2X8CA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni with the reduced c-terminal end
Total Genus 173
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
173
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase/flavoprotein
source organism Schistosoma mansoni
total genus 173
structure length 588
sequence length 588
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8cA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8cA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA03
2X64A 1GSNA 3ATRA 1HYUA 1KTEA 1WMJA 3G5RA 2DSAA 3M3MA 4ZB6A 4GTUA 1E1MA 3R2QA 5B8AA 1H86A 3NRNA 3UKHA 2O87A 4EQWA 1TU8A 2V5ZA 4NWYA 1RYIA 1I5GA 1DOBA 4TM1A 3AD7B 1FO5A 3F8RA 1OJDA 1A0FA 4LU6A 3S61A 3D1CA 1ZYEA 4TXVA 4Z2RA 3KH7A 2HFDA 5CNWA 5GSNA 3GMFA 3HVXA 1X31B 4HZ2A 1K4QA 1NHYA 2MBSA 3LXTA 3ADAB 1TDFA 1SJ6A 3DVWA 2CZ3A 1LTXR 3AEAA 3I6DA 2GSSA 3C1SA 3HZ4A 4X1UA 2R5GA 2LRCA 4PXOA 3LEFA 4POBA 3U6VA 4U8IA 4J57A 1CQGA 4TXOA 1O6JA 4TR4A 5FS7A 3M8NA 3DK9A 5BULA 2FBWA 3AEBA 2CX3A 2YNXA 4CHSA 4EDZA 4XS4A 3W8SA 4YTMA 1PX6A 4PUAA 2XBIA 1CJ4A 1CF3A 4EE0A 3CTYA 3LZWA 4ZILA 3HCZA 2LUSA 4EF0A 4XTSA 1IUWA 3FZ4A 3NIXA 2YVGA 2QA2A 2L57A 1E1KA 2E2GA 4PURA 4XRDA 3VWUA 4GLTA 4FK1C 4J2FA 3RHBA 2JACA 3GD3A 1SJIA 3NK1X 1D5TA 3P1WA 3HJOA 2R4EA 3F8PA 1EEMA 3GSTA 1OC3A 3PR8A 1SL1B 3P90A 4F2IA 2OA1A 4UDQA 4GR1A 2YVJA 5F0GA 4CCRA 4GSNA 2CULA 3MAKA 3H79A 1XVWA 4YH2A 1E1LA 5ECHB 1E6EA 5IMCA 1E39A 4B68A 2ES7A 3TJJA 2YG5A 1A8YA 4IP1A 1B9YC 1T4YA 3FR6A 3MSZA 1K0AA 3ICRA 4ML6A 4ML1A 4MF5A 5L46A 3RAZA 4ZL7A 1M99A 2QCUA 1YKCA 2FNOA 1EV4A 1M9BA 3VR9A 3QPMA 2V6OA 2E0QA 2KHPA 3EF6A 5HR3A 3TRXA 4GRFA 5A4UA 3KD9A 5J4UA 5A4VA 1TJDA 5CYYA 5IOXA 3BNMA 4C5OA 4CNKA 1OAZA 4YKGA 4MF6A 4RG3A 2OALA 1Z6NA 4NXIA 2WOIA 2YVFA 4MPGA 4B65A 2RGJA 3CSIA 2K6VA 4MZBA 2CAIA 1ZKQA 4YAVA 4IQAA 4U8PA 2B1LA 4HU7A 1QJDA 2YZHA 4J33A 3RNMA 3NYCA 3QAGA 1WPIA 5A4WA 1THXA 3ZMLA 3VWXA 4E0VA 2I0ZA 5CQFA 1MD3A 4WR5A 4N0ZA 5INYA 1B37A 1F8RA 3REDA 5HFGA 4H2RA 4KUNA 1TXXA 3GKKA 4CDOA 4I8BA 1SL2B 4G9HA 2H19A 2E7PA 2NPXA 4ECBA 3UBLA 3OZ2A 3AXBA 4MP4A 