2V6OA

Structure of schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase (smtgr)
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Glutathione Reductase and Thioredoxin Reductase at the Crossroad: The Structure of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 180
structure length 586
sequence length 586
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2007-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2v6oA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v6oA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA03
4EQSA 4MABA 2Q0LA 4AOXA 2AUVA 1DJNA 1GLQA 3D4MA 3GKNA 4O32A 4ECBA 4J57E 1EEJA 4EDZA 5EOWA 3C71A 2ARDA 4RG3A 1Q1RA 1MDJA 5HR1A 4XCSA 1QJDA 5HXIA 1GXFA 2B7KA 5KVIA 1GSEA 3EURA 5LD0A 1CC6A 1CBOA 1A8YA 2H6YA 1FOVA 2BCPA 3OC4A 1B5QA 3ERGA 4Q5NA 4GRFA 3QDNA 2R0PA 3IWAA 4PNFA 1GRTA 4K6XA 5DJLA 2XLRA 4AJ6A 1U88A 1V59A 3LXZA 1VDCA 1FO5A 3KLJA 4EQRA 3A5WA 3EINA 2LRCA 1M2AA 4U8PA 2YR5A 2XLSA 3O6TA 2GVCA 3D8XA 2W0HA 5COHA 4C77A 3O3TA 5FS7A 3IF9A 2ES7A 2WPFA 12GSA 2Q6UA 4DSHA 3MDKA 1N4VA 1TRBA 1GSFA 4BA7A 2OBKA 4H86A 4ZL8A 2A2SA 3GHAA 2H0IA 13GSA 2ALBA 1E7PA 3UVTA 4YSXA 3ICTA 4X1UA 1P2EA 2IIYA 3M0FA 4H4UA 5HFIA 5J41A 1AQVA 2GSQA 3ERFA 2VCZA 4USRA 4C3YA 3LFLA 1YZXA 2WQYA 4TW5A 4J31A 5IMFA 3KVEA 1ZX9A 1SL0B 2GH5A 4FIWA 4KE3A 4XIHA 1ZP0A 1ERVA 1AUCA 1EP8A 4BWQA 4USQA 3UL3A 4LL1B 4MJEA 1JU2A 1G7EA 4PUAA 2E5VA 2OLOA 1ZCPA 2WB9A 2H73A 1V98A 3NIXA 1R4WA 4TM1A 3D0ZA 3FW2A 1XANA 1QLBA 5F07A 2NPXA 2IPAA 3RBTA 1V58A 2WP6A 1GUMA 4HJ2A 5CRDA 3M8NA 4U8LA 5KVHA 2A87A 4HZ2A 1FECA 4E8EA 2YLRA 2JACA 2C72A 1IUVA 5JWRB 1XOAA 2R6KA 4MCUA 4HS1A 1XWGA 2A4VA 1YQZA 3UTHA 1DOEA 1JFUA 4YH2A 2BK5A 4V2LA 3GWFA 1Y6EA 5ECRB 1HQOA 4KUNA 3UP5A 3FR9A 2BMXA 1WOUA 2R3XA 2VL2A 3L9VA 1PN9A 1XBSA 3NN0X 3DEXA 4K8DA 1BX9A 2HZFA 4H2RA 3GKMA 3GD3A 3M3MA 6GSSA 3NYEA 2OACA 2JSZA 2DKIA 2GRTA 4D73A 5U63A 4XRAA 2YPMA 1REOA 2C66A 2DLXA 5JCIA 3LQ7A 3DMLA 4WKWA 5C00A 1F8RA 3GL5A 2CVBA 3COXA 1O95A 4UDQA 5IQ1A 2GZYA 1VG0A 2K8SA 1ST9A 1DJQA 4XWZA 3KA7A 2X8GA 4JN9A 2YJHA 11GSA 1HYUA 3LB8A 4MA9A 1Q98A 