4KCAA

Crystal structure of endo-1,5-alpha-l-arabinanase from a bovine ruminal metagenomic library
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
635
structure length
635
Chain Sequence
IIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGSGSGPSTYELKRVSVHDPSIVWDPSSKTYYIFGSHRAAAKTTDLMSWTAFTAPWKTATSNNAANNVAFETPAVKKVKKGGVDVDFPAFSATKWSAKGGSGYSVDGNMWAPDVIYNKVLKKWCMYLSINGNAWYSSIILLTADNIEGPYLYQGPVVIGGFKNGTEYKETDFELVLGPQSSLPERYATGGKWGDRYPNNIDPCVFYDEEGKLWMTYGSWSGGIWMIELDENTGLRDYDVTYELTGSGNGITVDPYFGKKIAGGYYVSGEASYIEYIGGYYFLFVTYGGLAAGGVASDYNNGGYQMRVFRSEKPDGPYLDARGTDAVFASYKLDFGPDANDNRGVNIFGAYGDWGNQTKGKNSERSQGHNSIIAAEDGRTYLVYHTRFQNRGEEHEVRVHQVFQNEDGWLVAAPFEYTGETVKSADIATSQQVPTNKIAGSYKLLTHPFKLDHRVKELAKPVDIELNADGTITGSTTGTWSVKEGTSYITINLDKEYKGVIVEQTLEPTSDKAFVFTALNRNGVTIWGYKPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endo-1,5-alpha-L-arabinanase
publication title Mechanistic strategies for catalysis adopted by evolutionary distinct family 43 arabinanases.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 181
structure length 635
sequence length 635
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.99: Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase.
pdb deposition date 2013-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.128.10 Mainly Beta Beta Barrel Lipocalin Lipocalin 4kcaA03
2.115.10.20 Mainly Beta 5 Propeller Tachylectin-2; Chain A Glycosyl hydrolase domain; family 43 4kcaA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kcaA01
