4KCAA

Crystal structure of endo-1,5-alpha-l-arabinanase from a bovine ruminal metagenomic library
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
635
structure length
635
Chain Sequence
IIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGSGSGPSTYELKRVSVHDPSIVWDPSSKTYYIFGSHRAAAKTTDLMSWTAFTAPWKTATSNNAANNVAFETPAVKKVKKGGVDVDFPAFSATKWSAKGGSGYSVDGNMWAPDVIYNKVLKKWCMYLSINGNAWYSSIILLTADNIEGPYLYQGPVVIGGFKNGTEYKETDFELVLGPQSSLPERYATGGKWGDRYPNNIDPCVFYDEEGKLWMTYGSWSGGIWMIELDENTGLRDYDVTYELTGSGNGITVDPYFGKKIAGGYYVSGEASYIEYIGGYYFLFVTYGGLAAGGVASDYNNGGYQMRVFRSEKPDGPYLDARGTDAVFASYKLDFGPDANDNRGVNIFGAYGDWGNQTKGKNSERSQGHNSIIAAEDGRTYLVYHTRFQNRGEEHEVRVHQVFQNEDGWLVAAPFEYTGETVKSADIATSQQVPTNKIAGSYKLLTHPFKLDHRVKELAKPVDIELNADGTITGSTTGTWSVKEGTSYITINLDKEYKGVIVEQTLEPTSDKAFVFTALNRNGVTIWGYKPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mechanistic strategies for catalysis adopted by evolutionary distinct family 43 arabinanases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endo-1,5-alpha-L-arabinanase
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
total genus 181
structure length 635
sequence length 635
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.99: Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase.
pdb deposition date 2013-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.128.10 Mainly Beta Beta Barrel Lipocalin Lipocalin 4kcaA03
2.115.10.20 Mainly Beta 5 Propeller Tachylectin-2; Chain A Glycosyl hydrolase domain; family 43 4kcaA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kcaA01
