4LA1A

Crystal structure of sjtgr (thioredoxin glutathione reductase from schistosoma japonicumi)complex with fad
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLQRTIESAAVIVFSKTTCPFCKKLKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSVIQKALSNFSKIETVPQMFVRGKFIGDSKAVLNYHNNNQLQAIVNENKYDYDLIIIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKIAVLDYVEPTPMGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHSLEDAQHFGWSLDKSEISHDWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVSLRDNAVTYLNARGMLLSPHEVQITEKNKKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAIEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVVGASYVALKCAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEITQLKPVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKLNCEAVGVKLDKNGRVVCSDDEQTTVSNIYAIGDINAGKPQLTPVAIHAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDNDIEVYHSHFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRISDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKEDFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKRSGGSAAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of SjTGR complex with FAD
rcsb
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma japonicum
total genus 197
structure length 586
sequence length 586
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2013-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 4la1A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4la1A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A03
1VDCA 5A5KA 3QSMA 3S5WA 1VG9A 4K6XA 4EXJA 4Z2TA 3NKSA 1Q4JA 1OJCA 2Q0KA 5LCZA 1T7PB 3B6DA 3J7Yk 4IBPA 4GRTA 5H5QA 5CP1A 1SU9A 2C3NA 5DJLA 4F0BA 1PJ6A 1YKAA 5KVHA 3KEBA 2CA8A 5KOXA 3CMIA 4MH2A 5G30A 4QL7A 4RG4A 2GMHA 2AJQB 3V3NA 1KSSA 2EIRA 3P4RA 3PR8A 2YJ7A 4L5LA 2FLSA 2V1MA 3LEFA 3M8NA 4N30A 4TM4A 2GSTA 3Q6OA 1MXTA 2XHFA 1QQ2A 6GSYA 4YXDA 2GRTA 3DH9A 1DSBA 2FNOA 3GWFA 3ZREA 2PWJA 4RUVA 2L5OA 2CVJA 4B67A 1M0UA 2YV7A 2WS2A 4TRXA 3D0ZA 4C3XA 1JRZA 4GWRA 4KUNA 5JWQB 1RYIA 2VUPA 1SL2B 1OJDA 1RK4A 4PAAA 4OFMA 1SL1B 1X31B 4IVFA 2H66A 2JB1A 2C0DA 5IOXA 1X9MB 2PBJA 3C4NA 4YKFA 3Q74A 3LXDA 4EM3A 5D8IA 1H4OA 4F9ZA 3CRTA 3II4A 2C76A 1Z9HA 1N8JA 3DYRA 1K3YA 1TDEA 4POLA 2BA9A 4TW5A 2GR3A 2IVEA 1CHUA 2H73A 1ON4A 2OE3A 4USRA 2ZCTA 1M9BA 2OE1A 3UTHA 4POMA 4OPCA 