2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords E80-TELSAM domain
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
143LA 3C82A 1G0KA 2B70A 4EPFA 4LZMA 1OV5A 248LA 3F8VA 1C6NA 1D9WA 3DN2A 1F0MA 4DKLA 1L82A 235LA 3C83A 1L10A 2RBQA 4LDOA 1L65A 4YXCA 1X66A 3BQ7A 1C66A 1L30A 1P7SA 3HH4A 1KW4A 1DYCA 2QARA 4RQNA 1L92A 1D3NA 1C6HA 1CX7A 111LA 1G0GA 1L88A 243LA 3UONA 176LA 2JV3A 159LA 2O4WA 199LA 3SBAA 1G1WA 1L14A 3C8QA 1C6IA 1P56A 1PQMA 1QT3A 3C81A 3GUPA 1C6EA 1L37A 184LA 1QT7A 2GLEA 118LA 4I7QA 1L04A 3HDFA 254LA 4PZOA 130LA 246LA 3KKAC 1L32A 1KS3A 1C6LA 1LLHA 1QSBA 168LA 157LA 1JI7A 3FA0A 1LYJA 1WWVA 196LA 1ZYTA 2B6TA 1LI3A 2RBSA 1L23A 3PBLA 1L60A 2CUUA 212LA 2FE9A 190LA 2QKQA 122LA 128LA 1L57A 1L56A 1L77A 3GUKA 3PDSA 1QS9A 2L5YA 1L50A 1L28A 1G0MA 3SEIA 1C6DA 2B6WA 4W55A 4IS7A 3H8MA 186LA 1L76A 1L85A 3VW7A 1L02A 4RQMA 2DL0A 185LA 1L46A 1C6FA 238LA 2B75A 1L73A 4I7LA 1JQUA 258LA 3NY9A 4W56A 229LA 3OE6A 3DN4A 1OVKA 4NL9C 3HUAA 3GUJA 3TADC 2ESEA 102LA 2F44A 189LA 200LA 183LA 3ODUA 4PZNA 1L68A 3C80A 1PQKA 1ZURA 3DNAA 1PK1A 2RBOA 3DMZA 1T6HA 1L81A 4W52A 2KG5A 1KW7A 158LA 1L17A 5J8YC 3HDEA 175LA 1P6YA 4NJ8A 2QARB 1L55A 3RZEA 2RB1X 2K4PA 4ARQA 1CUQA 2RBNA 3BS5A 1L27A 1CU2A 2RAYX 1DXSA 3HU8A 226LA 2OE4X 1L11A 3CDRA 3NY8A 4EKSA 2B6ZA 3SENA 167LA 1SXEA 1XJTA 5JTIA 4YXAC 2OU0X 152LA 1L75A 1L34A 191LA 251LA 4DAJA 256LA 1B4FA 1L67A 4ARMB 1CV1A 250LA 3SBBC 4S0WA 231LA 3F9LA 5JRTA 1QT6A 7LZMA 1SX2A 249LA 1WWUA 1L22A 126LA 1OWYA 4AQNA 1V38A 1L12A 1LKYA 1UCVA 2E8NA 2OE7X 138LA 1LI2A 3RUNA 1NHBA 3GULA 3L64A 4W51A 1QTVA 4I7KA 1SV4A 1QUGA 241LA 3FI5A 4I7JA 142LA 1P2LA 1L38A 5KNIA 115LA 1DYBA 201LA 1L74A 1OXJA 1C6JA 1P3NA 261LA 131LA 1L91A 148LE 2QB0A 177LA 1L13A 3HH6A 1G06A 1KW5A 1C6BA 1G0QA 1PQDA 1P36A 125LA 3DN6A 3HT8A 2A4TA 4GRVA 188LA 219LA 1L29A 1L69A 1QT8A 2QARC 170LA 1L70A 103LA 4I7OA 1XJUA 3C8RA 166LA 3HUKA 4EJ4A 255LA 1T8AA 4W53A 1P5CA 3DMXA 1L45A 1L66A 1SV0A 1SXDA 3GUNA 