The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
33
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sequence length |
137
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structure length |
137
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Chain Sequence |
MNFVLSDVADAEAEKAIRDPLVAYNLARFGESDKRDLNITIRNDDNSVTGGLVGHTARGWLYVQLLFVPEAMRGQGIAPKLLAMAEEEARKRGCMGAYIDTMNPDALRTYERYGFTKIGSLGPLSSGQSITWLEKRF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Crystal structure of putative acetyltransferase from Agrobacterium tumefaciens
rcsb |
molecule tags |
Transferase
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source organism |
Agrobacterium tumefaciens str. c58
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molecule keywords |
acetyltransferase
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total genus |
33
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structure length |
137
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sequence length |
137
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2006-02-17 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF13673 | Acetyltransf_10 | Acetyltransferase (GNAT) domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Up-down Bundle | Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces | Single helix bin | ||
Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Aminopeptidase | Aminopeptidase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YRE A; 1XE4 A; 2CY2 A; 2H89 C; 4CAX A; 4PSW A; 1MJA A; 5I0C A; 4YRH A; 5EBV A; 1Q2Y A; 5F46 A; 2B4D A; 1BO4 A; 3FNC A; 4IF5 A; 3D8P A; 4Y49 C; 3W6S A; 3AEE C; 2CNM A; 4NEX A; 1MJ9 A; 4ORF A; 5F49 A; 4AVC A; 4XPL A; 4RI1 A; 2AJ6 A; 3TOA A; 1J4J A; 4MI4 A; 4KVM E; 2PSW A; 3I3G A; 2REE A; 5KTA A; 3I9S A; 2PQ8 A; 3SHP A; 3C26 A; 3DR6 A; 2Q4V A; 4QUS A; 1K05 A; 3DNS A; 3FXT A; 3FYN A; 3TO7 A; 2VQY A; 3SXN A; 4KOT A; 1XF8 A; 2WPX A; 4EVY A; 3TE4 A; 4UWI A; 4II9 A; 1I12 A; 4MY3 A; 4UWJ A; 1Z4R A; 2QEC A; 2FIW A; 2R7H A; 3W6X A; 2GE3 A; 1MJB A; 2B4B A; 2K5T A; 2VZY A; 1XEB A; 2QIR A; 4U5Y A; 5DWN A; 3LD2 A; 4R3L A; 4KUB A; 3AE1 C; 4YTP