3H4KA

Crystal structure of the wild type thioredoxin glutatione reductase from schistosoma mansoni in complex with auranofin
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of Schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase by auranofin: structural and kinetic aspects.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
total genus 174
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2009-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 3h4kA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3h4kA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA03
2J23A 4ZBDA 1Q9IA 3ALLA 4NEWA 1XWAA 1NPXA 2FNOA 1IUXA 3QSEA 3HZ4A 2BCPA 5LCZA 2XVJA 5IPHA 1PS9A 2IMFA 3D6IA 2C7GA 1S3BA 2LSTA 2FA4A 1XW5A 1O8XA 2R0CA 3P4RA 1ILOA 4ACSA 1HQOA 4IVMB 2R37A 1XW9A 3CNTA 2AAQA 2CT6A 3KMNA 1GULA 2HI7A 2L5OA 3NHOX 1MEKA 5DDLA 4J31A 4HZ2A 2YJHA 3RPPA 3FYGA 4X9NA 3LEFA 4IGJA 4TM3A 2JB2A 2YOIA 3KTLA 1ERVA 1VF3A 2LRNA 3GFKA 4EM3A 4PQ1A 6GSVA 1XPVA 4AP3A 1S3EA 2A8XA 3D4TA 1YQ4A 2XPDA 1WPIA 3CSJA 4KA0A 2WPFA 1BG5A 1FOVA 4GRTA 3MWHA 2CAIA 3LZXA 4Q5FA 1THOA 4GDPA 4K7IA 4AJ8A 4Z44A 3ADAB 4I2TA 1G6WA 3TKSE 5HFIA 3SFDA 2TRXA 4YXDA 5ECLB 1E6EA 2FGXA 1NHQA 1TDNA 3LJRA 1MOKA 1EEMA 2EC4A 3Q19A 3FHKA 5JWQB 4WBJA 3OR5A 5KN1A 2WHDA 3Q18A 1O81A 19GSA 2WQYA 4GDEA 4U2LA 1RK4A 3NT6A 3D4MA 2XHFA 4ZXGA 4MK3A 1A2JA 5HFKA 2GF3A 3APOA 3FIMB 1KSSA 1URMA 3QAVA 4C3YA 3FR9A 2YPMA 1CJ4A 3F8RA 4F9ZA 3FRCA 3L8KA 4J2WA 4APNA 3VQRA 4B68A 1USBA 3KD0A 5EBKA 1JU2A 2Q0KA 4NPBA 2WP9A 1BGNA 5HR0A 1F6MA 4A7AA 1AQVA 3GWDA 4IA6A 1E1KA 1GNEA 2LJAA 2QAEA 3TRPA 1LV0A 1YQ1A 1NENA 4H4UA 4FK1C 4Z2TA 2E2GA 5AN1A 1TRUA 1JNRA 4DGKA 2IVEA 2IIDA 5EL8A 2HE3A 1LJRA 2GR2A 4KDUA 4B65A 4WF4A 2ZUPA 2FA8A 3DRNA 3FZ4A 4NTDA 1G0TA 5J9BA 4ZCDA 4TR0A 1XW6A 2HRFA 4NXIA 9GSSA 2BACA 2H88A 4Y4MA 2B1KA 4HA6A 2OA1A 1VG9A 3D1CA 3DH9A 2YLTA 1OC9B 3EC3A 1CQHA 2GLRA 3DKSA 3GH9A 2LV3A 2R4JA 1GERA 2VVMA 4BJZA 3KP9A 3QFBA 1A0FA 2XFOA 4TKYA 1RYIA 4C74A 1N1PA 