4KCAA

Crystal structure of endo-1,5-alpha-l-arabinanase from a bovine ruminal metagenomic library
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
635
structure length
635
Chain Sequence
IIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGSGSGPSTYELKRVSVHDPSIVWDPSSKTYYIFGSHRAAAKTTDLMSWTAFTAPWKTATSNNAANNVAFETPAVKKVKKGGVDVDFPAFSATKWSAKGGSGYSVDGNMWAPDVIYNKVLKKWCMYLSINGNAWYSSIILLTADNIEGPYLYQGPVVIGGFKNGTEYKETDFELVLGPQSSLPERYATGGKWGDRYPNNIDPCVFYDEEGKLWMTYGSWSGGIWMIELDENTGLRDYDVTYELTGSGNGITVDPYFGKKIAGGYYVSGEASYIEYIGGYYFLFVTYGGLAAGGVASDYNNGGYQMRVFRSEKPDGPYLDARGTDAVFASYKLDFGPDANDNRGVNIFGAYGDWGNQTKGKNSERSQGHNSIIAAEDGRTYLVYHTRFQNRGEEHEVRVHQVFQNEDGWLVAAPFEYTGETVKSADIATSQQVPTNKIAGSYKLLTHPFKLDHRVKELAKPVDIELNADGTITGSTTGTWSVKEGTSYITINLDKEYKGVIVEQTLEPTSDKAFVFTALNRNGVTIWGYKPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mechanistic strategies for catalysis adopted by evolutionary distinct family 43 arabinanases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
molecule keywords Endo-1,5-alpha-L-arabinanase
total genus 181
structure length 635
sequence length 635
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.99: Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase.
pdb deposition date 2013-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.128.10 Mainly Beta Beta Barrel Lipocalin Lipocalin 4kcaA03
2.115.10.20 Mainly Beta 5 Propeller Tachylectin-2; Chain A Glycosyl hydrolase domain; family 43 4kcaA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kcaA01
