2X8GA

Oxidized thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 193
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8gA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8gA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA03
4D73A 1O94A 2HQMA 2FJBA 2YR5A 2CVBA 2Z5YA 2YPMA 3UKFA 3SGLA 1E1NA 1GSUA 1TW9A 4ILFA 3ZFBA 3DK9A 5CRDA 5LV9A 2JBVA 3NN0X 1EWXA 3A2VA 3QFBC 2IWTA 2VZ2A 3EYTA 4QL9A 3K7QX 3AB1A 5G2ZA 4N10A 3VR8A 3Q74A 2OA7A 4IVFA 2GQFA 3CGCA 2WS3A 2GZYA 1NHPA 4NTCA 3RPNA 4AT0A 1E6EA 2IVDA 4FK1A 3MDKA 3M0OA 1XW6A 3AEEA 2HSYA 3F4RA 1PKWA 2WPEA 3KU9A 3NYCA 2JB1A 1A0RP 4U8LA 3HYPA 2WU2A 5IPGA 3I6DA 3Q6OA 3II4A 4FYUA 10GSA 3AEGA 3H8LA 1TDIA 4PURA 3E9JB 4Q5NA 4AGSA 2AR8A 1VG9A 1A8YA 4YQUA 1LVLA 3U5RE 3BI2A 5CO3A 5HFIA 3IWAA 2N5AA 5IQ1A 3TJGA 2C0DA 3LFLA 5ENUA 3DWVA 1F37A 4M52A 2NPXA 2GT6A 5IMCA 4O7HA 2WDUA 1JRXA 1GOSA 2GB0A 5ECHB 2MZCA 2B9YA 2Y6QA 2B1LA 2E2MA 2I3YA 3AE3A 1BG5A 3D8XA 3IBHA 4H4UA 3EC3A 1PBFA 4BK3A 4N0ZA 1J9BA 4KB3A 1KSSA 2MBSA 4GSNA 3Q18A 5D96A 1OC9B 3CSJA 5IIZA 4TW5A 4C5OA 3G5QA 5AIVA 2I81A 2VQBA 4BK2A 3QAGA 3FR6A 3WE0A 5CRHA 1B4VA 1F3PA 1M2BA 1VF4A 3M13A 1SD8A 2CVDA 1A8LA 4HZ4A 2H01A 3UAPA 4J2WA 4YSYA 1IYIA 1ZGNA 3GSSA 2XVIA 3N5OA 2OLNA 3E1TA 1O7UA 2KLXA 2ZUPA 1PBDA 5ECRB 2B7SA 1CQHA 3AE8A 2VOCA 1T4ZA 2GSTA 1BEDA 4YQVA 4A6NA 1XZOA 2B7KA 4FO5A 1OJAA 3C4NA 1V58A 3CPJG 4F2IA 5D93A 1K0MA 3NIVA 4BWSA 2FJEA 2RGHA 2L6CA 2LS5A 2YG4A 6GSWA 2L4CA 2YR4A 4REKA 2GQMA 1NG3A 2GSRA 1K0CA 4IKHA 5AGYA 4AJ6A 4X4JA 2HRFA 4LL1B 1WOUA 2JKCA 2LSTA 3V1WA 2YWOA 2YLSA 2HNLA 1DOEA 1Q4JA 1SKRB 1YF0A 3VQRA 3C8EA 4HB9A 1F3AA 1M7TA 3TUEA 2HRNA 3BBYA 4YAPA 4ZXGA 2DMLA 3FG2P 4D73B 1H4OA 3F4SA 3VI7A 3D1CA 1EOHA 1WJKA 4JNQA 3COXA 1J08A 4NTDA 4PUAA 2I0ZA 3HY2A 5JCWA 2YN1A 4EUYA 11GSA 1FOHA 1DXLA 3LWAA 4MF7A 2BCPA 1N2AA 5ELGA 4HJMA 1WE0A 4X0XA 2DIYA 1QGVA 5G5FA 5C04A 1M6IA 2ZZCA 1B48A 1EL7A 3LG6A 2B7RA 