3H4KA

Crystal structure of the wild type thioredoxin glutatione reductase from schistosoma mansoni in complex with auranofin
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Inhibition of Schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase by auranofin: structural and kinetic aspects.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
total genus 174
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2009-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 3h4kA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3h4kA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA03
2PVOC 2YV7A 3M8NA 2H1DA 5IQYA 5LV9A 3GFKA 4D73A 4EUYA 3DA1A 3BI4A 3DGHA 1SYXA 2DMMA 3TKSE 1SD9A 3LG6A 2I81A 1ZYEA 2YN1A 1K0LA 1CC4A 5EY6A 5IIZA 4IN0A 4GF7A 3ZMLA 2EIOA 1I9DA 3F63A 1GSNA 5DJLA 5LD0A 3VURA 1F8WA 5J41A 4RSLA 1MO9A 1GLPA 1B37A 4XWRA 2OE0A 4CHSA 4TM4A 1DODA 5D9TA 2V3BA 4FYUA 1A2MA 3LSZA 3NTAA 1THXA 2V1MA 1S3CA 1TI1A 1OE7A 4UDRA 2HQMA 2KUCA 4RG4A 3NOFA 3KGKA 2LQOA 2VM2A 2C3TA 3A2VA 1DJNA 3I43A 3KEBA 2B5EA 2RLIA 3DK4A 3M12A 2GZYA 3UBLA 2BC0A 4GRFA 3MWHA 1H7WA 3EVIA 4CBQA 1PD21 4IS0A 3ALJA 4MJWA 1FEAA 4NHWA 4ZB9A 2CAIA 4HU7A 4ISDA 4FO5A 1J0FA 5E4WA 2XLUA 2BCGG 3V3NA 1GUHA 2C65A 3DWVA 4X9NA 1GP1A 2HZFA 3EINA 1T1VA 2PU9C 1F3PA 1SKWB 1TYPA 5DBQA 1AQXA 3GD3A 2GR2A 2BA9A 4WETA 4GTUA 4FH8A 4POBA 4OWYA 3AE6A 3PH9A 1JU2A 4MJEA 1OC9A 1ELIA 2K8VA 3QAGA 11GSA 1JFUA 1O95A 2ALBA 4EMWA 2C75A 4YT0A 5AIVA 4F2IA 1V9WA 3G5SA 1JRZA 4WR5A 3AECA 1O94A 5D9WA 2X8HA 3ATRA 2NTOA 4K1FA 3H1NA 4K22A 1BG5A 4GDEA 1GESA 2H75A 4YQMA 2TRXA 1X9SB 1Z6NA 3M9KA 2H74A 3P4SA 3KLJA 4O5QA 2YR4A 5CP1A 2BYBA 2XCGA 1PDHA 3ZVJD 17GSA 2A87A 4WR4A 3ZDNA 1J9BA 1OYJA 5JCMA 2R3XA 3REDA 1Y25A 5LNKe 2VIMA 1CC2A 2R9ZA 2XPDA 1D4DA 2QA2A 4BK2A 1ZY8A 3SGLA 1H83A 4PABA 2OADA 2CVBA 3VI7A 1IUWA 2PMTA 1X0RA 6GSUA 1YKAA 1PA3A 3P7XA 1CJ3A 2R4VA 3GKXA 