2X99A

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni in complex with nadph
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
587
structure length
587
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 191
structure length 587
sequence length 587
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x99A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x99A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x99A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x99A03
3LJPA 3ADAB 3NH3X 1THXA 3PR8A 2YWIA 3UKPA 2XFPA 2BA9A 4O5UA 2WDQA 4KPRA 4EDZA 1GTIA 5DBQA 3O3TA 2XCGA 4DSGA 3LGCA 3FEUA 4GRTA 1LQTA 1YKJA 5DAKA 2KUCA 3IBHA 2YPMA 3HVSA 3DA1A 1HQOA 1GTAA 3S5WA 1VF3A 1REOA 4YKGA 3FZ5A 1IUXA 1XVWA 1DJQA 1EEJA 4IV9A 3DK8A 2H75A 6GSXA 4MABA 4D73A 1P2EA 2L59A 3LSZA 4FDCB 1OC3A 1NDAA 2YWNA 3EC3A 3KH9A 3EVIA 4NWYA 5J5NA 4AT0A 1PBEA 3FRCA 1TU7A 3E9JB 4GWRA 3BCKA 4OO5A 2DMLA 2WS2A 3BOAA 2H73A 22GSA 3DJGX 5DQYA 2GQKA 3QR6A 4ID0A 4IQ1A 4H4TA 4AJ7A 4KGIA 3WYWA 4AP1A 3BHFA 4JRRA 4X0XA 4P3YB 5D8IA 3HDCA 3UMAA 1F6MA 4IP1A 2L4CA 2YVFA 3F6FA 3CSIA 4TR0A 1FL2A 2RUFA 4FK1A 2X8GA 4H4VA 3APQA 4KDUA 1EOGA 3GWDA 2VCTA 1QQ2A 4TXOB 3W8JA 3VK9A 4EL1A 5DCHA 4KSMA 1ZYEA 5LV9A 4ZILA 1GRAA 2H6YA 1TDNA 4GF7A 3UCLA 1G6YA 1AC1A 2GLRA 3KA7A 3DVXA 4EC0A 1ERTA 1RW1A 1SENA 3NIVA 4U8LA 3G7YA 16GSA 1JLWA 2FA4A 4YSYA 2EQ6A 4K0NA 5CRGA 4K1FA 3GL3A 4L5LA 5C04A 5IPYA 5G5FA 2HYXA 3AEAA 4MJBA 1DJNA 2VL3A 1R5PA 4U8PA 3LADA 2JK6A 3E1TA 1XANA 3VLNA 4F0CA 1T7PB 1S2QA 2C66A 3KGKA 1TRUA 2E1MA 2FJAA 2RM5A 1M7TA 1BJXA 3QDNA 1TKDB 3L4NA 1GV4A 2C3DA 4BVYA 4JZQA 3H8LA 1GRBA 2YLRA 4IW9A 1B8SA 4XWRA 2GR3A 2IPAA 5CRWA 5EL8A 1JFUA 4PUFC 2HI7A 3GSSA 3AECA 4XRAA 3J7Yb 2GQWA 1DNCA 2C7GA 1TXXA 4GDEA 3GA4A 3CYNA 2WHDA 1XBSA 2H6XA 1GTEA 