4KCAA

Crystal structure of endo-1,5-alpha-l-arabinanase from a bovine ruminal metagenomic library
Total Genus 181

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
635
structure length
635
Chain Sequence
IIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGSGSGPSTYELKRVSVHDPSIVWDPSSKTYYIFGSHRAAAKTTDLMSWTAFTAPWKTATSNNAANNVAFETPAVKKVKKGGVDVDFPAFSATKWSAKGGSGYSVDGNMWAPDVIYNKVLKKWCMYLSINGNAWYSSIILLTADNIEGPYLYQGPVVIGGFKNGTEYKETDFELVLGPQSSLPERYATGGKWGDRYPNNIDPCVFYDEEGKLWMTYGSWSGGIWMIELDENTGLRDYDVTYELTGSGNGITVDPYFGKKIAGGYYVSGEASYIEYIGGYYFLFVTYGGLAAGGVASDYNNGGYQMRVFRSEKPDGPYLDARGTDAVFASYKLDFGPDANDNRGVNIFGAYGDWGNQTKGKNSERSQGHNSIIAAEDGRTYLVYHTRFQNRGEEHEVRVHQVFQNEDGWLVAAPFEYTGETVKSADIATSQQVPTNKIAGSYKLLTHPFKLDHRVKELAKPVDIELNADGTITGSTTGTWSVKEGTSYITINLDKEYKGVIVEQTLEPTSDKAFVFTALNRNGVTIWGYKPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
publication title Mechanistic strategies for catalysis adopted by evolutionary distinct family 43 arabinanases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endo-1,5-alpha-L-arabinanase
total genus 181
structure length 635
sequence length 635
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.99: Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase.
pdb deposition date 2013-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.128.10 Mainly Beta Beta Barrel Lipocalin Lipocalin 4kcaA03
2.115.10.20 Mainly Beta 5 Propeller Tachylectin-2; Chain A Glycosyl hydrolase domain; family 43 4kcaA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kcaA01