2B7RA 3P8WA 4F82A 4F0BA 4KX6A 4DSSB 4RI7A 1R5PA 4IV9A 4F0CA 1DOCA 2RM5A 2GSRA 3G5QA 1ON4A 4B69A 2EC4A 3GDPA 1O73A 2R0PA 2JB2A 1NG3A 5F8BA 3A5WA 3DWVA 1XHCA 4WX1A 1BX9A 1BF3A 4A7AA 1OVNA 4FO5A 1PMTA 2IMDA 3I69A 4LL1B 4YSZA 2GRTA 4KB3A 3UKKA 1V57A 5IMDA 1VF3A 2XPDA 4N10A 3GN3A 1EGRA 2VQBA 2Q0KA 1Z7PA 3ZLPA 5J7XA 1B4VA 1GPEA 3AE7A 2BMXA 2WS2A 4WBRD 3GL5A 2C3DA 2VO4A 2GGTA 1URMA 3V1WA 1GNWA 4IVFA 3IRAA 3I3LA 4A5LA 3EANA 1V2AA 2B76A 4H2QA 3KEBA 4IKHA 2GH5A 4JRRA 3EU4A 2Q6UA 4TM3A 2OA7A 2PU9C 2BCPA 3GRTA 4PNFA 3GSIA 2GAHB 3O76A 4BK1A 2O7KA 1F8SA 5IQ4A 3IHGA 4BPYA 1X0RA 1Y25A 2ALBA 2VIMA 4POMA 4TW5A 2XHFA 3M13A 3CXGA 1TDOA 4AGSA 1JRZA 3IPZA 2QA1A 1TP9A 2HQMA 2IMIA 3VR8A 3O0HA 3R9UA 1F3PA 2C67A 2HXKA 3FW2A 1PL1A 2AHEA 3SWLA 1TRBA 2BCGG 4JNQA 2JB1A 2C1YA 6GSVA 5FMHA 2HZFA 3AEDA 2C80A 3URHA 5IO2A 1GT8A 4ECIA 1TK0B 3AE5A 4MJWA 2PBJA 4ID0A 2IJYA 1SU9A 2YWOA 3HZ8A 1PBEA 2BK5A 1GXFA 1YQ1A 3CN8A 1H7XA 5LD0A 3F4SA 4NTDA 3TKQA 2XFOA 2YR4A 1Y6EA 4Z2UA 3GH6A 2BABA 4TLXA 5DBJA 4A65A 3CSJA 3CGDA 4OFMA 4BV6A 4MJCA 2YANA 5IIZA 18GSA 3UOVA 2VOCA 1GOSA 3UOYA 4BK3A 5IMAA 5EBKA 4Z26A 2C72A 5COHA 1EL5A 4JU5A 3KTLA 1IUVA 2WZ9A 3HKRA 1LJRA 5CRDA 1AXDA 3HJMA 2LSTA 2L5OA 1NEKA 13GSA 1XBSA 2RUEA 1L9DA 5BRTA 4FYUA 3IOSA 5B6NA 1K0MA 3DA1A 5ELAA 5B8BA 2YP6A 5G31A 1GSYA 3QSSA 3FY7A 3QVPA 1ZDLA 2WPEA 4EC0A 5FS6A 4PABA 2JZRA 4L0WA 1SYXA 1REOA 1X5DA 1BEDA 2IIDA 4TM0A 2ON7A 2W0HA 2QC7A 2WEUA 4K8DA 2C0EA 2LTKA 1B5QA 2OLOA 1TKDB 2YV9A 5FS9A 5HR1A 4ZBAA 4LL4B 1NHRA 4KDUA 2XLRA 3O6TA 1NAAA 3AD8B 3M0FA 3WYWA 2A87A 1F6MA 4D04A 3UVHA 2FJBA 2OACA 2YLZA 2WP6A 4XXGA 4L5OA 1GSFA 3EE2A 3P7XA 5HYMA 4H50A 2VLTA 2WU2A 2H71A 1AC1A 3BI4A 4XWRA 3CNJA 1Z9HA 2GS3A 4N9XA 2B5XA 3F8UA 3GMCA 3UP4A 1YQ4A 1A24A 2Z5XA 2PGTA 5LV9A 3CRTA 1WOUA 4MH2A 2MMOA 3HY2A 2C65A 3TOTA 2IL3A 2OBIA 2XLUA 1CC6A 4NPBA 1ZX9A 3EINA 3GWDA 1E7PA 3DGZA 1PA3A 3NN6X 3A2VA 5D8IA 3NIVA 4OFNA 3Q9TA 2N5BA 4BJYA 2EQ9A 3UTGA 1D4CA 1ZMDA 2FCHA 1Q1RA 4JR4A 4EM3A 1GUMA 1PGTA 5CO3A 2H1AA 4QL7A 1PXAA 2E1MA 1B4QA 3BJ5A 3ZVJD 3BCKA 1NM3A 2H0IA 3OC4A 1JLWA 3ZVJA 1GERA 