2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
molecule keywords E80-TELSAM domain
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
2F32A 232LA 3C81A 1C6FA 1QUDA 1L28A 2Q9EA 3HTGA 1T8FA 178LA 1L25A 3BS5B 239LA 1L93A 1G0JA 214LA 4RQMA 4I7NA 1LYEA 1CV5A 1L90A 2CUUA 1L01A 4I7JA 103LA 2RB0X 1RG6A 1KNIA 1L86A 1L47A 258LA 1CTWA 1L89A 3SB9A 5J8YA 1C6TA 1L64A 1QT7A 4EKRA 1L91A 4MHVA 3NYAA 3HUKA 3K2RA 2DKZA 1X9XA 2Q9DA 165LA 1L40A 1P7SA 140LA 1QTCA 198LA 1LKYB 4ARLA 1QUOA 2OE9X 1OWYA 3KKAA 1CV1A 254LA 118LA 4LZMA 148LE 215LA 3GUOA 2B6ZA 1L73A 1SSYA 1PQDA 166LA 167LA 2ANVA 1L74A 1UQVA 1DYBA 187LA 1C6DA 1D2WA 156LA 196LA 1DYFA 3RZEA 2KIVA 1LW9A 4OO9A 227LA 1KY1A 1L35A 1SWZA 2KE7A 114LA 109LA 1EPYA 3HT9A 5F3XB 219LA 2QARA 3SBAA 1L41A 2KSOA 201LA 2RBSA 1L63A 1QS9A 139LA 3CDTA 2GLEA 110LA 3HH6A 2LCBA 1CU0A 4ARJA 1SV0C 104LA 3FI5A 1SV4A 1P3NA 174LA 1QT5A 3L2XA 1C69A 4W57A 2B6TA 149LA 3C8SA 3HT7A 213LA 1L16A 152LA 146LA 1L75A 1L0JA 1T8AA 1L06A 2YTUA 1CU3A 1CU2A 1G0QA 4I7LA 3TACB 2O7AA 2OU8A 197LA 2RBPA 1L60A 1L29A 2KMDA 1COKA 161LA 1QTBA 2DL0A 3SB8A 1DYAA 237LA 1G0PA 1Z1VA 120LA 1T97A 1V85A 3UONA 4IAPA 1PK3A 4PZOA 180LA 1P5CA 1L19A 1TLAA 2NTHA 3GUJA 1PQKA 155LA 1C61A 2HUKA 1SSWA 164LA 2QB0A 243LA 5KNIA 1C6CA 1L81A 4YX7C 1PQMA 4NJ8A 206LA 4I7RA 1OW5A 1SX2A 1XJUA 217LA 183LA 1LYGA 2E8MA 1C67A 1L04A 252LA 3RUNA 168LA 2RBOA 3SB6A 1L96A 1C6PA 1L80A 3HTBA 1LGWA 3HUQA 1L14A 1DYGA 4K5YA 247LA 4EPFA 4EKPA 1C6HA 3G3VA 3GUMA 4GRVA 2JV3A 172LA 1C63A 251LA 1KS3A 3HT6A 1C64A 1PQJA 4I7KA 3IDWA 200LA 1CV0A 1OV5A 2B75A 3C83A 4I7TA 111LA 1L61A 1PQIA 1D3JA 1L77A 1D3MA 1OVKA 3DN4A 1JI7A 1L24A 1ZYTA 2FE9A 2D3DA 1G0GA 1QSQA 2EAOA 3SN6R 1L65A 2O79A 2Y9TA 1P37A 1LYJA 4DKLA 3V2WA 1L58A 4ARPA 1CV4A 3HH4A 102LA 195LA 1D3NA 157LA 245LA 1L0KA 1L55A 1L62A 151LA 1C68A 241LA 4LDLA 1L99A 3F9LA 1PK1A 2F2QA 1T8GA 4ARQA 2LMRA 4S0WA 1L54A 1WWVA 1C62A 1P2LA 3G3XA 190LA 184LA 2RBNA 188LA 2D8CA 224LA 2E8OA 3DN0A 3NY9A 1L32A 2HUMA 108LA 1LI3A 128LA 234LA 