1PKZA 3KD0A 3VSFA 1TU8A 4PNFA 5GLNA 3KF3A 2G2QA 1DSBA 1O81A 4FIWA 2HSYA 4ISDA 3HVVA 5ECKB 2P0GA 5IOWA 1GL8A 3ZZXA 3NQHA 1NM3A 20GSA 1F2EA 2RUFA 3VT1A 4PURA 4K0GA 2CX4A 2H76A 1A0RP 3WAUA 2NDOA 4MZBA 1EGOA 4XHMA 1NHOA 5HFKA 5ECLB 1K0BA 2DIZA 1A8LA 18GSA 4L0UA 2H6ZA 1YQ1A 1MDKA 2DJ1A 4LLRA 3LFLA 3M8NA 1ACVA 1OKDA 5ELGA 1UV4A 19GSA 2C0GA 5ECHB 3LQ7A 3TUEA 3C7OA 5JCGA 3LYKA 1M99A 3VWWA 1BEDA 1K3LA 4OFNA 3C1RA 2B6MA 5CRWA 2FD3A 4OWYA 3KXOA 1FOVA 1KBNA 3ZVJD 3I43A 5JWQB 3I6AA 3WGXA 2C4JA 5ABRA 3M9KA 4KSOA 2VUPA 3D0ZA 2X8FA 3C7GA 4N4BA 3GX8A 1GYDB 1B4QA 4HU9A 3UVTA 4MPFA 5HR1A 3TKRA 1TKDB 4N0ZA 3NIVA 2K6VA 4MLYA 3GN3A 4POBA 2O87A 1SK1A 3VI7A 3OM7A 2VD0A 3RHCA 4AJ8A 2HSHA 2MBTA 4J2FA 4NOVA 2PUKC 5GSTA 3MWHA 1KTEA 5JCUA 3TOUA 3A2VA 3ISOA 2CAQA 3D4MA 4AJ7A 3BYJA 2TRXA 1HQOA 5DALB 2OJLA 12GSA 4FYBA 1SL0B 1XWBA 4IJ3A 5B7CA 4RUVA 5IO2A 2R37A 2GSTA 4HQSA 1W89A 5JOYA 3QAGA 1JZOA 5CNWA 3I9V2 1JHBA 1O7UA 3F63A 4LMWA 1AXDA 4PQ1A 1FVKA 4MDCA 5CP1A 4MABA 2B5XA 1MTCA 4EO3A 4AK7A 5AYDA 3LSZA 4GSNA 1HNCA 2VL3A 2B3SA 2IFQA 1MD3A 2JSZA 4IN0A 3O76A 1AQVA 3GKMA 1LBKA 3L9SA 4ZL9A 2VCQA 1J0FA 5CRHA 1MDJA 3US3A 14GSA 2B4WA 3NZNA 5KN2A 1ZL9A 3HJPA 4TXVA 3PIGA 2H1BA 3HA9A 4EL1A 4XS4A 4EKZA 1U6TA 2WCIA 3FZ9A 3GTUB 2MYGA 4PQHA 2I3YA 3ME8A 4V1Ap 5IMCA 2X8GA 4X0XA 1YDKA 4TXOB 2GSRA 2FWGA 2CZ2A 1FB0A 5ECQB 4KB3A 1AAZA 4GXZA 5D9TA 3P8WA 2H19A 3BJ5A 3WT2A 5DVBA 3ZYWA 3LV4A 2HYXA 1R5AA 2FWHA 2IWTA 2YCDA 1OYJA 3LEMA 2PU9C 1S3AA 1WL7A 1GSFA 1PD21 1HYUA 3LWAA 5F05A 4HUAA 3MAKA 5ID2A 4MP4A 1SMPI 1OC3A 3HD5A 2EIOA 4KDYA 1ST9A 3ERGA 1M9AA 1Y9GA 3VPTA 5D8IA 5FK7A 1A8YA 5LNKe 4K2DA 4TR1B 5ECPB 1RK4A 3EURA 4KC7A 4K0NA 2YANA 2V6OA 2VO4A 3C73A 2OE3A 2YN1A 3A2WA 1BQ7A 2F3MA 1SJ6A 4KE3A 2XQRA 1SD9A 1SKSB 5E59A 1WMJA 4N10A 3QD9A 5IPHA 2DMLA 3IAM2 3BBYA 2YZHA 2GZYA 1AQXA 3VK9A 3GX0A 4G19A 4O5RA 1B48A 2X8SA 2ZNMA 2B5YA 2VCTA 5B6MA 3QPMA 1FVJA 5EVOA 5GLQA 2PWJA 1YEPA 2D2ZA 2A4VA 2M80A 2YFSA 5H5QA 2RM6A 3KH9A 3O3TA 5IMVA 5ELAA 1WOUA 1SL2B 4JE1A 2LRNA 