2X8GA

Oxidized thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 193
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8gA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8gA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA03
2V61A 4X1UA 2KUCA 1RSGA 4LU6A 5ABRA 4BVYA 5J4UA 4XWRA 2WOWA 3E0UA 3N9JA 1M64A 1GWCA 2PVOC 1GP1A 4M52A 5IPGA 4D73B 3B6DA 2GLRA 3GYJA 1F37A 2PERA 4MF5A 5JWRB 2LSTA 4NEVA 1PKWA 4K0NA 5U1OA 4L8EA 5HR1A 3US3A 1IUSA 3UP5A 3IXRA 5TR3A 4OFMA 3ZIJA 4CW9A 4E8HA 2NPXA 1S3CA 2GT6A 4WF5A 3KXOA 1LU4A 1OJCA 4O5UA 3H8IA 1F3PA 3QAGA 4OO5A 2EQ9A 2GT5A 1K0BA 1PMTA 4V2NA 4WKWA 1QMVA 3AD9B 4EQSA 1MTCA 3UTGA 3CGCA 1FB0A 2H6ZA 1GALA 2F5ZA 1GSEA 4U8MA 3IPZA 4TXOA 3RHBA 1NG4A 4Y4LA 2TRXA 4OPLA 4OFNA 1SKWB 3FZ9A 4JQ9A 2YVJA 1R7HA 3KTLA 2M80A 3FR6A 5FWGA 2GSQA 2RUEA 3GYKA 17GSA 3D0ZA 2MZCA 2BACA 1PHHA 4HJ2A 3M1GA 6GSSA 1S2QA 2GF3A 1HYUA 1K0MA 3D6IA 2XVIA 2HZEB 4Q5QA 2TRCP 2VD1A 2LV3A 4E0VA 2GR2A 2GRTA 2YWIA 3C96A 3SM8A 1ILOA 2BC1A 3V3NA 4Y4MA 1ERVA 3G7JA 3CMIA 1GLPA 5KN2A 3NKSA 3TJBA 5DALB 1A0RP 1B9XC 3EURA 3MDKA 3CRTA 4ZL9A 3BI5A 4L0UA 1TTZA 5IO0A 5J41A 3W6GA 4ADWA 3KKJA 2LRNA 2GQLA 11GSA 2B7KA 2CFYA 3TB2A 3NOFA 2YVGA 4P9SA 7GSSA 3UTEA 2H1AA 4WF4A 3TOUA 4OWYA 3GMCA 1WJKA 5IPHA 2FJBA 1EOHA 3AEGA 3BI2A 3TKSE 4EDZA 3DA1A 3ZZXA 4MJCA 2FUG2 3TRPA 3VPTA 2RGJA 12GSA 4H4SA 3QFAC 1EL5A 2VZ2A 1PA3A 4K8DA 4ZCDA 2HZEA 1GETA 3HA9A 4CRTA 2YOIA 2YV9A 1F8WA 1RK4A 1AOGA 1J08A 4GQFA 4KA0A 2D2ZA 4YQVA 3AE2A 2YLRA 2L6CA 3ZFBA 2AYTA 1ML6A 2E1MA 4HEA2 3FW2A 4QQ7A 2YWMA 4RI6A 4IA5A 3ATQA 4YT0A 1EV4A 5DALA 5JCMA 2C76A 2XDOA 2MMNA 2C73A 3BCKA 4A65A 3FR3A 1PSQA 3TUEA 4NV2A 1XHCA 2MBTA 1PS9A 2FA8A 2XFNA 2L4CA 4LL4B 1SEZA 1BZLA 1PBBA 4Y4NA 3QVRA 2YZHA 3F6FA 3F4TA 3ZRDA 4K6XA 2RM6A 5AISA 4J56E 1AC1A 1EV9A 1DOBA 2NTOA 4IW9A 3DGHA 2XYOA 