The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
69
|
structure length |
69
|
Chain Sequence |
TPDCVTGKVEYTKYNDDDTFTVKVGDKELFTNRWNLQSLLLSAQITGMTVTIKTNACHNGGTFSEVIFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
STRUCTURE OF THE G62T MUTANT OF SHIGA-LIKE TOXIN I B SUBUNIT
rcsb |
molecule tags |
Toxin
|
source organism |
Phage h30
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molecule keywords |
SHIGA TOXIN B-CHAIN
|
total genus |
18
|
structure length |
69
|
sequence length |
69
|
chains with identical sequence |
B, C, D, E
|
ec nomenclature | |
pdb deposition date | 1999-09-03 |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Beta | Beta Barrel | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1D1I A; 1CQF A; 2C5C A; 2GA4 B; 1CZW A; 1CZG A; 4M1U B; 1R4Q B; 2XSC A; 2BOS A; 1QOH A; 4P2C B; 4ULL A; 1C4Q A; 1DM0 B; 1R4P B; 1BOS A; 1C48 A; 1D1K A; 1QNU A; 3MXG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EE1 A; 4BY1 B; 2VUM B; 4R8N A; 1NSN S; 1KD1 C; 1PFB A; 4KHZ A; 2NUC A; 3G6E A; 2Y0S E; 3I7F A; 3GTK B; 1HFG A; 1Y1W H; 4IO9 A; 4Y52 H; 5FLM H; 2UXC L; 1B1Z A; 3BVZ A; 3EIV A; 2K01 A; 5KNC A; 4DV4 Q; 4FXG C; 3RZO H; 2WAQ G; 3G48 A; 1LAB A; 3W1G A; 3RMH A; 1Q8K A; 1DJR D; 1YJW A; 1QVC A; 3D6C A; 4L8J A; 4X64 L; 1YVC A; 2WKD A; 1YJ9 A; 3T16 A; 4DAM A; 3AFP A; 3WOE A; 3M7N A; 4I7A A; 1HZB A; 5CV8 A; 2HDL A; 4V19 0; 5G3L D; 2NZ1 D; 3KBX A; 4E6I A; 3OMC A; 3ZYY X; 4F8M A; 3CME A; 4GKJ L; 4LW1 A; 3TP8 A; 3HOX H; 2JYO A; 4LFB L; 3E0J A; 3HOU B; 2MO0 A; 4PQX A; 5C3E B; 3J80 i; 4MHE A; 4X66 L; 1KDC A; 4IUV A; 5KIX A; 3HOZ B; 2BDO A; 3QIA A; 2RVL A; 4KY6 A; 3VA7 A; 1MSG A; 2Q8R E; 2NVX H; 5T1G A; 1EUJ A; 3A7A B; 1C8C A; 2XVS A; 3NUC A; 4C2M B; 5IYB H; 1HJP A; 1WTH A; 1LTG D; 5IGB A; 5I4D A; 5FO7 B; 3DUZ A; 2QEJ C; 2CH4 A; 2B2Y C; 1MSH A; 2N55 A; 3E9I A; 4YHH L; 2K52 A; 4P71 A; 3SK4 A; 4DK1 A; 4N9T A; 1VMC A; 1K83 B; 2DY8 A; 1U4L A; 5EPJ A; 4AYB E; 3CPF A; 2KA7 A; 3RUZ A; 5JAV A; 3MFG A; 3J7A