3QCPA 2CZ2A 4MF6A 1ACVA 4X1UA 1GNWA 4IKHA 1K0MA 1F2EA 5ID2B 5ANNA 3ERGA 4HDEA 1GULA 2IFQB 2O85A 2PUKC 4HUAA 3LGCA 1U6TA 4NAXA 4K7NA 3RPPA 3D60A 1A0RP 2AEZA 4O92A 1BX9A 3O76A 1SL2B 2GQMA 4N0ZA 4NOVA 4QQSA 2AJQB 3H8QA 3WPUA 1WIKA 3ZLPA 1T4ZA 3NQHA 3C7HA 3IR4A 3BYKA 4K0NA 4PNGA 3L9SA 2X8SA 1GSYA 1VGLA 3DKSA 3F4TA 2LQOA 1X5CA 5E4WA 3ZL5A 4E8EA 4D73A 3KP8A 1M7TA 4FFHA 3F3RA 2QQUA 2DJKA 1IYHA 5CNWA 3CMIA 2L5OA 5A7VA 3IA1A 4FYBA 4GTUA 1GSQA 3GL3A 3HZ8A 1GH2A 5AGYA 2I4AA 2F3MA 1OAZA 5FMCA 3M9KA 1Y9MA 5ELGA 5F07A 3APQA 1X5DA 2L6DA 4IJ3A 4WBRD 2H76A 1XFLA 20GSA 2PWJA 4ONZA 2OE0A 1BJXA 2IPAA 1UVZA 4WBJA 4ZB9A 2B3SA 2O87A 1OC9A 1QQ2A 4GCIA 1GWCA 1ZZYA 4TXOA 3V1WA 1ST8A 2C4JA 2L4CA 1NM3A 4HQSA 4H86A 3FEUA 1G0TA 5EPFA 1OVNA 1QUWA 1SL1B 3VSRA 1Z6NA 3HVXA 1Y25A 3ZMLA 2H8LA 2M72A 4I97A 4YAPA 1GSSA 3C71A 4NHZA 5LCZA 1A0FA 4XS4A 1V40A 3BCKA 4FH8A 4MP4A 4I5QA 2ADDA 3VWVA 2KP2A 3WASA 1USBA 2ADEA 3ZVJA 4HZ2A 1OKTA 3GN3A 5JOXA 3U5RE 1TU8A 4KE3A 4PNFA 10GSA 1BYEA 2AUVA 2AC1A 2GSSA 4O8PA 4OFTA 2GT5A 3L4NA 2CAIA 2XBIA 3C7OA 1EP7A 4JE1A 2ALBA 3GKXA 3LFIA 3KCMA 3LWAA 4ECBA 1KTEA 4MJEA 4LA1A 3KEBA 4IQ1A 2AV4A 3VSSA 4BVYA 5JCGA 1O81A 2B5EA 5AY9A 3BBYA 2F9SA 2DJ2A 2CX4A 2KP1A 2C8UA 5IMDA 4ZL9A 5FKBA 5IM9A 2O7KA 4OFMA 2VAFA 4AJ7A 4PUAA 2YP6A 5B6TA 2IMKA 4O8NA 5D96A 5F0GA 5HR1A 4EO3A 1A24A 1FVKA 2WB9A 4I2UA 3BD2A 1XWCA 1T00A 1GUHA 2RUEA 3TJJA 5JOZA 1XOAA 1GLQA 2V32A 1TW9A 1SJ6A 5DVBA 4IS0A 1URMA 4UDGA 4BL7A 2QGVA 5AYCA 3BYLA 4CHSA 4F03A 1B4PA 2F8AA 2CVBA 4KCEA 3VPQA 3WMZA 3ZIJA 2VUPA 1RQMA 1UV4A 4J2FA 3W8SA 2LJKA 2M46A 3QFBC 3HHVA 1UN2A 3J7Yb 2P31A 5B6MA 2CAQA 2LNSA 3HVSA 4XRDA 1EZKA 1E6BA 1SKSB 3AKHA 1Z6MA 3C7FA 4RI7A 14GSA 1XXUA 5GLOA 2KOKA 3GH9A 3HA9A 4KC8A 1YF1A 2KUCA 3LG6A 4CW9A 1G6WA 5KN0A 5C0PA 4DVCA 2C3NA 4GF0A 2PERA 4KNDA 1WJKA 3KF5A 3EC3A 3AKGA 3GKNA 3KTBA 1ZGNA 5DDLA 2OADA 2VL2C 1GNEA 4EDYA 5FT3A 4EDZA 4MJBA 3FK8A 4GSSA 2AHEA 1F37A 3PINA 3TKSE 3DRNA 4DSSB 1AIUA 4OD7A 3VWXA 3VWUA 4IVFA 3TKRA 11GSA 2OE1A 5KN2A 3LF7A 2DIZA 4K2DA 