3H4KA

Crystal structure of the wild type thioredoxin glutatione reductase from schistosoma mansoni in complex with auranofin
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of Schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase by auranofin: structural and kinetic aspects.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 174
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2009-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 3h4kA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3h4kA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA03
1ONFA 2EIRA 2YM1A 4OO4A 4V1Ag 5LCZA 2YG5A 2KOKA 3GNJA 4V2LA 2GZYA 4AF2A 4N9XA 2A8XA 1W89A 3BNUA 4XXGA 1X5DA 1GETA 3E1TA 1X5EA 1UA5A 5ID2A 1PBEA 4A9WA 4G2EA 5U63A 5ID2B 2WESA 3GKKA 3F8UA 1GRFA 1XXUA 2DJ3A 1NHYA 1VDCA 2Z9SA 4KX6A 3VWUA 2IN3A 1ZOFA 4ZCCA 4H2NA 1PL1A 4ML6A 1O5WA 1Z9HA 1PA3A 4ZIJA 1G6YA 4A7AA 3GSSA 4L5OA 2BC0A 3UKKA 4KUNA 4IP1A 1TRWA 4RI7A 2F8AA 1NHQA 2YAUA 1J0FA 2C3DA 1JHBA 3ADAB 4X4JA 1N1PA 2C64A 4NV2A 3ZMKA 4AP3A 2YANA 2WP6A 5FHIA 3TB2A 4I59A 5DALA 2W0HA 2J23A 5DALB 2XFNA 3DWVA 3VI7A 2YZUA 3TGZA 5CRWA 3G9BA 3M0FA 2LQQA 2YWIA 1RW1A 3L9UA 5G31A 3AEGA 1UN2A 1QLBA 4YSHA 2IFQA 4PNGA 3NYFA 4PABA 5IIZA 2GR0A 3DYRA 3WT1A 3VWWA 3ISHA 1QQ2A 2OACA 4KB3A 1NDAA 1XWBA 5CQFA 3SM8A 2Z5XA 4ULXA 4TM0A 4CRTA 1O8XA 4U8OA 2VCVA 3AYJA 2C73A 2QA2A 5KWFA 1D4DA 2H76A 3UEMA 3F8DA 3A3TA 1NENA 5A4WA 1QFNA 3GMFA 1GSFA 3REDA 5LV9A 5IOWA 1O94A 3A2VA 4K7OA 4K7IA 5DCGA 3UKAA 1NHPA 3IE3A 5ECNB 2H1AA 2GR1A 5KN2A 4MJAA 1IUXA 1BGJA 3GTUA 5ELGA 3HVVA 3VRDB 2O8VB 4QL7A 1SEZA 3HYPA 5FMHA 1G6WA 2FHEA 3CSJA 1QXHA 4POBA 1COYA 2C67A 4EC0A 2WULA 1RYIA 1BYEA 5IO2A 2E2MA 1FB0A 4CNKA 3IPZA 1TK5B 2JADA 1F6MA 2XVIA 2NDOA 5ECLB 2H8LA 4RSLA 3PS9A 1GP1A 1CJ4A 2C80A 5DJLA 4H4RA 3LORA 3HKRA 2R45A 2R4VA 1ZL9A 3LYPA 2RLIA 1FL2A 2ARDA 1EV9A 2ZNMA 4OD7A 3GURA 3HJMA 1TDKA 2VD1A 4EIQA 4NWYA 3ZRDA 2YWMA 3DGHA 1YEXA 1E6EA 3EINA 1F3BA 2ZCTA 1XIYA 4YKGA 3M1GA 4I2TA 4H4SA 2HT9A 3FEUA 3HJOA 1Z7PA 3KZQA 3IF9A 1K4QA 1IJHA 4IVFA 4EMIA 3NK0X 3ZIVA 1BJXA 3FY7A 3ATRA 1QO8A 