2GAGB 3FMWA 4OCFA 2BTOT 2LV3A 4NTEA 3CTFA 4KNDA 2XLPA 1E7PA 5IMZA 3RNMA 2HRNA 4MZBA 1N8JA 1BZLA 4JU5A 1PMTA 1I5GA 4APNA 1PBBA 5AISA 2C70A 4OPDA 1TRWA 4NV5A 5D96A 1QQ2A 2C0DA 4B69A 4CCRA 4TR3A 10GSA 1O73A 2B7JA 5AN1A 2JSYA 3O0HA 4CNJA 1ML6A 1Z5YE 1A23A 4ZCDA 4HI7A 5FS9A 3ZMKA 3IXRA 2MYGA 3EMPA 3GH9A 1M64A 1NAAA 4IVMB 2DJ3A 3C71A 1H84A 1M2DA 4ZBAA 1A8YA 4LU6A 4BA7A 4CCQA 4KAEA 3GL3A 5ECKB 1LQUA 3KA7A 4U8OA 1NG4A 1ZOVA 1JRYA 2FLSA 1SL0B 2YVFA 2GGTA 1RSGA 3P4QA 4KDUA 4F03A 1Q1WA 5U1OA 2CX4A 1L9EA 5HXIA 5F0GA 1K0DA 2OACA 4O7HA 4MJAA 2VLTA 3ITJA 2DJ2A 3VRAA 5HQPA 3VFIA 1QO8A 1GSEA 1TYTA 2F8AA 4RI7A 2FWGA 3H93A 2Q0KA 1OJTA 4ZB6A 5H5QA 3SBCA 1YQ3A 1XDIA 3G5QA 4IA5A 2BCPA 2RUFA 2L5OA 3O3TA 2PBJA 1KDGA 3HCZA 1H86A 3FZAA 3APSA 4XHMA 3DJEA 3RP8A 2HXKA 4TXOB 4KPRA 1V98A 3MSZA 3V1WA 2V5ZA 5EB5A 2DJ0A 12GSA 3CXGA 1TK5B 2BC1A 4TR0A 1GH2A 2CT6A 4EDZA 5KN2A 1OAZA 1QXHA 3ME7A 5F8BA 4YSYA 2JB1A 2ZZCA 3APOA 1LV0A 1XHCA 2YLXA 3UKPA 3CPIG 2JK6A 4LL1B 4TM0A 3DIEA 1FEBA 3VR8A 1O8XA 4TOPA 2NPBA 2IWTA 3ZZXA 3FG2P 3ERGA 2VLVA 3GMCA 3UVTA 3EU3A 2Y6RA 3H8QA 1VRSD 4ZL7A 3QSMA 3H79A 5D8IA 4J57E 5KXJA 3BBYA 1O6JA 3GD4A 2GQMA 4H2PA 3SM8A 3D22A 4EIQA 2ZCTA 5J3RA 2FA4A 1ZK7A 4A79A 3WGDA 2YOIA 3F3QA 1GERA 4I8BA 5A4UA 1GSYA 3K7QX 4X9MA 3E9JB 5D93A 4I6XA 4I59A 3ZVJA 1EEMA 3QVPA 2B7KA 1WE0A 5CKUA 3RHAA 3CTYA 3VK9A 2DJ1A 2IN3A 2YG4A 2CVKA 3UBKA 2IMIA 3KCMA 6GSXA 4Q5QA 2YWOA 4HJ2A 1L9DA 4MZCA 1VF3A 1OVNA 2KP1A 3ZFLA 1XWCA 3G5RA 3IWAA 2RGHA 1PJ5A 3G7YA 4JRRA 1TDNA 3D21A 4H4PA 5ECLB 1OJAA 3NIXA 1DE2A 1D7YA 4NPBA 3DJGX 4ZL9A 4TXVA 3NT6A 4MJCA 1W4XA 3D1CA 5D9XA 5G1LA 5GSSA 3AEAA 1HD2A 3A2WA 3RHCA 2E1MA 2ZUPA 2MBSA 2P5RA 2WEUA 1F9MA 1DOBA 4TVEA 3NKSA 2C72A 1T4YA 3EYTA 2L4CA 2V2GA 3IAS2 2JZSA 3UARA 4ZIJA 2VCVA 3DGQA 2O89A 3TCOA 2X64A 1N4UA 1AQWA 1GXFA 2H72A 2GQLA 3NN6X 3KJYA 4YSHA 4XIHA 2RM5A 1JEHA 3KD0A 1FHEA 3G7JA 4TXOA 4L5LA 4M52A 