5DJLA 2GGTA 2O7KA 2VCZA 4XS1A 3WYWA 2OKAA 4ZXGA 3PS9A 2GAHB 2R4JA 5EB4A 4LMWA 3GDNA 1JZWA 1CC4A 4CCRA 2K8SA 2IMKA 4H2PA 3FHKA 2VM1A 3FMWA 1EBDA 1FOHA 4KE3A 3NHOX 4NWYA 5IMVA 4EQWA 2VM2A 3HJOA 4J57E 4KCEA 1RP0A 1TK0B 1O5WA 2CV4A 2O8VB 2KP1A 4ICYA 2B1LA 1OYJA 1REOA 6GSVA 1OC3A 3FBSA 3IAS2 5U25A 2YLZA 5G1LA 1KDGA 1TK8B 1H86A 4OPGA 2JKCA 2YG5A 4MMMA 4IP1A 5F07A 5CAXA 5AGYA 1WE0A 1VQWA 2CVJA 1U87A 2FGXA 3S61A 14GSA 3UKLA 2YLSA 1KNPA 4JY3A 5IOWA 4ECIA 5LCZA 3UL3A 4REKA 3P1WA 3GX0A 2FCHA 1UVZA 5IIZA 4DVCA 1GRGA 2L6DA 3EF6A 3L0HA 4IV9A 1CL0A 3ITJA 1T4YA 2I9HA 2HSYA 22GSA 2C1YA 2WGRA 2XFUA 4TW5A 1RW1A 1BQ7A 20GSA 2REMA 2VL3A 3II4A 1GUHA 3AD8B 1QK8A 2H71A 1ZGNA 4AF2A 2CA8A 2W0HA 1IUXA 4YAPA 1Q9IA 2KLXA 4MJBA 1SKSB 4G2EA 4NAXA 3WGEA 4B66A 4KDXA 5ECIB 2IMEA 1T8EB 2BK5A 3UARA 4GXZA 5ECMB 4NEWA 3UOZA 1SK0A 2XBQA 3CTFA 3O6TA 2QA1A 4IN0A 1FL2A 2B9XA 3UOVA 1GTAA 4OPUA 4USRA 2FD3A 2J9HA 1GNDA 1CC6A 1A24A 3TJGA 1GEUA 5GSNA 2YWNA 4RUVA 1TDKA 1QUWA 2L59A 4J36A 2B5XA 2RM5A 3LB8A 2WDUA 1QJDA 4N9XA 1FHEA 5C00A 4FIWA 5J60A 5ECHB 1M99A 2ZUPA 1JLVA 3D4TA 3P90A 3RAZA 4ML6A 4OCEA 1YY5A 2Q0LA 1THOA 2J3NA 5HXIA 5IMAA 1PQNA 3CPHG 1EL7A 4KW6A 2HYXA 2B5EA 4IGJA 3AE5A 4XXGA 4U8OA 4NPBA 3AEBA 2I4AA 3CTGA 5DDLA 3ZDNA 4PNFA 5DBJA 4F82A 4K7NA 2L4QA 3VI5A 4F9ZA 2GDRA 3GSIA 4A7AA 3GKNA 3IK7A 4K22A 2WHDA 3LOVA 3DGZA 3OC4A 1Z3EA 1O94A 3LSZA 2GVCA 1K0CA 2V5ZA 3DK9A 4EC0A 3UJ1A 2DMMA 3FYGA 3TKRA 1BGJA 5A4WA 2A89A 3ISOA 3WT1A 3HXSA 4D03A 1MO9A 1D4DA 4RG3A 3T37A 3BJ5A 1A8YA 3TKSC 2CVBA 2Z5YA 4KX4A 1CQHA 2LS5A 4ECJA 1YZXA 4H4WA 3GURA 4YWOA 3GRSA 2QGVA 1TK5B 3Q74A 3GH9A 4TM1A 5M10A 4KUNA 2H6YA 3ZFLA 2KP2A 4B69A 2LUSA 1V59A 2B6MA 1Q1WA 1TU7A 4DSQA 1PXCA 5IM9A 1GT8A 1KNRA 3AYLA 2LKUA 1H83A 1Y6EA 5GSTA 3IOSA 5DBQA 3NYCA 1CJ2A 1MOKA 3KEBA 1TW9A 3VFIA 1F6MC 2VCWA 1UA5A 