2V6OA

Structure of schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase (smtgr)
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glutathione Reductase and Thioredoxin Reductase at the Crossroad: The Structure of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 180
structure length 586
sequence length 586
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2007-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2v6oA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v6oA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA03
4ZBAA 5ELGA 2GF3A 1X0RA 2KLXA 5E59A 4J34A 4OPCA 5F8BA 1GOSA 5A4UA 4NV2A 1FO5A 1N1PA 1GALA 1CHUA 3VWXA 4H4RA 5KOXA 4WX1A 2FCHA 4XS4A 4J57E 2WU5A 2R0GA 4NAXA 3CPIG 5ID2A 2H1GA 4PQIA 3GMCA 3BOAA 3IRAA 3BD2A 3PH9A 4AT2A 1A24A 1PN0A 2FWGA 2L57A 4CNJA 2XPEA 2V61A 4DEJA 2WETA 2NTOA 4KB3A 1GPEA 3IPZA 1T8EB 1X5EA 1P2EA 1VG0A 3AY8A 2O85A 1EL7A 4IBPA 2FLSA 3EYTA 3AE1A 1NHYA 4D03A 2F9SA 1VG9A 3IV4A 12GSA 1U3AA 3BJ5A 5H5QA 4K5RA 3Q9TA 3CYNA 3SWLA 3HCZA 4QL9A 1VRQB 2WOVA 4OPUA 4EE0A 5DALB 3OC4A 4HQSA 2VLUA 3E0UA 4ADWA 1YDKA 4X9NA 4AJ8A 3P1WA 3F8RA 1XZOA 2I81A 3IC4A 4P9SA 3UEMA 2VL2A 1L9DA 2XC2A 3RHAA 1XWBA 2ZBWA 1G7EA 1ZYEA 3GNJA 5JCIA 5IMFA 1GNDA 3DKSA 3US3A 4EF0A 2CVBA 3UMAA 4K2DA 1OVNA 5F05A 1FCDA 2H66A 3ICSA 3NLCA 4J33A 1KNRA 2X8CA 2YCDA 4K5SA 3S5WA 2HRNA 2BS4A 2WDVA 2J9HA 2FNOA 3NK2X 3E1TA 5IIZA 3HKRA 3I6DA 1Z9HA 1LPFA 2XFUA 4WETA 1GT8A 2FA4A 1Q4JA 3A3TA 2C3DA 3GTUA 1XWKA 2L4CA 4IJ3A 1TDOA 3Q19A 4K1FA 3D21A 4HEA2 4U2TA 2M80A 3LEFA 1PMTA 1X5DA 4I59A 3HZ8A 1SL2B 1NW2A 3K7MX 1GLPA 2XVFA 3HJPA 2IIDA 3EWLA 1GSDA 1PJ7A 2OE3A 1EL8A 3V3NA 2GS3A 2BACA 5CP1A 1H7WA 3JSKA 1IUVA 1IYHA 5IO0A 4CY8A 3KKJA 4PGTA 4H4QA 1N8JA 2NPBA 3P2AA 4TR1A 2BCGG 4ECIA 2RM6A 1LQUA 1U87A 5FS9A 2C1YA 1A2MA 1YJ6A 4LL1B 2IMKA 2BK5A 7GSSA 2GMHA 4ZCCA 4IVOB 2YAUA 3M0OA 3FG2P 4DSRA 4PAAA 