4KCAA

Crystal structure of endo-1,5-alpha-l-arabinanase from a bovine ruminal metagenomic library
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
635
structure length
635
Chain Sequence
IIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGSGSGPSTYELKRVSVHDPSIVWDPSSKTYYIFGSHRAAAKTTDLMSWTAFTAPWKTATSNNAANNVAFETPAVKKVKKGGVDVDFPAFSATKWSAKGGSGYSVDGNMWAPDVIYNKVLKKWCMYLSINGNAWYSSIILLTADNIEGPYLYQGPVVIGGFKNGTEYKETDFELVLGPQSSLPERYATGGKWGDRYPNNIDPCVFYDEEGKLWMTYGSWSGGIWMIELDENTGLRDYDVTYELTGSGNGITVDPYFGKKIAGGYYVSGEASYIEYIGGYYFLFVTYGGLAAGGVASDYNNGGYQMRVFRSEKPDGPYLDARGTDAVFASYKLDFGPDANDNRGVNIFGAYGDWGNQTKGKNSERSQGHNSIIAAEDGRTYLVYHTRFQNRGEEHEVRVHQVFQNEDGWLVAAPFEYTGETVKSADIATSQQVPTNKIAGSYKLLTHPFKLDHRVKELAKPVDIELNADGTITGSTTGTWSVKEGTSYITINLDKEYKGVIVEQTLEPTSDKAFVFTALNRNGVTIWGYKPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mechanistic strategies for catalysis adopted by evolutionary distinct family 43 arabinanases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
molecule keywords Endo-1,5-alpha-L-arabinanase
total genus 181
structure length 635
sequence length 635
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.99: Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase.
pdb deposition date 2013-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.128.10 Mainly Beta Beta Barrel Lipocalin Lipocalin 4kcaA03
2.115.10.20 Mainly Beta 5 Propeller Tachylectin-2; Chain A Glycosyl hydrolase domain; family 43 4kcaA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kcaA01
4KMIA 4KCAA 3F0IA 2LQOA 2OBIA 3KP9A 2WGRA 3MSZA 2EXIA 2BTOT 1HQOA 3IA1A 2X8TA 1JZOA 3A2WA 1GLPA 3QMXA 2E7PA 4EO3A 2GZZA 2YOIA 3UVHA 4MK3A 1AQVA 1XIYA 4ML1A 1I9DA 5ECSA 1PMTA 2FA4A 3TRQA 1SD8A 4WF4A 4BL7A 3DGQA 5E59A 1GP1A 3Q6OA 4IKHA 1B4PA 5FKBA 5B6TA 2H72A 2C3QA 1GUMA 4N0ZA 4KE3A 1V57A 4XTSA 3R4ZA 2VIMA 3H93A 3H1NA 3RHBA 3FZ4A 3DYRA 4UDGA 2ON7A 4IP1A 1SL0B 5A4VA 4KDYA 4MPFA 4KB3A 3GH9A 5J41A 4PQHA 4EXJA 5IMVA 3E9JB 