3P4QA 5BULA 1SU9A 4LU6A 4FDCB 5D73A 1YZXA 2FGXA 3GH6A 3CGDA 3HHVA 4XS6A 3NHOX 3NYCA 2LS5A 3UVTA 3WT2A 1Y6EA 4FH8A 1U6TA 2XVEA 4HDEA 3PR8A 5BVAA 4TR1A 3KPFA 2XHFA 1V40A 5ECKB 4TR1B 3KJYA 1PS9A 1NEKA 1FECA 1URMA 1GEUA 3UOVA 4MF6A 3C1SA 3RBTA 1DOEA 1KTEA 3FZ5A 4K6XA 2C3CA 3IV4A 2GVCA 3DJGX 1WPIA 1GNWA 2GLRA 1ZYQB 1TTZA 5FS8A 1BG5A 3CPIG 4AT2A 2P5RA 4IVOB 2A2RA 8GSSA 3GKNA 3QFAC 4YWOA 3LQ7A 3RHBA 4CY8A 5EL8A 3IC9A 3UBKA 2C3NA 4B65A 1D7LA 4USRA 3FZ4A 3M9JA 1ZY8A 1HNBA 3TKQA 2N5BA 1QJDA 3AE6A 3M8NA 2HZEA 3IRAA 5HFKA 3I3LA 2HZEB 3CGCA 3LJRA 1DE1A 1OC8A 4YSYA 3LYKA 1GTEA 1P2HA 3QFBA 5ABRA 2XBQA 3KH7A 4XTSA 2GQLA 1RP0A 3GN3A 2H1BA 4ML1A 4TXOA 3QVRA 4TXOB 4HJ2A 1SYXA 3ATQA 4YQVA 3AE8A 4JDRA 4OVIA 3IR4A 4IHUA 4YQUA 4I97A 4Z24A 4AOSA 2DIYA 1AIUA 1VF4A 2GSRA 1XVQA 4XS1A 1WP0A 1GTAA 1M99A 4GSTA 3P4RA 2YWNA 2WFCA 4LL4B 2N5FA 4J57E 5AIVA 2B3SA 1Z6LA 1RQMA 4H50A 3K7TA 4L0WA 4U2TA 1Q1RA 1S2QA 4U2LA 4K7NA 3EU3A 3NG7X 1ZCPA 4EQXA 1JU2A 1V98A 3CRTA 4ACSA 1YKCA 1UVZA 1EEJA 4PUFC 2TMDA 3BD2A 1CC2A 2ZZCA 3LZXA 2X64A 1SKRB 3H8QA 3L8KA 4FIWA 2GAHB 1FVKA 2R46A 2I3YA 3S5WA 2G2QA 1Q4JA 3HZ8A 4ECIA 2PYXA 2WHDA 4JU5A 4OCGA 3LSZA 2H71A 1FHEA 1DBYA 1E1NA 4GTUA 1H7WA 3IDVA 3BI4A 2VAFA 1VF3A 2HSHA 3DVWA 2MMAA 2L4CA 4CNJA 5HR0A 2VIMA 4O7HA 5IMDA 3I6DA 2XLSA 5G5EA 2C66A 4H86A 2ES7A 3PINA 3WGXA 4YQMA 1M9AA 1ZK7A 1SD8A 3DMLA 1CJ3A 2EQ6A 3D22A 1K0AA 4WKWA 2PPTA 3SFEA 3ZTLA 20GSA 3GL3A 4X43A 2GQKA 3ZZXA 5E4WA 1GV4A 3KIJA 5JCUA 2PVOC 3DXBA 1CBOA 2RUEA 2LRNA 3GFKA 4PURA 1AOGA 4F03A 4KDXA 2GR3A 1CQHA 1DE2A 4MF7A 3CNPA 5C2TA 5DBQA 4K5RA 4Z2TA 3NT6A 4MMMA 3AYLA 3F4SA 5H5SA 3VI5A 1JRYA 2YZHA 2VM1A 1M2AA 1MOKA 2GT5A 5GAPD 2C4JA 2YV7A 3HZ4A 2DBCA 1U3AA 4GLTA 4H4QA 3D6IA 5GSTA 1YQ3A 1ERVA 3AE5A 1GWCA 3IA1A 1V59A 2MBTA 4REKA 1B48A 3KMNA 3VK9A 2LJKA 1GPEA 3NYEA 4OWYA 5FS9A 1ZP0A 4IA6A 3NGCX 3HJPA 2VD0A 1NPXA 1IUUA 4A65A 3ZMLA 3D0ZA 1ZGNA 4AGSA 2Q7VA 5L71A 4OPDA 2V41A 2GDRA 3QJ4A 3MNGA 1EP7A 3R9UA 2JSYA 2XPDA 1J08A 2B5EA 1K0IA 5EB5A 1P2EA 4MJWA 4TM1A 3Q9TA 1N4WA 2X8GA 4XWZA 5U25A 2AAQA 3TKSE 1K0LA 3DIEA 2LQOA 4YT0A 2CT6A 2QSIA 3KXOA 