2NTGA 2KMDA 1G1VA 3L2XA 217LA 5L1MA 1LYGA 1L53A 1L25A 233LA 4W54A 1Z1VA 1SWZA 3HT7A 2KIVA 1QSQA 139LA 4ARQB 4I7PA 129LA 2KSOA 252LA 3BS5B 107LA 2O7AA 3DN3A 146LA 2ANXA 1L99A 173LA 240LA 3CDQA 1CVKA 4EKRA 1C6KA 1CUPA 4MHVA 1L20A 3GUIA 1D2YA 1PQIA 3LZMA 1L09A 4I7TA 3DN1A 247LA 1L64A 3OE0A 6LZMA 1C65A 211LA 4LDLA 2D8CA 1L95A 2ANVA 5LZMA 1QT5A 2LMRA 1G0LA 1P46A 1LKYB 1QT4A 198LA 4E97A 150LA 215LA 1L06A 2EAMA 4EKQA 2LCBA 3TADA 1L97A 3V2WA 1CU5A 1CV3A 236LA 1L16A 1X9XA 144LA 1L15A 3SB8A 3SB9A 4EXMA 2RH1A 227LA 1L05A 1C6GA 1OYUA 4I7RA 1L71A 2QB0B 1LGUA 1C61A 1LYEA 4PJZA 4EPIA 1CU3A 230LA 1LWGA 1LYFA 1L96A 2F8KA 2B7XA 218LA 216LA 165LA 1OVJA 1KY0A 1QS5A 1L58A 2OTZX 228LA 4EKPA 253LA 1C6CA 2NTHA 3GUOA 223LA 174LA 1OWZA 1T97A 123LA 178LA 1L63A 1L42A 171LA 2E8PA 3HU9A 155LA 242LA 192LA 187LA 3HH3A 1L0KA 1CU0A 5F3XB 2EANA 3NYAA 1CV4A 2Y9TA 1L44A 2OU9A 1L31A 1L33A 1QTBA 3EMLA 1D3JA 3D4SA 2RB2X 209LA 1L51A 1LGWA 2F3NA 1L83A 3SB7A 2E8MA 4LDEA 1DYGA 1L89A 3FADA 161LA 1LYHA 1C6QA 239LA 172LA 2LZMA 169LA 2DKXA 3C8SA 3CDVA 182LA 3BS7A 1L21A 220LA 2RBPA 3QAKA 2K60A 2OEAX 1DYAA 1C63A 4I7MA 147LA 4I7NA 1L86A 1L36A 4GBRB 3SB6A 2B6YA 2EAOA 1L54A 3DKEX 1L80A 1L62A 1KY1A 2HUMA 3GUMA 5I14A 140LA 1C68A 1C6PA 163LA 4ARJA 1X40A 2OTYX 1B0XA 1OW5A 149LA 112LA 259LA 1LYIA 2B72A 221LA 3CDTA 2O79A 1SGGA 2KE7A 4YX7C 1L35A 1PK1B 1LI6A 3K2RA 4ARLA 1I6SA 1EPYA 1LW9A 1C64A 4W59A 4W58A 3SN6R 262LA 1ZWNA 3KKAA 1CU6A 127LA 2Y9UA 137LA 1CX6A 1L94A 1LYDA 2Z6BA 3C7WA 3HTDA 2F32A 1SSYA 1P2RA 3G3WA 1JTMA 4ARPA 3DMVA 3C7YA 1P64A 1PK3A 1C69A 1CV6A 1QUDA 1D2WA 214LA 195LA 1T8GA 3HT6A 1SV0C 1L40A 4ARMA 4DJHA 1PQJA 145LA 4W57A 3K1RB 234LA 1L08A 1WTHA 1L01A 2ES6A 2Q9EA 3G3VA 5JU5A 104LA 3IDWA 151LA 2F2QA 2HULA 2LPEA 1L00A 3CDOA 1G07A 2IGCA 4OO9A 1G0PA 1L03A 4ZPUA 141LA 1L72A 120LA 2D3DA 3G3XA 1K28A 1LWKA 1DYDA 257LA 260LA 1L59A 1UQVA 1LGXA 2B6GA 1C62A 1L39A 3HH5A 1D3MA 1QTHA 162LA 4NL9A 110LA 1L24A 1L43A 2B74A 245LA 1L79A 