2X8HA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni in complex with gsh
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 192
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8hA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8hA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA03
2YNXA 4HQZA 4G19A 2O8VB 2FNOA 1PA3A 1TKDB 3GHAA 3BI5A 3TRXA 3SFDA 1D4EA 1TRSA 3F6FA 5B6NA 1ZX9A 4H4YA 4GCIA 3EU4A 3CTFA 3DVWA 3GX0A 2Q7VA 1GRBA 1ERVA 6GSUA 5KOXA 5EL8A 3APSA 1SK2A 3GTUB 3KGKA 2C3QA 1TI3A 2FWHA 3HYPA 2DIZA 4X4JA 3D1CA 2AR8A 1BZLA 4YSYA 5ID2B 5B8BA 1A23A 1NPXA 3GA4A 5ECIB 1EL9A 2AJQB 3G5QA 4UDRA 4GDPA 1FL2A 1ZZYA 3CNSA 3EYTA 3F8DA 4AP3A 3DXBA 3VURA 1NM3A 2DJJA 1B8XA 9GSSA 4BK2A 4L0WA 3VWUA 2H0IA 2YAUA 1GRGA 2LS5A 5DAKA 3ZFBA 3VI7A 4H4QA 4YTMA 2WFCA 2ZNMA 4BL7A 2RGOA 2V60A 2EC4A 4MJBA 2Y6QA 2IPAA 4LIIA 1G6YA 19GSA 1R5AA 1OC9B 4EQXA 2H1BA 5H5RA 1NHSA 1TDEA 2WPCA 1EZKA 2XDOA 1PHHA 2R45A 4J2WA 1PJ5A 1AAZA 1PQNA 4ECIA 1N4WA 4KCEA 4JY2A 1WRYA 2YWIA 5AIXA 5HR0A 4H50A 2G2QA 1KNGA 4POMA 1DE1A 5D96A 3HKRA 3AE8A 3KJYA 4YTPA 5J5NA 4JR6A 2C67A 2XFUA 1BQ7A 3ICSA 4DSSA 2WEUA 3GFKA 3CNPA 4ZN0A 3KVEA 3GDPA 2GGTA 4XCSA 3K7QX 1DJQA 4POBA 1HNBA 3BI4A 1F8WA 3AE7A 3KMNA 1NG4A 2A2SA 5JCGA 22GSA 4DVCA 3RHCA 3TJKA 4OPUA 4BK3A 5JCKA 2R0GA 1ON4A 4NWYA 3QFBA 3ALLA 3HVVA 2H73A 1Y56B 2REMA 3AYIA 2QA1A 3ZVJD 3KPFA 4HOJA 1IUXA 2FJBA 5JCUA 1ELIA 3VWVA 4Z44A 1Y6EA 1D4CA 4OPLA 2GS3A 1M9BA 3P2AA 1QJDA 4QQ7A 2AV4A 2LTKA 3ME7A 3IC4A 1YY5A 1LPFA 3EAOA 4K8DA 2GT6A 3EVIA 1EGRA 2B5YA 4EDZA 3HVSA 4KPRA 1VGLA 3AEDA 1ILOA 1VF1A 4XS4B 4GR1A 1FAAA 4K9ZA 1FG4A 4IVMB 1SYXA 3G5RA 1RQMA 2ON5A 1W89A 2KP2A 4HZ2A 2FJAA 2QSIA 5ENUA 4NMUA 2YLXA 1V58A 3AWIA 2IMKA 1I5GA 1JHBA 4Z2RA 2YVGA 1YY7A 2GH5A 2CDUA 1PL2A 4BA7A 2WBAA 3LADA 4KA0A 1COYA 1CL0A 3W8SA 3A2XA 3V76A 4B64A 4V1Ap 3HCZA 1TDIA 5A5KA 3K30A 5JWRB 6GSWA 1S3BA 3M8NA 1JLWA 4IN0A 1M2DA 3BOAA 1NDAA 1T00A 1WWJA 3HVXA 3VWWA 4OD7A 1S2YA 1PBEA 3H8LA 2DSAA 3GKMA 1PBCA 4I2TA 1GSEA 4C74A 2GAHB 2IN3A 2XPDA 4TM0A 