4AZCA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
419
structure length
416
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 166
structure length 416
sequence length 419
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azcA01
3SUWA 4A3YA 1VEMA 4EKJA 4J3VA 4QLKA 5CJ5A 3W38A 1V6YA 4R5EA 4KRTA 2YL9A 2PBOA 1AQ0A 2WWCA 3SCUA 5AYBA 3RO8A 1CXEA 1XSIA 4F66A 4FK9A 2YA0A 4UOQA 5CSYA 4E8DA 3VTRA 2D0GA 1GVIA 2XVLA 3PTMA 1O6IA 3UR7A 3DYMA 4U33A 4IUGA 1W9XA 2VZSA 4DUWA 2GUYA 1JZ5A 3ARXA 1OSEA 3B9AA 1J0ZA 3QR3A 3ARWA 2ZX8A 3RCNA 4BQ4A 3AZRA 3EYPA 1EIBA 8CGTA 1XYZA 2VZVA 4N0RA 4GI6A 4PMYA 5LYRA 2XFYA 3VILA 3GH4A 1J0HA 1JD9A 1GVYA 1KXVA 1W2VA 1MQRA 3U5YA 3WKZA 2EO7A 1UYQA 2PBGA 1WCGA 5FOOA 1SFSA 2UY3A 1E3ZA 4QCFA 3SCSA 1GQLA 4A4AA 3GYCA 1HVQA 3ARZA 5BXPA 1ITCA 2XGIA 1E0WA 5M17A 3O6AA 1XRVA 1WDRA 3AMLA 1SMDA 4WF7A 1EDGA 2JEPA 1C93A 2YDRA 1U30A 1JXKA 5I0DA 1ODZA 4B15A 1CECA 5A2CA 4CN6A 1ZJAA 4PMVA 4J3SA 3K8KA 5KZ6A 5IDIA 4MDOA 3OIHA 2CITA 4EAMA 4JIEA 2DSZA 1QHPA 3PN8A 2AMGA 5LA1A 1UUQA 5I77A 3HN3A 1JZ6A 1CXKA 3FN9A 4J3WA 4W85A 4JAWA 3RM8A 4PSRA 2WBKA 3N17A 2BY2A 4IM4A 5LA2A 1MWOA 4QCEA 3T2PA 4PTVA 4CKQA 1GNXA 5EFDA 3BAXA 3ZO9A 2ZUSA 1ISVA 3N1AA 1E4IA 4RE3A 5A6SA 3KEHA 1CXHA 1LG1A 2J7GA 4AEFA 5A95A 1MYRA 2GK1B 3NSXA 2YA2A 4U2ZA 1W3KA 4MB4A 1TVNA 1KCLA 4UTFA 1DWGM 2WMFA 2DIEA 3E1F1 5A6BD 5TD4A 1AMYA 1JIBA 5BRQA 4D6CA 5D9MA 1V03A 1LQ0A 1A3HA 4PN2A 2ZOXA 3ARQA 3APGA 4LYPA 5C71A 3A6OA 2ZX5A 1H0GA 3CMJA 1QNQA 1L0PA 4PTMA 4EK7A 3VMOA 3CMGA 1V0NA 4OOZA 5HOSA 1QOXA 2PMRA 1GPFA 2C0HA 1IZKA 2YDQA 2ZUUA 1B3XA 1QW8A 1ODUA 4Z2KA 2WMIA 4C7GA 8A3HA 4W89A 2VTFA 1JNDA 4IPLA 3CZJA 1Q4NX 2ZE0A 1LG2A 4W7WA 1WZMA 3ARVA 1E43A 2EQDA 1G9HA 3AROA 3UERA 3AJ7A 4FLRA 4WK9A 4M24A 2FH6A 2JIEA 1NM9A 3L4TA 4QDMA 2OLHA 3VGDA 2Y8VA 1TG7A 2CESA 3WD2A 2FHFA 3KL5A 3WEZA 2V3FA 2XGBA 3ARRA 5M3WA 4UQCA 4WLCA 1JI1A 2BVDA 3VDAA 3CZEA 2X1IA 