2LC9A 1C67A 1OV7A 4PK0A 1L48A 2OE9X 1D3FA 205LA 119LA 1RG6A 1T8FA 2OU8A 1OVHA 1SWYA 3OE8A 1JTNA 3HILA 1C60A 1CV0A 164LA 3HWLA 1L18A 2QB1A 237LA 5J8YA 1B6IA 2Q9DA 1C6AA 1PQOA 3HTFA 1CTWA 108LA 1L61A 3DN0A 1L84A 1L52A 244LA 1L07A 2E8OA 213LA 2HUKA 3HT9A 3SB5A 1QTDA 1C6TA 1L49A 1XEPA 1TLAA 3HTBA 1SX7A 4I7SA 1L98A 1G0JA 1L90A 3HTGA 1SSWA 1C6MA 1DYEA 225LA 1KNIA 3C7ZA 3HUQA 160LA 2EAPA 3OE9A 2B6XA 1L26A 222LA 206LA 114LA 2RB0X 1CV5A 4IAPA 180LA 1L0JA 197LA 156LA 2KSOB 2F47A 1V85A 3JR6A 4K5YA 3V2YA 2RAZX 1L41A 113LA 1QUOA 1P37A 2YTUA 1L47A 1LPYA 1L19A 224LA 1QTZA 2L78A 1COKA 1DYFA 2RBRA 1L87A 2DKZA 232LA 1QTCA 1QUHA 3TACB 1L93A 2B73A 3DN8A 181LA 210LA 109LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IOSA 1HFYA 1P2CC 1NBZC 2DQFC 2FPMA 4Y2SA 1G0KA 4EPFA 3TMWA 8ICKA 3RH6A 1F0MA 3Q8LA 4UWVA 1L82A 2LBOA 3H8SA 4NSHA 2LYZA 2RBQA 4LDOA 1CJ6A 1X66A 5ALVA 1LHLA 3IM1A 4EBCA 4F4KA 3ZEKA 3H4DA 2QARA 2W9AA 4M04A 1DOQA 4J7VA 1JTTL 1D3NA 1C6HA 111LA 3RAXA 159LA 3EW9A 5KT2A 1L14A 3C8QA 1MLCE 3CB7A 5B5EU 1PQMA 3C81A 1IM4A 2ZIVB 1L37A 4DQJA 5DQGA 1REYA 1L3TA 5GTIU 4Y2VA 5KFUA 184LA 1GF7A 1QT7A 4I7QA 1GFTA 1L04A 3HDFA 3TI0A 1MELL 4WLXA 4BWMA 4DSLA 9ICUA 3DV9A 1L7OA 1KS3A 1L32A 1C08C 4NLKA 1XSFA 1MA7A 1EL1A 3A96A 168LA 5EWEA 1D6PA 2KHVA 1ZQAA 1NZBA 3FA0A 2EQLA 4DLGA 1ZYTA 2B6TA 3I28A 5AIBA 5E79U 4Z6CA 4YMOA 2LYHA 1KDHA 1L60A 2D4JA 4UARA 4JV1A 4ZFPA 5APDA 3C29A 3HW8A 2FMQA 4M9NA 3IG5A 4AP9A 5DQHA 2D6BA 4WLDA 2BAAA 2DQDY 2MAXA 7ICFA 3SQIA 1QS9A 2HHSA 5AI4A 3PNCA 3HX0A 7ICOA 2C2RA 2JEGA 1NF5A 2YMPA 4WMGA 1AROP 186LA 1L76A 1UHUA 3GV5B 7ICVA 1L85A 5I53A 5TZVA 3VW7A 4M9LA 4RUAA 1L02A 1HF4A 2JH7A 2HEAA 185LA 1C6FA 3GDXA 1B43A 1BNOA 1JSFA 5DGBA 4KTQA 4I7LA 4YF2A 1XU4A 1XGRC 5KFFA 2KNJA 5EE1A 3Q8PB 3DN4A 1GF0A 4NL9C 9ICNA 4GCCA 4KT3A 4HYKA 4DL6A 2LYOA 4RDSA 1RZTA 2KZ3A 5KAIU 2ESEA 102LA 200LA 2BQNA 1JXLA 4MEYA 4UB1A 3T6UA 1QLNA 1N60A 2M0NA 1L68A 1OUIA 2G4PA 2HEFA 4XJFA 2BGWA 1PK1A 2RBOA 3TMVA 