3FR9A 1ZYEA 3UOVA 2A4VA 1S3AA 3SQPA 3NYCA 2M72A 2GTUA 1ZMAA 1XWKA 4Q5QA 2BABA 1GSFA 4LLRA 4J33A 3FY7A 5J3RA 3M3MA 4YQUA 3DRNA 4QL7A 4GWRA 4TRXA 2V61A 3NIVA 3EINA 4Z43A 4RSLA 2TRCP 1CC6A 4PABA 3CNJA 2IIDA 5D9VA 3ZL5A 4ZBAA 3JCML 5A4VA 3LYPA 4DSHA 5GSSA 1BGJA 3WD6A 4L5LA 2JB3A 1BX9A 2YWLA 1D7YA 1YZXA 3LXTA 3KLJA 3CGEA 5DQSA 3G7JA 4A79A 13GSA 2H30A 2DC5A 3US3A 3L9UA 3UKPA 1USBA 1SK1A 2AAQA 5DQYA 4IA6A 4ECJA 3LOVA 2QA2A 4EM4A 1O6JA 2JADA 3H8QA 3PS9A 4H2QA 1U3IA 3V1WA 1GTBA 2L6CA 4CRTA 1Q4JA 2FGXA 1AQWA 3Q9TA 3TGZA 3QAVA 3GD3A 1EEMA 3D0ZA 4I6XA 3DGZA 2EQ9A 1QQ2A 1AIUA 2JK6A 1V98A 3A3TA 1M9AA 1GNDA 3M12A 2C65A 4MCUA 4DSSB 3OR5A 4U8IA 2YM1A 3DJDA 1TK5B 3ERGA 3BCIA 1SL2B 2N5BA 3TJGA 2MYGA 1Z9HA 1Z7PA 3TOUA 3UOYA 2XPEA 3FEUA 3DGHA 4H4RA 1TDNA 2C4JA 1JNZA 2C64A 3GWFA 3PGTA 4H4UA 3UOMA 4AOXA 5J60A 3TDGA 1TDOA 2K6VA 1JFUA 1PN0A 4NTCA 2VD0A 2TPRA 4K7NA 5EY6A 2HYXA 1FECA 3CMIA 1ABAA 4EQSA 4GDEA 5CQFA 3QR6A 1EV9A 2HZEA 2DKHA 4GLTA 1SEZA 1G6WA 1OC3A 5ECMB 4ZBDA 4MZWA 2HSYA 1ERWA 3DIEA 1NHOA 1A0RP 3C4AA 2E2GA 4F03A 2X3NA 1PKZA 2YR5A 4H4TA 2JZSA 3DJGX 2WJUA 4Q5FA 3MWHA 4RG3A 3FZAA 1ZL9A 2HRNA 4ZIJA 2X8CA 1FOHA 1LQTA 4G2EA 3VR8A 1NAAA 5KN2A 2B1LA 2WESA 3D4MA 3GH6A 4IHUA 1E1LA 2P5QA 3GKXA 3B3RA 3CIRA 2HE3A 3UMAA 3ZTLA 3QFBC 1BEDA 3LORA 4ECHA 3QDNA 1YQ4A 4H4WA 4IQ1A 4Y4NA 3TB2A 2WP6A 2YJHA 1WIKA 2OBKA 1X5DA 1LTXR 1H7WA 4H4ZA 4K7OA 4GCMA 5GAPD 3E1TA 4C77A 5JWOB 2A87A 1NEKA 4NHWA 3AE6A 3EPTA 5LV9A 2FBWA 2WDQA 4YQMA 3LJRA 4IP6A 3FG2P 2KUCA 4H4SA 3ZITA 2IMDA 5J4UA 1PD21 5DBJA 3WT2A 5DBQA 2GQKA 1O73A 4FX9A 2L5LA 4YTNA 4Q5NA 1PXAA 5IMZA 2VZ2A 4PUFC 1XPQA 4RG4A 5IO0A 3F0IA 2ZZ0A 1E7PA 1PBBA 2O9ZA 5M0ZA 3ZMKA 2YP6A 3E0UA 1VDCA 5LCZA 3K7MX 4GQCA 4K6XA 1S2QA 2F3MA 1SYRA 4TXOA 1VG9A 2B7KA 3VRDB 1T7PB 1EGOA 2H1AA 2H66A 3A2VA 2LSTA 2TMDA 3TUEA 3KH9A 4MLYA 4F82A 3P8WA 4XRDA 1M7TA 4EXJA 1A2LA 3GV1A 1V57A 4APNA 3CRTA 3VPTA 3ITJA 1CF3A 3AYLA 3KP9A 1CJ2A 3VLNA 1K0NA 4K1FA 3RP7A 2CVDA 4KX6A 1LJRA 4EMWA 2CULA 1K0DA 3UOXA 2HT9A 2PVOC 5IIZA 2FJDA 2YLSA 5KRQA 