2BK5A 2RABA 2XLPA 2VCZA 2AJQB 3GL5A 4JE1A 3UKPA 1H83A 5KOWA 2F3MA 2VLVA 1C72A 2V6KA 3M3MA 2C3TA 4I2UA 2LNSA 2VQBA 2IMIA 1Y56A 3CNSA 3FBSA 1M9BA 1X9WB 1Y56B 4ZBAA 5DQSA 1VG0A 5JCLA 2WJUA 1GREA 2VL9A 3H4KA 1LPFA 3ERFA 1ACVA 1N8JA 2FNOA 4MCUA 5J7XA 4H4WA 4B69A 2R9ZA 1KEBA 5HFGA 4IVMB 2KHPA 4K8DA 2VCTA 3LEFA 5EY6A 2OADA 2B7SA 2IL3A 3VR8A 4XIHA 4DSHA 3ICSA 2O87A 1SKWB 2GSSA 2OLNA 1YF0A 1ERUA 2JBVA 3QVPA 3D1CA 1NG4A 1VRQB 4OO5A 5DAKA 4N11A 5ECSA 3ZDNA 4B67A 4HA6A 5DAKB 5EB4A 1PBBA 5DQYA 3FR9A 3A2XA 2GSQA 3IC4A 2PBJA 5G5FA 3CNTA 3KCMA 1O6JA 4H7UA 3OZ2A 4B63A 3F0IA 2H0IA 3Q74A 3RNMA 2C75A 1T8EB 3NNEA 3BNMA 2XBIA 5U1OA 2BK3A 4EDZA 3AYIA 4KDYA 3ZL5A 5CRDA 4POMA 3NOFA 3CBUA 1VF1A 3IAM2 3V1WA 3S9FA 3KP8A 2V3BA 1I5GA 3ZYWA 4BPYA 1PL2A 4CDOA 1GERA 4LMWA 1JNZA 2F9SA 3FPZA 4BJZA 2WDQA 1DJNA 1EL8A 5D9XA 3ZREA 1PBFA 4UDQA 4UP3A 3U5RE 4RG3A 5ER0A 6GSUA 2TRCP 1DOCA 1FOHA 1YY7A 2REMA 1ON4A 2JSZA 3C4AA 4G10A 4TR4A 3VWVA 3KD9A 4O32A 1D7YA 2AR8A 1KBNA 1Z6MA 2E7PA 4ZB6A 1LQUA 5IMVA 4H4XA 1PJ7A 3CTGA 3P7XA 1PBCA 4BVYA 1CHUA 4FO5A 1H6VA 2LNTA 3D4TA 3FZ9A 3EF6A 1DODA 4NTDA 3EE2A 2VCWA 3IK7A 2NBSA 2WRTA 4ZL8A 4D73A 2ZBWA 1SENA 2E2GA 4H2QA 3L4NA 1F3PA 3F8PA 1Y25A 5AN1A 4WX1A 1T4YA 1O8WA 3ICRA 2DSAA 2Y6QA 6GSVA 2VL2C 4MF5A 4H4ZA 2B7KA 3UP5A 2NPBA 1TKDB 1YEPA 2JL4A 2A4VA 3CTYA 1SL2B 1GTBA 1EL7A 2EQ7A 1THOA 1EEMA 1A2MA 4K5SA 2R3XA 3SGLA 5KOXA 5HR3A 2C0GA 2QAEA 5D96A 4J2FA 3L1RA 4ZBBA 1M0UA 4BWSA 4N10A 5J9BA 1DXLA 2AHEA 1XW9A 3BI5A 1KSSA 2FBWA 2NPXA 1G7OA 4GXZA 4IW9A 1TXXA 1FCDA 2H75A 3ERGA 2K18A 5JCMA 2WP9A 3ZIJA 2YQUA 2QA1A 2XLUA 1E6BA 3IOSA 3Q19A 1K0JA 1CC4A 3NK2X 4NXIA 2DMMA 5FS7A 4TN8A 1OKTA 4GQCA 3BJ5A 3K7QX 3TJJA 4GR1A 1WWJA 2YV9A 2WZ9A 3II4A 2R0GA 2IMFA 2CVJA 1XOBA 9GSSA 3GIXA 2H1DA 1QK8A 3ZVJA 2YG3A 2WPFA 2AQJA 1VRSD 1R5AA 2HLSA 1SD9A 3UIWA 2B1LA 5IMCA 1OC3A 2IFQB 3AE2A 1U87A 2H74A 1SJIA 14GSA 3KGKA 1DNCA 3P9UA 4IP6A 3I69A 1H82A 4X9NA 3CSHA 3NTDA 3CGBA 4EDYA 5B8BA 2E1MA 3UOYA 3MAKA 4BK2A 2R2JA 3UOZA 4L8EA 3US3A 4HOJA 5HXIA 3F3QA 3TKPA 3RPNA 3V3OA 2B7JA 4MZCA 4BJYA 5JCKA 2K9FA 5IPGA 4Y4LA 4K22A 1PJ6A 2EQ8A 2CVDA 