4LA1A

Crystal structure of sjtgr (thioredoxin glutathione reductase from schistosoma japonicumi)complex with fad
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLQRTIESAAVIVFSKTTCPFCKKLKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSVIQKALSNFSKIETVPQMFVRGKFIGDSKAVLNYHNNNQLQAIVNENKYDYDLIIIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKIAVLDYVEPTPMGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHSLEDAQHFGWSLDKSEISHDWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVSLRDNAVTYLNARGMLLSPHEVQITEKNKKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAIEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVVGASYVALKCAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEITQLKPVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKLNCEAVGVKLDKNGRVVCSDDEQTTVSNIYAIGDINAGKPQLTPVAIHAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDNDIEVYHSHFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRISDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKEDFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKRSGGSAAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of SjTGR complex with FAD
rcsb
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma japonicum
total genus 197
structure length 586
sequence length 586
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2013-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 4la1A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4la1A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A03
4IS0A 2PVOC 5HYMA 3DGHA 1O5WA 3DH9A 3H93A 3ZVJD 1T4YA 4Z2TA 1EOHA 3LQ7A 2YWNA 3TKPA 2YM2A 2BJXA 1DUGA 3CXGA 1XHCA 3KH9A 4KNDA 4EF0A 1O6JA 3LB8A 2I9HA 2C67A 1PX6A 2C72A 1GRFA 2CVKA 2XPEA 2E1MA 2V60A 1LPFA 4B67A 2QA1A 3VK9A 1CC6A 1RP0A 4EMJA 1PBCA 1O73A 5FWGA 5DALB 5HR1A 2VLVA 3AE4A 2XDOA 2DJ1A 2X64A 3L0HA 2MMNA 4V2MA 3HZLA 4EMWA 6GSSA 1NAAA 4KE3A 2JB3A 2V6KA 2EQ7A 1RW1A 2DC5A 2N5BA 4BA7A 1O94A 1GSDA 3RP6A 2VLUA 3UTFA 5LV9A 3H1NA 3HZ4A 4DGKA 4HS1A 3QD9A 14GSA 2C64A 2JZSA 1Z6NA 2AUVA 1FECA 3LEFA 3EAOA 5D96A 4JE1A 3E0UA 4H86A 1SKWB 2GZPA 3CNPA 4CBQA 3ZDNA 3UOXA 3NT6A 4YH2A 5ECNB 2YWMA 1D4CA 1IUVA 1SK0A 3I69A 2LJRA 1K0JA 3G7YA 2GSRA 4TM1A 2PWJA 