2X99A

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni in complex with nadph
Total Genus 191

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
587
structure length
587
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPI
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 191
structure length 587
sequence length 587
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x99A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x99A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x99A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x99A03
4EMIA 2XFQA 1EL7A 3MSZA 1G7EA 2R6KA 4RQRA 3EMXA 3IC4A 5ECNB 3QJ4A 2OALA 3PVCA 2WOVA 3VPQA 1VG0A 3ICSA 5B6MA 4K7IA 1THOA 16GSA 4Q5RA 5DALA 5GSSA 3URHA 4J31A 1GREA 1TDNA 2A89A 4EMWA 3RPNA 4PQIA 3EAOA 1VF1A 2ARDA 2XLPA 4POKA 4DSQA 3HDCA 4AOSA 2NDOA 3M0FA 3UVTA 2B7KA 5BULA 4USRA 4BURA 2AUVA 2YR6A 4D73B 2I4AA 3FK8A 1Q1RA 1JNZA 4JR6A 1KNRA 2YG3A 1UC7A 5U1OA 2B5XA 4NEVA 1WE0A 5BRTA 1X9WB 1AUCA 2K8SA 2VLTA 4BL7A 3KP9A 3I6DA 2LS5A 2M72A 3KTLA 2YLTA 3KP8A 4WF5A 3KIJA 3HY2A 2DMLA 3TKSC 3FG2P 5DAKB 3AECA 4A65A 2V6OA 1G0TA 5DVBA 5HR0A 1B48A 4ICYA 1NEKA 1R7HA 2BTOT 2Q0LA 3H8IA 4GLTA 3I3LA 3DJJA 3KA7A 3L0HA 4F82A 1B4QA 4PAAA 3GNJA 3TOUA 1XVQA 3D4MA 2DC5A 1OJ9A 5ER0A 3RP7A 2VCQA 2H8LA 4ZL9A 1H81A 4A5LA 5D9XA 5IMZA 3TOTA 3L4NA 4OWYA 1PJ7A 3CXGA 4Z44A 3KPFA 1GRFA 4ZB8A 3IHGA 4K22A 1MOKA 4ULXA 2ES7A 3H4KA 4A79A 2GRTA 2FWGA 2H0IA 1D7YA 1XVWA 5IIZA 2GZZA 1B37A 4PX1A 5G1KA 3AE6A 1YKAA 2GR2A 3VPTA 3AE7A 5ENUA 3BI2A 3AYLA 2GV8A 4POMA 4YWOA 5HHFA 5KN1A 1JNRA 5BVAA 1IUXA 1GERA 5CQFA 4PUFC 1IUUA 3A5WA 1V59A 2YG5A 3D21A 4MPGA 2GMHA 2IN3A 3L8KA 2E2MA 4L0UA 4X9MA 3F3QA 3BJ5A 1U3AA 3FZ4A 2CDUA 5CRGA 5FS9A 1BZLA 1GSYA 2XVHA 1X9MB 2L59A 5KVIA 2GQWA 4PQ1A 2VCTA 4DVCA 1EGOA 4U8OA 1V40A 2DLXA 5DALB 3IAM2 4IJIA 4Z26A 4ML1A 1SL1B 4H4TA 2XFPA 2WP9A 4JEDA 3ZYXA 3FZAA 3RHAA 1EL5A 2KLXA 3DWVA 1GESA 2HXKA 4MDCA 3ZZXA 1B4VA 1XWGA 4G9HA 4U8IA 2DIYA 3IPZA 2K8VA 5IQ4A 2PPTA 5A4VA 2R4VA 5AISA 4FH8A 3LADA 4N0VA 2XPDA 4EL1A 1YQ3A 3UAPA 2XFOA 5M0ZA 2GH5A 2YWLA 4GSNA 3UKLA 