1B48A 2CT6A 5A5KA 1SJZA 1MD3A 1HYUA 4ML1A 3F4TA 4LLRA 5DBQA 1XCCA 4N30A 1NW2A 1F3BA 2YN1A 3FZ4A 3JCML 3TKPA 3AKFA 2JSZA 5D9VA 2L6CA 4AK7A 3GNJA 5FMDA 3ZRDA 4MDCA 3VK9A 2A4VA 1X9SB 4BL7A 3L9UA 2LJAA 1A0RP 2PVOC 1W2TA 5DALA 1ON4A 3HYPA 3F6FA 3F6DA 4RQRA 2LRCA 1GWCA 5GLKA 1T3BA 2P5QA 1Z7PA 3DGQA 2E2MA 1OAZA 3DD3A 3LGCA 4DSSA 1THXA 2RIIA 4KCAA 4MH3A 1EOGA 4NPBA 2LUSA 3IHQA 4ZBDA 3MNGA 4YAVA 3FR9A 3Q6OA 5AGYA 4V1Ap 3GTUA 3TJJA 4EL1A 3CSIA 3GUSA 1BAYA 4CW9A 2LEGA 1SJ6A 1A2LA 3FYGA 1B8XA 4MLYA 2X8FA 1LJRA 2KOKA 3A2XA 4HZ4A 1GH2A 2ADEA 4J57E 5ECPB 3TB2A 2O7KA 2LJRA 5FIXA 3TJGA 4EE0A 3UAPA 5E4WA 1TRSA 3GTUB 2DIYA 3TRQA 1ERVA 4YQUA 4YAPA 1Z3EA 2C3NA 4LMVA 5D93A 4KAEA 3FZ9A 3O76A 3LDRA 1R4WA 2GSTA 5G2ZA 1G7OA 2HXKA 3HJPA 5IMVA 2YPMA 2OJLA 2GQMA 1ST8A 4AGSA 1SL2B 4ECBA 3HCZA 2X8TA 4F9ZA 1O85A 2IJYA 1Y25A 5EVOA 3E9JB 4WEYA 4ZBBA 4N4BA 4GTUA 4EKZA 1SYXA 1PX6A 17GSA 3UL3A 1KNGA 1GUMA 4I2UA 4V2LA 3RDWA 2EIOA 4MJBA 2FNOA 4DSRA 1Z9HA 5AISA 1USBA 4HEA2 4PUAA 3VPTA 2VL2A 3BYLA 2L57A 4PNFA 4KW6A 3TJBA 3ZMLA 1B4QA 2HE3A 1F9MA 3VI7A 4JZQA 4X1UA 1KBNA 3KD0A 1A8LA 4XS1A 2AEYA 2R2JA 3HVSA 2XPEA 3W8SA 3WPYA 2XC2A 1N2AA 2J23A 4U6BA 2AHEA 3QDNA 3F3RA 4KNDA 3CTFA 4WKWA 5ECLB 4K2DA 2FLSA 2DMLA 2KLXA 2B7JA 1GSDA 1DE2A 2VAFA 3OM6A 4G10A 4IJ3A 2L6DA 2GVPA 5FK7A 2I9HA 1AUCA 1J08A 3VPQA 1TOFA 1PKZA 2WZ9A 3DRNA 4J56E 1YKCA 2EXIA 2PPTA 2YOIA 1B9YC 4ZB6A 5CYYA 4HI7A 3PINA 2DJKA 1OC9B 3O6TA 5FLWA 2F8FA 4YQVA 3C7EA 3VT0A 2MMNA 5EPFA 4JE1A 5AYCA 1ABAA 2QKEA 4G19A 3ME7A 3GA4A 11GSA 5DDLA 2OKAA 4AJ6A 2P5RA 4OCFA 2MZCA 2C0GA 4MCUA 1T8EB 5AY9A 2MMAA 2EXJA 5GLMA 3UBLA 4ZL9A 2BTOT 3LFLA 5H5QA 2VCQA 2LSTA 4MZBA 1NM3A 4WBRD 2LS5A 3EU4A 3L0HA 4COTA 3GL3A 1HD2A 1ML6A 3GSSA 2L4CA 2O8VB 4PQ1A 3D0ZA 4RI6A 1RW1A 1WOUA 3MSZA 1K3LA 2XHFA 3GHAA 1VF4A 1W89A 2QSIA 3UIWA 1K0AA 3CSJA 5F07A 2X99A 3IAM2 3ZXJA 3EURA 5LCZA 4WETA 4UDJA 1B4PA 1MD4A 3KH7A 1V57A 2EIQA 5IMAA 3MDKA 5DCGA 4GQCA 3UGGA 4O8NA 3DKSA 2V41A 3LXZA 3L9SA 5IM9A 3KTLA 1Z6NA 1RK4A 