F; 1GUO A; 4OIK A; 1YHQ A; 4EGV A; 2K5W A; 3HOW B; 1RD9 D; 1WTW A; 2E2H B; 2UUC L; 2IPK D; 3GO5 A; 3RR5 A; 4DF7 A; 3OW2 A; 2K7V A; 1IYU A; 4KKT A; 1PRT B; 2EYH A; 1H9K A; 1IW7 C; 1K0R A; 1K8M A; 4JV5 L; 1Z47 A; 3SGI A; 3BVG A; 1HZA A; 2K75 A; 3G7L A; 4K2K A; 4PZ6 A; 4V0B A; 1OTC A; 1TWG H; 1EYC A; 5CGK A; 3EFX D; 4C3H H; 4DR5 L; 4C3J B; 3KFU A; 3GD7 A; 4IUP A; 2FMM A; 1E0B A; 1QOH A; 3G4S A; 2L1B A; 2K32 A; 3K7A H; 1V9P A; 2BE5 C; 4J6H A; 4HIM A; 3S14 H; 4MNO A; 5I2X A; 2NVQ B; 1SAP A; 1A62 A; 1AE3 A; 1HNZ L; 2UU9 L; 4LNQ A; 4DK3 C; 4C1N I; 3NWT A; 1XMQ Q; 2KOL A; 1D5M C; 4L63 B; 4UP8 A; 4YCU A; 2R61 A; 3FVQ A; 1K8G A; 1Q90 A; 1HNW L; 1L0W A; 1K9M C; 2V4D A; 3A8I E; 2F0N A; 3C1E A; 1Q82 C; 2A73 B; 2VB3 X; 1JJC B; 1MJE A; 4C3I G; 1CHQ D; 1SNM A; 3U4Z A; 4B3R Q; 3VR5 A; 4KJN A; 5JEA G; 4X3S A; 3MTS A; 3T1H Q; 1WJJ A; 1JC7 A; 2A69 C; 3Q23 A; 5CV5 A; 4HMJ A; 2DGY A; 1PRT C; 1PTO D; 2PQE A; 1TU2 B; 4LF4 Q; 3EN2 A; 1JWS D; 4K6L A; 3CW2 C; 1PXU A; 1VCI A; 4JI0 Q; 1TR5 A; 1ROD A; 3AFQ A; 5E4W C; 4MZ9 A; 3STB C; 4XDX A; 2GVA A; 2JA6 B; 5C6A A; 4IUU A; 1IZ6 A; 4AIM A; 2RHS B; 4R4O A; 5LHY 1; 3ULL A; 1BCP F; 1O7Z A; 1J9O A; 3M4P A; 4H02 A; 4XQJ A; 3QR8 A; 1BUV T; 1NNX A; 1RIP A; 5JVH 3; 4IFD H; 2UXD Q; 4KY7 A; 2MGS A; 1I94 Q; 2DN8 A; 5AJ3 L; 1FJG Q; 3PF4 A; 2B2W C; 3BYY B; 3AYH B; 3RN2 A; 1II3 A; 1JOK A; 4A75 A; 1N33 Q; 3HOY G; 4L5T A; 3CCM A; 3BZD B; 3TP6 A; 3K6O A; 1N8R C; 4JI2 Q; 3H3V I; 2PZW A; 1M8A A; 3M7G A; 4DPG A; 5J1Z A; 2TMP A; 5K5P A; 1P8L A; 2NVY H; 2ZTC A; 4FYD A; 2EZV A; 1G6P A; 4GOP A; 1CKN B; 3GTO H; 3S1R B; 3I4N H; 4X62 Q; 3RNU A; 2RF4 A; 3ERO A; 3QOJ A; 2ZT9 C; 3VYU A; 4DN4 M; 3HRZ C; 3ND8 A; 1F9Q A; 2DJG C; 2B2U A; 2OCE A; 2VQF L; 5IYD G; 1SYB A; 3A0J A; 4NP5 A; 2PI2 A; 1SE8 A; 5JPN C; 2GA4 B; 4GZY C; 4JI8 Q; 4R4C A; 5CV7 A; 4WJW A; 1GD7 A; 1NR4 A; 3AU7 A; 4X65 Q; 1KNE A; 3D6W A; 5LMU L; 4DR6 Q; 5IY0 A; 1KL9 A; 4UP9 A; 1Q8I A; 4LWC A; 4ALP A; 1C48 A; 4H13 C; 4IPD A; 5ELC A; 1I3Q H; 2X69 A; 4PZ8 A; 1Y69 U; 