1EZKA 4ML6A 3N9JA 1S3DA 3TAWA 4BVYA 4NHWA 3WGEA 2HE3A 3ZL5A 4BWQA 3C7HA 1EP8A 2GSQA 1GNWA 5B6NA 1NSWA 4IQ1A 5IMFA 2OBIA 2DJ3A 2C0DA 2H0IA 3IR4A 4ZILA 4OFTA 4PGTA 4TVEA 2VLTA 1NHYA 3FRCA 4ZIJA 3CTFA 1FB6A 2REMA 2GTUA 2VD1A 2HNLA 2GT5A 1FAAA 2YFTA 1XVQA 2O8VB 2V6KA 3IRAA 1F37A 4WXTA 2H1DA 4TRXA 4GCIA 5G31A 4UDJA 1Z6NA 2FA8A 4FFGA 2FWFA 1E6BA 3RDWA 1TJDA 1K0AA 2EIQA 1TK0B 4TR0A 3FYGA 3ERFA 5DDLA 1T1VA 2WS2A 1TK5B 3IHQA 4LL4B 3HKRA 4GSTA 1E2YA 3CSIA 3IDVA 2X8CA 1V57A 3E0UA 5DJLA 5G5EA 4HU7A 1OC9A 3GIXA 3ZXLA 5D9VA 5GLLA 4LL1B 2YV7A 3KZQA 3AKIA 2YFRA 1GLQA 2AV4A 3MNGA 3QC2A 4HQZA 4MH2A 4F9ZA 2JL4A 1XW6A 4ML1A 1G6WA 1GSDA 5AGYA 3IOSA 5JOXA 3TRQA 3GV1A 1GH2A 1H4OA 3H93A 4K8MA 3VT0A 3H79A 5GLPA 4K7OA 2YV9A 4NXIA 2CZ3A 3AKFA 1EEMA 1TI1A 3JCML 4EDYA 5A7VB 3D60A 2QC7A 3GKKA 4IBPA 4PUAA 5IMZA 4O8PA 5JOZA 2AYTA 1PX6A 1F3BA 4JZQA 4KCAA 4K9ZA 2JSYA 4GLTA 3M3MA 16GSA 2ES7A 1SKRB 3EMXA 1EOGA 4NHZA 3EVIA 4L5LA 1KEBA 2RM5A 1ON4A 2L6DA 1SYXA 2OA7A 2VOCA 3H4KA 2C0EA 2PBJA 2DIYA 4MF7A 4EVMA 3WMZA 1Y6EA 2HI7A 4UDKA 2E7PA 2H6XA 3HZ8A 3SWLA 3ZTLA 4L8EA 4JU5A 1UYPA 1ZGNA 1F9MA 3DYRA 3BCIA 3FK8A 1GUHA 4O92A 4XIHA 3LFIA 2B1LA 3U6VA 2YNXA 3UJ1A 3UBKA 1UN2A 1TDIA 1XWAA 1TU7A 2WGRA 3U75A 17GSA 2IMFA 5D73A 1K0MA 2QSIA 5IMAA 4F0BA 4DSSB 5KN1A 1X9SB 3QCPA 3QZ4A 4X1UA 2XPDA 3DKSA 4D73A 3TGZA 1A24A 1A23A 1BYEA 3HYPA 4F82A 2YPMA 1IYIA 3WATA 1O85A 1XW5A 3A3TA 3GRXA 4ZXGA 4I2TA 4FFHA 2R6KA 2HRFA 3LXTA 3GH9A 1ML6A 3GSTA 3EYTA 13GSA 3U5RE 3WN1A 1U87A 3C7FA 3OM5A 2F8FA 2N5AA 2WZ9A 3V1WA 3J7Yk 1MDIA 1DBYA 4WEYA 2JZSA 2LQOA 2FCHA 4AJ6A 3UOMA 4XRAA 5HR0A 9GSSA 3QFBC 1VGLA 3D61A 3TKSA 5IOXA 1SJZA 2L6CA 5AN1A 2KP2A 3TB2A 1PL1A 3BYNA 3TJKA 3EE2A 3RWKX 3F8UA 4PXOA 1DE1A 4ZBBA 3WYWA 2DJ0A 5HQPA 3Q6OA 3GA4A 1TP9A 2K9FA 3BYKA 3GYKA 1ZYQB 