C; 1IYK A; 4PSX A; 3F8K A; 3WR7 A; 3R1K A; 4PK3 A; 3AE5 C; 4NSQ A; 2O28 A; 3CXQ A; 2PDO A; 3JVN A; 1TIQ A; 3AEF C; 1Q2D A; 2DXQ A; 1NMT A; 2Z11 A; 5EC4 A; 4AB7 A; 2OZG A; 3AED C; 4JJX A; 5IX3 A; 4B5P A; 4HNX B; 1M4D A; 1IID A; 3S9O A; 4L8A A; 4L89 A; 3AEB C; 4HNY B; 1Z4E A; 3R95 A; 1L0C A; 5HMN A; 2Z10 A; 4IUS A; 3AE3 C; 3QB8 A; 3S6K A; 2Q4Y A; 4UBR A; 2C27 A; 1YVK A; 1WK4 A; 1KTM A; 4QC6 A; 4PV6 A; 2J8N A; 2JDC A; 2X7B A; 4KOY A; 3K9U A; 1Y9K A; 3G3S A; 2VZZ A; 3UY5 A; 1PUA A; 3D2M A; 4KOR A; 5E96 A; 1RXT A; 2Q44 A; 3TOB A; 3TO9 A; 4CAV A; 1VHS A; 3R96 A; 2EVN A; 4KLV A; 2NMT A; 1I21 A; 4JXQ A; 2PRB A; 2FE7 A; 1U6M A; 5J8C A; 2J8M A; 2OU2 A; 5C88 A; 1CM0 A; 3JUW A; 4NCZ A; 2G0B A; 3AE8 C; 3SFD C; 2VI7 A; 2B5G B; 5IB0 A; 1ZOY C; 5DWM A; 2EUI A; 4XPD C; 1V0C A; 4NXY A; 2B58 A; 2HV2 A; 2FSR A; 3FB3 A; 3FIX A; 4CRZ B; 5KTD A; 4FD6 A; 2QML A; 4LUA A; 1YLE A; 3EY5 A; 4Y49 B; 1IB1 E; 1M4I A; 1S5K A; 2FIA A; 4E0A A; 4FD5 A; 3W91 A; 1KZF A; 4AVB A; 5FVJ A; 2ZXV A; 3KKW A; 2P6F A; 4PK2 A; 1R57 A; 1XMT A; 3BJ8 A; 2Q7B A; 3AEG C; 1K04 A; 3AE6 C; 3D2P A; 2D4P A; 3SXO A; 2GIV A; 2Q0Y A; 2P0W A; 3AE7 C; 3AE4 C; 3GY9 A; 4LX9 A; 2ARH A; 4KVX A; 2PR1 A; 3R9G A; 1I1D A; 2G3A A; 1GHE A; 3B71 A; 5HH1 A; 4MY0 A; 3R9F A; 5F47 A; 2FT0 A; 2OH1 A; 3T90 A; 3S6G A; 4YFJ A; 1S7K A; 3B8G A; 5GCN A; 3AEC C; 4R87 A; 4CRY B; 4NF1 A; 4GS4 A; 1S7N A; 4MJ8 A; 3G8W A; 2OZU A; 3OWC A; 2R1I A; 4YXD C; 4XNH C; 4H6Z A; 1NE9 A; 3E0K A; 2I00 A; 1YX0 A; 3AE2 C; 2FXF A; 2BL1 A; 1M4G A; 4M3S A; 2PR8 A; 3FBU A; 1YGH A; 2JDD A; 4B5P B; 2FS5 A; 5J8F A; 2P6E A; 1Z9U A; 4H6U A; 3ZJ0 A; 1CJW A; 2WPW A; 4KZT A; 3RYO A; 4KVO E; 2BSW A; 3NE7 A; 5ISV A; 3QAH A; 1YR0 A; 2P6G A; 4HNW B; 4X5K A; 1IYL A; 3EXN A; 1QSO A; 1SQH A; 4JXR A; 2IL4 A; 3MGD A; 1PV3 A; 2AE6 A; 1OZP A; 3AEA C; 3IWG A; 2CNS A; 1FY7 A; 4QBJ A; 2VEZ A; 1YVO A; 2REF A; 1P4N A; 3PGP A; 1YQ4 C; 4JWP A; 3CXP A; 3BJ7 A; 4FD7 A; 1OW8 A; 3D3S A; 2B3V A; 1ZP0 C; 2F5I A; 4UA3 A; 3P2F A; 4KLW A; 3F0A A; 2BUE A; 4MBU A; 3H4Q A; 1OW7 A; 4AG7 A; 4KOV A; 2B3U A; 2B4D B; 4M85 A; 1QSN A; 4JD6 A; 5KTC A; 4BMH A; 2Q04 A; 3GYA A; 3LOD A; 3ZZI A; 1KUV A; 4KUA A; 4FD4 