5M10A 2YLTA 3QCPA 3WYWA 2O89A 2YNXA 1H81A 2IPAA 4NTEA 3AD9B 1O8XA 4PABA 1GRHA 3DK8A 2OJLA 4OCEA 3IF9A 2R3XA 1GUHA 2XFNA 3IHQA 2IMKA 3FMWA 4Z43A 1M2AA 3KLJA 1JLVA 1UC7A 3QVPA 3LXTA 7GSSA 3LQ7A 4KA0A 1PN0A 6GSTA 2EIRA 4MF6A 8GSSA 2ZZ0A 2XHFA 4MK3A 2H88A 1IJHA 1AOGA 4EC0A 1KSUA 1K3LA 3A3TA 2NTOA 3BNMA 2H70A 4JR4A 1FEAA 1FVKA 1B8XA 4IGJA 2EIOA 3M9KA 3TGZA 3FBSA 2C65A 4CCRA 4J57A 4F0BA 4A5LA 1U88A 2MMZA 1UA5A 4K0GA 2VQ7A 3T37A 3DJEA 1CF3A 4TLZA 5D9XA 4EF0A 2X8CA 1PXBA 3NK0X 5DJMA 2ZBWA 2GS3A 5J9BA 4GRFA 5COHA 3HVSA 4NHZA 4POBA 1GSNA 2WFCA 5CNWA 2QA1A 3DJGX 2YR6A 2XLTA 3VPTA 4DSQA 2GH5A 4FYBA 2B1KA 4AJ7A 2C3TA 3IC9A 3LYKA 5JCUA 5KVHA 1GSQA 2WOVA 4OPIA 4H4ZA 4I2UA 1AXDA 4EDYA 2I1UA 1MDKA 5B7CA 2AB6A 1JZWA 3LOVA 4RQRA 1Y6EA 3ADAB 2H71A 1V98A 1F3BA 1NHRA 4Z26A 2XFPA 1MDJA 1JZDA 2CX4A 1XBSA 4G2EA 2O87A 3ALJA 2GVCA 4A65A 1Y25A 2WDVA 3ZVJA 2Q7VA 1TK5B 3VPQA 3HCZA 1TDNA 4PXOA 1N4VA 3D5JA 4G9HA 3CTYA 5KN3A 2APGA 3BCKA 1TDKA 1ZZYA 1ZL9A 4K2DA 4TR3A 3Q9TA 1KNPA 1G0TA 4OPTA 2LJRA 4A6NB 3VRBA 3KGKA 2RIIA 4ECJA 4MPFA 4IV9A 4XCSA 1W4XA 2WU5A 2FGXA 3QFAC 3EVIA 2WCIA 3CRTA 1ZKQA 2GDRA 4UP3A 4XWZA 2WDRA 2YV9A 1E6BA 4POKA 2A8XA 2K9FA 2R0GA 2CFYA 3QOUA 3C1SA 1E7PA 3GRSA 2XBIA 4Z2UA 3TKQA 2GMHA 5DBJA 3M12A 4ZCDA 2LRNA 2YV7A 1GALA 4BVYA 5DCGA 1EL5A 2WEUA 3GH9A 3O3TA 2VL2C 1T1VA 1KDGA 5AISA 3J7Yb 3LJRA 1HQOA 3L78A 3AXBA 3EMXA 1BGNA 1NEKA 3QJ4A 4RG4A 2EC4A 2FJDA 3JCML 3TKSA 4OCGA 1SK2A 2L57A 2YLWA 3PGTA 4HS1A 2M46A 1M9BA 2O85A 4KDUA 3GRXA 4WF5A 5D9VA 5DAKB 2H30A 1Z6LA 1TYPA 1SU9A 1OKTA 5JCLA 2VL3A 3K30A 3GMCA 4NHWA 5JCGA 2YLRA 4TRXA 5KXJA 3P4PA 2RABA 3LXZA 3CPHG 3D0ZA 4GF0A 4OPDA 4TVEA 1EL9A 2I4AA 2YANA 3DGQA 2ARDA 4KNDA 2H1GA 2V2GA 3Q19A 3RP7A 1V2AA 1XVWA 4I5QA 5ID2A 3IXRA 3NTDA 1IUSA 1PQNA 3DKSA 4C3XA 2VUPA 1EV9A 4EQSA 3CNTA 1ILOA 3S61A 1GUKA 3SFEA 3AYJA 4DSGA 1NHSA 3C1RA 3I3LA 1T4YA 4DGKA 4V1Ag 4QQ7A 4H4SA 2PN8A 4HI7A 4YH2A 