1Z9HA 2O89A 2QC7A 2FWGA 4OCEA 1Y9GA 4IP6A 4UDJA 1M2DA 1I9DA 2YJHA 2XQRA 2LSTA 5FK8A 1F3AA 1YEXA 1HQOA 5GZZB 1AC1A 1TRSA 3QD9A 3I6AA 4U6BA 1JIWI 2X8FA 1W4VA 3TKPA 1PX6A 1E2YA 1ZL9A 4O5RA 1FO5A 2AEYA 2IMFA 4ILFA 4YAVA 3TKSA 4GSTA 4MDCA 4KDXA 5KEJA 3FYGA 2LRTA 2TRCP 1GUMA 5FMBA 4KCBA 5JCWA 1TTZA 2F51A 1J08A 4GSNA 4KGIA 1JHBA 1XVWA 3L9VA 2HXKA 4Q5RA 2VLUA 1K0CA 4LMWA 1GTBA 5CO3A 3E9JB 6GSSA 2PBJA 4FYUA 2WCIA 5JCUA 1FHEA 5JWOB 2YPMA 4HJ2A 2H19A 4GLTA 5CAXA 1TKDB 5J9CA 1UC7A 1OYGA 1EWXA 2PVQA 1G7OA 4JR6A 4WF5A 3TRPA 5H5RA 5G1LA 5ECSA 4X0XA 3BCIA 2CA8A 2CV4A 2VL9A 5HQPA 1LJRA 1B9YC 1PRXA 5ECNB 5ID2A 3C2UA 2E2GA 5JWRB 1GYEB 6GSUA 1SJIA 4PGTA 2I9HA 3TKQA 3KGKA 2IFQA 2V41A 5E59A 3U14A 1ZMAA 2DIYA 3DIEA 5CRDA 5COHA 2ON5A 4J57E 4TR3A 4ZBDA 3ZYWA 5DQSA 1PQNA 2HYXA 4PVAA 4K7IA 3HJOA 3M9JA 1EEMA 2H6XA 1VKDA 3GHAA 5A5KA 2HT9A 2HZEB 1YQ1A 6GSTA 1W2TA 1R26A 2DBCA 4HEA2 5G31A 13GSA 4N10A 3HYPA 9GSSA 2H70A 2A2RA 4WEYA 4X43A 3E3EA 1K0BA 2MZCA 5CYYA 2YWMA 1M2AA 2H1AA 1YZXA 1ZCPA 2ON7A 5A8CA 3O6TA 1ZOFA 3GH6A 2P5QA 4O7HA 2JL4A 4COTA 5A8DA 2IMEA 3R4ZA 4POKA 4TVEA 3EU4A 1GRXA 2VD0A 5FMDA 2WJUA 2WULA 5B7CA 2H71A 2ES7A 1K3LA 3UAPA 2GZZA 3J7Yk 4N4BA 4TR4A 5DCHA 4WKWA 1XWKA 1Y7BA 4UDKA 3UOMA 2QKEA 2TRXA 3R67A 3GRXA 4ULXA 1TJDA 5IO0A 1Z7RA 2HZFA 5D93A 3DD3A 4MCUA 2ZUPA 4MF5A 3U6VA 4I6XA 1ABAA 3D6IA 1OC3A 5GLNA 2V2GA 4KC7A 22GSA 3FR3A 1XCCA 3HVVA 1XVQA 3K1UA 5KN1A 1OE7A 3QEEA 2JZSA 2RLIA 2EXJA 1CQGA 5LD0A 1SL0B 5C00A 2LRNA 1SENA 3F63A 3NIVA 3WGXA 5GLRA 2PPTA 4HU9A 3L9UA 3A2XA 2BTOT 4KDUA 2REMA 1NSWA 3GV1A 1EV4A 2BMXA 5ENUA 1ERUA 1K0NA 3GTUB 5AYEA 2JACA 1YDKA 3US3A 3VI5A 3QC2A 2DLXA 4D47A 1OKDA 1AXDA 4AK7A 1Z3EA 1WE0A 2OKAA 5DCGA 2N5FA 1PN9A 1HNAA 2GZYA 1K0DA 2WDUA 3E0UA 4OO4A 2G0FA 1EEJA 5CRGA 3OM4A 5AN1A 4TKYA 2QQWA 