4AZIA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
415
structure length
410
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGWYFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 164
structure length 410
sequence length 415
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4aziA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aziA01
4NSBA 3K46A 2VRQA 1PZ2A 2JALA 4TX8A 4P8XA 4IPLA 2CCRA 2WWDA 5A95A 2V5DA 2CYGA 4MJ4A 3WIJA 2QLYA 3EMQA 1QNPA 5GNYA 1DTUA 3ARVA 3UR8A 4P8WA 4LX4A 2Y8VA 1NP2A 1ZB5A 1XRVA 4GO9A 4Z2LA 2ZUVA 1J18A 2FHCA 1KWGA 2BY1A 1Q6CA 1E6NA 2WANA 1JYNA 1NWRA 2BHYA 3EYPA 3VGDA 4NRSA 2EPLX 2CHNA 3IJ9A 1V02A 1BLIA 1JYXA 2A3AA 2WLZA 2WVVB 2CKRA 2ZWZA 4MDOA 1I1XA 5BRQA 1GPFA 3VPLA 1J0HA 1K9EA 4M29A 1V6UA 4UQAA 1H41A 2NT0A 3BAIA 3FN9A 1RPKA 4HA4A 4IM4A 3D5HA 2E9BA 2CITA 3MS8A 1CXFA 3AHYA 4CN1A 3VNZA 2WSKA 4DWSC 2VCAA 4JL1A 1GCYA 3W27A 3BC9A 4ZEPA 3WUEA 2ZUWA 2WAGA 3WF1A 3WQ5A 2VZTA 2VT0A 2WWCA 4DM2A 1XYZA 3HU7A 2GDVA 4UOZA 1G0CA 1NOUA 3MMWA 1V3IA 2WMFA 1VBUA 3ALFA 2A3BA 1LL6A 5GPRA 3ARYA 4D6DA 2G41A 1R87A 5HDRA 4UZSA 4AWEA 4MNJA 4WSKA 4QCEA 3PTMA 4M56A 1UA3A 1E40A 3WD1A 1DWJM 6CGTA 3SUSA 1J0KA 3ARQA 2CHOA 3HJEA 3WH6A 2BNJA 3W37A 2WW5A 2E8ZA 4LXFA 5TD4A 3U7VA 4LYRA 1DWFM 3FXYA 1CGTA 1SMAA 4HTYA 4OKDA 5A8NA 5BRPA 2VJXA 2DQXA 2E9MA 2PMRA 2W63A 3GH7A 1OGGA 1W2VA 2QV4A 1NWUA 4HP5A 4C7GA 3PZQA 4PMDA 4UFLA 3OA5A 4PMRA 1XHGA 2G3JA 3NYDA 3AMGA 1XSKA 1WCGA 1H5VA 5HOSA 4MB4A 1J01A 4PCSA 3NIYA 1ZBCA 1LQ0A 1ISZA 3MKKA 1UD3A 3VGGA 1C93A 3AIVA 4AIEA 3SCVA 1UH4A 3WDRA 1VFUA 4OJYA 3POCA 3WF4A 2J7HA 1QVBA 1UQYA 3T09A 4IPNB 1E72M 2X0YA 2PWFA 2X8RA 4DUVA 2BHZA 4W5UA 5FL0A 5CLWA 1DWAM 2YOCA 1C91A 1I75A 3N04A 3DECA 4GI8A 3AHVA 3EBVA 1KQYA 1BYAA 1ODZA 3MSGA 1GQKA 4HZ7A 5M17A 1SYTA 3B8SA 3TTSA 3O2LA 1XCXA 3WQWA 5AC4A 2G8ZA 4Z2JA 4BZYA 1WDPA 3WNPA 1EQPA 4ZFMA 2ZX8A 2O9TA 1OSEA 1MFUA 1GOWA 1WDQA 4AZCB 3NCOA 3VDHA 4HPHA 5AC5A 