2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
molecule keywords E80-TELSAM domain
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
184LA 1D3MA 137LA 2Z6BA 1KY1A 2NTHA 4MHVA 1L92A 217LA 3KKAA 2RB1X 102LA 251LA 1L59A 3GUKA 2OU0X 1C61A 219LA 2Q9DA 3V2WA 139LA 2K4PA 1DYAA 2F47A 1CU3A 177LA 4I7JA 1LGXA 1L82A 2L5YA 3L64A 1OWYA 1G1WA 3SB8A 2QB0A 2B75A 1P46A 1L01A 2F8KA 1C6HA 2EANA 1C64A 3C82A 1SV4A 3SB6A 1UQVA 1LYIA 1SXDA 3K2RA 1C66A 169LA 2QARC 4LDEA 1WTHA 1G0MA 1C6PA 170LA 157LA 143LA 225LA 1C69A 2L78A 1CX7A 4RQNA 4S0WA 186LA 3CDQA 3HTDA 1L95A 1KY0A 1QT6A 245LA 3LZMA 230LA 4E97A 120LA 2F44A 1QS5A 1L76A 160LA 1B0XA 1C67A 1ZYTA 3HH5A 3HTGA 2RH1A 1L0KA 1L51A 1LGUA 249LA 2F3NA 156LA 1OVHA 1SSWA 1L15A 110LA 2OE9X 4ARQB 244LA 4W51A 1QUGA 3C7WA 3HH6A 1JTNA 1KW7A 3HT7A 3OE0A 1CU5A 176LA 1L23A 3OE9A 4GRVA 1OV5A 4PK0A 1L77A 1QUOA 4LZMA 115LA 1LLHA 1L36A 1SSYA 125LA 1CUPA 1CUQA 1KW5A 222LA 1L63A 1OVJA 1L87A 1L41A 1KS3A 3SB9A 205LA 4RQMA 1L99A 4W53A 4I7RA 206LA 1L65A 1L61A 1SWYA 1X40A 247LA 130LA 3H8MA 240LA 216LA 2F2QA 4W56A 209LA 1CU0A 231LA 3NYAA 1G07A 2K60A 1P37A 163LA 4NL9A 162LA 1D3NA 2F32A 2OE4X 1C6GA 1C6BA 2KSOB 1P3NA 1QSQA 1L70A 111LA 3CDRA 2E8NA 2OU9A 1L52A 1COKA 187LA 1L79A 3HUKA 2RAYX 1PK3A 3PBLA 1L26A 3HILA 167LA 223LA 4PJZA 158LA 1XEPA 224LA 3DN6A 3CDOA 1C6DA 1TLAA 1P5CA 1LYGA 5F3XB 2EAMA 131LA 1C6TA 159LA 1L94A 1C6NA 3C8RA 1QTZA 1C6EA 1L18A 5LZMA 1L72A 2Y9UA 1D2YA 1QT4A 3RUNA 2IGCA 140LA 2QB1A 2QB0B 4PZNA 181LA 1L02A 1Z1VA 1L60A 1QT7A 1L75A 1L85A 253LA 3GUNA 1L19A 1DYCA 1XJTA 4ARMA 2E8MA 3FA0A 1L40A 4I7TA 3HWLA 3OE8A 1SXEA 243LA 191LA 1QT3A 3D4SA 1G1VA 3DN8A 2B6WA 2DKZA 190LA 1L84A 1L90A 1G06A 1L00A 165LA 3SN6R 4W55A 4EKRA 2EAPA 1L50A 1L20A 4W58A 3TACB 1QTBA 1L21A 161LA 2OEAX 3KKAC 1D3FA 1QTDA 260LA 1F0MA 1CV4A 3DKEX 2B6ZA 4I7KA 1T97A 3V2YA 1L64A 145LA 1LYFA 128LA 1L69A 1C6AA 144LA 1L22A 1V38A 1G0KA 2LC9A 3FADA 1L14A 182LA 250LA 3HU9A 218LA 138LA 3ODUA 4ZPUA 