2X8CA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni with the reduced c-terminal end
Total Genus 173
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
173
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase/flavoprotein
source organism Schistosoma mansoni
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 173
structure length 588
sequence length 588
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8cA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8cA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA03
1YQ1A 4FK1A 3SBCA 3DA1A 2GZZA 1K4QA 2TMDA 3D21A 4MLYA 4OVIA 5G30A 4NEWA 1XWGA 2JADA 1GTEA 2H8LA 2LV3A 3H93A 5ECOB 3FZAA 2M72A 2LSTA 1GUMA 3PINA 3HA9A 1IUVA 4OCFA 1SD9A 3PVCA 5ECIB 4YWOA 4TKYA 3AE9A 2JB2A 2F9SA 1PBFA 3UKFA 4CBQA 4HS1A 4MH2A 3V76A 1YEXA 5IO0A 5KXJA 1U3AA 4EC0A 2QA1A 3FZ9A 4G2EA 3KA7A 3FBSA 3AEAA 1MD4A 4TM3A 3F63A 3UARA 3GYIA 4X4JA 1E1LA 3IAS2 1JZWA 3KD0A 2V1MA 5M0ZA 3GL3A 1NM3A 2XC2A 2FA4A 5H5SA 1R5AA 4JZQA 2IIDA 1X0RA 5HFIA 3UOZA 1LPFA 5ECNB 4HZ4A 4L5OA 3KPFA 2H74A 3EU4A 1MO9A 1TDKA 4IKHA 2MMZA 3IV4A 1VF2A 3ISOA 4ZILA 4USRA 1SENA 1WJKA 2K6VA 11GSA 2Q7VA 2PN8A 3ZFLA 2X8CA 2G2QA 3AYLA 2DKIA 1EGRA 4YAVA 4MF5A 4NTDA 5FT3A 1O5WA 1JHBA 4NTEA 4Y4MA 4FX9A 5HR1A 3TJGA 1WP0A 3UTEA 1ERVA 4REKA 1RK4A 1YKCA 4XS4A 2JB3A 3BCIA 4MK3A 3VFIA 2HI7A 3ALMA 3FKFA 2XYOA 2JZTA 2MZCA 2A8XA 5JWRB 3AE8A 1CHUA 2NDOA 3P9UA 2VM2A 3ICSA 1U87A 3M8NA 3FHKA 1GSDA 2P5RA 4EIQA 1A2MA 2PU9C 4C5OA 4ILFA 5DAKB 1USBA 4JN9A 2VL9A 3GWDA 1MXTA 3RPPA 3KH7A 4B69A 1A2JA 3GKMA 3ZRDA 1G7OA 4ZCDA 1PBDA 3EMXA 1V9WA 2A2SA 1NHRA 5KVHA 2N5FA 2XPEA 2E2MA 1MD3A 5FS6A 4GCIA 3ABVA 5KVIA 2H0IA 4FO5A 4X0XA 3QFBC 4JR6A 4NV2A 1GRTA 2L4QA 4B68A 1P2HA 5IMFA 2DMLA 1H6VA 2NBSA 1GP1A 3QVRA 4YTNA 5KOXA 5F8BA 1ZYQB 1MDKA 2FBWA 2R0PA 4B63A 4J31A 4QL9A 2DSAA 2QA2A 3KGKA 14GSA 1EZKA 3FR3A 1ZMCA 1GRXA 1NEKA 2H70A 4H4TA 1QK8A 2YG7A 2Y6RA 2DIYA 4CW9A 1R26A 1QXHA 4PGTA 5ENUA 3G7YA 1TRBA 4G19A 1KEBA 4Z43A 1TDOA 5AGYA 2NVLA 4KDYA 1K3OA 2IMFA 3E1TA 3D22A 4YTMA 4IVFA 4KE3A 3SWLA 4JR4A 3MDKA 1DOBA 3TGZA 2H0GA 