3PVCA 4U8PA 2XBQA 5G1KA 4YTPA 1S3CA 3GMCA 3E9JB 3TKSE 1GLQA 9GSSA 5GSSA 5IOXA 2WPFA 1X9WB 2CZ3A 1FCDA 3QFBA 4H4SA 2IPAA 2K8VA 5EVOA 4XRDA 2C3CA 3AE9A 3S5WA 3UCLA 3NYCA 1GL8A 4CCQA 1TDIA 3GYKA 1VDCA 1M9AA 4HEA2 5KEJA 3M1GA 3ZFBA 3DA1A 2YR5A 3P2AA 3TJKA 3DK8A 1FVKA 1SENA 4TM3A 2Z9SA 2P31A 2YR6A 4GDEA 4XS1A 4HQZA 2NVLA 4DEJA 2YCDA 1TRWA 2PPTA 5FS7A 3M9JA 1XW6A 1K0AA 3IK7A 4L5OA 2R9ZA 1Q98A 3W8SA 4Z2RA 2TRCP 1TP9A 3AWIA 1BAYA 1E1LA 2C66A 2BABA 1L9DA 4NHWA 2VD1A 1Z3EA 3CGCA 3LSZA 1GSSA 5HFIA 4LIIA 5JCLA 2LJKA 3BJ5A 5ECIB 2E2GA 1LJRA 3BHKA 2C3DA 1YQ4A 3DGZA 1PXAA 2WOVA 2B5EA 4YXDA 2VVMA 3EYTA 1PL1A 3GL3A 3TJGA 1PDHA 2DMLA 3F6DA 1THOA 2LV3A 2O85A 4ZILA 2HI7A 4XWZA 2XFPA 4ZL9A 4CY6A 4DSSA 4L8EA 1FO5A 4Q5NA 1PBDA 2LNSA 5IO0A 3GSTA 1R26A 2KP1A 2H88A 1OYJA 6GSWA 4EO3A 3I9V2 2GQWA 4FK1A 3DEXA 3NOFA 2IVEA 2B6MA 1RSGA 3EU4A 4J57A 4FIWA 4JNQA 1U3AA 3ERWA 1EGRA 3KLJA 3ALJA 4WR5A 4O5QA 4TM4A 3A2VA 3CMIA 3F4SA 3GV1A 3E1TA 4EC0A 4Z25A 5JCWA 1CJ2A 4H2RA 2D2ZA 4EM4A 3ZZXA 1LBKA 13GSA 4RI7A 5G1LA 4EXJA 3CNJA 4U8KA 3CYNA 1BGJA 2M80A 3QDNA 3IE3A 3PS9A 3KMOA 2OBKA 2VL2C 4H4VA 3KA7A 1ZKQA 4I6XA 1GRGA 3RP7A 1GNEA 2BYBA 4MH3A 2HZFA 2R46A 2BXSA 1JLWA 5IPHA 1F6MA 4U2TA 1HD2A 3VWUA 1GOSA 4OO5A 5D8IA 2GR0A 4J2FA 2VQBA 2PYXA 1GSNA 3FZ4A 2Y6RA 5FMHA 1AIUA 3NZNA 5L71A 3UP5A 1JHBA 3LJRA 4TR4A 3UMAA 1M64A 4IVFA 2VM1A 4TR3A 4ACSA 2GDRA 3EPTA 4IW9A 4BWSA 1Z7RA 2OAMA 4MP4A 3APQA 2H1BA 4ZCDA 4FYCA 3F3QA 4IJ3A 1F8RA 1T00A 4J56E 2AJQB 1N4WA 4A99A 3DK9A 4MZWA 3AE8A 3SQPA 4XCSA 1U3IA 3FZAA 5IM9A 4H50A 1NEKA 1SEZA 2LJAA 2P0GA 5ECMB 1BGNA 1KNRA 2YV7A 1E6BA 5JCIA 3NIVA 1X9SB 2A2RA 1EEJA 2H72A 5J3RA 2C73A 5KRQA 4IELA 2WQYA 5IMAA 1OKTA 1XOAA 3HJPA 1TOFA 3RDWA 2DMMA 4V2NA 3FR6A 2R0PA 1ACVA 2YLRA 3KH7A 1VGLA 4ML1A 2CX4A 3GMFA 4NV5A 3U6VA 3AE5A 2WB9A 3QFAC 2YR4A 4I2TA 5KN2A 4MPFA 3UBKA 5ECKB 5JCGA 3EANA 4Q5RA 4TOPA 2CVDA 3GKKA 3L4NA 3ERFA 3CPHG 4BV6A 3WYWA 1N2AA 5EY6A 3HHVA 1TK0B 5CRDA 3H79A 1YKJA 4K0NA 1BF3A 2IN3A 4U8NA 4ECCA 5IQ1A 3D8XA 4MLYA 5JWRB 11GSA 1F37A 1ZOFA 3QAWA 3W8JA 1ZY8A 1CL0A 4AP1A 4N30A 2WBAA 4YT0A 2BC1A 4QL9A 4H4XA 3NTAA 2VUPA 1X5DA 4V2LA 1H86A 4J33A 3ZRDA 3FEUA 2OADA 4DNAA 4HDEA 1YKAA 5DBJA 1EV4A 2FLSA 1LTXR 2R4JA 4BK2A 3NN6X 5E4WA 1TI3A 