1Z6MA

Structure of conserved protein of unknown function from enterococcus faecalis v583
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
SNAMDISVIDATKVNTETGLHIGESNAPVKMIEFINVRCPYCRKWFEESEELLAQSVKSGKVERIIKLFDKEKESLQRGNVMHHYIDYSAPEQALSALHKMFATQDEWGNLTLEEVATYAEKNLGLKEQKDATLVSAVIAEANAAHIQFVPTIIIGEYIFDESVTEEELRGYIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a conserved hypothetical protein from Enterococcus faecalis V583
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Enterococcus faecalis
molecule keywords conserved hypothetical protein
total genus 57
structure length 175
sequence length 175
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.1200.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A DsbA-like domain 1z6mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1z6mA01
9GSSA 1PL2A 1JLVA 1TW9A 2LJKA 3KEBA 1GL8A 5CNWA 1PGTA 4ZBBA 2WZ9A 2C80A 4IQ1A 1K0OA 2LRNA 5IO2A 4DSSA 1O73A 1XW9A 2LQOA 3O6TA 3TJJA 2NBSA 2FY6A 2E2MA 5KN2A 4E8HA 5DAKB 1XFLA 4MF6A 4JR4A 5A4WA 1BX9A 2LNSA 2KLXA 5H5RA 3CMIA 2YOIA 1XOAA 3GRXA 1SL1B 3C73A 3UVTA 2B6MA 2GVPA 3F0IA 2H1BA 2B5YA 1G6WA 1WOUA 3GFKA 2H73A 2B7JA 2VL2A 5IO0A 3UMAA 2MMAA 3KTBA 5HFGA 2N5BA 4EL1A 1SJZA 4MH3A 1GTAA 4D73B 4PX1A 5JWQB 3N9JA 1JLWA 2L5OA 2NTOA 4NMUA 1G7EA 1TKDB 5IMAA 4RUVA 5A4VA 1DBYA 5F8BA 1HNCA 3EURA 2GQMA 1ON4A 3IRAA 1OC9A 3TGZA 4ZBDA 2I1UA 3JCML 5J9BA 1QUWA 3M1GA 1OKDA 2RUEA 1FW1A 5H5QA 3VURA 4L5LA 4O5RA 3LFLA 1R7HA 2AYTA 4HS1A 3KP9A 1K3LA 5GZZB 5LNKe 1PX6A 2JADA 2VL3A 2HZEA 4I8BA 3TKRA 3HCZA 5HR0A 2LJRA 2GZYA 4MCUA 3HYPA 5G31A 5GSTA 2J9HA 4NXIA 5CO3A 5ENUA 4LLRA 1S3CA 14GSA 2DMMA 3N5OA 1K0DA 1Z7PA 1O8WA 1YY7A 4JBBA 1R5PA 1CQHA 2VL2C 11GSA 2L6CA 3TOUA 5CYYA 1GUKA 2H01A 3LJRA 2FA4A 2O8VB 2ZUPA 16GSA 2J23A 4AJ6A 2CV4A 5JCWA 4K0NA 1B9XC 3ISOA 4IS0A 4DSRA 1PKWA 2DIYA 3F3QA 4XRAA 4IP6A 3RDWA 2GQLA 1F3BA 1U87A 4OFTA 1EV4A 2GQKA 4TOPA 1M9BA 4KDXA 2V6OA 2FA8A 3FEUA 3CRUA 1YF1A 4PNFA 2ALBA 2YZUA 2K8VA 3UBLA 2I81A 3ERGA 4TR4A 3GA4A 5CREA 3IAM2 1SJ6A 2ON5A 2I4AA 3HD5A 1XW6A 