2CQ9A 5DCHA 4LA1A 4BV6A 2C64A 2CZ2A 4J2FA 5GAND 5LCZA 5KN2A 1EEJA 3J7Yb 6GSXA 2OJLA 2O7KA 2LEGA 1GALA 2OLOA 1D4EA 4KA0A 1XZOA 4HB9A 5DALA 2VIMA 2CVKA 2VCQA 4GUVA 4NHWA 1ACVA 3IAM2 1Q9IA 1F3BA 3P4PA 4BWQA 4Q5RA 4UDPA 4OPIA 2GV8A 4DSSA 3IK9A 4JRRA 2J23A 4IGJA 3QVPA 1XWAA 5GSSA 4CY6A 1PMTA 1URMA 3PS9A 1H7XA 2CA8A 3P4QA 4Y4LA 5JCWA 2AAWA 1SU9A 4WETA 3HJMA 1GESA 2RLIA 3EC3A 1DJNA 2YQUA 4CHSA 4IV9A 3EWLA 4BWSA 4YQUA 2BS4A 4U8NA 5C2TA 5CRDA 8GSSA 4MPFA 3VWWA 4ZB6A 1FEAA 1U3IA 4C74A 1THXA 4POMA 1JLVA 5J3RA 6GSSA 1Y6EA 5J5NA 1CC2A 1KSSA 5HY5A 2R5GA 5KN1A 4EDZA 2XVIA 2ALBA 3UVHA 4TR0A 4HU9A 4DSRA 4AP3A 1XHCA 1GLPA 3SGLA 2BA9A 5IM9A 5G1LA 3LADA 1RQMA 1XWCA 2XVJA 1H83A 1L9DA 3CSIA 3UTHA 1O73A 4JQ9A 3AEFA 2YR4A 3KIJA 4GSSA 3FR9A 4HU7A 3SFDA 1O8XA 4PUAA 1TJDA 2HYXA 1NDAA 4ECJA 4WR4A 3AE3A 3DXBA 4TR4A 4IVMB 2IMIA 4GTUA 1G7EA 18GSA 3VPQA 5A4VA 3CNTA 3IWAA 2YVFA 4XWRA 3L78A 2HNLA 1OKDA 3KVEA 3NYEA 5FS7A 1K0MA 2YP6A 5IPHA 2YLWA 2JZRA 3LFLA 4O5QA 1XWBA 1K0IA 1EWXA 3KM6A 4AF2A 4JNAA 3UAPA 1H84A 3MSZA 2WPFA 1COYA 4U8IA 5LV9A 4AJ8A 2YG6A 4KAEA 2YG5A 3US3A 2XLUA 2H1DA 4WF4A 4NAXA 2R0CA 1GTBA 1WWJA 3DRNA 2IVDA 1JZRA 2VUPA 1GOSA 2GSQA 2C75A 3AY8A 4IQ1A 1TI1A 4L0WA 1B9YC 3F0IA 1GTUA 3C4AA 2X99A 2F8AA 5BRTA 1FB0A 2GR1A 2DBCA 2EQ7A 3I9V2 1KSUA 2ZBWA 4V1Ag 4BJYA 3I6DA 5EL8A 3CNPA 3K30A 2HZEB 4MABA 2GH5A 2YAUA 2H66A 4P9SA 3G5SA 2FY6A 5J9CA 4EIPA 2CX3A 2GQLA 5EBKA 1TU8A 1TP9A 2YG4A 2RGHA 5B7CA 2REMA 4KW6A 1J0FA 1L9EA 2V3BA 4M52A 3LB8A 1F6MC 1JLWA 2GZYA 3AECA 1N4VA 4GDPA 2C3TA 2LJAA 4U2SA 4APNA 3EMPA 2WJUA 4GQFA 3Q19A 1PL1A 3UBLA 1B48A 5ECMB 2YLRA 4QQ7A 5BVAA 2IMDA 2GTUA 4YSYA 4E0VA 3GTUB 2C67A 3VPTA 5DQSA 4J57E 4U8MA 4Z26A 2PVOC 2H1AA 4Y4NA 1XVWA 3EVIA 3CRUA 4ISDA 1FCDA 3A3TA 3ZTLA 1XW5A 4N11A 4TM1A 4TXVA 4A6NB 4PX1A 1PA3A 3TJKA 1ZL9A 3C8EA 4J33A 3BNUA 3G5QA 2FA8A 4B65A 1FHEA 2XFNA 4A65A 2GF3A 3UOYA 1PJ5A 3DWVA 1XWKA 1MEKA 2APGA 3DK9A 4IW9A 3UP5A 2C7GA 2YPMA 3EPTA 1ZX9A 5ECQB 2V60A 4KDUA 1JRXA 2B6MA 1JNRA 2JAEA 4H4PA 3QJ4A 4IQAA 1NSWA 1GV4A 2B7JA 1X5DA 3BOAA 4E8EA 3NYFA 1SD8A 3C7MA 2YLTA 3PO7A 2IL3A 