2V6OA

Structure of schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase (smtgr)
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glutathione Reductase and Thioredoxin Reductase at the Crossroad: The Structure of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 180
structure length 586
sequence length 586
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2007-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2v6oA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v6oA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA03
5J5NA 1PXAA 4HJ2A 5HR2A 3N5OA 3DD3A 4H4PA 3QJ4A 2FCHA 2VCZA 1WWJA 2YVGA 2VL9A 5G5FA 5IOWA 1EL9A 4TLXA 3US3A 2BYBA 1B4QA 1EV9A 4TR1B 2GDRA 4K5SA 1SD9A 4PQ1A 1CQGA 1AQVA 2BS2A 1XOBA 2PN8A 1B4VA 3IAS2 1FW1A 1QGVA 3AE6A 4ULXA 2BCGG 3SM8A 5IMDA 3UTFA 4F2IA 18GSA 4KDYA 1SL2B 3K7TA 2V2GA 3O0HA 1SJZA 1J0FA 2DKIA 3B3RA 3IAM2 4H4UA 2RGHA 2CFYA 4A7AA 3G5QA 2YG7A 3F3RA 2VQ7A 1ZGNA 2NBSA 3KKJA 3KZQA 2VVLG 1K4QA 3UKHA 1SKWB 5DCGA 3GYIA 3UEMA 4OWYA 1IJHA 1AXDA 3UTGA 3F63A 3ZTLA 1OKTA 2HI7A 3LB8A 1GPEA 4XWRA 4IVMB 1K3YA 1G7EA 4Z44A 4ZB8A 1T00A 4YT0A 2LNTA 5ECKB 4NV5A 4YKFA 1XW5A 1UC7A 3IHGA 5DQYA 3W8SA 1CHUA 3RP7A 3DGHA 3NYCA 1DOBA 1Q1WA 3UKPA 4L0WA 2MBSA 2AB6A 3ZMLA 2R46A 2C76A 2L6CA 4EE0A 2E1MA 1QMVA 3GX0A 4C3XA 2FUG2 1GRTA 1NW2A 3GD4A 4ISDA 1MD3A 4ADWA 5D93A 1DOEA 2R9ZA 2H73A 2YV9A 3H79A 4MF7A 2LUSA 1R5AA 4MPGA 2YN1A 5ECQB 3C73A 3BHKA 1JEHA 3EE2A 3QSSA 3C1SA 5KN2A 4RI6A 2VCVA 5CYYA 4MJAA 3NRNA 1LQTA 5BUKA 3I69A 5J60A 4J56E 1SJIA 3QMXA 3ZLPA 3DA1A 1ZMCA 1D4EA 3SGLA 2P0GA 3TKRA 3TRQA 1M99A 2B3SA 5ECPB 1X9SB 1YY5A 3AE2A 1OKDA 4WR5A 2XC2A 2NVKX 3CSJA 1CJ2A 5KN0A 4A6NA 2YM2A 2I81A 5DJMA 4H7UA 2WEUA 2KP2A 4NHZA 1A24A 1EGRA 4GTUA 2CAIA 5DDLA 1U3AA 1W4XA 2K8VA 1FB6A 2A2SA 2YQUA 3TKSC 1R26A 3CRTA 3RHAA 4EM3A 4GCMA 2VLTA 4WCTA 2IVDA 1ZK7A 3DGZA 5E59A 1DOCA 4H86A 2C75A 1DBYA 3UKAA 4PABA 1V59A 3ATQA 2LJKA 1GNDA 3DK9A 3VPTA 1X9MB 2YNXA 5FWGA 4JY3A 4KW6A 2GQMA 2OE0A 2WQYA 2H0IA 4HA6A 1S3AA 3NTAA 1WJKA 3UOYA 4HJMA 2CT6A 4N30A 3TKSA 1GRFA 3BNUA 3DEXA 2ACZA 2H19A 