1Z6MA

Structure of conserved protein of unknown function from enterococcus faecalis v583
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
SNAMDISVIDATKVNTETGLHIGESNAPVKMIEFINVRCPYCRKWFEESEELLAQSVKSGKVERIIKLFDKEKESLQRGNVMHHYIDYSAPEQALSALHKMFATQDEWGNLTLEEVATYAEKNLGLKEQKDATLVSAVIAEANAAHIQFVPTIIIGEYIFDESVTEEELRGYIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a conserved hypothetical protein from Enterococcus faecalis V583
rcsb
molecule keywords conserved hypothetical protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Enterococcus faecalis
total genus 57
structure length 175
sequence length 175
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.1200.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A DsbA-like domain 1z6mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1z6mA01
3HZ8A 1EV4A 3IC4A 1AAZA 3TRQA 2GZYA 1G7EA 3AY8A 1W4VA 2ZNMA 1ZL9A 4LMWA 3M9JA 5G31A 1NHYA 1FVKA 5LD0A 3KEBA 1R7HA 2YCDA 1H75A 3CSHA 1V2AA 2XC2A 4LLRA 3UAPA 5DQSA 2IJYA 2LTKA 5IO0A 5IPHA 4K0NA 4J2FA 4POBA 2H73A 5CO3A 1GRXA 1V9WA 1TRVA 2YP6A 1RW1A 3G7YA 3LYPA 1PRXA 2JSYA 3F9UA 1G6YA 2BMXA 1UC7A 1OC3A 1F2EA 3IBHA 3LG6A 3RDWA 1PMTA 4JR6A 3FZ5A 4OFNA 1HYUA 5ID2A 2VCZA 1KBNA 3M8NA 2DJ3A 4V1Ap 4GRFA 2FLSA 4HJ2A 3MAKA 4POKA 1GUMA 2PPTA 3VWVA 4WBRD 4G9HA 2N5AA 2GDRA 5GZZB 1TDIA 4G10A 2VCQA 2YJ7A 2V41A 4Q5RA 1Z7RA 3EYTA 1QQ2A 4WXTA 1A24A 3C7MA 6GSXA 2I81A 3M1GA 4RQXA 3G9BA 5ECKB 2R37A 2HI7A 5AISA 1O81A 5HR0A 1VRSD 2OBKA 2HZFA 4I6XA 3QAVA 3QDNA 2FA4A 3I69A 4POMA 1XXUA 4ZBBA 5IMZA 2GS3A 1NHOA 3GTUB 4KGIA 2HT9A 2H76A 1T7PB 5ECMB 1YQ1A 4MA9A 4MMMA 1T4ZA 1WMJA 4ZB9A 4RI6A 2XHFA 1SU9A 3L4NA 2YOIA 1ZOFA 3KMOA 3CTFA 5G1LA 4I97A 2AYTA 2H0HA 