4LA1A

Crystal structure of sjtgr (thioredoxin glutathione reductase from schistosoma japonicumi)complex with fad
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLQRTIESAAVIVFSKTTCPFCKKLKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSVIQKALSNFSKIETVPQMFVRGKFIGDSKAVLNYHNNNQLQAIVNENKYDYDLIIIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKIAVLDYVEPTPMGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHSLEDAQHFGWSLDKSEISHDWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVSLRDNAVTYLNARGMLLSPHEVQITEKNKKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAIEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVVGASYVALKCAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEITQLKPVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKLNCEAVGVKLDKNGRVVCSDDEQTTVSNIYAIGDINAGKPQLTPVAIHAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDNDIEVYHSHFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRISDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKEDFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKRSGGSAAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of SjTGR complex with FAD
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma japonicum
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
total genus 197
structure length 586
sequence length 586
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2013-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 4la1A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4la1A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A03
4CHSA 1RW1A 2CT6A 1Y56A 2PU9C 4BL7A 1TTZA 2IIDA 1FB6A 1V98A 14GSA 1ZMDA 4IS0A 4V2MA 2OLNA 2GQFA 3UBKA 3QCPA 1E6BA 1DE1A 1VRSD 4EF0A 5HFGA 3UARA 3PINA 3KP8A 4C74A 3ZREA 4GLTA 2VD0A 3NG7X 1DOCA 1K0JA 2YLSA 4XIHA 2PERA 2EIRA 1KNGA 1D7YA 2FWEA 3N9JA 1X9MB 3IXRA 4PQHA 2YG7A 3GYKA 3AEFA 2K8SA 3PH9A 4FH8A 5G31A 1DOEA 2E4GA 1JEHA 3ZVJD 4H2QA 3NYEA 2RM6A 1E1MA 3SBCA 1COYA 1PN9A 1GRGA 5CRDA 3AXBA 3NOFA 2CQ9A 2EC4A 4PNFA 4I2UA 4JRRA 3HD5A 3ALJA 1OAZA 2YZUA 2HT9A 4DSGA 1Y56B 4V1Ag 3AEBA 1JZRA 4L0WA 3WD6A 1LQTA 1VQWA 4G19A 3QVRA 2V2GA 3AD9B 5JWRB 1IYHA 1EL9A 4E8HA 3L8KA 2QSIA 2AHEA 2RUFA 3EC3A 3FRCA 5HFIA 6GSUA 4K0NA 