1J9BA 3M8NA 4IBPA 5FT3A 1SKSB 2QQUA 4YH2A 4CHSA 3HZ4A 1CQHA 1EP7A 1ZYQB 1WL7A 22GSA 4TR4A 3TUEA 3G7JA 3PR8A 4OWYA 2AYTA 3G7YA 4OO4A 3HJMA 4KC8A 3TRXA 3OM4A 4XS4A 2GGTA 3GN3A 1QK8A 1EOHA 5HQPA 3KJYA 1V98A 3LORA 4MLGA 3H4KA 5KEJA 3TKSA 4POKA 5JOXA 3AKGA 5D96A 2H30A 3WPVA 3GX0A 2H66A 3P2AA 4GSNA 1JIWI 2B1KA 3TAWA 2FUG2 2JACA 5J4UA 1Y7BA 2F9SA 3RPPA 3US3A 4MPFA 1T1VA 5A4VA 2C3TA 5JOWA 4E8EA 2J9HA 1O81A 1Y6EA 5J5NA 4IQ1A 3M0FA 2FD3A 1ILOA 4IS0A 4H86A 5GLNA 5IIZA 2FA8A 3HD5A 5KN2A 3EVIA 1OVNA 1X5EA 1ZGNA 1VF2A 4O7HA 1XOAA 1YEXA 1XPVA 2YNXA 5G30A 5D73A 1BQ7A 3AY8A 5HR0A 1SD9A 2PVQA 3ERGA 1A2MA 2R3XA 4L0WA 4ZL8A 3NQHA 3VWXA 3DMLA 4FIWA 2H75A 4OO5A 1H4OA 2C1YA 4JBBA 1O8WA 3H8QA 1FO5A 4QL7A 12GSA 2QQWA 5B7CA 2R37A 3AKIA 2B3SA 3BD2A 1Y4WA 2IFQA 4QQSA 4D73A 2P0GA 4GF0A 2LQQA 3C1SA 5CRDA 3PH9A 3I9V2 3RBTA 3WD6A 3OM5A 3NIVA 3U75A 4X0XA 5F05A 1QXHA 4Q5NA 1WP0A 3ZITA 3PIGA 2FY6A 2AB6A 2EIRA 3RHCA 4LA1A 5AIXA 2VLVA 4ULXA 2HT9A 4MPGA 2VL2C 16GSA 3BYJA 2OXBA 2HZFA 3H1NA 4XRAA 1OYGA 5DAKA 1FHEA 3WGDA 1FW1A 1G6WA 3C8EA 1A0FA 1GTIA 1YRZA 2N5FA 1WE0A 3WATA 4HQSA 2LV3A 4EDZA 2R5GA 4ISDA 5B8BA 4ZXGA 2I4AA 2OE3A 4KSOA 1AIUA 4O5RA 1A23A 1A2JA 1KEBA 4K6XA 4AF2A 2VCVA 4EUYA 5AIVA 4N0VA 2DC5A 1SENA 2DIZA 3IBHA 1TU7A 1ZOFA 2CAIA 3EE2A 1UA5A 4TR1A 4ML6A 1XWBA 1ACVA 2IMFA 2B5EA 4KCBA 3DYRA 4O8PA 1TRUA 3DIEA 4JR4A 1AQXA 4V2MA 5DJMA 2YWIA 4OFTA 2GZYA 5H5RA 2IMEA 5HFKA 2N5BA 2JZRA 4WF5A 3P90A 1R5PA 1GSEA 4TR1B 4L5LA 4IQAA 1OE7A 2VM1A 5L71A 4I8BA 1K0DA 5HFIA 4IVFA 5DVBA 3FR3A 1TK5B 2VL3A 4QQ7A 2H1AA 4HS1A 3UVTA 4KB3A 1TTZA 5EL8A 3TRPA 1F6MC 2PWJA 2X8SA 1M2DA 1XW6A 5DCHA 1GSFA 3FHKA 2H71A 5CO3A 3HHVA 5CP1A 5IMZA 4NHWA 1K3OA 2B6MA 3BCIA 4K7OA 3F4SA 4MH2A 3K8NA 3VSSA 4KE3A 2DBCA 2GSQA 2AV4A 2LKUA 1GUKA 3WYWA 1FVJA 4ZIJA 4JR6A 3I6AA 