1SK0A 1Y56B 3EF6A 2XLRA 4K9ZA 3KZQA 2IMIA 3WT2A 1F3PA 2APGA 3APQA 22GSA 1DXLA 2L5LA 1UKVG 2C72A 2BA9A 4HB9A 3MSZA 1SYXA 2ACZA 2IVDA 1DNCA 2K6VA 2DKHA 3C71A 4EKZA 4NTDA 3LSZA 3KXOA 4MLYA 5JCNA 4Y4LA 1KSSA 5L46A 4GUVA 5FS8A 2YP6A 1RSGA 1IUTA 3SGLA 3RAZA 4KH7A 2VM2A 2R4EA 3GA4A 2HZEB 3DEXA 3ADAB 3NKSA 1AAZA 1EEMA 1A0RP 3TKRA 1NPXA 2DJ2A 4ZB8A 3A5WA 2CVJA 3H93A 4ZCDA 2KP2A 3HXSA 2H72A 1X9MB 5ECSA 1A8YA 4LA1A 2YLSA 2Q0KA 1NSWA 4EQWA 1RP0A 2WRTA 4U2LA 5CNWA 2JSZA 2Q6UA 2KUCA 1RYIA 4XCSA 3EU4A 4MK3A 4O5UA 2FD3A 2RM5A 4IELA 1YF1A 4JDRA 4DSGA 1NHSA 1D4EA 2IMEA 1QQ2A 1SKSB 1Z6MA 3UOXA 3RDWA 4I2UA 1KNGA 6GSVA 3CBUA 2JKCA 3HJOA 2CULA 1FEBA 1Q98A 2HSYA 5B6MA 1HD2A 4G19A 1PJ5A 5BRTA 4IVMB 1AOGA 2GQFA 1YKJA 3CSHA 4KSMA 6GSSA 6GSXA 1Z6NA 4FX9A 1B9XC 2XBIA 1GP1A 2WPCA 1R4WA 4K7IA 1COYA 1FECA 2EQ7A 5ER0A 1DOCA 4NMUA 5AISA 1JEHA 3VPTA 1PBBA 1JZDA 1FOVA 2R37A 2A89A 3KH7A 2PYXA 2I4AA 3C73A 1GUHA 4MP4A 1QLBA 3D5JA 2LJKA 2VIMA 4RI7A 4BURA 3TRPA 3P4PA 4C5OA 5TR3A 4K22A 1SKRB 3RP6A 4XRAA 3GKNA 2L5OA 4H4SA 5J41A 2ZZCA 1I9DA 3F8PA 4RI6A 4IVFA 2XVEA 5FS7A 1XIYA 4CBQA 1TI3A 4GTUA 1GSFA 4QQ7A 4GR1A 2RUFA 1V57A 2VRMA 3KVEA 3KLJA 2G2QA 4IJIA 3C1SA 4OPLA 1JNRA 3GMFA 5DAKB 4J56A 2MMOA 4JR4A 1VGLA 5KWFA 2H6YA 4XRDA 3GHAA 3LADA 1KNPA 1XFLA 4RUVA 5GAPD 1I5GA 2B9YA 3VWWA 1BQ7A 5FWGA 4K2XA 2GAHB 4DSSA 2C73A 2NVKX 2LNTA 4YAPA 2DSAA 3FHKA 3VK9A 3ZVJD 1GTBA 3AE5A 2B3SA 2J3NA 5KVHA 2XLUA 5GZZB 3BHFA 3TRXA 4XWRA 5CRWA 1KTEA 3LZXA 2JACA 3SQPA 4GF7A 2AUVA 1O73A 1GRTA 3GL3A 4PUAA 3UTHA 3M13A 2JBVA 5COHA 4JRRA 3ZDNA 4KAEA 1M0UA 1FB0A 2ZNMA 4Z2TA 3D1CA 4H4YA 4B69A 4MH2A 3QJ4A 2FA8A 2HT9A 2PN8A 4ID0A 2V3AA 1KBNA 1ZL9A 3F63A 4H86A 2OBIA 3ABVA 1TYTA 3ME7A 2JK6A 4OCGA 3ZTLA 5C04A 2C3QA 2V5ZA 4PURA 3NTDA 2XFNA 4U8IA 5CKUA 2GSTA 1VF2A 2LJAA 1M2AA 1ML6A 3ZL5A 3TDGA 4ZN0A 2OADA 2LSTA 3M9KA 4BPYA 4YQVA 3CN8A 1TK5B 1TU7A 4GRFA 5A5KA 4H4WA 