3VURA 4I6XA 4GCIA 4QQ7A 2GSRA 2LRTA 4RSLA 2L57A 1K3OA 2LEGA 4MJEA 1N2AA 3IK7A 1CC2A 1UVZA 1IJHA 2APGA 1XVQA 2XVJA 1LJRA 2R4EA 1SKWB 3AE4A 4OFNA 4HJMA 4JZQA 5JCKA 3ZRDA 5DBJA 2H1GA 4UDRA 3CTFA 1LQUA 2G2QA 3P2AA 3QAGA 4H4PA 1XOAA 3FBSA 2KOKA 5HYMA 3Q6JA 3ZYXA 3PO7A 1LTXR 5KN2A 3E1TA 3IRAA 3P90A 2VL2A 4MA9A 3BNUA 2R4VA 5AISA 5C2TA 1ERVA 5KEJA 2GR2A 5DVBA 4RI7A 2B1KA 1XOBA 3Q9TA 1G6YA 2YG3A 2K8VA 1E1LA 3F6FA 4POBA 3UTGA 3HDCA 3ZL5A 4IA6A 2X50A 2O9ZA 2NTOA 1FL2A 4J34A 2YLSA 1I5GA 3D5JA 2YR5A 4BL7A 1A23A 5CRWA 5J3RA 1JNZA 4KCAA 1BAYA 2E1MA 3A2VA 2CFYA 5LNKe 2GMJA 4MLYA 2HZFA 4HA6A 5EVOA 2WOIA 4MK3A 3GX0A 4YTPA 1IUTA 5B8BA 1YY7A 3RP7A 4H4RA 4AJ6A 4GSTA 3CGEA 2YV9A 4V1Ap 2YWIA 4TXOB 4J57A 3LG6A 4TXVA 2MZCA 5BVAA 3DWVA 4OPLA 1RQMA 3C73A 3P8WA 4MF5A 4TOPA 2VRLA 3UKFA 2JADA 4G9HA 2H6XA 1D7LA 2DJ1A 3KM6A 3NIVA 4EM4A 3ME7A 3LZWA 4GXZA 5HHFA 1TYPA 2ZZBA 4HQZA 4OCFA 2H70A 3VWUA 1GNWA 1XW5A 1M2BA 4LLRA 1E39A 1GTBA 1VF2A 3CRUA 2GR0A 4N10A 5AIXA 2AQJA 3ZTLA 5FHIA 3DK8A 3AEBA 5JCNA 1V98A 3DGHA 1RW1A 1XWCA 4UDPA 4USQA 1N4WA 3IWAA 1TP9A 2EIQA 2XVFA 3MWHA 4NAXA 1Z7PA 2H1DA 5LD0A 3GRTA 2VM1A 4D73A 3NYFA 4E8HA 5A4WA 2YLXA 2LV3A 5U25A 3IDVA 2OALA 1H6VA 4B63A 3ZMKA 3BHFA 1TRVA 2DIYA 1PJ7A 3ICTA 1YF1A 2IIDA 3VR8A 3KTLA 4YSYA 2KHPA 3DK9A 1R5PA 7GSSA 3K7MX 3UKAA 4NHZA 1NHSA 4KGIA 3UOMA 2XLPA 1OC3A 2B5XA 2BTOT 4TVEA 2RUFA 4G19A 3DJEA 3UTFA 2L5LA 3ZYWA 4GF0A 1MTCA 3F0IA 3GSSA 1XCCA 1K0BA 2VCTA 3ALMA 5IMAA 4IS0A 4V2LA 3L1RA 4Z2UA 3LOVA 5DQYA 1YJ6A 3GIXA 3NK0X 3EMPA 2DIZA 2WDQA 3FHKA 5CNWA 5D73A 2GDRA 4J36A 1BYEA 3UEMA 2PVQA 5CKUA 2R4JA 4LMWA 3M12A 1TU8A 4WBRD 6GSUA 1NHOA 1MO9A 2C3CA 2HRNA 2R0GA 4UP3A 3ISOA 2BXSA 3C1RA 5G31A 1AIUA 3VLNA 5FS7A 3EMXA 1CF3A 2FJAA 1WRYA 3ZLPA 2H1AA 2KP2A 1IUSA 1TTZA 4NMUA 3VWWA 4LL1B 1GUHA 5J5NA 1IUVA 3HJOA 2H01A 1ZOVA 3ADAB 3KKJA 5KN1A 3F4SA 4ECJA 3KJYA 3IHGA 1T8EB 3C8EA 4Y4LA 4Z26A 1SKRB 3LADA 3DKSA 2BC1A 4HQSA 1YQ3A 5ECRB 3I43A 5EBKA 1A2MA 1Z3EA 4EL1A 3GNJA 4I59A 3G7JA 2YM2A 4KA0A 1PN9A 3D4MA 12GSA 4EE0A 2OLNA 3TKSA 1ML6A 1GLPA 2A4VA 3VQRA 5CQFA 1ZCPA 3CBUA 3UARA 3A2WA 3TJKA 3NTDA 2H74A 3QFBA 3J7Yb 1R26A 3CPIG 3SWLA 2GB0A 1GEUA 3LZXA 3VRDB 1VF3A 4YAVA 3UBLA 3CPJG 3RBTA 4NHWA 1FB6A 5IPYA 1KDGA 2I4AA 2R37A 1F3BA 3EWLA 2MMOA 2H88A 4ZB9A 3UJ1A 3GKKA 1TI1A 5IQYA 2RABA 1A2LA 1TU7A 2GSQA 3M9KA 3ALLA 4CBQA 3HCZA 2NPXA 