2X8HA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni in complex with gsh
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 192
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8hA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8hA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA03
4OO4A 2CVKA 3S5WA 3BI2A 5ECNB 3JCML 3K7TA 2I81A 3C1RA 1SJZA 3B3RA 4EL1A 3J7Yk 2B9YA 3GIXA 3HHVA 4NWYA 1K0CA 2QA1A 5AIVA 3KCMA 2APGA 2LTKA 4U8JA 4OFTA 5C04A 1PBBA 5HR2A 3CNDA 5C3JA 5B8AA 2C80A 2GSTA 2WP6A 1NHSA 3UTFA 1BGNA 3MWHA 2DKHA 7GSSA 4YTNA 3UOYA 2OJLA 3DH9A 3UL3A 1JNZA 4AP3A 1YKAA 1ZMDA 5KOXA 2FY6A 3KD0A 2HYXA 2GZYA 1ZP0A 2YR6A 3UKHA 2YOIA 3FR6A 4HS1A 1CJ4A 1H6VA 2GLRA 2DJ1A 2YR5A 4G9HA 4OPTA 4PABA 3LJRA 3DKSA 4NTDA 2VCTA 4NV5A 1LQUA 2LJAA 4GSSA 3SM8A 4PX1A 4BWSA 2YG6A 4K2XA 3A3TA 1O7UA 5JCNA 2BACA 2JB3A 5KWFA 5G2ZA 5KVHA 3VLNA 3GMBA 2J9HA 2QA2A 3IA1A 3GHAA 3NK1X 6GSXA 1PN0A 1USBA 2XDOA 4KNDA 3ISOA 2CVBA 2BS2A 2O8VB 1PRXA 1FAAA 1YF1A 2DJKA 4J56A 4TW5A 4PNGA 1BAYA 1SENA 1YEXA 3ERFA 5G5EA 3LZWA 4EDZA 3QFAA 2V6OA 5EB5A 4ECBA 3WE0A 2GT6A 1ZMCA 1GSNA 1MDIA 1GESA 2BC1A 2VL9A 3NZNA 3DJDA 3GRXA 5IMAA 5D9WA 1M7TA 3DEXA 5AN1A 2HXKA 4ADWA 3AE7A 1JLVA 5IQ1A 3GYKA 3ZVJD 1TYTA 4GSNA 3DVWA 2MBTA 4U2TA 1HD2A 1ZX9A 1EP7A 2DMMA 4KH7A 4U2SA 1XVQA 2NVLA 4YWOA 1HNAA 1TK8B 3HJMA 4GCMA 1ELIA 4TR3A 3AWIA 4RI6A 2XCGA 2MBSA 3NKSA 2HSYA 3NYEA 3V3OA 2O87A 1HNBA 1E1NA 3AE8A 1UKVG 3QDNA 1OJ9A 2WS2A 4ZBBA 3VWVA 5ECKB 3ATQA 3NIVA 4NMUA 2PERA 3ZFLA 3TOTA 1QXHA 1EL9A 3KU9A 2PN8A 3UVTA 2NVKX 1KTEA 2ZCTA 3BCIA 2FJAA 2LRNA 4KDYA 4A79A 4X0XA 1SJIA 1DNCA 4N10A 2BK5A 4A5LA 5CQFA 2XVIA 4NEWA 4H4WA 5DJMA 3K7MX 1E1LA 3P4QA 4K0GA 3K8NA 1KNGA 3GA4A 1LBKA 1XWCA 3QR6A 5HHFA 4O7HA 4NHWA 1KF6A 3K7QX 