4KCAA

Crystal structure of endo-1,5-alpha-l-arabinanase from a bovine ruminal metagenomic library
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
635
structure length
635
Chain Sequence
IIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGSGSGPSTYELKRVSVHDPSIVWDPSSKTYYIFGSHRAAAKTTDLMSWTAFTAPWKTATSNNAANNVAFETPAVKKVKKGGVDVDFPAFSATKWSAKGGSGYSVDGNMWAPDVIYNKVLKKWCMYLSINGNAWYSSIILLTADNIEGPYLYQGPVVIGGFKNGTEYKETDFELVLGPQSSLPERYATGGKWGDRYPNNIDPCVFYDEEGKLWMTYGSWSGGIWMIELDENTGLRDYDVTYELTGSGNGITVDPYFGKKIAGGYYVSGEASYIEYIGGYYFLFVTYGGLAAGGVASDYNNGGYQMRVFRSEKPDGPYLDARGTDAVFASYKLDFGPDANDNRGVNIFGAYGDWGNQTKGKNSERSQGHNSIIAAEDGRTYLVYHTRFQNRGEEHEVRVHQVFQNEDGWLVAAPFEYTGETVKSADIATSQQVPTNKIAGSYKLLTHPFKLDHRVKELAKPVDIELNADGTITGSTTGTWSVKEGTSYITINLDKEYKGVIVEQTLEPTSDKAFVFTALNRNGVTIWGYKPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mechanistic strategies for catalysis adopted by evolutionary distinct family 43 arabinanases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
molecule keywords Endo-1,5-alpha-L-arabinanase
total genus 181
structure length 635
sequence length 635
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.99: Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase.
pdb deposition date 2013-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.128.10 Mainly Beta Beta Barrel Lipocalin Lipocalin 4kcaA03
2.115.10.20 Mainly Beta 5 Propeller Tachylectin-2; Chain A Glycosyl hydrolase domain; family 43 4kcaA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kcaA01
