2V6OA

Structure of schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase (smtgr)
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glutathione Reductase and Thioredoxin Reductase at the Crossroad: The Structure of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 180
structure length 586
sequence length 586
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2007-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2v6oA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v6oA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA03
3M13A 3FZ9A 3IC9A 4CHSA 3I69A 4REKA 2VCTA 2O8VB 4A5LA 1U3AA 1LQTA 3DGHA 1OYJA 1SKSB 1K0LA 2R6KA 2VD1A 1X9WB 2DKHA 4GTUA 2B9WA 1TRWA 2XFUA 1GSNA 1JZDA 1GRFA 3GH9A 3FMWA 5IMAA 3HHVA 2WU5A 3DD3A 3TKSE 2XCGA 4YSHA 5KVIA 1JLWA 4OCGA 4EO3A 3K30A 2GDRA 3AE6A 2C0FA 4RSLA 3KGKA 4IP1A 3QFBA 3FR6A 1EV9A 4CNKA 4CY6A 3LXZA 3L0HA 2OAMA 3VLNA 4XS4A 2B5EA 3P4QA 1THXA 1PHHA 1H7XA 2AYTA 5IIZA 3F4SA 5IOXA 4ZBDA 1SJIA 5J9CA 4Q5QA 5C3JA 5D9TA 1K0OA 1WRYA 4IW9A 2R0GA 3IV4A 2Z9SA 1YEPA 4KA0A 5CRGA 1XPQA 3TDGA 2PN8A 1PD21 1K0JA 3RDWA 4NEWA 1CC2A 1EOHA 4F9ZA 1MXTA 4XIHA 1X5DA 4K2XA 2ARDA 1Z7RA 2Z5YA 2H19A 2VCVA 5KEJA 1TRBA 4YSZA 4J2WA 1H86A 5B6NA 2RIIA 5L46A 4J36A 1Y6EA 4MJCA 3NIVA 2XVEA 1HNBA 1EL9A 4GCMA 5F05A 4U2LA 3GHAA 2V41A 4TXOA 3A2WA 3NK1X 2B7RA 4H4UA 3NHOX 1JZWA 5BULA 1V57A 2X50A 1PBDA 1TDKA 2B5XA 3ADAB 3OZ2A 2X99A 4GUVA 2IN3A 2HZFA 2ON5A 2R5GA 3GKNA 3IRAA 3SFEA 4K8MA 5G31A 4OPGA 1NENA 5ID2B 1WPIA 1TYPA 2L6CA 1X0RA 4CNJA 1GTIA 3ZMKA 2JAEA 1AW9A 5DBQA 2LSTA 2C0EA 1IYHA 4WKWA 5HHFA 2HI7A 2ZBWA 1O94A 3ZRDA 4DSRA 3NTAA 3GTUB 3F0IA 4IP6A 4L5OA 3BD2A 1KBNA 1GOSA 4YKFA 2YR4A 2BABA 3US3A 2JSZA 3RPPA 3EF6A 4XRDA 2XVIA 2YG6A 1X9MB 2DMLA 3ZYXA 4YT0A 2OJLA 2IMEA 2GQKA 3ZVJD 2VM2A 2A2RA 2H0HA 2YCDA 4F2IA 4PNGA 1JOAA 4HQSA 3PVCA 2CVKA 1B4PA 3GRXA 2H70A 4AOSA 3KIJA 4JBBA 4OCEA 4EXJA 2YAUA 5IPHA 4JEDA 4ZL7A 3I43A 2IVEA 3F4TA 5CNWA 3UOYA 1JLVA 3DIEA 2KLXA 3KMOA 1GRBA 