2VRLA 2FBWA 1DE2A 4ZCDA 4DEJA 2IPAA 2AV4A 2NPBA 5ID2A 3EAOA 5J5NA 4JZQA 4BK2A 1YKJA 1DJQA 4Z2TA 4B64A 4H4YA 1PQNA 3DK9A 4NEVA 1SL1B 5EBKA 1AW9A 5J7XA 1ABAA 4AJ6A 3VR8A 2C67A 1NHPA 2XVHA 2L5OA 4ZB8A 5B7CA 2EQ6A 1X9SB 3PVCA 1HNCA 2R3XA 3IR4A 2Q7VA 1U3AA 4XWRA 3A2WA 5FS7A 1TI3A 2RUEA 1SL2B 2LRTA 1Z6NA 1BGNA 3TJKA 3TRPA 4MPGA 4ZL7A 1SU9A 4PQ1A 3CSJA 1WP0A 4WBJA 1GUKA 1S3CA 3CGBA 1LU4A 3HCZA 3E0UA 2WDUA 3L78A 1NHYA 4I59A 2ON5A 2YLZA 3I69A 2RM5A 2BS2A 2PBJA 1LJ1A 1S3EA 1A0FA 3CRTA 2VOUA 1YQ4A 4I58A 1GTUA 5IOXA 4HU9A 3KLJA 3GSIA 1SKRB 3CNPA 2LTKA 2RIIA 2XPEA 4TM0A 5ID2B 4KCAA 2OBKA 1GSNA 1NG4A 2GR2A 3AD7B 2VVMA 2H30A 1PXCA 2K6VA 2I4AA 3LZXA 4U8LA 4UDRA 3I6AA 1Z5YE 4ECHA 5JCUA 3G7YA 4Y4LA 1HQOA 1FL2A 4H4WA 1W4VA 4Y4MA 3US3A 4H4PA 2MMAA 3KP9A 3KIJA 1YY5A 1DUGA 3PS9A 3L9VA 3B3RA 1XPVA 5KN0A 1Y0PA 2XBIA 4GF0A 1QMVA 2I1UA 3VURA 2WB9A 3CPHG 5CRGA 3CTYA 4N0VA 2LQQA 1EV4A 5IMVA 1NENA 1ZZYA 2MBTA 1TRVA 1NM3A 2XCGA 4USRA 5CAXA 5DVBA 5A4UA 4BVYA 3IV4A 1LQUA 3FEUA 2LRNA 1SENA 4OPGA 2A2RA 4V2NA 2C3DA 3AD8B 5KVHA 4YSHA 1RSGA 2DMMA 2QAEA 3Q6OA 2F9SA 5EOWA 1JHBA 4GR1A 2IVEA 1YF1A 4C5OA 5AGYA 1IJHA 2PVQA 1PBEA 3K7TA 5F06A 3ZRDA 4MA9A 3SWLA 2GTUA 3ZLPA 1O6JA 1BEDA 2YLRA 5J41A 4EDZA 12GSA 2HZEA 2YM2A 2HXKA 4KH7A 3UMAA 3AE7A 3SFEA 4AP1A 2V32A 4USQA 3UP4A 2KP2A 4Z2RA 2QA1A 1EOGA 1SK2A 4OWYA 1ZL9A 1H86A 3CNJA 3UJ1A 3CSHA 2N5BA 2CAIA 3EWLA 1XWBA 1FEBA 5ECIB 2NPXA 1JU2A 1N1PA 4BURA 1THOA 2AYTA 1E1LA 2I9HA 5IIZA 1MDKA 2B5EA 4G2EA 1IUUA 2I3YA 2C3TA 3AY8A 1XOAA 3VPTA 1VDCA 1QXHA 5ECSA 4JY2A 1ZGNA 2VIMA 5EB4A 1TI1A 1F6MA 4CBQA 1KNPA 2C72A 5CO3A 4IN0A 1B9XC 3KVEA 2HQMA 1FVJA 3NGCX 3GDNA 3DK4A 2GGTA 1MD4A 4A6NA 3GX0A 4A7AA 1K0CA 2BK4A 1KFYA 5G1KA 5D96A 1A23A 1PBCA 4TVEA 1UKVG 2HZEB 1HD2A 2K8VA 4MF5A 3FYGA 2H0IA 4EQSA 5GRTA 1PJ7A 2ZCTA 1O94A 2YLTA 1XVQA 1TJDA 1KSUA 4YTMA 2YLWA 2KOKA 3EYTA 1TW9A 5FS6A 2B6MA 1E1KA 3UKKA 2EIQA 2NVKX 1K0BA 3G7JA 2B3SA 3M9JA 2JBVA 3LG6A 5ECKB 3CTGA 4MF7A 1AXDA 3DVWA 3RDWA 10GSA 2C7GA 4QQ7A 2KUCA 1G7EA 1IUVA 3M0OA 4MPFA 4FK1A 4IKHA 1D5TA 1JNZA 3M1GA 3AECA 1GNDA 1GSFA 4OO5A 1J08A 1LBKA 1PL1A 2LQOA 3ZIJA 4J34A 2IMEA 3AE3A 1USBA 4A6NB 4V2LA 5IPGA 1AIUA 3UTFA 1ZMAA 2AR8A 4HS1A 3E3EA 2XVEA 1XW9A 2FJEA 3B6DA 1K0DA 3LGCA 4X9NA 4U8PA 