3LEMA 1GSEA 3CSHA 2CVKA 4YQUA 2MBTA 5CNWA 2BTOT 3D6IA 2HRNA 4IKHA 2A2RA 2JZTA 3VPTA 1SK1A 1OE8A 5HR1A 2WS2A 2H75A 2LUSA 4OO4A 2PWJA 4O92A 4G10A 1G6WA 1Z3EA 3F3RA 1M2AA 2PMTA 4BWSA 4AGSA 3GKXA 1VF3A 5DCGA 4TR1A 1PT2A 2N5FA 3LXZA 4MF5A 4EXJA 3CBUA 5EVOA 3VSRA 2EIOA 1C72A 2L6DA 2RN4A 5DDLA 2LRCA 2J23A 2J9HA 4KDXA 3KF3A 2GZZA 5D9XA 3ZXLA 2CVDA 1DUGA 4HJMA 1CQGA 4FFIA 1TU8A 3TKSE 3TKRA 3TOUA 4K2DA 5ID2B 3DEXA 2LNSA 2DMMA 2YWIA 4F03A 1AQXA 4U6DA 2XBQA 4K7IA 1JZWA 1SL0B 1EGRA 2HSHA 2L4QA 1GYHA 4GTUA 5F0GA 3KCMA 5KN1A 2DSAA 4ZB8A 2CQ9A 4IP6A 4NOVA 4KNDA 3VK9A 5LNKe 1F2EA 3P2AA 1A23A 2LV3A 4TOPA 3R4YA 3C7FA 1WJKA 4IJ3A 1TK0B 5JOXA 3OM2A 1BQ7A 4N4BA 4V2LA 4UDJA 3D5YA 4KSMA 2DJ1A 1V9WA 3K8NA 1PL2A 5IMZA 1XCCA 2E2MA 4PGTA 4OFMA 3M3MA 3KH9A 1Z6MA 4TR0A 4FH8A 2YZUA 4X0XA 1YKCA 1FVJA 3A3TA 3F9UA 2AUVA 1W4VA 3IAS2 3GKMA 4L5OA 4XHMA 3MSZA 3QAVA 1TW9A 4PVAA 1K3LA 2O85A 3VSSA 3GMFA 4EVMA 1J08A 3LEFA 1E6BA 1AW9A 5CO3A 1JHBA 4KC7A 1NM3A 2JU5A 1TI1A 4CHSA 3RBTA 2GDRA 1U3IA 4QL7A 3WPUA 5ECHB 2LRTA 1VKDA 1A0RP 2XQRA 3KD0A 1VF2A 2MMNA 2QQWA 1J9BA 2VCTA 4IELA 4DSSB 4MCUA 4EKZA 5JOZA 2YFTA 1Z7PA 18GSA 2HZEB 3OM7A 3F4SA 2HLSA 2LQQA 5FMDA 1O7UA 3L9SA 1TXXA 2YWNA 4XS1A 3DKSA 3HZ4A 2CX3A 3CYNA 3HVXA 5ELAA 3QEDA 2H01A 5G2ZA 1ZZYA 3WPYA 4MJBA 1XVWA 3L78A 5IOWA 5J41A 5A7VB 1GSUA 3IE3A 3UBKA 3EC3A 4ECBA 3LJRA 3D0ZA 3C2UA 5B6SA 3QDNA 4MF6A 2EXIA 4OFTA 1S3CA 2A2SA 1UV4A 5C04A 5DJMA 2LEGA 1G6YA 2L57A 3BBYA 4OO5A 1TK5B 4POLA 1UA5A 4MZWA 2FA4A 2F8AA 1O73A 2LNTA 1B8XA 5J9BA 4HDEA 5GLMA 3TJGA 2D2ZA 4G2EA 3D5ZA 5IMCA 12GSA 2MMZA 3GFKA 2HI7A 2TRCP 1VF1A 2CAIA 5COHA 2CX4A 2GZYA 4PQIA 5ENUA 1THXA 2V6KA 3VURA 3LSZA 2H0IA 4GQCA 2FLSA 3EYTA 2DIYA 3TKPA 4AK5A 3LYKA 1SKSB 2DJ2A 4YQVA 4EL1A 4HQSA 2V41A 4BA7A 2CA8A 3A2VA 4TXOA 5G5EA 4EE0A 3C8EA 4FYCA 5KN3A 1M7TA 3KXOA 2WCIA 1A2JA 4KW6A 1A2MA 2OBKA 1ML6A 2C0EA 3N9JA 1DBYA 5J4UA 2G2QA 2B5YA 1G0TA 4EC0A 5G1KA 3ZXKA 1PQNA 2R5GA 5FK8A 3F4RA 1XWBA 1XW5A 4FO5A 2H0HA 5H5SA 1V2AA 4IGJA 3LORA 2WFCA 4BPYA 4MJCA 