5GQO A; 1PH2 A; 1UEB A; 1YNN C; 3I70 A; 4WRD A; 1EIH A; 4HN7 A; 1KRT A; 1HH2 P; 3HOX B; 1F2L A; 4ABN A; 2EYM A; 1DGS A; 2VS1 A; 4IUQ A; 1ICF B; 2K5N A; 2JA9 A; 5ELB A; 3UE0 A; 3QOL A; 4H0L C; 1PFS A; 2X6G A; 3KJP A; 1B7Y B; 4UPA A; 3TME A; 5I6W A; 4JI6 L; 3WOF A; 4KLK A; 5IGC A; 3J81 L; 1EYD A; 4HED A; 2JK8 A; 2JA7 B; 3PUW A; 1EY8 A; 1QCB D; 4DR1 L; 2E76 C; 1XTC D; 4JI4 L; 4LF6 Q; 1VQA A; 3ONA B; 4OXP A; 4JC0 A; 5FKA C; 3PUV A; 3U9S A; 2WKC A; 1PH1 A; 3CP0 A; 4IJH A; 5IWA Q; 4JBJ A; 3JAM E; 4LFC L; 3K81 C; 3S15 B; 1H9M A; 4WJ4 A; 4QGU A; 3CC2 A; 1ZEQ X; 3I4M H; 4BA2 I; 1X3Q A; 1HTP A; 2F4I A; 2PCF B; 1BVS A; 2F0M A; 2AQ1 B; 3DHQ A; 2K5Q A; 3S1N H; 1PTO H; 1STY A; 3TZD A; 3D0F A; 1KAW A; 1EQT A; 2ICE C; 3M3Y H; 2X6L A; 1JWM D; 2AWN A; 1SEB D; 1N9W A; 1PTO F; 4DAV A; 4DV5 L; 1O7I A; 1BKB A; 1K8O A; 3IKJ A; 4YCW A; 1M4V A; 4MTN A; 2F0V A; 3VDY A; 3HOY H; 1BBU A; 2F0H A; 2K5D A; 2IL8 A; 3HGB A; 2A6H D; 1YBY A; 1CKO A; 5C3X A; 1RKN A; 3FEW X; 4QUC A; 1CT1 D; 4DR7 L; 1U4R A; 2K04 A; 2XSC A; 1QE6 A; 4XQN A; 1LTI D; 1T5E A; 3A54 A; 3K5L A; 4DXG A; 4RFB A; 1U9R A; 2R7F A; 4DV1 Q; 1KAA A; 1XMO Q; 2B2T A; 1XWE A; 1D7Q A; 2FJ2 A; 1FGB D; 3IRB A; 4RWS C; 4X6A H; 5D14 A; 3MXU A; 1Y1V G; 5C4Z A; 3KF8 B; 3J7A 5; 4JI1 L; 1WI5 A; 2A6E C; 2SDF A; 4Y7N H; 4C56 C; 3FP9 A; 5FK9 C; 4LF8 Q; 2I46 A; 4KJO A; 5EBC A; 4B08 A; 3RZD H; 1BNZ A; 3CKI B; 3H6M A; 4YWK A; 4AYB G; 4IOA A; 2WAQ B; 2QCP X; 4QL5 A; 1M90 C; 2KJX A; 2E74 C; 3KF6 A; 4KTA A; 4N8X 1; 5C0X I; 4CKB A; 1GHK A; 3PO3 B; 2AWO A; 1Y8P B; 4TSS A; 3KLS A; 2C35 B; 2GN5 A; 3F2U A; 1E2Z A; 1PFN A; 2NBF A; 2WAC A; 3W2D A; 4DR3 Q; 2VZA A; 1VF7 A; 1CZW A; 2VW9 A; 5KNB A; 4ODG A; 4YCV A; 2F0L A; 3F8T A; 1EWI A; 3K57 A; 1X3G A; 3CPW A; 4A3E B; 3BG3 A; 1DOM A; 4JOI A; 2E2I B; 4MN3 A; 2PMZ B; 4LUZ A; 1JE4 A; 2J0T D; 4DNI A; 2KEC A; 5ELE A; 2PNH A; 1CM9 A; 3W3A A; 2DJF C; 2K5H A; 3BVM A; 1I5F A; 1Y8N B; 4IZ8 A; 1R9T H; 1LTS D; 2HQE A; 1FGU A; 1LTA D; 4LF7 L; 1JJG A; 4IPC A; 4K5W A; 1J5E L; 