1F9MA 2F51A 3P8WA 4F0CA 4B65A 2VL2C 1K0IA 1LVLA 1KFYA 4D73B 3GSTA 2X99A 2GT5A 4K9ZA 2YQUA 3TJJA 2PVQA 3HYPA 3F4RA 4E0VA 3DK8A 1F2EA 3ZL5A 4YQUA 4YAPA 3LORA 4BL7A 1QFNA 4Z7XA 2VD1A 2C3TA 3P4SA 5DBQA 2VVMA 3RP6A 1VG9A 1TI1A 3UKKA 4GDEA 4MZBA 3KU9A 5C3JA 5ECQB 4B67A 3FIMB 5U1OA 1ZMDA 2XHFA 4NHWA 2N5BA 1XWBA 1Z7RA 3QVPA 3L9UA 4J33A 4ZBAA 3LOVA 1E6EA 3ISHA 2MBTA 5LCZA 2VM2A 3QR6A 2OE3A 5AIVA 3EWLA 4CCQA 3GX8A 3F8DA 4PAAA 3BCKA 2VCVA 10GSA 2LQOA 3CGBA 3NKSA 3VRAA 2WOWA 3ZFLA 1BQ7A 2DIYA 2PBJA 3I69A 2C0FA 1YF0A 1KSSA 4TLZA 4GDPA 3LJRA 3DD3A 2X50A 3NTAA 4OO4A 3TOUA 1PXAA 5IOXA 4OCGA 4MJCA 2E2MA 1NENA 1VF4A 2FWFA 3H8QA 1X5CA 3QOUA 2H71A 3BOAA 3KXOA 4IA5A 1R5AA 4HOJA 3VR8A 4O5RA 2C70A 2WOVA 4K7ZA 2FD3A 2EQ9A 1D7LA 4KCEA 4RI7A 3ZIJA 1RP0A 3V76A 1LJ1A 1V57A 3S5WA 4IJ3A 1SKRB 3GRXA 2BXRA 4K8MA 1LBKA 1BJXA 4J56E 2DJ2A 4A7AA 4FYBA 4FYCA 1GALA 3ADAB 1WMJA 4MPFA 3BI4A 3RHAA 5GAPD 4XS1A 5FS6A 1PSQA 1HNBA 1J08A 4IA6A 4I2TA 2WHDA 1KF6A 1H81A 4Y4MA 4O7HA 1HNAA 4MZWA 4K22A 3UJ1A 4N0ZA 5DVBA 2GEWA 4OVIA 3R2QA 1U6TA 1LJRA 4XXGA 4BVXA 4YSYA 1SK2A 4KNDA 3FG2P 1TW9A 1FAAA 2MMOA 2EQ7A 1DE1A 3C73A 2I3YA 2J23A 3CPIG 1Z9HA 4K0GA 5IMZA 3Q6JA 3JSKA 2PWJA 1AOGA 4ICYA 2MBSA 2FNOA 5AN1A 1C72A 3F6DA 4WR4A 3UKAA 1TDEA 2C73A 3K7QX 3SBCA 3RP7A 2QKEA 2JB2A 1USBA 5IPHA 3K8NA 5G5FA 2H30A 1JNRA 1PQNA 4B64A 2C75A 2FCHA 4MH3A 2RGJA 2DJKA 1T4YA 1K0LA 2R0CA 5IQ4A 2E0QA 2HNLA 2QAEA 2H76A 2B7JA 3ZFBA 1GERA 2K18A 3QJ4A 5J9CA 4LA1A 4WCTA 1ML6A 3ALJA 1NAAA 5G1LA 3VWUA 1W4VA 1XFLA 2DMMA 3EYTA 1ZYEA 6GSTA 2YLZA 3C7MA 3R9UA 1PL2A 5J7XA 1H7XA 4BK3A 1EOHA 2MZCA 1FCDA 3PS9A 1DE2A 8GSSA 4YTMA 4YWOA 3GFKA 1DOCA 4QL9A 4GWRA 2OKAA 3AD9B 2L5LA 3N9JA 4K2DA 4C3XA 4GRTA 4EM3A 2FWGA 1TK0B 1FEAA 4IQAA 2CT6A 4JZQA 4G10A 2V2GA 4O5UA 3I43A 1QQ2A 2GSSA 2X64A 1GSUA 3FPZA 18GSA 4KA0A 4DVCA 3CN8A 4UP3A 4MP4A 2M72A 6GSXA 2YG7A 2WEUA 3EAOA 4I6XA 1SYXA 1YY5A 2O8VB 4L5LA 1RSGA 3B3RA 4JNQA 2GB0A 3D4TA 1XIYA 3H79A 3KKJA 3F0IA 1M6IA 3VPTA 1PX7A 4U8IA 1TDKA 2E2GA 1H7WA 3BHFA 1YY7A 3DYRA 2C67A 3IC4A 3LGCA 2YM2A 2QA2A 3M9KA 2G2QA 4HEA2 2AV4A 4IVFA 2DC5A 3UBLA 1H83A 