4J56E 2Q6UA 3PS9A 3TKRA 1MXTA 3LYPA 5J9CA 3L1RA 1V40A 2XFPA 1Y56B 1FB6A 2JADA 1OC8A 3CPJG 2V3AA 3GRTA 3UL3A 4JR4A 2YM2A 4GXZA 4HJMA 5ID2B 3ICSA 3II4A 2HZEB 3ICRA 4K6XA 3O76A 1QLBA 3FRCA 1IJHA 3LJPA 4YAVA 3GX0A 3Q74A 3FKFA 1PHHA 1G0TA 2QAEA 1TDKA 2GQKA 4X43A 4HB9A 1XVWA 3LEFA 2BS4A 2WPEA 2H66A 2H1GA 3FHKA 1AQVA 1E1LA 4D04A 3IA1A 2ZZ0A 7GSSA 4H4WA 3BNMA 6GSTA 1SL2B 1BGJA 2PPTA 2BACA 2YLWA 2WDQA 1M9BA 4XRAA 3AB1A 3LB8A 2FUG2 3DRNA 4AT0A 2R4JA 4BJZA 3M13A 2H1AA 3ZYXA 1LJ1A 5CYYA 2GS3A 4G10A 3LWAA 3ALLA 1ZL9A 2YG7A 5CO3A 4HEA2 5IMAA 4OFNA 4ICYA 3MAKA 4LMVA 2OJLA 4NXIA 1UA5A 1WOUA 4XS1A 4N0VA 4HU9A 2AV4A 3P90A 3HVXA 2H6ZA 3IC4A 4E8HA 5CNWA 4A6NB 1DNCA 3IPZA 2H88A 3O6TA 2YWMA 2B5YA 1H7XA 2YPMA 3DK9A 1KF6A 4GQCA 3K8NA 2RUEA 1BAYA 4ACSA 4N30A 2YG5A 4GDPA 2YJ7A 4XS4B 3LZXA 1VF2A 2I4AA 4EMJA 2C0GA 1GEUA 3HD5A 2BABA 4HS1A 3IHGA 4K8DA 3TOUA 3QAWA 4DEJA 3ERWA 2LQQA 4MA9A 1R5PA 1FAAA 4XCSA 3RPPA 5KWFA 4H4XA 3TRPA 5B7CA 3NZNA 3HYPA 4DSHA 2LSTA 4YTMA 2XDOA 3BD2A 4H4UA 1AC1A 3ME8A 2R37A 4AOXA 1V59A 2XLTA 3EE2A 5ECQB 3S9FA 1Y56A 4AJ8A 1TRSA 2VLUA 1IYIA 4IVOB 2VUPA 3W8SA 5ID2A 2MMZA 2YR5A 4WEYA 2PN8A 2VOCA 4ECJA 3CGCA 1XXUA 4LIIA 4O32A 1F3AA 2WB9A 3FEUA 2XFOA 5DCHA 2VRMA 1VDCA 1YJ6A 2IVEA 3KPFA 2PWJA 1CBOA 2YQUA 1D4EA 2GSRA 5J4UA 2PUKC 3QFBC 5FWGA 2GH5A 3GV1A 2WU5A 3UKHA 5EL8A 1M99A 3NYCA 4AP1A 2HSHA 5EOWA 3MDKA 4LMWA 1K0AA 3F4RA 2TMDA 1UKVG 2YM1A 4IGJA 4EM4A 2L6DA 1ABAA 2WDVA 4GSTA 1BX9A 3BCKA 3KVEA 3Q6OA 1SJIA 1NENA 4Q5FA 3WT2A 5DBJA 3HKRA 3HJPA 3KMNA 4ZBDA 4QL7A 1TTZA 3IV4A 2DIYA 4H4YA 1PN9A 1GNDA 4Q5RA 1THOA 4U8IA 1A0FA 2B7RA 2A8XA 2H19A 1P2EA 3AE8A 3LJRA 5ECMB 2NVLA 3DJDA 1WPIA 2VL2A 2VL2C 3AEGA 1ERVA 4B63A 5D73A 4V1Ag 4A6NA 8GSSA 4WKWA 4JEDA 5AIXA 4PQ1A 1UVZA 3PINA 4JDRA 3KZQA 3TKPA 3TKSC 1PBEA 1BWCA 4OPGA 4Z44A 2OAMA 3CNTA 1ZDLA 2AQJA 5FS6A 2V60A 4XS4A 1J08A 3LADA 3H8IA 1D5TA 3KM6A 3COXA 4Z25A 4H4ZA 