3FW2A 2EXIA 2OBIA 4I2UA 4RUVA 5G1LA 4KW6A 4K2DA 1QK8A 1JFUA 1A8YA 3HZ4A 2YWIA 1O8WA 3ERFA 4O5RA 5GZZB 1GH2A 3GL5A 2GS3A 2HXKA 3IDVA 3QD9A 1TRVA 5EY6A 5GAND 3SBCA 3A2XA 4DSSB 14GSA 3F4SA 3QAGA 1EOHA 2C8UA 1V2AA 1SKRB 3W6GA 3F4TA 3UAPA 1VRSD 3IBHA 2GGTA 2WFCA 4MJAA 1EOGA 1M99A 2DLXA 1DE2A 1XFLA 4D73B 2F9SA 2XQRA 2MMZA 5FHIA 4ZB6A 3KTLA 3TOUA 4IKHA 1ERUA 2H0GA 5H5QA 5E4WA 4OO4A 1HD2A 5IM9A 2VD0A 2H1BA 3KF5A 1YY7A 2IMDA 2WZ9A 2LRCA 2P5QA 3O6TA 4PGTA 3TB2A 2C0GA 2DJJA 3HVSA 5IO0A 4F2IA 4H86A 2HSYA 4N0VA 3J7Yb 5FT3A 1S3AA 1VKDA 17GSA 3H4KA 3D5JA 2DIYA 4TXOB 1BJXA 1YF1A 4ZB9A 3FK8A 2FD3A 3MWHA 3DGQA 3EYTA 4COTA 3ZLPA 2PWJA 1Z6NA 2K6VA 4WR5A 3VI5A 2FWHA 3ZFLA 1K0CA 3KM6A 2R3XA 2WDUA 4IHUA 1KNGA 2V6OA 1SJ6A 3C7GA 3TRPA 3DIEA 2A2RA 2LJKA 4ZXGA 2DJ3A 3C2UA 4MZBA 2PVQA 3P90A 2LSTA 4HQSA 1H4OA 3P8WA 5A8CA 2O85A 3C1SA 1GSDA 4MP4A 5KN1A 3TOTA 3KH7A 3OM5A 4PUFC 3C8EA 2CQ9A 4I5QA 4RQXA 3LXTA 3P2AA 2BTOT 2R4VA 4KX4A 1F2EA 3CTFA 3AKHA 3DKSA 3WPUA 4YAPA 3FZ5A 1PQNA 4HZ2A 5DJMA 4E8EA 1UV4A 4X43A 2H76A 2LTKA 2LQQA 5ECSA 4MJEA 1TRSA 3CSIA 1SJIA 1O81A 1QFNA 4PQ1A 1KEBA 5CO3A 4O8OA 3IK9A 4E8HA 4HQZA 1WRYA 5DALB 2J9HA 2E2GA 3TKRA 2DBCA 1Z3EA 4I6XA 2GZZA 1AC1A 4LA1A 3TJJA 4WBJA 1GNWA 4DVCA 4V1Ag 4PNGA 4AK7A 5EPFA 3BYLA 3OM6A 1TRUA 5ECIB 5IQYA 3I43A 2VCTA 3HZ8A 5HR3A 5DJLA 5ID2A 2V6KA 4FYBA 4WETA 3G7JA 2FGXA 3F3QA 3WYWA 4EDZA 2X99A 1R7HA 2YZHA 2OXBA 3HKRA 1C72A 3RPPA 3F6DA 4NHWA 3J7Yk 2EC4A 5DAKA 2B4WA 5CRGA 5A4WA 2IFQA 3Q6OA 3LDRA 1XW5A 4JRRA 3LXZA 2NTOA 3ERWA 4YQMA 1K0BA 2R2JA 20GSA 3K1UA 2OE0A 3LORA 3ZITA 3HVXA 5C0PA 1DUGA 1OKTA 4NXIA 4L5LA 4G10A 2GQMA 2AAWA 5IMDA 2DIZA 5A5KA 1SK2A 5B6MA 16GSA 3TJKA 2YNXA 1GSSA 3L9UA 4ULXA 3WN1A 3LDKA 2C3TA 3HHVA 5DBQA 2AC1A 2YFRA 5G5EA 5D9XA 1OAZA 2GSTA 1THXA 2FWEA 1XOBA 4LLRA 3TKSE 3LIGA 3QFBC 1PT2A 4GXZA 3TJFA 1V58A 1SYXA 4G2EA 3FR3A 5COHA 2PGTA 3NOFA 2R6KA 3HDCA 1BQ7A 1U3AA 3EMXA 2FLSA 4MH3A 2OE3A 4IN0A 4RQRA 4FH8A 1BEDA 2GVPA 1JHBA 4IVFA 2HYXA 1NW2A 5F0GA 1A24A 3LF7A 1GLQA 3FYGA 2RIIA 