2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords E80-TELSAM domain
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
1L62A 3GUMA 1B4FA 197LA 1L73A 1C6IA 3HT6A 2QB0B 3DN3A 145LA 4ARPA 3HH5A 2RBOA 3PBLA 1QUGA 2DKZA 123LA 2LZMA 5J8YA 4I7NA 1COKA 1L20A 1L02A 1L56A 4PZNA 3HTBA 1QTHA 1L92A 4I7PA 3GUJA 157LA 1L37A 1LYHA 2Q9DA 3DN6A 1L28A 228LA 235LA 161LA 221LA 2A4TA 1CV6A 1QTZA 1L60A 144LA 1L32A 3G3VA 4LDOA 3SN6R 1LGWA 1OV7A 3DMVA 177LA 3HUQA 4I7JA 1KW5A 4MHVA 1LKYB 125LA 224LA 261LA 1D3NA 108LA 1L64A 3SBBC 229LA 1L23A 1QTVA 3HH3A 3C8QA 222LA 4EPIA 104LA 119LA 2F44A 1L08A 3NYAA 1XEPA 1L91A 257LA 176LA 3ODUA 4I7RA 1L38A 2F3NA 1L06A 118LA 128LA 1QTCA 4EJ4A 5JU5A 1L51A 3FA0A 3CDTA 4IS7A 1C63A 2B6WA 3HDFA 1L04A 1LWKA 2RBSA 1L47A 1I6SA 248LA 2RB1X 182LA 3C7YA 3VW7A 1L12A 1OV5A 1C69A 1SX7A 2KSOA 2OE7X 146LA 1QSBA 1T8FA 1P7SA 1C6AA 4YXAC 4ARMA 2DKXA 109LA 1T8AA 1C6JA 4W55A 4I7QA 2O7AA 1X40A 1L57A 186LA 1SGGA 114LA 2D3DA 233LA 2K60A 1CX6A 3V2WA 3C8RA 1SV0A 113LA 1T8GA 2KE7A 2B6XA 4EXMA 1L83A 4I7LA 1L39A 3QAKA 1C67A 1G1VA 240LA 3TACB 3JR6A 2E8PA 1LYJA 3OE8A 3L2XA 1P64A 2ESEA 3OE0A 1C66A 1L81A 149LA 2L78A 199LA 1L94A 1T97A 152LA 107LA 3DN0A 4EKSA 1RG6A 111LA 256LA 1V85A 4DJHA 3LZMA 155LA 1L70A 1OVJA 1C60A 1D3JA 1L05A 2B75A 3DN8A 1UCVA 3IDWA 181LA 1ZWNA 4EPFA 3TADC 212LA 3DNAA 3SEIA 191LA 1L26A 1L93A 3CDOA 1L86A 115LA 2RBPA 3GUNA 187LA 241LA 1CU5A 2JV3A 139LA 3KKAA 3BS5B 1DYDA 1L50A 4PJZA 3HU9A 231LA 4W58A 2B6ZA 1L40A 206LA 3RZEA 1OYUA 3SB6A 4ARQB 4EKRA 3DMZA 1D2WA 1XJUA 2QARA 1LYEA 2YTUA 2LC9A 4RQNA 1C65A 1L63A 4GBRB 4K5YA 5J8YC 1P2LA 1G06A 2OE9X 1C68A 1L55A 3HILA 3C8SA 2HUMA 167LA 3V2YA 4GRVA 1PK1A 3SBAA 127LA 5I14A 1UQVA 2F47A 137LA 195LA 151LA 173LA 162LA 1L77A 2E8MA 1G0PA 1C6BA 2Y9TA 1L41A 1L46A 5L1MA 1L22A 1L44A 1L17A 1LI3A 1QUHA 1G1WA 4IAPA 1L79A 3K1RB 1LI2A 165LA 2RBNA 1LYDA 245LA 1SV4A 4NL9A 3GUKA 3HT8A 1PQMA 1L59A 1NHBA 246LA 215LA 1L31A 3C80A 1F0MA 1LYIA 3C81A 1C6NA 1L42A 3HU8A 126LA 1L27A 217LA 4EKQA 3HT7A 1QUOA 163LA 2Z6BA 2RBRA 1P3NA 1SWYA 1SX2A 3DN2A 169LA 4W56A 4W54A 1CV4A 3HTGA 1CTWA 2RAZX 1LYFA 1K28A 1P6YA 190LA 253LA 1L65A 188LA 3OE9A 1D2YA 1KY0A 174LA 1D9WA 1WTHA 1D3FA 3CDRA 1CUQA 2OU9A 159LA 1L49A 2HULA 2LPEA 