1A8LA 3C71A 3AE1A 4JU5A 2YLTA 2OADA 3FEUA 2FJBA 3TRPA 2H8LA 1U6TA 2FWHA 3AECA 3ERGA 1TK5B 2GAGB 3UKLA 1O6JA 3WT2A 5IPHA 1JLWA 2YN1A 3C1SA 2HXKA 4OVIA 2Y6RA 3VR9A 1QFNA 4N0VA 4ZXGA 2I9HA 1E1NA 3UKPA 2C72A 3HKRA 2VCVA 3TRXA 5F8BA 4Q5FA 1VF1A 2K9FA 2LQQA 1PHHA 3KTBA 4Q5NA 4HDEA 3BI4A 3UOZA 2PU9C 2QAEA 1O8WA 1NW2A 2C0EA 2F5ZA 2ON5A 1TYTA 2B5YA 1GP1A 5DALA 3BI2A 3F4RA 1O81A 2GVPA 2LJKA 1Y0PA 2BACA 1H82A 2BK4A 3QAWA 5ECOB 5ID2A 1NG4A 4ZL7A 2JZSA 2CT6A 1ZDLA 1GESA 4L8EA 5IMZA 5IO2A 5HFIA 2V32A 3FY7A 1M64A 5GZZB 4ECBA 6GSVA 1UKVG 3PH9A 1D5TA 3UCLA 4AF2A 3DVXA 2DC5A 4H50A 1JZWA 1THOA 3P9UA 3HY2A 1UN2A 2B7SA 5ECKB 4OFTA 3G7YA 4H2PA 5DAKB 1TI3A 2D2ZA 1N4VA 1X5CA 4B68A 1XPVA 2MMNA 3GA4A 4FYUA 1ZGNA 1FOHA 1KSUA 1PBFA 1X5EA 3NH3X 5D9TA 4IP1A 1FEBA 2X99A 3FYGA 4I2UA 4GDPA 4JY3A 1TDNA 1YEPA 3OC4A 2FJEA 1EL5A 1N4UA 4IELA 13GSA 3GMFA 2GR1A 3KU9A 4PURA 4O5UA 2CAIA 3A5WA 1SYXA 5C04A 3WGDA 2LTKA 1Y56B 1ZKQA 4H4WA 1VF4A 2TMDA 5EB5A 4PQIA 1PS9A 2VCWA 4G2EA 4NTDA 3VI5A 3GDNA 5CYYA 4KAEA 2JB3A 1XHCA 4APNA 1SK1A 5HR2A 4BVXA 2I0ZA 4U2SA 3SBCA 2GSSA 4J2WA 3AWIA 1PA3A 1Q98A 3HVSA 3SM8A 3HZ4A 1B9YC 2VVMA 4U8PA 2IMDA 3EURA 5J9CA 1PBCA 4LMVA 1FVJA 4ISDA 1V2AA 3EU4A 1A2JA 4XHMA 2HI7A 4LIIA 4YH2A 3KH9A 2B7RA 2V2GA 2M46A 2JACA 1RSGA 4DSSB 2JBVA 1ZYEA 4I5QA 2YNXA 1A24A 2JU5A 3GH9A 4KCEA 3UOVA 2F8FA 2C80A 1K0MA 1AW9A 4JE1A 4WF5A 4I2TA 2WETA 2JSZA 3O76A 4H7UA 1SD8A 4AJ7A 4FK1C 4NXIA 4ZN0A 4IGJA 5J60A 2XYOA 2ALBA 4J56A 2PUKC 2VLVA 1PXBA 2XVIA 3AE7A 5DDLA 3FIMB 1B4VA 1B4QA 3F8PA 4EQWA 1ZYQB 2XFOA 4GLTA 3AXBA 1MOKA 4ZBAA 1GSEA 5IQ4A 1URMA 2IL3A 2PYXA 1IUXA 2X8GA 2C70A 1QMVA 4H86A 4ZCDA 4MABA 1VRQB 1GV4A 2AUVA 3PGTA 1EP8A 4KSOA 1B5QA 5HR1A 4ICYA 4OPDA 3AYLA 2PVOC 5IMDA 1YF0A 1GERA 5ECMB 2YVJA 5EL8A 1B8SA 4IVMB 2XLUA 2VCZA 1EP7A 2YJHA 4LL4B 1TRWA 1PGTA 1PXCA 2QC7A 1GSQA 5DQSA 1WP0A 2H0IA 3OZ2A 1EGRA 1YY5A 1R4WA 3GL5A 5EOWA 1CJ3A 5JCMA 1QK8A 1M2DA 2LQOA 4N11A 4K9ZA 2XBIA 4J56E 5CAXA 4BURA 3RPNA 3KP8A 5J9BA 3GL3A 5G1LA 4MJCA 2JSYA 4RQRA 4ZL8A 2DKHA 1NPXA 2YOIA 3SQPA 1BZLA 3W6GA 3SFDA 2DJKA 2DBCA 1K0OA 1AC1A 5JCUA 3Q19A 3CNJA 1HNBA 1HNAA 1OE8A 1O94A 2E4GA 3LXZA 5ABRA 2BS2A 4OPTA 2VRMA 3FMWA 1GRGA 2X8HA 1F8WA 3IPZA 1XDIA 1LJ1A 1CJ2A 3GYJA 3ICRA 1Z7RA 2YP6A 1BWCA 1XANA 3GYKA 4XS6A 4BWQA 3FK8A 3P1WA 4JBBA 4TR1B 2Z5YA 3DMEA 4JEDA 2GVCA 1FECA 1GREA 3QVPA 