1L13A 4EJ4A 3OE6A 119LA 3SB7A 255LA 1LI2A 218LA 220LA 2B74A 1UCVA 2RB1X 210LA 4PK0A 257LA 127LA 1CV3A 1L68A 2RAYX 4PZNA 1G0KA 4PJZA 1T6HA 142LA 1F0MA 2ANXA 2RB2X 1X40A 1OYUA 1C66A 1QT8A 233LA 1QT3A 3DMXA 2QKQA 1C6AA 1QTZA 199LA 1L97A 222LA 3BQ7A 1LYHA 1LWGA 1OVHA 1LLHA 4W51A 1L70A 1L50A 2B70A 3D4SA 192LA 130LA 2E8PA 1G1WA 3C7WA 2HULA 2QB1A 5LZMA 3C80A 1C6NA 185LA 1LYFA 4EKQA 1L20A 1L84A 1C6QA 112LA 1L05A 3HH5A 2F47A 235LA 1CX7A 4NL9C 169LA 1QUHA 3HH3A 4I7PA 4E97A 1OVJA 181LA 1L10A 4ARMA 1C60A 1L56A 2B6YA 2RH1A 1SV0A 2Z6BA 3HTDA 3DN2A 3HU9A 2Y9UA 1C6IA 4I7QA 2O4WA 4RQNA 1L92A 1L22A 1L36A 1CV6A 2QARB 262LA 2B6XA 4W59A 4W53A 1L09A 3L64A 2KSOB 1L33A 3BS5A 246LA 3QAKA 1L44A 1SWYA 2L78A 2E8NA 1CUPA 4EPIA 107LA 2B6GA 191LA 1L85A 5JU5A 1I6SA 1CVKA 1LGXA 126LA 189LA 1DYDA 2RBQA 158LA 256LA 4W58A 3GUKA 1KW5A 3CDVA 1L94A 1QTHA 2LPEA 2L5YA 182LA 1B6IA 226LA 1QUGA 4I7MA 3OE9A 1L79A 176LA 170LA 141LA 138LA 2B7XA 1LKYA 2LZMA 1L67A 3TADA 3G3WA 159LA 3V2YA 2IGCA 1KW7A 6LZMA 205LA 1CX6A 2B6WA 145LA 1LPYA 1XJTA 1LGUA 2A4TA 3DN3A 1QTVA 1G1VA 1CU6A 1CU5A 240LA 4LDEA 1L42A 5J8YC 1D2YA 2OTYX 160LA 3SEIA 225LA 4GBRB 1P64A 150LA 1P6YA 1KY0A 250LA 4ZPUA 3HWLA 209LA 3KKAC 4YXAC 2QB0B 1QT6A 248LA 1L11A 249LA 1D9WA 4W56A 1L83A 2F44A 3C8RA 115LA 1L95A 2NTGA 3ODUA 163LA 1SXEA 3K1RB 3SENA 1D3FA 1L52A 3BS7A 3DNAA 1G0MA 2QARC 238LA 3HDEA 1X66A 1DXSA 3C8QA 4IS7A 1K28A 2EAPA 216LA 1L48A 3DKEX 1OXJA 2ES6A 2B72A 244LA 1L82A 1L27A 1L51A 1QS5A 1ZWNA 1KW4A 113LA 223LA 4DJHA 242LA 5JTIA 2OE7X 3HUAA 1L59A 229LA 4W55A 1L45A 2EANA 1WWUA 1JTMA 3DMVA 1L98A 123LA 259LA 1L69A 2RAZX 1L53A 221LA 3PBLA 2OEAX 1OWZA 253LA 1PQOA 2OU9A 3PDSA 5L1MA 1L87A 4I7OA 1L71A 1SX7A 1QT4A 1LI6A 1LYDA 3HU8A 1DYEA 1C6JA 1B4FA 1WTHA 173LA 231LA 4W54A 1L31A 2K4PA 1G07A 1C65A 1L57A 1C6MA 2OE4X 1SXDA 3DN1A 1L23A 3LZMA 3VW7A 137LA 162LA 3C7ZA 1PK1B 1P46A 2KG5A 3GULA 5I14A 1L34A 2DKXA 4ARQB 1L66A 3DN8A 1B0XA 1L43A 3FADA 5JRTA 1NHBA 1L00A 4EKSA 230LA 3GUIA 177LA 3CDOA 4DAJA 4W52A 1L26A 211LA 