1G6WA 1RK4A 1S3BA 4HQSA 3GL3A 4LLRA 3D4TA 1UC7A 5D9XA 3IC4A 3FR9A 5KN2A 4HI7A 4LMWA 2QAEA 4M52A 2XVEA 3UKFA 3FZ5A 1MD4A 2F9SA 2C76A 2X99A 3EURA 2ZCTA 2FD3A 4HUAA 4ZXGA 2BXRA 4U2SA 5G5EA 4A6NB 4ZN0A 1TDIA 4RI6A 3NN0X 3P4RA 2MMAA 3JCML 1COYA 1A8LA 1PRXA 4IA6A 4PAAA 3DEXA 3E0UA 1XW6A 1YQZA 2YN1A 1KDGA 1M6IA 4YQMA 4XRAA 1D7YA 1S3DA 4L8EA 5G1KA 5HR2A 3AE8A 2VD0A 3IBHA 1GUHA 4MJAA 2OLNA 4DSGA 3CGBA 2YLSA 1N4WA 5JCGA 5M0ZA 3MNGA 4GF0A 2FHEA 4K9ZA 5CRHA 3KD0A 3DIEA 3B6DA 3AE6A 1F37A 3IV4A 3ZFLA 1N4VA 1H75A 4MF7A 1YZXA 2YJHA 2LJKA 1XW9A 2GMJA 1JEHA 2X8CA 3VFIA 1B9XC 5JCMA 5JWQB 2WGRA 4YTNA 3BHKA 3O3TA 4EO3A 2YR5A 5KRQA 3C8EA 4KW6A 1GTEA 3G5SA 4EUYA 2VL9A 4UP3A 3UOMA 2YZUA 5IPGA 3DJDA 1TDEA 2R3XA 1FAAA 3FYGA 1XIYA 3WT1A 3GD4A 1IUXA 3TUEA 4X43A 2WS3A 1OKDA 2VCVA 3ZMKA 1H82A 1Z5YE 2LJRA 4AJ8A 3K7QX 1M2DA 4H4TA 3KIJA 3KLJA 3TB2A 1K3YA 1S3EA 2R2JA 3GUSA 1WP0A 5ID2B 2E5VA 2YM1A 1CHUA 4WCTA 2GSQA 2B6MA 2BJXA 1BJXA 2Q0LA 2JZSA 3Q6OA 5CAXA 2JADA 2C3NA 3V3OA 2H76A 1DNCA 4RUVA 4MZWA 22GSA 1VQWA 1GRAA 1V98A 4QL9A 3ICSA 5JWOB 3WD6A 1X9MB 3AEFA 5JCNA 4IBPA 4Z7XA 4EXJA 2MYGA 1K0NA 2Q7VA 1JZOA 5HHFA 3II4A 2JKCA 2DJKA 4YAPA 4ZCDA 2JSZA 2H89A 2WRTA 2MZCA 2ZBWA 4H4RA 3AE3A 1EL8A 11GSA 1VG9A 2TRCP 3GYIA 2EIQA 2HSYA 2WESA 4K1FA 2JZTA 3IF9A 4AP3A 1FHEA 5GSSA 1EGOA 4EQXA 1Z6MA 2H1BA 1K0OA 3NK2X 4IP6A 3GTUB 1GESA 3FRCA 3PVCA 4USQA 2GR1A 1AUCA 5DAKB 4K5SA 1V9WA 4K7IA 1IYHA 5LNKe 1J0FA 1FB0A 4B1BA 5D9WA 2GMHA 3RP6A 4I2UA 4GUVA 6GSYA 1GSQA 2BACA 2LQOA 3E9JB 2LKUA 4PUFC 2HZEB 1QK8A 2EQ6A 4KPRA 2OADA 4ZB8A 1O85A 1FOVA 4J34A 2GQFA 2A89A 1GREA 1SKRB 2C7GA 3QAWA 4NAXA 3G7JA 2DIZA 4EM4A 5G1LA 1HNBA 3RHCA 1XPVA 1WRYA 5F06A 3M12A 2H01A 3AYLA 2YG3A 3LGCA 4AOXA 2B9XA 3QD9A 4IS0A 5M10A 1MEKA 2VL2A 3UKAA 5IMVA 4G19A 4MCUA 2VLVA 4REKA 3TKSE 1GH2A 3RP7A 3GIXA 3DMLA 5BUKA 4BJZA 5GZZB 3CNDA 1BQ7A 4K6XA 4FH8A 1IUUA 4BVXA 2YLTA 4O5QA 4DSHA 5AISA 1ERUA 3IC9A 1BZLA 2XVHA 2PYXA 1MXTA 1TDKA 1UVZA 4BVYA 2DKIA 4U2LA 2IPAA 3HYPA 2FA8A 1FVJA 3IHQA 3CNPA 1Q9IA 4H2PA 3BNUA 1DBYA 4KAEA 2WJUA 2C0GA 1MDKA 2H30A 3BOAA 3MDKA 3T37A 