2JBVA 1UC7A 2YVGA 4IBPA 4K0GA 7GSSA 1EOGA 3C8EA 4WX1A 4V1Ag 1JFUA 4D03A 4OVIA 2XVEA 3NK2X 1ZOVA 1JOAA 3KP8A 3P4QA 4YQMA 2GZYA 3ZFLA 4YT0A 4TRXA 2ON7A 3BD2A 3VR9A 5AISA 2ALBA 3AE9A 5G5FA 1Z7PA 4USQA 5J9CA 4BK1A 1EL8A 2EIOA 2DJ3A 4HJ2A 1IUUA 5A5KA 1GRFA 4GTUA 2C70A 2X64A 2UZZA 3TKSA 4GF0A 4KAEA 4IQAA 5IQ4A 3ME8A 4JZQA 2R0PA 1TRWA 2AAWA 4XRAA 4Y4LA 1K0MA 2YG7A 2H0GA 5F8BA 2IWTA 3MNGA 5D9XA 3AE2A 1GWCA 3WYWA 3VR8A 3G9BA 5ID2A 2VCTA 3UP4A 2RUFA 3ERFA 1FAAA 4DSSA 4OFMA 3IA1A 4P9SA 3BJ5A 4MMMA 1O94A 3IAS2 4IS0A 1MDKA 2C1YA 4DNAA 5J41A 3UOXA 20GSA 2LQQA 2LNTA 4N0ZA 2VVLA 3QVPA 4KUNA 4N9XA 2EQ7A 5G2ZA 3IK9A 1FHEA 4I6XA 2H75A 2LJKA 5M10A 1KTEA 1PSQA 2OBIA 2CQ9A 3E3EA 1QLBA 3AB1A 3DMEA 5H5QA 5JCKA 1H83A 4K22A 3ZVJD 2YWMA 2BK4A 3QDNA 1NM3A 4OFNA 1TI1A 4MJBA 2GEWA 4UDPA 3GKKA 5B8AA 4IHUA 2WP5A 2WP6A 3IOSA 3ITJA 4KNDA 4H4RA 1CC6A 1PX7A 1B9YC 3DVXA 3APSA 4PXOA 1K0CA 1YY7A 3BNMA 1LVLA 2C3QA 1GSFA 4JNQA 4OPIA 2XBIA 3TJKA 2LUSA 1L0VA 4LA1A 4X43A 3CTYA 3R2QA 4GWRA 4O5UA 1SU9A 5FT3A 1IJHA 2NPXA 3FEUA 3DJJA 3NG7X 2IMKA 1YQ3A 4YSYA 4RG4A 2H71A 2W0HA 4JY3A 4EMJA 2ACZA 2VIMA 1U87A 1SJZA 4MH3A 1K0OA 4A5LA 4H4SA 2YV7A 1F6MC 3FMWA 3NKSA 3VPQA 4FYUA 2CV4A 5ECSA 3E1TA 4POMA 3GIXA 5A4WA 4A6NB 2DIYA 2RUEA 3UTFA 1AAZA 2B6MA 3ZL5A 1KF6A 2H6XA 2JSZA 2FD3A 3SM8A 1FB0A 3NK1X 1V9WA 2CULA 1XOBA 4K9ZA 5JCMA 2FY6A 4JU5A 5JCGA 2ZZ0A 3UCLA 3DJGX 2PVOC 1KFYA 4YKFA 5HQPA 1TK5B 1J9BA 4BL7A 2TIRA 5DBQA 1TU7A 2DJ2A 2VQBA 2H73A 5D8IA 1V2AA 1W89A 3LORA 4E0VA 1H82A 1ZOYA 2WGRA 3F4RA 1M7TA 2B7JA 3QR6A 1PGTA 1H6VA 1NEKA 1GUKA 3QFBC 4J56E 4A9WA 3L0HA 4MPFA 2EIRA 2PPTA 1PQNA 3TB2A 3M0FA 4JNAA 1GH2A 4ADWA 1BJXA 3KH9A 2CFYA 3DK4A 2GR0A 18GSA 4QL9A 4MZWA 2HQMA 4EKZA 2WBAA 1TW9A 3F0IA 4ML1A 4WBRD 1TRBA 1UN2A 2IFQB 2PYXA 3RPNA 2YAUA 1Z6LA 4TXOB 4UP3A 3CGEA 2VD0A 4KGIA 1XPQA 4G2EA 4L0UA 3UVTA 3F6FA 1D4EA 1X31B 3ED3A 5ECQB 3SQPA 3KTBA 5GAND 1QO8A 3UTEA 2XLSA 3KKJA 4YQUA 2CVJA 2GMHA 1TP9A 4X4JA 2YNXA 4K6XA 4K7ZA 5F06A 5BVAA 3UOYA 3URHA 2EQ6A 1PN9A 