4WETA 1BF3A 1O8WA 4U8MA 1SJZA 3IAM2 4IBPA 2Y6RA 2K6VA 1FEBA 2F9SA 1O5WA 4H2RA 5CRDA 1SYXA 4ADWA 2EQ9A 3DK8A 1IUVA 2HQMA 4X43A 3CRUA 3SFDA 3VR8A 3D4MA 5FS6A 2ON7A 3QCPA 1D4CA 1VRSD 3LADA 4DSQA 4FYBA 4H86A 1O81A 2M46A 2WOIA 1CQHA 4BA7A 2GMJA 2GVPA 1PDHA 4DGKA 3H1NA 1SJ6A 2V61A 2JL4A 1GPEA 3P4RA 3UAPA 1RP0A 2C64A 4MF5A 2IL3A 4RI6A 3LEFA 4K2DA 4OPUA 1PL2A 1SU9A 2E5VA 3ZFBA 3FZ5A 1NG3A 1G6WA 3GMFA 3D8XA 3IWAA 2V6KA 3OC4A 3LG6A 1VG9A 3LJRA 2NVLA 4L5LA 4HJMA 1PA3A 5LNKe 2OE0A 2NTOA 4K1FA 3MDKA 3ATQA 3NTDA 4GF7A 4KSMA 4TR0A 1FB6A 2F8FA 2GF3A 1O85A 1VF1A 4RG3A 5EBKA 2BK3A 2WB9A 2V1MA 2C3QA 3UL3A 4MCUA 4ZIJA 4V1Ag 1YKJA 3P4PA 2KHPA 3UKHA 3AE3A 3W8SA 9GSSA 5GZZB 2R4EA 1W89A 3L9VA 1FVKA 5D96A 3AECA 1USBA 4IJIA 2B1LA 1L9CA 5IMFA 4EQWA 5IPGA 4YAVA 1UN2A 4A99A 2H72A 3KVEA 4XWRA 4XRAA 3V76A 3UOXA 3NYEA 4A6NB 1GSQA 3GUSA 2MMAA 2MMOA 3FZ4A 1M6IA 1QJDA 4TRXA 1ZOVA 4JZQA 3NOFA 16GSA 2L4CA 3ZL5A 4B67A 4ZN0A 2C80A 4POKA 4WCTA 4ZB8A 4EDZA 2L5LA 3A3TA 5B7CA 2H76A 3C71A 4POLA 1MDJA 2QA1A 4NV2A 2H75A 2L4QA 3PGTA 4ZL8A 2C0DA 1QUWA 3HVVA 3QAWA 3S5WA 4H4ZA 2XVHA 4BJZA 4LIIA 3BOAA 4RQXA 2YWMA 4KAEA 3GRSA 1XOAA 3HKRA 1J08A 2H74A 3A2VA 4EM3A 3DEXA 1ST9A 3P1WA 4ZCCA 3I3LA 2GQFA 1H81A 3SQPA 4NAXA 2B6MA 1CJ3A 1FW1A 3ICTA 3K8NA 4NHWA 4X1UA 2VCWA 4BJYA 2JZSA 4U8LA 3FR9A 3FEUA 4X0XA 4QL7A 1DE2A 3E3EA 3VI7A 2NBSA 1XDIA 3DRNA 5BRTA 3DK9A 2H1DA 2VRLA 4POMA 2TRXA 4D04A 4EQSA 2PGTA 2PERA 1TDIA 4D73B 5JCUA 2FBWA 13GSA 5JWRB 8GSSA 3AYIA 3NIXA 3TOUA 4U8NA 2WP9A 1PQNA 5KN1A 4MPFA 5C04A 4UDQA 3V1WA 2GGTA 1GLQA 2B5YA 5AIVA 4YQVA 2C67A 3F3QA 2YVGA 1M99A 4JN9A 5ECIB 5G5FA 2YPMA 2TPRA 1ZL9A 2FGXA 2GEWA 3UKKA 5ID2A 3AEFA 1FO5A 3KD9A 3PH9A 5HFGA 2IIYA 1O73A 4Y4NA 2WRTA 5A4VA 3P4SA 2O85A 3FBSA 1YY5A 1HQOA 4FX9A 2H8LA 3AD7B 4TLZA 3GTUA 2GS3A 3F6DA 5J7XA 1XXUA 4Z44A 5AGYA 3QMXA 5LV9A 3VPTA 3D6IA 4C3YA 5TR3A 3KXOA 1KSSA 4ECBA 1NM3A 4RI7A 1WMJA 6GSUA 1GULA 4K7NA 2H01A 4N11A 3ATRA 4MZBA 1X31B 1YQ1A 5ECNB 1KFYA 1TJDA 4ECIA 4C74A 1OJTA 