2GH5A 2VCTA 1ELIA 2OE1A 1DNCA 4ZL9A 4MMMA 4BK1A 3CNTA 1PL2A 2P5RA 1A8YA 2CVDA 2GAGB 1V58A 1GRXA 1JRZA 4U8MA 1NENA 1EOHA 1MO9A 2GRTA 2APGA 4FIWA 4KE3A 1DJNA 1GULA 1VDCA 4KCAA 4EIQA 1BAYA 1UVZA 4PQIA 10GSA 1NG4A 4TR0A 1MEKA 2UZZA 3GL5A 4HQSA 1X31B 4XCSA 2VLUA 2K18A 3K8NA 2A8XA 2IJYA 4WKWA 3LORA 3UTEA 2H74A 1Q98A 2NPXA 2DJ3A 3TGZA 2AAQA 2FWGA 2GB0A 3QAWA 3LOVA 1JZOA 3ERGA 1XPQA 2BACA 3FR9A 1GUHA 1BX9A 1CF3A 1KSUA 1A2LA 4NAXA 3GV1A 1GUMA 3BCIA 3KJYA 2H6YA 3GUSA 1GESA 3GURA 3C4NA 4YQMA 1A0FA 4JQ9A 1CC4A 2PMTA 2XHFA 2EQ6A 2XPDA 4MPFA 2XFPA 2Y6QA 1GWCA 5KEJA 1O8XA 4AJ6A 2FJAA 1B8XA 3I9V2 4RUVA 2GT6A 4CHSA 2GTUA 3ZRDA 3MDKA 2YLTA 2QCUA 1KTEA 4N11A 4OCEA 3DRNA 3NOFA 5KN1A 1XANA 1TRSA 4XS1A 2HRNA 4DNAA 2XCGA 2IWTA 1ACVA 1NHQA 1E6BA 2YZHA 1JFUA 3D8XA 3TKQA 3G7IA 4JE1A 4OMVA 2C67A 4J57A 4KA0A 1NEKA 3M9KA 4Q5RA 2OA7A 4CCQA 2C0FA 4NEVA 4D73A 1C72A 3OR5A 3FR3A 2M46A 1VRQB 1V98A 2JK6A 4LA1A 3CPIG 3APSA 2YV7A 5DAKA 3F6FA 5IIZA 4DVCA 2Z5XA 1F3AA 1ILOA 4XS4A 1TDFA 2V3BA 2PBJA 2HQMA 2BXSA 1UN2A 2BMXA 2YWMA 3URHA 1AQWA 1X5CA 3D4TA 4FX9A 4V1Ag 1N1PA 2YLWA 3T37A 4Z2RA 5AISA 3BBYA 1O8WA 17GSA 1UKVG 3LG6A 1SYRA 1NHSA 5C00A 4F82A 1XBSA 3KA7A 3F8UA 1X5EA 4PURA 1MD4A 3F4SA 1OJCA 4K8MA 1XIYA 2RLIA 4O5RA 5CP1A 1OJTA 4H4TA 2RABA 4WBJA 5JCGA 1DXLA 3WD6A 4UDQA 2X3NA 2LS5A 4U8PA 1URMA 1JRXA 1YKJA 3E3EA 3ZVJD 5H5QA 2H1DA 5EOWA 3U6VA 3WGDA 1XPVA 1J9BA 2CX4A 1ZDLA 1BG5A 2RM5A 3A2VA 2EQ7A 4Z2UA 3APQA 1SKRB 1O85A 1CQHA 2VCQA 3AEFA 4D73B 4TN8A 3QCPA 5GAND 3IHMA 5DBJA 2E7PA 5ENUA 3CNDA 4PUAA 2YG6A 5GRTA 1JNRA 5HFGA 3IC9A 1K0OA 5DAKB 5ECIB 3KH7A 2R0CA 4GRTA 5EVOA 4XS4B 4ML1A 5HFKA 2AQJA 4CCRA 1VRSD 4ID0A 3O76A 3GIXA 3ISHA 1KNPA 2F8FA 2WP5A 3TKSE 1D4CA 1LQUA 2OLOA 2H72A 1V57A 5D73A 4XXGA 4HB9A 4RG3A 1SD8A 1DE1A 2MBTA 3CNPA 1JZDA 4EO3A 5COHA 3P2AA 3TRXA 3VWVA 2PVQA 1MXTA 2Q0LA 4IA5A 2NPBA 1V9WA 2HZFA 2YG5A 1BEDA 2VD0A 4N9XA 2MMOA 4POLA 3LJRA 4CY6A 1G6YA 4QL9A 4WEYA 6GSYA 2A4VA 4OCGA 3KTLA 1XDIA 3OZ2A 4PNFA 1NSWA 2DSAA 5GAPD 2G2QA 5AGYA 4FH8A 2I4AA 4EQRA 1LPFA 2C70A 3J7Yk 1AAZA 1H4OA 4FO5A 1GSYA 5B7CA 2MZCA 5CREA 1LV0A 1O81A 