2CA8A 4I8BA 1EEMA 2GZPA 2YP6A 4TR4A 2IPAA 1Z7PA 1PMTA 3TJGA 1AQXA 2YWOA 3IE3A 4F82A 4XS1A 3VLNA 2XBIA 3AKFA 5HQPA 1YF0A 2L4CA 4ZL8A 1YZXA 1T8EB 2K9FA 22GSA 4F9ZA 3ZIVA 5HR1A 3KJYA 5IMCA 3PIGA 3EE2A 4OFTA 4ML6A 1GLPA 4O32A 3A2VA 2EXKA 3KXOA 2H8LA 2IL3A 2CVBA 2DJKA 3M8NA 1URMA 3EVIA 2H6XA 4NHZA 3AKIA 5A8DA 1PA3A 5FIXA 3BYKA 3EC3A 5LCZA 4FFIA 3DWVA 3I9V2 1M0UA 2HZEA 3CBUA 1T4ZA 2IMFA 5ECKB 5H5SA 2GSRA 2OA7A 5ECQB 1GTIA 3QFAC 4OFNA 10GSA 2D2ZA 5FWGA 2LUSA 1GSQA 2IMEA 4IGJA 4UDGA 5ELGA 5DQYA 5FMCA 1YDKA 1PKZA 2E7PA 1QQ2A 4BA7A 3UOMA 3GKXA 1ZL9A 4JE1A 1OE7A 4DSRA 3DMLA 3FR6A 1G7EA 2MBTA 2OE1A 1WPIA 3WN0A 1J9BA 2EXHA 1VF4A 4TRXA 4OO5A 2DJ1A 4JZQA 4TR1A 1PX6A 5ABRA 4POLA 3ZVJD 4MF5A 2OACA 2YN1A 4NV5A 1EGOA 1GUHA 4MZWA 2DJ0A 4LMWA 3LWAA 18GSA 5FLWA 1ILOA 1X9WB 1NM3A 3TKSA 1G0TA 2MBSA 3VT2A 2O87A 3DYRA 1XW6A 2XHFA 4PVIA 4V1Ap 2H73A 1OYGA 3R67A 4KDXA 1EP7A 4EQVA 5D73A 3H79A 3A3TA 4EUYA 1GSFA 4JR4A 5ENUA 3AKGA 1E2YA 4GSTA 3GFKA 4IQAA 3BYNA 1UYPA 2CX4A 3WGDA 1W4VA 2OJLA 3ZXLA 5GSTA 2B7JA 3GTUA 3R4ZA 2H6ZA 1YI7A 5KN0A 2I3YA 2MMAA 2FCHA 5ECMB 4TR0A 3G7YA 2CT6A 5ID2B 2QGVA 5FK7A 4J56E 3F63A 1F6MC 2JU5A 5D8IA 5KN3A 1Y25A 4GLTA 1QGVA 3PR8A 4HEA2 1OC8A 4MH2A 4X0XA 1A2JA 5IOXA 2FWFA 1U3IA 3UGFA 2QKEA 2PPTA 4ZBBA 2AV4A 1O8XA 1H75A 2HRFA 5CNWA 1B4PA 5A7VA 3C7OA 2EIRA 2KP1A 1X9MB 5F07A 2O7KA 3GURA 1B4QA 6GSYA 2VOCA 3QDNA 4XTSA 5DQSA 3FHKA 5A4UA 4X1UA 5D9WA 4KCEA 4QQSA 3GX8A 3GUSA 5ELAA 5JCGA 3MSZA 1ABAA 5DCHA 2F8FA 2YFSA 5IMAA 2JZTA 1GP1A 2RM5A 1I9DA 5JWRB 5IMZA 2AEZA 4K1FA 2FY6A 1LJRA 1PSQA 5FKBA 4MLYA 3QC2A 2VCXA 1HNAA 4XS4A 3ERGA 1KBNA 4L0WA 2DMLA 4XS6A 1PD21 3W8SA 4KA0A 1K3YA 5JWOB 2KUCA 11GSA 1M2BA 3IAS2 3LIHA 3ZYWA 2TRCP 5FMBA 4AGSA 2X8FA 4FFFA 3WGXA 5JOWA 2B3SA 3ISOA 2XC2A 2YANA 4HU9A 1BAYA 4IW9A 1N2AA 