5H5RA 1PKWA 2LJKA 4H4PA 4XCSA 4K0GA 3JSKA 1X5EA 2PU9C 2I0ZA 2NDOA 4DNAA 3GYIA 3CNDA 2OBIA 3FK8A 2RM6A 4PX1A 4TR1A 4H4RA 4ICYA 3TB2A 5ECNB 4K7ZA 3KCMA 4CNJA 1ERUA 1H81A 3N5OA 3VWWA 3ZL5A 3JCML 2VOCA 4EMIA 1NHPA 5HR1A 1NG4A 4TR4A 5KN3A 3LOVA 3UTEA 4MH2A 1XWCA 1JHBA 1A2LA 1GTBA 1PXCA 2FCHA 4KW6A 4IVMB 3DWVA 4N0VA 3C96A 3NYCA 4Q5NA 2ZCTA 2H70A 3UVTA 1S3EA 5F8BA 3ABVA 4U8IA 5IIZA 3AEGA 2GMJA 2AR8A 5ELGA 2YG7A 2E4GA 4XWZA 5KOWA 4K6XA 5IMAA 4EMWA 2XC2A 1XPVA 3K7MX 3FZ9A 3UKLA 3DGHA 4HA6A 1D4DA 2GEWA 4H2QA 3F63A 5HY5A 4ZL9A 2I81A 3I43A 1YQ3A 2DIZA 4WBRD 2XLRA 2XPEA 1FG4A 1F3BA 1IYIA 1KDGA 3DVWA 3GYJA 1SJZA 3IXRA 2BK3A 4N11A 3TKQA 4I2TA 1K0OA 1Z6NA 3H8IA 5DCGA 2GDRA 1MOKA 3QJ4A 5B8AA 3DGZA 4EQWA 3M12A 4OFTA 2CV4A 5FS9A 1THOA 2H88A 3QFAC 3ZFBA 1UVZA 2H76A 2HE3A 2VCWA 1XOAA 3IC4A 3BNUA 5GAPD 4HQSA 4H4ZA 4DSSB 1S3AA 2X3NA 4IN0A 1SD9A 1U6TA 5FHIA 1IUUA 3BNMA 10GSA 4ML6A 3O6TA 5CYYA 1F2EA 3GSIA 2C73A 2B1KA 2YWOA 4TM3A 1K0JA 2LV3A 1TDIA 1ACVA 5HFGA 2GZPA 1IJHA 2XVFA 1H86A 5F06A 1XWKA 1JRYA 4OPTA 2R4VA 2YM1A 1EZKA 1QUWA 3GYKA 4IS0A 1SKWB 3VWUA 1D7LA 4OD7A 4GSNA 4N0ZA 3V76A 4PXOA 1M6IA 3NRNA 4QL7A 1ZP0A 3EINA 3E3EA 5IMFA 4MLYA 2R3XA 4J34A 1KSUA 4KH7A 2VOUA 1WP0A 1FB0A 2K6VA 3LORA 3NGCX 5ECQB 4RSLA 2RGJA 1MD4A 3F9UA 1PL1A 2GSRA 4MF6A 4ACSA 1TK8B 1D4CA 3VQRA 2OADA 3W6GA 2X8CA 3APOA 4E8HA 1SJ6A 5KRQA 3HVVA 2Y6QA 3H4KA 3J7Yk 5KN1A 4LIIA 1WJKA 1QXHA 3A3TA 5J7XA 3IRAA 1YQ4A 1Q1RA 5EB5A 4V2MA 1EGOA 3CNPA 2B3SA 4TR1B 3AE1A 5GSSA 1GETA 4J2WA 4J56E 3TRQA 4EKZA 2H1GA 1FAAA 1O81A 3F8DA 4WETA 4RG3A 1I5GA 3LEFA 4MF7A 1VF2A 3ME7A 2C0EA 4Y4LA 3KMNA 5C00A 3B6DA 4YWOA 1TW9A 5HR0A 20GSA 1EOHA 1O5WA 3W8SA 1CQGA 2PBJA 1NSWA 3CGCA 2VM2A 3PVCA 1Y56B 4Y4MA 3R9UA 2KHPA 4BA7A 3BI4A 2X8HA 1J9BA 3HVXA 3TJJA 1V59A 3M1GA 2OAMA 3S61A 