4AIOA 3GXMA 4UFKA 2WK2A 4HU8A 4ML4A 4U2YA 1OIMA 1VRXA 3N11A 1CGYA 1GOMA 2XVGA 4UFJA 3PZNA 3VMOA 4LQ1A 2GJRA 3WUFA 1W91A 2BFGA 4PSPA 3AMKA 5I2UA 3A3HA 1GVYA 1QW9A 1Y7VA 4HPGA 2WCGA 3CUIA 2ZOXA 2XFFA 4J3SA 3W6LA 3LMYA 2C8NA 2J25A 3IK2A 4FF5A 3WEOA 3BAYA 1J0IA 2C7FA 2EPNA 3L4ZA 5BWFA 3OLDA 3W82A 1MXDA 2VL4A 1QNOA 2ZUNA 5CPSA 1UD5A 2AOSA 3KL5A 4RE4A 5I78A 3WNNA 2J7FA 3MANA 3GYCA 3W81A 2C0HA 3AIWA 1VJZA 1B2YA 4AD3A 5KZ6A 4MNLA 2DH3A 3ARXA 2VCBA 3QHNA 3VGEA 3AS0A 3W4RA 3O9NA 1PEZA 5A8QA 4GINA 1B31A 1GQIA 3NSMA 3VGBA 4HOWA 1QHOA 1E5JA 4W8LA 2DSZA 5BXPA 5EMYA 1U33A 3M07A 1XV8A 4MTVA 4AZ6A 6TAAA 1JAEA 2OSYA 3APGA 1LLOA 2X05A 5GNXA 4AXNA 5M5DA 1IT0A 3RILA 3IJ8A 3CUFA 4JFVA 5HXMA 2CIPA 4AY1A 4AZ5A 2Y5EA 1WNOA 2Z1KA 2QMKA 5JIWA 2BXZA 2D0HA 3MMUA 3WQ8A 4WLCA 3WMCA 1GORA 3CGTA 1V3KA 2W92A 4AC1X 1R7AA 4CD8A 1X6NA 1XCWA 4GI9A 4W7UA 1UG6A 4A3YA 1D7FA 4S3KA 3WD3A 5A6LA 4TUFA 2ZX9A 4J27A 1CWYA 2DPEA 4KWUA 4YHGA 1LWJA 1TMQA 1HT6A 2WYSA 2DT0A 3OB8A 3W38A 3A6OA 3POHA 1BFNA 4AIUA 3VTRA 4ATDA 2WHMA 5HPOA 3FHQA 2XIIA 4XZWA 4M1RA 4Z2KA 3AHZA 1E6RA 5I3DA 4ACYA 2E40A 5CG0A 3EDKA 4AZBA 2DEPA 3OBAA 4NI3A 3QOKA 4PTVA 1UD6A 5GQBA 5BXTA 4ATLA 1KGXA 1HL9A 4U3AA 2WVVA 3WFLA 2J62A 1UR4A 1W3JA 2Q8XA 5FD0A 3CTTA 3ZT5A 4PMUA 4PYSA 3BLKA 4WKFA 3ZJ7A 1GVIA 3WDPP 5BXRA 4BQ5A 5ECUA 1W3HA 1HJSA 2A3CA 7TAAA 4JZ5A 3SCPA 4UQCA 1VFMA 3AS1A 2DT1A 3BCDA 1FOBA 1JIBA 3QGVA 4ZXLA 3I3DA 1HF6A 1E43A 1E4LA 4FLOA 1PBGA 4OIFA 4KRTA 3ALGA 1FHDA 2ZXQA 2D1ZA 3THDA 4UFHA 3BH4A 1WKYA 3W53A 1NOWA 4M24A 4X0VA 3OGRA 2ZWYA 4AD1A 3PZOA 1UWIA 2JF7A 3CUHA 2X2YA 2BVDA 1J0JA 2O92A 3SIMA 4R5EA 1XC6A 1ZJBA 3PTQA 2FHFA 1JZ5A 1UKOA 4KGJA 4GKLA 1BF2A 1TCMA 3GXIA 2RGMA 1KGUA 2A3EA 5CPQA 1M03A 3ARUA 1O6IA 5D9OA 1PJ9A 2WKGA 2FDMA 4UQ9A 4CU6A 1QBBA 4WSJA 3F5LA 1A47A 4WK9A 4YHEA 4AZ7A 2YL9A 5AYIA 1QBAA 1ITCA 1C7TA 1ESWA 2YLLA 1TA3A 5ABEA 4AEFA 3RO8A 4WKAA 1RP9A 1KXVA 3AZTA 2WMIA 4MB1A 4TTUA 3WNMA 2J7CA 4F79A 