4XRDA 3EINA 3U5RE 3TOUA 3DJJA 1JEHA 3DMEA 4K2XA 5BUKA 4RI6A 1OC8A 5KN0A 2L4CA 1ZDLA 3KP9A 4ADWA 3ICTA 3TRXA 3CPJG 3TKSE 2XLTA 3LORA 3VRAA 2GDRA 1S3CA 3AE4A 1Q4JA 2H6XA 4F0CA 4D04A 4V2LA 19GSA 2AAQA 4KNDA 1U6TA 2B7RA 2AB6A 4IHUA 2X8GA 2MMOA 4K8DA 1JNZA 1A8YA 4Z2RA 1M9BA 4MF6A 1N1PA 2GQWA 1O95A 3GDNA 4USQA 4EMIA 2XVEA 1CJ2A 4GRFA 2OE1A 4O32A 3QOUA 5E59A 4L8EA 2YJ7A 2GRTA 1F2EA 4KCAA 1CJ4A 3ZIJA 4HJ2A 2ZZCA 1V98A 2N5AA 4J56E 1AOGA 17GSA 22GSA 4ZBBA 2HE3A 3UMAA 3L1RA 2HFDA 3DH9A 3LSZA 4L0UA 3BD2A 5B8AA 4YT0A 1ZCPA 3APSA 2VL2C 5JWQB 4H2RA 4MJCA 5EVOA 4L5LA 1F8SA 4AT0A 4GSNA 1PXCA 2I9HA 3AEDA 1DBYA 3E0UA 4B67A 2XDOA 3CMIA 3ALLA 2YLSA 1TRUA 5BULA 3ME8A 4ZB9A 1P2EA 4WEYA 2BK4A 2OBIA 4N10A 3F8DA 4XCSA 2XFOA 3LGCA 2LRTA 1G6YA 2XFPA 2XVHA 5HR2A 4PQ1A 2B9WA 1ZY8A 4GDEA 2PPTA 4XS4B 1XOBA 1BX9A 2B9YA 5JCKA 1PHHA 1YF0A 4PAAA 1S3DA 3UOVA 1R7HA 4DNAA 1M2DA 1REOA 1CQHA 2YLZA 4XXGA 1K0OA 1YJ6A 4P3YB 1GUHA 1SL2B 3CIRA 5C3JA 1SL0B 3HHVA 3WD6A 3VK9A 4U8LA 4H7UA 4CNJA 3TB2A 1ZMDA 1B9XC 2GQKA 4NXIA 1B4PA 1PN9A 1BYEA 3H1NA 1T1VA 4A9WA 1SJIA 2PERA 1RP0A 4XS6A 1DOCA 3M13A 1X5CA 2E2GA 2C8UA 2WP5A 3I3LA 3UP4A 3EU3A 1CF3A 1BGNA 1UA5A 3GMBA 4BJZA 4K1FA 1M64A 2H1GA 3IE3A 1GSSA 1FOHA 1Z7RA 5HQPA 4TRXA 3UL3A 4Z7XA 1ONFA 2O87A 5E4WA 3BHFA 3UOMA 2IFQA 1FVJA 2B9XA 4UP3A 3GFKA 3FG2P 4IBPA 2E5VA 4BURA 1JRYA 4U8PA 3ALJA 3LJPA 3KH9A 3P8WA 1M6IA 1HYUA 1B37A 2GAHB 2B5XA 4F9ZA 2E1MA 1V40A 1QQ2A 5DCGA 3UCLA 2H72A 1ERWA 5LD0A 2VL3A 3CXGA 4OD7A 1TU7A 3AB1A 3QPMA 3GYJA 3ZREA 1ABAA 3APOA 1E1KA 3Q74A 1JFUA 4MJBA 4IN0A 3KEBA 4TVEA 3F3QA 2E0QA 2YJHA 5EOWA 4PABA 4RSLA 1X5EA 3CRTA 4BK1A 2VLUA 2R2JA 5D9VA 2WB9A 4Z24A 3W8SA 2PHHA 1OJTA 5IOXA 4KUNA 1XPQA 3VLNA 5IPYA 3A2VA 4TR3A 4DEJA 1K0BA 2OE0A 1PBEA 5F06A 2DJJA 5KRQA 2F51A 5L46A 2PBJA 3IDVA 3HZ4A 3FMWA 2BJXA 5J4UA 3L4NA 2YR6A 3GHAA 5DALB 1VDCA 1SYRA 3VRBA 3NOFA 5A4UA 4AT2A 1Q1RA 4TXOA 3H79A 1IUWA 1E6EA 3VWXA 4H4RA 1N4UA 1YKJA 1JU2A 1BWCA 4V1Ap 2DIZA 5ER0A 2TRCP 3QDNA 4DSSB 3NK0X 3GKNA 4LIIA 4MF7A 4KX6A 4MJWA 2Q0KA 1V58A 1CC4A 2HXKA 3CPIG 2AHEA 4U2LA 2LRNA 5KN3A 3BHKA 5JCIA 4OWYA 