236LA 2LC9A 1ZURA 2F8KA 1L08A 1LYIA 3CDQA 1L72A 129LA 1L17A 1C6GA 1QTDA 1JTNA 1L88A 1CUQA 3H8MA 1L18A 3JR6A 175LA 1QSBA 212LA 4LDOA 4AQNA 147LA 1LWKA 1L07A 4I7SA 3DMZA 1XEPA 2K60A 1P36A 1L76A 3TADC 1L15A 1L03A 1L49A 1L39A 143LA 2EAMA 3GUPA 7LZMA 4EXMA 4NL9A 1L38A 3C7YA 3FA0A 3HTFA 228LA 4YXCA 1JQUA 1C6BA 1L21A 2ESEA 1C6EA 261LA 1L46A 1L12A 2OU0X 1DYCA 2F3NA 3F8VA 1L30A 260LA 3OE8A 3NY8A 2OTZX 1C6KA 1V38A 171LA 1SGGA 122LA 1OV7A 3GUNA 144LA 1P2RA 3HILA 3SBBC 3SB5A 2RBRA 1L37A 1G0LA 3C82A 1P56A 125LA 3DN6A 3HT8A 4ARMB 131LA 1G06A 1C6LA 3CDRA 3HDFA 2B73A 186LA 1L02A 3EMLA 3OE0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KXPA 3C81A 2Q9EA 3O0FA 1QUSA 1UBZA 1N5XA 3F5EA 3I28A 4GN3A 4YMOA 3BS5B 1ALCA 3KOOA 4ED8A 1JKDA 1LSZA 1OUHA 3NVVA 1IP4A 5AI4A 4FS1A 3PO5A 1L01A 4FZMA 2CUUA 1GBYA 2YX8A 4PRUA 4UAYA 4CF4A 1HIWA 5KXRA 3SB9A 2XBRA 4FFDA 3T79A 4DQIA 1L64A 1QT7A 3QXGA 1V7SA 8ICJA 4ELUA 1A0PA 3NYAA 4I2IA 3MBYA 2XY5A 3LDAA 3HUKA 4LYMA 1X9XA 165LA 1L40A 5KG5A 4DL2A 1VAUA 1LKYB 1JUGA 3AQFA 3WUAA 1SL0A 5BPCA 4BAFA 2MAXA 3HWTA 4BUGA 4IRCA 254LA 5APCA 4C0ZA 1IP7A 2Z12A 4LZMA 2XTHA 2EZXA 148LE 1MQ3A 4YMMA 1SL2A 5AKYA 3LZ2A 2JXJA 3RRGA 1DOQA 4O5CA 1B7OA 2YDGA 1OUGA 1RJCB 2HHSA 1LOZA 1QQ5A 1DYFA 4ED7A 3OJUA 1FLWA 1GB5A 4QW8A 3ATOA 4DL4A 2ZWBA 3WPKA 4ECWA 2XCPA 227LA 2G08A 3TXJA 1L35A 1LZAA 5A3EA 2YQEA 3KAMA 2R8GA 5F3XB 4Z98A 4Y2YA 1ZOLA 1B5VA 1CKCA 4YCXA 7ICJA 3RAXA 5DQIA 2ZQ3A 3ZD9A 1CRXA 139LA 5KG7A 1GFKA 4W96A 4Y2TA 3UMGA 4HAIA 3P66A 1CU0A 2OCEA 3CT0A 5AKGA 1FKQA 4LVSA 4N1CC 2G0AA 3QUQA 104LA 2LM4A 3FI5A 1P3NA 1WTMA 4IRDA 2C8PA 5KFHA 1C69A 5D5CA 1Z00A 4JWMA 7ICUA 2B6TA 3AZ5A 4ZEEA 5AI6A 3HP6A 4YR0A 3SQIA 1OUIA 152LA 1JKCA 1T8AA 2H3IA 1TK5A 1CU3A 3GV5B 2BDUA 1VFBC 1F6SA 208LA 2BLXA 2BQJA 5APEA 2UVRA 3Q8LA 4JK1A 3QU2A 3CB7A 5CEHA 2R8JA 1COKA 1ZJNA 5KFSA 2EZZA 1QTBA 133LA 4TUNA 4F2RA 120LA 1T97A 5J0YA 3IJUA 4PJ2C 1PK3A 1BPYA 5DBAA 2WFAA 2NTHA 1L19A 5AICA 155LA 4O9MA 3C2LA 4YMNA 4I28A 164LA 1LZNA 3T6UA 2WF8A 2OM6A 3H4BA 2I6XA 