1QUWA 4Q5FA 3KEBA 2ZCTA 3BBYA 4AJ7A 4POMA 4J57E 3EMPA 5AN1A 2FHEA 5CRHA 5IIZA 2YFTA 1WP0A 1HYUA 4ONZA 2ON7A 4WBRD 2B1KA 2VAFA 4G9HA 1J08A 1NSWA 1ST9A 3G7IA 3KTBA 1PX7A 5HFIA 4D47A 1IYHA 2M72A 4MZCA 3WMZA 2HZEB 2YWMA 4XIHA 1GSYA 2AEYA 3HCZA 1OC9A 2VL9A 3VURA 4O8NA 2X8SA 5GLMA 4XRDA 1XOAA 4U6DA 2P31A 3VSFA 3N9JA 3W8JA 3O3TA 1GTBA 1K3LA 4MCUA 1XWCA 3D4TA 1GWCA 2H75A 4WKWA 3DD3A 3TGZA 3HD5A 4F0CA 3GN3A 3IA1A 4K7IA 4PNFA 1OYJA 1M7TA 3GV1A 1V9WA 4IP1A 5ECOB 3GL3A 3RDWA 1VF3A 1GULA 1G7OA 3BJ5A 5LD0A 3HJPA 2B1LA 2N5FA 4YQVA 3OM4A 2JSZA 2QQUA 3UBLA 4KSOA 2DMMA 3L4NA 1XBSA 3VWUA 4BL7A 1MDIA 5CP1A 3CYNA 4MJBA 4TW5A 2CV4A 2K8VA 2LV3A 3APQA 4LMVA 4ML1A 4EKZA 5GAPD 5C00A 3HXSA 5G2ZA 2DJ2A 4BVXA 1M2AA 3C71A 1EV9A 1T00A 1SK0A 4LL4B 2X8CA 3C7HA 3ZREA 2L6CA 1GRXA 2EIQA 1SK1A 3KP9A 1GNEA 1FG4A 1WJKA 1LU4A 4K9ZA 3GKNA 4KGIA 4XRAA 5AY9A 2WRTA 2VCZA 5J5NA 1G6WA 1TKDB 1ON4A 1USBA 3E3EA 4N10A 1ERTA 3D5YA 4GWRA 5E59A 1SL2B 5DVBA 2MZCA 4UDJA 2MMOA 5AIXA 4ZIJA 4KUNA 3C7FA 1B9YC 4DSQA 1YEXA 2C0FA 4V2NA 4GCIA 3BCKA 2JACA 2VLUA 5A7VB 3LV4A 3F0IA 4N1IA 3EU4A 4PX1A 1A0FA 1F3AA 2MYGA 1PL2A 4KAEA 5DCGA 1PL1A 2JZRA 4JR6A 1SENA 1WIKA 1Y4WA 2PBJA 3OM2A 3M0FA 1GYHA 2LRTA 2NPBA 1SD9A 1EEJA 4KC8A 1KTEA 3VT0A 2CVDA 6GSVA 3FY7A 2AUVA 4MK3A 3KD0A 4EE0A 1Z7RA 5AYCA 3DEXA 3D21A 1FVJA 4NV2A 2GSSA 4O8PA 3VSRA 4BWSA 3HYPA 1YKAA 1ZYEA 1U87A 3GH9A 3PH9A 3ZMLA 4DEJA 3ZZXA 5J41A 3ME7A 2CAQA 1K0NA 2V41A 1Y6EA 4BPYA 1FW1A 1Z9HA 4CW9A 2H1AA 2LRNA 4JU5A 2VL3A 4YAVA 1R5AA 2VCQA 3NIVA 4KB3A 1W18A 3P7XA 4YH2A 3VFIA 2V1MA 2H1DA 2YV7A 4K0NA 3WGEA 1B8XA 4OMVA 4IP6A 2DSAA 5GLOA 3FRCA 4L8EA 3GSSA 1OE8A 1YEPA 1TDIA 1GYDB 4UDKE 1JZRA 2C0DA 3S9FA 3SWLA 3CSHA 2AJQB 3KP8A 5J4UA 5ANNA 1QMVA 1Q4JA 3QEEA 2LJAA 4K8MA 3QMXA 4DSSA 5GLKA 5GLNA 3LEFA 3ZVJA 5CYYA 