4PXOA 3CMIA 6GSWA 1F6MC 3SWLA 2ZUPA 4AOXA 3AY8A 2FLSA 1F3BA 3TRXA 5HYMA 5EB5A 2BS3A 2OLNA 3DMLA 4GRFA 3O6TA 3GD4A 2YANA 4F03A 1PBFA 1QMVA 4JE1A 1TRUA 3IHQA 3URHA 3CBUA 1HNAA 3LXTA 5IO2A 1FG4A 1IUUA 2DJ3A 5IMDA 1E1KA 1K0NA 4WR5A 4M52A 1PKZA 1Z6MA 2C1YA 2CVBA 1AIUA 1ACVA 3NN0X 1HYUA 1ZOFA 4ZBAA 3KEBA 2PUKC 1GNWA 4Z2UA 1Q9IA 1LQUA 4JNQA 3COXA 3QVRA 1EL7A 4O5UA 4EIQA 2VLVA 3CNPA 4OPIA 3QVPA 5DALB 3TOTA 2E1MA 2E2GA 3KU9A 1C72A 4XXGA 2XLRA 4NTDA 3V3NA 1GETA 1SENA 1AC1A 4V1Ap 4KUNA 4ML6A 5ECLB 3VK9A 7GSSA 1H83A 2GR0A 3IK7A 4K0NA 1QFNA 1DOBA 2MZCA 4USRA 2YN1A 3ZVJA 2E2MA 5HR0A 2IFQB 1QXHA 2LNSA 3KTBA 1EZKA 2CA8A 2FHEA 2I0ZA 1GRTA 3RBTA 3MAKA 4OVIA 1XW6A 1ZMCA 2VVLA 2ES7A 2XPDA 4U8JA 1GUKA 4FK1C 4JY3A 3O3TA 4B63A 2MBTA 3NKSA 3UVHA 2Y6QA 1TXXA 3P7XA 3QOUA 4XCSA 2JADA 5HQPA 5LCZA 4KW6A 4GRTA 1JEHA 3ED3A 1JNZA 3EANA 2B7KA 3TJFA 4WX1A 2V32A 3DVWA 5HR3A 3NLCA 3UMAA 3M0OA 5KWFA 1GSEA 1XVWA 2VVMA 4P3YB 5LD0A 1XCCA 1YQ3A 3F9UA 3QD9A 3UIWA 2YOIA 4MJAA 4A6NA 2C76A 5ECKB 1MDIA 1MO9A 3IAS2 3II4A 3TRPA 3Q9TA 2E7PA 3UBLA 2VOCA 2HT9A 4H2QA 4TLXA 4XHMA 1BGNA 1LJRA 4C77A 3VQRA 2WDUA 1EWXA 3E0UA 2H6YA 2OBKA 2CZ2A 3LORA 4J56A 1F3PA 2PVQA 3B6DA 3QPMA 1Z5YE 3TB2A 1B37A 2O7KA 4CCQA 2WU2A 2BCGG 3ZLPA 3ZIVA 1GTBA 3EVIA 3HA9A 2R45A 1GTEA 2C72A 4H4QA 1SK1A 3VWVA 5CO3A 2XBQA 3HCZA 3GV1A 3LZXA 2A2SA 4GWRA 4EKZA 1A2MA 3DA1A 3G5SA 3RP8A 2C0GA 2I4AA 1PKWA 2OALA 3FRCA 3AXBA 3CTYA 2IWTA 1IUTA 4Q5NA 4N9XA 2WS2A 1XANA 1JZOA 3N5OA 5GAPD 4JDRA 4L0UA 2CVJA 2GR3A 1GTUA 2AAWA 4H4YA 4LMVA 1JHBA 1O95A 4PX1A 2H6XA 1KNGA 3CNJA 4D73A 1DJQA 1YEXA 1K3YA 3KA7A 2YJHA 3Q6JA 2E4GA 1XWAA 1G0TA 2BC0A 4KB3A 2PBJA 2NVKX 3KM6A 2QCUA 2NPXA 5DDLA 1CQGA 3G7IA 2YG4A 3SGLA 3HVXA 1YKCA 1GRHA 6GSTA 3PS9A 4O5QA 3KTLA 3TKSC 1PJ5A 1PSQA 3VURA 3HJOA 4YTPA 2DJ0A 4V2LA 3PINA 5E59A 2LQOA 4DVCA 3Q19A 1T3BA 1GESA 1S3DA 1XBSA 4AP1A 4C3XA 3AEGA 3V3OA 1CF3A 1ZKQA 2XHFA 1Q1RA 3FR3A 4G10A 4WBJA 3HDCA 2RUEA 3EAOA 19GSA 3LJPA 1B9XC 2GH5A 2YVJA 2CFYA 1S2QA 2EIRA 