2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords E80-TELSAM domain
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
1LYHA 1KW5A 1L19A 1LYJA 217LA 3GUKA 1L48A 1L11A 1T8AA 252LA 1L42A 3HUAA 1L0KA 1UQVA 3L64A 2LMRA 4EXMA 3C7YA 1D3NA 1L26A 1P46A 3SB5A 1CVKA 1L46A 1G07A 1XJUA 3RZEA 143LA 3HT7A 107LA 1L99A 233LA 1LI2A 3FA0A 4I7PA 167LA 2B73A 1CU2A 1L73A 2F44A 1C6QA 1SWZA 4EJ4A 4ARJA 155LA 148LE 1QUOA 2Q9EA 1P64A 2B75A 3BS5A 126LA 1L59A 2DL0A 1L08A 238LA 1L81A 2QARA 3TACB 1G1VA 4RQMA 1OV7A 1L12A 2OE7X 4ARQB 2RBNA 2HUKA 1QT3A 1KNIA 1DYDA 3JR6A 1C6IA 1OV5A 2JV3A 3HH6A 1TLAA 2RB1X 187LA 3GUOA 180LA 4YXCA 234LA 3C82A 1L93A 152LA 3HH3A 2O79A 1L30A 2KMDA 1D3JA 3F8VA 1C6BA 2OTYX 1L85A 176LA 114LA 2F47A 2EAOA 1V38A 2OE4X 3C80A 168LA 4I7OA 4DJHA 1L58A 1L02A 1RG6A 1G06A 1SWYA 232LA 3SN6R 1CV5A 1DYAA 3DN1A 4I7SA 4I7TA 4OO9A 3G3VA 160LA 1QT6A 3DMZA 3KKAC 4EPIA 2A4TA 2RB2X 3HU9A 262LA 1LYDA 1T97A 1LKYA 3OE9A 123LA 3DN2A 1P3NA 192LA 4GBRB 140LA 2QARB 3PDSA 220LA 2RBPA 3OE0A 1LYEA 166LA 3SB9A 1L15A 4W54A 5L1MA 1LYIA 1CUPA 1X40A 3DKEX 158LA 2Q9DA 173LA 1C69A 3FADA 1C6GA 4W53A 1K28A 3HH5A 2B74A 1PQMA 4I7LA 2Y9TA 1C65A 2B70A 1KY0A 2EAPA 2KE7A 3H8MA 4EPFA 2B6YA 1SXEA 1L51A 1P36A 1L87A 3HTDA 3DMVA 1OVHA 230LA 3C8QA 1L66A 236LA 1CV0A 1L54A 1L38A 1PK3A 175LA 2LZMA 1LKYB 119LA 256LA 3HDEA 4EKSA 1L92A 3DN0A 1L84A 4GRVA 3C8RA 1QTDA 2B7XA 3EMLA 6LZMA 1L09A 224LA 3K1RB 2QARC 1CTWA 1KS3A 1OWZA 242LA 5J8YA 149LA 223LA 4EKPA 2YTUA 4W59A 239LA 1L62A 3C7WA 3DN8A 1I6SA 3HH4A 4I7MA 1C6NA 1XJTA 210LA 1L21A 2CUUA 248LA 137LA 1T8FA 2QKQA 2DKZA 1C6PA 261LA 162LA 2B6WA 178LA 1QS9A 3BQ7A 1SV0C 225LA 3SENA 3HTBA 3GUMA 1G0LA 1L37A 1L34A 1CU0A 1L89A 1L49A 1XEPA 3GUPA 1QTCA 1V85A 3SB6A 1L33A 3NYAA 2KSOB 1L83A 1LW9A 1CUQA 3OE8A 111LA 253LA 2K60A 165LA 177LA 1C6KA 1L36A 1L43A 1SSWA 3SB7A 2FE9A 3HILA 122LA 2E8MA 1P2LA 1D9WA 2OU8A 1F0MA 1L75A 4YX7C 1OWYA 1L71A 1P6YA 243LA 2RBOA 2RH1A 3GULA 1DYCA 4W58A 4I7NA 