4GDEA 4AF2A 4HU7A 2O8VB 4GCIA 2FNOA 1GRAA 5DBQA 3H93A 3RP8A 2OA1A 3AE4A 2HFDA 1KNRA 3LYPA 1K0LA 3S61A 3LQ7A 1DSBA 3CSIA 4U8KA 19GSA 2LTKA 5CRWA 4X4JA 5AN1A 1QQ2A 4C74A 2IMKA 1K0NA 1KFYA 1RP0A 2GEWA 2BK3A 3ERWA 4FDCB 1YKAA 2TMDA 3IDVA 1H81A 2FHEA 4WBRD 3CPHG 3CYNA 2Q6UA 3CPJG 4WF5A 4EMJA 3HKRA 3E1TA 3V3NA 3DMEA 3L8KA 1ERWA 3ABVA 2WZ9A 3HY2A 1G7OA 3GSSA 4I58A 2KHPA 1D7LA 4ZCCA 2XBIA 4EF0A 1WRYA 3VWXA 4DGKA 5KVIA 2HLSA 3DYRA 4OCFA 5IM9A 1Y56A 2LNSA 2WOIA 3RHCA 5DALA 3TUEA 2FJBA 2H71A 4ML6A 4Z26A 1T7PB 3KGKA 1GRGA 1K3LA 4BWQA 3G9BA 4GDPA 2OLNA 3CNJA 3FHKA 1WPIA 1VGLA 2YLXA 1FL2A 1QFNA 3TJFA 3RAZA 4Q5QA 5IMZA 2VD1A 1GTHA 4DSSB 4I8BA 1IYHA 3R9UA 4J36A 3DWVA 1EP8A 1EEMA 1H83A 3GHAA 2C0GA 2B1LA 1VF3A 1NM3A 4KH7A 2VQBA 4V2MA 2LRNA 2H66A 1EP7A 4H2PA 3GYJA 1F3BA 1G0TA 4EQSA 3PGTA 2GR2A 1H7XA 1AC1A 5H5SA 2CDUA 1Z9HA 1A0RP 5DJLA 2VM2A 2WGRA 1ML6A 4IGJA 4ACSA 5KN3A 4J56A 5GSSA 1FCDA 1H7WA 2ON7A 1PHHA 4Z43A 2GR0A 3GKMA 5CRGA 3KP9A 3QOUA 1KSSA 3LZXA 3I6DA 1SJ6A 3ITJA 1OJ9A 3VFIA 4TW5A 2KLXA 4Q5FA 4LU6A 2G0FA 3CRUA 1TDIA 5CNWA 5A4WA 1Y56B 2XVHA 4A9WA 1GSSA 1Q4JA 4KCEA 2LQOA 1BYEA 4BJZA 1ZOVA 3QD9A 4TKYA 3LFLA 2WOVA 1PKWA 4H2RA 3HJPA 2GSRA 1TJDA 3QDNA 6GSVA 3F8PA 4RQRA 4NV2A 2JSZA 2XDOA 1XHCA 3L0HA 5FS6A 2LSTA 2F9SA 5D96A 1G6WA 4CNJA 2YCDA 1ONFA 5IOXA 3ALJA 2E2MA 4CBQA 3GNJA 1YY7A 2NDOA 3KPFA 4GQFA 2GMJA 2JB2A 5KWFA 3IC4A 2GR1A 3GSIA 4U8JA 2PPTA 3KXOA 1GLPA 1GTEA 2A87A 3RHBA 1E2YA 2DLXA 2J3NA 2XVFA 1FEAA 3OC4A 1ZMAA 4K2DA 2CVBA 4IN0A 3ZIJA 4EXJA 4CY8A 4EUYA 2W0HA 3KH9A 2R4EA 1AIUA 3GMFA 4G9HA 3SWLA 2WDUA 5BVAA 2MMAA 3P4RA 3FYGA 3Q18A 2LJAA 2CA8A 4H4XA 4BV6A 4KUNA 4K8DA 4G19A 1GETA 3JCML 4E8HA 3ME8A 5M10A 4ZL7A 3M12A 3DJDA 2DBCA 2H01A 5CRHA 2BABA 1PKZA 4K1FA 3M8NA 3KMOA 2WDQA 5EPFA 3EMXA 5ELGA 2I9HA 3FZ4A 2CVJA 2V1MA 1TI3A 1U87A 4YH2A 3ME7A 4KX4A 1PA3A 4B66A 5JCWA 1PN9A 4MP4A 2FLSA 4DSHA 4IA6A 3LSZA 2WOWA 4U8IA 4A5LA 2GVPA 3P4PA 1D7YA 1KEBA 2WCIA 5C3JA 3UMAA 4ECJA 2B7KA 2H88A 4POBA 5B6MA 2JSYA 1AOGA 1Q9IA 4EQWA 3I6AA 3M9JA 4ILFA 1DUGA 1PBBA 1ZZYA 3F8RA 2CVKA 1OAZA 2YJHA 2VL2C 3NHOX 5FS7A 4GLTA 