2R4VA 4YKGA 3D22A 2VL2C 4ACSA 2WDQA 2JBVA 4LA1A 2XLTA 3UOZA 5HR1A 2GAGB 5DAKB 4GSNA 3AYJA 1L9DA 3IXRA 3R2QA 3KLJA 2DLXA 2QKEA 5INYA 3CNTA 4B64A 1N4UA 1Q4JA 5IMCA 5L71A 3EURA 1P2HA 1E2YA 4G19A 2WP6A 1UA5A 2CULA 1DSBA 2UZZA 4MLYA 1PGTA 1GV4A 4AT0A 1NHSA 6GSYA 2R0CA 4H4WA 1NHQA 3W8JA 2VLUA 2WEUA 2FWHA 3SBCA 5G1KA 4JQ9A 1NG4A 1KSUA 2C70A 1KNPA 4NTCA 5IOWA 2DJ1A 1JZRA 3ZYWA 4OWYA 1JRZA 3HZLA 1GP1A 4FH8A 2GAHB 2A89A 1EEMA 2G0FA 1MTCA 4Z7XA 1LV0A 1GNDA 1H75A 3APOA 2FJAA 2WETA 2M72A 2RUFA 2JB1A 1AQWA 5F06A 1R4WA 1RYIA 4CRTA 2OADA 2B9YA 1FVJA 1ON4A 1K3LA 1W4VA 4G9HA 6GSXA 4DSSA 4EQXA 5DVBA 2JK6A 1TI3A 4TR1B 5JCWA 1J9BA 4ECHA 1A23A 3LWAA 4ZILA 4J31A 1G7EA 4QL9A 1PXBA 1FOVA 1SD8A 3VWWA 5KN0A 4B69A 3D1CA 5H5SA 4IV9A 3MWHA 1U87A 5DALA 1F6MA 4ILFA 4IKHA 4A65A 1T4YA 3LFLA 2BTOT 4K7OA 5ABRA 3BI4A 3QAVA 1I9DA 3WGEA 4KH7A 3KP9A 1IUSA 1K0MA 4G2EA 5FT3A 1E1NA 2Z5XA 3ICSA 4K9ZA 5EB4A 2O87A 2H66A 2WOWA 3F4RA 4HEA2 4J2FA 2RM6A 3VRDB 5FS9A 2DBCA 1ERTA 1K0AA 3GMCA 4HQZA 2EC4A 3DWVA 4CW9A 3CTGA 2OLOA 2R37A 1Q98A 2RGJA 3G5QA 2QAEA 1R7HA 3FZAA 5ECQB 2VZ2A 3NK0X 2R0PA 3ZREA 1KF6A 4WXTA 3I9V2 1FECA 1BAYA 1XW9A 3CGBA 4RUVA 2C8UA 2CX3A 1MD4A 2AQJA 3T37A 2VD0A 2MMZA 2IVDA 1WP0A 1NHPA 2GSQA 3IC4A 1CBOA 1XZOA 2YLZA 4Z24A 1E1LA 4Z2RA 3DJDA 1ERVA 1OC9B 2FJDA 4LLRA 5G5EA 2YG5A 1MDKA 1BKWA 3UBKA 4J57A 2WESA 4FYUA 5JCIA 1V59A 3QSMA 4MH3A 3ALLA 3IPZA 2HE3A 3AWIA 4ZBBA 4ID0A 3QFAC 4GF0A 4TR4A 2C75A 4Z43A 2VM1A 2WJUA 2C3CA 2FCHA 1LVLA 2OA7A 2LS5A 4O5RA 3O76A 2GTUA 2QGVA 3ERFA 3ZITA 3F8PA 5B8BA 3NGCX 3CRTA 1HD2A 4FK1A 3GFKA 3HD5A 4E8HA 1UVZA 1Y56B 4AGSA 5CYYA 4YTMA 4YQMA 4BV6A 4H4XA 4Y4MA 1Y25A 3DMEA 1KTEA 2H73A 1OJAA 1RSGA 4TM0A 1V9WA 2GQMA 2GT5A 2F5ZA 2BJXA 2OKAA 4IHUA 5EL8A 1FCDA 2R4JA 3LZWA 4P9SA 2KP1A 3RHBA 3H8IA 4Q5RA 1YDKA 2K8SA 5ECPB 3QAGA 5GSSA 2NPBA 4NWYA 3AE4A 2QSIA 3GX8A 2QA2A 5DQSA 3DH9A 1TYTA 1M9AA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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