1GNWA 3KMNA 1EBDA 3F3QA 2VVLA 1AAZA 1NHOA 3SBCA 4J31A 2WU5A 3LGCA 2C3DA 4YTPA 1CBOA 2WCIA 2BABA 5L46A 4TM1A 2X8GA 4C74A 3AE5A 3APSA 1YY7A 4NV2A 1Z5YE 4I8BA 2WDUA 2XFNA 1RW1A 2FWEA 1TDIA 2OACA 3GNJA 3FMWA 4OFMA 3G7IA 5C00A 3UBLA 4APNA 3IXRA 2C70A 4TLZA 5HXIA 3ZITA 4UDRA 1AXDA 2HZEB 3CRUA 5B6NA 8GSSA 2I3YA 3L8KA 4JDRA 2YWLA 3FZ5A 3Q18A 3CPJG 3P9UA 3P1WA 3IOSA 1JHBA 4MA9A 4OCGA 2YVFA 1O8XA 3C71A 1Z6LA 2REMA 3TRXA 4IP6A 5IQ4A 2GGTA 4CNKA 3FZ9A 2EQ9A 2VCQA 4L0UA 2PMTA 5DQYA 4WXTA 2VM2A 4YKFA 2YG3A 4K22A 2YV9A 4TM0A 1A23A 2VVMA 4H4QA 5ID2A 4Z2RA 2G0FA 1ZL9A 2JB2A 4POMA 2F8FA 3KP8A 4NXIA 3KVEA 3AYLA 4ZBAA 1V58A 3L0HA 2K9FA 4IHUA 1ZZYA 1BWCA 1PQNA 4P3YB 4EO3A 2VVLG 1Y25A 1XWGA 4HQSA 3KGKA 2BA9A 1MDKA 2R0PA 3A2XA 4J34A 3KTBA 4H2NA 2NPXA 4MJBA 1Y56A 2A2RA 4AT2A 2H70A 1B8SA 1GLQA 5KXJA 2F5ZA 5GAPD 3HXSA 1BEDA 3BHKA 2LQQA 4Q5FA 5AISA 1A2MA 3HVXA 3SWLA 3AECA 3NTDA 1QLBA 3GWFA 5EVOA 5JWRB 2CT6A 2C75A 1PKWA 2YWNA 1PXBA 3F63A 4USRA 2B7JA 3IAS2 4KB3A 3QAGA 3HZ4A 4CDOA 5D96A 5D73A 1VQWA 2CQ9A 4F0BA 2TRXA 1X9WB 3ZVJA 2GR3A 2P5RA 3ZIVA 5HR0A 5FS7A 1GUHA 3VPQA 5CKUA 2B3SA 1JZDA 3LXZA 5E4WA 2BCGG 1O95A 2YLXA 4YQVA 2YLSA 1GRXA 4A9WA 4F2IA 4Q5RA 4F03A 1E7PA 2ALBA 1H75A 2RLIA 1XIYA 1CQGA 4HQZA 1BGJA 3F8DA 4ZN0A 2XLPA 1QJDA 2GAGB 2R4JA 4EQWA 3D0ZA 6GSYA 5G1KA 1NHPA 2OE0A 3UP4A 1GSEA 2XLSA 2JSZA 2FHEA 4DEJA 3QSMA 1N4WA 4AOXA 3ME8A 4V1Ap 3O3TA 4GTUA 4X9MA 1TP9A 2H1GA 3ZMLA 4K5RA 4D73A 1SL2B 1NAAA 3NYCA 4Z26A 1KFYA 3S9FA 2YLRA 5CRGA 2WOWA 3VR8A 2WZ9A 2EIQA 3UCLA 3K30A 2ON5A 2C3TA 3APOA 5KVIA 1OE7A 5E59A 2PBJA 4WKWA 1A0FA 1TRWA 3CYNA 5IPGA 4EE0A 2C66A 1Z9HA 4D03A 4YH2A 1A8LA 1OJDA 1EL8A 2F3MA 3TKSA 2H73A 3MAKA 2HE3A 2YP6A 3ZTLA 1PJ5A 3EYTA 3ICRA 5ECPB 3CNJA 3GTUB 4IKHA 2GDRA 4LL1B 1FL2A 