1VF3A 4MDCA 3D6IA 3J7Yb 2QKEA 5GZZB 6GSWA 3TCOA 2FY6A 1YY7A 3TDGA 3VWVA 1Y6EA 4OFNA 5JCWA 3HZ8A 2EXHA 4TR3A 3I9V2 5ECIB 2IMEA 4V2NA 2VM1A 2JADA 1PSQA 5G1KA 1PD21 3MAKA 3LSZA 1USBA 4TRXA 1OYGA 4GSTA 1RK4A 4RI6A 4ZL9A 4O5RA 4COTA 3FR6A 3PIJA 3ZL5A 4IHUA 3S9FA 4YQVA 4GQCA 3GUSA 3L78A 1XW6A 2LJKA 2ADEA 3FR3A 3KMNA 3VT2A 1WJKA 1QFNA 1ZYQB 4LMWA 2R37A 3WGEA 5D96A 1S3DA 1SKRB 5A7VB 1B9YC 1U3AA 3CSIA 3K8NA 5DDLA 1ERTA 3AKFA 1SYXA 3WATA 2ALBA 6GSXA 5CP1A 2LSTA 4FO5A 2XBQA 5AIVA 1YIFA 1EV4A 5HR1A 3UAPA 4IBPA 5IMCA 4DSSA 4WETA 2PBJA 1GH2A 1Z7PA 3ZXLA 4N30A 5B8BA 3C71A 3WD6A 12GSA 1OAZA 1Y25A 1YI7A 2PPTA 3C7GA 2AB6A 3QZ4A 1O8WA 5D9VA 2XC2A 4LA1A 1M2BA 1EV9A 2FNOA 3LG6A 4TR1B 5A8CA 1XPVA 2H1GA 2H1AA 1F37A 2DJ1A 3KMOA 1DSBA 3TB2A 1JLVA 1M99A 1J08A 5CAXA 2DLXA 3VSZA 3UGHA 2IPAA 4D73A 11GSA 3AKHA 3VWUA 4BPYA 1E2YA 2GSQA 4CDOA 4K7NA 2HSHA 4AF2A 1ON4A 3NOFA 4PURA 1TP9A 4WXTA 2HZFA 4IELA 4V2MA 5COHA 1QK8A 4WKWA 2HLSA 4EKZA 4JE1A 4NAXA 3I69A 1PX6A 4PX1A 4YH2A 2TRCP 4AK5A 2H74A 5GLNA 2QGVA 5C04A 2WULA 3TAWA 5FT3A 2XPEA 1TTZA 3F6FA 3TKQA 3QR6A 2H19A 2C0EA 3LYPA 1SMPI 4PUAA 4ZBDA 1PN9A 1W4VA 1TI1A 4OFMA 2H1DA 2CV4A 5LD0A 3EU4A 5JCUA 1NHOA 5D9WA 3ZXJA 3GA4A 3LORA 1WWJA 3C7MA 3VSFA 4ZBAA 4BVXA 4G19A 2B6MA 2YNXA 2YCDA 5ENUA 2QQUA 1GSUA 2V2GA 4IVFA 3F4TA 1A24A 2R6KA 1JLWA 4HZ2A 2VCTA 1OE8A 5FMBA 4MPGA 1XW9A 4OWYA 2MMZA 3VURA 2QQVA 1B9XC 1WE0A 3GX0A 4K7IA 2IL3A 5IM9A 2F3MA 3C2UA 3TJKA 2DJKA 1FW1A 3PIGA 5ID2B 2JZTA 3LIHA 2IFQB 1K3LA 2YFSA 1ILOA 2L59A 5HFKA 1VF1A 2X8GA 2F9SA 1X9WB 2GQKA 3HZ4A 4V2LA 2E2GA 3GV1A 4F2IA 1ZYEA 6GSTA 1TKDB 5GLQA 4IN0A 1JFUA 5DALB 1GUKA 2VCZA 4OO5A 3EINA 1TJDA 2YPMA 3VT0A 3SC7X 1MDJA 5IMAA 3U75A 4K0GA 18GSA 4OMVA 4ZL7A 3TKPA 1DE1A 1X0RA 1YKCA 3D5YA 2KP1A 3LWAA 3KD0A 4FYCA 3F6DA 1GNWA 1X5DA 2B1LA 4I2UA 2DJ0A 2HI7A 1ZCPA 2KUCA 5FLWA 4MJBA 3DVWA 3AKGA 1O6JA 2YANA 3HXSA 4XCSA 4N4BA 4POBA 4OFTA 2D2ZA 3BYKA 2HXKA 3TGZA 4TOPA 1FG4A 1K0CA 4GTUA 3QEEA 1KEBA 5HQPA 1TW9A 3F4RA 5CRHA 2PUKC 5ELGA 