2IPAA 3ZXJA 1KNGA 2GQKA 3GKXA 1Z7PA 4KA0A 5FLWA 1BX9A 2I81A 4EF0A 3G7IA 3UMAA 3IV4A 2WFCA 1VF2A 3OM6A 2CX3A 2L5OA 3F6FA 1I9DA 1TRVA 3M0FA 2IMKA 1B9YC 4Q5FA 1CQHA 1M9BA 4MJAA 3IK7A 4TW5A 3GNJA 5INYA 2H72A 5A4UA 2R3XA 4K6XA 3EU4A 1T8EB 4GWRA 2DC5A 1U3AA 3IE3A 3WMYA 4OCFA 1EV9A 1PKWA 2FA4A 4IKHA 3IAS2 3DRNA 4GTUA 4LA1A 3FEUA 4PVIA 4N2ZA 3LGCA 2L4QA 3G9BA 5A8CA 3ZMKA 1GSYA 2VCZA 4XTSA 2C1YA 1VF1A 2V2GA 4QQ7A 4ZBAA 2OE1A 5ANNA 1VKDA 4KUNA 1MEKA 2MBSA 4N30A 5IQYA 3HJOA 4Z7XA 1GSSA 4FYCA 1YI7A 2AAWA 4KH7A 1V9WA 2O85A 2WULA 5ENUA 2X64A 3PH9A 5H5RA 4EC0A 4E8EA 5FKBA 4E8HA 4MPGA 2K8VA 3VFIA 2H70A 4NWYA 5A5KA 1TRWA 1Q4JA 3F3RA 3KCMA 1OKTA 4RI6A 4DVCA 4TR4A 3D4TA 2H01A 2BJXA 3H8QA 1FO5A 2X99A 3ZRDA 2IMIA 4RI7A 5FT3A 2H66A 1GLPA 1JZDA 3J7Yb 3WPZA 5B6SA 3FW2A 4HJMA 2LRCA 4O7HA 2GLRA 3PGTA 1X9WB 1HD2A 4KMIA 3FY7A 2L57A 3DIEA 2VLUA 5JCWA 4IGJA 5L71A 5FMDA 4Q5QA 3KM6A 1YEXA 1WRYA 2JZRA 1B4PA 3K1UA 2GVPA 1ZCPA 5D93A 1BJXA 2HT9A 4WF4A 2VCXA 2RIIA 4I8BA 4PVAA 4EUYA 1GUMA 2M46A 1PL2A 1GTAA 5GLOA 2GGTA 3L0HA 2PMTA 1ST8A 3EINA 4KGIA 3ZREA 4TKYA 4U6BA 4XRDA 4FO5A 2VL2A 5GLMA 4HI7A 3M9JA 2KUCA 5F0GA 1XXUA 1W2TA 1WJKA 1OAZA 1SJIA 2WRTA 2B1KA 2E0QA 2FUG2 3L78A 3C2UA 5COHA 4MMMA 4J56E 4O32A 1S3CA 3N5OA 2OADA 3VWVA 3WN0A 4TR3A 4X43A 3APOA 3DMLA 3FZAA 2GSSA 2IMDA 2VCWA 2E2MA 3KF5A 1M2DA 1TI3A 2H71A 4I97A 4POLA 4O8NA 3VI5A 3CRTA 1THOA 4HZ2A 2PN8A 1PMTA 4UDKE 5ECMB 2H75A 1RQMA 2ZCTA 3BD2A 4IQAA 5DALA 3GSSA 3L4NA 1THXA 5AYCA 2MZCA 4ZB9A 4P3YB 4DSQA 4IJIA 4EDZA 1Y9MA 3HVSA 2IN3A 3DWVA 2OBKA 3F6DA 3DGQA 4GRFA 1W18A 4JRRA 3KTLA 2MMZA 1TRUA 1JIWI 1JFUA 3MSZA 2CVDA 2K8SA 1WE0A 2GT6A 3OM4A 1K3OA 3Q74A 1J9BA 4IP6A 3WT1A 4KC8A 1WP0A 2QKEA 1SKWB 4I6XA 3KEBA 3ME7A 3P90A 3W8JA 2LV3A 4Q5NA 3CSHA 4AK6A 3H1NA 1V2AA 3APQA 2QGVA 2HLSA 