A; 3F5B A; 1YK3 A; 3R9E A; 1Y7R A; 2B5G A; 3TFY A; 1LRZ A; 3EO4 A; 2HUZ A; 3TT2 A; 2R8V A; 4DNC A; 1S3Z A; 3EFA A; 3VWE A; 2CNT A; 5H86 A; 2D4O A; 1N71 A; 2HQY A; 4AG9 A; 3P2H A; 2JEV A; 4XPK A; 4XPD B; 2I79 A; 4OAD A; 3VWD A; 2GAN A; 4KOU A; 5JPH A; 3S6H A; 1MK4 A; 4J3G A; 4R57 A; 4OLL A; 4KOS A; 1B87 A; 1WWZ A; 4U9Y A; 4CS0 B; 1Y9W A; 3PZJ A; 2R98 A; 2VBQ A; 1PU9 A; 2ZW6 A; 2FBW C; 2G3T A; 1B6B A; 4U9Z A; 2WQY C; 2H5M A; 3BLN A; 4H89 A; 1KUX A; 4B5O A; 4E2A A; 1QST A; 1IIC A; 1Q2C A; 3IGR A; 1OW6 A; 1UFH A; 1S60 A; 3CXS A; 5H84 A; 2OB0 A; 4OAE A; 2BEI A; 2Y0M A; 1ON0 A; 3TO6 A; 3N7Z A; 3FRM A; 5CNP A; 2A4N A; 2OZH A; 3SFE C; 2RC4 A; 2JLM A; 4R9M A; 2VXK A; 4R3K A; 2ZW7 A; 3TTH A; 4JLY A; 3DR8 A; 1XIX A; 3S6F A; 2J8R A; 4F0Y A; 1M44 A; 2KCW A; 2Z0Z A; 2PC1 A; 3PP9 A; 1P0H A; 4I49 A; 1VKC A; 3EC4 A; 4RS2 A; 3AE9 C; 2FL4 A; 3TCV A; 1QSM A; 4KOX A; 1K4J A; 5F48 A; 3ABV C; 1RO5 A; 4QB9 A; 4MHD A; 1M1D A; 3GKR A; 4E8O A; 1S7F A; 4AVA A; 4XNH B; 4QVT A; 3DDD A; 5C82 A; 2FCK A; 1BOB A; 4KOW A; 1YQ3 C; 5JQ4 A; 1S7L A; 3T9Y A; 1KUY A; 3V8I A; 4ZBG A; 2ZW4 A; 4HKF A; 2ATR A; 4CAW A; 2H88 C; 2ZPA A; 4YGO A; 1NSL A; 4K30 A; 4ONU A; 3DSB A; 1QSR A; 2ZW5 A; 5IV0 A; 4F6A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2N1T C; 3Q3D A; 1YRE A; 3CWB J; 1XE4 A; 2CY2 A; 3FX6 A; 5CBO A; 1BE3 E; 5L8R J; 5EBV A; 2E76 B; 2JP3 A; 1RF1 B; 5F46 A; 1QLE D; 3KPE A; 3FNC A; 1T2K C; 2GA1 A; 2I3C A; 5K5G B; 2YKO A; 1AQ5 A; 4OGQ B; 5HVF A; 3G4S P; 2E76 D; 3Q2Y A; 2JWD A; 2Z3O A; 1X9V A; 4RO0 A; 4LGD E; 4MCQ A; 2P7J A; 1BE3 G; 3MUD C; 2WPR A; 4OGQ D; 4UCN A; 1VQO P; 1AJY A; 5KKZ C; 1NU1 D; 1J4J A; 4MI4 A; 3I3G A; 2E74 B; 1PPJ D; 1S9K D; 1Q82 Q; 3P7K A; 5KTA A; 2I8D A; 4B11 A; 1JY3 P; 3IU1 A; 2Z3P A; 1VGY A; 1W2B O; 2RKL A; 2E74 D; 2Q4V A; 4QUS A; 3V2R A; 1J2J B; 3FXT A; 2KOG A; 4C7H A; 5C39 A; 4OC1 A; 1A2Z A; 4RN7 A; 2VQY A; 4KOT A; 1XF8 A; 2OTL P; 1BGY J; 3FX0 A; 3B3W A; 1H0T A; 1N73 B; 1I12 A; 2K3R A; 3CX5 I; 4X2T A; 4EI2 A; 4XA4 A; 2XKM A; 4EWT A; 4W80 A; 2JBJ A; 1MJB A; 2K5T A; 3V6I A; 2VZY A; 4UF4 A; 1Q90 D; 2LKM A; 2ZYA A; 5LYF A; 3V2Q A; 3NXS A; 5B5E H; 1IYK A; 1NJI Q; 4PSX A; 4RKU