2I81A 2HE3A 2AAQA 1CL0A 2BS2A 1A2LA 5DQYA 3HA9A 1KSSA 4OPTA 3M9JA 2YG7A 1GTIA 4MLYA 5AIXA 1TOFA 2FGXA 1CJCA 2YCDA 3VWVA 2XVIA 1YY5A 2YR6A 4KCAA 3QJ4A 2BK4A 3C73A 3L9VA 1FEAA 5DVBA 3VPTA 4D73B 4CRTA 4HEA2 4H4YA 4O5UA 3QSEA 1ZY8A 1NHQA 1PD21 2OE0A 3RHAA 4XHMA 1SYRA 1M64A 1XANA 4E8HA 4U2TA 3IAM2 1U3IA 3NGCX 1PN0A 1NG4A 1ZP0A 5KEJA 1O94A 3F6FA 6GSSA 2I4AA 1XFLA 3AD9B 5KN3A 2R0CA 5KOXA 2GLRA 2GZPA 1K0JA 4JN9A 4KNDA 1E1NA 2XBQA 1Q98A 2M46A 3ME8A 2WB9A 4OPDA 3LJRA 2GQLA 1K0LA 2C73A 1ERVA 2CA8A 3QMXA 5ECKB 5IOWA 3J7Yk 3TJGA 3G7YA 1N1PA 5ECSA 1IYIA 3F3RA 1X9WB 2CX4A 4DEJA 5AN1A 3UL3A 3QDNA 2YLXA 2KOKA 4IA5A 1ILOA 2YOIA 3LXZA 4XS6A 2ZZBA 3M1GA 2APGA 2PPTA 2V6KA 3ERFA 4O92A 4OCFA 2KUCA 5J9BA 4B66A 2WHDA 2H6YA 2B7SA 2L59A 1FB6A 1UN2A 3CNTA 1TW9A 1T00A 1ZMCA 4N0VA 4TN8A 4EMWA 3TCOA 3VRBA 4BA7A 2V41A 4GSTA 1PBCA 1QQ2A 5CRWA 5IM9A 3UAPA 1THOA 1PBFA 3CPIG 4OD7A 5EB4A 1P2EA 4OWYA 3SFDA 4YSXA 2DBCA 2GB0A 3AE1A 5KWFA 2EIRA 2L4QA 3J7Yb 2R0GA 1SKSB 3D8XA 2BK3A 1GL8A 1SENA 3NLCA 4OMVA 4J31A 4Y4NA 1XWKA 3GA4A 7GSSA 2WU5A 1F6MC 2CAQA 3A3TA 1PL2A 3GRXA 4H2NA 1XCCA 1FCDA 3HDCA 1SD9A 2HNLA 2DJ0A 3VI5A 1VF1A 1PJ5A 1ZGNA 3GKMA 1ONFA 2H1DA 3Q18A 1YF0A 3F9UA 3ZIVA 1B4PA 1GETA 3L9SA 3PGTA 4KGIA 3CMIA 2VZ2A 1OJAA 1A2JA 3BI5A 2IMFA 1N4UA 3L4NA 4WEYA 2EIOA 1KNGA 1YJ6A 2AQJA 5A5KA 1GLQA 1OE7A 3UMAA 1BGJA 1Y56B 2O85A 1PDHA 2B9WA 2CT6A 1TYTA 3CTGA 5J3RA 1O8XA 3ICTA 1TI3A 4YQUA 2YWNA 1U87A 1LBKA 4K5RA 4BWQA 5IO0A 3H8LA 1S2QA 5GRTA 2H0GA 3IA1A 1EOGA 1AQWA 3QFBA 1I9DA 1M9AA 2YJ7A 4H4VA 3TRQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2XFU A;  2JSY A;  1T7P B;  1S2Y A;  1K3L A;  5EVO A;  1BGN A;  4AP1 A;  4TR1 A;  5U63 A;  3NYE A;  3GH9 A;  3DXB A;  4Z17 A;  2FA4 A;  4ZB9 A;  1H6V A;  4GDP A;  1GRG A;  1NW2 A;  3P9U A;  1D7L A;  3FCP A;  2LJA A;  5ENU A;  2PGW A;  1OE8 A;  1QUW A;  4H4P A;  2WPC A;  1GTB A;  2VRL A;  4BWS A;  1U3A A;  3ZLF A;  2AL1 A;  2HT9 A;  4H4U A;  2C75 A;  3GSS A;  2RUF A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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