2X8GA

Oxidized thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 193
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8gA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8gA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA03
1KNPA 1IUUA 3NIXA 3TJFA 4IS0A 5COHA 5ECNB 1E7PA 3TJGA 2A4VA 2GSTA 1GREA 2R0GA 1YZXA 4BV6A 3EANA 4EMIA 5IIZA 3DA1A 3S5WA 3NOFA 4X9NA 4JR6A 5GSSA 2AAWA 1THOA 3QFAA 3P4PA 1X31B 4N0ZA 3WD6A 1AQVA 1A2MA 1E1MA 1NHRA 2WU2A 2FD3A 4JN9A 3KTLA 4IA6A 5C3JA 3UKAA 3AY8A 4H50A 3D8XA 2H72A 1GWCA 5A4WA 4MF6A 5BUKA 1GULA 1YQ1A 3DJJA 1OE8A 3M0FA 2WOIA 2H71A 5CRDA 1T8EB 1X9WB 3FRCA 3KEBA 4H4VA 2BK5A 1UC7A 1Y25A 4CNJA 1TRBA 1SD9A 2CVDA 1K3OA 2WBAA 2CX3A 4PQ1A 3UEMA 3RBTA 1TKDB 4NV5A 4U8IA 5AN1A 1IJHA 2DJJA 2F5ZA 4D04A 4HJMA 3CSIA 2VVMA 4FIWA 2VOUA 1DUGA 3AXBA 5CREA 4O92A 4XWZA 2VVLG 3HDCA 3ICTA 2ZZBA 4G10A 4HJ2A 5JCUA 3QDNA 4YQUA 4H4RA 3KVEA 2CZ3A 1IYHA 2X64A 1MO9A 1XBSA 2FJAA 2DSAA 2WCIA 3C96A 5M0ZA 2X50A 2ZCTA 4HQZA 4OVIA 2GAGB 3ZREA 1ZKQA 4MJAA 3GUSA 5IMDA 2YR4A 5IMZA 2H70A 1YDKA 2WGRA 2H30A 2PERA 4Q5NA 1TK8B 2BJXA 2BXRA 2OADA 5DQSA 3KP9A 4XS1A 4HB9A 2YWNA 1TRSA 2V5ZA 4Y4MA 2VLVA 4POMA 2GH5A 2C64A 3H8IA 3PO7A 2H1BA 2R2JA 4JR4A 1XOAA 4K7NA 4LU6A 3DK8A 5KWFA 5CP1A 1DOBA 5LNKe 1ZMAA 3M8NA 2XLPA 3COXA 1QFNA 3AEFA 3VI7A 3BI2A 3DK9A 2E1MA 4IQ1A 1Z7RA 2IMEA 4OO5A 3TRQA 1FL2A 3HYPA 3C8EA 3R9UA 3CNJA 2JADA 3QAGA 4PURA 3J7Yk 2RM5A 1PJ6A 1LBKA 2PVQA 4PXOA 1OJTA 1NW2A 5EY6A 2VZ2A 1PBBA 2XVHA 3EF6A 3JCML 2RGHA 3S61A 4D73B 4XCSA 1GPEA 3BHKA 2B1KA 4POBA 4K7OA 1ZYQB 1K0DA 4X43A 5G30A 3GRTA 4EUYA 5ID2B 4KPRA 5CQFA 4AP1A 2O8VB 1PDHA 3AE9A 1U87A 4H2RA 3TCOA 1DSBA 1B9YC 2EQ9A 3QAWA 1EZKA 4FDCB 1WJKA 1NSWA 3D6IA 3TKRA 4U8JA 4OCEA 2ACZA 2BS3A 5GRTA 2ZUPA 3GYIA 4H2PA 2REMA 4RG3A 3ALJA 2EQ7A 1V98A 2X8HA 3IPZA 4WEYA 3AYJA 4MCUA 2GTUA 1H86A 3RNMA 1A23A 2XBIA 3UP4A 4TR1A 1O95A 5CRWA 3C4AA 3P4RA 1X5EA 1GUHA 5DAKA 1SJIA 2XDOA 2IVDA 4POLA 1SK0A 1TW9A 2YAUA 4H4ZA 4GXZA 1ERTA 3F8RA 5JCIA 2YVGA 4TM3A 2EC4A 7GSSA 