1OVKA 3G3WA 2RBPA 173LA 1L08A 3C7YA 155LA 1RG6A 2OE7X 1L39A 1L43A 1L28A 227LA 1L80A 3C7ZA 3IDWA 1C62A 4GBRB 2FE9A 1L06A 201LA 3F8VA 4YXAC 1L25A 3L2XA 4EJ4A 3RZEA 3C8QA 4ARJA 3HUQA 3G3VA 4EKPA 2RB2X 1L93A 1SGGA 3GUIA 1L05A 2RBNA 5JU5A 2LMRA 1L37A 1L74A 1LWGA 1L54A 1I6SA 2OU8A 238LA 246LA 1L10A 1LW9A 242LA 1L03A 212LA 2RAZX 1L46A 2HUKA 123LA 3GUOA 142LA 4I7PA 2B6GA 2O7AA 164LA 2B74A 1QSBA 2O4WA 107LA 1LKYA 2OTZX 1DYBA 2B70A 226LA 2B6XA 113LA 1C6CA 1D2WA 1L38A 3EMLA 3PDSA 262LA 166LA 1L11A 1P7SA 236LA 2RBSA 5KNIA 3VW7A 3C83A 1DYFA 1CV1A 1LYDA 4NL9C 4AQNA 3DNAA 1L30A 211LA 3HTFA 4I7OA 3DMZA 4ARMB 1L29A 1PQIA 4LDLA 4EXMA 1V85A 1CX6A 2LZMA 3HDEA 1LYHA 1OWZA 2B73A 1OW5A 175LA 196LA 1QS9A 3SEIA 147LA 1L04A 248LA 112LA 3SB7A 1OXJA 1L73A 2ANXA 2KG5A 1P56A 141LA 146LA 1L83A 4ARLA 256LA 1PK1A 4I7QA 1OYUA 2B7XA 5J8YA 119LA 1L32A 108LA 1L88A 4K5YA 2E8OA 1LPYA 3C80A 3TADA 2QKQA 3DN4A 103LA 1CV6A 3GUMA 3QAKA 1CVKA 1L42A 2RB0X 2OTYX 1G0QA 2B6YA 2RBRA 1L45A 210LA 1QUHA 168LA 1CU2A 1PQDA 1G0GA 1SV0A 229LA 4ARPA 1SWZA 3G3XA 214LA 2ESEA 215LA 4I7SA 2RBQA 4YXCA 1C6IA 4W59A 109LA 1L62A 5I14A 1L67A 6LZMA 2E8PA 3GUJA 5JTIA 1ZWNA 1LI6A 3CDTA 2HUMA 3NY9A 1G0JA 1L24A 4I7LA 1LI3A 1T8GA 1T8AA 1C63A 1X66A 1L49A 1D9WA 1B4FA 2DL0A 1C6KA 1SX2A 3HH3A 4I7NA 150LA 1L89A 1LWKA 221LA 1C6JA 252LA 3SBAA 1G0PA 1L13A 7LZMA 3F9LA 2DKXA 3BS5A 4ARQA 2QARA 4IS7A 171LA 2JV3A 1L09A 1OV7A 4OO9A 2B6TA 1LKYB 2KE7A 3HT9A 1L86A 3UONA 1DYEA 2Y9TA 4IAPA 1CTWA 1D3JA 1P2RA 4EPFA 1CV5A 2ANVA 200LA 5L1MA 3CDVA 3HT6A 3BQ7A 197LA 1WWUA 1L96A 126LA 1QUDA 255LA 2YTUA 241LA 2LPEA 1L98A 2RBOA 189LA 254LA 233LA 118LA 180LA 2LCBA 2KIVA 4W54A 172LA 1QTVA 4YX7C 1KNIA 4W57A 122LA 1DYDA 3OE6A 174LA 1QT5A 1L44A 1L0JA 3DN2A 1L55A 228LA 1UCVA 3HT8A 4DJHA 1JTMA 1P2LA 104LA 3SENA 2Q9EA 1C65A 1JQUA 235LA 1PQKA 1K28A 151LA 2ES6A 4I7MA 1PK1B 1L53A 3HUAA 4EKQA 188LA 259LA 3SB5A 1L71A 3JR6A 1T8FA 1B6IA 1PQMA 1L58A 213LA 1C68A 232LA 2GLEA 1L17A 1JI7A 1L27A 