1BZLA 3E0UA 2BJXA 4HQZA 4GLTA 4KPRA 4H2QA 4ZXGA 2AB6A 2F9SA 2CULA 2E7PA 2JB3A 5IMCA 3U5RE 3EMXA 4IP6A 1F3AA 4NZHA 2XBIA 4U8JA 2JSYA 5IM9A 2LUSA 5HQPA 2PN8A 5H5QA 1JLVA 5H5SA 3CBUA 2H89A 2DJ1A 2RLIA 1WRYA 2P0GA 4A79A 4NWYA 4IJIA 4OPDA 2HE3A 2YG6A 1ZK7A 1G6WA 3LWAA 4YTNA 5INYA 4YXDA 3DRNA 4YSHA 2HXKA 3LXDA 2IMKA 1D4EA 1GLPA 1DOBA 4TR4A 2E1MA 5J9BA 3JCML 1YDKA 4Y4NA 4OO5A 4ZBBA 5DBJA 1PS9A 3KH9A 3UOVA 3EPTA 4YQMA 4AJ7A 1YF1A 2K8VA 3AWIA 3FR3A 3D1CA 3A2XA 2B3SA 4MLYA 2R4EA 3PINA 2XFUA 4NV5A 3QFBA 2BCGG 4OPUA 3CPJG 5DAKA 3FZAA 1CJ4A 1T1VA 2WDRA 4F82A 2GF3A 4C74A 5A4UA 2H1BA 1PKWA 1UKVG 4V1Ag 1ILOA 2A8XA 3GRTA 3AE9A 5G2ZA 1X5DA 4J57A 1CJ3A 4CCRA 3DJDA 1JEHA 1S2YA 5FHIA 2B5XA 2GQKA 3HCZA 2H8LA 4PXOA 4J2WA 1B4VA 1FVKA 1GRFA 1GEUA 1XWKA 1RW1A 2OA7A 4JRRA 4JDRA 1AXDA 3DGHA 5CP1A 5DAKB 3WGXA 1PDHA 1E2YA 2XDOA 3GWDA 4AGSA 2XFNA 2O87A 5DALA 1NHOA 2YN1A 3VQRA 1K3OA 4RQRA 1H82A 5J60A 3DWVA 4FK1A 1L9CA 2GAGB 3CSIA 3GH9A 1MXTA 3FK8A 3ATRA 1THXA 3CMIA 2AJQB 2R9ZA 3QSEA 1ONFA 3LZXA 3VRDB 4JY3A 3EE2A 2WBAA 5J3RA 4DEJA 5DALB 4Z43A 2P5QA 4AT2A 3M12A 4IW9A 1ZOFA 4I59A 1BKWA 1OJTA 1EV4A 3F4TA 5M10A 1CJ2A 2VL9A 2VOCA 3VR9A 3D6IA 2FBWA 1SK0A 2XYOA 4FK1C 1ELIA 3UTFA 4UDRA 2CDUA 2LKUA 5ABRA 4JNAA 2XVFA 3C4NA 1KNRA 1OKTA 1IUUA 4OD7A 3HA9A 5IPGA 2C3QA 1ZKQA 3Q6OA 3TJBA 3NGCX 4DSGA 4EL1A 2GTUA 2CV4A 4K7OA 2BS4A 1B4PA 3F3RA 2YV7A 5IIZA 3BJ5A 3FZ5A 4JR4A 2BC0A 1T8EB 1M7TA 1EOGA 1JZOA 4D03A 3TCOA 1B48A 2I81A 2CAIA 3AEDA 1M0UA 2H75A 3VURA 3P2AA 2IL3A 2C3CA 2V6KA 5G31A 3ZYWA 4BJYA 3DVXA 1RQMA 1TRUA 2HRNA 2YP6A 2TMDA 2IFQA 1XPQA 1GV4A 2IN3A 3W8JA 4ECHA 3CNDA 2IVEA 2O85A 4U8KA 2XVEA 1M9AA 1GNEA 3GMFA 3M1GA 4EXJA 4MZCA 3QPMA 2F8FA 3F4SA 2LNTA 4KW6A 2GAHB 3AB1A 1S3CA 1GESA 3NYCA 1QGVA 4MF6A 1A0RP 1S3BA 3TRXA 1B8XA 2MMAA 4F03A 1PXBA 1ZOYA 1GUHA 4F2IA 4G19A 2HLSA 2IFQB 4HDEA 2GT6A 2K9FA 1M2DA 5A4WA 2V32A 5LNKe 2RUFA 1VF2A 4BURA 1ZMCA 3GURA 1LPFA 2BK4A 1DUGA 1RK4A 1Z7PA 4OPCA 4ADWA 5HHFA 3FEUA 4F0BA 3QAWA 2KOKA 3MAKA 1Q9IA 5CQFA 1PMTA 1WE0A 2FLSA 2B6MA 4JBBA 2R0GA 1NHRA 4HUAA 4ZILA 4Z26A 3G7IA 2RM5A 2L57A 2ON5A 2CVDA 