4K5SA 1XWAA 3M9JA 3DMLA 1GRFA 4B1BA 5U25A 3NHOX 5KN3A 2YV9A 4H4RA 3CNDA 2V6KA 3JSKA 2GF3A 3RHBA 2MBTA 3GH6A 3ZLPA 2K9FA 3GDPA 2WP6A 4H4SA 3UIWA 1EGRA 4H2RA 1IUTA 2WS3A 4U8NA 2OLOA 1DJQA 5IQ1A 2FY6A 2X99A 2XFNA 1P2HA 4LA1A 3D4TA 1G6WA 5DJMA 2ARDA 1JOAA 4NZHA 4ZBBA 4DGKA 2JZRA 1VF1A 4GQFA 3OC4A 1X9MB 2HNLA 1K3YA 2K8SA 5IM9A 4OCEA 4KDXA 1CJCA 2BK5A 1LBKA 3K7TA 2WBAA 2YG3A 3QFAC 5BRTA 3UTEA 2RGOA 1GSDA 2JU5A 2WFCA 4MDCA 4YSZA 3IHMA 4FYCA 2F3MA 1PN0A 1XPVA 3NTDA 1TI3A 4Y4LA 2ZNMA 5HR1A 4I58A 3ABVA 1R4WA 1SJ6A 2GR1A 1RW1A 1PRXA 2GMJA 1K0OA 2YAUA 3KH9A 5GSTA 3GYKA 3CNJA 3AYJA 4YH2A 3VWXA 3UVHA 2QCUA 2JB2A 3IRAA 3D8XA 2E7PA 3TJFA 4OVIA 2R0CA 1TP9A 14GSA 4CY6A 9GSSA 2GSTA 22GSA 2XYOA 2WHDA 3VWUA 3GWFA 1K0NA 1BJXA 4A65A 5GRTA 4AT2A 4GLTA 1FB0A 4KB3A 4BK1A 4EQSA 2EQ7A 2JZTA 2R6KA 1YQ4A 2HI7A 3KH7A 4ADWA 5ABRA 3DMEA 4UP3A 5M0ZA 1XANA 4HZ4A 4OFMA 2B7SA 1JLWA 1U3IA 5ELGA 3RBTA 1H82A 2H70A 1PX7A 4OPTA 1A8LA 3NG7X 1EGOA 1H6VA 2O8VB 4EDYA 2YWNA 4B64A 5ER0A 2MMOA 1PQNA 4J2FA 2XVFA 1A2LA 1E1NA 1LTXR 4KUNA 1W4VA 4J2WA 1C72A 3FW2A 5HY5A 4K0NA 3GKMA 3PO7A 2KOKA 2APGA 2HE3A 4O5UA 1ONFA 4H4VA 1B4VA 2AR8A 4NEWA 1KNRA 3U6VA 2O87A 3PGTA 4H4QA 19GSA 4L0UA 3EURA 2IJYA 6GSWA 4YKFA 1GTEA 2AYTA 2R5GA 3BNUA 4Z26A 5E59A 1VGLA 2NDOA 4BVXA 1CF3A 3Q6JA 3UKQA 4MPFA 2XHFA 3GA4A 1ZX9A 2OBIA 4N0ZA 3LXTA 1XW6A 5FS7A 1M2BA 3GDNA 3FZ9A 3CYNA 4EMIA 1S3BA 3UOMA 2OE1A 2LS5A 2H89A 4Z2UA 20GSA 2YLRA 2VQBA 2LNTA 4K8MA 4CDOA 3DVXA 3C96A 3IK7A 2FJEA 3KXOA 5IPYA 1N4VA 3B3RA 2CULA 3TJBA 4JN9A 4D03A 2VQ7A 2C73A 1JNZA 1PJ7A 1TXXA 2VL3A 2H0GA 1TK8B 3F8DA 5HR3A 3R9UA 3DGZA 2GSSA 4BURA 5M10A 2VOUA 2IMFA 4P9SA 1ACVA 1NW2A 3ZTLA 5C00A 3E3EA 2AAQA 5ECHB 1D4CA 1SEZA 1O7UA 4MZWA 3I6AA 3L9UA 2REMA 4Z2TA 3GN3A 1B8SA 3UP4A 3H8LA 4GSSA 5BVAA 5HYMA 4H50A 2E2MA 4NMUA 3WGXA 2GLRA 1F6MC 4IJ3A 4XWZA 1EL8A 2Z9SA 3NN0X 4G9HA 5KVIA 1GTIA 2DLXA 3TB2A 2XVHA 5A4WA 