5C4H A; 4NXM L; 4A93 H; 5FJ8 G; 4Q0F A; 2H4O A; 1GXD C; 3PIP 3; 2BH2 A; 2F52 A; 1PMR A; 1N36 Q; 1F9P A; 1H9S A; 2YU9 H; 2A68 D; 1KQS A; 4KN7 C; 1UE6 A; 3PO2 G; 4UY8 C; 5CV6 A; 3MHB A; 1IKL A; 2E75 C; 1JT8 A; 4IFD I; 1LAC A; 3N52 A; 4IUN A; 4NKL A; 4GNX A; 4JI3 L; 2HQL A; 1D1I A; 5DLQ E; 4PV1 C; 4OON A; 3R2I A; 1J8I A; 1UE7 A; 1VQN A; 3Q22 A; 4ID6 A; 3OSO A; 4ZRZ A; 1KAB A; 4A3K G; 1E1T A; 1PZI D; 3GTQ H; 5M5X H; 2F0U A; 4WFN 3; 3FDT A; 1ML0 D; 3UDX A; 4DV3 L; 1IL8 A; 3BYT B; 2A5H A; 2OT2 A; 1CK1 A; 1H9J A; 4HSP A; 4EQO A; 5JEA J; 1YIT A; 4P74 A; 2UXB Q; 3P7J A; 1FNV A; 1Q86 C; 2K4K A; 1VQ7 A; 3ICE A; 1XPO A; 1K73 C; 3T51 B; 4JI5 L; 1LTB D; 5CYU A; 1MD2 D; 4OGQ C; 4RMF A; 1NTG A; 2WB1 B; 2A74 C; 2EQS A; 1ZKO A; 2VXW A; 4GOP B; 2YTX A; 1VQ6 A; 3ITP A; 5KGU A; 4QB4 A; 3G71 A; 2PO4 A; 3NTH A; 4K5V A; 2CWP A; 3J80 L; 1SLJ A; 1PH4 A; 5ISR A; 5IYB G; 3FKI G; 5D3D A; 1TWF H; 3P20 A; 3PQI A; 2MPM A; 3T1Y L; 1Y1V H; 2DNE A; 5KYL A; 3KLR A; 2EPB A; 1HXY D; 2LXJ A; 2MJ8 A; 1GM5 A; 1QNK A; 3H94 A; 2EY5 A; 3NQT A; 5M5W H; 1NY4 A; 4C3I B; 5ELN A; 4EX5 A; 4OX9 L; 3CD6 A; 3IAY A; 2VL6 A; 1EZ6 A; 2ZXO A; 4A3C G; 2KEE A; 4DV0 L; 4ILW A; 1QZH A; 4G7O C; 3S1Q B; 2CVR A; 3H3V H; 2Z6B A; 5ELD A; 2NZO A; 5BN4 A; 2E5L L; 2B39 A; 1VDZ A; 4QIW B; 1JOR A; 2RCN A; 4DR2 L; 3SXH A; 4BBS G; 3EQL C; 2PQA A; 3E9H A; 5IGE A; 4A3M H; 1BQQ T; 4MTK A; 1X3F A; 5LL6 S; 2O2L D; 1HRJ A; 1YHB A; 2F4V L; 2F3W A; 1WTQ A; 5M5Y B; 1KIX A; 2Z4H A; 3BZK A; 4MIU A; 1ZYR D; 3TBI B; 3M3Y B; 5JJZ A; 1MHW C; 3P1H A; 4LAA A; 3ULP A; 1WCM B; 1D1K A; 3NWS A; 1PV4 A; 3GTP H; 5C0X G; 4NXN Q; 1EY0 A; 4GOP C; 1TY0 A; 2EDG A; 5FJ8 H; 4JK1 C; 2JA8 H; 5JJI A; 3HOY B; 4A3I H; 3B6Y A; 2B2U C; 1LT6 D; 4CDD C; 1SNP A; 3K0X A; 1IHZ A; 4HJA A; 4B3S Q; 2PPB C; 1KDB A; 3PO2 H; 1Q81 C; 2KCT A; 3CHB D; 2M2L A; 3QO2 A; 3WDN A; 4GKK L; 4CBV A; 3I8Z A; 3TP7 A; 1AZP A; 2H5X A; 5I6Y A; 5DEH A; 1A63 A; 2EYF A; 4CHT B; 1BCP D; 2N78 A; 3BDC A; 4J1M A; 1XXG A; 5C3W A; 4KV6 A; 2BA0 A; 3OIQ A; 2OQK