2X8HA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni in complex with gsh
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 192
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8hA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8hA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA03
4DSGA 4AT0A 1MDKA 2M46A 3UOVA 3DK9A 2WB9A 1ELIA 1NHOA 1TK8B 3QAVA 3RPPA 2VCZA 3CNJA 2YJ7A 2L4CA 2GVPA 5B8AA 4JEDA 1CBOA 3TDGA 1BAYA 3CSJA 1XHCA 2DBCA 5DALB 2O7KA 1N4VA 3UKQA 2WGRA 4AP1A 4L5OA 3IXRA 4LL1B 5DCGA 1GTUA 3UVHA 4FYCA 3A2XA 5AN1A 1FCDA 1EBDA 4GF0A 3HZLA 1GUKA 1LQUA 4ZB8A 4ID0A 2PN8A 6GSTA 4Y4LA 3ZL5A 2XLUA 2C0FA 3L9SA 5CP1A 5ID2B 6GSSA 2GZZA 3NK1X 2C70A 2GAHB 1E2YA 2LNSA 3AD7B 4H2NA 1AAZA 3C1SA 3AE2A 2AQJA 4JY3A 1JZRA 2C3NA 3KVEA 1I9DA 1OVNA 3C71A 1FEAA 4EMWA 2C0GA 2ZZBA 4FX9A 1G0TA 4PX1A 2OADA 4RG3A 2IVEA 1QXHA 4H86A 4B1BA 2DSAA 4Z7XA 2C66A 3CTGA 1VF2A 3ALMA 1JOAA 3I9V2 2JZSA 4KDXA 1ZCPA 1XCCA 4POLA 3G9BA 1XPVA 3M8NA 4WETA 3W8SA 1E6EA 5GSTA 3CBUA 1XXUA 2H0HA 1XW5A 2PBJA 1KF6A 4YKFA 4YKGA 4MZBA 3SM8A 4E0VA 5JCIA 4BURA 2YLWA 4KUNA 3URHA 2XFOA 4EQSA 1V98A 4V1Ag 2FNOA 5D9VA 4NHWA 4YSXA 2C3TA 1X9MB 4Z2RA 1MEKA 2N5AA 1JLWA 1K0JA 1O6JA 5FS9A 2B7SA 3KH7A 1IJHA 1FB6A 2XPDA 1Z7PA 5DAKA 1OJCA 2C72A 3MAKA 3NG7X 4G2EA 4CNJA 2YR6A 1VDCA 5IPYA 3H8QA 3NYEA 2WJUA 4OVIA 4U2LA 4I8BA 1R4WA 1F37A 3G5QA 3DJEA 2L57A 3ISHA 4KH7A 2AHEA 2C64A 5D9WA 2YM2A 2FJBA 1K0BA 1K4QA 2WU5A 1H7XA 3JCML 2FA4A 4ZBBA 3CGEA 3MNGA 2Y6RA 1S3EA 4KX6A 3DGHA 3GRTA 5COHA 1TKDB 4O92A 1OAZA 4ICYA 1YZXA 2VVMA 1XVWA 3C73A 5B6MA 4CDOA 2MZCA 1X31B 2RUEA 3KD0A 2MMAA 2X64A 4G10A 3W8JA 1UN2A 1ZOYA 4NEVA 3VWVA 3ED3A 5JWRB 3BHFA 1TDOA 1SJIA 3CYNA 3CNTA 4NV5A 3RHAA 5IPGA 3P4QA 5ECKB 2IMIA 3Q9TA 1DBYA 2HZFA 1TP9A 2BJXA 2GAGB 3VR9A 2H1AA 3BCIA 4B64A 4DSSA 3ADAB 3GRXA 2WEUA 2XVIA 3P4PA 5JCLA 5C00A 2WBAA 4RSLA 4EL1A 1T1VA 3C96A 3I6AA 2K18A 1IUUA 4PNFA 1LJ1A 3HKRA 2FWHA 4O5UA 4A9WA 3WE0A 3O76A 4RQXA 3KTLA 2B5YA 2IIDA 3EWLA 3ZITA 3FKFA 4Z25A 2GH5A 3M9KA 4CNKA 1S3AA 4H4WA 