9LYZA 1TKDA 3VWOA 1IP5A 3AL0B 5DN4A 3THVA 1F5SA 3ZVQB 4EBDA 4KLIA 1DK2A 1T3QA 5ALWA 1A4VA 2FYDA 1P6YA 3J6KA 1N56A 5CA7A 4CF3A 4DSIA 9ICXA 3C28A 3JPPA 3AYQA 2ZUCA 4UB8U 4UWUA 4OJPA 2O6KA 4C80A 3PV8A 3BS5A 1L27A 3NS1A 1BWIA 5I4XA 4NLZA 2RAYX 1DXSA 3RJFA 3HU8A 2J6UA 2P66A 2KJ8A 4ECVA 1NMMA 3QY4A 8ICCA 8LYZA 2OYYA 2MEDA 4GN5C 4PHAA 4YXAC 3LVWA 3PY8A 7ICQA 152LA 2I6ZA 1V7TA 1L75A 1LZNA 5AHXA 4IQUA 5KFLA 256LA 1L67A 1LZYA 1NKCA 9ICAA 250LA 3SBBC 5T3FA 2K8BB 3GXKA 3FC4A 5JRTA 1ZVYB 4WM4A 4P0PB 5KG7A 2XVTA 4ED7A 3ONNA 1NK4A 1O08A 1ZQYA 1OWYA 1DGSA 1YROA 3L5KA 2RDIA 4QWCA 9ICIA 3HFMY 4XUSA 207LA 4Y2UA 1KBUA 4USAA 2C2DA 4OJOA 4J9RA 8ICBA 4FS2A 1KTQA 1FN5A 3HT3A 4JV0A 4GN3A 1XS9D 3HBHA 1HIWA 4EOFA 1P2LA 4TSBA 1OUBA 2RLTA 5KNIA 1LB2B 4GN4A 4LFXA 1B7QA 2JMGA 4I2FA 3B0OA 1VDVA 5KFBA 2ZIXB 4O3SA 7ICJA 3JPSA 4WJ3B 2I26L 177LA 2P6UA 2MEHA 1L13A 1AT5A 3IP4B 3ETRA 3ZI4A 1FBIX 3HH6A 3KHRA 5KG4A 3AQEA 3GIMA 4J9PA 5LAGA 1PQDA 2H9KA 3DN6A 2NRVA 4HAIA 2A4TA 4GRVA 188LA 3WULA 2KVSA 4I2EA 2G07A 4JV2A 1GE1A 4RUCA 1CEZA 4I0CA 132LA 1U49A 4IRDA 1BQLY 4F4YA 5AKLA 3GUNA 3KD3A 2EZXA 3NVZA 3W3EA 2CRXA 1D8LA 4PPXA 4LYOA 5B05A 2N5ZA 233LA 1YQVY 3TXKA 4WM5A 2R8IA 3LDAA 1SWZA 3HT7A 5KFWA 4ARQB 4TUQA 4IL6U 129LA 1KIPC 4R66A 2RP5A 2EZZA 3FDSA 4KN7A 2R8KA 1S0VA 173LA 3RB4A 3CDQA 4G4CA 4ECWA 1VAUA 4IQWA 2W9MA 5G5HA 3ICXA 1ZQ1C 1L20A 1BPDA 3AGHA 4US8A 5ALKA 3LZMA 5DG7A 1ZXIA 4X3BA 4I7TA 4M9GA 2UVUA 4QWEA 2PI5A 3OE0A 1W6ZA 3M7DA 4LDLA 4NG8A 4NWHA 1GB6A 2D8CA 2W8KA 4O3RA 2B21A 2ZWBA 5LZMA 8ICJA 1QT5A 1V9PA 2LMRA 1P46A 4BXOB 1DQJC 198LA 4E97A 150LA 2WF9A 4H9IA 2Y1IA 2K89A 2EAMA 1BGIA 1T6VL 2BQIA 2MEGA 1N5XA 5T14A 4RLNA 4DFKA 4KLUA 236LA 2LHMA 1U45A 4QZCA 4BGDA 4UAUA 144LA 2BQBA 1S0OA 4ZIXA 2DKVA 3BKVA 1XNSA 208LA 4EXMA 2BCVA 5DG8A 4M6WB 1QUTA 2KJ9A 3OSNA 4A8EA 1LCNA 1OYUA 3HJEA 4FZMA 5KFIA 2QB0B 1L71A 1LGUA 4EPIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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