2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords E80-TELSAM domain
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
1L51A 1L59A 2D3DA 2O7AA 3EMLA 1L14A 3NY9A 1C6NA 1L95A 128LA 180LA 114LA 1NHBA 4I7KA 4EKQA 205LA 1L09A 1QTZA 190LA 1QTBA 1WWVA 1B0XA 249LA 2E8NA 1CU6A 3C8SA 5I14A 259LA 238LA 1G1WA 1JI7A 1L42A 1L0KA 4MHVA 1L65A 1L07A 1LYHA 3FADA 1QT6A 2OU9A 3HT8A 1DYGA 3C80A 1P36A 102LA 2EANA 254LA 262LA 3C7WA 130LA 3H8MA 3HH6A 4DAJA 219LA 1L50A 3D4SA 122LA 1L49A 211LA 225LA 2OE9X 2B6XA 1OXJA 1L91A 236LA 1PK1A 1LYFA 185LA 4ARPA 4W54A 1C63A 1P3NA 1C64A 1C6LA 3HH3A 125LA 1P56A 3HTGA 1LWKA 1L89A 184LA 1PQDA 5LZMA 3CDVA 1SWYA 3DMXA 1SXEA 1D2YA 1L20A 1L27A 1L94A 1C6BA 1L25A 2F32A 1LWGA 1G0LA 1L31A 1SX2A 1DXSA 2B72A 4W51A 256LA 2Y9TA 3GULA 1L80A 2NTHA 4EJ4A 4RQMA 177LA 3GUOA 1L66A 1P64A 3DNAA 1L29A 3HT7A 1L75A 3DN4A 3CDQA 3C82A 1C6MA 1C62A 4EKPA 248LA 1X40A 4I7OA 1L47A 4LZMA 3SB9A 1SV0A 1KW5A 1PQKA 1SSWA 104LA 222LA 155LA 218LA 4I7RA 217LA 149LA 1L48A 1K28A 1C6GA 1C6KA 1OWYA 3HH4A 4EXMA 1LGWA 212LA 2EAOA 1T8FA 1B6IA 1C60A 2E8PA 1L04A 1L54A 2QARC 1L58A 3VW7A 3K2RA 1C6JA 243LA 4S0WA 1L68A 1CU3A 2HUMA 1P7SA 2RH1A 233LA 1ZWNA 3QAKA 1G07A 206LA 3HTDA 171LA 5J8YA 1L39A 164LA 2D8CA 5JRTA 1XJUA 2RBRA 161LA 1LYIA 1KNIA 2L78A 2RBNA 4I7PA 3F9LA 3DKEX 148LE 182LA 1LKYB 1OV5A 1PQMA 3HTFA 2B6GA 3KKAA 156LA 3HU9A 1X9XA 3V2YA 1PQOA 3SEIA 2QB0A 2F44A 1LGUA 4ARQA 1LLHA 2B7XA 227LA 3RUNA 145LA 1KS3A 3TADC 3C7ZA 1CU0A 2OTZX 1C65A 144LA 2Q9DA 1C6AA 4W53A 1KY1A 214LA 3GUPA 1CUQA 2DL0A 1L41A 2F47A 2K60A 1LPYA 3CDRA 3DN8A 3G3VA 139LA 1CUPA 255LA 1L86A 2EAPA 234LA 2HUKA 2RB1X 3DN2A 157LA 1C6IA 3RZEA 4EKRA 6LZMA 1G0PA 1P37A 3FI5A 210LA 1XJTA 1PQIA 261LA 1V38A 224LA 1B4FA 1TLAA 1QT8A 2KIVA 152LA 166LA 2RB2X 1CTWA 3HT6A 4ARJA 245LA 1L85A 1C68A 3PBLA 162LA 1PK1B 191LA 1G0KA 3BS5B 1L06A 1L10A 2Y9UA 1SV4A 172LA 1C6PA 1L97A 3GUNA 1L81A 4W52A 4I7LA 3OE6A 3BS5A 1L34A 223LA 2RAZX 1EPYA 1L26A 147LA 