6GSXA 3EU4A 3L9VA 2XYOA 5FMHA 4N10A 4TXVA 5EL8A 3F4TA 3G5RA 5ECQB 9GSSA 1JZDA 4YQVA 2R2JA 1B37A 5J4UA 4EE0A 4OMVA 4ZB9A 5ECMB 3DJJA 2P5RA 1DJQA 3ATRA 3S61A 4NXIA 2FHEA 4WF4A 4ZCDA 3ICTA 2PMTA 3C1RA 3QCPA 2JADA 2VUPA 1TI3A 1CJCA 1MDIA 1GRBA 5AIXA 4UP3A 3KMNA 2FWGA 4BJYA 2H76A 2NVKX 3CNDA 4OWYA 3CPIG 1NG4A 3TJJA 2HZEB 3TKPA 4KSMA 1F8SA 2VQ7A 5F06A 19GSA 4NWYA 1TK0B 2V60A 1F9MA 2KP1A 1K0MA 5G30A 3QDNA 3IHMA 4HA6A 1LU4A 4WXTA 4WKWA 5JCKA 5GSSA 2GR0A 1SK0A 1FB0A 1HNCA 2D2ZA 1PHHA 3CNPA 4X43A 3HZ8A 4K1FA 1ZZYA 2R0PA 4K8DA 1XIYA 3IR4A 1KSSA 3WYWA 2LRTA 1M2AA 3FZ4A 3EURA 3GMFA 5H5QA 4IVOB 2B9YA 4G19A 1JLVA 3VWUA 3EPTA 3G7IA 3P7XA 2QA2A 2NPXA 1JFUA 2EC4A 2HYXA 1F3AA 4GCMA 3R9UA 2YP6A 2XHFA 2CZ3A 5JCGA 1BGJA 4DVCA 3VFIA 4QL9A 2ARDA 2K9FA 4F9ZA 2WDUA 4Z43A 5JWQB 2BS2A 5DDLA 4BL7A 1B48A 2G0FA 2H71A 1TOFA 2VLUA 1Y0PA 1TU7A 1GNWA 4JDRA 4KX4A 1GRAA 1PJ7A 2H1DA 4KDUA 1E7PA 1PKWA 3MWHA 5FS6A 4MCUA 2XLRA 3KEBA 4J31A 3L8KA 2PPTA 1W4VA 4EDYA 4K6XA 4I6XA 1IUXA 3HJOA 5FS7A 1M0UA 2GSTA 3IK9A 4TOPA 4TXOB 1GTAA 4WR4A 3HVXA 3NTAA 1T4ZA 3GMBA 4YTNA 2FBWA 2CDUA 2X8CA 1MO9A 3B3RA 4OFNA 3D6IA 3N5OA 3QVPA 3F8RA 2DJKA 3U6VA 4WX1A 2YPMA 4X0XA 3CMIA 4YT0A 2OBIA 3LG6A 2VCQA 4Z2UA 3KH9A 2V61A 4MDCA 4JR4A 1COYA 5G31A 4EM4A 4FK1C 4Q5FA 2H70A 2B1KA 2BK4A 1UC7A 3TKSC 5J41A 1TRBA 3S9FA 3VWWA 4H4TA 1PXCA 2V6OA 5FWGA 1IUVA 3SWLA 3UKLA 3PINA 3IHQA 3H93A 2YZHA 3FPZA 5L71A 4IKHA 1AQVA 2OKAA 2MBTA 3CPJG 1XPQA 2C75A 1N4UA 1FG4A 4CY6A 1SENA 3L9UA 4IELA 1XWKA 3UP4A 1PBDA 1HQOA 4QL7A 3FW2A 3ZDNA 1ST9A 2CVKA 2WS2A 3IDVA 4HJ2A 1LTXR 2ZCTA 2YV9A 3CGCA 3AE3A 4L5LA 5C3JA 5F07A 4BVYA 5TR3A 1Z6MA 4APNA 2X8GA 3FEUA 1MD4A 3WGEA 5KVIA 1I5GA 1IYIA 11GSA 4GSNA 4TR1B 4B69A 2AB6A 1AIUA 4H4YA 1JZWA 3RBTA 4Z2TA 3LXDA 4NTDA 1AQWA 4KDYA 1XWAA 4K2DA 3GYKA 3APSA 3AE1A 4O5QA 1Y56A 1GTBA 4FYUA 1K0IA 3U5RE 1GT8A 4ECCA 4U8JA 3LXTA 5B7CA 1OJ9A 1SU9A 1TDFA 4BK2A 3BNUA 2B7RA 3K7MX 1B4PA 3VI5A 2H6YA 2H72A 1GSUA 3DK8A 3AE4A 2I9HA 2XFNA 3FG2P 2I1UA 3RPNA 2NVLA 4V1Ap 3V76A 3NLCA 3G7YA 1DOEA 3LADA 