2KP2A 2YVGA 1FB6A 3GTUB 3QSEA 2HQMA 2HNLA 3S61A 4DSRA 3ZLPA 1XBSA 4JR6A 2HZFA 1NG3A 2V1MA 3NIVA 17GSA 1TI3A 1OC9A 4LL1B 5IMZA 1ZDLA 3ZITA 3NKSA 2VLUA 1TDFA 2YWLA 3UCLA 5DJMA 2GF3A 3TKSC 3ITJA 2CV4A 3URHA 3DMEA 3QCPA 2WU5A 3NK1X 4YSZA 2LRTA 4MH2A 1VQWA 2DJ0A 3RHAA 1AQWA 2GQMA 3HDCA 3W6GA 3P1WA 2C72A 3F3RA 3ZYXA 3DK9A 3VPTA 3ICTA 1S3AA 3KMOA 4ILFA 3MSZA 4DNAA 2EC4A 1HD2A 1GSSA 3IK9A 1Z6NA 3HZLA 2MMOA 4U8JA 3GWFA 2X8CA 4J56A 3CN8A 3SBCA 1GALA 1GL8A 3HVSA 4UDPA 1LV0A 2DKHA 3BHFA 2BK4A 1MDJA 1NHSA 2OA1A 1WOUA 1T3BA 3JCML 2RM6A 4ZL9A 1IUTA 3UTFA 1OJDA 4C3YA 2P31A 1ERTA 4PGTA 5IM9A 1PXCA 5A4VA 3ME7A 4E0VA 1N4VA 1G0TA 2X3NA 4H2RA 4FK1C 2ZZ0A 4ZB9A 1FOVA 1LU4A 2K8SA 3DEXA 4EIPA 2OJLA 3BHKA 1LTXR 4ZB8A 3AD7B 3FK8A 3AEAA 3NTAA 2CQ9A 22GSA 4B66A 3LXZA 2DKIA 2GSTA 1ZZYA 3FKFA 3LADA 3APQA 3IHGA 1N2AA 2H72A 1FG4A 4RQXA 5GSSA 1W4XA 2VVLA 3AE7A 4OPGA 4XRDA 2JZRA 2BCGG 2YM2A 4F82A 3P4PA 4ZCDA 2V60A 1PD21 3CRUA 6GSWA 1PRXA 3RP8A 4RG4A 2B1KA 2JB1A 5IMFA 2ALBA 1SKSB 2VRMA 4V2MA 4O5UA 5KXJA 1T4ZA 2OA7A 2BC1A 4QQ7A 2G0FA 3C73A 3VRAA 4K7ZA 4F0CA 3GMBA 4TRXA 1EOGA 3M12A 1OE8A 2PHHA 3O0HA 1E2YA 2LEGA 5KRQA 4OPCA 2XVHA 2YNXA 1X9SB 2FUG2 4MLYA 1BZLA 5CRGA 3JSKA 4Z2RA 3GV1A 3KU9A 1ZOYA 1D4EA 4E8EA 1L9CA 4POKA 2XVJA 5M10A 1AC1A 1H75A 2B6MA 4NPBA 1EGRA 3QAWA 2OALA 4GCIA 4GRTA 3QSSA 2R4JA 1TDIA 4FX9A 4ID0A 3CPJG 1NM3A 2GGTA 2XC2A 2WOWA 1ZYEA 1XFLA 1AQVA 4BWQA 4PNFA 2C76A 2EIQA 1F2EA 4POLA 3N5OA 3NN0X 4OCFA 1YY5A 4D04A 2IVEA 5C3JA 3PH9A 4IGJA 2H6XA 4B68A 3UMAA 4GCMA 2CZ3A 2GS3A 3GDNA 3ED3A 3WYWA 1FAAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1SK2 A;  2JZS A;  5HQP A;  5IPH A;  1Z3E A;  4JED A;  2YJH A;  1L0V A;  2HSY A;  4NAX A;  5FS6 A;  4A5L A;  3RAZ A;  3UTH A;  4ICY A;  2MNR A;  1QGV A;  1T00 A;  4H4V A;  2LST A;  3DA1 A;  4KDU A;  3TJ4 A;  3GRX A;  4OMV A;  2FY6 A;  3IXR A;  3APS A;  1ZMA A;  2A87 A;  2DJ2 A;  4ISD A;  3C71 A;  2WP5 A;  3PO7 A;  1KDG A;  3QPE A;  2CX3 A;  4DN1 A;  4USQ A;  5C00 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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