146LA 4I7MA 4ARMA 1QUDA 3SN6R 3DMZA 4W55A 209LA 1L63A 140LA 4I7QA 1L55A 1L21A 4ZPUA 2B73A 111LA 143LA 3HDFA 3SB5A 1L79A 1L05A 4IAPA 244LA 4PK0A 167LA 2RBQA 1P46A 4W57A 131LA 242LA 2OE7X 4DJHA 4W58A 4YXCA 195LA 4YX7C 127LA 1D2WA 232LA 1CV6A 257LA 1D3JA 253LA 1L18A 2RBSA 2A4TA 183LA 3GUMA 3SB6A 2B75A 1G0MA 198LA 1CV3A 4AQNA 1L08A 3GUIA 176LA 1L36A 1L13A 1CU5A 163LA 1L73A 1L71A 1QT4A 4W56A 1KW4A 4GRVA 1L32A 1L64A 4PJZA 2EAMA 246LA 109LA 1L40A 2Q9EA 3BS7A 1LYDA 118LA 1L77A 3HUAA 1PQJA 1SX7A 4LDOA 175LA 1QT7A 1QUGA 1DYFA 3C8RA 4YXAC 168LA 4I7NA 1LI3A 2B6WA 201LA 4NL9C 1C69A 1L69A 199LA 1L23A 1L72A 3V2WA 3DN1A 189LA 1SSYA 3ODUA 1T6HA 1L61A 4K5YA 108LA 141LA 1LGXA 2B70A 4OO9A 1L93A 1X66A 188LA 1LI6A 4I7SA 1L12A 240LA 1L52A 1P6YA 3UONA 2QB0B 1C6QA 4ARQB 3TACB 220LA 1C61A 4LDEA 2Z6BA 2KSOB 3NY8A 3HILA 4EPFA 120LA 1L44A 252LA 1L96A 260LA 2QARA 4I7TA 1SGGA 1I6SA 1L87A 2KSOA 1G1VA 1OV7A 1L99A 2RBOA 1WWUA 1C6CA 1JTNA 1F0MA 4PZOA 3C81A 1L84A 1OW5A 1OWZA 1C6TA 1L70A 5KNIA 5JU5A 1QTCA 1C6DA 3BQ7A 1C6EA 2LCBA 3NYAA 1L28A 3HUQA 1G0GA 1L45A 237LA 3DMVA 1L88A 230LA 1T8AA 1L33A 1DYBA 1QT3A 2KG5A 2F3NA 2B74A 2QB1A 1CX6A 2HULA 103LA 1L98A 3DN0A 1G0QA 251LA 2ES6A 2LMRA 3TADA 150LA 1D3MA 2E8MA 1L46A 1L0JA 126LA 3SB8A 107LA 3L64A 239LA 1L02A 2YTUA 1L83A 1OYUA 1CV1A 1CV4A 1LW9A 2B6TA 1LYEA 1UCVA 1QSBA 178LA 2E8OA 3C7YA 1L38A 2DKXA 1C6FA 1QSQA 2OU0X 1LI2A 4ARMB 221LA 250LA 4RQNA 5L1MA 2OE4X 2QKQA 3DN6A 3HH5A 4EKSA 3IDWA 226LA 2O4WA 3SENA 2KE7A 228LA 192LA 1L22A 1L19A 2O79A 1OVKA 197LA 3K1RB 1L24A 3HT9A 1WTHA 1KY0A 2FE9A 1QTVA 258LA 1P5CA 170LA 1L90A 4I7JA 2IGCA 2LPEA 1KW7A 2OU8A 3HWLA 1L01A 1UQVA 115LA 1QS9A 119LA 165LA 142LA 3OE8A 1OVJA 1QTHA 1ZYTA 4ARLA 4DKLA 1RG6A 215LA 1QS5A 2OEAX 2L5YA 1DYCA 1L57A 235LA 1LYJA 1G0JA 3SBBC 2NTGA 1SV0C 2K4PA 1L43A 1C66A 1JQUA 3SB7A 2GLEA 1OVHA 247LA 2OTYX 186LA 110LA 112LA 1QTDA 1L35A 3HDEA 3HTBA 160LA 4W59A 3GUJA 2B6ZA 3F8VA 196LA 3L2XA 229LA 1QUHA 138LA 3C83A 