4X9MA 2WBAA 3UEMA 4FYCA 1BGJA 3GDNA 1A24A 1TP9A 1XWAA 3RP6A 3TKPA 1S2QA 5FS7A 1YKAA 3AE4A 5F07A 2B6MA 3EMPA 3GKXA 3C7MA 2CDUA 1GSYA 1JFUA 3VK9A 1OC3A 3GL5A 14GSA 5TR3A 3NOFA 2VVMA 5HFKA 4EQRA 4D03A 2LJKA 4LMWA 1X31B 1YZXA 4BJZA 2YG6A 2J23A 1A23A 4MA9A 4DSSA 2H72A 5GAND 2L5LA 1GL8A 3BI5A 3H4KA 4OPCA 1EP8A 2IJYA 4HEA2 3VRDB 5FS8A 3DD3A 1TRSA 2V41A 1K0BA 2CA8A 5IMFA 1OJCA 2YP6A 3KMOA 2K8SA 1Q1RA 4GTUA 4HZ2A 4OO4A 1PXCA 1JOAA 1NHQA 1PRXA 4H2PA 1L9EA 2M80A 2VCZA 1AQWA 2VLVA 3K7TA 1MXTA 3CIRA 4Y4NA 4BJYA 2D2ZA 3AEDA 4K5RA 1FW1A 4WKWA 2YWMA 5E59A 4YTNA 5B8BA 4H4TA 2JADA 3IA1A 5DQSA 4EM4A 2V3AA 1GULA 3IR4A 4EXJA 1H84A 2H75A 3AE2A 2KUCA 2FJAA 1CJ4A 2PHHA 2WPFA 3F8UA 1FO5A 1GEUA 2LRCA 3GD3A 2FA4A 3BHKA 2XLSA 1W89A 4H2RA 1ONFA 3NIXA 2MMNA 1SL1B 2BJXA 2H66A 4YKFA 2LJAA 4UDRA 1H86A 1GRGA 3UARA 2BK4A 2C3NA 1ZX9A 5GSSA 3UIWA 4U2LA 3NYFA 4Y4MA 3UCLA 4TR0A 4TM3A 3ZZXA 1Z6MA 1EZKA 1ZYEA 5J41A 1K0OA 4POMA 1F6MA 3ZRDA 1BWCA 1TU7A 1PA3A 1DNCA 2WPCA 1EEJA 1KF6A 5HY5A 3I43A 1G7OA 4K7IA 3DVWA 4WBJA 1PBBA 3AE5A 4CW9A 2GV8A 1JRYA 2H6ZA 4JQ9A 1JEHA 4C3YA 2WETA 2EQ6A 3CNJA 1TTZA 4B63A 1XWGA 1LV0A 4DNAA 4A99A 1OJ9A 3M1GA 4ULXA 2Q0KA 1P2EA 5ID2B 3L9VA 4JEDA 5HQPA 4IVMB 3AEAA 5IOWA 2H0IA 3ALMA 4APNA 4YTPA 1V9WA 3FRCA 3ZFLA 2ZZBA 1CC4A 2R4VA 3GKKA 4CRTA 4YQMA 3ITJA 3E3EA 2DJ2A 3REDA 2CULA 1S3AA 3AEBA 3ICTA 4H7UA 3GYIA 2E0QA 3BHFA 3CN8A 4J56E 1YEPA 2K8VA 3GNJA 3GKMA 3GURA 2EQ7A 1JZRA 4ZL9A 3A5WA 2H6XA 3UOZA 5D8IA 1YQ4A 4TM1A 1SL0B 5HFGA 2V60A 2XPEA 4V2LA 1PHHA 4AP3A 2BABA 1YY7A 2DBCA 3PH9A 4KH7A 2GR1A 2BMXA 3GX0A 4K9ZA 3BI4A 3KVEA 3P4RA 1GERA 3GIXA 1CJ3A 2YM1A 3FZAA 2AUVA 4WXTA 1ZOVA 2F8FA 1PN9A 1THOA 2IFQB 3G7YA 3ME7A 4EMIA 4CBQA 5GRTA 4FK1C 3KXOA 3P7XA 4KSOA 2E4GA 4DSSB 3EF6A 4H4YA 4HU9A 1L9DA 2FHEA 4ML1A 3NK2X 4PAAA 1FOVA 3HKRA 2C1YA 4J34A 1DE2A 1UN2A 3L4NA 4ECCA 2VRLA 3HDCA 2AJQB 2BTOT 2JSZA 4EE0A 2JL4A 1XOBA 2YJHA 4ZBAA 1MOKA 