2WS3A 2X8GA 3F0IA 3PH9A 9GSSA 2D2ZA 3IC4A 4YAPA 3FMWA 2JB2A 3CMIA 4AGSA 3BNMA 3VPQA 4X4JA 3F8UA 2VLUA 4AJ6A 3PS9A 5ELAA 1JNZA 1U6TA 5E59A 1L9DA 3CTGA 4E8EA 1GNDA 2B6MA 3O76A 3O6TA 1BG5A 1OYJA 3AE7A 2GR2A 2H19A 2DBCA 1GOSA 1PMTA 4YSHA 1TDFA 4O5UA 2DJ2A 2R3XA 4NTCA 3CGEA 3KD0A 5FMHA 5IQ4A 3QSMA 3H79A 4MMMA 3LZXA 1LQUA 3UTGA 1IUSA 4BJYA 3K7TA 3QFBC 1JHBA 3SFEA 2DJ1A 3GH6A 2R5GA 3BI4A 3KD9A 3F3RA 3KP8A 5CKUA 4BJZA 1K0CA 3ADAB 2E7PA 2GRTA 2IN3A 2R45A 5KOXA 4EDZA 3DYRA 1SYXA 4ICYA 1GNWA 2C67A 3EWLA 1FEAA 2X8CA 1BEDA 3TDGA 1N1PA 3NK0X 2E2GA 2JZTA 1B48A 2YNXA 4EQRA 5HFKA 2I1UA 1NHOA 5U25A 3U5RE 4AF2A 5FS6A 3DD3A 3EMPA 2H88A 1B5QA 2JK6A 2CA8A 2IMIA 1BGNA 2GT6A 2Z5XA 1AXDA 4K7ZA 1K4QA 1CF3A 3GL3A 5TR3A 2GT5A 3DMEA 2XFUA 3HVXA 4BURA 3HHVA 2XVFA 1ZL9A 1A2LA 2RGOA 4MDCA 3UL3A 2H0HA 4PUFC 2KOKA 2WESA 3KTBA 1B4VA 4D73A 1XW9A 4MJBA 3AEEA 4Z2UA 2E0QA 3K7QX 5HR3A 2GSRA 5ID2A 4DEJA 4I59A 1F3PA 4H2QA 5KN1A 4GWRA 1JZRA 1V2AA 4HU9A 3IHGA 4YXDA 1VQWA 3H1NA 4IVMB 1X5DA 1EBDA 3FW2A 2LNTA 2B5EA 4REKA 1TYPA 4U8NA 3F8PA 4JY2A 3RP8A 2L6DA 2WRTA 1GSNA 2YR6A 2KLXA 3KZQA 3U6VA 1J08A 3M13A 3Q19A 2B5XA 3URHA 3OR5A 5D93A 2C0FA 2YJ7A 1F9MA 3SBCA 1O6JA 1B4PA 2C1YA 5KN3A 3ABVA 1ILOA 5ECOB 3IXRA 4TN8A 14GSA 4B64A 2GEWA 3P9UA 6GSUA 3ATRA 1SYRA 2AR8A 1TK0B 4DSGA 4ZCDA 5F07A 1XWBA 3Q6OA 5J3RA 1GRFA 5IO0A 1SU9A 2VD1A 2C3DA 2VO4A 4HOJA 4OFNA 4WBRD 2BC1A 1G6WA 17GSA 3LOVA 4V1Ap 4N0VA 4YQMA 3M3MA 3TRPA 4A7AA 4DSSA 3TKPA 5B6MA 2V41A 3EU3A 1SEZA 1PA3A 1VG0A 2L4QA 2G2QA 1Z6NA 4Z24A 3VK9A 1XW5A 4GSSA 1KNGA 2I81A 4OPUA 2OJLA 1TDNA 1E1NA 2A2SA 2BXSA 1TDIA 2FWGA 1YQZA 2YG3A 3ZRDA 4EXJA 4AOXA 4J57A 1PHHA 1AUCA 5DALA 5IM9A 3CBUA 3LB8A 4K6XA 4NEVA 4ILFA 4CY8A 4F82A 4KCAA 4ZIJA 1KDGA 4UDRA 4XWRA 3VI5A 4ZL7A 5ECMB 1DE1A 2WULA 3UCLA 1CBOA 3IOSA 3RHAA 4ZB8A 4EDYA 1XOBA 2VIMA 4Z44A 4FYUA 1GETA 2RM6A 1YF0A 3IWAA 3ZVJD 3HVVA 4GSTA 3ZYXA 4P9SA 4MJEA 3P90A 3ERWA 3EYTA 3WGEA 1WRYA 3WGXA 6GSWA 2C3CA 1EP8A 4GDEA 3VRDB 2BK4A 2HQMA 5KN0A 4TKYA 4F2IA 2OBKA 3HKRA 4HZ4A 