3DN4A 1B4FA 102LA 1OYUA 1L60A 1PQIA 1C6FA 2DKXA 1L00A 1CV4A 247LA 241LA 1PQOA 215LA 1G1WA 161LA 1QTZA 1C6CA 257LA 1T8GA 4W51A 4W57A 5KNIA 1L01A 1L40A 1L68A 1C63A 200LA 4LZMA 4EKQA 1L57A 1C6LA 164LA 2QB0A 2B6TA 7LZMA 1T6HA 1QSBA 3C7ZA 246LA 240LA 3GUIA 3HUKA 1G0GA 206LA 1CU3A 2OTZX 1L97A 2K4PA 113LA 1DXSA 1L22A 1LI6A 1SX7A 1SV4A 4PZNA 1L44A 1SGGA 163LA 1L67A 2KG5A 1PQDA 3DNAA 1L41A 1CU6A 1Z1VA 185LA 1PQKA 212LA 2B72A 3G3WA 2B6ZA 214LA 198LA 5J8YC 1CV1A 4MHVA 3HWLA 120LA 1L25A 3L2XA 1NHBA 3HTFA 4RQNA 201LA 3HTGA 3HT9A 3BS7A 1L07A 4I7KA 1L70A 3D4SA 2HULA 4ZPUA 235LA 2Y9UA 222LA 4IAPA 1QTBA 5I14A 2ESEA 109LA 3SB8A 3HU8A 1L88A 2Z6BA 2L78A 1L06A 218LA 1C6EA 2QB0B 138LA 184LA 2KSOA 186LA 1LYGA 4PK0A 1L76A 221LA 1OW5A 1L65A 139LA 1B0XA 4DKLA 1JI7A 1L35A 4LDLA 115LA 1QUHA 1L94A 1G0MA 2EAMA 4NL9A 3TADA 1G0JA 3OE6A 213LA 4ARMA 4EKRA 1D3MA 1L27A 2RBQA 1QT8A 1CU5A 3DN6A 1JQUA 1QS5A 1L74A 2KIVA 1L56A 1C67A 216LA 1LI3A 237LA 3CDVA 2NTHA 2L5YA 1C64A 1L86A 1LGXA 2B6XA 2RBRA 1L77A 4PJZA 1LLHA 1L0JA 5JRTA 1D3FA 1QUGA 147LA 1L04A 209LA 3SBBC 1G0KA 1P2RA 196LA 1C61A 1C6TA 1SXDA 146LA 1ZYTA 195LA 1D2WA 4E97A 3DMXA 1L29A 3C8SA 144LA 5LZMA 3HT6A 1UCVA 1QTVA 250LA 157LA 1L31A 1X9XA 1L63A 1JTMA 1L17A 3CDOA 150LA 103LA 1CV6A 205LA 231LA 1L69A 181LA 2ANXA 3V2YA 1L82A 172LA 255LA 3V2WA 1CX6A 1LPYA 3G3XA 2D8CA 3GUNA 104LA 3HT8A 244LA 4ARMB 145LA 4IS7A 3DN3A 112LA 4I7JA 1L39A 131LA 249LA 3HDFA 191LA 3F9LA 1ZWNA 1LWGA 1L23A 5F3XB 1QT4A 3K2RA 227LA 1L64A 1SSYA 3QAKA 2F3NA 4LDOA 2LCBA 2OE9X 1L03A 4K5YA 1KW4A 3VW7A 1L96A 1L72A 1L18A 1QT7A 1B6IA 228LA 1L91A 2OU9A 2E8OA 1L45A 183LA 3CDQA 2O4WA 1PK1A 174LA 1LWKA 1SV0A 2F2QA 3LZMA 1L47A 2RBSA 5JU5A 170LA 199LA 3NY9A 1L14A 1L50A 169LA 4S0WA 1L16A 1G0QA 1L61A 2E8NA 171LA 251LA 4ARLA 151LA 1L53A 1PQJA 1EPYA 2OEAX 1L24A 3IDWA 4LDEA 211LA 4I7RA 1OXJA 1L52A 142LA 1WTHA 1D2YA 1CX7A 1L95A 1P37A 2ANVA 2GLEA 4NL9C 3TADC 129LA 1L10A 1L32A 3ODUA 3BS5B 1L28A 1DYEA 1QT5A 