2X99A

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni in complex with nadph
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
587
structure length
587
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 191
structure length 587
sequence length 587
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x99A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x99A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x99A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x99A03
4KAEA 2ZCTA 1ERVA 3CMIA 2A89A 4NV5A 13GSA 2C72A 4J33A 4EQWA 2YG3A 1O73A 4CBQA 4MPGA 3NK0X 2XLRA 3H93A 2DKHA 4PABA 2WP9A 1TYPA 3ERWA 3GYKA 4J2FA 1ZMAA 3GUSA 1JOAA 1YQZA 2PVQA 2L6CA 1EOGA 5GSTA 1TP9A 1NHSA 3WGDA 3UOVA 1IUWA 1OC3A 11GSA 1S3EA 3NIVA 4BJYA 5F8BA 2E4GA 4GRTA 1USBA 1O5WA 4PUAA 3MDKA 4K22A 2WULA 3QVRA 4NTEA 3V3OA 3AE9A 5JCWA 3IDVA 3RP8A 2K6VA 4CDOA 1X0RA 5JCIA 4L8EA 1PRXA 4V1Ag 1O7UA 3DD3A 1GRBA 2YWLA 4H4UA 1VRQB 4U8NA 1ELIA 1THOA 3IRAA 3IA1A 4IQAA 1MO9A 1JZDA 4KSOA 3BHKA 2ACZA 2C0DA 5F06A 1SKWB 2YNXA 4LL4B 3WGXA 4E0VA 3ZLPA 4I97A 1RSGA 1FOHA 2J23A 1ERWA 2IMKA 3NKSA 3OC4A 4WF4A 4Q5QA 3GX0A 1O81A 2VCQA 3DXBA 4GF7A 5KOWA 3VRDB 5A5KA 1YQ1A 4ZL7A 1EZKA 2CT6A 3GH6A 4J2WA 2VRLA 4J31A 3K8NA 4B64A 4PQHA 4RG4A 4ISDA 3A5WA 3IAS2 3LORA 5GSSA 2VCTA 1KNPA 2LQQA 1OE8A 2H0IA 5GZZB 2FA4A 4B63A 1L9EA 1AQWA 1XWKA 4KH7A 4KE3A 1QMVA 4EMIA 2E7PA 2BYBA 3OZ2A 1FEBA 3AE2A 1V57A 1H7XA 4U8MA 3CPHG 1DE2A 5KN0A 1T8EB 2HYXA 1V2AA 4XRDA 3L0HA 1BJXA 1GP1A 3FZ5A 1VF1A 4IELA 1GNWA 5KN1A 4PNGA 4FIWA 4D03A 5DDLA 1ABAA 3UKAA 1S2QA 1Q98A 1YF0A 2L57A 1TK0B 1MDIA 1F37A 1AQVA 3WE0A 3GKXA 2OBIA 2QC7A 1B4VA 4NMUA 1GTHA 3CPJG 3KPFA 18GSA 4CCRA 2C76A 2APGA 1ST9A 1BF3A 5D9TA 1DSBA 1H83A 2XVFA 2R4VA 1M7TA 4XS4A 3K7QX 3F8PA 4MJBA 2V32A 2WETA 1M99A 4I8BA 3ALMA 4EQSA 2GQFA 2JKCA 3HJPA 4JN9A 1K0AA 5IMCA 5U25A 1W4XA 2LTKA 3LJRA 