2ZCTA 3CRTA 4N1IA 1YKAA 3RBTA 2GDRA 4I2TA 4DEJA 3FZ9A 3APQA 2F51A 3MWHA 3HD5A 3HHVA 4AJ8A 1Q98A 2VLVA 2CA8A 4PGTA 5FIXA 5ECHB 3WT2A 2E0QA 3O3TA 3PR8A 1J0FA 4EVMA 2YJ7A 5KN1A 3C7HA 3L4NA 2AYTA 1GTAA 4N2ZA 4JBBA 1NHYA 2LNSA 3ZXKA 1MDIA 2CT6A 4GSSA 3HJOA 3IAM2 1EZKA 1VRSD 3UL3A 3GKXA 3DIEA 1THOA 6GSYA 3DD3A 1M7TA 3VI7A 3QDNA 3VT1A 3MDKA 3NQHA 2YV9A 3G7JA 2RM5A 4GSNA 1XWGA 2YWIA 1MTCA 1CQGA 4OD7A 1LJRA 1AAZA 2GGTA 2YFRA 2MMOA 5J3RA 4FFFA 3O76A 2B3SA 5ECKB 1S3CA 3VPTA 4N11A 13GSA 3WAUA 2PVQA 2HRNA 1TK0B 5IIZA 2VLUA 3P2NA 3G7IA 3FKFA 4ZBBA 5B6SA 1Z6NA 2NTOA 2WFCA 1N2AA 4KC8A 1BG5A 1WMJA 2WRTA 3LEFA 2P0GA 2OBKA 3UBLA 3TUEA 3QAGA 1EOHA 1RW1A 1HYUA 3BYJA 4FYBA 2ON5A 3D4MA 5D9XA 1TRWA 2XBIA 5GLRA 3ERGA 3GSSA 5J4UA 4V1Ap 3TKSE 2REMA 3IDVA 5ECQB 2G0FA 1XBSA 2BMXA 5GLKA 2FLSA 5GSSA 5H5RA 3M8NA 2PMTA 3IC4A 1OC3A 3C1SA 5IMFA 4TXOA 3IE3A 4KGIA 1T00A 2MBTA 5EL8A 4ONZA 1AQWA 2WZ9A 2NPBA 5KEJA 2Z9SA 4KUNA 2N5FA 4G9HA 3M3MA 4I5QA 3D61A 5DAKA 4YAVA 3RWKX 1E6BA 3D4TA 2R2JA 1MD4A 6GSSA 3VSRA 1WRYA 4MP4A 1SENA 1V9WA 2FWHA 4RUVA 4MF5A 3U14A 1T8EB 4KX4A 2H70A 1R5AA 1TXXA 2H01A 3KTBA 1GYHA 4ZXGA 5AISA 5J9BA 4FFIA 1SL2B 2R3XA 4ILFA 3ZIVA 1AQXA 2WJUA 4POKA 3QC2A 3LF7A 4Q5RA 1MEKA 2H1BA 2I1UA 4GLTA 3LV4A 3N9JA 3ZMKA 4J57E 3P2AA 5A5KA 3APOA 2IMKA 5CNWA 4E8HA 5FK8A 4JZQA 5HR3A 1XOAA 4U6BA 1GSFA 1M2AA 1ERVA 1O8XA 2MMAA 2GS3A 1Y4WA 5LNKe 3PH9A 2RM6A 2AEZA 5C00A 3HVSA 4QL9A 1XVQA 2VDTA 2OKAA 5EPFA 3W6GA 3HCZA 3KZQA 3M0FA 2L4CA 3WYWA 5IOWA 4BVYA 1JZWA 3R67A 2YP6A 4XS6A 1ZL9A 2ES7A 3CSHA 3W8JA 2H6XA 3OR5A 5HFGA 3VWWA 4BWSA 2JU5A 3DVXA 4IGJA 3IRAA 2P31A 1AXDA 2YFTA 3ZTLA 5ELAA 2GQLA 3F8UA 1SYRA 5IMDA 5D8IA 4K6XA 2V41A 4HOJA 3DWVA 5DJMA 4WBJA 2YWMA 3D22A 3FR9A 3HVVA 4EE0A 5AYEA 1TI3A 1ACVA 22GSA 1JHBA 4HU7A 4ZB9A 1TU8A 3GTUA 2C4JA 5CYYA 1BAYA 4XIHA 4DSSB 2O85A 5GSTA 1YF0A 2LRNA 3FHKA 3D21A 2WDUA 5CO3A 1GYDB 1XWCA 3C7OA 3I43A 5JOXA 3FZ5A 4DSQA 4PNGA 1X9SB 2FCHA 4BA7A 2OE0A 3EC3A 1OKDA 3TKRA 4MJEA 3KSTA 1Y7BA 4F82A 3H79A 3OM2A 