2IIYA 2E7PA 4BA7A 4F0BA 3U75A 1FB6A 5IOXA 2EXHA 3UIWA 3IBHA 2H72A 4L8EA 2HSHA 2GDRA 5DJMA 2DJ1A 1MD4A 1ML6A 2VCZA 2FA4A 2I3YA 4N2RA 3ZTLA 3IV4A 1SK1A 3RWKX 2EIRA 3IK7A 3LIGA 3QFAC 1S3AA 3UBLA 4MF7A 2JZTA 2B5YA 1VF4A 3CRTA 1VF1A 4WR5A 2FA8A 2VL3A 1F9MA 5J41A 1AQXA 4ZB6A 1W18A 2MMAA 2GSRA 4NMUA 3D5JA 1DUGA 3FRCA 3GX8A 2OBKA 3PIJA 1JZRA 3C1SA 1J9BA 2WS2A 2X8HA 3LEFA 2R37A 3CYNA 3FHKA 3NZNA 1PGTA 3OM7A 2A2SA 3EURA 19GSA 1T3BA 2VDTA 4K0GA 1JFUA 1MTCA 2H6ZA 1R4WA 1YRZA 1GYHA 5J9BA 5ECLB 1IYIA 5DQYA 1XWBA 2VD1A 2P5RA 2WZ9A 3VI7A 4KH7A 3VFIA 1TI3A 1O8WA 2HLSA 3GA4A 4HJMA 3UARA 1H4OA 4MLGA 2C0DA 3F4RA 4XRAA 1U3IA 3EVIA 2B5XA 3APSA 2IWTA 1EV9A 3MWHA 3WGEA 3LV4A 3L0HA 4GXZA 1TI1A 4DSSA 2VCVA 3IPZA 2IL3A 5G1KA 1BAYA 8GSSA 4PQ1A 1LU4A 4EF0A 4NWYA 1XW6A 5GLQA 5ECQB 3FR9A 3FR6A 3FZ5A 1SKWB 5ECHB 4IELA 3F6FA 1K3YA 2K8VA 3A2VA 4TN8A 1YKAA 2I81A 3GKMA 3QAVA 2X8TA 3D5ZA 5FLWA 5IQYA 4PQIA 3GURA 3WD6A 4NV5A 2YNXA 1JLVA 3LSZA 3Q6OA 3LEMA 4ECJA 2M80A 2CZ3A 3N5OA 2NBSA 1V2AA 2H1GA 3APOA 4QL7A 4G2EA 4L5LA 1O6JA 1WMJA 3KH9A 1A2LA 4WETA 2YANA 3TRXA 2AB6A 5JOYA 1U3AA 2LS5A 1M9AA 3UEMA 3DEXA 1JZDA 2PGTA 1MD3A 2WGRA 4CDOA 2H30A 3IAS2 1F3BA 5F05A 1DE1A 4IW9A 3QDNA 5D9TA 4KUNA 4N30A 4ZILA 3TDGA 4RI6A 4Q5FA 3CSIA 1UA5A 3OM6A 2C3TA 3KF3A 1VF3A 4LMVA 5IO2A 1X5EA 4QQ7A 3TRQA 3TUEA 4L0WA 3ME8A 3ZZXA 3UJ1A 1K0OA 3VT2A 4F2IA 2VM1A 4G19A 3GSTA 3ZITA 3TB2A 2K8SA 3IHQA 2QSIA 3HZ4A 2L6CA 4J56E 5EL8A 1O73A 2H6YA 2HE3A 1SJZA 1Z7PA 5AYDA 3A5WA 1NW2A 4TR0A 4N1IA 2C0EA 4IQAA 2YFSA 1XPVA 1T1VA 4ACSA 5GAND 4ZBAA 3ZVJD 3D21A 1R5AA 4HU7A 3IOSA 2VLVA 1NHOA 2RUFA 1JLWA 3PGTA 4HZ4A 5IIZA 1PKZA 3F0IA 3DYRA 3LORA 3UGHA 2HNLA 2HZEA 3IDVA 5DAKB 3CTFA 2H0HA 4JZQA 1V58A 1WRYA 2QQVA 3UVTA 3WN0A 4MH2A 1ERVA 1KBNA 1PD21 5ABRA 3MAKA 2K6VA 2MMZA 