2FWEA 1AXDA 4ZBAA 1FO5A 3GKXA 3PR8A 3LXZA 3QCPA 2VVMA 1BF3A 3D5JA 2O85A 3I9V2 3R2QA 2HRFA 1DOEA 2H66A 1NDAA 3KLJA 2BMXA 2VLVA 2F9SA 3CPIG 2WP9A 4G10A 4OPTA 3Q6OA 3SGLA 5JCKA 2JB2A 2JZSA 5EBKA 2DC5A 3DJEA 3DXBA 2VVLG 4H4ZA 2HNLA 5IQYA 4ML1A 1FOVA 2Q6UA 1GTBA 2H6XA 3LZXA 2PBJA 1OJAA 2OLOA 4ACSA 1TRWA 5D9TA 2BS2A 1ZY8A 2WB9A 3M9JA 1KSUA 2H75A 3P4SA 1ON4A 1ZYEA 1CQGA 2C64A 4AP3A 3AE6A 2ARDA 1TXXA 2GS3A 4QL9A 2R5GA 2GR0A 4C77A 4Z26A 4C3YA 2R6KA 4PQ1A 1LTXR 3S9FA 2C4JA 1OE7A 1GESA 4GRFA 3AY8A 1GRAA 3IC9A 2J23A 2C67A 2VRMA 1G6WA 2G0FA 4O92A 3TJFA 2ES7A 4GF7A 2K6VA 2NDOA 3CGEA 5IMFA 3GWFA 19GSA 3MAKA 4YTMA 3LJPA 2XVHA 3F4RA 1GLQA 3GH6A 2HXKA 4OCGA 1T7PB 2WEUA 2YJ7A 3UVTA 4RI7A 1K3YA 4U8NA 3KPFA 6GSXA 2GEWA 1LJ1A 4J33A 4FYBA 2YLTA 4POLA 3UBKA 4MJAA 1NEKA 5EL8A 5LV9A 3TJJA 2X8GA 2Y6RA 2IJYA 4L0WA 2XLTA 4LLRA 3F3QA 2HQMA 5EOWA 1CF3A 2K18A 1DE1A 1S3BA 2C3DA 3NN0X 3VI7A 1U3IA 16GSA 1TRBA 2YR5A 1BKWA 4Z44A 3TRXA 1FCDA 1K0IA 2DJJA 2FLSA 3UKAA 1JLWA 3L8KA 4XS4A 3AEDA 3HHVA 3H4KA 3CGBA 3ME7A 1X31B 1XBSA 1AQVA 4PNGA 2XLUA 4JN9A 4A6NB 1L9DA 1V9WA 3F8PA 5L46A 4IVMB 1SJIA 2Q7VA 3C4AA 3G7IA 1A23A 4DSRA 1MDJA 5ECRB 3NYEA 4GCMA 3QMXA 4LIIA 5HR3A 4CHSA 2FA4A 1UKVG 2YWLA 3GSSA 4JU5A 4N0ZA 4JRRA 1JZOA 1M9AA 1JEHA 2BYBA 4G9HA 2BC0A 3KM6A 4GSTA 4PGTA 2OADA 2WOVA 2PU9C 4YAVA 4B63A 3FPZA 3L78A 4TM4A 2H89A 1BYEA 3VRBA 5FHIA 3M0OA 3MSZA 4G19A 1GRTA 2CX3A 3GDPA 2PN8A 3I6DA 1PXAA 3U6VA 4A5LA 3GKMA 2PYXA 2JL4A 2B7SA 5KVIA 3CPJG 3GKKA 1YQZA 3LJRA 4MLYA 2WOIA 1GRBA 3RP6A 3GX8A 4POKA 1NM3A 4ZBDA 2QC7A 4U8JA 3QVPA 4B64A 5ELAA 4CNJA 2PUKC 4GR1A 1E6BA 1VF3A 2BCGG 5G2ZA 1WPIA 4JR6A 2YM2A 3WE0A 1KNGA 3KP8A 2R4VA 3DD3A 5H5RA 2NVKX 1LQTA 4HDEA 5ER0A 4APNA 4U8PA 4BVXA 3A2WA 3GRTA 1SENA 1VDCA 4FDCB 4A6NA 1M2AA 1Z7PA 5F0GA 3CTYA 4KX6A 4OPDA 2EC4A 2A2RA 2V6KA 1E7PA 1JRZA 