4I2UA 3F8UA 4NAXA 4ECCA 1FOHA 3VWVA 4L5OA 4LMWA 3DMEA 2NTOA 2AAWA 3LEFA 4XRDA 2L5OA 2OLNA 2VLTA 3A2WA 3PO7A 2F5ZA 3QAVA 3G7JA 3DH9A 3NRNA 2H6XA 4BK1A 2JZTA 2VZ2A 1GT8A 3M13A 2V6OA 2YVJA 3BNUA 2GZPA 1GPEA 4X43A 1OE7A 3NOFA 2XLUA 2ZUPA 3UBKA 2B7SA 4CHSA 1SJIA 3LG6A 3UOYA 3RPNA 4IBPA 4KCAA 1NW2A 1BEDA 4BWSA 5A4VA 1MDKA 3SFEA 3HVXA 4KB3A 2B9XA 4GF0A 3OR5A 3DK9A 5B8AA 2PMTA 3II4A 5KN3A 5CREA 1NG3A 1KNGA 1XWAA 2ZZ0A 1J9BA 2YM1A 2V3BA 1EL8A 4MJBA 3HZLA 4H4PA 1TKDB 1LTXR 4JEDA 1V40A 2PERA 4BK2A 2YVFA 2H70A 1V9WA 3GNJA 3L4NA 4EC0A 2WGRA 3AD8B 5DDLA 3C1RA 1OVNA 4YKGA 2O9ZA 2XLTA 2IVDA 5E4WA 5HR2A 1JZDA 4CY6A 3FKFA 5ECMB 3J7Yk 1BGJA 1X5EA 1SJ6A 5DQYA 3IRAA 1ZMAA 2B1LA 3WT2A 2YOIA 1M64A 1DNCA 2JAEA 5D8IA 4HJMA 5J4UA 4YKFA 3KM6A 4YTPA 1K0BA 4Z2UA 2RABA 5FMHA 3US3A 4OPGA 1G6YA 4NMUA 3NK1X 2JBVA 3G5RA 2QSIA 3HVVA 5B6MA 2DIZA 2I4AA 1GNDA 2K6VA 2LNSA 4JY2A 4J56A 2BXSA 2TRCP 3FHKA 1PBEA 1ZDLA 4IN0A 5EY6A 4H7UA 1NHPA 4N0VA 3DGZA 1GTHA 3Q9TA 1XOBA 3NG7X 3K7MX 1KNPA 2R45A 3ICRA 4H4SA 5DCGA 2X8CA 2WDVA 4Y4LA 3UOXA 5HFGA 3FMWA 4ZN0A 3TJGA 4IV9A 2JZRA 1IUXA 5AGYA 2OJLA 2C0EA 1UVZA 3UVHA 1X9SB 4KSMA 5KN2A 3AE7A 3H1NA 3WGDA 1A0FA 2H01A 3GIXA 3GSIA 1YQ1A 4Z2RA 3P1WA 3UOZA 4ECJA 3P9UA 4TR0A 3HZ4A 1O81A 4B1BA 1PJ6A 1N1PA 1GTBA 2DKHA 1MO9A 3EC3A 3TKQA 3UTGA 1FL2A 1GSSA 3CTGA 2RUEA 2WFCA 3KIJA 2WRTA 3PGTA 3F8PA 1SL2B 3UKHA 3FYGA 1R5PA 1OC9A 4H50A 2RGOA 4MPGA 5ENUA 2YLSA 1M2BA 5EBKA 1TTZA 2YAUA 4OMVA 2BK3A 4EIQA 5JCNA 2TIRA 1TK8B 2XVHA 4H2NA 2H1GA 1QMVA 3ZTLA 4A65A 1GH2A 3EANA 1MD4A 2GS3A 2C4JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2Z5Y A;  3C4A A;  2CFY A;  4U2T A;  4EKZ A;  2L4Q A;  2NBS A;  4ILF A;  1M9B A;  1U87 A;  3GKX A;  5DQS A;  2VAF A;  4U2L A;  3WT1 A;  2APG A;  3HHV A;  3ZVJ D;  1ZGN A;  1X0R A;  1OJ9 A;  1L9D A;  3RP8 A;  4J36 A;  1KD0 A;  3TWB A;  3TKS A;  2DSA A;  3KD0 A;  3HPF A;  4EIP A;  1MEK A;  3CSJ A;  3GYK A;  4IEL A;  3UIW A;  2MYG A;  1A8L A;  3ERW A;  3DA1 A;  3ENL A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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