4OWYA 4WXTA 4Q5NA 1GYDB 4KB3A 3M0FA 2GSTA 4AJ6A 3KIJA 2VOCA 4PX1A 5H5QA 3WMYA 2H1DA 2H1BA 4LL4B 3WATA 3KTLA 2DJ0A 3RBTA 4L5OA 18GSA 2HFDA 4EUYA 1UYPA 3IC4A 2LTKA 4YQVA 3M3MA 5INYA 2FD3A 3EU3A 4V1Ap 4V2LA 5F06A 3UMAA 1XBSA 3CRUA 3FW2A 2F8FA 3CBUA 3R2QA 2BJXA 3WN2A 3QOUA 5AIXA 4K8MA 3H79A 1S3CA 2VIMA 3ZFLA 1XOBA 2YWNA 2HRNA 3C1RA 3C7MA 4BVXA 4FFGA 4I8BA 2D2ZA 5LNKe 2J9HA 4TRXA 4MPGA 3JCML 2MMNA 2MMOA 4OFNA 2V6KA 5IMVA 5G5FA 2VCWA 3F8UA 1X9SB 5CP1A 1EOHA 1YY7A 3TOTA 4YH2A 1RW1A 5C04A 3GUSA 1SKRB 1B4QA 2B1KA 4TR1B 1JZWA 4EC0A 3O3TA 1FAAA 1EGOA 4IBPA 3C7GA 1GUKA 3C8EA 4TOPA 5ECIB 4JR4A 3WT2A 4N2ZA 3VLNA 1FW1A 1GTUA 2NPBA 3GTUA 3QMXA 4KSMA 2ZNMA 3GX0A 1FVJA 1QFNA 1TDIA 3BYNA 3WN1A 3ZFBA 5J4UA 5EY6A 5GLPA 2DMLA 3SWLA 2FCHA 4NXIA 3BOAA 5HR3A 5HR2A 3ERWA 2NDOA 3TJKA 3UL3A 3Q74A 3RHBA 3VPTA 2LKUA 3LIHA 1ST9A 2FWHA 2L59A 2HSYA 1PSQA 2V1MA 1PA3A 1VRSD 3WGDA 2JSYA 4ECCA 3LYPA 2R3XA 3C73A 2WRTA 4KCAA 1YJ6A 3F3QA 4BWQA 1ERTA 4XIHA 6GSWA 4JU5A 5GSTA 2OACA 3UVHA 1ILOA 1EGRA 12GSA 4WR4A 4ZXGA 3GYKA 5G2ZA 1AQWA 3AKIA 5FWGA 4TW5A 2MYGA 4GQCA 4EXJA 2GTUA 4NV2A 2LQQA 1TU7A 3IE3A 3MSZA 3G9BA 4KA0A 1B48A 2R6KA 2GSQA 3ZMKA 4ID0A 3F6DA 3LQ7A 3ME7A 1TK8B 3D0ZA 4KW6A 4G10A 2PN8A 1WOUA 4GWRA 3TKSC 1M9BA 3QZ4A 2RIIA 3EMPA 2MBTA 4OCFA 3EYTA 3HY2A 3TCOA 2B6MA 5HFGA 1V9WA 1CQHA 3ZXLA 4IJIA 3LXTA 2PU9C 1HNBA 5DALB 3UGFA 2FLSA 4GRFA 3CSHA 3I69A 3GFKA 5IMZA 4KDYA 2VO4A 1QXHA 3K8NA 2FY6A 3GIXA 4OO5A 5HR0A 3H93A 3HCZA 5G30A 2CVDA 1ZYQB 3FZ9A 3TJBA 1HYUA 1M99A 4DSQA 1TK0B 2L4QA 2OXBA 1WP0A 2GGTA 4HQZA 4BWSA 4PUFC 2CT6A 3BJ5A 3VT0A 1SYRA 3QEDA 5B6NA 3I9V2 5FIXA 3IXRA 3TGZA 2JZRA 2C3QA 3LJRA 2R5GA 4AGSA 1EP8A 5FHIA 3UGGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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