1TI1A 4Q5NA 4K9ZA 3AE4A 1ERTA 3AWIA 3SFEA 1WIKA 3D22A 5EB5A 1ZMCA 3VRDB 2GB0A 2DJKA 3H8QA 2R46A 1ZCPA 2C72A 3K30A 1Z6LA 3SFDA 2M46A 1OC9B 3QDNA 3RBTA 1R26A 4DSGA 4YSXA 3LYPA 3DKSA 3BHFA 3BHKA 5J7XA 4ZL8A 1LPFA 1SK2A 1AIUA 5J5NA 5DQSA 3CNSA 2N5BA 2YANA 3AE9A 4NXIA 2BS4A 3NG7X 3DMEA 4FK1A 2JBVA 1QGVA 2B5YA 5KN1A 2MMOA 1DSBA 1PDHA 3GMFA 3IHQA 4H4YA 13GSA 3I43A 4Z25A 2OLNA 4J2FA 2PWJA 4LA1A 1N8JA 1B9YC 3HCZA 4I6XA 4H2RA 1V58A 1CJCA 3UOXA 3SBCA 4MPFA 3APQA 2Z5XA 5EVOA 4IJIA 2A8XA 4XRAA 3ED3A 2I81A 4TLZA 4I2TA 4H2QA 4EQXA 2VCTA 3QOUA 4LL1B 1V57A 2PVQA 2NBSA 4WXTA 2R0PA 1J0FA 2YM1A 3PVCA 3V3OA 3IDVA 5EY6A 2BA9A 3KP9A 1DOCA 2C66A 3ZYWA 1K3OA 2YG3A 1NHYA 3DJGX 2YG4A 3L4NA 3UTHA 1WWJA 3G7YA 3EYTA 2XPDA 1YQ1A 3NK2X 2H8LA 5D9XA 1D4EA 2LQOA 3M8NA 1OC9A 18GSA 2JZRA 1EP8A 1XXUA 3VWWA 1XCCA 4POBA 4GWRA 3NTDA 1VF2A 2C0FA 3C4NA 1Y0PA 3CSJA 4FYCA 2YQUA 3EU4A 3ZMKA 2C0GA 4NTCA 3EVIA 2LJKA 4HA6A 3L9UA 2GH5A 1IYIA 2JSYA 3CXGA 2VUPA 3RPPA 3JSKA 1Q98A 1O7UA 1XWCA 1VRSD 1S3EA 5IO2A 1ZL9A 2C75A 1H82A 1GNWA 1I9DA 2R9ZA 2WU5A 1BX9A 4NTEA 2VIMA 5CO3A 2GAGB 1YKJA 4A79A 3AYJA 3HYPA 2JAEA 3ICSA 1RYIA 1M7TA 1FW1A 2BXSA 2A87A 1EEMA 4MF6A 2BK3A 3C73A 3FRCA 1QFNA 2HRNA 1JRXA 3AEFA 3K7MX 1M2BA 2CVDA 1O6JA 1L9CA 2R0GA 1DJQA 1EL9A 3HZ4A 1AW9A 2YV7A 5CRHA 4IS0A 5HFKA 4B68A 2EQ6A 4JDRA 1SL1B 3ICRA 2CAQA 4MJWA 2YVFA 3FZ5A 3GWDA 1PXBA 2H1BA 3NN6X 1Y56B 1FEBA 2VCQA 2GTUA 3NNEA 2E7PA 2V60A 4ZN0A 1ST9A 2FWHA 3CSIA 3CSHA 1PGTA 2ON7A 1JZDA 4YQMA 4UDQA 5C3JA 1X5DA 2EIOA 4EDYA 3UAPA 3QAVA 4AGSA 2GVPA 2C70A 2BXRA 4JZQA 3EANA 3C71A 1EEJA 1YEXA 3RHCA 2H0HA 4F03A 3H8LA 4FH8A 5J9CA 4GSNA 3S5WA 2R2JA 1MXTA 5KOWA 2O9ZA 2IMFA 4MA9A 2R45A 3P8WA 1MD3A 1OJTA 2X8CA 5COHA 2K9FA 1YJ6A 1ZZYA 2O87A 4HU9A 3AEEA 1E1NA 3WD6A 3QD9A 3ZMLA 4B65A 4TR0A 4J34A 3EU3A 4XHMA 2H1DA 4DGKA 3GNJA 1IYHA 