1TXXA 2GQWA 4YTNA 3D4TA 4A65A 3IV4A 3M1GA 1NEKA 1K0DA 4PGTA 5ELGA 4WF4A 6GSXA 2CX4A 4EQXA 2PHHA 2VL9A 4J2FA 3AE6A 5ECSA 3HZ8A 3AYJA 2BS3A 1OYJA 4K1FA 4MJWA 1K0NA 2OA1A 1USBA 2CZ2A 1ZL9A 4YSXA 1JZRA 2X8CA 2QGVA 2RLIA 2E2MA 4PQHA 2K8SA 2XFQA 4NV2A 4EQRA 3H8IA 3NK1X 3M9JA 4YQUA 2HT9A 3GKMA 4TXOA 2LSTA 5E4WA 2YPMA 5U63A 1O7UA 2R46A 4BVYA 1D4CA 3GURA 3HA9A 1K0JA 2GF3A 3ISHA 1PMTA 3DXBA 3U6VA 1GSSA 1REOA 1SK0A 1EWXA 4GQCA 2H30A 1OC9B 4OPGA 3MDKA 4E0VA 3IBHA 3NZNA 3LSZA 2WGRA 1M6IA 2TRXA 3LWAA 1DOCA 3QJ4A 1XWKA 1XWAA 2HSHA 5ECPB 2H72A 3B3RA 4MZCA 1LU4A 1F2EA 8GSSA 4IW9A 4HJ2A 2N5AA 3TB2A 2OAMA 4TN8A 1O95A 2WULA 3FZ4A 2VCXA 1JRYA 4KE3A 1TK0B 3HJMA 3Q18A 5AN1A 2YG7A 1GTHA 4O5RA 1B9XC 3URHA 3F8UA 1GSFA 1AXDA 3NOFA 3LJPA 3GUSA 1OKTA 4PUFC 2GQMA 3AB1A 2LJRA 4MZBA 1JNRA 4XWRA 3LJRA 2WQYA 4ZBDA 3BJ5A 5FS6A 2GS3A 2J9HA 1GULA 1U88A 1GTUA 3F8DA 1GUMA 1O85A 3M3MA 4A7AA 1T3BA 2YM1A 5B6NA 1S3BA 2HNLA 3P4QA 1GL8A 1KNGA 4WETA 3VPQA 2AHEA 2OLOA 2ES7A 3L0HA 4E8EA 4TM1A 1EOHA 4MCUA 4AT0A 4C77A 2VO4A 3GTUA 2O7KA 1LQTA 2R9ZA 1ERWA 3UIWA 2A87A 1DJQA 5KXJA 4MJBA 5A4VA 3W8JA 4HZ4A 1SL0B 4EDYA 1ZOYA 2QA1A 2RGOA 5U1OA 5D93A 4Z24A 4WEYA 1WJKA 3L8KA 4XS4B 1EZKA 2CDUA 4FO5A 3P7XA 1IYHA 2FD3A 3DGQA 3IAS2 1N1PA 3EANA 4EC0A 2ZUPA 2L59A 3VPTA 1TJDA 2HZEB 1YQZA 1GALA 3AEFA 2HLSA 4Z43A 1OJ9A 4KB3A 4DSRA 1NHYA 4A6NA 3QDNA 1G7OA 2BJXA 3UKKA 4K0GA 2KP1A 5ECHB 5GSSA 2XFPA 4IN0A 4JR4A 2JAEA 3WE0A 3VWXA 3SFEA 4MMMA 3UMAA 4RQXA 4J57E 4H2QA 2IMFA 1PBDA 5GRTA 4FDCB 4ADWA 3K8NA 2B3SA 2LJAA 1T1VA 1R7HA 1Z6NA 3QFAC 2XLRA 1GOSA 1SJZA 2DJ0A 5CRDA 1XW6A 3KCMA 2XPDA 1TDOA 2QKEA 1ZMCA 4XTSA 4KH7A 1SJIA 2E5VA 3UVTA 4HUAA 2P0GA 1FEAA 3ZVJA 1K0IA 3GTUB 2J23A 2XVEA 1T00A 4UDQA 4XWZA 5ECLB 2B9YA 3HJPA 1DOBA 3NRNA 4OCEA 4EKZA 3AE8A 3TOTA 4BJZA 4IP6A 1QO8A 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 1QUW A;  1PKZ A;  1Q1W A;  4OCG A;  3BNM A;  4N0Z A;  4M0X A;  4H4Y A;  2IN3 A;  1KBN A;  3T0K A;  2XH0 A;  3SZ0 A;  3ZDN A;  4H1Z A;  3GRX A;  2BK5 A;  4TLZ A;  1F6M A;  3OR5 A;  3ALJ A;  3NS1 B;  4NPB A;  1I9D A;  3UKH A;  1YKJ A;  3CSH A;  2IWT A;  3NVV B;  4OO5 A;  3GD3 A;  4ZCW A;  4E6M A;  1RP0 A;  4ACS A;  1AOG A;  4GR1 A;  3N9J A;  2E2G A;  1K0A A;  3BHK A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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