2M46A 2YNXA 2NBSA 2L4CA 4YQVA 4K1FA 4CHSA 2EIQA 3J7Yk 4JRRA 3F3RA 1F9MA 1OC8A 2QC7A 4F2IA 2KLXA 2B5XA 3GSSA 5D9VA 2JZTA 5DJMA 3GHAA 3HVSA 4JE1A 20GSA 1IYIA 2GT6A 2JACA 3TJJA 1TXXA 2D2ZA 3RBTA 3R2QA 3FR3A 1WWJA 3APQA 4MPGA 3CRTA 4HI7A 3EMPA 2RM5A 4MJAA 1JZRA 1A23A 4TW5A 4GTUA 3IXRA 3TKSA 3DYRA 3W8SA 1NSWA 4EKZA 1URMA 5EVOA 3H4KA 2OBIA 2MBSA 4HQZA 2DBCA 2GZZA 4XIHA 1YEXA 3ZREA 1GH2A 3H93A 1M2AA 5INYA 2OKAA 1HQOA 2IN3A 5A5KA 2M72A 4IELA 3Q74A 1GLPA 4G19A 1SKSB 1YKAA 1GTBA 1TP9A 1BQ7A 2DMLA 4KH7A 3TCOA 3QFAC 1SJIA 3QAGA 3EC3A 1Q98A 1F6MC 4IS0A 2NTOA 3MDKA 1SK2A 1UA5A 2FNOA 4MZWA 2MBTA 1GLQA 1V40A 3D22A 1FB6A 3GKKA 1PQNA 1VF2A 3BBYA 5IOXA 3VURA 3WT1A 3HKRA 2VLVA 4HJMA 5J9BA 1M99A 4I8BA 2A2SA 5CP1A 5CREA 5DBQA 1JLVA 4TR0A 3TKSE 2PMTA 3D21A 3A2XA 3ZYWA 1GSDA 4YQMA 4TKYA 1XWAA 1V98A 2VLTA 4GLTA 1SYRA 5HR3A 4MH2A 4ML1A 4TR1B 2C3NA 2WB9A 2VM2A 4MCUA 4E8HA 3OR5A 4P3YB 4XS4B 3D5JA 3KIJA 5GSTA 2H6ZA 3GH9A 18GSA 3LGCA 3U6VA 1S3DA 1PGTA 2H66A 4QQ7A 1WRYA 5KN1A 2GTUA 3QR6A 6GSVA 4KDYA 1GUKA 1GNEA 4XCSA 5H5SA 2YANA 4TR1A 3KTLA 2CVDA 3LORA 5COHA 3FZ4A 1YKCA 4FH8A 1TOFA 1SYXA 1CQGA 1OKTA 4PUFC 4XS6A 1PL1A 1N2AA 3IK9A 1GTAA 4DEJA 5KN2A 1G7OA 2VO4A 1USBA 3WYWA 4L5OA 4K8MA 3ZVJD 1VF1A 1O6JA 3W8JA 2WRTA 2H1BA 4I5QA 4MABA 1XCCA 17GSA 2B1LA 5DALA 2CX3A 3DVWA 1ERVA 2V32A 5J4UA 3C71A 3FYGA 3HJMA 1TU8A 1A8LA 3GUSA 5J9CA 2YZHA 2HE3A 4MZCA 3QOUA 1YEPA 3SWLA 3LWAA 3VFIA 3DXBA 1TRUA 2H75A 2R5GA 4E8EA 2MZCA 1JLWA 1RQMA 1EGRA 3GL3A 2J23A 5DDLA 3FKFA 2O87A 2VLUA 4KSMA 3UARA 2ZCTA 4O32A 2O89A 2P5QA 4XRDA 4XRAA 1YJ6A 2H6YA 1GULA 1FW1A 1Z9HA 2KP1A 1XWKA 2B7JA 3EU3A 1GSYA 2KHPA 1SD8A 1BG5A 3S9FA 2C8UA 2E2GA 5ABRA 2BTOT 4F0CA 1X9MB 4HU7A 4HZ4A 1TKDB 5ELAA 1J08A 