A94A 2WMJA 1JFHA 3MMDA 2DGAA 5TD4A 2Z1SA 3L4WA 2G3JA 2GDVA 1XH1A 4CD6A 2W66A 2J77A 3AYSA 5DF0A 1NM9A 5M3WA 2HVMA 3ARTA 1UR4A 4Q7NA 3ZR6A 1OWQA 4JFWA 5M17A 3ZM8A 3ZSTA 2EPMX 1HJSA 2A3EA 5IXEA 3WF1A 2ZICA 1AMYA 1XHGA 2PBOA 3EDFA 1OIFA 4HMCA 3SUWA 2CHNA 4NZCA 3T09A 5IFPA 1ZB5A 3FAWA 5BRPA 3L4ZA 4DM1A 3GH5A 2DQXA 3EYPA 3CHCA 1E6NA 4MTVA 5DT5A 2QPUA 4X0NA 1TMQA 4DWSD 2PWFA 3MV01 3L4TA 1E5JA 3GBDA 2V3EA 3UG5A 1TVNA 1V3MA 5IDIA 3ALGA 2XVKA 2BV9A 4XUYA 2ZWYA 2G41A 3NIYA 3W4RA 1KFWA 4B15A 1MVYA 5CJ5A 4LYRA 3LPOA 1QBBA 2EEXA 4WJXA 3WD1A 1QNRA 5LA0A 1EXPA 4TVDA 3WF3A 1ISYA 4CCCA 2XUCA 1DP0A 1BQCA 1DTUA 2VR4A 3HJEA 1KBKA 2D1ZA 4JL1A 3RO8A 3CHDA 1VIWA 4GPNA 1OD8A 3WQVA 5JUVA 3GTNA 1U2YA 4JL2A 4D72A 2UWFA 1CECA 1WAWA 2YOCA 3WIJA 3VIHA 2AMGA 4R5EA 4U3CA 4EK7A 1ODZA 1CGUA 1ISXA 1BYAA 1ISZA 2JE8A 1WPCA 4JIEA 1R7AA 3CGTA 3N15A 4MDOA 1YQ2A 2G3NA 3GNRA 3WNMA 2EO7A 1CXFA 3OLGA 1D2KA 2VCAA 2GDUA 4GZEA 3VVGA 4M8UA 1JXJA 4H7VA 1J0JA 2IXUA 4KRUA 2YL5A 1TUXA 1S46A 5I77A 3I3EA 2VL4A 2J8FA 2CITA 4J27A 4PMRA 2D3LA 4HMEA 2BHUA 2FDMA 4PTVA 4EE9A 4BA0A 4OIFA 2VMFA 4LXFA 4F8XA 4MADA 5A8NA 1UZ4A 1WNOA 4ACZB 3MMUA 1GONA 3KWXA 2CERA 1Y7VA 4P7NA 3VU2A 1QBAA 1UH4A 5M03A 1XGZA 4AXNA 4JHZA 4A4AA 1VFMA 3VGDA 1ISVA 2YA2A 3WBEA 1WDRA 1GJWA 2E0PA 2PF0A 1J01A 3JUGA 2CEQA 4H8VA 1VEMA 3LPFA 4BCEA 4CN4A 4FZPA 3K8LA 3L4XA 1TCMA 1JAEA 3AIWA 3W53A 5AC4A 2OWWA 4PYSA 4P8XA 3M6DA 4P8UA 3MSGA 1V3IA 3NCOA 2A3BA 1EIBA 3WD2A 2BY1A 2GK1A 1UR8A 4NF7A 4MNMA 3TTYA 4CKQA 1OT2A 4JCLA 4PBGA 4RE4A 1LL6A 1F4AA 2J7FA 4CN6A 3ARUA 3OA5A 1C90A 3TOPA 1ODUA 5CGTA 5GNYA 3VGBA 1TFVA 1GJUA 3K8MA 4ZENA 4H2CA 1PIGA 4D71A 1MXGA 2XWEA 2PI6A 1CDGA 4D6CA 4UR9A 1WZKA 1VF8A 4Q22A 1X6NA 1V6VA 4LYPA 4E8DA 1OBAA 2BVDA 