1Z7RA 4GSSA 1XXUA 1SD9A 1O7UA 1HQOA 4TR3A 1KBNA 4LL4B 2FWHA 2WGRA 3HZ4A 2H0HA 2H6YA 3A2WA 2CQ9A 1T3BA 4ZL8A 2PERA 3FZ9A 5ECOB 3Q18A 2H30A 3F6FA 4F0CA 3FK8A 5AN1A 3I43A 19GSA 3NIVA 1IYIA 2OADA 3KZQA 5DQSA 4NHZA 8GSSA 1B4PA 3IC4A 1PRXA 1PL1A 1AXDA 2C0EA 1SYRA 2YWNA 4IW9A 1EGRA 1VF4A 2NPBA 1B4QA 4WXTA 2CX3A 1YEXA 4TXVA 5G5EA 2OBIA 4EXJA 5AISA 2FNOA 22GSA 1GTIA 3DIEA 3SBCA 2A2RA 5JCGA 3VI7A 4GXZA 1FB0A 2OKAA 2R6KA 1TDIA 2OA7A 4OD7A 1UC7A 3RHCA 1QK8A 3MNGA 1AAZA 4CW9A 4OMVA 4P3YB 3E0UA 3KMOA 5D9VA 1GLQA 2H72A 3FR3A 3BCIA 2YWIA 3APOA 2PVQA 3GNJA 3D4MA 2LJAA 3G7YA 5DALB 4TR1B 2N5AA 3WGXA 4IN0A 4EUYA 2KUCA 1DE1A 3UVHA 4ML1A 10GSA 4PUAA 2HSHA 2H1DA 4JE1A 1PN9A 4XS4A 3W8JA 5J4UA 2GSSA 2P31A 3TDGA 1XWCA 5IMZA 4CDOA 1HYUA 2C0FA 2YP6A 3IDVA 1DE2A 1ML6A 5ABRA 4AF2A 1B48A 2L4CA 3O3TA 3AY8A 4BA7A 3HY2A 3G7JA 3L9SA 3H8QA 2IFQA 2PWJA 1S3AA 2LUSA 1FVJA 3F8UA 5C00A 2B3SA 1GSQA 3GV1A 1T4ZA 4IQAA 3D0ZA 4WR4A 2B7KA 3MAKA 1KNGA 5JCUA 4MDCA 5B8BA 4POLA 4ZL7A 2G2QA 2FWGA 3MSZA 5D9TA 2NVLA 1WJKA 2HNLA 1HD2A 3VWXA 1BYEA 1AUCA 1XWKA 2JSYA 3D5JA 5CAXA 4IJ3A 2P0GA 3QFBC 3QFAC 4X43A 5JWRB 12GSA 3CRTA 4Q5NA 3HKRA 2LRTA 5GSSA 5G1KA 1X9WB 2WJUA 1GSEA 3Q6OA 2OE3A 4NV5A 3ME7A 3FKFA 3QCPA 3KP8A 4IVFA 3FZ5A 1TXXA 3LORA 1G6YA 4FO5A 2DJ2A 3NOFA 5EY6A 3QAVA 1MTCA 4EKZA 4K1FA 1A0FA 1T4YA 4Q5RA 4ZILA 4G10A 4KDYA 6GSVA 2TIRA 2JSZA 3CSIA 1ERUA 5ID2B 5KEJA 1ERWA 2CVBA 2DJ3A 1XWGA 2WCIA 2GZPA 3SWLA 4MJEA 4H86A 5D73A 3TRPA 2MMZA 4K8MA 1G7OA 5A5KA 1MDJA 2TRCP 2CA8A 1PQNA 4MABA 1SK2A 2DJ1A 4RI7A 2GSTA 1YKCA 5DJMA 3UBKA 3F3RA 3BBYA 2EIRA 1Z9HA 3A2XA 4NHWA 4HJMA 3L9VA 3UEMA 5J9CA 4EDYA 18GSA 3EYTA 3TB2A 1T7PB 2P5RA 1OE8A 5B6MA 5J5NA 13GSA 1E2YA 4G2EA 1LJRA 1Z5YE 2X8CA 1YDKA 2PUKC 4RQRA 3TKSE 3F4SA 1YKAA 1SL2B 3DVWA 3VWWA 4V2LA 2AUVA 1E6BA 3P8WA 1NHOA 4TW5A 3GIXA 4ILFA 1F3AA 4X1UA 5GAPD 3LYKA 4LL1B 1BEDA 1F9MA 2Z9SA 1TK8B 5G5FA 5CRDA 4KH7A 4IBPA 4K7IA 5ECMB 2JZTA 4KDUA 4MPFA 1USBA 3ZMKA 3KCMA 1GNEA 2KHPA 4IGJA 1OC9B 3GKKA 1LU4A 2F9SA 2H19A 2LSTA 3KM6A 1ZOFA 4ECCA 1FO5A 1B8XA 3O76A 3I9V2 4MJCA 