3AD7B 1HQOA 1YQ4A 2NVLA 3C8EA 5BULA 1QLBA 1QUWA 3IOSA 1MDKA 1AQXA 5FHIA 2VLVA 2F5ZA 1T4YA 2WFCA 4MF5A 2WPCA 2V5ZA 4N0VA 1GNEA 3KD9A 3D22A 4AP3A 3ZDNA 2IIDA 3ALLA 4X9NA 1CJ3A 2HZEA 2C0EA 3F4TA 5LNKe 1IUWA 1IUUA 4OO4A 2TPRA 2K6VA 1XZOA 4BURA 1XWGA 6GSXA 2VL2A 3AYLA 2E5VA 4F0CA 1ON4A 4IW9A 3FZAA 4OFTA 2AHEA 3EU4A 1O73A 2VM1A 1L0VA 1XWAA 3AEAA 4EMWA 3UKLA 5G30A 3AEGA 1EL5A 3F4RA 4XRAA 3DXBA 3WE0A 5B8BA 1MOKA 1YQZA 4PGTA 4TR3A 3LXDA 2BA9A 2JZSA 3AE8A 1BGNA 3UP4A 4K9ZA 2XLUA 1YJ6A 1S2QA 2B7RA 3L9UA 1EEJA 1F6MC 3UARA 1KF6A 4BWSA 3CGBA 2R5GA 4ZIJA 1OYJA 4BA7A 3LXTA 1QJDA 2ZUPA 2BK5A 5U1OA 5ECRB 4HU9A 1ZP0A 1O95A 2BS3A 1ABAA 1N2AA 3BHFA 3II4A 2EIRA 1EBDA 1ZX9A 4JZQA 2VRLA 4L0UA 1SENA 4YSYA 2K9FA 2WP6A 4Z25A 3KM6A 1O94A 3CIRA 2A89A 3GSTA 3VQRA 5IMFA 3CTYA 2C3QA 3KVEA 4L8EA 4MH2A 4O92A 4KB3A 3Q19A 1Z7RA 3I43A 4ZBAA 2X64A 1F6MA 2HZEB 1U88A 2QA2A 4X0XA 1BGJA 5FS9A 3IF9A 2GZZA 1ZY8A 4KGIA 2E2GA 3DMLA 2R0PA 4JNQA 1Z6LA 4TXOA 3ICSA 2DJ0A 1OJDA 2EIQA 4ECIA 1K0BA 4YQVA 1PJ7A 4MJWA 1P2HA 4PAAA 5J4UA 2B7JA 6GSSA 14GSA 4A6NB 2I3YA 4LMVA 1FECA 2ZZCA 3F0IA 1L9DA 4USRA 3HZ4A 1Z5YE 3IHQA 4CRTA 1B9XC 4JDRA 4H50A 2O85A 4EMIA 2YOIA 1R4WA 4J2FA 2B76A 3AEBA 3FW2A 1LJRA 16GSA 5IQ4A 1TXXA 2REMA 4CW9A 2LRTA 2HSYA 2YWLA 4IV9A 4OPDA 2GSSA 3DVWA 5FS8A 5IPYA 1NHOA 1R7HA 3C96A 4HDEA 1GSEA 1S3BA 3TCOA 2O87A 3H8IA 3NYFA 4TVEA 2WHDA 4DEJA 1BKWA 2V60A 3IR4A 13GSA 1JZWA 2KP1A 4C3YA 1XW6A 2B5XA 4TXOB 1M7TA 2JACA 1FG4A 2QSIA 2BC1A 5DQSA 1E1KA 2L57A 4I2TA 1EWXA 4EDYA 2TRXA 1S3EA 4YSXA 5L71A 2Y6RA 4H4QA 1T3BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1BZL A;  3R2Q A;  4IJI A;  1HNA A;  2A4H A;  4DSG A;  3UKQ A;  3RR1 A;  2F8A A;  3FBS A;  4GXZ A;  3LZW A;  1BWC A;  3MY9 A;  3RPP A;  2IL3 A;  2QA1 A;  3ZIT A;  1BF3 A;  4ZCD A;  5FMH A;  2ONE A;  2PHH A;  3ZFL A;  3NN0 X;  4IVF A;  2YG4 A;  4HNL A;  4ZBB A;  2ES7 A;  1A2J A;  4U2S A;  3O6T A;  3ED3 A;  2RII A;  2GLR A;  3D9X A;  4K5R A;  4YTM A;  2J9H A;  2AJQ B; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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