1PMTA 3BNMA 5DDLA 4Q5FA 2GRTA 2WPCA 2QCUA 2ACZA 1FOVA 8GSSA 3AY8A 1VF4A 4GWRA 5H5SA 3VPQA 3W6GA 2X99A 1YF0A 2FWEA 3TGZA 1JZDA 4KX6A 1M2BA 1K0OA 4H2PA 1BEDA 1YEPA 4KDYA 3GRTA 4I5QA 4U8LA 4GSTA 5B7CA 3WE0A 5C04A 2YLSA 4EQRA 1GSEA 2E7PA 3H8IA 4UDPA 2J3NA 4JRRA 1EL7A 1NG3A 2UZZA 1EZKA 4BVYA 1TRUA 2CVBA 3MNGA 1NHYA 3RPPA 2V41A 2OLNA 2J9HA 3LG6A 2V1MA 1SK1A 1E6EA 4N0VA 2XFQA 1ABAA 1DOBA 3IWAA 1PX7A 2DIYA 1ERTA 2HSYA 3GSSA 4I2UA 4NHZA 2L6CA 3QJ4A 1X0RA 3RPNA 2XFOA 3AEFA 4BK3A 3NYFA 5ECHB 5IMFA 4K8MA 1UC7A 4PUFC 4EMIA 4GUVA 2GV8A 5CAXA 3GWDA 18GSA 1ON4A 5B6MA 3Q74A 1PD21 2AR8A 1PJ5A 1OE7A 1GPEA 3OR5A 4C77A 2IFQB 1A2JA 2R4VA 1Z5YE 4H4QA 2EQ8A 3D21A 3GD4A 5HXIA 2GB0A 1M2AA 1T8EB 1BYEA 2CA8A 3S9FA 2HRNA 2YLZA 5BRTA 4OPLA 1GSQA 3CGDA 4OWYA 1DE2A 2DJ3A 1S3EA 3F8RA 3AYJA 4OFNA 2OACA 3AEGA 5KN0A 1SJZA 1F3BA 1G6YA 1PXBA 3KP9A 1YQ3A 1ZMAA 3SGLA 2ZZ0A 4ZXGA 3G5SA 3IR4A 5ID2B 3DKSA 2JADA 2I0ZA 3KD9A 3NNEA 5B6NA 5BVAA 2O7KA 5EOWA 3CN8A 2E2MA 3AE2A 4GQCA 4B63A 2GAHB 3D6IA 2V2GA 5GSTA 4J57E 5FHIA 4M52A 4OFMA 4P3YB 3FY7A 5A5KA 4MDCA 4RSLA 1H84A 3SFEA 3KTBA 2WETA 2X8CA 5ABRA 2RUFA 4V1Ag 3ICTA 3HVVA 1VF2A 3CBUA 1A23A 2B1LA 4OCFA 3ZVJA 1UKVG 3UTEA 1JFUA 1BKWA 3UTGA 2HZEA 3VI7A 3LWAA 4HZ4A 4L0WA 2QA2A 2AB6A 3LYPA 2Q0KA 3DJJA 1WPIA 1PN0A 2XVHA 5AGYA 4X4JA 4PGTA 3FK8A 3U5RE 2WS3A 4H4TA 2VO4A 20GSA 1KDGA 4JR4A 2VL9A 4CDOA 1ELIA 1XVQA 2CAQA 4U2SA 5A4WA 3T37A 2IFQA 2MBTA 2YWIA 2YZUA 4MMMA 3BNUA 5IO2A 4K2XA 4O5UA 5EB5A 1UVZA 4F9ZA 4EDYA 1QXHA 4KSOA 1OC9B 2RGJA 2AYTA 3P4RA 3F6FA 3A5WA 3NGCX 1S2QA 4DSQA 3VWWA 1NM3A 3QOUA 3VI5A 1PJ6A 5HHFA 4ZBBA 6GSYA 5LD0A 5ECQB 5J9BA 1TK8B 5ID2A 3UJ1A 2CX3A 6GSVA 1ZMDA 1XWGA 5GZZB 1G6WA 2FA4A 2Q7VA 2WPEA 3NN0X 1WP0A 1KSSA 3FPZA 2DKHA 4RUVA 4K22A 2H76A 4NEWA 2GVPA 2LUSA 1KTEA 3NIXA 1B5QA 3QAGA 4I97A 2O89A 1V2AA 1B4QA 4DVCA 2VVLA 5DQSA 3H8LA 1K0CA 2K9FA 2ON5A 2B7KA 1T3BA 2YVGA 4ULXA 4D04A 3UKPA 2GAGB 2LRNA 4JEDA 3LOVA 2VD0A 1K3LA 1PN9A 1JRYA 1XWKA 4A9WA 2C4JA 1YDKA 3HDCA 2VCVA 4PNFA 17GSA 2ON7A 4X9MA 4MJWA 4PXOA 5CRWA 5J41A 4U2LA 4D73A 2BK5A 3CRTA 1L9CA 4WCTA 1AAZA 3UIWA 1PBEA 2JB1A 2AV4A 2FD3A 2ZCTA 2MMAA 4F03A 1ZOYA 3Q6OA 2N5AA 2H0HA 5HR3A 3F3RA 3AE7A 3QVRA 3QPMA 2YLWA 3TOUA 4PAAA 3GX0A 1OC9A 3HVXA 5KOWA 