4IGJA 4IVMB 4MF5A 1Z9HA 4NTCA 3R2QA 1GREA 2V32A 3UBLA 1K0NA 1O7UA 3WGDA 1CJ4A 2F8FA 1NHRA 2C8UA 2DLXA 3D22A 1OE7A 3FIMB 2VL2C 4FDCB 2QC7A 4P9SA 2GQKA 3D0ZA 4JN9A 4OPIA 5KN2A 2GMHA 1U6TA 1OJAA 2KUCA 1L9DA 3LYKA 3DVWA 2PVOC 1RK4A 3ZRDA 2RABA 5CO3A 3IF9A 1H81A 3A5WA 3NOFA 2X50A 1YKAA 4KAEA 1QK8A 3UCLA 1F8RA 1E6BA 3ICSA 3G7JA 3ZLPA 1T00A 3FZ5A 5H5RA 2VM1A 5EVOA 4JR6A 2LRNA 4YQMA 3FMWA 2E0QA 5CAXA 3VLNA 4WEYA 3C4AA 1DNCA 3ERFA 3NHOX 2LV3A 4XRAA 2LTKA 1EV9A 1PA3A 3Q74A 4HQSA 2HRNA 2YLRA 2ZBWA 1CHUA 3IV4A 3D21A 5G1KA 1GLQA 2AR8A 2OE0A 3KU9A 5IMDA 3E1TA 2EQ8A 3HY2A 1QJDA 1YQ4A 3QAWA 3LJRA 3AEBA 4BK3A 1NEKA 3DMLA 1O8XA 4PQIA 4XS1A 1H7WA 2YQUA 5DAKB 1PXAA 4JQ9A 4TM3A 4GUVA 3NYCA 4K7NA 5HXIA 3ATQA 1ONFA 5HFIA 5JCWA 1VQWA 5JCNA 2FWEA 1FVJA 4Z44A 1GSYA 1PMTA 2GSRA 5GAPD 4XS4A 1DODA 5FT3A 1K3YA 2E4GA 2CZ2A 4IVFA 2JZRA 3E0UA 4YSZA 2F51A 2C65A 3BBYA 2MMNA 2O8VB 4GQCA 2VL3A 2WZ9A 4C77A 3GTUA 4LMVA 2GVCA 4D04A 3UJ1A 1HD2A 4IHUA 3QFBA 1V40A 3KP8A 3SGLA 1VF4A 2TRXA 2LJAA 1ACVA 1VGLA 3AEAA 2FWFA 1OJDA 1M6IA 4GCIA 1EV4A 2RGHA 1NPXA 3H4KA 3WD6A 3L4NA 2C3CA 1XFLA 5CREA 1TYPA 1TDEA 1ON4A 4KCAA 4A6NA 5GRTA 5LV9A 2OLOA 3GNJA 3LQ7A 2DJ3A 2BACA 4DSSB 3D4MA 4OCGA 1A8YA 3BNMA 3AYLA 2WHDA 3SQPA 4OPDA 2OALA 4PUFC 1EL7A 2E5VA 3NN0X 4H4PA 3O6TA 3H8IA 5CQFA 3GYIA 3FZAA 4C3XA 1SL2B 4EQXA 2Z9SA 2PUKC 2XFUA 1YEXA 2CAIA 2R46A 1PJ5A 2H1BA 3KD9A 4HQZA 4QQ7A 3AE9A 4PQ1A 1HNAA 2LUSA 1MXTA 1OC9A 3HVSA 4Z24A 2WDRA 3JSKA 3Q6JA 2H66A 5CKUA 2VCXA 3UEMA 3EF6A 5DQSA 3SBCA 4YAVA 3J7Yk 3UOMA 5JWOB 2C67A 3GWDA 4ILFA 2YJHA 1ZGNA 5GSNA 4XWZA 3EMXA 2WPCA 1KNPA 4J34A 3WT1A 3PGTA 2YG6A 1N1PA 3ME8A 4MLYA 3DD3A 2OACA 3HD5A 2BS4A 1BWCA 5IO0A 3I69A 4UDRA 4ZBDA 5D9XA 4J57E 4H4XA 4KNDA 14GSA 3DGZA 2GS3A 4ZXGA 1CQHA 3DEXA 4TW5A 2KHPA 3I3LA 6GSVA 20GSA 3QOUA 3ZVJA 4IN0A 3K7TA 4XS6A 4HDEA 5D96A 3TJGA 1TDIA 5JCMA 5IO2A 4OCEA 2VD1A 1VG0A 1YKJA 2O89A 5CNWA 3ERGA 1GALA 4LIIA 2CX4A 3OR5A 5B6NA 4MJWA 2GLRA 3H8LA 4RG4A 4U8IA 1PJ6A 5AIVA 4KW6A 3GMCA 3D5JA 2CULA 2JU5A 2OA7A 4ECHA 4ZL8A 1H82A 