4HU9A 5CAXA 2H76A 4PUFC 2ZZCA 4BK2A 3UEMA 1FCDA 1R26A 4TXOA 2JB1A 3EE2A 3GX8A 5KN2A 2WP5A 1XPVA 3EVIA 3O76A 3C73A 2V2GA 2H1DA 1RYIA 4IA6A 3EURA 1TJDA 4YQMA 3GKKA 3NYFA 1R7HA 2NDOA 3G9BA 4WF4A 1XZOA 2EQ7A 3TUEA 4IGJA 3V1WA 1M9AA 3ALMA 4FK1C 5ELGA 3GDNA 1M9BA 1QMVA 4CNJA 2HI7A 3UOMA 3NTAA 2E2GA 3LEFA 4B1BA 2V3BA 4NHZA 1LU4A 4B69A 1PX7A 2DKIA 3VRDB 3P90A 4KUNA 3P4SA 4EDYA 2OE1A 2BMXA 2V1MA 3PVCA 3W8JA 5F06A 3E3EA 1H86A 4HZ2A 3CTGA 6GSVA 3HDCA 1WPIA 3H1NA 4TM3A 2WPEA 3UKQA 4H2QA 3US3A 2CX3A 2QKEA 1VF2A 5D9VA 2LRCA 2IWTA 1TDEA 3C96A 2G2QA 4X4JA 3GV1A 4ECHA 1YEPA 2C3QA 2EQ6A 1GNEA 2GF3A 1YJ6A 4GF0A 11GSA 1K0LA 1ZGNA 1CQHA 3HY2A 1JLWA 3TJJA 2K18A 1TRVA 1W4VA 1SK2A 4O92A 4V2NA 3LG6A 2GH5A 5CYYA 4H7UA 1GL8A 3RHAA 1F8RA 2R4EA 4HZ4A 4F9ZA 1AC1A 3LB8A 3L4NA 4OCEA 4IA5A 2RGJA 3GYIA 2AV4A 3L9VA 4XXGA 2GV8A 3M9JA 1TDFA 4JRRA 1K0JA 2XVHA 1F8SA 2LJKA 2VAFA 4GQCA 4HJ2A 3EMXA 1CL0A 5G5FA 2B1KA 1M2BA 1GV4A 3LYPA 1QGVA 4PURA 3R9UA 2A89A 1FEAA 4H4XA 2GQWA 3DJGX 4AF2A 3PS9A 2C67A 3IRAA 5M10A 1FHEA 1X5CA 3KKJA 4YXDA 2EQ8A 1PBFA 1R5AA 2H66A 2JL4A 3QVPA 5B7CA 3UMAA 1NG4A 2DIYA 2FWGA 5DBJA 3VWUA 2WPFA 1H7XA 4ZBDA 1GETA 2NTOA 5LCZA 3UOVA 2R9ZA 3IBHA 4K7OA 2ACZA 4HB9A 1OKTA 1PMTA 1P2HA 2LQOA 5LD0A 1GOSA 4U8PA 4YT0A 4AJ7A 4Z43A 2BCPA 1X9SB 3AYIA 3BOAA 2OADA 4V2MA 2Q6UA 4E0VA 1VG9A 3U6VA 2VLVA 2GVPA 5EL8A 2C64A 4H4YA 1NSWA 2AR8A 3RHCA 5DAKB 1YZXA 4FYUA 3ATRA 4K2DA 3COXA 5C2TA 2LNSA 3O6TA 4G10A 3L78A 2RABA 1OJAA 2BTOT 4F82A 5IMVA 3KH9A 5ECOB 3RBTA 2JAEA 3AE6A 3ZMKA 4MDCA 2DIZA 1PS9A 1ML6A 5DAKA 5IMZA 2R37A 4TR1A 4K8MA 2LRTA 2C4JA 2IN3A 1I5GA 4JNAA 2JKCA 3QPMA 1BG5A 3KPFA 3H79A 2XC2A 2WGRA 3AD7B 2C0FA 3ZIJA 1EEJA 17GSA 3AB1A 2PUKC 1BJXA 2R45A 2PWJA 4RQXA 2F8AA 4KSOA 3N5OA 4YSXA 4GXZA 4I5QA 3GL3A 