4POMA 1FHEA 1N2AA 2KLXA 1KEBA 2MMAA 2GZPA 4MLYA 3AKIA 5FIXA 2IWTA 1WL7A 4KDUA 4NHZA 4F0CA 4NWYA 4DSQA 4RUVA 4WF4A 1UC7A 4TVEA 2WGRA 3GRXA 4ZXGA 1WP0A 2IIYA 3ZLPA 1OYJA 1WPIA 2XBIA 2OXBA 1ST8A 3OM4A 4F0BA 5IMVA 4I97A 2P5QA 4N1IA 2CZ2A 2CV4A 5JCUA 2PU9C 4GRFA 2X99A 5B6TA 1QGVA 2V2GA 5HFGA 4OWYA 3S9FA 2B5EA 3GIXA 2YFRA 5GLRA 5AY9A 3KP9A 2BMXA 2I4AA 2DIZA 1XOBA 1T00A 2IFQB 4YH2A 3F63A 1GTBA 3RPPA 1Q98A 2M80A 1AUCA 1HD2A 2C3TA 1ABAA 1MDJA 3QD9A 5DALB 5DQYA 3WPVA 1GTUA 4IHUA 1T8EB 3CTFA 3D21A 3UOMA 1ZOFA 3VSZA 2AC1A 4XRDA 6GSWA 1K3OA 4ILFA 4Z7XA 3ZVJD 3AKHA 2XPDA 3LIHA 2R6KA 3R67A 3TUEA 2MYGA 3H8QA 1W2TA 4FFFA 5HR2A 1TRSA 3UVHA 1XVQA 1JLVA 3EE2A 5D73A 3US3A 2VCWA 3WN1A 1SK0A 3C1SA 3F4TA 2C3QA 1ZL9A 2YCDA 2HNLA 1G7EA 4KCBA 3F6FA 2DJ0A 4COTA 4IQ1A 2IN3A 1OAZA 5IOXA 2H74A 2DBCA 1R5PA 3CMIA 3EU3A 5ELGA 2LJKA 3LGCA 2HZFA 4MK3A 2JSYA 1H75A 10GSA 3IBHA 3VWVA 3QCPA 4HU7A 3ZXJA 2L5LA 3TB2A 1EV9A 1GL8A 2JSZA 3KH7A 3D4TA 3C1RA 2X8SA 3GKNA 3LF7A 5D9VA 1EGOA 1ZYEA 2H6YA 3DMLA 3KEBA 1QMVA 2AHEA 2GGTA 1F3BA 2H70A 5DAKB 4HS1A 3VI5A 3GA4A 3DWVA 3FYGA 3U75A 4ZB6A 1EEJA 3C7MA 1K0OA 3D5JA 3G9BA 5GLKA 3ERFA 4I5QA 3M1GA 4GF0A 4F2IA 3WN2A 3UGHA 3FY7A 1X9MB 1YIFA 2C0DA 2GQMA 2N5AA 1O81A 4HZ4A 4KX4A 1WRYA 1Y6EA 2RM6A 3H1NA 3LDKA 4ZIJA 1DSBA 2H6ZA 2DJKA 4I2UA 4TKYA 2YV7A 4I2TA 1OKDA 5FHIA 2RUEA 3UIWA 1YKAA 1TJDA 4PX1A 2FCHA 1XPVA 2R37A 2RM5A 2R2JA 1TRVA 2O7KA 5FK7A 1SD8A 1XXUA 4OCFA 1AXDA 2TRXA 3M9KA 3TOTA 3KIJA 4IW9A 4NHWA 1K0CA 3IA1A 5A8CA 2ES7A 2EC4A 3LFIA 5IM9A 4GWRA 3D60A 1SJZA 4MABA 1TRUA 2PN8A 3BD2A 2C0GA 3J7Yb 6GSUA 5DCHA 1FB0A 1ERVA 2K8SA 5GSSA 2JACA 3GNJA 1GSDA 4JR6A 2DC5A 3VPQA 2MMOA 2XPEA 4MMMA 1FOVA 4MF7A 1GSQA 3U6VA 2P0GA 4EUYA 5J9CA 3FK8A 4MZCA 3MDKA 2IMKA 4ZL8A 3KF5A 4WR4A 2GQLA 3QC2A 1XWAA 4Q5RA 4V1Ap 