2WULA 4Q5FA 4KAEA 4AJ7A 1V9WA 4O32A 4LA1A 2PVOC 3ZL5A 3PINA 2PBJA 1PMTA 1GTUA 4KB3A 4MPGA 5B7CA 4V2NA 2EIOA 4ML6A 4GCIA 2HYXA 1EEJA 5A4UA 3IBHA 4KW6A 1OE7A 1JHBA 2WB9A 2GLRA 1QQ2A 3H79A 1CQGA 1ZYQB 1TRVA 1ERTA 2VCZA 1S3DA 1FAAA 4K2DA 4FH8A 1PA3A 2PPTA 2LRCA 4EF0A 5IPGA 3C71A 3IK7A 2IJYA 3BD2A 3KIJA 3MDKA 4XS1A 4HQSA 1EOHA 1WPIA 1AQWA 1XZOA 3DMLA 1U3AA 4O7HA 3GH9A 5CRWA 4OCFA 1TI3A 3IAS2 3KH9A 3GTUB 1N2AA 2IMKA 1ILOA 1OKTA 4KA0A 3FW2A 4HOJA 3GN3A 2OJLA 2F3MA 3IPZA 3QD9A 1YF0A 1SL0B 5IOXA 1TRSA 2HT9A 4OO5A 1SD8A 3D22A 1OC8A 1TTZA 2JZRA 4HZ2A 5ECLB 1AQVA 2OE1A 5D93A 2F51A 1QGVA 2H71A 1W89A 1XW5A 1SK0A 3EWLA 4PGTA 2YV7A 5DAKA 3TKPA 2K8SA 3APQA 5D96A 2P5QA 2B1LA 3HVVA 3GHAA 2E2GA 3D6IA 4GSTA 1JZWA 5F05A 3ERWA 3EU4A 1GWCA 4KE3A 1JZRA 5DQYA 3GL3A 4AJ8A 1XVWA 4L8EA 2C0DA 5AIVA 3UOMA 5ECIB 3UL3A 2FLSA 1TOFA 4ZIJA 2VD1A 2GT6A 2CAIA 3EE2A 3LSZA 4ZL9A 1A23A 3RPPA 4PURA 5AIXA 3TKSA 2K6VA 2FGXA 3IE3A 3ZRDA 1ST9A 4MF5A 1EOGA 4BL7A 4XHMA 3A5WA 2M80A 2O85A 2BMXA 5CP1A 2QGVA 4MK3A 4D73A 3GKXA 4EE0A 3W6GA 3LGCA 3TRXA 3LXZA 2X8HA 5F0GA 2K18A 1Y6EA 4EDZA 3PR8A 3DRNA 4F0BA 4MZCA 3FZAA 3VWVA 1X0RA 4XS6A 3HDCA 5IOWA 2YWMA 3EINA 3UAPA 4IP1A 3QR6A 4XCSA 3M3MA 3HXSA 1MD4A 4WF4A 1VF1A 2PU9C 2YN1A 6GSTA 1WMJA 3EU3A 3GUSA 3ZMLA 5HQPA 4MZWA 1A8LA 3I69A 3L9UA 1GP1A 1FVKA 4I2UA 1SU9A 20GSA 3QOUA 2GS3A 3KD0A 3H4KA 2YJ7A 2OE0A 2JZSA 3ZVJA 1IYHA 1SKRB 3HJMA 4ECIA 3KGKA 4FYCA 4PQIA 4ZXGA 2V41A 3ZITA 4XTSA 2DJJA 2V2GA 4ECBA 2ON7A 4V1Ap 3KH7A 2CAQA 1TU8A 1YQ1A 1XCCA 3W8SA 3TKSC 3BJ5A 2X64A 2E0QA 1OVNA 1VF2A 3C1SA 2VO4A 3F4RA 4J57E 4HI7A 4K7NA 2WS2A 3F63A 1C72A 4KNDA 1AC1A 4CHSA 1W4VA 2VLVA 4AGSA 3ERFA 1K0NA 5DCGA 3KMNA 4DEJA 2H76A 4G19A 3EMXA 3ZVJD 4RI6A 1I5GA 1WIKA 4TRXA 4TXOB 5IMDA 3TJFA 4I6XA 4POBA 4JRRA 1PSQA 1YEPA 3CSHA 1MD3A 2LKUA 3WT2A 3ZIVA 1WRYA 5D9XA 2C8UA 2CVDA 3FR6A 4PQ1A 3P7XA 4HDEA 4NAXA 5ECNB 1QFNA 3C8EA 2YCDA 1VRSD 4LMVA 2MMNA 4NPBA 3M9JA 4TR0A 1PKZA 1SYXA 3D4TA 1J08A 3DXBA 1R5AA 4YAPA 4GSNA 5ECQB 2HXKA 1FOVA 2H0IA 4BWQA 4BVYA 3VFIA 3HHVA 2ZCTA 3ZREA 1GNWA 4V1Ag 3J7Yb 