4YX7C 1PQMA 2A19A 2CN1A 7ICQA 1C08C 4I2DA 5KL1B 8ICWA 3PW7A 4EELA 4QGZA 2LM1A 4B1AA 1WQNA 3T5LA 5J0PA 217LA 3PW5A 4R63A 4ET9A 4J03A 3LWMA 1MN8A 7ICFA 1L04A 3RUNA 1LZSA 1DKKA 1LJIA 2MUTA 3MR2A 1G7JC 4QZBA 1VDVA 5J2IA 3HKZC 4NG1A 9ICMA 1L96A 1C6PA 4R66A 3F53A 5EE1A 3Q8SB 2H9JA 1XGUC 1L80A 2FLNA 3HTBA 3KFUF 4QIWC 3UQ2A 3VCBA 1UIGA 2ZQ4A 1VLBA 1BVKC 2RDJA 2NRXA 3EO5A 1ZQRA 1QSAA 4HP0A 1HFZA 4H9EA 3M18B 4GRVA 4RQ7A 3BKHA 3WKAA 5EBHA 3I1YA 251LA 3HT6A 3IDWA 4I7TA 5J2CA 3HPOA 1D3JA 2EQYA 2HEDA 1NHEA 3DN4A 3WH1A 1FO4A 1K5OA 2D3DA 4IRKA 1UACY 3MR3A 2FPMA 3OGUA 3K4GA 8ICMA 5AI5A 1YAOA 8ICQA 3MDAA 4PHPA 1ZQIA 1WYGA 5IIOA 3V7KA 1H38A 3V2WA 1ZQWA 9ICRA 1UHUA 1L58A 1A77A 1LHHA 1O23A 1GF7A 102LA 2ZIWA 4NSHA 2YBIA 1GBWA 1GBOA 3M3UA 1L0KA 3ISCA 1ZQYA 4NM2A 1ZXIA 4DWXA 1C68A 1JKBA 241LA 4ETAA 5ALYA 1L7NA 1L99A 3F9LA 2YB1A 4F5PA 1NJWA 4Q8EA 4S0WA 4N9RA 3GU3A 1WWVA 2MEBA 5C6IA 1C62A 1GFHA 4ED6A 4YR3A 3ZDBA 3PY8A 2Y1IA 1JTOL 4H91A 3N9AA 1LZEA 3D2SA 1UCOA 1REXA 4MCKA 1UPHA 3DDHA 4QWDA 2DGZA 1LJGA 1S77D 2WARA 2BQAA 234LA 4OW1A 4DSEA 7ICVA 1T7PA 2XI9A 1H87A 3F2BA 1TEWA 3AZ4A 2H9KA 3GXKA 3OE6A 1GB6A 1GE4A 1BB3A 1HELA 2A1JA 2DF4B 3M7DA 5AKEA 4P4PA 3C2MA 4KLFA 3QU5A 1VDSA 2ZIJA 5DL9A 1NNLA 5J2KA 1GFVA 2HI0A 2BQRA 1B7PA 1ECWA 1AKIA 5ALSA 3GIKA 4P0QA 5AM4A 4OD0A 1Z1BA 4PJZA 4PGJB 4GXJA 3IRUA 3C1YA 2F76X 5ALNA 1ZQTA 3RJGA 7ICEA 5T14A 3N97B 233LA 1QDTA 3BQ0A 4TQRA 1NK0A 5ALQA 1JXLA 5CRXA 4KL7A 199LA 1L97A 4H94A 4N1EI 1DK3A 3WK8A 1NZBA 1LWGA 1LYHA 1TK0A 5KFPA 5CHGA 2HHWA 5FCPA 4Z41A 1YQVY 5ALZA 1L70A 4NLBA 1L50A 4OWCA 2YB4A 4MFAA 1SIJA 1AT5A 1LZRA 5G5HA 1G1WA 3RB4A 3C7WA 5KXKA 4KMUA 3W6FA 1NK5A 3BQTA 3C80A 4DC4A 185LA 1L20A 1L84A 2JRZA 3HH5A 4NFVA 1TAUA 4US8A 5J0QA 2I1QA 1COOA 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 5KNI A;  1S9F A;  2JHD A;  5E9R A;  1C6C A;  5L1K A;  2K4H A;  2ISP A;  4H9F A;  4I7R A;  5KG2 A;  4RQ5 A;  4O3P A;  4M9J A;  1LYG A;  2E8M A;  5AK3 A;  4F72 A;  252L A;  4G9B A;  4PH5 A;  4IQT A;  5KG6 A;  1ZV5 L;  5IIK