169LA 181LA 200LA 1ZURA 1CVKA 213LA 1PK3A 1L53A 1QT5A 2ANVA 4NJ8A 2ESEA 1JTMA 1L92A 1D3FA 1CU2A 2KMDA 1L82A 231LA 2RB0X 3GUKA 5F3XB 5J8YC 3HU8A 1D3NA 1T97A 1SXDA 1L17A 1L11A 1L37A 4PZNA 3PDSA 4E97A 7LZMA 3CDOA 1P2LA 1D9WA 1LYGA 2JV3A 1G06A 2LC9A 1L67A 1P2RA 2QARB 3KKAC 2F2QA 1L76A 3G3XA 3DN3A 129LA 1Z1VA 1L62A 3OE0A 3HUKA 1T8GA 3LZMA 3CDTA 1CV5A 1L56A 1CV0A 4GBRB 123LA 187LA 1L16A 4NL9A 1L15A 3FA0A 3OE9A 1L60A 2F8KA 3SBAA 158LA 2RBPA 241LA 3C8QA 159LA 2CUUA 1L00A 2B6YA 5JTIA 1SWZA 151LA 1L74A 1QUOA 1XEPA 2LZMA 1V85A 2DKZA 1DYAA 174LA 113LA 1C67A 216LA 137LA 1CX7A 1L30A 1L03A 4EPIA 3G3WA 2RAYX 1COKA 1DYEA 3JR6A 4IS7A 1DYDA 173LA 1LKYA 2ANXA 4LDLA 1C6HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L51A 1L59A 5GTHU 2D3DA 8ICWA 2R18A 4FFDA 2HOIA 3NY9A 3VCBA 4M2YA 4LVSA 3C28A 4WM5A 3NVYA 4DL6A 4Y2XA 3WKAA 1EQEA 1GBXA 205LA 1BVKC 1LVHA 3TXJA 3N9AA 4B9NA 3V7KA 1B5YA 2XI9A 4ED3A 4RQ1A 249LA 2DKVA 2G09A 1DI4A 2BQCA 1F44A 3WXTA 2I1QA 238LA 3RH4A 1LMTA 3QX7A 4ECYA 2ALZA 5EBHA 2AQ0A 1V7TA 4USAA 2MEEA 4MHVA 1T3QA 4OJ6A 1JROA 1L07A 1L65A 2KP7A 5IIMA 2OU9A 5CHGA 1DYGA 3WU7A 1D0LA 3B0OA 4DL7A 4WG1A 3MABA 1P36A 4NSIA 102LA 4NXZA 4WO9A 262LA 5F9LA 7ICGA 2O6KA 4RPYA 3RH6A 1LZAA 3LYZA 1N60A 5ALVA 4YD2A 1LHHA 1M6YA 2G07A 4H9BA 1L91A 2W9BA 1GDXA 4FDYA 4ARPA 1L7NA 3NVWA 5ALNA 3HFMY 2WF9A 1LSEA 2DQCY 5KL1B 1DXJA 2W9MA 9ICXA 2W11A 1G7IC 125LA 1LWKA 1L89A 2FMSA 3QU9A 3D9AC 4TWSA 1RYRA 1L20A 1L94A 2Z2FA 4IRKA 3OGUA 2HBKA 1YAOA 2MECA 5I4WA 2F32A 4EBCA 4J9KA 4ECWA 1HMKA 4M47A 2RLTA 1IY4A 4UWVA 3AW6A 2ASDA 3C23A 1GFAA 1DXSA 3ZVQA 3HWTA 1NMMA 4RDSA 3HBEX 2WFAA 3P4ZA 4DF8A 1BPBA 2ODGA 4H9FA 3PX6A 4RQMA 1ZQMA 3ETRA 177LA 4I27A 1DZBX 3AUOA 4BXOB 5D49A 2G06A 1FO4A 1E8LA 1L29A 2FYCA 4OOOA 4Y2SA 3CDQA 4LZDA 3C82A 4FZMA 8ICTA 1X40A 1XS9D 2PFNA 1GE3A 4JWNA 4LZMA 1GFJA 1SWWA 149LA 1WCNA 4XADA 3K75D 5J0XA 5KL8B 4NSGA 1D8YA 1GFUA 2FYDA 1OWYA 3F2BA 2ZUCA 4MCKA 1JN3A 3RBEA 4PRUA 4YD1A 2H5XA 4MFFA 5KFUA 4F93B 