2DJ3A 3ERGA 1JNRA 1PXAA 2CX3A 2C72A 3CRUA 3GHAA 4TKYA 3FK8A 1V40A 5GZZB 1UKVG 3HZ8A 3AD8B 1O73A 3UBLA 4O5QA 4O32A 4MPGA 2OLOA 3WGDA 2YG3A 2C80A 3BOAA 3HZ4A 4J36A 2C3CA 1EP7A 1T7PB 4KE3A 3TOUA 4N11A 1X9MB 2C66A 3TB2A 3F6DA 2GZZA 2XDOA 3AYLA 2BS3A 4EM3A 1CC6A 2V32A 3GSTA 1H7WA 1MO9A 1LTXR 1CC2A 3IRAA 4HOJA 1ERVA 1O6JA 4TXVA 3RHCA 1P2HA 4Z25A 4K7NA 3LYPA 3SWLA 1M0UA 2GEWA 2KOKA 2O7KA 2PVQA 1PDHA 2FUG2 1H83A 3BCIA 2B76A 3GRTA 4ZBBA 4LA1A 3M0FA 1LQUA 1AQVA 2FY6A 4GDPA 1PX7A 1B9YC 4GQFA 1DE1A 3AY8A 2IMDA 3FZ5A 4FH8A 4KW6A 2A2RA 5A4WA 3KPFA 2XFUA 2ACZA 1Q9IA 3O0HA 2WQYA 1OJDA 3V3NA 5GSTA 3L9SA 1PL1A 2XFQA 4LU6A 2W0HA 2FCHA 4MZBA 1YKCA 1Y56A 3CTFA 4IHUA 4Z7XA 1GRXA 1Q98A 1R5AA 3UOMA 1B37A 1Z3EA 2MMOA 2F3MA 4X43A 3ZYXA 3I69A 3GUSA 4QL7A 2C0EA 2WESA 5U63A 2GGTA 3TRPA 3KJYA 3ALLA 2WULA 4IQAA 4GWRA 3DRNA 17GSA 4BPYA 1AC1A 4KAEA 5HYMA 4AP1A 1MEKA 1RYIA 3ATRA 2DJKA 2B9XA 3EANA 4GSTA 4MJBA 2LV3A 3RAZA 1DJNA 1O85A 1SKSB 3P2AA 2Z9SA 5B6MA 5ECKB 5GAPD 3C4AA 4IA6A 4I2TA 2CZ2A 4EO3A 4IVOB 2K18A 2P0GA 5AIXA 1VF2A 5JWQB 3FYGA 6GSVA 3KZQA 1TKDB 4O92A 4ZILA 3DXBA 3MNGA 4Z24A 3DA1A 4I59A 3TJBA 2L5OA 1VRSD 3QMXA 1QO8A 4PQ1A 3P4QA 2LTKA 3H8QA 5ABRA 4B67A 2PVOC 1YJ6A 5EB5A 3A2WA 2R4JA 2JZRA 4H4WA 1QMVA 3ED3A 2BXSA 3P4SA 4L0UA 1TDFA 4PQHA 2FNOA 3GL3A 3L0HA 4IBPA 5CYYA 1B4PA 2H0GA 4WEYA 5A5KA 1TXXA 2DSAA 5DAKA 1F8SA 5KVIA 4JBBA 3W6GA 5IMDA 3DMLA 4BA7A 5FS9A 1E1KA 2CT6A 2WOIA 2LKUA 1GTUA 3APSA 2OBIA 2OE0A 2DJ1A 4H4PA 2AAWA 2VLTA 5B8AA 2HFDA 1ZY8A 3WD6A 4J33A 5IMAA 4JRRA 5HHFA 1GWCA 1K0AA 1K0JA 1YKJA 4WR4A 4OPUA 2VCQA 2DKHA 5B6NA 1O8WA 4OVIA 1W4VA 2R46A 2LUSA 3UTGA 4KDXA 4IW9A 3CTGA 1GP1A 3ZYWA 3TKRA 2WGRA 1F8RA 2V61A 4L0WA 3DGZA 4U2SA 4EL1A 3TRXA 3QR6A 2CZ3A 1RW1A 1XW5A 3ZLPA 5H5QA 1PJ6A 4ID0A 4XWRA 3KP9A 4D04A 1X5CA 4MJAA 1S3EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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