2V3AA 3PGTA 4EQXA 3A5WA 4XIHA 2JL4A 5HHFA 2IMEA 2HT9A 1DUGA 3QSMA 2BTOT 1EL5A 1GTIA 5DDLA 2BK5A 3UTGA 4HEA2 3ZVJA 4NPBA 1JRZA 3BI4A 4A7AA 2I0ZA 2LKUA 2KP2A 2EIOA 5C04A 4XRAA 3GIXA 1SEZA 2VL2A 2V5ZA 1PXBA 1U88A 4N0VA 2KLXA 3F4TA 5KOWA 2CZ3A 1BJXA 3SFEA 1AAZA 3HDCA 1AUCA 5INYA 2FGXA 4WKWA 2YWLA 3LJRA 3DMLA 2BK3A 3C96A 3NT6A 1HQOA 2OE3A 4F2IA 3NKSA 3UKAA 4ECIA 3CGDA 1J08A 4K0GA 1IYHA 5U63A 4EQSA 2LQOA 5FWGA 1AQWA 3ERGA 4QL7A 3TJJA 3F9UA 2NPXA 1K3LA 2VZ2A 2IJYA 4Q5NA 4HUAA 1VQWA 3AE5A 4LMVA 2JKCA 3C73A 1PJ6A 3HJPA 4ACSA 5J41A 3QFAC 3TKQA 2XVFA 3NIXA 4Q5QA 4ML6A 4WR5A 2YV7A 3R2QA 3IR4A 3CNDA 1M2AA 3VI7A 2YZUA 1M9AA 3W6GA 5JCGA 5FMHA 2OA1A 2PMTA 6GSUA 3AYIA 1UVZA 3L9SA 1TDNA 2PWJA 5D96A 2YANA 1BQ7A 4O92A 5DJMA 4I8BA 2CVJA 3CTYA 3DK8A 5IQ4A 4EVMA 3GH6A 1SKWB 4EQWA 12GSA 4TOPA 1XXUA 1RYIA 4OPLA 4K7NA 2HRNA 3ZLPA 3GL5A 4F82A 3ZL5A 2K8SA 4CNKA 4I2UA 3DJDA 3I6AA 4Z25A 2XPDA 5ECPB 2ZNMA 3M3MA 4H4YA 5IMCA 5JWOB 1AW9A 2VD1A 4ZBDA 1NW2A 2XLRA 2C73A 4RQRA 2YWIA 4CDOA 1NAAA 2DJ1A 3GKKA 2WETA 1M7TA 4WXTA 2WRTA 4GCMA 2GGTA 2Z5XA 3C4NA 1VF3A 2EQ9A 2MYGA 3GRXA 3NRNA 2GT6A 1SKRB 3UOXA 3GD4A 4A99A 3TKSC 4YSXA 1OVNA 1BF3A 2CX4A 2D2ZA 1E2YA 1O6JA 4HDEA 2XBQA 3K7MX 3NN0X 2WOIA 1NENA 2EQ6A 1VRSD 4CCQA 2K8VA 1CQGA 4U2TA 3KTBA 4XTSA 5J60A 1OJ9A 1CJ3A 3RHBA 1BAYA 4YQMA 3B6DA 4IELA 3O76A 2YLXA 3P1WA 1GSQA 4GR1A 1GNEA 4ZIJA 4K5RA 1R5PA 4TM0A 1OE7A 1B4VA 3WYWA 2J3NA 3E3EA 4YH2A 1OYJA 1XDIA 2VCXA 2LQQA 4YKGA 1C72A 2P5QA 4YXDA 1M99A 2VRMA 3F6FA 3URHA 2LNSA 4TR1A 4HQZA 5FS8A 2BCPA 4O5RA 2V61A 2WGRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2ACZ A;  3HVX A;  4LMW A;  1GTH A;  1LJ1 A;  1MDJ A;  1GXF A;  1S7M A;  1GSF A;  4PQI A;  1EBD A;  2W0H A;  1QGV A;  4D73 A;  1WOU A;  4RUV A;  4JED A;  4K22 A;  3IHM A;  2FUG 2;  2HSM A;  1HD2 A;  1EV9 A;  1M2B A;  2W3S A;  1ERU A;  4HYR A;  4G8T A;  3SN1 A;  2C80 A;  5C00 A;  4EDY A;  1K0L A;  3IBH A;  3KMO A;  1KBN A;  2YR5 A;  2RM5 A;  1EL7 A;  2BMX A;  1XCC A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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