6GSSA 5D9XA 3DEXA 1G6YA 2EC4A 3FR3A 1LU4A 4G9HA 5J4UA 2YZUA 5G1LA 4OO5A 4WBJA 5KN3A 1YIFA 5B8AA 4WETA 4D73B 1V58A 2BTOT 1A0FA 1YRZA 1GSUA 1ZZYA 3BOAA 3GTUA 22GSA 5ECNB 4TXOA 4AF2A 5B6TA 3ZMLA 1OE7A 2GZZA 5IM9A 4V1Ag 3TKSE 2ZUPA 3C7EA 2LKUA 1YKAA 2VLVA 3G7YA 5J3RA 1EP7A 1XPVA 1GTBA 3S9FA 3IC4A 3Q19A 4NV5A 2VM2A 4POMA 2LNSA 1QUWA 4O8OA 2YJ7A 3VT2A 4OO4A 4I2UA 1GSQA 1XWKA 3EC3A 4TR1A 4HS1A 2ADDA 2IJYA 2B7JA 4I5QA 2KP1A 5AIVA 2XBIA 3HVXA 2RN4A 3KGKA 3RAZA 3FR6A 4ECJA 3D5JA 5JOWA 2XHFA 2CA8A 3ZXKA 1VF4A 3UL3A 5LD0A 5HR3A 1PX7A 2LRTA 2YP6A 2A2SA 3Q18A 1GTIA 1TOFA 1G7EA 5ECIB 3OR5A 2FGXA 4KX4A 4UDIA 2MMAA 3GURA 4QL9A 1WIKA 1AW9A 1EEJA 3IXRA 3SBCA 1XBSA 4N1IA 1RW1A 2OACA 3QEDA 4WBRD 3LF7A 1JLVA 3UAPA 3LDRA 3LYPA 2DLXA 2XC2A 2FHEA 5DCGA 3FKFA 2YOIA 3QAVA 2LQQA 4DEJA 2FNOA 2TIRA 3AKHA 2JZTA 3NOFA 3QAWA 4YQUA 1T4ZA 3ZVJA 2VIMA 1T00A 1QXHA 3LXZA 2H73A 3F4SA 3UARA 4ECBA 1PQNA 4ACSA 2F8AA 4YAVA 1XOBA 5CREA 4IW9A 1OE8A 2VM1A 1OVNA 3G7JA 1Y7BA 5AISA 1M0UA 4MA9A 2RUEA 4MJCA 5J41A 1K0DA 1XOAA 3ED3A 4H86A 1EGRA 4FYUA 2XPEA 2NPBA 5ECRB 1V40A 4TOPA 1TK8B 5GAND 2L4CA 5GZZB 3K8NA 5GLKA 2ALBA 2RLIA 2H6YA 1SK0A 5DQSA 3QEEA 3C1SA 1PGTA 1R5PA 1J08A 4MF6A 4ONZA 4FFIA 1PRXA 2G0FA 3D5YA 5G30A 3KP8A 3F9UA 2O89A 4JR6A 3DVWA 1U3IA 4IS0A 4JR4A 5ECOB 2HZFA 4GSSA 1AQWA 2X8HA 3C7MA 6GSWA 5FIXA 3UGHA 5IO0A 5C0PA 4N0VA 4HEA2 3FZ4A 5J5NA 2GDRA 3UGFA 3UIWA 1M2BA 1SK2A 2LTKA 2DJ2A 4PUFC 2IFQB 2F9SA 3R4YA 3KMOA 1M7TA 2HXKA 3HCZA 1DE2A 1CQGA 4YAPA 1SD8A 2CV4A 2PERA 1AUCA 2N5BA 1EWXA 3RPNA 1YKCA 1GYHA 1UC7A 3D22A 3GL5A 4KDXA 2J9HA 3KMNA 1YF1A 4ECCA 1Z3EA 3WGDA 2CT6A 4OD7A 2C3QA 3VWUA 4XS4B 2LS5A 5A7VA 2NVLA 4ECIA 3KTBA 3TJGA 3ERWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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