1TP9A 4I2TA 3HA9A 3VK9A 2REMA 3QAWA 1BAYA 4F9ZA 1TI1A 1UN2A 4N0ZA 5F07A 1AW9A 4PQHA 1Z3EA 3ZFBA 3HJOA 4DVCA 2R37A 2LNTA 2H6ZA 2RM6A 3GSTA 3F4TA 4HUAA 3V1WA 3CXGA 3GSSA 3GX0A 1DSBA 1TK0B 1K3OA 2R3XA 3QPMA 4K7OA 1EWXA 1XWBA 4KGIA 2GTUA 2V32A 2LTKA 5E59A 3TCOA 1EEMA 1BQ7A 1HNAA 2C3NA 2HI7A 4WBRD 2MYGA 2VUPA 3BCKA 2XPEA 3CYNA 3KXOA 1R4WA 2PMTA 1MDKA 1T1VA 2LEGA 5DALA 1GTBA 1VGLA 4QQ7A 2EIQA 5HFIA 3LQ7A 1ZGNA 2AB6A 2I9HA 4OO4A 3GKNA 3WYWA 5J3RA 1EP7A 3A3TA 1SENA 4POMA 2FHEA 1TK5B 3G7IA 4YQUA 1ERVA 2IMIA 2YANA 3VPQA 1LBKA 1ABAA 4DSSB 3DVXA 1A0RP 3DYRA 3H93A 3M9KA 1F37A 1GH2A 2VM2A 3APSA 4MZBA 5IIZA 5F06A 2LS5A 2A2SA 3TOTA 1URMA 5FT3A 3WT1A 2LV3A 2NDOA 1X5EA 4MH2A 3IOSA 5G30A 3LWAA 1SKWB 3BOAA 2DLXA 4PUFC 1A2LA 7GSSA 4OFMA 1V40A 1QXHA 2G0FA 4HQZA 3F9UA 5C04A 2ES7A 2B5XA 1KTEA 1K0AA 1F6MC 2I3YA 3GKMA 4MLYA 3ZFLA 1AQXA 1SJIA 3L4NA 1AIUA 3FZ4A 4WEYA 2X8GA 3DEXA 3CSJA 4WF5A 4GF0A 1NSWA 1WE0A 3IA1A 1EZKA 4ZBAA 2QSIA 5ECHB 1M7TA 6GSXA 1Z6NA 2O87A 4XRDA 2VM1A 5KN0A 2HRNA 5ECPB 2DJ0A 4J2FA 1FB6A 3GYKA 3IK9A 2L6DA 4IHUA 3FYGA 4HU7A 2FD3A 4Z7XA 1U3IA 2V6KA 6GSYA 4JR6A 4GRFA 3US3A 1A2JA 1RK4A 4L0WA 3H1NA 2HSYA 2JL4A 2HFDA 3ZIJA 3RHBA 3TKQA 1V58A 4MF7A 3HJPA 1DUGA 2H0GA 4N10A 4FIWA 5ID2A 4RQXA 5AGYA 2H70A 1X5CA 5ECSA 1N8JA 2BJXA 4PNGA 2VIMA 1H75A 3GX8A 3QDNA 1O85A 2HZEB 1K0MA 1GUHA 2OBKA 3IV4A 1O8XA 1GSUA 1GUMA 4ZB9A 3UIWA 3LEFA 1TJDA 3ED3A 4ECJA 4I5QA 3ZYWA 3DGQA 2VCQA 2C0GA 4PXOA 3VLNA 1GULA 1XWAA 1X5DA 4ULXA 2LQQA 2D2ZA 1J0FA 4E8EA 2IWTA 4O92A 2GZZA 3S9FA 2MZCA 2M46A 2R5GA 3LXTA 1ZMAA 1M0UA 4KSMA 5EVOA 1O6JA 2QC7A 2CVKA 2L4QA 3KJYA 5DJLA 3EVIA 3ME8A 5DCHA 2X99A 3IHQA 2O89A 2K9FA 2C4JA 5HR3A 2QKEA 1WP0A 4MMMA 1XBSA 5G2ZA 1XPVA 2AJQB 2B5EA 2H1GA 1GSYA 3U6VA 3LYPA 5DDLA 2XHFA 3OR5A 1O81A 2VCWA 2AV4A 3A2VA 4EC0A 3TJKA 4MJBA 2WDUA 1F2EA 1ACVA 3DD3A 3ZTLA 1T00A 1NM3A 4POKA 5ELAA 3K8NA 2EC4A 5CRHA 1I9DA 4ISDA 2HE3A 3QMXA 2GSQA 3M8NA 1OAZA 3D21A 5HR2A 4MP4A 1Z6MA 1V57A 3HVSA 2F8FA 2GT5A 2BTOT 3FHKA 2L59A 1ZCPA 3IXRA 1FHEA 2H74A 2M72A 3DKSA 3P90A 2VLUA 2H66A 2VAFA 