5KN0A 1YQ1A 1DJNA 2BS3A 3DK9A 1PJ7A 2RGOA 3FKFA 1GREA 2JADA 1A24A 2CAQA 1O6JA 1EL5A 2AHEA 3LQ7A 3UTHA 5BVAA 4JY3A 4K1FA 3IR4A 5IMFA 5ECMB 3CNTA 4YAPA 3KLJA 1B9YC 1FVJA 2YG5A 2VLTA 2OE3A 4PGTA 2H8LA 3FEUA 4YKGA 2N5BA 2K6VA 3RHBA 1TDOA 3I3LA 1LPFA 1O85A 2AYTA 4EQSA 4WBJA 4H50A 1O5WA 3PR8A 4IJIA 4LMVA 2V32A 5ENUA 2Y6RA 4WETA 3NN0X 5GSSA 2R46A 1J08A 4MF5A 3M3MA 2GQFA 4RSLA 2TMDA 4IW9A 1GRFA 1YKJA 2VL2A 2WOIA 1LQTA 1FECA 1CJ3A 2KUCA 4N0VA 1VRQB 1TRUA 2H71A 1URMA 4GCIA 1XPQA 4CHSA 3HCZA 2OKAA 2L5LA 3RDWA 5DCHA 2H74A 3CGDA 4H4TA 1S3CA 3LXTA 2B76A 1TTZA 3QFAC 4HOJA 2DLXA 1ZCPA 1TK5B 3BNUA 3IPZA 4IELA 1EOHA 4IVFA 3P2AA 3WD6A 4B64A 3A2VA 5ECSA 2H0IA 3DGZA 1F2EA 4EQXA 3UTGA 3CTFA 3E0UA 3RPNA 1N4UA 1QO8A 4OPCA 2WFCA 1GTUA 1Z6NA 3CSHA 5HFKA 2R0GA 1IUUA 4K7NA 1M0UA 2YVGA 1T4YA 2R3XA 1K0NA 2RM6A 5JCMA 2OLOA 3AE9A 4H86A 1DJQA 1REOA 5DDLA 2DMLA 2VRMA 1GRAA 1YQ4A 1NM3A 4MLYA 2YANA 1O81A 5B6MA 1FW1A 2GR0A 1TI3A 1XOBA 2K8VA 4WR4A 4HDEA 1O8WA 5IMCA 2I4AA 3NG7X 5ECRB 4GDEA 1WRYA 4RG4A 3G7JA 4L8EA 2MMOA 1LJ1A 4PQ1A 1G6YA 4O5RA 4BPYA 1UN2A 2IMFA 4CY8A 4ZB8A 5JCUA 3SQPA 3BJ5A 3E1TA 5JWOB 2PVOC 2GAHB 3NK2X 4A99A 2C3NA 3UVHA 4A65A 4DVCA 3TCOA 3ABVA 1EEMA 3F0IA 4YTMA 1MOKA 5H5RA 2XFUA 5CRHA 3ZRDA 2XLRA 4N30A 2YQUA 1R4WA 1XWAA 4IJ3A 4B66A 4B65A 3DK4A 3RPPA 5DBQA 3F3RA 3H4KA 3UKFA 4C77A 1LTXR 2DJ0A 2PYXA 1ERTA 4L5LA 4K8DA 3UAPA 1B37A 5TR3A 1J9BA 2HRNA 5D9XA 3AE1A 2OALA 1WIKA 2B6MA 2H75A 3ZYWA 3G5QA 3LORA 1H4OA 4EQRA 1Y6EA 2VQ7A 1FB6A 4A6NA 4QL9A 2OAMA 3DJEA 3D4TA 2HQMA 5FS8A 1OJTA 1AOGA 5ECHB 4ACSA 2LEGA 3D6IA 4Z44A 3FIMB 5JCGA 3SFEA 1U3IA 2HLSA 3TRQA 3TKPA 2XFQA 3FYGA 3LJPA 3UKLA 4MK3A 1K4QA 1SD9A 2OBIA 4E8HA 3TKQA 3ERGA 4N11A 4ZIJA 1WMJA 3I9V2 2VCVA 4H4ZA 1ZDLA 3LOVA 3UP5A 5ID2B 3DMEA 