The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
86
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sequence length |
291
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structure length |
291
|
Chain Sequence |
EIISPHHYVYPNTTTLKNKYGIKNLNAFLEKCSHDTAKAMINLREESLPEYFDTAYLCHIHQQLFKNTFEWAGYLRHIPFTFADGTTAAMPEMKRTGWKNAFAIGDEIQEGLQRLDQTLAEKNNLQGLTREEFNSEAIELFNSLNQLHPFREGNGRTQRLFFENLAKAAGHQLNFSLITKERMMVASVAVAENGDLEPMQHLFEDISNPEKIRLLKEFMHTMKNTGRNVNDRPVMVAKEGETYTGTYRGAGLEGFALNVKGAYIIGNIDHLPPEQLKILKPGDKITFTAPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Fic Domain Catalyzed Adenylylation: Insight Provided by the Structural Analysis of the Type Iv Secretion System Effector Bepa.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Cell adhesion
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source organism |
Bartonella henselae
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molecule keywords |
CELL FILAMENTATION PROTEIN
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total genus |
86
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structure length |
291
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sequence length |
291
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chains with identical sequence |
B
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ec nomenclature |
ec
2.7.7.n1: Protein adenylyltransferase. |
pdb deposition date | 2008-07-17 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF02661 | Fic | Fic/DOC family |
A | PF18543 | ID | Intracellular delivery domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Fic-like fold | Fido-like domain | ||
Mainly Beta | Beta Barrel | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | Nucleic acid-binding proteins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4JI2 L; 5ELO A; 2NVT H; 4X62 Q; 1PVO A; 1KHI A; 2EQS A; 1AE2 A; 4A3C G; 1IL2 A; 4BY1 G; 1NBW A; 3F2B A; 2YU9 H; 4LUZ A; 1Z9F A; 2NN6 G; 1GKH A; 3K7A H; 4A76 A; 4KHP L; 5K36 G; 4IFD J; 2E2J H; 1EUJ A; 4A3J H; 4WJ3 M; 1NMF A; 4KI0 A; 1X9N A; 4A3K G; 3M4P A; 3TQY A; 3CCL A; 3G4S A; 2E2H H; 4AYB G; 4GNX B; 2ZJQ A; 4JI8 L; 2N78 A; 5CKL A; 4P75 A; 1V9P A; 3F2D A; 2IX0 A; 4YHH Q; 4DUZ Q; 1QVG A; 4XTC S; 