5F8BA 1VRQB 2NVLA 4I8BA 4OFNA 3ERGA 3GL3A 4HA6A 2CX4A 2RM5A 3ATQA 3GKKA 4CCQA 5IO0A 3ICTA 2GQLA 2OACA 1XW6A 1H82A 3APQA 3DD3A 1JLVA 4K6XA 3AB1A 1ZCPA 4I97A 4BK3A 1L9DA 4BK2A 4MJBA 5AIXA 2VCXA 1Q1WA 1FB6A 3DVXA 4AT0A 3AE3A 1EBDA 2HSHA 1AOGA 3IRAA 4EC0A 5ID2A 4F0CA 4TKYA 5ECOB 1S3DA 1XPVA 4XS1A 3NLCA 4BK1A 4YAPA 3DGHA 4EO3A 1PBFA 4B69A 4X1UA 1A2MA 1ZK7A 2O8VB 2JB3A 4GCMA 2L4CA 5FMHA 3GV1A 2RABA 2VCWA 1TXXA 4J2FA 2B6MA 2XLUA 1SL2B 3S5WA 2R3XA 2GB0A 4NZHA 2IIDA 2HRNA 1MDKA 1RYIA 3L1RA 2ZBWA 1ZYQB 2AV4A 5B8BA 3EMPA 2CFYA 1EV9A 4F9ZA 3O76A 2A2SA 1FEAA 3H1NA 1PQNA 3WT2A 3II4A 1F2EA 3ISHA 2PWJA 2PMTA 3HZ8A 2B1KA 3C4NA 4TLXA 3IC9A 2K6VA 1OKTA 5D9WA 4V2LA 2LJAA 1Z7RA 3AE1A 1LVLA 1SL0B 2AQJA 1XBSA 1RK4A 2XHFA 3SGLA 3ZMKA 1YEXA 1A0RP 3M9KA 4TM3A 4AJ6A 3LEFA 5IO2A 2AB6A 3G7YA 1Z9HA 1REOA 3GRSA 2OLNA 2FD3A 3ZVJA 4K0GA 1ZYEA 1K0AA 1CJCA 1PRXA 5IQYA 1E1MA 1M64A 4BA7A 3WGDA 5FT3A 4EIPA 1GRBA 4H2PA 4J2WA 1X5CA 2NPXA 2R0CA 2A4VA 3TCOA 1OAZA 5ECKB 1LQTA 5TR3A 4MCUA 4GR1A 3LQ7A 2YWNA 3AEEA 1ERTA 2XC2A 4GSTA 2VOCA 2YM2A 5FS8A 3CMIA 3US3A 4H4ZA 2ZZ0A 2Q6UA 4Y4MA 1GSNA 3UKFA 4B68A 1WOUA 3GHAA 1G6YA 1GSSA 1XOAA 1OKDA 3KLJA 4K2DA 4I58A 4WEYA 3FY7A 2HQMA 1R4WA 1CHUA 3UKPA 2Q0KA 3GKXA 3GH6A 4B1BA 3UJ1A 5CAXA 4X4JA 2Z9SA 4V2NA 3L78A 4IP6A 1N4UA 1TYTA 3KD0A 2XPEA 4GXZA 1FHEA 3Q18A 1GPEA 3H8QA 2AYTA 1O5WA 2YR4A 3HJPA 2C76A 4XS4B 3IWAA 5C3JA 1RQMA 3QSEA 4O5QA 4OMVA 4KX4A 1LV0A 4J36A 3LORA 3KEBA 3VI5A 2YQUA 3G5QA 1GSUA 1B8XA 1T8EB 3W8JA 5KEJA 4OPCA 3EPTA 3OZ2A 2IFQA 1EWXA 1GNWA 1NG3A 4HZ4A 1XHCA 3KCMA 3LWAA 2HZFA 1PSQA 3LYKA 3CSIA 1MDIA 1JLWA 2DJ3A 17GSA 5EB5A 1XW9A 3IV4A 4EDYA 3GH9A 4K2XA 3TGZA 4IVMB 3QAVA 3EC3A 5F05A 3GYIA 1SJIA 4BJZA 3M12A 3PS9A 1R5PA 1M99A 3RP8A 3SWLA 1CJ3A 2JB1A 5L46A 3DH9A 1ERWA 2C4JA 4Z7XA 1M0UA 4E8EA 5ECQB 1W4XA 4N30A 1QQ2A 5IQ1A 3IA1A 4IA6A 3P9UA 2H1DA 5KN0A 3NN6X 4U2TA 1YKCA 1DJQA 4BJYA 1D4CA 1SYXA 4U2SA 4AF2A 2O85A 3BI5A 2WS2A 3CN8A 3ZMLA 5G31A 2YWOA 4LL1B 1F8SA 1PMTA 3VI7A 3DMEA 4AOXA 2I1UA 2E2GA 3GL5A 1ZZYA 4K7ZA 3ISOA 4MPFA 2FJEA 2DJKA 2G2QA 3V3NA 1QGVA 1OC9A 2OBKA 1XZOA 1T4ZA 1RSGA 