A; 5IWA L; 4A3K H; 1K3B C; 4CJ0 B; 3LWU A; 3Q24 A; 2B29 A; 4RGM A; 4LF9 L; 2JA5 H; 1ENA A; 1QJO A; 1S40 A; 4R4T A; 1O78 A; 1B4O A; 1JR0 D; 2L5T A; 3LGJ A; 3OYY A; 1SRO A; 1ONL A; 1I4G A; 2NYZ D; 4M8A A; 4FNF A; 5M3F G; 1MKH A; 2EYP A; 4WOR A; 1B3Q A; 2JJQ A; 4PNY A; 3PIO A; 2PW5 A; 4G7Z C; 4DUY L; 1P16 A; 4RHS A; 4UP7 A; 2UUA L; 3PV0 A; 2NVT H; 4IFD G; 1EZ8 A; 1IYV A; 3FKI H; 4HIK A; 4RG1 A; 2L0C A; 1I6V C; 1OXT A; 5EKL A; 1JB3 A; 1OXS C; 2RDH A; 4DV2 Q; 2IHE A; 2QA4 A; 2IJ0 A; 3GTL H; 3HKZ E; 1VQK A; 1HPC A; 4LFA Q; 1UUP A; 2E2D C; 1AP0 A; 3DMU A; 5I9O A; 5C4J H; 1EY5 A; 4KHP L; 1F2Y A; 4A3C H; 2I5M X; 2FXQ A; 1S5E D; 4FF2 A; 3OWF A; 4HCS A; 1HNX L; 3GTG H; 1WD0 A; 3NHH A; 5FLX c; 1SMX A; 3I4N G; 3SHL A; 4QUF A; 3J81 E; 2CH4 W; 3GTJ H; 1EU3 A; 5EJW A; 5CBA E; 2H1E A; 4BBS H; 1V1Q A; 5IT9 c; 2D62 A; 3CCQ A; 1IBK Q; 1VF5 C; 1KHI A; 3MA2 B; 1B50 A; 2RDG A; 2LS0 1; 2XIW A; 1EOT A; 1QUQ B; 1KTK A; 1YZ6 A; 1VQB A; 3R2T A; 4AQY L; 4NB3 A; 4RH6 A; 1TWC B; 3OOC A; 2KED A; 5AFW A; 2OF1 A; 5C0X H; 1Q1E A; 5M5X B; 2B2T C; 3GTM H; 1SYG A; 4R8I A; 4HID A; 4POF A; 1XNQ L; 1VQP A; 1H9S B; 1I50 B; 2ENB A; 1IXR A; 1A8V A; 2F0O A; 1JOO A; 1ICW A; 2E2J H; 2Q2I A; 1TWA B; 4R4Q A; 2D0P A; 3KBG A; 5EAY A; 1NUC A; 2G9H D; 5DM6 3; 1BBX C; 1E1O A; 4JI7 Q; 3JC6 6; 3OIP A; 2ICI A; 2MQH A; 4U68 A; 1LLR D; 1XNR Q; 1PZK D; 2SNM A; 4DV7 Q; 3S2D B; 1ASY A; 3CMA A; 4DUZ Q; 2EJM A; 2YV5 A; 1Y1V B; 4K0K L; 1EFI D; 4QQB X; 1Y14 B; 3I3C A; 5IT9 L; 2AQ2 B; 2HIV A; 4AYB B; 5TSS A; 3I72 A; 5M5W B; 3W5O A; 4JVZ A; 3E5S A; 3SDZ A; 1W2B A; 4P73 A; 1X9N A; 5COR A; 3I4M G; 4J15 A; 4JOI C; 4A3F H; 2F0I A; 1SMY D; 3KJO A; 5M3F H; 3TDQ A; 3H09 A; 5K36 G; 1W3S A; 1CQF A; 1U5K A; 2C5C A; 5EPL A; 3RLF A; 3HZX A; 2Z6K A; 2DUD A; 1SYE A; 4A3B G; 4ME3 A; 1IBM L; 1KXL A; 1HR0 Q; 2B2V A; 4TQU S; 4S3S A; 4ZK9 B; 2CQA A; 1F2Z A; 2TSS A; 1IBL Q; 4POG A; 3I56 A; 1AW7 A; 3SR1 A; 1AEX A; 1IYJ B; 4ZLT F; 3S2H H; 5J39 A; 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