2QB1A 1L55A 188LA 245LA 1P56A 1DYGA 2IGCA 2EANA 127LA 141LA 3NY8A 4YXAC 1C6MA 4PZOA 259LA 2O7AA 1C62A 2D3DA 197LA 1DYBA 182LA 1CV3A 1SX2A 2F8KA 229LA 2HUMA 2LPEA 3C81A 4DAJA 1DYFA 4NJ8A 260LA 258LA 219LA 4I7QA 2RAZX 1C6AA 3RUNA 2LC9A 4W55A 1COKA 1LYFA 125LA 1PK1B 1G0PA 128LA 3PBLA 1L90A 2E8PA 110LA 1C68A 1LGWA 3KKAA 118LA 2RB0X 4ARPA 5JTIA 1P5CA 1L13A 108LA 3FI5A 3C83A 2B6GA 1OVKA 2OU0X 190LA 1L79A 1L05A 1C6HA 1WWVA 130LA 1OVJA 1QSQA 1P7SA 1C60A 1KW7A 1C6DA 1ZURA 1JTNA 4ARQA 1L98A 3HUQA 4W52A 4W56A 1KY1A 1QUDA 159LA 1L20A 226LA 3UONA 3GUJA 3SBAA 2RAYX 1WWUA 3CDRA 2ES6A 1QTHA 1L80A 1C66A 2F32A 1X66A 2NTGA 189LA 3CDTA 3SEIA 1LGUA 156LA 1C6JA 4AQNA 254LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SV3A 2DQFC 4KLJA 4CNQA 4DSFA 1D0KA 3GUKA 1TK5A 1L48A 1T8AA 1L3SA 3NRWA 252LA 1L0KA 1OUBA 1UQVA 1S0MA 2DQNB 3L64A 2D4JA 2AU0A 2LMRA 1PVQA 1N60A 5K4LA 3TMVA 3WW5A 4UB6U 3C7YA 1L26A 4R66A 2FLPA 2Q0MX 1VJ5A 2BPCA 4LYZA 9ICPA 3AZ6A 4QWCA 2Z37A 1GPQC 143LA 1GFEA 4DF4A 1NKCA 107LA 1LVHA 5G5HA 4O9MA 167LA 1UIBA 1T8EA 1L7NA 4EJ4A 4M04A 2H3VA 148LE 1QUOA 4DSLA 3BS5A 1ZYQA 2HHSA 4KL7A 3C29A 1GF8A 4DWXA 5LYZA 1QQ6A 2NRTA 2QARA 2OE7X 3S6JA 4RQMA 1L12A 2HUKA 2KJ5A 2KFZA 4YFKA 5KFIA 3MGHA 1G7LC 1Z4NA 3GDXA 3FC4A 4N5RA 4IJ4A 1IP3A 3V72A 180LA 4G3IA 4KLTA 3QNGA 2YMMA 3AW7A 3MC1A 2FMQA 4C4RA 1F0WA 1NJWA 2KMDA 3ISBA 1L85A 2WF7A 2J6SA 1NJXA 2F30A 4OWCA 1F5SA 1LZ8A 3C80A 3RF9A 5ALXA 1IC4Y 2KIWA 2HBJA 3T5JA 1BVXA 1L02A 1L58A 1QSWA 4TTDA 4CGZA 2BCSA 1SWYA 3SN6R 3AZ5A 1DYAA 3DN1A 3MFHA 2LBOA 4I7TA 4PL1A 4RPZA 4YEMA 3IJVA 2B0CA 4IQVA 1TE2A 1QT6A 3DMZA 4LT0A 3NGDA 2CRXA 4DT3A 1ZD4A 4Y2QA 5ALMA 1T97A 1LKYA 5I4WA 1QTMA 1JMSA 4P4MA 1NJZA 5LA5A 5ALZA 4B9SA 192LA 5L9JA 5LYTA 2W9MA 3A0HU 5J2BA 9ICEA 2F76X 5A0LA 8ICUA 4M6WB 4UBCA 3OE0A 154LA 5DGAA 1BPZA 1LYEA 1WYGA 3SB9A 5EE1A 3KFUF 2V9WA 5DDMA 1CUPA 3DKEX 1DI4A 2BQLA 3QU7A 1C43A 3B0OA 2HVIA 1B7LA 5C0YA 4DLGA 4W53A 4H9CA 3HH5A 3N7SC 2JEGA 1PQMA 2Y9TA 5ALPA 