4L0UA 3QVPA 2PVQA 4ECBA 4HS1A 3Q74A 3TKQA 4X9MA 2Q0LA 5HHFA 1EEJA 4JR6A 3WT1A 2XFQA 3RHCA 4NXIA 2JZTA 3D8XA 5D9VA 9GSSA 4AF2A 5ECRB 3L8KA 5DQSA 4POLA 1BGNA 3KP9A 3WYWA 4NZHA 1WIKA 5KN0A 1OC9B 3BI5A 3DK9A 2RABA 2OE1A 1SD8A 1GXFA 4BJZA 2OACA 3QAVA 3NIXA 1DOEA 3VURA 3LYKA 3ZVJA 3IBHA 2WJUA 1ABAA 1HYUA 19GSA 4KDUA 2HFDA 4IS0A 1W4XA 5U25A 3GSTA 2R45A 5IMVA 2VZ2A 2XCGA 2VQ7A 1L9EA 6GSUA 3TCOA 2H8LA 4CNKA 4HZ4A 3LJPA 4ML6A 3CNDA 3LGCA 1GTAA 2AYTA 4CY6A 3AB1A 2DBCA 4D73B 4OVIA 3FKFA 3QR6A 3R9UA 2VCQA 1GWCA 5KN1A 3TKSA 3CIRA 3AEBA 2CDUA 1QO8A 2HLSA 2I3YA 2BC0A 3UOVA 2BJXA 1K0JA 4U2SA 1XW9A 1ZOVA 4KE3A 1VQWA 3KTLA 1K0CA 4V2MA 4IP1A 3CNJA 3DJEA 2VD1A 3IXRA 2QA2A 3QSMA 2OA7A 2X50A 4EQSA 3NRNA 1OAZA 1Y6EA 2KHPA 4DSHA 4A65A 5D93A 3K8NA 4RQXA 4EMWA 2LNSA 1FVKA 2O89A 3ZMLA 4H4ZA 1ERTA 4A6NB 3J7Yb 1IUWA 2XHFA 2H0HA 2GLRA 4OPIA 1E6BA 1F3BA 3ZZXA 4MJEA 3FZ9A 5GAND 2GRTA 1H84A 2MBTA 4WCTA 4GDEA 3RPPA 3TRQA 2IL3A 2FBWA 5AIVA 3B6DA 3D22A 16GSA 2NBSA 3TB2A 2C0EA 3NHOX 3RP7A 1WMJA 3AEAA 3GDNA 5HFGA 3UJ1A 4JNAA 2EQ8A 4YKGA 1GSNA 5IMCA 3AE8A 2TRXA 3EPTA 4PABA 4DSQA 2JB1A 1QGVA 1GRHA 2YZHA 3DJGX 3IF9A 3ZIVA 1TTZA 2C8UA 3VI7A 1H83A 1ONFA 4UDPA 1PA3A 3BHKA 2OA1A 2R46A 2DLXA 4UDRA 1XDIA 4I6XA 3G7JA 4AOSA 1C72A 3KGKA 3AE9A 1F2EA 4EQRA 5DDLA 2YWLA 2WOWA 4X1UA 3FR3A 4AJ7A 2C3TA 2ZCTA 1A2LA 2BCPA 4I5QA 2BK4A 3CRUA 3L9VA 3GYKA 2HXKA 4GLTA 1DE1A 2C0FA 4QL7A 2TRCP 3FIMB 2QKEA 5LNKe 3B3RA 1O94A 3HY2A 5FHIA 3NYCA 3AE4A 3AE7A 1M2BA 1BF3A 4H4VA 2IMFA 1ST9A 1QMVA 1M99A 1X5CA 2OJLA 4FH8A 5JCLA 1BJXA 1QUWA 1D7LA 5J7XA 5CO3A 1AW9A 2FJAA 3FYGA 2FJBA 5LV9A 3QPMA 4TW5A 1YEXA 2L59A 4IA5A 3ATQA 3I43A 4IKHA 3GL5A 2K18A 4TR3A 1NG4A 3GYIA 5M10A 4Q5FA 2VRLA 1ZMCA 3G5QA 1XPVA 4APNA 4BK1A 3HVSA 4OCEA 3RBTA 2GDRA 3Q18A 4K7NA 1XXUA 1A23A 3GRXA 1BKWA 1URMA 4WBRD 5JCGA 2YN1A 5DCHA 1GNWA 2B7JA 5EVOA 2EIRA 2NDOA 3CGDA 2QSIA 2VOUA 2OBKA 3HVXA 