3A2XA 3QSMA 1WIKA 1BF3A 2VLUA 3C1SA 4EF0A 1X0RA 3CSHA 3TKSC 3CNDA 3GNJA 5KXJA 1AQWA 4PQIA 3CPIG 4LMVA 2V1MA 3HJPA 1XVQA 1I9DA 4EC0A 1GSEA 4Q5QA 2I4AA 4AF2A 5KN2A 1CJ3A 3AD9B 5EB4A 5E4WA 4O5RA 3VI5A 3EU3A 2OA7A 2VOCA 3FBSA 1IYHA 3QAGA 2ZBWA 2WJUA 2IPAA 3GTUB 2IN3A 3HJOA 4IJIA 4U8MA 3F3QA 1GTBA 3KIJA 1YJ6A 3NTDA 4ID0A 2GQWA 3FY7A 4HZ4A 3DWVA 4ZL7A 3CBUA 4GSSA 2X50A 1DSBA 3SGLA 4FH8A 2MMOA 4GUVA 2VCXA 4KB3A 5ECMB 1F3AA 4Z24A 4JBBA 5CRDA 3HCZA 4EXJA 1FEBA 1PJ5A 3QCPA 4KDYA 3M8NA 2CAQA 3M0OA 3I43A 4J2FA 3P7XA 2Y6RA 4OPLA 4K2DA 1K0NA 2H1GA 4YTPA 3AEAA 1B37A 2BABA 2NBSA 3BHKA 4C77A 2I0ZA 3WGEA 1E1LA 1S2YA 3ATRA 4USRA 2VL3A 4H4YA 2AUVA 2OKAA 4OPUA 4GCMA 1I5GA 3RHAA 4GF7A 1B8XA 1T7PB 4AT0A 3WE0A 1YY5A 1XFLA 3BBYA 4U8OA 4MF7A 1A2LA 1SKSB 4GSTA 2XFPA 5HR2A 2VQ7A 4RG3A 2D2ZA 4N10A 1S2QA 2OLOA 1GPEA 2BXSA 4DSGA 1SL1B 4RUVA 3L9VA 4KE3A 1K3LA 5FS7A 2V61A 3L9SA 5KN0A 1RQMA 2A89A 3NYEA 2B76A 3EMXA 4J56A 2WS3A 4JY2A 5C00A 1YEPA 1TTZA 4U8JA 4CCQA 4ISDA 2L5LA 2C4JA 1TJDA 2MZCA 4PGTA 3VFIA 3EPTA 4JRRA 1N4VA 2QGVA 4MJEA 4GRFA 1NHSA 1GV4A 4AGSA 2KHPA 2R6KA 1A23A 3G7IA 1OVNA 1W4XA 4HS1A 3UKPA 2H70A 1T4YA 3UKHA 1BGJA 3ICTA 1MTCA 4IW9A 4ZIJA 3GRSA 4F0CA 2E4GA 3ISOA 2YR4A 4EIPA 1SJ6A 3G7YA 5IOXA 1CL0A 2BXRA 2V3AA 4NHZA 3TOUA 2I3YA 2O7KA 1WMJA 1F2EA 1Z3EA 5G31A 4EQWA 2DJJA 2LQOA 3CGDA 2VL2A 5DJLA 1GXFA 1A0RP 1CF3A 1A8LA 3ZFBA 2YG5A 1QGVA 3D8XA 1U3IA 4CDOA 5AGYA 2HT9A 4GXZA 5CQFA 5G30A 1TDFA 1GOSA 2GZZA 1DODA 4BURA 3I6DA 4XS6A 2V32A 4J34A 4J36A 1XDIA 3UKAA 1PN0A 4L5OA 1H81A 2YANA 2FJBA 1NG4A 3ALJA 3J7Yk 5BULA 1TK0B 2OE3A 2WOVA 5CRHA 2GS3A 3D0ZA 4G10A 2C3NA 5J3RA 3GRXA 3CRTA 3RAZA 2ON5A 1OYJA 4ILFA 2GTUA 4NTEA 3GSSA 4ZN0A 1G7EA 3AWIA 3NH3X 4B67A 1X9WB 4FYCA 1D5TA 4HJMA 3TDGA 1J0FA 1XBSA 4ECHA 2WB9A 4L0WA 4PQHA 5KVIA 4Z25A 5KWFA 1SD9A 3EYTA 2GSQA 3P4PA 5D9WA 2DKHA 1GTUA 2XVFA 3V3NA 4ZL8A 1PJ6A 3U6VA 3V76A 5DCGA 3CGCA 3IR4A 1HD2A 2M72A 1PMTA 4HQZA 5CKUA 1FVKA 2FWGA 1V59A 3BCIA 3W6GA 2P31A 2FBWA 3RP6A 2RM5A 3BNUA 