1KBNA 4FIWA 3QCPA 2F9SA 4B65A 1YQ1A 1D7LA 3L9SA 3E3EA 4EKZA 2C80A 3GYKA 2CZ2A 1TU7A 1B4VA 2NBSA 1ZK7A 3UVHA 4YAVA 3U6VA 5U63A 4JE1A 1MEKA 2J23A 2PU9C 5FS9A 4HDEA 4EIPA 2L57A 3DK9A 2VVMA 4PX1A 2WRTA 2BXSA 2BK3A 2RGHA 3ISHA 4FYBA 3ATRA 3QAGA 4UDQA 2C75A 2CAIA 2VVLA 2F8AA 1CQHA 1GRFA 2H8LA 2L4QA 3F6DA 3KCMA 3LFLA 1E2YA 4K0NA 2C70A 4XS1A 1VF3A 1GREA 2E7PA 4NZHA 4NTEA 1E1NA 5FT3A 3P4SA 2XVEA 1NW2A 4EVMA 5GSNA 2H01A 2VLVA 2OE3A 4N0ZA 2PN8A 1PX6A 2GRTA 2KLXA 5DJLA 2LRNA 3AY8A 4O5RA 1M6IA 1MOKA 4PAAA 2AUVA 4OPTA 2XLPA 1AXDA 1NHQA 4WXTA 2K8SA 3QOUA 4JNQA 4K7ZA 4JDRA 1P2HA 2HZEB 3TKRA 2B6MA 4GQFA 2V5ZA 2HXKA 3UTFA 4MMMA 4C3YA 1UN2A 4HEA2 3WGXA 2OE0A 1AQVA 5E59A 4BWSA 3I3LA 1T3BA 1V59A 1A8LA 2FA4A 2DJ3A 1HQOA 3JSKA 4N9XA 2NTOA 3GMBA 1GLPA 3AE5A 4POKA 4V2LA 5B7CA 2DMMA 2DJ2A 1H7XA 2VLUA 4N11A 3TJFA 4UP3A 2C7GA 2DJ0A 3CSJA 4P9SA 3HJPA 3COXA 5IQ4A 3VWXA 2P0GA 2LQOA 3GSSA 4EM3A 3H79A 1XWBA 1J0FA 2UZZA 3CN8A 1HD2A 4MJAA 3GRTA 5HR1A 3AE9A 1A2JA 3BI2A 1EBDA 3FR3A 3VK9A 2XFNA 3HXSA 4CDOA 5L46A 1U87A 3F4TA 2OLNA 3QSMA 4WETA 2PERA 1YEXA 2XFPA 4H4XA 2JKCA 2O89A 1YF0A 2XVIA 1XPVA 1RP0A 3M9JA 5ER0A 3C7MA 2CZ3A 3NKSA 1EWXA 1X5CA 2IJYA 5IQYA 3M0OA 3QSEA 3H1NA 5ECLB 3NIXA 4KE3A 5AIVA 4H4VA 4Z7XA 1JRYA 5EOWA 1P2EA 3RHBA 4MJWA 2M46A 1QMVA 3IK7A 1PL1A 1OKTA 1BGNA 3Q74A 2A8XA 1ML6A 2RABA 3URHA 5DALA 2E5VA 1KDGA 5F06A 4MF5A 3RAZA 5KN0A 2VCTA 4K2DA 1C72A 2WZ9A 4PQIA 2R4EA 2VQBA 3BBYA 3AE3A 5KN3A 1K0JA 1XW9A 4OPIA 4JBBA 2O87A 2O7KA 2XVJA 2LUSA 3GYIA 4IVFA 3DGQA 2I4AA 3M13A 2R6KA 2WCIA 4TXOB 4G9HA 5G1KA 4WBJA 1RW1A 5HR3A 4HZ4A 2PBJA 4OFNA 5HFKA 3R2QA 3WGEA 2MBTA 4D73A 2Y6RA 2NDOA 3TRQA 2ALBA 1GTAA 3ZVJA 1NHYA 3UL3A 3MAKA 1PBDA 5B8AA 5B6MA 4HJ2A 4F0CA 4NTDA 1GSYA 1GLQA 4MH3A 3WGDA 4TXVA 1B9YC 4JRRA 5H5QA 4YH2A 2I0ZA 2NPXA 3IXRA 4E8HA 3P90A 2E2MA 2E0QA 3TJJA 5U25A 1Q98A 2IWTA 1K0IA 1PBFA 2ARDA 1GP1A 2VD1A 2P31A 2H88A 3NT6A 4NEVA 12GSA 2BJXA 2JSYA 2DMLA 3O76A 1LQUA 1ZOYA 1WMJA 2B76A 5ECPB 1HYUA 1L9EA 5IMAA 2HLSA 2GSSA 1B48A 3GNJA 2WOVA 3REDA 3BHKA 1TK0B 