1BGJA 4OO5A 1F6MA 4TXOB 4HQSA 4B1BA 5CRGA 4EC0A 5HXIA 3ED3A 5DAKA 2XHFA 1QLBA 2DBCA 2GSQA 1CC6A 2ZZCA 1NG4A 2CVKA 2B6MA 4MZCA 1GETA 1U3AA 4X1UA 2XVJA 5IO2A 4FK1A 2JK6A 3C1SA 3EMXA 5ELGA 1GSSA 2YG5A 3KP8A 1LQUA 4JNQA 4U8OA 1B48A 3KD0A 4KX6A 3LYPA 2W0HA 5BRTA 3D1CA 1FW1A 3CXGA 4IVOB 2XVIA 2Q0LA 4XS1A 2L4CA 4Q5NA 1SENA 3GRSA 2H1DA 4MJAA 1H84A 3SQPA 3D8XA 2RGHA 2DJJA 2FY6A 4AOXA 3KLJA 4ZBAA 2AV4A 1SL2B 5INYA 5EY6A 4NWYA 3L8KA 4J56A 1S3DA 3A2XA 4ZB8A 2JZRA 2WS2A 3E1TA 1EWXA 3M9KA 1QQ2A 3FPZA 1DNCA 3K30A 3GSSA 2CX3A 3GDPA 3DKSA 4XXGA 3VWWA 4J57E 1XWBA 2BS3A 3VURA 2PVOC 5CKUA 4HI7A 3NOFA 2GRTA 3UJ1A 2WDQA 3HCZA 4IJ3A 1HYUA 3WGEA 2KOKA 4B67A 7GSSA 3ALJA 2K9FA 2BCPA 2BK3A 3UTFA 4CY8A 3HVVA 2YPMA 5KVHA 3GV1A 1T3BA 2F51A 3L9SA 4IGJA 6GSWA 2NTOA 2L4QA 3HZ4A 1YQ3A 1A2LA 3HA9A 1O6JA 2RM6A 2VQ7A 4N0ZA 2CFYA 3B6DA 4OPIA 3ZFBA 3GMCA 5IPGA 1GXFA 1CQHA 3QCPA 2C75A 2PERA 2DJ1A 2YWNA 3DJJA 1ZCPA 2H1AA 1TRUA 4WCTA 3U5RE 3BNUA 3BI4A 2R4JA 4B65A 2EQ8A 2KP2A 3FZAA 1TXXA 6GSXA 4YSXA 1LPFA 4AJ8A 1XIYA 1DJQA 3TJJA 1IUSA 3VI5A 5HR3A 5G2ZA 2DKIA 4IP1A 1ZX9A 3W8JA 4MH2A 5H5SA 1YF1A 2MYGA 3IV4A 1XFLA 1Y0PA 3AY8A 1F2EA 1EP7A 2HSYA 3ZZXA 2FWGA 2R4EA 5C3JA 5HQPA 2I4AA 4MK3A 2VQBA 1J08A 3R2QA 1WOUA 5IMVA 3M9JA 2MBSA 3H8QA 2LNSA 4TXVA 1THXA 4D73B 2H89A 2IMIA 2ZUPA 3NG7X 4LU6A 4TR1A 1PN9A 3GTUB 4BJZA 2DIZA 3NIXA 3UTGA 1W89A 3DYRA 4CCQA 2QGVA 4MA9A 1X31B 2VCZA 2C1YA 1FCDA 6GSUA 3AEBA 4OCEA 1GRFA 4I6XA 1K0IA 5IMFA 2VD0A 3TKSC 1NM3A 3F9UA 1YEXA 2R0PA 2F3MA 2K18A 5ID2A 3Q18A 4NHWA 5A4VA 2F8FA 1X9SB 3FR6A 3BCKA 5ABRA 4H4ZA 1ONFA 2O87A 4J56E 2H66A 2GR0A 2NVKX 1ZK7A 3OR5A 3CTYA 3VPTA 4H4XA 1K0CA 5DQYA 3I43A 4A6NA 4FX9A 5B7CA 2L6DA 2MMAA 1LU4A 1N1PA 4NZHA 2YOIA 4AP3A 3F6DA 1SD9A 4YTPA 3DVXA 4H86A 4MF5A 4OVIA 3J7Yk 4ZCCA 5C00A 3TJBA 1TKDB 2YG7A 1OKTA 1GLPA 2YAUA 1SKRB 4H2RA 4KDYA 1NHOA 4HZ4A 5KRQA 1L9CA 2J3NA 