4FIWA 2C73A 1M9AA 2H01A 3APSA 2H6ZA 4HB9A 4MCUA 2GS3A 1AQXA 1QLBA 5IQ4A 5FWGA 4POMA 2YJHA 1B8SA 6GSVA 2V3BA 4LL4B 2GLRA 1OKDA 3VRBA 3FZ5A 1PKZA 5F0GA 2BJXA 2DLXA 4TR1A 2F5ZA 3HZ8A 2N5FA 2OJLA 3CN8A 1T3BA 3UKPA 1S2YA 4MP4A 1AC1A 4DSQA 3KPFA 3F4SA 1GUHA 4NHZA 4DSRA 5DDLA 3GH6A 4MMMA 3KKJA 3PO7A 2M46A 1TK8B 1Z7PA 5IOWA 4Q5FA 1H84A 3FR3A 4ADWA 3EF6A 1REOA 2YQUA 3NIXA 3C7MA 2BXSA 3WT2A 19GSA 1PN0A 3KH7A 1ERVA 3BBYA 3EMPA 1UC7A 4L0UA 2XDOA 2YVFA 2F51A 1ZOVA 4RI7A 1QFNA 2GMJA 4RUVA 3IC4A 3EANA 3IBHA 1N4WA 4YSZA 2DJ1A 1NPXA 2R2JA 5CKUA 4CNJA 3F6DA 4YQMA 1QUWA 3L4NA 3IC9A 1E1NA 2Q6UA 1PJ6A 2BS3A 4J31A 1G7OA 3HYPA 1XANA 1UN2A 4N30A 4ML6A 4IW9A 3DD3A 3GRTA 3VPQA 4L5LA 1M2AA 5KN2A 1OVNA 1Q1WA 3AE8A 3ICRA 3HXSA 2E2GA 1WIKA 2YR4A 2VCXA 3AYIA 5KXJA 2WP6A 4AT2A 2YG6A 2YANA 2R9ZA 1GNEA 3BJ5A 4K8DA 3TKRA 2M80A 5EB5A 4TXOA 1GUMA 2E1MA 1BWCA 4IHUA 4YTNA 4EMJA 4U8IA 4B67A 4GWRA 1Z6LA 2BC0A 4EC0A 2TRCP 2FLSA 4XRDA 5F05A 1FAAA 1QO8A 4J57E 3ZYWA 4NPBA 1YZXA 1SK1A 2WPFA 2JKCA 1ZCPA 3NZNA 5HQPA 1S3DA 4GXZA 4OFTA 2HE3A 1RK4A 1CJCA 2H72A 3IE3A 3ZTLA 3IPZA 4U2SA 2WP5A 1XFLA 4BJYA 2TMDA 3LFLA 3F8UA 4N11A 1TRSA 3GL5A 3D22A 1PL2A 2WU2A 3V3NA 2B1LA 2R45A 2WESA 1W4XA 1N2AA 1GULA 3L9UA 3Q19A 5GZZB 1OJAA 3UCLA 2JZTA 1XWGA 3P7XA 3R2QA 3RHBA 3UTGA 4BPYA 2JU5A 2C75A 2H6XA 4K2DA 2MZCA 4L8EA 1TDKA 1A24A 1EWXA 4MABA 1ON4A 1U87A 5DBJA 1T4YA 2PMTA 4WEYA 2DMLA 4AJ8A 1OE8A 3P90A 2BK3A 2LRCA 1X5DA 4A99A 1IUTA 2ZZBA 4ICYA 1FB0A 4GUVA 2C3CA 4ZL8A 4BWSA 2OKAA 1GRAA 3QAWA 2C0FA 5HR1A 4AF2A 4Z7XA 4LU6A 3TDGA 2CVJA 2WS3A 2X64A 4GTUA 3CNDA 3SGLA 2BCGG 5H5RA 4B63A 2WGRA 2DJKA 13GSA 3KM6A 3WGDA 1ZY8A 2ES7A 1K0MA 1B5QA 4WF4A 3ATRA 4IP6A 2FY6A 4OPIA 2OADA 1F6MC 2V1MA 2WQYA 3U6VA 3P4RA 3H1NA 5GSTA 4FYCA 5JCWA 2XPDA 4OVIA 4HJ2A 4ZIJA 3GV1A 2H74A 3BCKA 5JWOB 5HR2A 2GQLA 1NW2A 5M0ZA 2HSHA 5GAND 4EIQA 4H4XA 2JSYA 4X0XA 1AQVA 3UTEA 3IAS2 2NTOA 1BQ7A 1EP8A 1EL5A 1XHCA 2MMZA 1V57A 5INYA 4O7HA 1GRXA 4X1UA 1PGTA 3Q74A 2NVLA 3RP7A 1TXXA 3FZ9A 1O8XA 5IMDA 5KN3A 2YR5A 4B68A 1GTHA 3ZFBA 3I43A 4APNA 4N9XA 4FK1C 1UA5A 2YWLA 1F3PA 1J0FA 3KZQA 2FGXA 5ECPB 2B9WA 3UAPA 1WMJA 1MO9A 4Y4NA 3IWAA 3V76A 3DEXA 3GD4A 2DIYA 3N5OA 4MZCA 2WEUA 4HQZA 1KEBA 2YWMA 3BNMA 2H1AA 1DXLA 3GUSA 4LMWA 3F4RA 4KPRA 