4WGJ A; 1P16 A; 4A3F G; 2GVB A; 3ZC7 A; 5H1S E; 1HZA A; 4LFA L; 2JA8 H; 3KJP A; 3KF6 A; 2E8G A; 1V43 A; 1W2B A; 3I56 A; 4P73 A; 1HR0 W; 4DR7 L; 3U4V A; 4J15 A; 1Y14 B; 4B3M L; 4HIO A; 3GTP H; 1WI5 A; 1K83 H; 2Q2H A; 3L2P A; 1XNQ Q; 1XMQ Q; 1SR3 A; 5DLQ E; 5JEA J; 5IWA L; 1TWA H; 5LMU Q; 1EIF A; 1MKH A; 5GRO A; 4ALP A; 3OW2 A; 4QY7 A; 4X66 L; 3GTQ H; 3S1M H; 2I5M X; 4PZ6 A; 1C9O A; 3MEF A; 2ID0 A; 3SHG A; 3I4O A; 1L0W A; 4HIK A; 2E5L Q; 4JV5 Q; 3CCR A; 3KDF B; 1CKO A; 1NY4 A; 2D62 A; 5IY0 A; 2UXB L; 4LFB Q; 4PY3 A; 2K5N A; 3RLF A; 3OTO L; 4X2E A; 3A5Z B; 2NN6 I; 4DV0 L; 1VQ6 A; 4RMF A; 5IE8 A; 2CCZ A; 1J5E Q; 1L1O B; 1PH4 A; 4NXM L; 4JYA L; 3N3U A; 2QGQ A; 5BR8 L; 1R9T H; 3ER0 A; 1LTL A; 3HKZ E; 5M5X H; 5IT9 c; 1FJG L; 3AEV A; 3J7A 5; 2PI2 E; 1A0I A; 3FP9 A; 4Y7N H; 3M9B A; 4DV2 L; 4IOA A; 4LFC L; 3CCU A; 2XTI A; 2BH2 A; 1XMO L; 1JB7 A; 4QL5 A; 2UUB Q; 2AHO B; 4DR6 Q; 4JI0 L; 2VL6 A; 1PH6 A; 4LF4 Q; 3G48 A; 4P74 A; 3U50 C; 5IYD H; 4JBM A; 4GS3 A; 1M1K C; 1IBM L; 3G6E A; 2RCN A; 2UXD L; 1KRT A; 2DUD A; 5JJI A; 2EXD A; 5AJ3 Q; 4DV6 Q; 2F4V L; 3CCJ A; 4DR5 Q; 1I94 L; 3A5U A; 2CQO A; 2OTJ A; 3PUW A; 1E24 A; 4JI5 Q; 4HJ9 A; 5C0X G; 2JA7 H; 1VQK A; 3S14 H; 5HGQ A; 3HOW H; 5IYD G; 4H02 A; 4JC0 A; 1VQF A; 1YI2 A; 5EU0 A; 1JE5 A; 1PH7 A; 1HNZ L; 1D8L A; 4C3J H; 3HOV H; 1DGS A; 3JC6 6; 4BBS H; 2JK8 A; 3D0F A; 4XI8 A; 1PH5 A; 2AKW B; 1KQS A; 1SRO A; 1BBW A; 4R1J A; 1PH9 A; 3NEL A; 4HJ5 A; 4GLV B; 1BBU A; 2K52 A; 1XTD A; 1SE8 A; 2WAQ G; 3BZK A; 4JI1 L; 4APV A; 4LUO A; 1XJV A; 1K73 C; 1I3Q H; 4LF6 L; 1CUK A; 2R93 H; 1EFW A; 3HOV G; 5M3F G; 4QIW E; 5C4X H; 3CPW A; 2F52 A; 4HJ8 A; 1YIT A; 4L5R C; 1QUQ B; 4GNX A; 2IY5 B; 1PH1 A; 3CXC A; 5JJ6 A; 4IPC A; 2WB1 E; 3PGZ A; 1X3F A; 4DV1 L; 3B6Y A; 1XPR A; 3ERS X; 4U04 A; 1UE6 A; 2OCE A; 1UE5 A; 3PO3 H; 1VQA A; 1N33 L; 4A93 H; 4BBR H; 2IHE A; 2VQE L; 2Y0S E; 1X55 A; 4DR1 Q; 2R93 G; 3KOJ A; 2I0Q A; 4PZ8 A; 2ZTE A; 1Y1W G; 1VS0 A; 2YTY A; 3TS0 A; 4OWW B; 5C4X G; 3CCS A; 4HJA A; 2N3S A; 3CMA A; 2MQH A; 4DR3 L; 3CP0 A; 4A3I H; 3UDI A; 2JA5 G; 2UU9 Q; 2I5L X; 4DR2 L; 4B3R Q; 1HNX Q; 4LF7 L; 3ZLM A; 3W5O A; 3PO3 G; 1TWC H; 4A93 G; 1BKB A; 2NZH A; 4BBR G; 1Q7Y C; 1BVS A; 2IHF A; 5C0X I; 3KFU A; 3GTG H; 4LF8 Q; 1KRS A; 1OXT A; 2BH8 A; 4DPG A; 