J; 3AE5 C; 1LWU C; 1K8A Q; 3HUS C; 3CXH I; 4B10 A; 2PRR A; 1EE3 P; 4C7N A; 4MHY A; 2PIY A; 2XNX A; 5AVS B; 1NWQ A; 5A28 A; 3BVH A; 2AEF A; 3KZI E; 1CX8 A; 1NU1 J; 4JJX A; 1NTZ E; 2CPS A; 4PD4 E; 1S3J A; 4MFK A; 4P4E A; 2NRG A; 2PFX A; 2M3E A; 5AVY B; 1Z4E A; 5HMN A; 4UFV A; 4IUS A; 4BD9 A; 3IJ3 A; 4PD4 D; 2BO9 A; 3N5F A; 3QB8 A; 4X8I A; 3S6K A; 4ZYQ A; 3ISZ A; 3ZDM A; 3CX5 E; 1NTZ G; 3M06 A; 1AYE A; 4QC6 A; 1YME A; 4WJB A; 3GHG C; 2C9N Y; 2X7B A; 1Y9K A; 2PJB A; 1QVF O; 3NFQ A; 3H1J J; 4MFL A; 2L91 A; 1YTZ I; 3L75 J; 3F89 A; 1RE4 A; 3WC6 A; 1KIL A; 4CAV A; 1MFT A; 2EVN A; 2W27 A; 3L72 D; 2FFD C; 1LTA C; 1FDI A; 1CBX A; 3ISX A; 2DPT A; 5J8C A; 2J9A A; 2M5A A; 1M90 Q; 2NZ2 A; 3H32 A; 3S1K A; 5C88 A; 3PBE A; 5HXD A; 2HOD B; 6CPA A; 3E1I A; 4NCZ A; 5AG4 A; 2G0B A; 3AE8 C; 3E1R A; 4TLF A; 5IB0 A; 4ZX9 A; 1LP1 A; 5DWM A; 2N1T B; 4XPD C; 1S72 P; 1JY2 O; 5AW4 B; 2B58 A; 3BHX A; 3HE4 B; 4Q36 A; 2IX7 C; 3HD7 A; 2N1T D; 4H44 C; 1K73 Q; 4FD6 A; 5AW3 B; 5AVW B; 1VQ7 P; 1PP9 D; 1M4I A; 1Z8L A; 1S5K A; 4E0A A; 1KQS O; 3W91 A; 5JM6 A; 2BCO A; 7CPA A; 1KQL A; 3H8E A; 3KKW A; 4YWY A; 2K88 A; 2PJC A; 1DD4 A; 3D68 A; 3FXD A; 5B66 E; 2CIJ A; 3KR5 A; 3AE6 C; 2D4P A; 5APY A; 3RK2 B; 5LRG A; 3SWK A; 2PRQ A; 3AE4 C; 4CYP A; 3G6E P; 2BOA A; 1KV4 A; 2ZEH A; 1R43 A; 1Q7Y Q; 3RK2 D; 1GHE A; 3B71 A; 5HH1 A; 4MY0 A; 3IAO A; 2FT0 A; 1PGP A; 2AXT H; 2YO2 A; 3RK3 E; 8CPA A; 3IF4 A; 5KLV J; 5K8O A; 4O23 A; 1SQB J; 1YIT P; 4CRY B; 4JYB A; 1NTM E; 4DJG A; 2PCU A; 2IPP A; 3HE5 A; 2OZU A; 3B3S A; 2KZI A; 1NTM D; 1SQP E; 1LWU B; 2DF5 A; 3HUS B; 3H8F A; 1M4G A; 4GT1 A; 3RL0 B; 2PIZ A; 4M3L A; 1PP9 J; 1Z9U A; 4GOD A; 1QMU A; 2WPW A; 1G1J A; 4KZT A; 1SQP D; 4MFQ A; 3RL0 D; 4KVO E; 2IBZ E; 2VL1 A; 3QAH A; 1TKJ A; 2GFQ A; 3H1H J; 4JPZ B; 3EXN A; 1KB9 H; 1QSO A; 3GLJ A; 3PJS K; 3V2P A; 1SQH A; 2GLF A; 2KXP B; 3VYI A; 1GL2 D; 3D7F A; 2IBZ D; 3TX8 A; 4HPS A; 4OIW A; 4OVN F; 3CPX A; 1VDF A; 4RUH A; 1X8Y A; 3M0D C; 4MXU A; 4QBJ A; 1TU3 F; 1L4A A; 5CPA A; 5TJH A; 1FT7 A; 1YQ4 C; 1H8L A; 1BCC E; 2O1K A; 3Q1M A; 2B88 A; 3KYQ A; 3GHG B; 3CCU P; 4UA3 A; 5APQ A; 3P2F A; 2BUE A; 4MBU A; 3H4Q A; 1OW7 A; 1BPM A; 4KOV