5L3HA 4OWBA 5TZVA 1ZQLA 1HNLA 4M9NA 3T5LA 4UQGA 4I2FA 3KHRA 4H90A 4S0WA 3GIIA 1CU3A 2GO7A 4J9RA 1GDWA 7ICOA 1P7SA 2DUYA 4IQVA 2Z12A 2KVCA 2G4NA 134LA 7ICUA 4C8KA 3RNXA 1S76D 1GE1A 4IC9A 2FLLA 1UICA 206LA 2K4IA 4KX5A 2HUBA 3OSNA 4I2AA 1QSWA 5J8YA 1L39A 1C45A 1WTNA 1ZQHA 1QQ5A 1NKHA 2W1YA 9ICQA 1G7JC 1IP5A 2L78A 2RBNA 1LMOA 3F9LA 1FEZA 2RDJA 4LYBA 3QUBA 4F3OA 3KHGA 4TTDA 3KKAA 1PQOA 2Z2EA 2JZBA 1SKRA 5CRXA 4NHPA 1B0DA 2LYOA 2BAAA 4B1AA 1YIKA 4G4HA 4GFJA 2K8CB 4G4CA 1B5ZA 3B0KA 145LA 5KFXA 4J0LA 2PFQA 1B5WA 2V4QA 4DOBA 4H92A 3V6KA 9ICOA 1ZMYL 2Q9DA 1KY1A 214LA 3EMSA 2XQOA 3QU7A 4J9PA 4U6PA 1N4FA 3P65A 1JALA 5DLAA 3WH1A 2F47A 2C2DA 2XCAA 1URJA 5L1IA 5KXXA 5KXNA 1ZOLA 2HUKA 4UWUA 2RB1X 1GFRA 3DN2A 1C6IA 3FC4A 3TXKA 4QIWC 1TFRA 5KFKA 2JH7A 2C2RA 1XJTA 9ICPA 1U49A 1PQIA 2F2NA 5HHHA 1D8LA 3OHBA 3W3EA 4US8A 1QT8A 2RB2X 1XGUC 1CTWA 2C28A 5KT5A 1LMCA 4UB3A 1QDTA 4ARJA 5A3ZA 3H0MB 3ISCA 4ICAA 1C68A 4I2HA 3PBLA 3SI8A 2W9BB 1ZQIA 5AI8A 1DPXA 4TX7A 3BS5B 5DGBA 1L10A 1S5LU 1SV4A 5DBCA 2KKPA 1BB4A 1L97A 1ZD4A 1GE0A 3HBHA 1AROP 1ZQNA 4NLGA 3RH5A 5KG5A 1S9FA 1ZQAA 4NLZA 3QEBZ 1HELA 2W1XA 2ZJ8A 2AHOB 2G08A 1IX0A 1L34A 3LYOA 2K4HA 4Y2UA 1JTTL 4I8SA 1L26A 1VDPA 147LA 3T5KA 1B9OA 3MFHA 3ZVQB 8ICMA 4DDBA 2H9KA 3WK4A 3BJYA 4PHAA 3RBDA 5E4PA 4XRHA 1C43A 4ETDA 143LA 3SB5A 4JV0A 1VDQA 244LA 2WB1C 4GCEA 8ICRA 5KFYA 4PK0A 2LYAA 4Z46A 1P46A 4W57A 131LA 1I20A 2OE7X 1IVMA 4YXCA 2XY5A 195LA 4RU9A 3QXGA 1NKEA 3RW8A 4DD2A 1D2WA 2AH5A 1HEWA 1ZQBA 4LZGA 8ICJA 1REXA 4W96A 4RQ4A 1GO3F 4KMOB 3E58A 4ECSA 3ZDBA 4GCBA 5B07A 4CF3A 1G0MA 4AQNA 2H5ZA 2W03A 1UT8A 1L36A 1TV9A 2ZNWY 3QUTA 1L13A 4RPZA 1ZQKA 5G5GA 1CU5A 1L71A 1QT4A 1GF0A 2I9GA 4QWDA 5AKJA 2DQJY 3AZ6A 4UBBA 2P35A 2IMWP 1VDSA 1NK7A 1AT6A 4DQJA 4QIWF 3PR5B 4GCFA 4YF2A 4YR0A 4UB1A 2LYBA 168LA 3WK6A 3H8WA 5KFQA 3F2CA 5APFA 4PH5A 2BQNA 1N62A 2LHTA 4NL9C 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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