1X5EA 4Q5FA 1T4YA 1IUVA 3AD9B 1Y56B 4C77A 4TW5A 1TDOA 3GWDA 1COYA 2BYBA 4AJ8A 4IA5A 5ABRA 2BCGG 2H30A 4H4PA 1QLBA 4ZCCA 2X8GA 3O3TA 1D5TA 2BK4A 2TPRA 2IMKA 3KGKA 3DMLA 2K9FA 1GALA 1AAZA 1VF2A 4X9NA 1K0BA 4TRXA 2ZNMA 2GGTA 1XW5A 2GQMA 5JWRB 2K18A 4L5OA 1CC2A 5G1LA 1IUWA 2VUPA 1LBKA 4NMUA 3C7MA 3UOZA 3UCLA 5GRTA 4E8HA 5HFKA 2FWHA 3SFEA 1OVNA 2QCUA 4H2QA 3GTUA 1S3BA 3ZIVA 3DKSA 4BVYA 2Z5YA 4B65A 1GH2A 4IV9A 19GSA 3DRNA 2ACZA 1QK8A 3C71A 1JZDA 5LCZA 1TK8B 3DYRA 4B63A 3DK8A 1SD8A 2N5BA 3HVXA 3KM6A 1QJDA 3MDKA 1PX7A 3ALLA 2OLOA 1JZRA 4GF0A 5G30A 4WETA 1GLPA 3HD5A 2H70A 4HOJA 1BGNA 2QGVA 1QFNA 3NYEA 4PURA 1DOCA 3QVPA 5G5EA 4JNQA 3IF9A 3CPHG 3LXTA 3AWIA 2XLRA 4EF0A 3IOSA 3DGZA 1CC6A 2BJXA 5HFIA 5ECSA 4ZB6A 4A7AA 4LL4B 5LD0A 3NTAA 3DK9A 1Q4JA 4GRFA 2GVPA 3Q6JA 2B7RA 4ZILA 2WHDA 2IWTA 4CY6A 3LZXA 3BCKA 5DBJA 3GMCA 1W89A 2JB2A 1AW9A 4LMWA 5CREA 4ML6A 1KFYA 5EOWA 1Q98A 1Y0PA 3ZYWA 4I6XA 3FHKA 1A24A 4KW6A 3V3OA 2OJLA 4N11A 4YH2A 3UVHA 2H19A 3GRXA 2CVBA 3VWXA 5COHA 2IIYA 3TRQA 4FK1A 1D4DA 4YKGA 1K0MA 1PGTA 4RUVA 4H4QA 2VLVA 1NSWA 3P4PA 3BNUA 3F63A 1YF1A 2GEWA 4IELA 2UZZA 2H6ZA 2TRCP 3RNMA 3HZLA 1GOSA 2CVKA 3R9UA 4D04A 1MD3A 2H66A 2IMDA 2LNTA 3F4SA 2RIIA 3ALJA 2LRNA 3CBUA 3LSZA 1H4OA 3GDPA 2C3CA 1JZWA 1FOVA 3CYNA 2LEGA 4YSZA 1PD21 1DJNA 5HYMA 2H6XA 6GSWA 5IMCA 4DSGA 1MTCA 3QMXA 5B6NA 3F4TA 2C72A 5M10A 2DBCA 2X64A 1E6BA 4C5OA 2FLSA 1GRXA 2GTUA 3ZLPA 4YTMA 1GULA 3BHKA 1JFUA 1XDIA 1ZOFA 4O5UA 2YG7A 3UKKA 3UTGA 3V76A 4UDRA 4NAXA 3H8LA 1LJ1A 2JAEA 1XANA 3F8DA 3EVIA 2VCZA 3TJGA 1OC8A 4O7HA 4FO5A 2YLZA 4JE1A 1LJRA 3DEXA 2B5YA 1OE8A 3TRXA 2TMDA 4LA1A 1M9AA 1JEHA 2BK5A 5AN1A 2YPMA 4U2LA 4KNDA 5IPGA 3SFDA 3CTFA 2WDVA 3ERWA 5KOWA 1JRYA 5FHIA 2YAUA 2GF3A 2R46A 5A5KA 2APGA 2VL9A 5AGYA 4OO5A 2BS2A 2RGOA 2HYXA 3GSTA 1PBBA 1IUTA 1PN0A 4TM4A 2V61A 3M13A 4G2EA 1X9SB 2EIQA 1MEKA 1T1VA 2V1MA 1AC1A 3IHQA 1PL2A 2CAIA 2VLUA 5DJLA 1SEZA 5ECIB 1YF0A 4EM3A 1EP8A 1TDFA 4Z24A 2KP1A 4PNGA 4NXIA 4OPUA 3D22A 2A2RA 4K7NA 2WEUA 3Q19A 3EINA 3FRCA 1FOHA 2P5RA 2PVQA 2B76A 4EM4A 2XDOA 3VWUA 4JBBA 4YQUA 2VL2C 2NPBA 4GF7A 4N10A 1GTHA 