2H1DA 4EC0A 5KN2A 1MDIA 3CNPA 2PGTA 1E39A 2WPEA 3N9JA 1NHQA 4LIIA 3FG2P 3D21A 3O0HA 4FYBA 4A9WA 1EL8A 3BOAA 5L71A 2VCTA 2YP6A 3H8QA 3DGQA 4X9MA 4U2LA 3B6DA 2MYGA 4U2TA 2C66A 4LMVA 4GTUA 1SD8A 1LPFA 1EV9A 4IVFA 1S3BA 5JWOB 3UMAA 5A4UA 4MK3A 2FNOA 4E0VA 1E6BA 2XHFA 1MXTA 4IGJA 5B8BA 1M9BA 1OJAA 4AOSA 5D8IA 2WPFA 4KDUA 5GSTA 2KUCA 3EE2A 1YKAA 3E3EA 3GHAA 1XWCA 3LYPA 5IQYA 1EWXA 3AEGA 3NZNA 3TKSC 3D22A 4YWOA 3NRNA 1OJ9A 2AQJA 4C74A 4KSMA 1H83A 2MMAA 1PKWA 1I9DA 2K9FA 1DJNA 2V3AA 3GKMA 1QQ2A 2NVLA 5F06A 3MWHA 2AJQB 3W8JA 2IPAA 1M2BA 4YTPA 5DCHA 5JWRB 1O81A 4YQVA 3K7MX 4U8PA 3DVWA 1OC9A 4O5QA 2B3SA 3LYKA 3HJOA 1F8WA 5DVBA 2R4JA 3C4NA 4NXIA 1K0MA 1D4EA 4EVMA 4ZBAA 1F3BA 3QFAC 1S3EA 1M64A 2EQ8A 4RQRA 4L0WA 3EVIA 1IUVA 4I2UA 2PWJA 3LSZA 3KH7A 1XW6A 3AE3A 2ZNMA 2H8LA 2H74A 3P4QA 2OACA 5ECIB 4I58A 1N4WA 1PX6A 5CAXA 4HEA2 3KLJA 3NIVA 1V58A 3V3OA 2N5AA 3FZ4A 4MF7A 3VPTA 2WP6A 2GQWA 5LD0A 1F2EA 3UKLA 1WIKA 2H73A 2XVJA 3GH9A 4Q5FA 4EF0A 4KUNA 2MMZA 1PN0A 2H0GA 2TRXA 3FZAA 4J2FA 3VRAA 3GFKA 3WT1A 5JWQB 1IUTA 2VLTA 2FUG2 4OCFA 4I5QA 3CSJA 3LXZA 3ITJA 5D9TA 1GALA 2HRNA 4OFMA 1F6MA 2XLSA 3VURA 2H1AA 3I6AA 4EKZA 4H4QA 1FW1A 16GSA 3B3RA 3GV1A 1ZMCA 2LNSA 1G7EA 5JCGA 3P7XA 3ZVJA 1JU2A 2GR0A 2C65A 4B65A 2XFPA 1EOGA 3AYIA 4GUVA 4YSXA 5F8BA 5BRTA 2RIIA 3TKSA 2OAMA 4MJCA 1E6EA 2C80A 3ZLPA 1W4VA 5E4WA 5D9XA 5HXIA 4KSOA 5KVIA 5ECQB 3A3TA 3KXOA 4IA5A 5LCZA 1PXBA 1I5GA 3GSTA 4Y4LA 3VRBA 1MD4A 3FZ9A 1JZWA 1FAAA 1IYIA 1CQHA 2R0CA 1ZOFA 1AW9A 2WFCA 1GTBA 4USRA 5B8AA 2RUEA 1OVNA 1VG9A 5IPYA 5GAND 2CV4A 2IL3A 4K7IA 5AISA 1MD3A 2WDQA 1XIYA 3TKQA 3M9KA 1GRBA 3GKXA 4K1FA 3I69A 3CPHG 2YVJA 4ML6A 3KMOA 4KX4A 4WETA 2PMTA 3HXSA 3A2XA 1GLPA 4BK1A 2JU5A 2HI7A 3W8SA 3C7MA 2WB9A 1S3CA 3PR8A 1OC3A 2VL2C 3AE5A 1AAZA 2DIZA 4GR1A 1QJDA 1DXLA 1YJ6A 3GL5A 2CDUA 2ON5A 3TJKA 3CNSA 4K2XA 4TXOB 2VOCA 2HFDA 3NH3X 1ST9A 4Z2RA 5KVHA 2ES7A 1MTCA 4EQWA 2YG6A 1X0RA 2UZZA 3PGTA 3KIJA 1H82A 2QCUA 2HZEB 4F03A 1XZOA 4RG4A 2XFOA 3I3LA 3DIEA 3E9JB 4V2LA 2YQUA 3P8WA 3UTFA 