3WGXA 3GYJA 2HZFA 1TRWA 1F6MA 4FK1A 1AUCA 2Z9SA 3NN6X 1H7XA 1J0FA 4J2FA 2BK3A 2DKIA 3LXDA 1LBKA 1BX9A 2F51A 1QFNA 3AD9B 2RUEA 4F9ZA 3SFDA 3V76A 2V6KA 3TJBA 2YANA 3QFAA 1ACVA 3V3OA 1ILOA 3KEBA 5DALA 3PR8A 2H6ZA 4OPGA 3TGZA 3WD6A 1MD3A 1CC4A 8GSSA 1JLWA 5ID2B 5G1KA 18GSA 2YR4A 4MZBA 5H5SA 1L9CA 4KGIA 3ICRA 2CZ3A 3DWVA 3P90A 2GR3A 1GUKA 2AR8A 1FEAA 1LJ1A 4NHWA 5JWQB 3MDKA 2VVLG 2C65A 4M52A 2OLNA 1K0DA 5LD0A 4H4PA 1E2YA 4DVCA 5GSSA 3F8UA 1CJ2A 5GSTA 4OFMA 3N9JA 2H71A 4XWZA 2HYXA 2C0DA 3D4MA 3NNEA 2CX4A 4MA9A 3KD9A 3A2WA 4ZILA 1B9YC 2YV7A 3HA9A 1CQHA 2YLTA 2GQMA 3KMNA 5IOXA 1OJTA 2Y6QA 4EXJA 1Z3EA 4ECCA 4H4XA 1E1LA 3HVVA 1XANA 1JLVA 1S3DA 2WCIA 2DIYA 3BNMA 3FR6A 3A2VA 4L5LA 2VVMA 4D04A 4ACSA 4MDCA 4AGSA 3DA1A 1FVJA 1NENA 4MABA 2RLIA 3P8WA 3M1GA 3NH3X 2WBAA 4MJAA 3PGTA 1FB6A 14GSA 1V98A 1NM3A 4NWYA 2B7RA 1VF3A 3P4RA 4N11A 1MO9A 1PD21 4N0VA 4GCMA 5IPGA 3WGDA 4HJ2A 11GSA 1GSYA 3GX8A 5D73A 1KFYA 3NN0X 1IUXA 4Z25A 4G2EA 2IN3A 1PL2A 3TJGA 1YZXA 3ERWA 3D4TA 4LLRA 2LRTA 3LFLA 4HDEA 5EL8A 3EMXA 4RG3A 1UN2A 3IC9A 4K7ZA 2FWHA 2R0CA 1EGOA 1PGTA 1FG4A 1F9MA 2O87A 4N0ZA 3V1WA 1GNEA 1F8RA 1J08A 4YTPA 1GTIA 5HFKA 1Z7RA 4TM1A 1LTXR 1ZDLA 2XPDA 1SEZA 1Y56A 1XWGA 1ZMAA 4OO4A 1PBDA 4CDOA 2B6MA 2CVKA 3HDCA 1N4VA 1TDIA 2ON7A 4JNQA 3QFBA 3LB8A 3LWAA 3GKMA 1GEUA 4B64A 5HR3A 2VD0A 2YVGA 4MH3A 1CJ4A 3PVCA 2DIZA 2H6XA 1T00A 4H7UA 3ALMA 4YKFA 3EURA 5CRGA 2D2ZA 4KA0A 4MJCA 2WOIA 1NHPA 2IFQA 3FZAA 3AWIA 1XWCA 1JFUA 4RSLA 4TLXA 4LL4B 2C7GA 2WS3A 1DBYA 3G9BA 4EL1A 3QCPA 3DJJA 1TDEA 3HZLA 4FYCA 2LEGA 3FMWA 4PUFC 1G6YA 4TR4A 5M0ZA 3AE6A 5IQ4A 3GRSA 1E7PA 3HYPA 2XLSA 5IOWA 4V1Ag 2K8SA 4BVYA 4UP3A 3LYPA 1BZLA 1M6IA 5CYYA 5DQYA 1K0NA 4ZL8A 1GSEA 2LV3A 4G9HA 5U63A 2EQ9A 3VRBA 1D4DA 2AB6A 2G0FA 3ISOA 3F6DA 3M9JA 1PKWA 4TN8A 2H0IA 1CC6A 3W8SA 2K9FA 5DVBA 4Y4NA 3UVHA 1Y25A 1MOKA 4MF7A 2ES7A 3FK8A 4NEWA 1G7OA 1Z5YE 1SK1A 