3LOVA 1FHEA 1F3BA 4PGTA 5IQ1A 5BULA 3MDKA 3FR3A 2MMOA 2EIOA 5D73A 4WBRD 4HJMA 13GSA 5ECNB 2O9ZA 4XRDA 1GRXA 2VCTA 1FO5A 1G7OA 4YSHA 1WMJA 4C74A 4E8EA 1YF1A 3CXGA 4CW9A 2FUG2 3TGZA 3ME7A 1IUSA 4H4RA 2B1LA 3NH3X 2GZPA 3REDA 2J3NA 3F6DA 4PURA 4MZWA 4ECBA 1JU2A 5IPHA 4ZN0A 2GDRA 2F5ZA 3DWVA 2XVHA 1PDHA 1DUGA 4ECIA 1AC1A 5HQPA 2PYXA 2R9ZA 4EMJA 2R0GA 3KM6A 2CFYA 4YSYA 2UZZA 1H83A 2QAEA 1Q1RA 3EYTA 1CQGA 4KGIA 2L5OA 1Q9IA 2BC1A 1HYUA 4ACSA 4U8NA 2YWIA 3DXBA 4TLXA 2WP6A 2V6KA 5CRGA 2GQMA 2IMDA 2A4VA 3NGCX 2BCGG 1Q98A 4N30A 4F03A 1BJXA 4Y4NA 4EC0A 4I5QA 1USBA 2YANA 1X9SB 4DGKA 4Q5NA 3ICRA 2YVJA 1VRQB 5KEJA 2XLSA 3FBSA 4O5RA 3RHBA 4D73A 1XW9A 1KFYA 3AEFA 1TRVA 4V2MA 3UKPA 2YG3A 1B8SA 4AT2A 1M99A 1YF0A 4MK3A 4KA0A 3FR6A 2FGXA 2BCPA 2JKCA 1Q1WA 3CNSA 1EOGA 4X4JA 2VLTA 2R0CA 1ZKQA 1XBSA 2KLXA 2ZZ0A 3BI5A 2B3SA 5A4UA 4EQRA 4F0CA 1J0FA 1GRHA 3VPTA 3NKSA 2N5BA 5H5SA 1CC2A 3FY7A 1SJ6A 4F0BA 1XWGA 5G1LA 2N5FA 1OYJA 2GEWA 4REKA 2X99A 3DKSA 1URMA 3H79A 1B9YC 5M10A 2JB3A 1PRXA 3GKXA 2VM2A 1GH2A 1T4YA 5FHIA 1J9BA 5ECLB 3BHKA 3UKKA 3IAM2 3S5WA 3TJFA 4K0NA 1M64A 3KP9A 1YKCA 2F9SA 2V2GA 2YLSA 2CQ9A 3HXSA 3COXA 4MMMA 4YWOA 1FAAA 1N8JA 2REMA 2XPEA 5E4WA 1RYIA 2QKEA 1DXLA 4XHMA 3LB8A 1O5WA 2E7PA 2YG7A 1FW1A 1EGOA 1JNZA 4L0WA 2I3YA 4IA6A 2DMMA 3KKJA 3TOTA 1SYXA 4LLRA 4WR5A 1GESA 2YLTA 2M80A 2C80A 2NTOA 4NZHA 2VZ2A 1SK1A 3F9UA 1NG3A 2IL3A 2NPBA 2GF3A 5E59A 4MP4A 2RM6A 3DVXA 3L78A 3GD3A 2XVEA 2WRTA 1BKWA 5ER0A 1VG9A 3IOSA 3L0HA 1L0VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1YQZ A;  4IP6 A;  3QD9 A;  2O87 A;  4TR1 A;  3TJK A;  4OO4 A;  4GRT A;  1THO A;  4H7U A;  4IQ1 A;  4IS0 A;  3Q19 A;  2YCD A;  2WDV A;  5ECR B;  2BA9 A;  4KPR A;  2IME A;  5EY6 A;  2GV8 A;  1GSQ A;  4MF7 A;  1GRF A;  4YWS A;  2IFQ B;  3LWA A;  5IMF A;  3CPH G;  2OLN A;  1GNE A;  1UVZ A;  1ECQ A;  3PS9 A;  1GRG A;  4WBJ A;  1DOC A;  2E5A A;  1PGT A;  1D4C A;  3GWF A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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