4Q5QA 2A2RA 2MMOA 1EV9A 4GQFA 5GLQA 3D5JA 3D21A 18GSA 2H0HA 5B8AA 1GULA 3TKSE 1FB0A 1R26A 1R7HA 5DQSA 4ECIA 2GQKA 1XVQA 1JFUA 4POLA 3TDGA 1SKRB 4CDOA 1HQOA 2IWTA 1S3CA 3LEFA 5ECRB 2VCTA 1GSQA 2WB9A 2H6YA 5JOZA 3VWWA 3GL5A 4NAXA 4WXTA 3UOMA 3OM2A 3APSA 3UEMA 5A7VB 2DSAA 2OBIA 4MF6A 1TP9A 1FVKA 2V6OA 3LIGA 4FYBA 5CRGA 3IA1A 5IO0A 1K0BA 1M99A 3RWKX 3C7OA 4N2ZA 3L4NA 4POMA 1EWXA 3TKSC 1GLPA 4RUVA 2QGVA 5FMBA 1JHBA 3BJ5A 2OACA 5G31A 2LQOA 2F8AA 2MBTA 3FZ5A 5LNKe 1MDKA 4TXOA 3F4RA 3C71A 1OKDA 3Q19A 4AK5A 4MABA 5IQYA 2O85A 4XTSA 1GTUA 2M72A 1EEMA 2H8LA 1SMPI 2YV9A 3IXRA 3QAVA 2WJUA 2H19A 2EXHA 4TXOB 5J9CA 4IW9A 2X64A 4TR0A 1Q98A 3R2QA 2V2GA 1TJDA 2TIRA 1TRVA 2FWHA 4I97A 1PKWA 2AC1A 5E59A 4N10A 3TCOA 1OC9A 3MWHA 3M9JA 2CQ9A 5C04A 3F0IA 2GT5A 3WN1A 2IIYA 1GSYA 2RLIA 5F8BA 4L5OA 5JWRB 3KSTA 3KEBA 2CVDA 3N9JA 2H72A 1Z6MA 3HKRA 5DQYA 1ZCPA 3KTBA 2VO4A 1OE8A 1O8XA 4OFMA 2CX4A 5FWGA 3D5YA 3GRXA 2JSYA 4PURA 3O3TA 1NSWA 1SU9A 1K0MA 2HYXA 4F2IA 1JLVA 3HA9A 3ZREA 1BJXA 3C7FA 2BMXA 3LEMA 2HZEB 4MJAA 14GSA 3D4MA 3E3EA 5ANNA 2L59A 4O32A 1EP8A 2DJ2A 3CU9A 1W18A 3UVHA 1AQWA 2B5YA 1TDIA 3P2NA 3HZ8A 3J7Yk 2EC4A 2X8HA 1XOBA 4K0NA 1H75A 2FWGA 2ADDA 4V1Ag 1UN2A 5COHA 3M1GA 5A8DA 3I43A 2WS2A 2L4QA 4J2FA 1MTCA 4HQZA 2YWMA 1W4VA 2VOCA 2HI7A 3UMAA 4Q5FA 9GSSA 3RPNA 1N8JA 1NHOA 2H73A 1MDJA 4N0ZA 5ELAA 4JU5A 2CZ2A 2DJ0A 2LRTA 1GRXA 4KCEA 3KP9A 2WULA 4ZILA 1OC3A 1PQNA 2YFSA 5IMCA 5JWOB 1JLWA 7GSSA 2OA7A 4HUAA 4QL9A 1K0CA 1GYEB 5G1LA 3C2UA 1A8YA 2TRCP 3FK8A 4KDYA 4KMIA 1YIFA 2WRTA 3KCMA 1S3DA 5EY6A 1X9MB 3C73A 3IK7A 2Z9SA 1OYJA 2NTOA 2NVLA 1QMVA 3DWVA 1C72A 2C3QA 2FA4A 1OKTA 2I3YA 5ECNB 4FYUA 2NDOA 1VKDA 1BX9A 3DVXA 2D2ZA 1AW9A 1Q4JA 2CV4A 13GSA 3SC7X 3R4YA 1F3AA 2VCZA 4ZB9A 4N1IA 3HY2A 2WCIA 4ONZA 3I69A 4BVYA 2CVKA 2ES7A 