5ANNA 2K18A 1ZMAA 2QSIA 4EDZA 4J2FA 3LYKA 3VSSA 5HFIA 3F63A 1GTBA 1WOUA 3ERWA 3GH6A 2I4AA 4IQAA 1YQ1A 3WN1A 2VUPA 1U88A 2O87A 5DBQA 3FK8A 4D73B 3KF5A 3OM4A 3ZFBA 1JZRA 5H5SA 4ZB6A 3IV4A 2C80A 3KM6A 4RQXA 3VLNA 3U6VA 5F05A 1TRVA 5IMZA 5G5FA 3H8QA 2FA8A 4PQIA 1F6MC 2MBSA 2ZUPA 2R5GA 1V40A 1DUGA 4J56E 5JOZA 3IK7A 2DIYA 1OC8A 1A2JA 3LXTA 4UDKE 4FFHA 2A2SA 4AJ6A 4MH2A 2IN3A 2N5AA 3DXBA 5J5NA 2DBCA 1GSQA 2H6YA 3EURA 3LJRA 3ZRDA 3WT1A 4ZL8A 3ZITA 1XOBA 4Q5FA 1RQMA 3ISOA 3ZFLA 2H6ZA 2CQ9A 4KCEA 3EWLA 4GRFA 3C73A 2IWTA 4MA9A 5GLLA 1J9BA 2I81A 3DEXA 3HKRA 3GKMA 3O6TA 2WB9A 2PU9C 1EGRA 3LDRA 4V1Ag 3DMLA 5ECRB 2PGTA 2A4VA 3C8EA 4U6DA 2AHEA 3KXOA 2B1KA 1GSEA 5CRGA 1FVJA 2CZ3A 4ECJA 4JRRA 3UEMA 3Q74A 3D60A 2IMFA 3F3QA 4HJ2A 4XS1A 3FEUA 5A4UA 3BYLA 1T4YA 1PRXA 2LKUA 4MMMA 1W18A 1BQ7A 17GSA 1ST9A 1X5CA 2PWJA 3CMIA 5G2ZA 2LUSA 5GLPA 2TIRA 5B6MA 2XPDA 3OM6A 3QCPA 3TOUA 1G0TA 1A8YA 4DSRA 4AGSA 5F8BA 4PNFA 2EXKA 3QEDA 3LXZA 4HUAA 2GZPA 1KTEA 2GSTA 2B5YA 1H4OA 4ECCA 4PVAA 1K0OA 4ZIJA 1BEDA 1GSYA 3IPZA 1F2EA 3EU3A 3TRXA 1SK2A 3HVXA 5L71A 5ECOB 3UIWA 1AIUA 4AK6A 2FHEA 1PA3A 2GSSA 2YJHA 3KGKA 3BD2A 3GIXA 4QL7A 2NVLA 4MJAA 3HDCA 5F06A 1N8JA 4RQRA 1VGLA 14GSA 1XWAA 4PQ1A 1FO5A 4GCIA 4KA0A 2VOCA 2LV3A 4WEYA 1K3YA 2FUG2 5ECMB 5H5QA 1EEMA 5FWGA 3M9JA 1OE7A 1ZZYA 2H30A 4WR4A 1BX9A 2RUEA 4WBRD 1A8LA 2DMMA 2I3YA 4PUFC 5DVBA 4MLYA 2H0HA 1O7UA 2B7KA 2HT9A 2GT6A 2OA7A 3CXGA 3EMPA 1GRXA 3GNJA 2JZSA 2LS5A 3CRUA 1PT2A 1TK8B 2KHPA 1R4WA 3LDKA 3KF3A 2DJJA 1DBYA 2WCIA 4NXIA 4X43A 2DIZA 3WPYA 2I9HA 3GN3A 2ZNMA 2H75A 4FFGA 2HE3A 4EL1A 3UARA 2C3TA 1XWBA 3GX8A 5J9CA 1ST8A 1BYEA 3LFIA 1X5EA 1EWXA 3FZAA 4OCFA 3ZVJD 4HJMA 2LQQA 3BOAA 2NDOA 4O8PA 1M2DA 1XZOA 2X8HA 3EE2A 3KCMA 1QQ2A 3QOUA 2O89A 1V58A 20GSA 4YAPA 3UVTA 2GZYA 1EP7A 1ZGNA 3ZLPA 4LL1B 1URMA 4LMVA 3F3RA 1WL7A 5AY9A 4EDYA 3DRNA 1JZDA 1CQHA 2BJXA 1UVZA 1TOFA 3WMZA 3OM5A 1PQNA 3ZIJA 3VWXA 2K8SA 5JCGA 2F8AA 2B5EA 5IPGA 4CW9A 4I8BA 1GULA 4NV2A 4ACSA 5AGYA 2MMNA 4AK7A 2A2RA 