A;  2RBO A;  2FI1 A;  3H8W A;  3BQ1 A;  1U9L A;  4EBD A;  3SB6 A;  2LYA A;  3E0F A;  3AM9 A;  4NLC A;  1S0N A;  3V6K A;  4DQ5 A;  1LGW A;  5D5F A;  1PZN A;  2YVB A;  4K5Y A;  247L A;  4X5V A;  5CA7 A;  4EPF A;  4EKP A;  2HOQ A;  2RP5 A;  1P7D A;  1C6H A;  3G3V A;  1FLU A;  1GXV 2;  1D8Y A;  1C46 A;  2PMZ F;  1OV5 A;  2B75 A;  1KLN A;  3CT1 A;  5J2H A;  1L77 A;  1OVK A;  4NM1 A;  1TCY A;  2VJ4 A;  3NVY A;  2Z39 A;  2XGQ A;  2H5X A;  3QUB A;  9ICT A;  1LPI A;  4KLS A;  4FJR A;  2FE9 A;  4DF8 A;  1JRP A;  4KLI A;  1G0G A;  2KJ9 A;  1QSQ A;  4PL2 A;  1G7L C;  1HMK A;  3SN6 R;  7LYZ A;  8ICL A;  3EYZ A;  3ZDA A;  2BCU A;  3F6Z A;  5L3I A;  4P4M A;  4CJ2 A;  4RNO A;  4OJO A;  1LYJ A;  4PPO A;  1HEK A;  4DKL A;  5K4L A;  5KFZ A;  2G4N A;  4KLL A;  1CV4 A;  1LZG A;  2PMZ C;  2BR0 A; 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 1CU6 A;  1BNP A;  5LVG A;  1JSF A;  1JN3 A;  4J1A A;  1D2Y A;  207L A;  3Q8K A;  4DWI A;  3WXT A;  3WKD A;  2OTY X;  1GF8 A;  3SEI A;  2E3T A;  3FDS A;  3WKB A;  1IEE A;  9ICI A;  1KIQ C;  2PI5 A;  1UT8 A;  1JJ3 A;  2FBD A;  5F14 A;  8ICS A;  1UA0 A;  4NLK A;  2XC9 A;  7ICN A;  4YXA C;  4OCZ A;  1LJ3 A;  4MF8 A;  3TI0 A;  1DQJ C;  1QT6 A;  4F4Y A;  2G4Q A;  4PRQ A;  5ALU A;  1IC5 Y;  3CT5 A;  1JIY A;  1NKH A;  3PVX A;  1L83 A;  115L A;  1CKH A;  4GXK A;  2R8I A;  1ZJM A;  3ODU A;  163L A;  2CWI A;  1NBZ C;  3IP4 B;  1DGJ A;  1LSG A;  2E1E A;  1JAL A;  3SEN A;  2IBK A;  1N5W A;  2FLL A;  2HU3 A;  1KIP C;  2F1I A;  238L A;  3HDE A;  1X66 A;  1DXS A;  1L3T A;  1XSF A;  3C8Q A;  4IS7 A;  3WYH A;  2NV3 A;  4EX7 A;  5ALF A;  4XA5 A;  3MR6 A;  4O5K A;  3LK9 A;  1GEV A;  4HSF A;  1L48 A;  5KFL A;  1U49 A;  1OXJ A;  5KT6 A;  4DCC A;  3RBD A;  2LBO A;  2XY7 A;  1JIS A;  1L51 A;  1LYY A;  4GCF A;  1XWL A;  4KT3 A;  2N5Z A;  2RLT A;  1PZY A;  5JTI A;  4RPY A;  4I2B A;  2D91 A;  5AM5 A;  4NLN A;  4NHQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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