2YV9A 1PJ5A 3FR9A 1RP0A 4EKZA 3N5OA 2M80A 2B9WA 3Q74A 4EIQA 4TM0A 1GALA 3FHKA 1NHYA 3S61A 2CVBA 1KF6A 3CGEA 2XBQA 3F8DA 4ZBBA 1Z3EA 3HZLA 3IE3A 1PJ6A 3GYJA 2Y6RA 5EBKA 1FB0A 1A2MA 1WMJA 19GSA 2WGRA 4ML1A 2C66A 3ZIVA 3SFDA 4K2DA 4KPRA 1GSYA 1GSQA 3KP9A 1Y56B 5H5QA 3QFAC 3O0HA 3NYEA 3GSIA 3L78A 2GR1A 4HQZA 1MTCA 20GSA 1IYIA 1GRTA 2YJHA 4I5QA 1PXAA 2QAEA 2RABA 5GAND 2DC5A 2BC1A 2V3BA 4G2EA 4EM3A 2R45A 4A99A 5BULA 3D0ZA 2MZCA 4MZWA 5FMHA 1BKWA 1CBOA 2BK4A 1LJRA 1JNRA 2IVDA 2JB3A 2HNLA 2A8XA 2CQ9A 4B66A 3IHQA 3AB1A 1S3CA 2WPCA 4ECJA 4E8HA 2YM1A 3TKRA 3WT1A 4BWQA 3P2AA 4JRRA 5EB5A 1Q1RA 9GSSA 5IPYA 2FLSA 3IXRA 2Q7VA 3C73A 4X9MA 3EF6A 3UP4A 3AE4A 1O95A 4APNA 2BABA 2IPAA 1A8LA 2CAIA 2ES7A 3PO7A 4AT0A 4IKHA 3PS9A 4U8IA 4BK2A 1HQOA 4K8DA 3VWVA 4GSTA 1FEAA 4ADWA 4GQCA 2BA9A 3QMXA 1R5AA 1O85A 2ON5A 2I1UA 2R2JA 3G7YA 1VQWA 1NDAA 4N0VA 2AAQA 2KLXA 2H76A 2WOIA 2IL3A 4NEWA 3IBHA 1LBKA 3GD4A 1MEKA 1F8RA 1OKDA 4HDEA 1SK2A 4CRTA 3FKFA 1X5DA 2XVHA 1U87A 2CZ3A 1DODA 2GZYA 3DWVA 2OKAA 2GAGB 2PMTA 1GSNA 4EQXA 1KFYA 4H4QA 1QFNA 4LLRA 4H7UA 4HOJA 5IOXA 2YLTA 4NEVA 1K0MA 5CYYA 4C77A 3AE1A 2XLPA 1X5EA 2WRTA 3M13A 1V58A 4OMVA 4V2LA 4YAPA 3PGTA 2XPDA 1ZYQB 2WQYA 1B8XA 1K0DA 3B3RA 1D7YA 1K3LA 3IAM2 3LGCA 4CHSA 3VFIA 2ARDA 4U8KA 1A8YA 3VRBA 1PMTA 4ECCA 4EMJA 1CC4A 3TKQA 3KIJA 2C64A 3UOZA 4ECBA 2GQMA 1WPIA 2O8VB 2R5GA 2VZ2A 1P2EA 3RPNA 4OPGA 1SEZA 2GT5A 3RBTA 1XPVA 2GLRA 1QJDA 3HXSA 1GULA 2NBSA 3NN0X 1ZMDA 3L9UA 2AYTA 3UVHA 1XWCA 1M6IA 2HZEB 2VLTA 2XC2A 5DJLA 3UBKA 1VRSD 1AXDA 5LNKe 2LSTA 2A87A 4A7AA 3MSZA 1DOBA 1LVLA 2HQMA 2LRCA 3NTDA 3TOTA 2F8AA 3IC9A 3ZFLA 2CULA 4A65A 3GWDA 2YVFA 2OA7A 2V61A 1PN0A 3BNMA 4K2XA 2F9SA 4O92A 2LQOA 2WJUA 4IBPA 5JCKA 3C1RA 2GH5A 2N5AA 3HKRA 3VPQA 3TCOA 2GQLA 5E59A 2WOVA 4WKWA 1S3BA 4YSHA 4Z24A 4O5UA 1DE1A 4C5OA 5J7XA 4Z2RA 5D9VA 4H4RA 1VDCA 3K7MX 1Z7RA 1F3BA 2H6YA 5KOXA 