4EKPA 3HT9A 1L01A 1LLHA 2O4WA 4W51A 2ANXA 1JI7A 1PQOA 1DYAA 3SENA 178LA 2IGCA 1L96A 1L34A 226LA 2B70A 1P46A 2KMDA 1C6LA 1QS5A 4W53A 1V38A 183LA 1DYGA 2ANVA 3OE6A 3DN4A 1C6TA 1QTDA 1SV0C 1L61A 3C7WA 237LA 258LA 1L75A 1L85A 2ES6A 3HTFA 2LCBA 1DYCA 141LA 1L19A 2RB0X 4AQNA 142LA 3G3WA 3K2RA 1P2RA 1L68A 148LE 4E97A 1L72A 3F9LA 143LA 2HUKA 2O79A 4DKLA 1CV3A 5JRTA 1LGUA 254LA 1L84A 1PQKA 3G3XA 3BQ7A 2B72A 1P5CA 239LA 1PQDA 2QB0A 1G07A 1G0GA 223LA 3FADA 1QT7A 4YXCA 7LZMA 1WWVA 1L15A 1ZURA 1JTMA 2F2QA 1P37A 1DYEA 1QT8A 3HH4A 5JTIA 260LA 2OE4X 1DXSA 2KSOB 3GULA 1G0QA 1C6FA 3RUNA 1OWYA 1L67A 1OVKA 4PK0A 175LA 1L00A 4DAJA 1CU3A 3HH6A 172LA 1SSYA 252LA 103LA 227LA 2Q9EA 147LA 3GUOA 1KS3A 3KKAC 1SWZA 4OO9A 218LA 185LA 3BS7A 2DL0A 1DYFA 243LA 234LA 1ZYTA 1QT3A 220LA 3HUAA 1L29A 5F3XB 1LKYA 1L82A 1TLAA 1PQIA 1X66A 1CU0A 2QARC 3CDVA 192LA 1LPYA 158LA 2LMRA 1L88A 1C6CA 1P36A 2B6YA 140LA 1C64A 1CV5A 1C6EA 3SB8A 1L45A 1XJTA 110LA 131LA 2RH1A 3GUIA 4NJ8A 3F8VA 1CV0A 242LA 4LZMA 2D8CA 1L76A 3C82A 1L48A 259LA 2NTHA 1CUPA 1L18A 230LA 2E8OA 2OU0X 3DMXA 3NY8A 150LA 130LA 2OEAX 1L03A 4NL9C 2F8KA 255LA 122LA 236LA 1L07A 1EPYA 4S0WA 2B73A 2B6GA 2OU8A 1CU6A 3EMLA 1G0KA 4ARJA 170LA 3PDSA 2OTZX 120LA 1C6PA 1OXJA 3HTDA 198LA 1L80A 1B6IA 184LA 4I7SA 1L13A 3GUPA 2QARB 2EAOA 1PQJA 1QT5A 2FE9A 1L54A 138LA 3C83A 1KNIA 1JQUA 2QKQA 216LA 3SB7A 1B0XA 5KNIA 2RAYX 1CU2A 201LA 2KIVA 1L35A 1QS9A 2B74A 2GLEA 4I7TA 251LA 1PK1B 4I7MA 1CV1A 1DYBA 2L5YA 5LZMA 205LA 3D4SA 6LZMA 238LA 1OVHA 1C62A 1L74A 2E8NA 1L53A 247LA 3HDEA 3L64A 3HUKA 1C6DA 1L36A 209LA 171LA 1L33A 1QTBA 1C6KA 1SXDA 232LA 4RQMA 1WWUA 211LA 1L11A 1KW7A 4W52A 1QSQA 4LDEA 1OWZA 1L25A 1G0MA 2B7XA 160LA 1PK3A 3CDQA 166LA 2NTGA 1Z1VA 1L87A 3DKEX 3C7ZA 3BS5A 4LDLA 250LA 2K4PA 4ARLA 3NY9A 1JTNA 3DN1A 3UONA 4ZPUA 1L97A 2EAMA 3FI5A 4ARQA 1LYGA 1LI6A 2F32A 244LA 2EANA 1C6GA 4W59A 1CVKA 3H8MA 1QT6A 1QUDA 1P56A 1L10A 214LA 1L98A 2CUUA 1CX7A 1L0KA 180LA 1T6HA 4ARMB 249LA 1LGXA 1L99A 102LA 1C6HA 219LA 4I7OA 2RBQA 196LA 2RB2X 1KY1A 1QT4A 3SB9A 2KG5A 2OTYX 3HWLA 2QB1A 1KW4A 213LA 1L14A 1L24A 1L0JA 1D3MA 4I7KA 1L30A 164LA 1L89A 1SXEA 2EAPA 1G0JA 1G0LA 1L52A 1SSWA 200LA 4YX7C 1OW5A 1C61A 1L43A 4W57A 3TADA 1L71A 1C6QA 156LA 129LA 