2G3MA 2PC8A 3GDBA 4HZ7A 3VIIA 5CZKA 2ZXQA 4CD5A 2DT1A 3WNOA 1UR8A 4DWSA 3MV11 3WF0A 2PWGA 3TTSA 2E3ZA 5A69A 1H49A 1HKIA 3II1A 3NIYA 3AHVA 4AZHA 4NF7A 3WNMA 3POHA 1UD5A 1UD6A 2JIWA 2VT0A 2OSXA 1AQMA 3WNLA 4JFSA 3MMUA 4U2YA 4GZIA 2WMIB 3N9KA 1UKOA 1OBAA 2VCAA 4UQEA 2XJ7A 1JYNA 3ZJ7A 1VBRA 3WN6A 1NH6A 3N04A 1UD3A 3CUGA 3GM8A 4GPNA 4UCFA 3AFBA 4UOJA 1BVNP 2Z1KA 3G6MA 1BLIA 3AIQA 2O9TA 2XM1A 3B8SA 4QFUA 3CUIA 3VM7A 2CKSA 2E9LA 1JYVA 4ZXLA 4P8VA 5AC5A 3VINA 3WH7A 1JI2A 2XG9A 4BF7A 1VAHA 1RP8A 1NOFA 2YA1A 2WCAA 3WMBA 3F5LA 2BY0A 2WLZA 2W92A 1W9BM 3AS3A 2PWDA 2ESCA 2D24A 3ZT5A 2VO5A 2XFFA 1GW1A 3SCOA 1J12A 4CD4A 4X0NA 1OWQA 1CWYA 1PAMA 4P8UA 3ZJKA 3AHZA 2UY4A 1FA2A 4HTYA 4FLOA 2CPUA 1XYFA 5CPSA 3OLDA 3F5JA 1GOOA 3WELA 2VNCA 4X9YA 3RMEA 5I23A 2YOCA 4P8XA 4XV0A 4ZENA 2Y4SA 1JG9A 3F5KA 4WKFA 3ARYA 4PMZA 3K4DA 4MAVA 1V6XA 4P7NA 3U5UA 5A1AA 1V3LA 1ZBCA 1VF8A 4Q22A 3BCDA 1QHZA 4J28A 2YL6A 1W3HA 5A8QA 3AI0A 6A3HA 1QBAA 1Q6CA 2ZXDA 3HMCA 4BQ2A 2BFGA 2BS9A 2GVYA 3ZQ9A 1LF1A 2FHCA 2WCGA 2GJPA 4GQRA 4AISA 1PJ9A 1ZBVA 5D9OA 1KBKA 2UY5A 4XX6A 4BCEA 5CPQA 5E6YA 3AIBA 2D0HA 2JF6A 3S6TA 2D3LA 1HP4A 1GOKA 2Z1SA 1CPUA 4RL3A 3WQ4A 5I3DA 2J79A 1EH9A 2WXDM 4PTWA 2WBGA 3WD4A 5CLTA 1PX4A 4RE4A 5HXMA 3SCVA 3FY1A 4D6JA 3CPUA 3HU7A 5ABFA 1US3A 4PTXA 5A6KA 3VIPA 1K9DA 3W81A 1WE5A 1R8LA 2YL5A 3WH6A 4FMVA 1UR9A 4DM2A 1E6QM 2XIBA 1BGGA 1MFUA 4GO8A 1X6NA 3MS8A 3OA5A 3WUEA 1JNEA 4CD7A 2OZNB 1IT0A 2VCBA 3VM5A 1UR2A 3CO4A 2XVGA 4MNKA 4B9YA 5FCZA 3FXYA 4W7VA 4PMDA 4W5ZA 3IJ9A 1IV8A 5FKYA 2ZXBA 3PZVA 2CERA 1OT2A 1J11A 5IHSA 4LQ1A 1UWQA 5A6LA 1F4HA 4CVUA 2XIIA 3GBDA 1OGGA 1E1FA 4NRSA 1WDPA 5A8NA 1B3ZA 3PTQA 2GJXB 1JGIA 4HOWA 1LL6A 3OZPA 5ABGA 4LX4A 4ACZA 1M03A 1VB9A 3TP4A 4AZ6A 2WNWA 4V28A 4L4OA 2ZIDA 2E40A 4D6HA 1G0CA 3CGTA 4GINA 1UQZA 3NDZA 2EXOA 1ISXA 4W8LA 4HMCA 1FOBA 5A6BA 5EFFA 1J01A 1JAEA 2J7FA 1BHGA 4J3TA 1XSJA 4PMQA 3PZUA 2VOTA 2PWFA 