4HUAA 4YSYA 2FJAA 3QR6A 3CBUA 1E7PA 2VOUA 3M8NA 2OE3A 4BVYA 2AB6A 1VGLA 2A4VA 1CJCA 1NG3A 4AT2A 1XVQA 1J9BA 2GZPA 3EU3A 1ON4A 2HT9A 3LG6A 2OALA 2A2RA 3ICSA 3GMBA 2X8GA 3S9FA 2OADA 1EL9A 4RI6A 2EIOA 2FHEA 5CRDA 3AXBA 4K5RA 4POKA 3DK4A 2YG4A 2YWMA 4V2NA 3DGZA 3ZITA 3TDGA 1EGRA 3C4NA 3II4A 4OFMA 4YKFA 5D8IA 4HEA2 4TLXA 3QJ4A 2M46A 3ZYWA 3NLCA 2H0HA 1OJTA 2X8CA 5AN1A 1I9DA 2H71A 1TI1A 2PBJA 3AD9B 3DRNA 1M2DA 4H4TA 1X9WB 1TU7A 4GSNA 2GMJA 4BPYA 1TRSA 3ZVJA 1G7EA 4OO4A 4PX1A 2GMHA 2GSSA 5DVBA 4ECHA 3AYJA 1LTXR 2WESA 4JE1A 3TOUA 1ZYEA 1U6TA 1B4QA 3MNGA 3GD3A 4DGKA 2GTUA 2YVGA 3BOAA 3Q19A 4IQ1A 3IF9A 4I59A 5ECRB 2C3NA 5J60A 2R3XA 2ZZBA 4UDPA 4G9HA 4PAAA 1AUCA 1F3AA 1M9AA 2YWOA 4J57A 5D9XA 5ECHB 4MCUA 3APQA 1EL8A 1REOA 2NPBA 1FHEA 2H8LA 1RW1A 3N9JA 4I2TA 1PDHA 5DCHA 3AE3A 3QSMA 2O85A 2FGXA 2WDUA 1K0BA 4GUVA 4BK1A 4FYBA 2JADA 4IA5A 2QA1A 2YJ7A 2BXRA 2JZSA 3H8LA 3H4KA 1NPXA 4OPUA 3KVEA 2TIRA 1F3PA 2CDUA 1GNEA 3TJGA 2LJAA 4P3YB 4DSSB 4BL7A 5C04A 1ZMCA 3UARA 1EV9A 3PH9A 2DMLA 5F07A 4ZB6A 3FZ4A 4EIPA 4PQ1A 2VM1A 1OJ9A 4G19A 3P4QA 4Z26A 1YZXA 4BK3A 2DMMA 3MAKA 3ZYXA 2YN1A 3DA1A 2V3AA 2G2QA 1OE7A 1Q9IA 1WRYA 2C4JA 2YANA 4IS0A 5A4WA 2JB1A 3UBLA 1XWGA 3GTUA 2C73A 1E1MA 3R9UA 2BJXA 3TRQA 3ISHA 4J34A 4PUFC 1ERUA 1T7PB 1S3AA 3C4AA 3CPIG 1G6WA 4XCSA 3AEEA 3G5SA 4H4PA 3TKPA 2JAEA 1BZLA 1GUHA 5CNWA 1FB6A 3QD9A 1GUMA 1ZOFA 1CJ4A 4LMVA 5EB4A 3IOSA 5FHIA 1GL8A 3CGDA 3LXZA 1PJ7A 3M3MA 1V40A 5JCGA 4GTUA 5IPHA 1JEHA 4OD7A 3Q6OA 2IN3A 3DVWA 2CVJA 1URMA 3SFEA 2EQ9A 2WU2A 1A0FA 3QAWA 1MDJA 3FW2A 2WZ9A 5JCUA 2JSYA 4QQ7A 2UZZA 3ZREA 4KA0A 5FS6A 1K0LA 3IHGA 1GSEA 1BAYA 3SGLA 2RUFA 5B6NA 1NAAA 3ADAB 1A2JA 4V1Ap 1ZL9A 3CTFA 1ZGNA 2YCDA 5KN2A 4WX1A 4GCMA 3KD9A 1W4VA 4MDCA 3AEGA 3CIRA 3GMFA 3UOXA 2N5BA 3UTHA 4ZBDA 2VL2A 2B3SA 5J3RA 5G31A 1DJNA 1D7LA 5DALA 3AE6A 2WDVA 4OPTA 3BI5A 3K7TA 1OC9B 2OLNA 1XOAA 1G0TA 