1NHYA 1TP9A 2B4WA 1B9YC 4EO3A 3H79A 3C7EA 1F37A 5B6NA 3HXSA 5ECKB 4POKA 2F8FA 2H1GA 3HDCA 4NV2A 3I69A 5L71A 4MH2A 4CDOA 3TCOA 4K1FA 3HJOA 9GSSA 1K0NA 2QKEA 3IAM2 4U6BA 3AKFA 3TRXA 5H5QA 3DIEA 3Q74A 5GLOA 4GSSA 4NMUA 2VD0A 4N0ZA 5DJLA 3L4NA 3P7XA 2FY6A 1BAYA 4N30A 2HYXA 3BCKA 1K0DA 2FWHA 2EXHA 4EF0A 3VT0A 1SL2B 4JBBA 4WKWA 1PX6A 1YEXA 1E2YA 4XIHA 1GWCA 2VM1A 4BVYA 4E8EA 3Q18A 1ERTA 2JADA 5IPHA 1XIYA 5FWGA 4BL7A 4PXOA 2OKAA 4KE3A 1SYRA 2RUFA 3GL3A 1TI3A 4TR4A 2YJHA 2A4VA 1O8WA 3RPNA 3DXBA 1NSWA 3NIVA 1QQ2A 1FO5A 1HYUA 4AJ7A 1JZOA 3UGGA 3ZREA 1UN2A 1M0UA 4ACSA 3P8WA 4IP1A 5ECLB 3BYLA 1GLPA 2I81A 5D96A 1YDKA 2XC2A 3RHCA 1U88A 4D73B 4ECCA 1PKWA 1SU9A 1TKDB 1MDIA 3A5WA 1XWCA 2K9FA 3BOAA 5IO2A 1T3BA 1VF4A 3PIJA 1F3AA 5D8IA 4PNGA 4ZBDA 5DVBA 5JWOB 5EPFA 4O8OA 3ZZXA 2DMLA 5LCZA 1YF1A 3KGKA 2DJJA 2LJRA 4GQFA 3CU9A 5GZZB 3U5RE 5FT3A 2YP6A 3EMXA 4HI7A 4TRXA 5CRGA 2AEZA 1U6TA 4UDKA 3K1UA 4PURA 4J57E 3GL5A 2OE0A 3FZ9A 2NBSA 4FYUA 1NW2A 1QUWA 4TXVA 3FZAA 1X5EA 2CT6A 3C7GA 20GSA 3ZIJA 1M2DA 4BVXA 5HFIA 5E59A 2V32A 5HFKA 4N11A 4MP4A 3KJYA 1T1VA 4N10A 5H5RA 1GULA 1GYDB 3VI7A 1SYXA 5FKBA 1EV4A 2K6VA 1X5DA 1IYIA 5ID2A 3G7JA 3QAWA 2C0FA 5CYYA 2GSRA 2ADEA 4O7HA 2VO4A 2KP1A 5ECRB 1MEKA 4L8EA 3M9JA 2VLTA 1V40A 1Z5YE 2VDTA 1T4YA 3ZMLA 2ZUPA 4JU5A 3A2XA 4FFHA 4PUAA 1SD9A 3U14A 1I5GA 3KTBA 4AK6A 1ZYQB 5JWQB 5F07A 2FGXA 1YRZA 5CAXA 14GSA 4OFNA 1KTEA 3WGXA 3TKSC 1BEDA 4POBA 2YWOA 5ECNB 2IL3A 4KCEA 3W8JA 3IC4A 1PGTA 2LRNA 3UGFA 3RHBA 1A0FA 4AK7A 2EIRA 5GSTA 4N2ZA 3O3TA 4V2NA 5IMFA 2EIQA 1OVNA 4MH3A 4IS0A 1XFLA 2VL9A 3IDVA 1HNAA 5FKCA 4KH7A 2JZSA 3UMAA 1Z9HA 2X8HA 1OC9A 3TKSA 3WT1A 2KHPA 1X0RA 1GTAA 3GSSA 1ERUA 3G7IA 1BX9A 4LMWA 1HNCA 1W89A 4MZBA 4DSSA 3SWLA 2HRFA 4YQMA 2H76A 3EU4A 3L9UA 3DGQA 1GP1A 3OR5A 3ZTLA 11GSA 