2GOLA 2AQ4A 4O3SA 1HMKA 2KE7A 9ICTA 3LYSA 5KFKA 4Q44A 2W04A 5CR0A 4H8XA 4YG2A 1SXEA 1X6IA 1LZAA 2W1YA 2CDSA 4HJYA 2G09A 3RB6A 1LHLA 3RNXA 4ECRA 3ALRA 1S9FA 1IOCA 1IM4A 2W9BB 5HP4A 9ICUA 4B4EA 8ICAA 4FFDA 1OUGA 4XJIA 1X2IA 3M1YA 1CV0A 4H9IA 1PK3A 2ZNXY 1WQPA 5J0OA 3M8SA 1IWWA 5GTHU 5KJ9A 1IEEA 2XJWA 5KG0A 1CI4A 3C8RA 5KFAA 2BQEA 1LSMA 2I1QA 1B7QA 3V6JA 4DD1A 5KXKA 1LZ4A 2PFNA 1KS3A 1OWZA 5J8YA 1OUDA 4MFCA 223LA 1YZ6A 4YCXA 4B9UA 3Q8QB 4M47A 1S97A 3Q8LA 4F50A 9ICVA 4YMMA 3NVZA 1GFUA 4ELTA 4RQ8A 1BB4A 210LA 1L21A 3QUQA 248LA 1VLBA 2KKVA 1HEOA 261LA 1DXJA 4XRHA 162LA 1D9UA 2Y0SF 4FE3A 1GB0A 3SENA 1GB6A 3GUMA 4AGAA 3OSNA 9LYZA 1T4GA 2IFFY 5J2HA 4X5VA 3PVXA 3CW2C 4UATA 1V9PA 1WG8A 4YXMA 1UCOA 1XEPA 4CF3A 3GUPA 4NHQA 1QTCA 1V85A 3F2DA 3RB0A 1UHUA 2OHFA 2UVUA 3NYAA 3C2LA 2ZYPA 5KXYA 5K7OA 2GWSA 4JV0A 2XBRA 111LA 4RQ3A 4RUAA 3EMSA 177LA 1JKBA 4HSFA 5IINA 1ALCA 1SSWA 1AM7A 5CJ7A 2FE9A 1NI3A 2E8MA 2ZG6A 3PSPA 1TVAA 122LA 3F2CA 1I56A 3AU2A 1ZQXA 1YKXX 2FLLA 5FELA 3GFKB 3NTUA 1F0MA 2HHXA 4EBEA 4LZGA 5B07A 4Z46A 2XBSA 3RH5A 3SV4A 4YOPA 4MR1A 2W7OA 1KDHA 4NGIA 5T3FA 1GBZA 1DYCA 9ICKA 1LZBA 1LZEA 3V6KA 1EQEA 4M6DA 1PQIA 5ALNA 3UPQA 247LA 2DF4B 4ECZA 1KRPA 4YQWA 3OSPA 3EYZA 1LZGA 5KXRA 3M6ZA 2I25L 1L01A 1LJJA 2YBHA 1LHKA 4C4SA 3UQ2A 2QB0A 2MRLA 1ZRNA 1HF4A 1URJA 3H4BA 1OUEA 4J1AA 1QSBA 3C7ZA 1CKDA 4D9ZA 3HJEA 3MGIA 1DPXA 4QZCA 1LMTA 3HUKA 1CRXA 2W55A 5C5JA 3ULRA 5A3EA 5TZVA 1CU3A 4RT3A 1UIFA 2JR5A 1RXWA 1X6JA 194LA 3RBEA 2C8PA 5IILA 5DB7A 4Y2VA 1LSEA 1BB6A 1LI6A 1HENA 1GWDA 4PZNA 2KG5A 4DQ7A 1KIRC 8ICZA 3HKZC 4FBTA 1Z1VA 2NWDX 4DSEA 1PQKA 2B72A 2LM1A 3CP8A 2H5ZA 4MHVA 2AGOA 1GE3A 3D2SA 3HWLA 1FFVA 3IWRA 1L25A 1ZQWA 3AMZA 3HTFA 5KXZA 2W1MA 4LJXA 7ICJA 1NF5A 3A6BY 3GILA 1L70A 4IC9A 4DSIA 3N9AA 4U7CA 1YIKA 4NWEA 4GCEA 3H4DA 2ZTEA 2EZZA 5B1GA 5J2CA 5L9XA 1GE4A 4J9KA 2Z6BA 2EQYA 1U45A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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