5IYC H; 4BY1 H; 2KHI A; 1D7Q A; 3GO5 A; 4GOP C; 4HID A; 2IX1 A; 2Z0S A; 2RHQ B; 3KDF A; 4JI3 L; 2F3I A; 4A3I G; 4YY3 Q; 1IBK Q; 3CC2 A; 4GKJ L; 1IYJ B; 1NE3 A; 1G29 1; 4AQY Q; 4P72 A; 3ULJ A; 1YJ9 A; 4DV3 L; 1L1O A; 1SLJ A; 4A3K H; 1M90 C; 1PH2 A; 3RZO H; 4GKK Q; 2UUA L; 2LXJ A; 4PMW A; 5IYC G; 4XIG S; 5HY6 A; 1TXY A; 3NBH B; 5JFF A; 1B70 B; 3FKI H; 4LWC A; 2IT1 A; 4PZ7 A; 3UDF A; 4DV7 L; 1Q1E A; 4ME3 A; 4EX5 A; 1XPO A; 4JBW A; 1FL0 A; 4DAY B; 4DR7 Q; 1ASY A; 4MNO A; 2R92 G; 4BY7 G; 4A3F H; 4U0U A; 2K5H A; 4NXN L; 1FGU A; 5JJ7 A; 1I5F A; 1Q12 A; 3J80 c; 5M5W H; 4EQ5 A; 1XNR L; 3FKI G; 1VQ8 A; 2L15 A; 2UUC L; 4OWT B; 1YJW A; 1GD7 A; 1E1T A; 4JG2 A; 2R6G A; 2BA0 A; 2CWA A; 1Q46 A; 1JJ2 A; 2JEA I; 3RLN A; 1Y1V H; 3CCV A; 3CCE A; 1N36 Q; 2N8N A; 1IZ6 A; 4MZ9 A; 5GQO A; 2K50 A; 1N34 L; 1S72 A; 1QVF A; 4JBK A; 3PUY A; 4UPA A; 4X64 Q; 2ZJP A; 2A8V A; 1C0A A; 2B29 A; 1B8A A; 1X54 A; 3GD7 A; 1U0L A; 4OXP A; 1PV4 A; 3F8T A; 3G71 A; 1MJC A; 3DM3 A; 3K8A A; 3KF8 B; 4LW1 A; 3T1Y L; 1QZH A; 2ZJR A; 1OTC A; 1TWH H; 4K0K L; 1K0R A; 4LF9 Q; 1Y1V G; 5IYB G; 2WFW A; 1HJP A; 4X65 Q; 2LSS A; 2VQF Q; 4TQU S; 4DK3 C; 1VQN A; 4DUY Q; 1YNX A; 2MO0 A; 2VNU D; 3SE5 A; 4LF5 Q; 2ZM6 Q; 3M85 A; 4X62 L; 3K0X A; 4DKA C; 1QUQ A; 2JA9 A; 1OXS C; 4O0A A; 2D0O A; 3ICE A; 1X6O A; 2F4V Q; 1Z47 A; 5ELN A; 2B63 H; 3RN5 A; 3M7N A; 1N32 L; 2JJQ A; 3A74 A; 2LXK A; 2VUM H; 4R4O A; 3CC4 A; 2KBN A; 3F1Z A; 3TRE A; 3KLW A; 3CME A; 4DR4 Q; 1K8A C; 3D31 A; 3ULL A; 3W1G A; 5M3M H; 1E22 A; 3PIO A; 4A3M H; 1IBL Q; 3MXN B; 2AWO A; 4DV5 Q; 4IPH A; 1N9W A; 2B63 G; 3H0G G; 1WOC A; 1K8G A; 5LMN W; 1HR0 Q; 3K81 C; 4A3E H; 2VUM G; 4DUZ L; 1V1Q A; 1E7Z A; 5IP9 G; 2ATW A; 2WP8 J; 4L5Q A; 2Z6K A; 1X3G A; 1HH2 P; 5M3M G; 2HHH Q; 4A3M G; 1E3P A; 4OO1 G; 1OXU A; 4DV4 Q; 3BZC A; 5C4J H; 4OX9 Q; 3A0J A; 2HT1 A; 5EAY A; 1A63 A; 2MFI A; 1I50 H; 2OQK A; 4A3E G; 4UP9 A; 4A75 A; 4X2C A; 1XNQ L; 4YWK A; 5FJ8 H; 1KL9 A; 1XMQ L; 1XPU A; 5LMU L; 2NZO A; 1PH8 A; 5M3F H; 3ULP A; 4JI7 L; 2F6S A; 2C35 B; 4R4Q A; 3F2C A; 3E0E A; 3CD6 A; 2E5L L; 3PIP A; 5CGL A; 3VDY A; 3S15 H; 1MIU A; 2NVY H; 4B3S Q; 5FJ8 G; 5GAE C; 2JQO A; 4JI4 Q; 4B3T Q; 3HKZ G; 1Y1W H; 3FHW A; 3W1B A; 1J5E L; 1K9M C; 3M3Y H; 3M4O H; 4L5S A; 2XGT A; 1QZG A; 2R7Z H; 4OON