1VENA 3G6MA 2JF6A 1VB9A 1US2A 3W0KA 2XFRA 2VNCA 3AXHA 2O9RA 3UR7A 3BAJA 2GJXA 4QLJA 1LG1A 5LA0A 1HXJA 5A94A 1V02E 2CESA 4JKKA 1SMDA 4H04A 2PBOA 4E8DA 3OLIA 4V27A 3ZIZA 1C8YA 2G3NA 5EFDA 3AS2A 2WHJA 4E2OA 1WO2A 2GFTA 2Y4SA 3LPPA 4M82A 4W86A 4DUWA 1XGZA 4XZBA 1W9DM 1XSIA 1W9PA 1V3LA 2DIJA 2WPGA 3WNOA 1LL7A 1JL8A 4B15A 1UR8A 3VD3A 3T0AA 3WUBA 2CETA 2VOTA 4EKJA 1UWTA 1NARA 2EEXA 5HBFA 4URIA 1CYGA 1K6AA 3W24A 2ZICA 2JEQA 3IAQA 3VNYA 1EIBA 5A8OA 2WVTA 4W84A 3GNOA 3MV11 4E4PA 2E3ZA 4DUXA 4MDPA 4AZGA 1C3FA 4PMQA 1GOQA 1EHNA 2J4GA 1WAWA 2ZXBA 1F4HA 4JKLA 1V6XA 3VILA 3VGFA 2WXDM 3CZKA 2J75A 1VF8A 1EO5A 1VIWA 4GZJA 3VX0A 1JYVA 3ZM8A 4AZCA 2WMJA 3CPUA 3RMEA 3RPMA 2XSBA 4FZOA 2WC4A 2IXUA 4W93A 3MV01 3OGSA 2XYLA 3F5KA 3ARWA 3OIHA 5CXPA 2W4XA 4F66A 2VZSA 3AJ7A 3VDAA 2EJ1A 4DM1A 1EOKA 3ECQA 3CH9A 3N13A 4MPKA 1UHVA 4PUDA 3VU2A 3BAXA 1CECA 2J7DA 4UR9A 4CGTA 1CEOA 3SCQA 1G01A 4J3VA 3WDIA 2J8GA 1MW1A 3MO4A 5A69A 4H41A 4BS0A 3AZRA 3PZUA 2D0FA 1JNEA 5C70A 1QI0A 5ABGA 3VIIA 4UQDA 2XUCA 4KRUA 3EDEA 2XVNA 1EXPA 2GJPA 3OGVA 5A6MA 1TE1A 3GZAA 3ARSA 5E6YA 4H8UA 1LL4A 2VC9A 3U5UA 4QLKA 1W1TA 3QHMA 1GUVA 4C7DA 1H09A 1EA9C 4JFTA 5AYBA 2VX4A 2D0GA 3VINA 1VFOA 3NJ3A 1C92A 1C8XA 3L4YA 2WVSA 4OUEA 2XG9A 1ZJAA 3AHTA 3TTQA 4QP0A 1C8QA 2EQDA 3FAXA 1PX8A 1U2YA 5A2AA 2AMGA 1B30A 2XVLA 3B9EA 2PWHA 4XX6A 3A4AA 3GBEA 1LWHA 5GNZA 4HZ8A 1L0PA 4CKQA 3GNRA 4ZENA 4JCMA 4JHZA 1F4AA 1HP5A 1I1WA 1RD6A 1TR1A 2YLAA 1BHGA 1TA3B 1BVNP 2EXOA 1UWQA 1A3HA 3ZR6A 4P8VA 2WMIB 3SCWA 1CGWA 3B9AA 4OZOA 4J3WA 4UTFA 1D2KA 4U31A 1UR2A 1JXKA 5E9AA 1FP8A 2G3IA 2GJXB 3K8KA 3IJ7A 1P6WA 5ABFA 2OZNB 1HKKA 4AMCA 3AIBA 2VVNA 1JZ8A 4BQ2A 2W91A 3SURA 2D3LA 5BCAA 2PB1A 1UKPA 1EDTA 3BLPX 1E71M 1H3GA 1TZ7A 2VX6A 1B3ZA 1S46A 4EE9A 4OOZA 1JDCA 1JI1A 5IHSA 3AYRA 4JFWA 1FFRA 3PZVA 1PAMA 1AQ0A 1VEPA 1JZ6A 4H2CA 2WMHA 4UZUA 4B3LA 1DWIM 4CUCA 4FLSA 5IDIA 1RH9A 1LF1A 4AZHA 3E1F1 3L4XA 5JUVA 3WEZA 3VD5A 1V0KA 3UCQA 