1EEMA 1T4YA 2V2GA 3FHKA 2BJXA 2NDOA 3BD2A 2QKEA 2GSQA 5G5EA 5EL8A 3IDVA 3RPPA 2L5OA 4WR4A 5A4VA 4AJ6A 2NPBA 2CX4A 1T1VA 2YWMA 4XTSA 1MD3A 4L0WA 3CSJA 3A2WA 4WF5A 4ML6A 4JZQA 3D4MA 2PVOC 1PSQA 2ON7A 3A3TA 2MYGA 4DSRA 2XPDA 2IWTA 2RUFA 3M0FA 4JU5A 1K0CA 4OFMA 3GRXA 5ECHB 1GL8A 2K8VA 2VCTA 3WD6A 5IMCA 5G1KA 2LRNA 1Z6NA 3KCMA 3PINA 3GL5A 2IL3A 13GSA 2X8HA 4FIWA 3ME7A 5ECLB 3F6FA 1MD4A 5HFIA 2WZ9A 4TXOB 1MDKA 2LS5A 3DWVA 2JU5A 2YZUA 2JADA 1B8XA 5D8IA 2VD0A 2R2JA 2ZUPA 3WT2A 4IJ3A 2KUCA 5HR1A 2N5FA 3C8EA 3W6GA 4DSQA 4ECCA 3HZ4A 4PUAA 3FK8A 3G7IA 2OJLA 2PGTA 1PKZA 2IMDA 2VCXA 1BEDA 3IPZA 5FT3A 3D0ZA 5G30A 2YWNA 3KTBA 4TXOA 1K0AA 3H79A 2CA8A 14GSA 1TI3A 5J41A 3ZTLA 1GTUA 8GSSA 2FA8A 4IP6A 2CZ2A 1SL1B 2DLXA 3CRUA 5LCZA 4IQAA 3ZMLA 2E2MA 1XW5A 6GSYA 1OE8A 2A4VA 5ID2B 3GKNA 2FGXA 1MDJA 1R5PA 2G0FA 3WGEA 1B9XC 1IYHA 1GSSA 1FHEA 4X1UA 2GZPA 3ZFBA 2H74A 3ED3A 3HVXA 2YN1A 4EF0A 1X5EA 3VPTA 2B7KA 5DVBA 4TRXA 1XW6A 1EGOA 1V57A 2H0GA 4MJBA 2X99A 5ECSA 2DJJA 3L9VA 3VI5A 4V1Ag 5C04A 1YDKA 5F05A 1AQVA 2H1GA 1ST9A 1O8WA 3P7XA 3C1RA 1GWCA 4I2UA 2JL4A 4GCIA 3ZRDA 4FYBA 5IMFA 6GSSA 1F3AA 3VLNA 2K6VA 1EZKA 2I3YA 2FHEA 2HLSA 4AJ7A 1A2LA 1FAAA 5JWRB 2EC4A 1SK0A 4V2LA 1K0OA 5KEJA 1C72A 3BOAA 2IMEA 3IHQA 1A0RP 5GSSA 1M2BA 5D96A 4IGJA 2DJKA 3GURA 4EDYA 4XS1A 2IIYA 4NPBA 4GQFA 2HNLA 1TK5B 1KTEA 1MTCA 3MNGA 3C1SA 3GKXA 2H0IA 1K0NA 3DEXA 2F9SA 4ID0A 3P90A 3ZL5A 1K3LA 2V1MA 1A8YA 11GSA 4I2TA 5JCWA 3U5RE 1X5DA 1SKRB 3VWUA 5GAPD 3HVVA 3EE2A 2MMZA 1GUHA 2C0DA 2GQKA 2YJHA 3UL3A 1FO5A 4OD7A 4N0ZA 3UBLA 3FR6A 4IW9A 3KMNA 1QUWA 2G2QA 1AC1A 1FOVA 1O85A 3FW2A 1ZCPA 4ZXGA 3NOFA 3EWLA 3WGDA 2I4AA 1AXDA 2OE1A 2PN8A 4PNFA 4KDUA 3O6TA 4EXJA 1U3AA 1S3CA 5ENUA 4NMUA 