1A24A 4XWZA 2C3CA 2BC0A 4PNGA 3ZYXA 2F5ZA 1R7HA 5ECRB 2BS2A 2BA9A 2FCHA 2Q0LA 4J34A 1T4ZA 1Z7RA 4C5OA 3IR4A 3F8RA 1X9SB 1FCDA 2OJLA 2FJEA 3DJEA 3UTEA 3PVCA 2OAMA 2H6YA 1XDIA 1HNCA 1KSSA 3GH9A 2KOKA 4K22A 4OPDA 1SK0A 1XXUA 3NLCA 4B67A 4EQRA 4O92A 3UKLA 4FDCB 1JZDA 2XHFA 1MO9A 1TRBA 2PWJA 2Q0KA 4GRTA 2L59A 1A8YA 1FVKA 3D4TA 3C71A 1GH2A 2N5AA 1GSSA 1Z3EA 1F2EA 1G0TA 4RQRA 1F9MA 3GKKA 1OJCA 5JCMA 1KNRA 5G5EA 3CNTA 2H75A 1U6TA 3ISOA 3G7IA 1R5PA 3J7Yk 1N8JA 3IPZA 3ATQA 3A5WA 5ECOB 3NTAA 1B5QA 4JQ9A 3TKQA 1JZOA 1T1VA 1OJAA 3DJJA 4IA5A 3VR9A 3L78A 3NNEA 2D2ZA 4L8EA 2WU5A 2VVLG 1XW5A 4AGSA 1OC8A 2WGRA 4RUVA 3UTGA 3AEBA 3UBKA 4Z26A 1B9XC 3HZLA 2JZTA 1BKWA 1SJIA 2OBIA 3IV4A 1NHPA 4B63A 5AN1A 1ZGNA 4OPGA 2C0DA 3KM6A 1EL5A 4U2TA 3DA1A 1GETA 1FEAA 4G10A 1GSQA 1XFLA 4NXIA 4J36A 4HB9A 3KD0A 2GQWA 4GSNA 3GX8A 2BMXA 1BWCA 4MP4A 5KXJA 2HFDA 1F8SA 1B37A 2R4JA 1IUVA 3CPHG 4BJYA 2BYBA 2VCXA 3VRAA 3FZ9A 2L4CA 1ZP0A 4BPYA 2OA1A 1T8EB 17GSA 3I6AA 4LL1B 2V32A 2EQ7A 5JWQB 2LJRA 3TJBA 1XIYA 2A2RA 2YANA 5DALB 4EC0A 2X99A 5KN1A 2FHEA 2H1DA 2R46A 4O5UA 1S3EA 2R3XA 4KSMA 1BYEA 1E6EA 2IMEA 1N4UA 2H74A 3G9BA 2LKUA 1O8WA 4OPCA 5CRWA 1H75A 2WDUA 3AECA 5DVBA 4MJCA 1JLVA 2QC7A 2V41A 3DMLA 2WOIA 5HY5A 3GUSA 1TRWA 4H2NA 1F3PA 3UP5A 4YT0A 2BS4A 4D73B 5GAND 4USQA 2JB2A 3QVPA 5H5SA 5G1LA 4REKA 4TR0A 3FYGA 5BULA 2IIYA 4EIQA 3F8UA 1SL0B 1SKSB 3DH9A 2KHPA 1GV4A 2P5RA 4V1Ag 4IVOB 4ML6A 5IOXA 1OE8A 1SENA 4EO3A 4KSOA 3M0FA 1XW6A 3NYEA 2C8UA 3GKNA 4WEYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2QKE A;  5EB5 A;  3NRN A;  3H7V A;  3ADA B;  3UOZ A;  3EU3 A;  1SJ6 A;  3MSY A;  1L9C A;  4IS0 A;  2RII A;  1K4Q A;  1PN9 A;  4JU5 A;  3GSI A;  4KDX A;  2H6Z A;  5J9C A;  1X0R A;  1L9D A;  1REO A;  3VA8 A;  5KMQ A;  1DUG A;  1OVN A;  2J9H A;  3R3E A;  4ZCC A;  3ZDN A;  2RLI A;  2C0E A;  3KXO A;  3DG3 A;  1K0O A;  4F9Z A;  3QFA C;  2BK5 A;  1TW9 A;  1GUH A;  4U8P A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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