210LA 4PZOA 1L16A 1L95A 1LW9A 225LA 1LWGA 1L58A 1L09A 189LA 1L21A 2Y9UA 1C6MA 2B6TA 1L90A 168LA 262LA 1X9XA 112LA 3SB5A 1L69A 1L66A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZXIA 2M0NA 5KFQA 2MA1A 1HENA 1C6IA 4HV2A 2KN7A 1L3UA 4D9ZA 2YBMA 4ARPA 3PBLA 5AKKA 1NK9A 123LA 2ZTCA 2Q4TA 5HMLA 1BWHA 2EH9A 4K4IA 5J8YA 4J9MA 4F4KA 2EDUA 4I7NA 5J2KA 3RR8A 4LYBA 1L20A 1L02A 1COOA 1L56A 4PZNA 1SQ2L 3HTBA 4I7PA 4XN6A 4LGKA 9ICHA 235LA 2HBKA 161LA 5L3HA 3Q8MA 1CV6A 1J97A 2F2NA 1RYRA 1GFUA 2W9AA 1IP7A 2HHUA 4H9HA 4DQRA 4LT1A 5KXPA 1LCNA 1X6IA 4UB3A 1OV7A 1TEWA 1XEIA 177LA 1YAQA 4XJDA 5KT3A 1ZRMA 4B9MA 5HR6A 1KW5A 3G6VA 1VDSA 2I9GA 4CF4A 3UXOA 4QY9A 3PW5A 3ZDEA 1D3NA 2D91A 4EZ6A 3AL0B 3G6XA 1JSFA 1LHMA 5KFMA 1VDVA 1QTVA 3GFKB 4J9SA 104LA 3JPPA 5AI8A 2F44A 5AKJA 4CE6A 4WO6A 1ZQTA 5BPCA 4Q43A 5ALOA 1IO5A 3GXKA 3MDCA 4KLQA 4DQIA 1D8YA 3ODUA 4I7RA 4Y2VA 4DSIA 1QDRA 1L06A 4UB1A 5JU5A 1TKDA 3CDTA 1ZD3A 1JJ3A 3UQ0A 4NGIA 1C63A 2B6WA 2HU3A 5KXYA 1NMMA 4OOTA 3ZI4A 4KLMA 2H3IA 4RW1A 3Q8PB 9ICPA 4QZCA 1JPOA 3VW7A 4PL2A 1L12A 2YN4A 3SD7A 1SX7A 4OJ6A 3SAHA 2KSOA 1B7LA 9ICTA 2BQLA 146LA 4YR0A 3W6FA 5T3FA 1C6AA 4YN4A 2EKSC 3SAGA 7ICTA 1URJA 4R63A 3MR2A 4I7QA 5KFNA 3SV3A 3V7JA 3D2QA 3H40A 3RH6A 4DT3A 4NGJA 1SGGA 3M8SA 2F1IA 2D3DA 4HYKA 2W55A 3GV8B 3C28A 5KFLA 233LA 4IATA 1HEQA 4KPMA 3V2WA 1T8GA 3QE9Y 2AGQA 2JHDA 3P4ZA 2B6XA 4EXMA 1N60A 2F77X 1T7PA 4MF2A 1L39A 3QAKA 3ED5A 1G1VA 4HTNA 240LA 3TACB 1K5OA 1IP5A 5I53A 3A90A 3FC4A 1P64A 9ICFA 3BKHA 3C23A 4H8XA 1IWUA 1REMA 1DKKA 3GV5B 5F9UA 4M9LA 3PSTA 3H8SA 1AQ6A 4RUAA 4WLYA 1JUGA 4NLBA 111LA 1NKHA 256LA 1YQVY 2FBBA 4HJZA 3J81j 5T14A 1IWTA 3RZ4A 4H1PA 4B9TA 1C60A 3V6HA 8ICBA 3B0IA 2B75A 1GF4A 1LPIA 4P2HA 3P64A 1ZQGA 1L5UA 1H87A 1JJ0A 4XYYA 1L7OA 3QZ8A 3TADC 4TSCA 1N63A 4NWHA 3KD3A 4JMUA 3KZIU 1NI3A 3NRWA 4RPZA 191LA 1L93A 3DNAA 8ICNA 1L86A 1ZMYL 3OJSA 5AKYA 115LA 187LA 1CU5A 3LVVA 1C7YA 4KLJA 2ZYCA 3BS5B 4QZBA 2XTHA 1DYDA 4P0QA 4TURA 3IG5A 5KT6A 206LA 1IP1A 1OYUA 1XSFA 5APEA 1TCYA 1GFKA 4ARQB 1OUHA 2WF6A 4RQ4A 3K1ZA 4YEOA 1KKXA 2BQJA 1LSPA 1XS9D 1D2WA 2MEIA 1IXRA 1HC0A 2PMZF 2ZXIA 3BZCA 5KL8B 4F71A 2YTUA 9ICGA 5KXKA 3JPSA 2J6TA 4ED6A 3AM9A 4KLUA 193LA 2DQEY 2LC9A 1KLNA 3FI7A 4MR1A 4WLXA 5J8YC 1P2LA 1G06A 9ICEA 