2PUKC 4MDCA 4MLYA 1QGVA 1WPIA 2WULA 1RK4A 1X5CA 1XVQA 5ECQB 3IE3A 1CQHA 2GSSA 2LJAA 3VI7A 2B5EA 2P5RA 1GSEA 2I1UA 3K8NA 4DSSB 5D73A 4BVYA 2X8CA 1PX6A 4OWYA 4IVFA 2PERA 2RUEA 2H1DA 2V6OA 2LRTA 1BJXA 1G0TA 1SJZA 2EIOA 3JCML 3IRAA 4KCEA 4KW6A 5AGYA 5F0GA 5C00A 1EOHA 2FWEA 2FWFA 1A0FA 4MK3A 1OE7A 2VAFA 3GV1A 1U6TA 3LJRA 4MH3A 2LSTA 4IBPA 2B5YA 4DSSA 3EURA 1DBYA 3TOUA 1DUGA 1O73A 2N5BA 2VM1A 3HDCA 2C3TA 4HUAA 5B6NA 2YV7A 5B6MA 4Q5QA 1FB0A 4NWYA 4IJIA 4OFTA 3HY2A 3Q6OA 4WKWA 1F3BA 1PX7A 3KJYA 3ERFA 3ZMKA 4PNGA 3EVIA 3M9KA 1B48A 4ZL7A 1J0FA 2PBJA 5HR2A 5G2ZA 1LU4A 1JZDA 2IFQB 4MF7A 1M9BA 2R4VA 2HZEB 3APOA 5DCGA 2F3MA 2VL3A 3TDGA 3I6AA 3LXTA 4TOPA 3VWWA 4MP4A 1ZYQB 4D73B 1XOAA 1OVNA 3RHBA 1AQXA 2V6KA 4Z7XA 3VWXA 4L5LA 1X0RA 1TW9A 2C0GA 12GSA 5IO2A 5DALB 1ML6A 2C80A 4ZBAA 4G2EA 1XPVA 1B9YC 2IFQA 5E59A 3QFBC 3CMIA 2HZEA 3IR4A 5KN0A 2XPEA 3GX8A 4PQHA 2WDUA 4L8EA 1QK8A 3FRCA 5HQPA 1TTZA 3HYPA 4D73A 4LL1B 3IA1A 2CVBA 2C4JA 2O8VB 4H86A 3ZITA 3HD5A 3DKSA 1ERTA 3TB2A 2C3QA 4GSNA 2JZSA 3TJFA 5CNWA 4NHWA 3LFLA 3UMAA 5E4WA 2LRCA 3LXZA 1SL2B 2YWOA 4F03A 2TRXA 4Q5FA 4EE0A 4O92A 4BVXA 3DRNA 3H1NA 3HJOA 1ZZYA 3GFKA 5D9XA 4EVMA 1ERWA 4CDOA 2MMAA 5H5QA 2C1YA 2CV4A 2FWGA 3E9JB 1A2MA 2FWHA 3KD0A 3HXSA 1Z6MA 1B4QA 5HFGA 2HSYA 1YF0A 4ISDA 1XW9A 3GN3A 3QAWA 5ELGA 4ZB8A 4K7NA 2QSIA 1EOGA 5ECNB 3TOTA 5B8BA 4BL7A 2DJ0A 1SJ6A 3N9JA 3IK7A 4YQUA 2L6DA 1THXA 1YY7A 1JHBA 2WFCA 2LKUA 3PGTA 3ISOA 2VOCA 5F07A 3F6DA 3TRPA 1YF1A 3GYKA 3HHVA 4ZILA 3QPMA 1FG4A 2L5LA 4CW9A 4BA7A 4MZBA 2GQLA 3KXOA 1JZOA 4JEDA 2LEGA 2K9FA 1V58A 2AUVA 3F4SA 4NAXA 2H8LA 2GGTA 2O7KA 3GA4A 4EDZA 1PA3A 2CAQA 2IMFA 1OC9B 1EP7A 2H1AA 3MSZA 5IMVA 2F8AA 4WEYA 6GSUA 2OADA 6GSWA 2CQ9A 3KP8A 