2LNTA 2B5XA 3KTLA 1IYHA 3GYKA 2HZEA 4HZ4A 5A4WA 3WPVA 2HFDA 1R7HA 3TKSC 2E2MA 3N5OA 1K0AA 3PINA 4TXOB 19GSA 1XXUA 1YJ6A 4MZCA 3CU9A 1MD3A 5D73A 4NHWA 4PVIA 3CTGA 3P7XA 2YN1A 2VL2C 3M1GA 1EEJA 2VCXA 3QAVA 5DJLA 5DAKB 3GSTA 3KH7A 3L9VA 2H8LA 1VKDA 5FMCA 1NW2A 2MZCA 2CX3A 3ME7A 3L9UA 4IS0A 1R26A 5AIXA 4XHMA 1A0FA 1Z7RA 2LJAA 2V6OA 1ERUA 4EUYA 4KAEA 1OC9A 4KSOA 4NOVA 2PN8A 2YZHA 5ECPB 3TJFA 2AC1A 1H75A 1YZXA 3BBYA 4XS4A 3WMYA 4MF7A 5IOXA 3ED3A 3BYNA 3H4KA 1ZOFA 2CX4A 2OADA 1K3OA 3HYPA 2H66A 2IMDA 2IJYA 3EMXA 3D5ZA 1VF2A 2B7JA 1GWCA 5G1LA 5FHIA 5D9TA 2C3NA 1GUHA 4K2DA 4LLRA 4KDXA 2L57A 4MJCA 4WF5A 3I6AA 2EIQA 4MF6A 3UOMA 3APSA 5IO2A 4KDUA 3TJJA 1FOVA 2FGXA 2OE1A 4ML6A 4Z7XA 2LEGA 3GFKA 3UBKA 2G2QA 4GXZA 4XRAA 2HNLA 4KC7A 2DJ2A 4KSMA 4YQMA 3VPQA 2JSZA 1UC7A 3HJPA 4I97A 4IJIA 2M72A 1AW9A 3UGGA 2IMIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4KMI A;  4KCA A;  1ERB A;  1RBP A;  3F0I A;  5BMU A;  2LQO A;  2OBI A;  3KP9 A;  5HAE A;  2WGR A;  3MSZ A;  2EXI A;  2RCQ A;  2BTO T;  1KXO A;  4ORY A;  2FLJ A;  1HQO A;  4ID2 A;  3IA1 A;  2X8T A;  3WJE A;  3VE2 A;  1JZO A;  3A2W A;  1GLP A;  3QMX A;  1SY3 A;  2E7P A;  4EO3 A;  2GZZ A;  2YOI A;  2Z4I A;  3UVH A;  4MK3 A;  1AQV A;  1XIY A;  4ML1 A;  1CBR A;  1I9D A;  5ECS A;  1PMT A;  2RD7 C;  2FA4 A;  3TRQ A;  1SD8 A;  4DQ3 A;  4YKG A;  3FIQ A;  4WF4 A;  4BL7 A;  3DGQ A;  5E59 A;  1GP1 A;  3Q6O A;  4IKH A;  2DKI A;  4K5S A;  2WEW A;  3VU1 A;  3WOV A;  1B4P A;  5FKB A;  5B6T A;  4O4U A;  2H72 A;  2C3Q A;  1GUM A;  4N0Z A;  2AT3 X;  1V57 A;  4KE3 A;  1LNM A;  4XTS A;  3R4Z A;  2VIM A;  3STK A;  1T0V A;  3H93 A;  3H1N A;  3RHB A;  3FZ4 A;  4KH8 A;  1IW2 A;  3DYR A;  4UDG A;  2ON7 A;  4IP1 A;  1SL0 B;  5A4V A;  4KDY A;  4D6A A;  4MPF A;  4KB3 A;  5EED A;  5D48 A;  3GH9 A;  5J41 A;  4PQH A;  4EXJ A;  5IMV A;  4LZV A;  5LJC A;  1KOI A;  3E9J B;  1VF3 A;  4MDC A;  4UU2 A;  3D6I A;  1URE A;  2QKE A; 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