3WQ4A 4WJXA 4B9YA 2V38A 4UQEA 1JZ7A 1E4IA 1CDGA 4FLQA 3T0DA 2DGAA 4ZE5A 1H1NA 2CPUA 2YDRA 1CXLA 1SR0A 3SCRA 5C71A 1V0MA 4UOJA 1UOKA 2PWGA 3WL1A 5JBFA 4ATWA 1V3HA 2GDUA 4P7QA 5LYRA 5A6AA 1M04A 1OGSA 2RGLA 2JIEA 3T08A 4M81A 4PUEA 1CGVA 3CHDA 5EFFA 4E8CA 5DMYA 2WSPA 3W26A 2CBUA 4W7VA 3WMSA 1UZ4A 7A3HA 1CGXA 1B3VA 4HZ6A 1EQCA 1WZAA 3AROA 1JF5A 2W5FA 8CGTA 3WFZA 3GTNA 3AI0A 3VIJA 1KCKA 2DT3A 3EDJA 5JIPA 5M03A 3CHEA 1VBRA 1E1EA 2UY5A 5HNNA 3A4WA 9CGTA 2YIHA 4S3JA 2JEPA 4J3TA 3CO4A 4JIEA 2W66A 1YQ2A 3CBWA 4TVDA 2V3EA 1L8NA 4HA1A 1JI2A 3WF2A 1CXIA 2QHAA 2YA2A 3EMCA 4CVUA 1E0VA 2OYMA 4V28A 1MXGA 4F8XA 1BSIA 2J78A 1DWHM 3WMBA 4D6JA 3BCFA 3ZSTA 1WDRA 3HMCA 3MUZ1 1WB0A 2QPSA 4MB3A 1J0YA 4FK9A 1NP0A 1JDDA 3OG2A 1UR1A 1W9UA 4HMDA 1XH0A 2J79A 4Z2GA 1GHRA 4UNIA 1H0GA 2TAAA 2IUZA 1QHPA 5DT7A 4AYSA 4N42A 3PHAA 4EANA 3K8MA 1E6QM 1CXKA 5BXSA 3WF3A 4FMVA 2OWXA 1JFXA 3NSXA 5FL1A 1BQCA 2UY2A 2BS9A 1E56A 4M80A 1GOOA 1BVZA 1BPLB 1XD1A 3A4XA 1GOKA 1E1FA 3WDHA 2D23A 3WY1A 4D6EA 4IUGA 4PMOA 3ZOAA 2NT1A 4Z2IA 4HOZA 2JIWA 1UWRA 5DO8A 2F61A 4JCLA 1UR9A 3TTOA 1Q6FA 4AW7A 1PIFA 1DWGM 5ABFB 1J10A 2DSKA 2VR4A 1J11A 4D1IA 1QI4A 4PSRA 3M6DA 1GW1A 4FLRA 1WDSA 1E73M 1EDQA 1WZMA 4BA0A 4DWSA 2VVSA 1XH2A 3RM8A 4M8UA 3N1AA 5D9NA 1JG9A 2FHBA 1OGBA 1E15A 3KE0A 3VKKA 2UY4A 1XSJA 2OLHA 4RE3A 4P7NA 2WBKA 4HU0A 1ISYA 2OYLA 1W9XA 4C7FA 4PMNA 8A3HA 3BSHA 4W5ZA 4D71A 1K9FA 1NH6A 5AY7A 5I79A 4A3HA 4UFIA 1EHAA 1QW8A 3OZOA 3VIOA 3VOCA 1BGGA 2EBNA 4PCTA 4MB5A 2VRJA 2PWEA 4L4OA 2ZUUA 1H0IA 2ZX7A 1ECEA 2WC3A 3SUTA 3VMNA 4PTWA 3AIUA 1WE5A 3RJYA 3PZIA 4CCDA 5A2BA 1V6YA 4EK7A 3UETA 4CCEA 4R27A 2QPUA 1E6PA 1M53A 1UH2A 1KR0A 2AAAA 2WHKA 7CGTA 4P7RA 3VIKA 5A8PA 3NUKA 4U5IA 4L4PA 3AMDA 5A1AA 1UKQA 1QI5A 3CZJA 3SCNA 1K9TA 1KQZA 4J28A 1UWUA 1TUXA 3RDKA 6A3HA 4YPJA 1EOMA 3M7SA 2ZE0A 4QDMA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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