5C3JA 3UKPA 2P0GA 2TIRA 1JZOA 3QSSA 4EM4A 2E2GA 2C64A 1MXTA 4HZ2A 5EBKA 1EGRA 3P7XA 4P3YB 2TMDA 3APSA 1GTHA 3EINA 3APOA 2GQKA 1EWXA 1V59A 3QOUA 3F4RA 1A0FA 1DSBA 2VCVA 2YG7A 2R4JA 1EL9A 4HA6A 5AIXA 2Y6RA 1AIUA 5ECKB 2AV4A 3CNTA 5BULA 5G31A 3GURA 3FEUA 1MDKA 5IQ1A 2B7KA 3H1NA 1O81A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1TRV A;  2BTO T;  4IQ1 A;  2BS3 A;  1AQX A;  2PBJ A;  1E1K A;  2BYB A;  2H89 A;  3T2K A;  1KCZ A;  3H8L A;  3GN3 A;  3MKC A;  3NO1 A;  4XHM A;  1R26 A;  1F3A A;  5G2Z A;  1F8S A;  5EB4 A;  3RNM A;  1SL0 B;  3F6F A;  3T2Z A;  2H1D A;  3PIN A;  1XBS A;  5J60 A;  1J9B A;  1CBO A;  2OQH A;  5D9W A;  5IPY A;  3TJF A;  5J3R A;  3GRT A;  5KMS A;  2IMD A;  4OPT A;  5CRE A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 4ZBA A;  5ELG A;  3SZC A;  2GF3 A;  4PTS A;  1X0R A;  2KLX A;  5E59 A;  4J34 A;  4OPC A;  5F8B A;  1GOS A;  5A4U A;  4NV2 A;  1FO5 A;  1N1P A;  1GAL A;  1CHU A;  3VWX A;  4H4R A;  5KOX A;  4WX1 A;  2FCH A;  4XS4 A;  4J57 E;  2WU5 A;  2R0G A;  4NAX A;  3CPI G;  5ID2 A;  2H1G A;  3LW9 A;  4PQI A;  3BOA A;  3GMC A;  3IRA A;  3BD2 A;  3SZW A;  3PH9 A;  4AT2 A;  3IC8 A;  1PN0 A;  1A24 A;  2FWG A;  2L57 A;  4CNJ A;  2XPE A;  2V61 A;  4DEJ A;  2WET A;  2NTO A;  4KB3 A;  1GPE A;  3IPZ A;  1T8E B;  1X5E A;  1P2E A;  1VG0 A;  3AY8 A;  2O85 A;  1EL7 A;  4IBP A;  2FLS A;  3EYT A;  3AE1 A;  1NHY A;  4D03 A;  2F9S A;  1VG9 A;  3IV4 A;  12GS A;  1U3A A;  3BJ5 A;  5H5Q A;  4K5R A;  3Q9T A;  3CYN A;  3SWL A;  3HCZ A;  4QL9 A;  1VRQ B;  2WOV A;  4OPU A;  4EE0 A;  5DAL B;  3OC4 A;  4HQS A;  2VLU A;  3E0U A;  4ADW A;  1YDK A;  4X9N A;  4AJ8 A;  4G74 A;  3P1W A;  3F8R A;  1XZO A;  2I81 A;  3IC4 A;  4P9S A;  3UEM A;  2VL2 A;  1L9D A;  2XC2 A;  3RHA A;  1XWB A;  2ZBW A;  1G7E A;  1ZYE A;  3GNJ A;  5JCI A;  5IMF A; 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