A; 2B4D B; 2WPQ A; 5APX A; 4QMA A; 3LOD A; 4FAI A; 2W8Z A; 1BCC G; 4A94 A; 2FFD B; 3VN0 A; 4GOF A; 2B5G A; 3D66 A; 1LRZ A; 2KSJ A; 3O6Q B; 3TT2 A; 2ZOG A; 4A31 A; 1FZA A; 3VWE A; 2V7Q J; 2B89 A; 3TNU B; 5CJ0 A; 1K9M Q; 3HLP A; 4WVZ A; 2HQY A; 1LTJ A; 2P1J A; 5KJ7 D; 2K1A A; 4F9U A; 5AW9 B; 5AW8 B; 2I79 A; 4XPD B; 2IQ6 A; 3D7H A; 2OYI B; 4OAD A; 4C2Z A; 4KOU A; 1QL1 A; 2FXM A; 2YGW A; 1NTK K; 1JB0 J; 2WIT A; 5B5E E; 1OBR A; 1IFP A; 3RNZ A; 1LFW A; 4OLL A; 4H44 B; 4HKZ H; 2XZR A; 4PQA A; 4RJT A; 4U9Y A; 2CTC A; 3SJX A; 3PZJ A; 4CYN A; 2VBQ A; 4H44 D; 3CCJ P; 2OTJ P; 4L73 A; 3BRT B; 1F57 A; 3B7I A; 2G3T A; 3RAM A; 1JMM A; 2WQY C; 4H89 A; 1EDK A; 1IIC A; 1Q2C A; 3CLQ A; 2QJ8 A; 1DX7 A; 5THW A; 1JMB A; 5DJT B; 1L0N K; 4OAE A; 2Y9Z A; 2Y0M A; 3S9M A; 2YMK A; 1VF5 C; 2OZH A; 1XOV A; 2Z3K A; 1DEB A; 3RL0 g; 4R9M A; 3D6Y A; 2VXK A; 4R3K A; 3B8E B; 5LRJ A; 2XU6 A; 3FWL A; 3DR8 A; 1L0L D; 1OMI A; 3S6F A; 2J8R A; 4F0Y A; 4B12 A; 4Z1M H; 2KCW A; 3OAK A; 2Z0Z A; 3BCC E; 3A2A A; 4A95 A; 1VKC A; 3EC4 A; 3TCV A; 3L71 J; 2FL4 A; 3H1L D; 3JSV C; 4M6G A; 1QSM A; 1QEX A; 1M1J C; 3GIU A; 4M6H A; 2WSC H; 3FEC A; 1GZL A; 2FXO A; 3BCC D; 1M1D A; 3GKR A; 4QVT A; 1N7L A; 2OOT A; 2RN0 A; 2FCK A; 3U1C A; 2J5U A; 3K2K A; 1YQ3 C; 3WU2 E; 4LQG A; 2QM8 A; 4H13 C; 3T9Y A; 1KUY A; 4W7Z A; 2P58 A; 1RF1 C; 3NE8 A; 4I1L A; 3FJU A; 4D6T D; 1YJW P; 1QX8 A; 4MMO A; 4CAW A; 4AYC A; 1AVY A; 1M57 D; 1Q2N A; 2Q9I A; 3CX5 H; 1PCA A; 1L2P A; 1PZQ A; 3L73 J; 3VAR A; 1AMP A; 3C9I A; 1YW6 A; 4EME A; 4ONU A; 2IDB A; 3DSB A; 4NGQ A; 3VAT A; 4NGR A; 3L70 D; 3TGU D; 3CL3 D; 4F6A A; 4OWF A; 2H89 C; 2R32 A; 4XE5 B; 2R3C A; 2FVG A; 4CAX A; 4PSW A; 2ZEG A; 5I0C A; 1TF9 A; 2PJ6 A; 5KLI C; 3I56 P; 1BO4 A; 3RBU A; 1HDU A; 2P67 A; 3W6S A; 3AEE C; 1FJK A; 3CXH H; 4A7P A; 1L0L J; 2HC9 A; 4ORF A; 3GW6 A; 3WAB A; 5CCG C; 4AVC A; 1VHE A; 5CCH A; 4OC4 A; 4RI1 A; 5M1B A; 1NKZ B; 2ZYG A; 3H1L J; 1RQU A; 2JEE A; 2PJ4 A; 4KVM E; 2P10 A; 3O8Z A; 2Z3M A; 4OP4 A; 3SHP A; 4A32 A; 3A0B H; 1Q81 Q; 2KSE A; 2WZN A; 1KYO I; 2AFM A; 2RMZ A; 3TO7 A; 4KHX A; 1FJP A; 1L0N E; 4EVY A; 1F2P A; 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