2E5VA 4H4TA 1ERTA 3KMOA 3F9UA 1N2AA 4USQA 2YZUA 1YKJA 4Z2RA 3U5RE 5J9BA 1XBSA 1PS9A 2B9WA 1R5AA 3NYEA 1GRAA 3R2QA 2IMKA 1NEKA 2C0EA 3FZ5A 2P31A 4MPGA 2IIDA 1TU8A 1WP0A 3VRDB 1S2QA 1GRXA 1E39A 2VVLA 2DBCA 4IP1A 4EQXA 1FOHA 4U8LA 1HQOA 1MDJA 3KU9A 1B8XA 2NPXA 3L8KA 6GSVA 1K0MA 2KHPA 1SYRA 5L71A 1CJ4A 2H8LA 4BL7A 5B6NA 1RK4A 1BF3A 2WETA 3IK9A 3KP9A 3QAVA 4C5OA 4G2EA 1NHSA 1GRHA 3GSIA 4ECCA 5C2TA 3TJJA 3GSSA 4DSRA 4B67A 4F0BA 2AB6A 3TOTA 2LJKA 4N11A 2CZ2A 2PHHA 4J57A 1GPEA 5CRHA 1AOGA 4IV9A 4B68A 2O7KA 1N1PA 1KTEA 3AD9B 5ECPB 2YLTA 2JBVA 1XOBA 2MZCA 4WCTA 3BJ5A 3GKKA 3A5WA 3CSHA 2X50A 2DMLA 2L6CA 2HSYA 1M2AA 1L0VA 3HY2A 2EIRA 2F5ZA 2CX3A 2FNOA 5IPHA 2OBKA 5JCKA 1GTAA 3ZYWA 2H1BA 4AP3A 4YKGA 1ZZYA 4F82A 1IYHA 4V2NA 2DKHA 5KOXA 3UEMA 4OO5A 4GF0A 1RYIA 1TW9A 4C3YA 3UOYA 2YWLA 4LLRA 2R46A 1SKRB 1UN2A 2A2RA 2CDUA 1KEBA 1EL9A 1Z6MA 3QSSA 4OFTA 3VPTA 1GETA 2I9HA 2R45A 2BS2A 2A4VA 5JWRB 3M0OA 3EMXA 2OA7A 4BWSA 3RP7A 5KN0A 2WCIA 2VAFA 3LORA 5G5FA 2FJDA 2C64A 3F8UA 1PBDA 1R7HA 4FDCB 4EQRA 5IOWA 3FIMB 3V76A 3ZREA 3AEFA 1JHBA 4O92A 1XW9A 3FK8A 2LKUA 4OO4A 5H5RA 3GYJA 3Q9TA 4MK3A 1B5QA 3NIVA 5DCGA 1LVLA 1JZDA 3UP5A 1IUXA 1EOGA 1MEKA 4IA6A 2NBSA 3KP8A 3IAM2 2Q7VA 4V2MA 4J56A 2F8FA 1FW1A 4KX4A 1PSQA 3NK0X 2JKCA 3UOXA 3BCIA 4PGTA 2NVKX 3RP6A 3EANA 3TRXA 3GMBA 4POLA 5C3JA 5B8AA 2G0FA 1S3DA 3ERFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2FJB A;  2WOW A;  1EZK A;  1U6T A;  1NG3 A;  5DAL A;  2ZZB A;  1QK8 A;  4OPI A;  1HNA A;  2GDR A;  1K0B A;  4YQV A;  3R0U A;  4KSO A;  3DK8 A;  1RVK A;  5G5H B;  2H0I A;  4IBP A;  1K3O A;  1GT8 A;  3FBS A;  1JPD X;  3PVC A;  4ECB A;  3ISH A;  1SK0 A;  1M7T A;  2C3Q A;  1OJC A;  2JSZ A;  1GUM A;  2PYX A;  2ZBW A;  5BOE A;  3R1Z A;  3BJS A;  3CB3 A;  2H76 A;  4IQ1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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