1TK8B 3OM5A 3FRCA 5E4WA 5ECQB 4HUAA 1XZOA 3ZYWA 1TOFA 1ZCPA 2H1AA 2B6MA 2EXKA 2GS3A 1GUHA 4KC8A 5D9WA 4YAVA 5G1LA 2I9HA 3Q19A 4HQZA 4K8MA 5F05A 3TJJA 3WASA 3O76A 3GTUA 5GLLA 4KB3A 4UDGA 4JE1A 3LYPA 5AYCA 3IK9A 4IN0A 3APOA 2G0FA 4WEYA 3BYJA 2L5OA 6GSYA 4MA9A 1MD4A 4XS4A 4JEDA 5FLWA 5ECSA 4E8HA 5CRDA 2RLIA 5ANNA 4MPGA 1GLQA 1EZKA 3OM6A 2LKUA 4WETA 1BJXA 3TJBA 1PSQA 2M46A 1T7PB 3TRQA 4PUFC 3R4ZA 3WAUA 2PPTA 4RQXA 1GNEA 3CRTA 2LS5A 5EL8A 5GLNA 1N8JA 3PINA 1EWXA 5IIZA 4K9ZA 5GLPA 1YJ6A 5AIXA 3Q6OA 4ECIA 2L59A 2AAWA 2OBIA 4F9ZA 2VOCA 4TR1B 3IPZA 4ZL9A 1ZMAA 3QMXA 2H66A 2IPAA 5AYDA 4WBRD 1O8XA 1YY7A 4ZBBA 1B48A 1XBSA 2AYTA 1WOUA 3SC7X 3IRAA 5GLQA 22GSA 3C71A 2RIIA 4XRAA 1WWJA 3V1WA 2VL2C 1W18A 4LA1A 2C4JA 3UL3A 2ON7A 2VIMA 4KDYA 4PQ1A 3D22A 2DLXA 1BG5A 4G19A 3WN0A 2K18A 2AB6A 19GSA 3WD6A 1U87A 1Y25A 3WGEA 2E2GA 2TIRA 3PGTA 4JZQA 1M9BA 4I6XA 3DD3A 4XTSA 3UVTA 2B5XA 2WB9A 3MWHA 2PUKC 3EWLA 1ON4A 1FAAA 3VSFA 4X1UA 5IMAA 3ISOA 4MJEA 1GUMA 3PH9A 5A8DA 3QPMA 5CRWA 4F82A 4UDKE 2LJAA 1USBA 3HD5A 2GSQA 2X8GA 3FR6A 4MLGA 4X43A 2GSSA 4XCSA 2C8UA 4O8PA 1TDIA 1SMPI 5HQPA 2IFQA 4ECJA 1WMJA 4ZB9A 1EOGA 2C80A 1A24A 2GLRA 1M2BA 1PD21 1SJ6A 3HYPA 5ECIB 2X8FA 2VL3A 5D9TA 1X9SB 2PERA 4EDYA 2FNOA 2GT5A 3NQHA 1GNWA 1YQ1A 5AYEA 5AISA 1KNGA 4N2RA 4K7OA 4KAEA 1PN9A 2Z9SA 1B9XC 1I9DA 3HCZA 2AEYA 4Q5QA 1XW6A 4RI7A 3QFAC 4CW9A 2HSYA 3P2NA 3VT2A 2B7KA 3CTGA 4TN8A 4MPFA 5A4WA 2DJ3A 5AIVA 1XOAA 4GLTA 4GSTA 3RWKX 5A4UA 2MZCA 4N0VA 3F6DA 1XW9A 2FD3A 4O5RA 4OD7A 5AN1A 1XWKA 3VWWA 3F8UA 3GUSA 3QOUA 1PRXA 5ECOB 17GSA 1H4OA 2VAFA 4WR5A 2OA7A 2YNXA 1GH2A 3DVXA 2JZRA 4NV5A 3TGZA 1LU4A 2H19A 2E7PA 1A8YA 3UEMA 5A5KA 3TAWA 1QXHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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