2OE0A 1YY5A 3QPMA 4USRA 3KP8A 4G2EA 3TKSA 2X50A 3ZVJA 2A87A 4A7AA 3GMFA 4RI7A 2YM2A 4CCQA 3IAM2 1H84A 3I6DA 2C0DA 5ELAA 2WPCA 3P2AA 5IMZA 4TN8A 1VG0A 1MTCA 4IGJA 5DJMA 2PERA 1FB6A 4F0BA 1GSEA 4TM0A 3AE4A 3APSA 2BJXA 5FS8A 1TK5B 2R0PA 2IMIA 5FT3A 5F05A 1OJ9A 5IMCA 2WETA 3UTFA 3GRXA 1USBA 2F51A 5U25A 1BZLA 1M2AA 5D9XA 4WF5A 2IMDA 3ALMA 4Z2TA 2MMOA 2VCZA 1GESA 6GSYA 1G7OA 3BCIA 3CXGA 3GV1A 2AUVA 4AGSA 4Z2RA 4MPFA 2V3BA 2I3YA 1BWCA 4DSRA 5KEJA 3C1RA 4NHWA 1ZMDA 1TP9A 2LQOA 4F82A 1ERWA 4ZXGA 1K0IA 3ATQA 3HCZA 4ZB9A 1GP1A 3URHA 1TRSA 4Y4NA 5D9TA 4Q5RA 4FYCA 1MEKA 1K0MA 3P90A 1F37A 4U8MA 2VL2C 3CRTA 1ZOVA 2R4EA 3QD9A 1M64A 5BUKA 1GWCA 1LJRA 2IMKA 3VWVA 2JKCA 4ZCDA 4TLXA 3DJDA 2JU5A 3DRNA 3EMXA 2PVQA 3UAPA 2YVGA 5CP1A 3ED3A 4K2XA 4TOPA 1ZZYA 4PQ1A 4IVFA 4GR1A 1XPQA 3KVEA 3DJJA 3ZIJA 4U2TA 1G0TA 4PQIA 2H1AA 2GQMA 3GTUB 1ST9A 3TOUA 1TYPA 2WJUA 2GS3A 3UOYA 2ON7A 2C3NA 2ACZA 5HXIA 3UTHA 3GL5A 2C64A 3AEDA 2WDRA 2LQQA 5JCGA 1AQVA 1PGTA 2DBCA 1JRXA 4YTNA 1TDKA 4LL4B 4WEYA 3P9UA 3QSEA 2P5QA 1L9CA 1NHYA 1DE2A 3BI2A 4XIHA 2R6KA 4TR3A 1FVKA 5A4VA 1PN0A 2V3AA 2IIDA 5DQSA 2OA1A 1SJIA 4KAEA 5LCZA 5B7CA 3K7QX 4XTSA 4BL7A 2P31A 4JBBA 4A9WA 2YV7A 1TTZA 4PAAA 1U3IA 2R46A 4WKWA 3UP4A 4H86A 3GX8A 1FOHA 1RYIA 4ZB8A 1PXBA 2R45A 4TXOA 5JCUA 2E2GA 1V2AA 4OWYA 1QO8A 1R5AA 1O94A 3CPJG 2BMXA 1OJCA 1K0AA 1CHUA 3SFEA 1IUSA 3AEEA 4EIQA 3WGXA 1EL7A 4BPYA 3IHGA 4A99A 2C0GA 6GSSA 3IPZA 5ECHB 1E1NA 3CTGA 2Q0KA 2IWTA 4M52A 4U8OA 2XVJA 4GQFA 1OJDA 2YR5A 1PS9A 2AV4A 2DJ2A 2C72A 1OE8A 4YT0A 1S2YA 1B9XC 2JZRA 5HR3A 3ICTA 1T4YA 2BK5A 3AE9A 2N5FA 2YLWA 3RHBA 5IO2A 2WQYA 3H79A 1YEPA 4K8MA 1OC9A 3Q6OA 2QCUA 2BYBA 2P0GA 2FJDA 1R4WA 1N4VA 4YAVA 1B37A 2H89A 4UDRA 4BJYA 1ZX9A 1GLQA 3K8NA 5GAND 2KLXA 5L46A 2ZNMA 4LLRA 3GKMA 1BX9A 1PHHA 1CJ2A 