5A3HA 4FZOA 7TAAA 3DYPA 2W63A 3OLEA 1OGSA 1E6XM 4KGJA 3BMWA 2FHBA 4P7LA 3PZ9A 4JL1A 2XSBA 4W8BA 1HKMA 2CETA 2QLYA 4AWEA 3LPPA 5IHRA 3POCA 3ZM8A 4GXPA 5HPCA 1U33A 1OT1A 3GXIA 2G8ZA 1N82A 3VGBA 3MMDA 2NT0A 2WSKA 3W27A 2WHMA 4ATWA 1UD4A 2OWWA 3DHPA 4HA4A 1OINA 4MJ2A 5GNYA 1JYWA 3CUJA 2IUZA 3WF3A 1C92A 4GI8A 3KL0A 3BC9A 4D6DA 4X0VA 4AD3A 5CG0A 1KGXA 4ACZB 3A4WA 4MB5A 3L2LA 3L4VA 1BG9A 5CQ1A 1QI3A 4BQ3A 4HZ8A 3ZR5A 4AD2A 3EMZA 1G01A 1TZ7A 4D6EA 1QI0A 3FAXA 2J74A 1JZ2A 1PIFA 2BVTA 1CGXA 2VJXA 1UR4A 4PCTA 2E0PA 3ARTA 3WUFA 1ZB5A 4TTGA 1TMQA 4OBSA 4E8CA 3FHAA 1MW2A 3MUY1 5A8OA 2J7CA 3PZIA 3LMYA 2DSUA 2JNKA 3BLKA 1GOWA 3IAQA 2VRQA 4YN5A 3OGVA 2XPKA 4H8UA 2WAGA 3PZNA 4ATDA 3I3BA 3UG5A 3KL3A 2X0YA 4PMNA 1CXFA 2WMGA 4W84A 1KXHA 2WLYA 4AEEA 2VUYA 1PIGA 3WUBA 2J8GA 3NSNA 3QGVA 1MW3A 1E55A 3VOCA 3MANA 4E4PA 1Q6DA 3DHUA 2BHYA 3AHYA 2XUCA 3VIMA 2XVNA 2A3BA 9CGTA 1B1YA 2D23A 4FZPA 2WHKA 2CBVA 4PRWA 4K68A 4TVCA 4S3JA 3VD3A 1CLXA 2GK1A 1E1EA 4AYSA 5HDRA 3MSGA 2YKKA 5DT5A 3N15A 2CKRA 1DHKA 4OOUA 1K9EA 2VR4A 3K1DA 2D22A 2XFRA 1C90A 3K4AA 1MVYA 4DWSC 1NP0A 1DTUA 1EO5A 4F79A 2GJRA 1LJYA 2CEQA 2D0FA 3AXHA 3ALGA 4ATLA 4NRRA 1HJXA 3AMKA 3K8LA 3VVGA 2G41A 3RJXA 2NSXA 2QPUA 3ZT6A 1EDTA 1I75A 3M46A 3CIVA 3ZR6A 3FAWA 1E6SM 1BSIA 2OO2A 2UWFA 1CBGA 7CGTA 2Y2WA 2EPNA 2PWHA 3WL0A 1CGTA 1MFVA 1OCQA 1NARA 3T2QA 2VX4A 2WHJA 5BWFA 1VJZA 4UZSA 1DWJM 3T08A 1X1NA 1JDAA 3WNNA 4Z2IA 2ZX7A 1LL7A 3CZGA 1WB0A 3NSMA 3SURA 5ECUA 3AYSA 5E9AA 4MNJA 1W32A 1D2KA 4JHOA 3GXDA 2F2HA 3AIRA 3ECQA 2BXYA 4W7UA 3M7SA 3WBEA 2PF0A 1GONA 1Z32X 5A2BA 3WQ5A 3ARPA 2HISA 2V3EA 5D9NA 5CSUA 3THCA 1DWAM 3RILA 1B0IA 2V3DA 3L4ZA 4HMEA 4UFMA 3T0BA 1QHOA 2EBNA 2E9BA 2CBJA 4AD4A 2DT2A 2AAAA 2O9RA 3MO4A 1BVZA 3N18A 2XWDA 3THDA 5BXTA 4CU8A 4JCLA 3RIKA 1J18A 3VGFA 2PWEA 3L4WA 1Q6FA 4GQQA 5DF0A 3VNZA 1XSKA 4GKLA 1OIMA 2X8RA 1ISZA 1KWGA 1CZ1A 1I1XA 3VD7A 4D1IA 3ARUA 2DPEA 1WAWA 