4U8MA 2FUG2 3FG2P 2D2ZA 5CRWA 3UVTA 3ITJA 4A79A 4H50A 1V58A 3GSSA 3L0HA 2TIRA 1CJ3A 2OALA 5ECOB 2H70A 4LL1B 5DQYA 1H4OA 3TKSE 2WHDA 4HZ2A 1XW5A 4JNAA 4FX9A 4CRTA 1F9MA 3G7IA 1EBDA 1FEAA 4ZB9A 5G5EA 4GSTA 1DBYA 3ZYXA 2YCDA 5C2TA 4Z43A 5BRTA 5B6NA 3TKQA 5FS9A 3HZ4A 3EU4A 2P31A 3ZL5A 5IQYA 1JRZA 2IN3A 1YKAA 2I0ZA 1N4VA 2JL4A 4O5UA 3TB2A 2HRFA 3GNJA 2B7RA 3DGQA 4N0ZA 2OBIA 4EDYA 1TDEA 4P9SA 3C96A 2DJJA 3GH9A 4KDUA 2GSSA 4HJMA 4X4JA 3F3RA 3D0ZA 4TM3A 1T1VA 2ZBWA 2BK5A 2C0GA 1CHUA 4MJAA 3KMNA 5EL8A 2GH5A 3GYJA 4XS6A 4K0GA 5GAPD 2JB1A 3GRXA 2VOCA 4JR6A 2WDVA 2DJ3A 2GR1A 3EU3A 4H7UA 4PUAA 3Q18A 5CRHA 3RP8A 2IL3A 2YP6A 5DQSA 1ERUA 5ABRA 3E1TA 3MDKA 3QVPA 1FCDA 3FZAA 3F3QA 2RABA 2XVJA 2F8AA 2GZYA 4MJCA 3Q6JA 2AUVA 1OC9B 1FHEA 2Z9SA 5JWQB 4TLXA 4EIPA 5LV9A 1SEZA 3DWVA 1GRHA 3ALLA 3P8WA 3LYKA 3EINA 4MH3A 4K7OA 1XWCA 4JDRA 4JR4A 2QGVA 4D73B 3ZMLA 3R9UA 2C3QA 1H83A 1B48A 6GSXA 5BUKA 1PSQA 3RHAA 3BI2A 1E39A 2B5YA 3NRNA 3GTUA 3NHOX 1O81A 5CP1A 2J9HA 4MJEA 3K30A 3CGEA 1SJZA 2IWTA 2VL3A 1QGVA 1TU7A 1L9DA 2XYOA 3P4PA 4OPCA 2OLOA 1GRTA 3VQRA 1ZYQB 2A8XA 3C1RA 4IJIA 4IA6A 4B66A 11GSA 3LQ7A 2DJ2A 5HYMA 4FO5A 5G5FA 3KTBA 3DRNA 1TOFA 5CYYA 2HZFA 2H19A 2BACA 4EQRA 1A2MA 1EOHA 2IMDA 2XLRA 3CPJG 2V6KA 3NNEA 4YQVA 3NIVA 4MZWA 4ECBA 4ILFA 2DKIA 2JACA 2X99A 4JEDA 2QKEA 2GQMA 2FJAA 1HYUA 1XOBA 2HNLA 1TRBA 1NHRA 4TM1A 4NTDA 2WULA 4NEWA 1SD9A 4F2IA 3ED3A 2FA4A 3NK1X 4J56E 3UL3A 1SKWB 3GWFA 1YEXA 2GR0A 9GSSA 3LOVA 1MXTA 3FR6A 1JZWA 3UP5A 3NK0X 3P4QA 1N8JA 2H66A 4KDXA 4OD7A 2YOIA 2NDOA 3TOTA 1GSSA 3GTUB 2REMA 4IELA 2P0GA 4ECIA 1VF1A 2V5ZA 1YEPA 2A2SA 6GSYA 2H89A 2QCUA 1GTIA 2DC5A 5G2ZA 1JOAA 3WGXA 4OFMA 4YWOA 2R4JA 2Y6QA 1W89A 1GNWA 4BJZA 2H76A 4POKA 2VCTA 3LWAA 4ZBBA 2YWIA 1XWKA 4PAAA 3GL3A 3HKRA 4MJBA 1JLWA 3TCOA 5H5SA 2GR3A 2JB3A 1BKWA 4HUAA 4RG3A 2E7PA 5J60A 2WETA 2C80A 2L6CA 1VF4A 1JFUA 3V3OA 1L9EA 1WWJA 3KA7A 1XPQA 3GURA 2LS5A 1QJDA 3TGZA 4U8OA 3BD2A 1I9DA 3TJFA 2WPEA 2WDRA 2C1YA 3L9SA 2O9ZA 3AEAA 2DSAA 3HJMA 2XVFA 3SQPA 1EL8A 4EMWA 4H86A 4XS1A 3KD0A 3A3TA 5G1LA 1BJXA 1CJ4A 3ZMKA 4XCSA 2V60A 3LXZA 1TRUA 3II4A 1NSWA 4O5RA 2EQ8A 2C76A 5DAKB 3LADA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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