3C8SA 1G0LA 1LI2A 129LA 258LA 1QT8A 4PZOA 2CUUA 199LA 2EAOA 149LA 1L97A 1CV0A 1EPYA 1L66A 220LA 4EPIA 2B72A 1L12A 5JRTA 192LA 1P64A 1CV3A 257LA 1LYJA 3GUPA 4NJ8A 1CU6A 3NY8A 1T6HA 4LDOA 1ZURA 1DXSA 1L35A 1L47A 261LA 1L56A 3DMXA 1L91A 1P36A 4EKSA 1XJUA 2NTGA 1L33A 1C6MA 1L07A 1LGWA 2HULA 3C81A 1PQJA 3DMVA 239LA 4W52A 1X9XA 4DKLA 195LA 5J8YC 1L34A 114LA 3DN1A 237LA 2O79A 3SBBC 1L16A 1C6QA 3BS7A 3K1RB 148LE 1LYEA 1DYGA 127LA 3TADC 185LA 1KW4A 1SX7A 234LA 3HH4A 3BS5B 3HU8A 1C6FA 3GULA 178LA 1QTHA 2KSOA 2QARB 1P6YA 2D8CA 1QTCA 3DN0A 1NHBA 3HTBA 1WWVA 3FI5A 183LA 2KMDA 1L57A 198LA 4DAJA 1L68A 2A4TA 152LA 1C60A 2D3DA 3HDFA 1PQOA 1C6LA 1L48A 1L81A 1SV0C 3DN3A 1L31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KD1A 5AK4A 1LZRA 2PMZF 4B9TA 4MHVA 1ZQNA 194LA 217LA 4YG2A 3I1YA 2WB1C 1B5WA 5D49A 3ZD8A 4ED7A 4NM2A 4ED0A 2HU1A 1LPIA 1WCNA 1ZETA 4I7JA 1XEIA 2L5YA 4JV1A 1OWYA 4E3UA 1G1WA 3SB8A 4ANRA 4DDAA 4G49A 3G3AB 3Q8QB 2QB0A 3V6JA 6LYTA 1L01A 5F9UA 4DD0A 4Z41A 3KAMA 2EQYA 2YQEA 3C82A 1LYIA 4PHEA 2NO5A 3K2RA 2XIDA 2BQRA 5DDYA 1C66A 4LDEA 4DFKA 4J9SA 1XC9A 1B7MA 5J0QA 1G0MA 1WTHA 3MDCA 4KTQA 3L4PA 1S76D 4BWJA 4EBCA 157LA 1L7NA 2A7FA 2LI6A 2L78A 4FFDA 5AKGA 1L3SA 186LA 2LYOA 3HTDA 1L95A 1KY0A 2J6UA 4QZAA 5KFIA 2Z12A 120LA 1IWVA 3UMBA 4PHPA 2ISOA 8ICGA 3HTGA 3G3BB 4XJHA 5T14A 3PSPA 3RJEA 2RH1A 1L0KA 3GXKA 249LA 3RJHA 4DO9A 1D0KA 4J9KA 5F14A 2EKSC 1L15A 1SZPA 4J9RA 244LA 4IJ4A 1ZYQA 5CJ7A 1CKFA 4I8SA 2GH1A 5HNKA 3OE9A 1OV5A 4O3RA 2H3FA 1QUOA 2HU3A 4LZMA 2XY5A 3PW0A 1GB9A 2WF9A 3PZPA 3SAHA 5EBHA 1YKXX 4YOPA 3HKZC 1TDYA 1S9FA 1KW5A 1L63A 2DKVA 4JB3A 1L87A 4LYTA 1CNSA 1L41A 1BB7A 3SB9A 4CFPA 4GCCA 4EMNA 8ICKA 4Z6DA 4W53A 2KK0A 1L61A 1T3PA 1X40A 3SAGA 5KFQA 4YD2A 2Y1JA 1JISA 1PZNA 1GBOA 1N2XA 3ZDAA 240LA 216LA 3H4BA 9ICUA 1H38A 1HIWA 1KN5A 2ZIXB 5J2DA 132LA 1WG8A 5EE0A 2K60A 1ZQDA 2AGPA 1G07A 1P37A 2E1EA 3T5HA 1TKDA 4MFCA 1WYGA 4G3IA 3FE0A 5ALDA 1ZQVA 1SWWA 5APEA 1C6BA 4F5RA 4HSFA 2VKQA 