3AZTA 1VEPA 1E0WA 2OYMA 1JNDA 4CD5A 4BQ2A 4EAMA 1HNYA 3KL0A 2YL8A 1ISWA 1VENA 1E71M 2XVNA 4W5ZA 3BLPX 3TTQA 3A6OA 1JF6A 4X0VA 3F5JA 3VIMA 5IHSA 4BZYA 5EBAA 2D2OA 1AVAA 1E6RA 4JAWA 1GQJA 5A2BA 1E6ZA 3PZGA 4D6IA 1HKIA 4WKAA 3PZ9A 2QPSA 4BQ5A 1JZ4A 1B2YA 1PZ2A 2XGBA 4LGXA 2WVVA 3VPLA 4MAZA 4QCFA 1QNOA 1NWSA 4PMOA 4QLKA 5E09A 1NWRA 2FHCA 4WSKA 1GOQA 3TTSA 3WNKA 1GUVA 3BAIA 5JBDA 3W26A 2UY4A 1U33A 3CZKA 3MU7A 3IJ9A 2BY0A 1V02A 3A4XA 5LYRA 3HN3A 1NOUA 5FL0A 4ATDA 2J78A 4U2YA 4PMYA 4GZJA 4MAVA 2C8NA 1FH8A 3FW6A 2VRJA 1C3FA 3AIBA 2J74A 5DT7A 4D6DA 4OBSA 2D23A 3OLEA 4E8CA 3FXYA 2YL6A 4W7WA 1UYQA 2HISA 2G3IA 1DWIM 3ZR5A 3UG3A 1WDPA 1JZ3A 4QDMA 5BXRA 2CKSA 2MANA 1CBGA 3AMKA 4FLRA 1CGTA 3EMCA 3WEOA 4JKKA 4BF7A 4DWSA 2FGLA 1TE1A 4HOZA 3W25A 3W27A 1C8YA 5EMYA 1PX3A 1JZ5A 4HPHA 3OG2A 3VDBA 3EDKA 3GXDA 1MFVA 1ZBWA 3POCA 1B3YA 2J7BA 2BY3A 4CCEA 4D1JA 4PMUA 3RJXA 1B1YA 2YDSA 4CGTA 5ABEA 4JCMA 4P8WA 1UKOA 4S3KA 5D9PA 1HP5A 2D0GA 2J4GA 2OWXA 5EB8A 5KEZA 3ZO9A 4FLQA 3FAXA 2XVPA 1E73M 4ZE5A 2A3AA 5A6MA 5GNZA 4AIOA 4PMZA 3BAKA 1XSJA 3N11A 4GI9A 3BSGA 2V38A 3WDRA 2V5DA 5CPTA 4PUDA 4PUEA 1RP8A 2VJXA 3IJ8A 1XCWA 1OCQA 4CN1A 5CG0A 5I78A 2ZUWA 1B3ZA 5CSUA 1V0NA 4H41A 1LWHA 1LWJA 1V0LA 1UKPA 3DYOA 3GH7A 2ZIDA 1VFUA 1CGYA 1TZ7A 1UWTA 1JF5A 4OKDA 1B9ZA 5I3DA 3NSNA 3UETA 3EBVA 2IXVA 1QI5A 4YN5A 1E43A 4PEEA 1EH9A 4ZE4A 2WM0A 3ZT6A 5A6KA 3O6AA 1EDQA 2ZX7A 2WLZA 5IFTA 1YHTA 2VZTA 4TOQA 4W7UA 1V3JA 5JIPA 1MQQA 1W9BM 1D3CA 4WSJA 1HIZA 5HXMA 4PN2A 3W28A 4B16A 2TAAA 4GINA 3VD5A 1KR1A 3VINA 1HJWA 3D3AA 3RM8A 1ZBVA 1W3LA 1ITCA 2VVSA 1V03A 4W87A 2PMRA 1NOFA 1H1NA 1NOWA 2W62A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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