A; 4LNQ A; 1VQC A; 1K3R A; 2PMZ E; 1OXV A; 2JA5 H; 4DNI A; 3CCQ A; 2A19 A; 2YTX A; 1EOV A; 1C7Y A; 3L7Z C; 1HNW Q; 3OYY A; 1I6H H; 2KCM A; 4GNX C; 4JI6 Q; 4JI2 Q; 3PCO B; 3J81 j; 3PUZ A; 2UUB L; 4L5T A; 1TWF H; 3EIV A; 4GN3 B; 5E7N A; 4LF4 L; 3I4N H; 1JT8 A; 2R7Z G; 3CC7 A; 1PHJ A; 4U07 A; 4LUV A; 2B3G A; 4OO1 I; 4YCU A; 1Q81 C; 4KHP Q; 1U5K A; 4A3D H; 4IOC A; 2MNA A; 5C0X J; 2K75 A; 1YHB A; 5AJ3 L; 4DV6 L; 1OXX K; 1UE1 A; 3M4Q A; 3NEM A; 4DR5 L; 4KLK A; 1VQO A; 1GVP A; 4NXN Q; 4JI5 L; 1X65 A; 3I4N G; 3I4M H; 5LMN L; 2NVQ H; 2NVX H; 3E9I A; 4IFD G; 4A3B G; 4YWM A; 1XNR Q; 2R7F A; 1HZB A; 1VQJ A; 3NEN A; 1VQ7 A; 3PF5 A; 4QJF A; 4JI8 Q; 2Q2U A; 1YZ6 A; 1EQQ A; 4AYB E; 3UDG A; 4A3D G; 2R92 H; 4BY7 H; 1N8R C; 3ZCB A; 2KCT A; 3T1H L; 3J81 i; 4UY8 C; 2PQA B; 1JMC A; 4JOI A; 2OTL A; 2V1C C; 3I4M G; 2CWP A; 4LFA Q; 1SFO H; 1KIX A; 1GO3 E; 5J3B A; 2K14 A; 1YHA A; 3PSI A; 4GLA C; 1L1O C; 4N67 A; 1NJI C; 4B3M Q; 2VZA A; 4IO9 A; 3S1N H; 4IJL A; 2A1A A; 2WB1 G; 1YJN A; 4IJH A; 1SMX A; 3GTM H; 5IWA Q; 1NMG A; 2Y0S G; 3HOU H; 2CKZ B; 3PO2 H; 2I5H A; 1CKN B; 4X66 Q; 4HJ7 A; 1PA6 A; 1G6P A; 5JEA G; 1KC8 C; 1UWV A; 3AYH B; 4DR1 L; 3RZD H; 4P71 A; 3STB D; 1Q8K A; 1PH3 A; 1SRU A; 4PG3 A; 2UXB Q; 1KXL A; 2RHS B; 1VQE A; 1X3E A; 5CMT A; 3GDE A; 3CPF A; 2KHJ A; 4NB3 A; 3U4Z A; 5IYB H; 3OTO Q; 4DV0 Q; 5JJL A; 2VY3 A; 2AMC B; 2VS1 A; 2UU9 L; 1ASZ A; 3HOU G; 3PO2 G; 4NXM Q; 4JYA Q; 4B3R L; 1N32 Q; 3UDX A; 5BR8 Q; 1HNX L; 3AQQ A; 1Q1B A; 1WCM G; 1FJG Q; 3I2Z A; 1JJC B; 2K5V A; 3IRB A; 4GN5 A; 5M5Y H; 5FLX c; 1S3O A; 4LF8 L; 4IFD I; 4DV2 Q; 3TS2 A; 4LFC Q; 4TVA B; 5JFZ A; 2UXC L; 3ZJY C; 2Q2I A; 3K80 C; 1XMO Q; 4RG1 A; 4U0S A; 1WJJ A; 2ALY B; 4QGU A; 1EYG A; 2RF4 A; 4YY3 L; 3L0O A; 1LM0 A; 3Q8D A; 4NPS A; 3PUV A; 1NTG A; 1IBK L; 1PFS A; 4JI0 Q; 4HIM A; 4AQY L; 3I55 A; 3TRZ A; 4A3J G; 1LYL A; 1W3S A; 1IBM Q; 3S24 A; 1WYD A; 4C3H H; 4GKK L; 2UXD Q; 4IPD A; 3GTO H; 3AFP A; 4YCV A; 3RNU A; 1VQP A; 3GTL H; 4M16 A; 4R4C A; 4FDB A; 4POG A; 3CAM A; 1I94 Q; 3HKS A; 3PF4 A; 1VQH A; 3H0G H; 1VQ9 A; 2PI2 A; 2QEX A; 3S17 H; 4A3G H; 2PNH A; 5IP9 H; 4BA2 I; 3J81 c; 3PUX A; 4GOP B; 1Q86 C; 2ES2 A; 2R7D A; 3S1R H; 1YIJ A; 1HNZ Q; 1VQL A; 3RLO A; 2DGY A; 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