1VJ5A 1L55A 1MSWD 1AT5A 1BNOA 4UAYA 4QWCA 4K4GA 1MQ3A 3WPKA 2LHMA 2LKYA 195LA 1DI5A 5L3IA 4DOBA 3RJHA 1G0PA 5DLAA 2ZNXY 1L41A 4G9SA 1Z19A 4MFFA 4FZLA 3KZXA 133LA 4DWXA 1NZPA 1LI3A 1E8LA 4UB4A 1OUGA 3K1RB 1LI2A 165LA 1LYDA 3W3EA 2BPGA 245LA 2WF7A 1RXWA 2LBOA 3RF9A 5KFCA 4UAWA 4NL9A 4UBCA 2LM4A 4F5NA 5KFVA 4WM3A 3WXTA 5LVGA 2H9KA 1L8LA 3M3UA 1HERA 1L31A 1F0MA 1BPYA 2V4RA 4DL5A 1C6NA 1LHJA 1VDTA 5FCPA 1O03A 1ZV5L 1L27A 3QU5A 4EKQA 4IQVA 5L1JA 8ICUA 2DQNB 4DSKA 1GAYA 2KD1A 1P3NA 1SWYA 3ZVQA 2Z12A 4IR9A 5HMVA 1B5XA 1YZ6A 1CTWA 5DB8A 2FMSA 154LA 3PR4A 5B5EU 3OE9A 3ATOA 4NM2A 2BPFA 8ICGA 1RFPA 3V6JA 1D3FA 2YDGA 1L8OA 2KJ5A 1OUDA 3CDRA 3RB3A 3C1ZA 3LWMA 3VCBA 4KT3A 1UIAA 1FLUA 5J2EA 3ISBA 4DQSA 7ICGA 1UIFA 4XJGA 1GWDA 2BQFA 2HOFA 2O4WA 4ACOA 4OD0A 3C1YA 2W8LA 2ANXA 3AZ7A 4YEMA 1DYAA 5C6IA 5AK3A 4BJQA 2IGCA 4F5PA 3QU7A 7ICQA 3TARA 2N5ZA 2B70A 4WM6A 3OE6A 5C6JA 4UB6U 4HPEA 4EBCA 4F4YA 1L85A 3HTFA 4DWIA 141LA 1JJ1A 3K2RA 2Z38A 3T6UA 1P2RA 1GE1A 1NKCA 4NLNA 4E97A 2BHNA 4LYMA 1NJYA 1UIDA 1UBZA 2O79A 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 3RBD A;  3NVY A;  4NGK A;  184L A;  4I7S A;  3WUA A;  1L13 A;  3GUP A;  1PQJ A;  3C83 A;  138L A;  1OUQ A;  1JQU A;  1D9F A;  1FEZ A;  2QKQ A;  216L A;  3A96 A;  5HNC A;  1FN5 A;  1N62 A;  4ZEE A;  1N48 A;  4H9C A;  1YAM A;  5KAI U;  1L35 A;  5KT5 A;  2GLE A;  1RJC B;  2B74 A;  3NS1 A;  4O3M A;  5EOZ A;  4R6C A;  4GCF A;  1DYB A;  1GB2 A;  4H93 A;  3A95 A;  3AMZ A;  1KBU A;  2MSN A;  1OVH A;  5F9N A;  4RT3 A;  1NF5 A;  5KG2 A;  1WQQ A;  1HIW A;  3OPX A;  1S10 A;  247L A;  2DQI Y;  3HDE A;  2HUB A;  207L A;  4LYT A;  1KRP A;  4IJ4 A;  4NGO A;  4C3W A;  1LSC A;  1C6K A;  2HHW A;  1KDH A;  2OCE A;  4RQ6 A;  1LSM A;  232L A;  1NK5 A;  4WOA A;  1I56 A;  3Q8L A;  1BB3 A;  1KW7 A;  4QIW C;  1B7S A;  4I29 A;  1VFB C;  4W52 A;  4CRX A;  4IQU A;  5IIM A;  2IBK A;  4DSL A;  1LZ5 A;  4ELV A;  1OWZ A;  2YVB A;  1L25 A;  1S8O A;  5IDD A;  4Y2Q A;  4NHQ A;  3LVW A;  5D4B A;  5LVI A;  1IP6 A;  1L87 A;  4IAS A;  4P0P B;  3WKB A;  250L A;  3N7P D;  4LFX A;  3NY9 A;  2GO7 A;  4NHP A;  4NY5 A;  1JTN A;  1JTO L; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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