5KN3A 1BJXA 3CTFA 2C1YA 3PH9A 1M2BA 2FUG2 1X9SB 4KX4A 1K0BA 2VCTA 3RPNA 1B9YC 4OCEA 5IQYA 3GTUA 1PD21 4BWSA 5D8IA 1YJ6A 3G9BA 2TRXA 2VLTA 2PN8A 5LCZA 4TN8A 6GSUA 3R2QA 4L0UA 3M0FA 1Q98A 4JZQA 4GWRA 3L78A 3KTLA 2L57A 2IMDA 4FYUA 1NW2A 1NHYA 2N5FA 1KEBA 2OACA 3DWVA 3VPTA 5IMFA 2VL9A 3UARA 4X0XA 3L0HA 1ZZYA 4YH2A 2IN3A 4XIHA 4QL9A 2AAWA 1YZXA 4ZB8A 4WBJA 1GLPA 2FWEA 2GSRA 3IR4A 2YWOA 3RBTA 3QAGA 3F6DA 2R4VA 2YNXA 1EGOA 1K3YA 4XS4B 1FG4A 2XPDA 2V1MA 1XOBA 4KUNA 2C3TA 2CZ2A 1WWJA 1Q4JA 2H1AA 2IMFA 5JWOB 3FY7A 1TRWA 2IFQB 2F8AA 1V2AA 3WD6A 2CT6A 4EVMA 1JZDA 3TUEA 3GL5A 2C3QA 1H4OA 1A24A 1M2DA 3E3EA 4K9ZA 4KCEA 3C1RA 4WKWA 2JACA 4JU5A 2KP1A 4KCAA 5G1LA 1JFUA 1JZOA 4NV2A 3FRCA 3WGEA 3I6AA 3PGTA 4GTUA 2GGTA 4MA9A 1K0CA 4GQFA 1U6TA 1SK1A 1XVQA 4N11A 3GH6A 1UA5A 3C7MA 3Q19A 4OWYA 1OC3A 2HZFA 2L5LA 5GAND 5IMVA 3LG6A 2B1KA 4KSOA 5INYA 2KP2A 4HU9A 1R26A 1RQMA 4IELA 4HEA2 1GSDA 1U88A 2KOKA 1MDIA 4G9HA 3HVXA 2MMOA 1THOA 3WGDA 1TU7A 5L71A 5H5SA 2VOCA 2VD0A 1XIYA 3EMPA 4L5OA 1T8EB 4GLTA 2HRFA 2IPAA 4JEDA 1M9AA 2YJHA 4LMWA 2MBSA 2WFCA 1TRUA 5ECKB 5HR1A 2DJKA 2DMLA 5KN1A 2XC2A 1MEKA 3VI5A 3RAZA 2DC5A 3MWHA 1V98A 2H8LA 4YQVA 17GSA 1QMVA 5CRGA 2RUFA 2AHEA 2ZNMA 4ACSA 3CBUA 4TXOA 5D9WA 1HNBA 2RM5A 6GSWA 3E9JB 4NWYA 2GDRA 4IJIA 4WETA 1M2AA 2IL3A 2IIYA 4ZB6A 3TRQA 5B6NA 1GSSA 2HLSA 4OFNA 4TR1A 5EPFA 5FWGA 4HJ2A 2YPMA 4TVEA 4FYBA 1A2MA 5LD0A 4GQCA 2YV9A 3FR9A 5COHA 1J9BA 2YZHA 2VCXA 5DVBA 2FCHA 4DSQA 4F82A 4V2MA 2RLIA 2A4VA 5FHIA 4F03A 1EV9A 2DBCA 4WR5A 6GSSA 1RW1A 2XBIA 2VCVA 5IM9A 3TJGA 1G0TA 1GRXA 5IPHA 2RIIA 1OYJA 5IMCA 3EC3A 1ZYEA 2CZ3A 4K0GA 3NZNA 5HFKA 2WRTA 2H6XA 2MBTA 5DBQA 2CX4A 1UVZA 2H75A 5J41A 2O7KA 4BVXA 2XBQA 3J7Yk 4Q5QA 1ZL9A 3CTGA 5E4WA 1BG5A 4HZ4A 4YAVA 2DSAA 4IKHA 1X9MB 1THXA 4EO3A 4MJAA 4F2IA 2R2JA 1Y25A 2E7PA 4QL7A 1A8YA 5B8AA 3Q74A 4N0VA 4N30A 3ZZXA 1M99A 3ZLPA 1PX7A 5ELGA 5ECRB 3P2AA 4I97A 4YQMA 2PGTA 4TKYA 4ID0A 2IMEA 1VF3A 1GSFA 3UJ1A 2DIZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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