5CRWA 3HYPA 2XFUA 5HHFA 2XFOA 3TRPA 2GSRA 2PYXA 2IMDA 4TKYA 3RP6A 2CA8A 3FMWA 5F05A 2J9HA 4FH8A 2BC0A 4JY2A 4ZIJA 4H50A 3CGBA 4ML6A 1PL1A 1WP0A 1DBYA 2QKEA 2RIIA 6GSYA 3LYKA 1F6MC 3WT2A 3ZL5A 4K5SA 6GSSA 3DMEA 1R4WA 2AUVA 2CX4A 2C0GA 1M2AA 5ELAA 1ZOYA 4AF2A 6GSVA 1GTEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4RQR A;  2L5L A;  1GT8 A;  2XLS A;  2IFQ B;  4KCE A;  2BCG G;  3A3T A;  5EL8 A;  3GH9 A;  1K4Q A;  3KGK A;  2N5F A;  3QAV A;  4ZL9 A;  3T2Z A;  3S5W A;  4JDR A;  3NH3 X;  3QFB C;  3EUR A;  4OFT A;  3VLN A;  1TRW A;  4GAV A;  1LV0 A;  5DBQ A;  2ZNM A;  4IVM B;  4CNJ A;  1T00 A;  5JCM A;  1OC9 A;  4XIH A;  3QOU A;  4MLY A;  4MJE A;  4UDQ A;  2VAF A;  1NHQ A;  2VCW A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 2QGV A;  4MA9 A;  1X31 B;  2VCZ A;  2C1Y A;  1FCD A;  6GSU A;  3AEB A;  4OCE A;  1GRF A;  4I6X A;  1K0I A;  5IMF A;  2VD0 A;  3TKS C;  1NM3 A;  3F9U A;  1YEX A;  3SZF A;  2R0P A;  2F3M A;  2K18 A;  5ID2 A;  3Q18 A;  4NHW A;  5A4V A;  2F8F A;  1X9S B;  3FR6 A;  3BCK A;  5ABR A;  4H4Z A;  1ONF A;  2O87 A;  4J56 E;  2H66 A;  2GR0 A;  2NVK X;  1ZK7 A;  3OR5 A;  3CTY A;  3VPT A;  4H4X A;  1K0C A;  5DQY A;  3I43 A;  4A6N A;  4FX9 A;  5B7C A;  2L6D A;  2MMA A;  1LU4 A;  1N1P A;  4NZH A;  2YOI A;  4AP3 A;  3F6D A;  1SD9 A;  4YTP A;  3DVX A;  4H86 A;  4MF5 A;  4OVI A;  3J7Y k;  4ZCC A;  5C00 A;  3TJB A;  1TKD B;  2YG7 A;  1OKT A;  1GLP A;  2YAU A;  1SKR B;  4H2R A;  4KDY A;  1NHO A;  4HZ4 A;  5KRQ A;  1L9C A;  2J3N A;  2YV9 A;  1PJ5 A;  3FR9 A;  1RP0 A;  4EKZ A;  3N5O A;  2M80 A;  2B9W A;  3Q74 A;  4EIQ A;  4TM0 A;  1GAL A;  3FHK A;  1NHY A;  3S61 A;  2CVB A;  1KF6 A;  3CGE A;  2XBQ A;  3F8D A;  4ZBB A;  1Z3E A;  3HZL A;  3IE3 A;  1PJ6 A;  3GYJ A;  2Y6R A;  5EBK A;  1FB0 A;  1A2M A;  1WMJ A;  19GS A; 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