3NIXA 1VGLA 2WB9A 2A8XA 1J08A 3DA1A 20GSA 3UTFA 1EZKA 2I3YA 5KRQA 3ME8A 11GSA 4POBA 1NPXA 2RUEA 3K30A 4DSHA 2IPAA 1O94A 4PXOA 2L6DA 1A2JA 2C3DA 1PJ6A 4ISDA 1PKZA 1NDAA 3VRDB 5HQPA 4MZBA 3VURA 4TXVA 1NHYA 3NK1X 1K0LA 1WJKA 1H7XA 3BBYA 4MK3A 3TB2A 5ECRB 1LQUA 1F8WA 2GSQA 4RI6A 1XPQA 1GV4A 3CGDA 2L6CA 4XWZA 1GXFA 1BWCA 2ZZCA 3A3TA 4E0VA 3GWFA 3I6AA 1WRYA 2BXSA 1N4VA 4WBRD 3JCML 1X31B 4MH2A 4KX6A 1K0JA 3UL3A 1EOHA 5D9VA 2GSRA 2V3BA 4YXDA 3KH7A 4RI7A 4PQHA 1TRWA 2XLSA 2C0DA 2GR3A 1XWCA 3Q6OA 1AQXA 4IVFA 2ZUPA 2BK3A 4HEA2 4KH7A 2XVJA 2V32A 2J23A 2WCIA 22GSA 1B5QA 4NTCA 2CV4A 1T3BA 4L5LA 1EL9A 3SQPA 1BAYA 1V57A 2VRLA 2L5LA 2XFNA 3QVRA 3UKHA 2C66A 3QFAA 4GSSA 5AIVA 2GQKA 1FVKA 4GRTA 2MMZA 3ICRA 3NN0X 4QQ7A 2FY6A 4I2TA 2AHEA 1E6EA 4YQVA 1EL8A 3KU9A 3M3MA 3CRTA 2DSAA 5E59A 2XVEA 4GDPA 4ZIJA 4OFMA 5IPHA 1B9XC 1GP1A 4KB3A 3CNSA 2E4GA 1ZX9A 4U8LA 4OO4A 2YVJA 5C00A 1DBYA 2KOKA 4RG3A 3ZFBA 1SKWB 2BC0A 2OA1A 3P2AA 2WQYA 3M8NA 1BYEA 5JCIA 1QXHA 1XFLA 1Z6NA 1ELIA 2VO4A 1GTUA 3ED3A 1O8WA 5J3RA 2H75A 4MF7A 4V1Ag 5J41A 2V41A 2O7KA 3CPIG 1CQHA 3LG6A 1WP0A 1M9BA 5GAPD 4TR1A 4KE3A 4WCTA 5J9CA 4JNAA 2E5VA 4D03A 1V98A 1N8JA 4U8PA 4EQSA 3UBLA 1X5DA 3ZIJA 4F03A 4TM0A 1NHRA 2JZSA 3UOMA 3NH3X 2XVIA 5JWOB 4K8DA 5KVHA 1F6MA 2P5QA 1S3EA 2C75A 3TJFA 3NRNA 1HNCA 1SU9A 5HR1A 2FWFA 3A2VA 3PINA 5DBQA 2VRMA 1ONFA 1UVZA 1ILOA 1THXA 1T7PB 3NYCA 3QR6A 5KN3A 1E1LA 3S9FA 2X50A 1GUMA 4KDXA 4YQMA 2VZ2A 3IHMA 1Q9IA 2VVMA 3T37A 3IK9A 3NYFA 4IP1A 3NK0X 2C0GA 3D4TA 1DOBA 4X0XA 5KOXA 2LSTA 4O5RA 2H1BA 2OBIA 2C1YA 4ILFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4MZC A;  3EE2 A;  1M2B A;  1RP0 A;  1JPM A;  9GSS A;  1GEU A;  3NZG A;  3ZDN A;  1NEN A;  4E5T A;  1BED A;  3NHO X;  5BMU A;  2VD1 A;  3NT6 A;  4WF4 A;  4L0W A;  3QPM A;  4Q5Q A;  1NHO A;  3GKM A;  4LII A;  2CQ9 A;  2DJJ A;  4NHZ A;  1F8R A;  4MZW A;  3CSH A;  4IJ3 A;  1KCZ A;  2QJM A;  1OC3 A;  1IJH A;  1SB3 B;  1SK0 A;  2PTW A;  4PUA A;  2P88 A;  1A8Y A;  4OPD A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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