3KH9A 1FVJA 5KN3A 4QL9A 3N5OA 5A4UA 1R4WA 3UVHA 4TN8A 4J57E 1SK1A 1K3OA 3TJKA 5CAXA 2ES7A 3ZFLA 3LSZA 1SD9A 1BYEA 5J5NA 1OC9A 1K0MA 3L9SA 4PQIA 3F8UA 5AN1A 4NV2A 4LL4B 3KM6A 3GMFA 3KZQA 1XWBA 3E3EA 1PKWA 4HQSA 1G6WA 4L0UA 2AJQB 3CYNA 1TRSA 2JSZA 4HDEA 1MDIA 3DMLA 5DAKB 2VIMA 1GTIA 2VL9A 4KCAA 1XBSA 1XWGA 5ECPB 1PD21 2IPAA 1R26A 1TI1A 5LNKe 1ZMAA 1TK8B 1AIUA 3G7JA 2B3SA 3DVXA 3CXGA 3IAS2 2KP2A 3TKQA 2PU9C 4IHUA 5DAKA 5CRWA 2H6XA 2K8SA 4PXOA 3US3A 2ON5A 2VCWA 1Q4JA 2O85A 4IN0A 1U88A 2YWIA 3EMXA 1ZYEA 1PL2A 5F8BA 3LQ7A 4F0BA 1SENA 4YAVA 2YV9A 3F63A 1GSFA 2FUG2 1T00A 1XWCA 4ILFA 5ECOB 3O3TA 3GH6A 4K0GA 2H72A 4O5RA 2K18A 4KA0A 2VD1A 4TR3A 2AAWA 3I43A 2ALBA 3PH9A 3V1WA 3IOSA 3LYKA 2LJKA 3ZVJA 3PR8A 4KDXA 3TKPA 2TIRA 2B6MA 2X64A 1LBKA 4GXZA 4OCEA 4OCFA 2C0FA 4ZL8A 4V2NA 2P0GA 2FCHA 1JZWA 3GIXA 1TK0B 1UN2A 5CRGA 1TU7A 2DJ1A 3TRXA 2VL2C 3NZNA 3F3QA 3P2AA 1BAYA 1XVWA 4ECIA 2GVPA 5GAND 4KAEA 2LQOA 1Y25A 1ON4A 2H70A 2WJUA 4MJEA 4NXIA 2OACA 1X9WB 2DIZA 1WOUA 1VGLA 4JBBA 2CT6A 4N10A 3UJ1A 2H01A 1ILOA 2H19A 4BWSA 2WS2A 2GT5A 4IP1A 2MMOA 4HZ2A 1DE2A 3ZZXA 5IM9A 1O7UA 2J9HA 1X9SB 2L59A 3D4TA 4FO5A 1AW9A 2JZRA 5FWGA 3TGZA 4F9ZA 5EY6A 5CYYA 3L9UA 1A2JA 3EU4A 1NM3A 4WETA 2HRFA 3UVTA 4ZIJA 3HA9A 3O76A 1TJDA 3GTUA 3E0UA 4POLA 3GNJA 4YAPA 2PVQA 2WGRA 1TRWA 2LNSA 1GP1A 3ERGA 5AIVA 2L6CA 16GSA 5EPFA 3BCKA 1LJRA 4EC0A 1E6BA 4HU9A 4EO3A 2GSRA 2A2RA 4F82A 3WGXA 4K9ZA 1DE1A 3HCZA 2P31A 4ECBA 4YH2A 2KOKA 4IQ1A 4X0XA 2F51A 5FHIA 1E2YA 19GSA 3FZAA 3VK9A 4GSSA 3CTGA 1AUCA 1F37A 4WF4A 1OYJA 3L0HA 4AF2A 4TVEA 4GWRA 2Z9SA 3L78A 3QMXA 1M7TA 2AHEA 4GQCA 4MJCA 4NHZA 1K0DA 2DIYA 4J56E 5CRDA 5IMDA 2R3XA 4N30A 3VPQA 4N11A 5JCUA 2CZ3A 3ZLPA 1MEKA 1N8JA 2LV3A 2WCIA 