1JZDA 4HDEA 4NMUA 5D9TA 3Q19A 2FA4A 4KC7A 1OVNA 1TXXA 4NAXA 3FZ4A 1AIUA 1X5EA 4KDUA 1VGLA 3H1NA 5CRDA 1ERVA 3D6IA 5AIVA 4OCEA 4V2MA 3I6AA 5DDLA 3VPQA 4QQ7A 1Q98A 1OC9B 1LBKA 1ZCPA 2C0EA 4ZL7A 1MDKA 1O6JA 3UARA 3U5RE 2PMTA 4KMIA 1MTCA 13GSA 4BWQA 3F8UA 3A5WA 2YWNA 2GQKA 4FIWA 2VL2A 4AK6A 2GSQA 4PURA 2E0QA 3GRXA 2L57A 3TUEA 1PRXA 3GNJA 5ECLB 2RLIA 2YV9A 3OR5A 4YQUA 1GTAA 3R2QA 1X5CA 1GUMA 4OD7A 3VI7A 2G0FA 3VWXA 2AYTA 4TXOA 2VM1A 3A2WA 1SD8A 2L5OA 1GUKA 3EINA 1TW9A 1UA5A 3OM7A 3QOUA 2VM2A 4KSMA 4ECIA 2E2MA 2C3QA 5G5FA 4TR3A 3ZXKA 2N5BA 2VD1A 4K6XA 4ECCA 1ZYQB 4HI7A 5HFKA 4POBA 2LNSA 3BCIA 3UL3A 3TJBA 1YKCA 1R26A 2I9HA 5HR2A 3U75A 2B5EA 4K7OA 4NOVA 5GLLA 2F51A 4WEYA 1FOVA 1F37A 1TP9A 4CDOA 4I2TA 2GLRA 5HFGA 1I5GA 5JCUA 1WE0A 1CQHA 2X8HA 3M3MA 1R4WA 3QEFA 3TKQA 2WCIA 5H5RA 5J3RA 4N0ZA 5CAXA 1TU8A 1Y7BA 2PN8A 3LJRA 5G31A 1SL0B 4U6BA 2YZUA 2M80A 5DALA 2B6MA 2O8VB 3M9JA 5KN2A 1SMPI 1BG5A 2ON5A 2ADEA 1M9AA 3M1GA 2VCVA 3LFLA 2R37A 1R5PA 3C7EA 4N30A 4NPBA 9GSSA 5GLQA 3QAVA 2PERA 3DVXA 4WF5A 5ECHB 2NDOA 3GIXA 2I1UA 3CRTA 5DAKB 3WASA 2TRXA 2IFQB 5B7CA 2QQWA 1XPVA 3U14A 2A2SA 6GSXA 2C4JA 5CREA 4EVMA 3WN2A 3R4YA 4HJMA 1PGTA 1V57A 2P0GA 3DVWA 6GSWA 1BX9A 3IAM2 4Q5NA 4N11A 1XVQA 3U6VA 1T1VA 4PQHA 2AB6A 3D60A 2ALBA 1X0RA 1FB0A 2H72A 1TI1A 2N5AA 2LKUA 4ILFA 3CMIA 2VUPA 1K3OA 1MD4A 1AQVA 3UEMA 4EL1A 5D93A 5CRWA 2CAIA 3APSA 1W2TA 4JBBA 4HJ2A 1UVZA 4CHSA 5J9CA 1GTUA 2YJ7A 5JOXA 2V2GA 1YQ1A 2VL2C 5L71A 3TAWA 4BVYA 3UGHA 5F06A 1RK4A 2V32A 2X8GA 3ZFBA 4KNDA 4ZB8A 3KMNA 19GSA 2C3NA 3WPZA 1JLVA 1A0RP 1RQMA 4NWYA 2A4VA 2GZYA 5EVOA 1ZGNA 2BJXA 2F3MA 3GA4A 1PN9A 1Z5YE 3D5ZA 2HSHA 5B6NA 3D61A 3RHBA 2VLVA 4G19A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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