1IP5A 1P3NA 111LA 2E8NA 3A6BY 187LA 167LA 4UB1A 4PJZA 5F9LA 1Z00A 2LZ2A 2YBJA 1X42A 2OM6A 4TTDA 158LA 3RH6A 1LZYA 4LYMA 2W3SA 1RDFA 2WF7A 4ECXA 3CDOA 1MLCE 1X9WA 1P5CA 1BVKC 2J6SA 1TLAA 3IJVA 5KL1B 8ICNA 1GD6A 2RSCA 3WU8A 3ETLA 1LJIA 1LSYA 4UB4A 3C8RA 3M8SA 1L7PA 1BWIA 1L18A 2K8AA 4MFAA 2Y9UA 4NG8A 1UA6Y 3ZVQA 2IGCA 4P2HA 3BQ2A 3MABA 2I26L 4XQ8A 1L60A 4B4IA 2ZIUB 2OYYA 4Y2VA 5B5EU 1ZOLA 3A0BU 3TANA 9ICMA 1QSLA 4ECTA 4EX7A 4KLSA 3EO5A 2DF4B 4XJDA 4RQ6A 1YILA 1YQVY 1QCKA 2CXYA 1QT3A 2EDUA 4ZEEA 1OUEA 1W6ZA 2B6WA 3PR5B 190LA 4ICAA 3AGIA 1L90A 4CGEA 2LHMA 1KXYA 1GWDA 3SN6R 4W55A 4I2CA 1IOTA 4W58A 1BVXA 1SLYA 161LA 5ALEA 2OEAX 8ICZA 1D3FA 5KFBA 2R8HA 4UATA 1BVSA 2KHVA 2BCSA 5ALWA 1KXXA 2B6ZA 4HJZA 1ZD5A 4RT2A 1L64A 3SZ2A 4CHXA 1RXWA 2Z2FA 8ICCA 145LA 2MECA 3WU7A 3JPPA 3EYZA 2ZJAA 2FLNA 1BWHA 1LYFA 4HP0A 1DOQA 1JITA 2HBKA 5ALTA 2UVUA 144LA 5CB1A 1GDWA 3E2EA 5HNLA 1B22A 1G0KA 2LC9A 2ZXHA 2JGAA 1Z4OA 5KG4A 5KT2A 182LA 4MEYA 1IOCA 1JTTL 138LA 2MEDA 1ALCA 1T7PA 1T8EA 1QQ5A 5L9XA 2RBPA 4KMOB 1L08A 5LYTA 4IL6U 1L5UA 4FZNA 3A93A 4TWSA 1L43A 1N60A 4PRUA 4P0QB 1L80A 1TK0A 1KQQA 227LA 4YR3A 5HMVA 1IR8A 1ZQSA 2BZFA 4QNLA 5AM2A 4F4XA 4NLNA 2HHTA 201LA 3RTVA 1N62A 1B5UA 4W94A 3C8QA 4NGWA 2DQEY 1MQ3A 2XTHA 1NWGA 2PI5A 3Q8MA 2F76X 4OOTA 2LYAA 5AI8A 2C2RA 1L05A 4PGQA 1NZPA 5JU5A 3OGUA 4H8XA 8ICIA 4DSEA 2HBJA 1UBZA 2M9NA 4UBBA 2EZZA 3N7RC 1ZQWA 2OU8A 3H8JA 3TKAA 1JX4A 246LA 1LW9A 4YEOA 2ZTEA 3PSIA 1L03A 1LHMA 1Z55A 2B6GA 1XGQC 4DOBA 2H3IA 2B74A 2O4WA 5J2GA 107LA 3WK4A 1GFAA 5DBAA 4EYIB 1BNOA 2W1LA 3GDXA 3KD3A 2WFAA 1C6CA 3CRXA 2FLPA 4XJIA 4ECWA 4B6JA 2PXIA 1ZQLA 1L38A 5EWGA 4O5EA 2YMQA 4HV2A 236LA 2BQHA 3LVVA 1IP7A 1TCYA 1JKAA 3VW7A 1LMAA 1QQYA 3C83A 5APDA 4AXTA 2YMLA 4F71A 8ICPA 1NMMA 3P64A 2RQ5A 4QIWF 4IASA 211LA 4MSTA 1Z1BA 1LJKA 4NGJA 5J0XA 1JJ3A 1GO3F 3DMZA 5KXZA 4EXMA 1RPLA 5CEHA 1RE2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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