1OKDA 1QXHA 1YZXA 1GNWA 4MPFA 4OMVA 3UIWA 1BX9A 4ECJA 3FZ9A 1QFNA 2X8GA 1I5GA 2XBIA 4XHMA 3TJBA 4EL1A 1M9AA 1EP8A 4K7OA 2DC5A 2VCVA 1K0BA 3ZIVA 4PURA 5IQYA 5H5RA 4ACSA 2RIIA 1VF4A 1XOBA 2LJRA 1U87A 5CRHA 3A2VA 3DD3A 2L57A 2DMMA 4N0VA 1SL0B 4V2MA 3Q19A 2CAIA 4OO5A 2REMA 5F06A 1THOA 3KH7A 1HNAA 1KEBA 5AIXA 3GX0A 3Q18A 4BPYA 2B1KA 4KX4A 5DJLA 1ERUA 3BJ5A 1T8EB 7GSSA 1XIYA 1ABAA 1B4PA 3D6IA 4KB3A 3IV4A 2HSHA 3RAZA 2LQQA 2HFDA 3J7Yb 2LNTA 3BCIA 2R6KA 2IMIA 3F4TA 2HRNA 1ACVA 3C73A 2AB6A 3RPNA 4PGTA 3ME8A 4KE3A 2AV4A 4K2DA 2OA7A 5JWQB 1DSBA 2MMNA 4RI7A 1M2DA 3CSIA 4ZB6A 2GSTA 3CBUA 4DVCA 4LA1A 2VUPA 3TUEA 22GSA 2VL2A 4FYUA 4XS4A 2E7PA 1KNGA 4K7IA 4ZL9A 2PWJA 4KUNA 1AQWA 3KGKA 1ZGNA 4HEA2 1GSQA 4ULXA 3SBCA 2FY6A 2CVKA 3UBKA 1XZOA 1Z7PA 4TXVA 3F4RA 2DSAA 1WP0A 9GSSA 1SKWB 2OE0A 1OAZA 4Q5NA 3I9V2 4K6XA 2H71A 3MWHA 1Z5YE 3GKMA 4O7HA 2H30A 4HOJA 3FR9A 2DJ2A 1EWXA 2F8FA 4WR5A 3TJGA 3RHCA 1WJKA 5IPGA 5D9TA 4PQ1A 3ERWA 1EV9A 2E0QA 4RUVA 5ECRB 5IOWA 5A4WA 2EIRA 4BWQA 1Y6EA 3DIEA 3DGQA 2C0EA 3HJPA 2NVLA 1HNCA 3H8QA 3TKRA 1W89A 2TRCP 4MF6A 1I9DA 5IIZA 3KP9A 1O8XA 2I9HA 2RLIA 5HFKA 5JCGA 4AJ8A 5J3RA 4HS1A 1T3BA 3A5WA 4JR4A 5DQYA 1XFLA 1JFUA 1HNBA 3P8WA 2IMKA 4LMVA 5IMAA 4KSOA 2L4QA 4GSTA 2M80A 1J9BA 1WE0A 5DCHA 1R5AA 3ZIJA 2HYXA 1U3IA 3NIVA 4PX1A 4FYCA 4AGSA 1GSUA 1UVZA 3IAM2 2QGVA 4QL7A 5B7CA 4TR4A 5D93A 3GSTA 3FY7A 4EUYA 1VF3A 1QMVA 2GLRA 6GSTA 1Z3EA 1EEJA 3LEFA 3QD9A 3M3MA 2HXKA 1K3YA 5D9WA 3FEUA 4WBJA 5G5FA 1PN9A 4ZBDA 10GSA 4IKHA 3QCPA 1S3AA 4MF5A 1HD2A 2YPMA 4RQRA 1M0UA 2FD3A 5B8AA 3TKSC 2RM6A 2XBQA 2LUSA 3F0IA 4KNDA 2OE3A 3APSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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