4Z2UA 1GRAA 5HFGA 3C1RA 3BI4A 2PUKC 5F07A 1QFNA 1U3AA 2PN8A 4AOXA 1LQUA 5C2TA 2GSSA 5D9TA 3H8LA 4KCAA 1O85A 2O89A 3CPHG 3RHBA 3KU9A 1WRYA 1CQGA 1SKWB 3FW2A 1WP0A 1C72A 3BCKA 4NZHA 3C4NA 4K0NA 3KA7A 1FECA 5IMZA 2O8VB 5FMHA 3VLNA 1CJ2A 1ZY8A 3WGXA 4H7UA 4N11A 2GR1A 1M9AA 1FW1A 1R7HA 1MXTA 4OPDA 5DQYA 5BRTA 1DXLA 2JKCA 2CA8A 3RP8A 2QCUA 1YDKA 2CVBA 4IELA 4TM0A 2Q6UA 1GETA 3UBKA 1H7WA 4BPYA 2GB0A 3CMIA 4AT2A 4JE1A 2JZTA 1ZKQA 2JB1A 2V6KA 3QOUA 3LB8A 1OJDA 22GSA 1DE1A 2X8HA 4MJWA 2OADA 1ABAA 2YLRA 1OJCA 4V2MA 1BEDA 2YM2A 1FG4A 5D93A 1GLPA 3Q74A 2BS4A 4F0BA 5KN3A 5B6NA 3HJMA 2KLXA 3ZIVA 3HHVA 1ZMCA 2HRNA 4KH7A 4MZCA 4QQ7A 2N5AA 1GUMA 1NW2A 1U88A 2ARDA 2YLWA 5J60A 2M46A 4MZBA 3AEEA 4J57E 2CVDA 4ZB6A 4IVOB 5ELGA 1H86A 1TDEA 3TJJA 1NHRA 1GLQA 3ICSA 3NRNA 5JWOB 3CGBA 3ZLPA 1R5PA 1EV4A 3DGHA 4DSSB 2AHEA 1QXHA 2XVHA 1GTAA 3TGZA 1WWJA 4H2NA 2Z9SA 2VAFA 4X1UA 3FK8A 4RI7A 1HNBA 1PKWA 3MAKA 1GT8A 1PXCA 2AQJA 1K0BA 1SYRA 5U25A 5DAKB 2PWJA 4DSQA 3TJBA 1E1MA 1K0LA 4FO5A 2C66A 2LRCA 4H4QA 4BWSA 3KLJA 3IBHA 3P2AA 3UMAA 4D73B 2VL2C 3P8WA 4A65A 3S9FA 4JDRA 3IXRA 3IPZA 2XLTA 2GGTA 3US3A 2FHEA 3CNSA 3FG2P 2YWOA 2MBSA 1PXAA 3PGTA 4K5SA 4EIQA 4H86A 5G1LA 3K7TA 1KEBA 4BWQA 3HVVA 4JN9A 3IE3A 1D4DA 4K5RA 1TXXA 2BC0A 2XLUA 3AD8B 1GSSA 1X5CA 4V2NA 4HDEA 2R5GA 6GSWA 4Y4NA 5G1KA 5FHIA 1D7YA 3KZQA 4L5LA 1LJ1A 2HSYA 4TVEA 3P90A 5CRWA 2YM1A 1LQTA 3AEBA 3DGQA 1L9DA 2OACA 1ZDLA 1XWCA 4KX6A 4RSLA 3M9KA 4XHMA 2B9XA 1M2BA 3NYFA 5ECHB 3DEXA 2XFNA 2GAHB 2FWHA 2GVPA 4EQRA 3PS9A 1SK0A 2QKEA 2DLXA 4I58A 1PL1A 4B64A 13GSA 4BK2A 3AE4A 1BZLA 3LQ7A 3RNMA 1J08A 1CBOA 3PH9A 3LFLA 3VWXA 2H19A 4AOSA 3DK8A 4PAAA 1F3BA 4FIWA 5D9VA 11GSA 4HU7A 3QD9A 2JSYA 1GL8A 3FZ9A 4XWRA 4ZL9A 4OWYA 3UOVA 1G7OA 2LS5A 4XS4B 1Q1RA 3H4KA 3AYLA 1H84A 2R4VA 2C3TA 2HZFA 1FVJA 2R2JA 2CZ3A 4YWOA 1OKTA 2YN1A 3CTFA 2JB3A 1ZOFA 3HVSA 2OLNA 2BC1A 2YVFA 2YV9A 2XDOA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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