3C8EA 1B9XC 1PL2A 3I43A 5DVBA 1XW5A 3WGXA 1B5QA 2GT5A 3TGZA 2YLZA 4B63A 2XLTA 3LSZA 3KA7A 1X5EA 2H72A 12GSA 3LZXA 2LSTA 5ECQB 5A4UA 2GRTA 1YY5A 1P2EA 5DJLA 4IVMB 1NENA 1RSGA 4LU6A 4K6XA 5ECLB 2YR4A 1YDKA 4IBPA 5EY6A 2X8HA 1Y56B 1DE1A 3ICTA 2YNXA 3P8WA 5G30A 4Q5NA 3IF9A 2XYOA 3IC9A 5ER0A 1N8JA 3VPTA 1AQXA 3DVXA 4DSGA 2C0DA 2CVDA 2WDQA 2HZFA 3QFBC 3GX0A 3TJBA 4DSSA 1IJHA 1OAZA 4YSZA 4DSHA 1PD21 2WESA 2R4VA 1CHUA 5FWGA 2YJHA 3QFBA 2C0GA 4FX9A 4ML6A 2CA8A 1SEZA 4OPGA 1K0AA 1PN9A 1OVNA 2BC0A 2V41A 1IUVA 4TVEA 1VGLA 2GR2A 3TJGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1GRH A;  4IL2 A;  2ZZB A;  3FR3 A;  4DNA A;  1M99 A;  2CFY A;  4IP4 A;  4FDC B;  4MCU A;  2EIO A;  5H5Q A;  3HA9 A;  3AD8 B;  2YV7 A;  2GGE A;  4BA7 A;  3L9S A;  3DYR A;  3VUR A;  1VG0 A;  1TU7 A;  3LFL A;  3QAV A;  1SK0 A;  5CRD A;  4YAV A;  3GD4 A;  3T2Y A;  4TR4 A;  1EV4 A;  3CB3 A;  16GS A;  4K7Z A;  1XW9 A;  1WJK A;  2MYG A;  1FVK A;  2GSQ A;  4QL7 A;  3EAN A;  2QCU A;  3CGB A;  2CX4 A;  1WP0 A;  3ZLH A;  2IVD A;  3D4M A;  3F8U A;  2J23 A;  2X99 A;  4H4V A;  2QAE A;  1GUL A;  2RGH A;  3KXO A;  5J9B A;  1NU5 A;  5KRQ A;  3URH A;  5BUL A;  1WOU A;  1WUF A;  1SYX A;  3PIN A;  3VWX A;  1HYU A;  3M13 A;  2JZR A;  4ZL9 A;  4BK1 A;  2ZBW A;  1TW9 A;  1O94 A;  3OZY A;  4TXV A;  3D1C A;  1WE0 A;  3KH7 A;  1THO A;  2RUF A;  4X9N A;  4B67 A;  2YLW A;  1V40 A;  1P48 A;  2Y6Q A;  4V2L A;  4Z2U A;  1Q4J A;  1PJ6 A;  2AAW A;  3TTE A;  3ZVI A;  4EIP A;  4MZB A;  1CJ2 A;  3GN3 A;  1QFN A;  2FD3 A;  1MD3 A;  1U6T A;  4EMW A;  1OC9 B;  2JU5 A;  3CN8 A;  4OWY A;  4H4P A;  4X1U A;  2IME A;  4OPD A;  2L5O A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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