3A5WA 3C4AA 2XLSA 5DJLA 3DEXA 3PINA 2YR6A 3ZYWA 4YXDA 4IVOB 3HZ8A 1AQWA 3RHAA 1YZXA 3DK4A 1A8YA 2Q0LA 4H4UA 2F5ZA 1C72A 1VG9A 3R2QA 5M10A 4MJCA 2REMA 2WB9A 3RAZA 3HA9A 3D0ZA 1TK0B 4ECIA 1PJ6A 5CREA 2LNTA 4MZWA 5B8BA 2CFYA 2P5RA 1VRSD 5DVBA 3GKNA 3ERGA 4Z44A 4LMWA 3M9KA 3TCOA 3RDWA 3T37A 3Q18A 4AT2A 2NPXA 3NTAA 2O85A 3G5SA 2J9HA 5LNKe 1GSNA 1DE1A 2M80A 4ILFA 2WULA 2EQ9A 2H74A 3NKSA 3ICSA 1B4VA 3DK9A 3FBSA 2VL9A 1A0RP 1SD8A 1GPEA 2K9FA 4NMUA 2CDUA 4DSQA 1YDKA 4OFNA 2WPFA 2WOVA 1H7XA 2VQBA 2GMHA 2NPBA 3L78A 1JZDA 1JZRA 1XW5A 4HS1A 1GRGA 1MXTA 2MMNA 3K7TA 2Z5XA 4HU9A 1WWJA 3VPQA 4L5OA 2C65A 1EL8A 1AOGA 3BD2A 2LKUA 4OPUA 1PJ5A 5GSNA 5BVAA 4F03A 3AYIA 5AIXA 3VPTA 5AGYA 3AE5A 2DJ3A 3US3A 3UKAA 4RUVA 1DOEA 2VVMA 5LD0A 1ZDLA 3CNSA 4MH3A 1N8JA 1IUWA 1QLBA 5IQ4A 1JRZA 1T3BA 3FKFA 4O5QA 3KKJA 4RQRA 3MWHA 1SL2B 3FYGA 2WFCA 3GWFA 4H7UA 5G5EA 1YKAA 2WU2A 1P2HA 3IAS2 3O76A 3GHAA 2FBWA 2YLSA 2CZ3A 4PNGA 4RG4A 4ZB6A 1Q9IA 3DYRA 3FIMB 1Z5YE 2VD1A 5FMHA 3VI7A 2A4VA 2PPTA 5EB4A 4A5LA 4I97A 2VCQA 3ZYXA 1TRWA 5AN1A 5D73A 1GNWA 3IC9A 4KA0A 2BXRA 1N2AA 5E4WA 4POBA 3QAGA 1BF3A 4YQUA 4DSSA 2B9WA 5D93A 5U1OA 3F8RA 2XVIA 2B9XA 1O8WA 2Y6RA 3LXZA 1GALA 2H01A 1XFLA 3AE8A 2E0QA 1OC9B 5J9BA 3H1NA 5CO3A 2DJ0A 3FR6A 1JEHA 4OPIA 3VURA 4YKFA 4N30A 5FS6A 2LJAA 2I9HA 4L0WA 3ITJA 4U8NA 2K8VA 4J36A 3MSZA 3C1SA 1EGRA 1S3CA 3LJRA 2CVDA 4USQA 3NYEA 3F3QA 3P7XA 2FJBA 1KTEA 1XDIA 5AISA 3QCPA 2GT5A 2RGHA 4I58A 2K8SA 5KVIA 2AHEA 2DKIA 4K5RA 4CY6A 5KVHA 4IP6A 2MZCA 1I9DA 4KX6A 1GNEA 3GKKA 1L9DA 4EMJA 1AQXA 4OPLA 5KWFA 1H7WA 3F4TA 4Z25A 2FJEA 3OZ2A 2XHFA 4PABA 2LRCA 3NK0X 4ML1A 4CRTA 3ME8A 1KEBA 2HT9A 1X9SB 2DC5A 1K0CA 2GQFA 4CNKA 5A4UA 1PL2A 2H0IA 1GSYA 3V3OA 4C5OA 4H4YA 4DGKA 4YSHA 1FCDA 3IV4A 3AWIA 3EWLA 2GVPA 3WD6A 4J57E 1N1PA 2NTOA 