2XYOA 1LV0A 1EP7A 2NBSA 1GNDA 4A79A 4J31A 3HJMA 1SYRA 2WP6A 4MJAA 2DLXA 2A2SA 4KX4A 4WBRD 2CVJA 1J9BA 1IUWA 3OZ2A 5G5EA 2VZ2A 4YWOA 1ERUA 1F3PA 2VLTA 1CBOA 1SD9A 1TI1A 2YPMA 4GF0A 4ECIA 3GFKA 4Z43A 2FWHA 1ZGNA 2QGVA 2XLRA 1PRXA 4O32A 1ZOVA 1ML6A 3AEAA 2GR1A 2CT6A 1SKSB 5U63A 2K18A 1M0UA 1SKRB 2CAIA 4TXVA 2XLUA 4ILFA 4JBBA 3F4TA 3KJYA 4N0ZA 3TRPA 3BI5A 1T7PB 3GYIA 1GEUA 2YJHA 2XPDA 2GTUA 4DSSB 3ICRA 4C3YA 3UEMA 1BG5A 1URMA 3LFLA 2XVIA 2GVCA 1LQTA 4FDCB 4MA9A 4A5LA 2WRTA 4WBJA 2DJ0A 4MK3A 1ZCPA 2NVKX 5J7XA 5JCKA 1H6VA 4XXGA 4TW5A 2CDUA 2G2QA 1PS9A 1SL2B 1LU4A 3Q19A 4A6NA 1N8JA 2DBCA 3GKXA 1XPVA 2GQKA 1GRBA 2QAEA 2V3BA 2VOCA 5GRTA 2E4GA 2BS3A 3KZQA 1E1MA 3R9UA 3VR8A 4EDZA 2A4VA 2WESA 3FW2A 1PXCA 3DD3A 4POLA 3SM8A 1RK4A 2GSTA 4EL1A 4APNA 1Q1RA 1J08A 2R0CA 5EPFA 1C72A 3ALLA 3FMWA 5GSNA 3APSA 2WCIA 1IYHA 1D7YA 2MYGA 4MJBA 1LVLA 5EL8A 5G2ZA 3M8NA 3IRAA 4TVEA 1XFLA 3Q18A 4F0CA 2ZNMA 3H8QA 2IMKA 4XS6A 3LGCA 2H1DA 1P2EA 4YTMA 2TRXA 1B8SA 5H5RA 2BXRA 12GSA 2PN8A 5HFGA 4YQVA 5HR0A 1AXDA 5IMDA 1JZRA 2WP9A 1O81A 1SYXA 3K7TA 4CNKA 2HSHA 3RHBA 2YJ7A 5CO3A 1TTZA 4IQAA 2ZBWA 4JU5A 3HCZA 1E7PA 1GSFA 4X43A 3L1RA 1O8XA 2KHPA 1AQWA 3AECA 2WJUA 3CTFA 2I1UA 5E59A 5IMCA 3KU9A 1K0IA 3E3EA 3SBCA 2C0DA 2DIZA 2C65A 2WEUA 2FY6A 2X3NA 3UKLA 2M72A 2HNLA 2YM1A 5JWQB 2L6DA 3KXOA 2WOWA 1GTAA 3HZ8A 4IP1A 1GTEA 5U1OA 1CC2A 4NTCA 3P9UA 4Q5QA 5A4VA 3C4NA 3UKAA 1EL5A 4GDPA 3WGXA 3ISOA 4C74A 4RI6A 2GEWA 4K6XA 1NHQA 1IUSA 2L4QA 5J4UA 2VL3A 4IQ1A 4YSXA 5GAPD 1XWAA 3TJBA 3CNTA 1SL1B 3C96A 3P4PA 3N9JA 1YJ6A 3KD0A 4YSZA 2WP5A 3RAZA 2QKEA 2TIRA 1GH2A 2H0IA 3IBHA 4OVIA 5CYYA 3ZFLA 2FA8A 3EVIA 3A3TA 4Z44A 2GSQA 3P8WA 4NWYA 2V32A 4POBA 2AAQA 5GAND 3J7Yb 3OC4A 2YANA 1VG0A 5KN3A 2WOIA 3LXTA 4NEVA 2AHEA 3UOZA 1RYIA 3DGQA 1P2HA 2VCQA 3LXDA 2R3XA 1ONFA 2L57A 4F2IA 2A89A 1JLVA 1GTHA 4MZCA 2VL2A 2W0HA 2AQJA 2F51A 3M13A 3D0ZA 1Y0PA 1FOHA 1O85A 3IC4A 4ZL7A 4EIQA 1JRXA 3AXBA 1B9XC 1DBYA 2V5ZA 2WU5A 4QL7A 2WZ9A 2PUKC 4UDRA 4LA1A 1YY5A 2WGRA 1IUTA 1MTCA 1XWCA 5IPGA 2I81A 3GIXA 4OPTA 3I6AA 3V3OA 3DIEA 2C0EA 1B8XA 1AQVA 4KDUA 1MO9A 1NPXA 1GT8A 3IDVA 1OJCA 4JY2A 4N9XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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