1TKDB 2RGHA 1W89A 5BRTA 4MK3A 1K0NA 1LBKA 3GYIA 4JBBA 1Y56A 9GSSA 4ZB8A 4AT0A 2B9YA 3QFBA 5ELGA 3LXTA 3REDA 1GOSA 2JB3A 5G5FA 1Q4JA 1Q1RA 4V2MA 3NLCA 2YJHA 3BBYA 4YSYA 5KXJA 2GZPA 1TRSA 3PH9A 4TVEA 3N5OA 2V3BA 5IQ1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1THX A;  3PG6 A;  2LNS A;  1Z6N A;  5KWF A;  4DNA A;  1K4Q A;  2FYM A;  3VCC A;  1ELI A;  4IA6 A;  1SYX A;  4DSS B;  1GRX A;  4EM4 A;  3HZ8 A;  3CNP A;  3WGX A;  4MCU A;  4YSZ A;  2BS3 A;  5ECS A;  4H4P A;  1CJ3 A;  2VL2 C;  2H0G A;  3EAO A;  5EU9 A;  3FEU A;  2OQY A;  3VFC A;  3CBU A;  3HVV A;  3LG6 A;  3VR9 A;  4ULX A;  3LFL A;  1TRV A;  2VQ7 A;  1R4W A;  5BVA A;  1NEN A;  1B4Q A;  4AJ7 A;  1B8X A;  3UKK A;  1SD8 A;  4C74 A;  2MMZ A;  2DJ3 A;  4BVY B;  2RAB A;  3AYI A;  1L8P A;  4UDR A;  3A7U A;  3I6E A;  4I8B A;  4HB9 A;  3RIT A;  2PMT A;  1QLB A;  3VQR A;  3VWU A;  4XS6 A;  5L71 A;  3PWG A;  3TDG A;  2AJQ B;  5CNW A;  3UBL A;  4GIR A;  2I1U A;  4HN8 A;  4XTS A;  1F3A A;  4AOX A;  1F9M A;  4EMI A;  1M6I A;  2X3N A;  2H1G A;  1TE6 A;  3UOM A;  1XG8 A;  1EC8 A;  3DK8 A;  4K0G A;  3ZVJ D;  1CBO A;  1BKH A;  2E2G A;  1YDK A;  5CKU A;  1ZX9 A;  3M9K A;  3R10 A;  4OO4 A;  2L5L A;  1GXF A;  1NHR A;  2F51 A;  2YZU A;  4NHW A;  2C7G A;  5KN3 A;  4B1B A;  2IPA A;  2HFD A;  2PTZ A;  1S3D A;  3VRA A;  2GQK A;  2WPE A;  4LMV A;  2PU1 A;  2XVJ A;  5HFI A;  3H8A A;  1WUE A;  1XVQ A;  3QR6 A;  4BK3 A;  3W8S A;  3CRU A;  4DSS A;  2HSH A;  2B9W A;  3SZW A;  1TZZ A;  1N4U A;  4WCT A;  1Z6M A;  4EO3 A;  3SQP A;  5JCU A;  3C8E A;  2IID A;  3V1W A;  3TCO A;  1EGO A;  3EIN A;  5GAP D;  4TXO B;  4WEY A;  1E1M A;  4H4V A;  2FJE A;  4F0B A;  4GGH A;  3H1N A;  1LJR A;  4GME A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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