4ZCCA 1F8WA 3IK9A 4HJMA 1CJ3A 3SGLA 5HFIA 4H4XA 1B8XA 3NK2X 4AOXA 2VRLA 1ZOFA 4MJWA 1T00A 2YANA 3EF6A 3AE2A 2QAEA 3ALJA 4HQZA 1F9MA 1X5CA 1OJAA 3D8XA 3LQ7A 3HZLA 2A89A 5IM9A 4APNA 3LXDA 2BABA 2C76A 2VIMA 3TOTA 1Y56A 2GAHB 3GN3A 4JY2A 4GRFA 3OC4A 2OACA 4Z43A 2RABA 1NW2A 4YQVA 3P8WA 2FNOA 3C71A 3UKFA 1E6EA 1WE0A 1GH2A 2HRNA 2M72A 4FYBA 2JAEA 3CSHA 3IWAA 4G9HA 4ECHA 2L6CA 1FEAA 2YG4A 1K0LA 4Z26A 2B5EA 5BRTA 2H1BA 3DXBA 2EC4A 3IHMA 2TRXA 3MAKA 1A24A 4HOJA 1KNPA 2O9ZA 3CPIG 1FO5A 1X9WB 3PH9A 1ELIA 2AAWA 3GDPA 3UKQA 2ES7A 3NZNA 1JNZA 1ZGNA 1ZK7A 2NBSA 4I5QA 4IJ3A 2VD0A 3ZFLA 3TJGA 3HZ4A 1OAZA 4V1Ap 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 3IRA A;  1YQ4 A;  1Q1R A;  5EB5 A;  4V2M A;  1EGO A;  3CNP A;  2B3S A;  4TR1 B;  3AE1 A;  5GSS A;  1GET A;  4J2W A;  4J56 E;  3TRQ A;  4EKZ A;  2H1G A;  1FAA A;  1O81 A;  3F8D A;  4WET A;  4RG3 A;  1I5G A;  3LEF A;  4MF7 A;  1VF2 A;  3ME7 A;  2C0E A;  4Y4L A;  3KMN A;  5C00 A;  3B6D A;  4YWO A;  1TW9 A;  5HR0 A;  20GS A;  1EOH A;  1O5W A;  3W8S A;  1CQG A;  2PBJ A;  1NSW A;  3CGC A;  2VM2 A;  3PVC A;  3R3E A;  1Y56 B;  4Y4M A;  3R9U A;  2KHP A;  4BA7 A;  3BI4 A;  2X8H A;  1J9B A;  3HVX A;  3TJJ A;  5KMQ A;  1V59 A;  3T2K A;  3M1G A;  2OAM A;  3S61 A;  2OE0 A;  4G0K A;  1YY5 A;  3QPM A;  4USR A;  3KP8 A;  4G2E A;  3TKS A;  2X50 A;  3ZVJ A;  2A87 A;  4A7A A;  3GMF A;  4RI7 A;  2YM2 A;  4CCQ A;  3IAM 2;  1H84 A;  3I6D A;  2C0D A;  5ELA A;  2WPC A;  3P2A A;  5IMZ A;  4TN8 A;  1VG0 A;  1MTC A;  4IGJ A;  5DJM A;  2PER A;  1FB6 A;  4F0B A;  1GSE A;  4TM0 A;  3AE4 A;  3APS A;  2BJX A;  5FS8 A;  1TK5 B;  2R0P A;  2IMI A;  5FT3 A;  5F05 A;  1OJ9 A;  5IMC A;  2WET A;  3UTF A;  3GRX A;  1USB A;  2F51 A; 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