2J77A 2VC9A 4P7RA 1E6NA 1UH4A 2W5FA 1FFRA 2D2OA 1DEDA 3I3EA 5FD0A 5A8PA 4AZCB 5M5DA 4HU0A 4PUDA 3MUAA 2B31A 1NOUA 4AZ7A 2DH3A 1P6WA 1XH1A 1J0YA 3KE0A 4HOXA 2EPOA 3MUIA 3WNKA 4B3KA 3OG2A 1GJUA 2DQXA 3PZGA 3PZOA 1UKPA 5DT7A 1NWSA 3MSDA 3W0KA 3WH5A 2JALA 4WJXA 1EHAA 1M53A 4BZYA 1BQCA 1HX0A 3WDHA 1V0MA 2YDSA 5BROA 1W1YA 2VR5A 4GO9A 3SCPA 1GZJA 2DGAA 3K8MA 1G1YA 5A6AA 2NT1A 1TE1A 1KBBA 3MMWA 3GBEA 2VL4A 4MB3A 4QLJA 1V0LA 3CH9A 1OM0A 3WF4A 5E09A 2FH8A 3NCOA 1H1NA 2UY2A 1R87A 1UR1A 2F61A 2JF7A 1Q6EA 2XYLA 3PZTA 4W5UA 4J3XA 4JKMA 5JIPA 1K9TA 3CLWA 4U3CA 3VKKA 1VJSA 4Z2GA 4CCDA 2EPKX 1DWFM 1J9YA 1GQKA 2DT3A 4W87A 1D3CA 5CGTA 4U5KA 4DM1A 3MU7A 4HP5A 1W2PA 2A3CA 5BXSA 4JZ5A 3VX0A 2VVSA 5DO8A 2X09A 3FW6A 1W1VA 3IJ8A 2WVSA 3AIVA 3VIJA 2HVMA 3TA9A 1FHDA 1EDQA 3UCQA 1PZ2A 1C8QA 1WP6A 4TVDA 3EMCA 2W62A 4D6IA 3T0DA 4YHEA 4ZFMA 1VIWA 2VVNA 3VMPA 3WD1A 1XC6A 4HZ6A 3TTOA 4UFJA 4D6GA 3B9DA 1BYDA 3WY1A 5E6ZA 3CUHA 1UH2A 2EJ1A 3WSUA 3GXFA 1NP2A 1HNYA 1V6VA 1H11A 4EANA 1JDDA 2ZXAA 1UD2A 1V6UA 2O92A 1H3GA 2VX7A 4ACYA 3RM4A 2DSVA 2Q8XA 1E4MM 3EDFA 4UFIA 3WQWA 4NSBA 2WC7A 4ZEPA 3VGEA 1LL4A 2OYMA 1KB3A 1CGYA 1CGUA 1I1WA 4Y7EA 1JZ8A 4P7QA 4MB1A 2FGZA 3A4AA 4MPKA 4J7RA 3SCRA 2DSWA 1GHSA 2VZUA 4IISA 1PX8A 1XHGA 1BG4A 2OSYA 4JFVA 1W9PA 2WM0A 2WANA 4J27A 3AQUA 1UD8A 1XH2A 2BY3A 1DWHM 2DEPA 3WDJA 2YBUA 4KH2A 1OD0A 2GJXA 2XVKA 4CD6A 1U2YA 4LPCA 3L4UA 1CENA 3SUVA 1CXLA 2CXGA 4ZE5A 3SCQA 4KWUA 3ZMRA 1HIZA 1QNRA 4W86A 3A3HA 4D71A 4ML4A 1YHTA 4KRUA 1KGUA 2WW5A 3VMNA 4AC1X 3BSHA 3FHQA 3SCTA 1HVXA 2OWXA 1GORA 2VI0A 3MUZ1 1RPKA 3U7BA 2CHOA 4H41A 1AVAA 1M04A 1V3MA 3CHEA 4UFLA 2CCRA 4M56A 4P8WA 1LLOA 1UKQA 2EPLX 1KR0A 2J7EA 1MQQA 1QVBA 1ZL1A 3ZJ6A 1PEZA 5DEZA 1JAKA 3W29A 5E0CA 3JUGA 3VNYA 1XCXA 4AW7A 1B9ZA 1MXGA 3GXMA 2D3NA 4CN1A 2DH2A 2CYGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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