4WR4A 5B6NA 5G5EA 1XWCA 3IC4A 3GFKA 3HJOA 4RI7A 2ON5A 5GSSA 2HNLA 3QAGA 2FCHA 5D9XA 3TKRA 1SD8A 4XIHA 5JWQB 1AC1A 3VT2A 2M80A 3FZAA 2K9FA 6GSVA 5IMDA 1URMA 4RQXA 3VWVA 3LDKA 4OMVA 2VCXA 2RUEA 3PIJA 4UDKA 5FKCA 3IE3A 1JZDA 3LG6A 1KTEA 3DEXA 3EWLA 4KA0A 3M3MA 5KN3A 1PL1A 1SL1B 3SBCA 2IPAA 5J9BA 3ED3A 3TGZA 2JZTA 3L78A 4I5QA 3IDVA 2AEZA 2C80A 1A24A 3WMYA 4KDXA 3FKFA 1ZMAA 3KGKA 4MF5A 5JOYA 2IMDA 1VRSD 1XWGA 4XCSA 3CBUA 2FGXA 5FKBA 5G1KA 5D8IA 4MJCA 1T00A 2IN3A 1G6YA 3LQ7A 5GAPD 1TI3A 4D47A 5HR2A 2K6VA 1BG5A 3V1WA 3D60A 3FEUA 3F9UA 1GLQA 1VF3A 5H5SA 4BWQA 3D61A 2E0QA 2HLSA 1G7EA 4HU7A 5ABRA 3QD9A 4NV5A 2K8SA 5ID2B 2RM5A 1X5CA 5ECIB 2YZUA 3WASA 1GYDB 3ZMKA 3TJKA 2K18A 2G0FA 3IAS2 1T7PB 2M46A 4EQVA 4EF0A 2WGRA 4NXIA 1SK1A 4JRRA 1PGTA 2DMMA 3GX8A 5AYDA 4LL1B 4PVAA 1VF1A 5D9TA 3FY7A 3RHBA 4NMUA 3VSRA 4NWYA 3F3QA 3KZQA 2L5OA 3NZNA 4HJ2A 4Z7XA 2CZ3A 3IV4A 2BJXA 3TJFA 1X0RA 2LRNA 5A8CA 2JU5A 4G9HA 1GL8A 1FG4A 3ZIVA 4DSQA 5CREA 1CQGA 2VDTA 2R4VA 4XHMA 1U3IA 5GZZB 4BA7A 1U87A 4MP4A 1ZZYA 4L8EA 1XWAA 5ELGA 3GKKA 5J3RA 2PERA 1U3AA 3VURA 3SWLA 2VM2A 2MBSA 5ECQB 5FK8A 1EV4A 1M9AA 3EMXA 2AAWA 3UGFA 3QEDA 4K1FA 4KUNA 4YQMA 3DVWA 2YWOA 4TN8A 4ZL7A 3ZZXA 3G7IA 5ECKB 4XS6A 3WGEA 2FWFA 1QQ2A 1PD21 4K8MA 5F0GA 3A2VA 3U5RE 5B6MA 2TRXA 3WT2A 1YQ1A 1PA3A 1E6BA 3C1RA 1ERUA 2C0EA 3KIJA 3KH9A 4AK6A 3CRUA 4GWRA 4EO3A 3A2WA 3EC3A 1AAZA 4GRFA 2MYGA 2C0DA 3Q18A 4GCIA 3W6GA 4MF7A 4UDGA 2YWNA 2B1LA 2A2SA 1IYIA 4TXVA 3GV1A 2YCDA 1AQVA 3KF3A 2ALBA 1QUWA 3Q74A 20GSA 3IPZA 1SYRA 4TKYA 5IO2A 3S9FA 1U88A 3APQA 3HVVA 3D22A 4POBA 1SK2A 4K7IA 5AN1A 4ZBAA 2OBKA 3KM6A 3IK9A 3VT1A 2IL3A 3EYTA 4PQIA 1YZXA 3ZXKA 5GLLA 3H79A 3ZFBA 2H01A 2FWEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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