4XIHA 4OPCA 1UN2A 1V40A 3QJ4A 3VQRA 2FJBA 4ML1A 4GQFA 6GSTA 4A5LA 3WGDA 4CW9A 2YG4A 1OKDA 1ON4A 4MLYA 3ZITA 5FHIA 5G31A 2GSQA 3TGZA 4Y4NA 1XPVA 2V60A 1NHSA 3OZ2A 2GS3A 1KSUA 5ELGA 5GSNA 4ZBDA 3FK8A 3QMXA 8GSSA 3ED3A 5JCNA 5HR1A 2JACA 2V2GA 3AEBA 3IHMA 1UVZA 1ABAA 6GSSA 5D96A 4RI6A 2DLXA 2R46A 5JCMA 5F0GA 2QC7A 4BL7A 4G19A 2QGVA 4C5OA 3AB1A 2GMHA 1HD2A 2VCZA 3G5QA 5AIVA 4NTEA 3ISOA 1R4WA 3P4SA 2EIQA 3VFIA 2DJKA 4GRTA 1H84A 3ALLA 2FHEA 4XRAA 3QVPA 5HQPA 2PVOC 1GUMA 1FB6A 2KHPA 2VL2A 2O7KA 2B5YA 3D0ZA 3AE6A 3IV4A 2AHEA 4A79A 3NN0X 1JLVA 4FK1A 3ERFA 4NMUA 2B9YA 2JKCA 3PVCA 2TPRA 2WEUA 3GIXA 5H5QA 4IVOB 1YKCA 3CNTA 4U8MA 3LORA 5CO3A 5JCWA 5U1OA 2R4VA 1ONFA 4H4WA 4TRXA 2O87A 2V6KA 2WJUA 4L8EA 5HFGA 4TW5A 3IC9A 2XFNA 2A8XA 4NTDA 1WMJA 4ZB6A 3ZDNA 2K18A 3RPPA 2C8UA 2WOVA 2WP9A 2GF3A 4O7HA 3H93A 2W0HA 2V6OA 4JQ9A 1GEUA 2LSTA 2F9SA 2HSYA 1KEBA 2GZZA 1W4XA 2WDVA 4FYCA 4KE3A 3QSEA 4M52A 1MEKA 4ZL8A 3LG6A 5FT3A 2R9ZA 2XBQA 2C72A 1F37A 4HUAA 1BWCA 1NPXA 4KB3A 1TDKA 4YSZA 3CPIG 3AEAA 3GD4A 2YLRA 2C3TA 3AE8A 2FA8A 1A0RP 2BTOT 3DRNA 3MAKA 2DIYA 5CRHA 5HY5A 1CL0A 5BULA 3HZ4A 3EMXA 3RHBA 1JRZA 2OE1A 2HZEA 2FA4A 1HNBA 3APSA 2YM2A 4L5LA 2P5RA 1TDOA 4I97A 2C3QA 4BK3A 1GRTA 2CAIA 4FH8A 1PBCA 1GTUA 5D73A 5BVAA 1ZGNA 2EQ6A 4OWYA 1GSDA 3IE3A 1GV4A 3HY2A 1LV0A 3QCPA 3QAVA 3BNUA 2NBSA 5ER0A 4IW9A 18GSA 4K5RA 1A0FA 3UOVA 1RK4A 4HDEA 1B8SA 3D1CA 3CGCA 3H8LA 1D4DA 4X0XA 1T3BA 1DODA 2IVEA 4AJ7A 1GT8A 2HE3A 2WQYA 1YQ3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5ENU A;  1K0L A;  1FEC A;  1CHU A;  4JU5 A;  4TR3 A;  2VRL A;  2VCV A;  5EOW A;  1ELI A;  2CVB A;  3AED A;  5FS7 A;  4WKW A;  3GA4 A;  4HA6 A;  1X2H A;  2YWO A;  3RGT A;  5F05 A;  3BJS A;  1KF6 A;  4MAB A;  1NG4 A;  3KU9 A;  5ECL B;  2GR3 A;  3R0U A;  1HNA A;  4H86 A;  2LQO A;  3MZN A;  3D5J A;  3WE0 A;  1KN0 A;  3ZVH B;  3VLN A;  2BCG G;  3M12 A;  1GTA A;  2A87 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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