The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
PFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGMDYWIVKNSWGTGWGENGYFRIRRGTDECAIESIAVAATPIPKL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Cathepsin C Inhibitors: Property Optimization and Identification of a Clinical Candidate.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
DIPEPTIDYL PEPTIDASE 1 EXCLUSION DOMAIN CHAIN
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| total genus |
8
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| structure length |
68
|
| sequence length |
68
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| chains with identical sequence |
F, I, L
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| ec nomenclature |
ec
3.4.14.1: Dipeptidyl-peptidase I. |
| pdb deposition date | 2013-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | Cysteine proteinases. Chain C |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4CDE C; 4CDF C; 4OEL B; 2DJF C; 2DJG C; 1K3B C; 4CDD C; 1MHW C; 4CDC C; 4OEM B; 1ICF B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1D8L A; 2AWO A; 1RDP D; 1IL8 A; 1E22 A; 1NAP A; 4LFB Q; 4A3G G; 2K5V A; 2PMZ E; 4DUZ Q; 4S3S A; 1EY8 A; 2YYZ A; 4EVO A; 4DNI A; 1D5Z C; 2ZTE A; 4O42 A; 3ULJ A; 3CD6 A; 1GJX A; 1SFO B; 3MVV A; 1PA6 A; 4R8I A; 4PV1 C; 1PLF A; 4RCO A; 1K73 C; 1LT6 D; 3SK5 A; 2Q2U A; 2JN4 A; 1V9P A; 4A3E G; 5M9O A; 1XTC D; 2AQ3 B; 4GLV B; 3ZYY X; 2WKD A; 5KND A; 4QUC A; 5KNC A; 5IYD G; 1BF4 A; 3PF5 A; 2DY7 A; 2WV6 D; 2Y0S B; 3WWV A; 2F0V A; 2ZM6 Q; 1OXU A; 5DM6 3; 4A3J H; 2WB1 E; 4CDD C; 1PDQ A; 2B2V A; 4UP8 A; 3NPP A; 4A3C H; 2A6H D; 1AH9 A; 4X3T A; 2R93 G; 1DCZ A; 4Q0F A; 4BY1 G; 3D0F A; 4X66 L; 4FNF A; 2E8G A; 3D3R A; 1JB7 A; 3PUW A; 1LT4 D; 3HP3 A; 1ESF A; 1SYF A; 4QQB X; 1OO9 B; 2F3I A; 4CHT B; 4KV6 A; 1EYD A; 3CQZ H; 4LF5 Q; 4BBS G; 4MHE A; 2E2J H; 4XYO A; 2ATW A; 1SJE D; 3Q22 A; 3UDF A; 1IXR A; 1PFS A; 1I4Q A; 2WB1 G; 1WD0 A; 3M4O B; 4WJ3 M; 3OMG A; 2VQE Q; 1CA6 A; 4P73 A; 1IW7 D; 1YI2 A; 4K6D A; 5E4X A; 3FP9 A; 3MXG A; 2K5D A; 1WTR A; 1VQL A; 1X32 A; 5G3L D; 1QG7 A; 2V4D A; 1B50 A; 3WOF A; 5JEA J; 2RDF A; 3NQT A; 1PYB A; 3DUZ A; 2CW0 D; 2B63 H; 3MXN A; 4UPA A; 3TEH B; 3B6Y A; 1NMF A; 5IOC A; 1LTT D; 4C2M H; 1FNV A; 2L5T A; 2ZTD A; 1XMQ Q; 1HZ9 A; 1K8O A; 3LNN A; 1IBM L; 3U4Z A; 1BCP B; 1VQD A; 2I07 B; 1VDZ A; 1RD9 D; 4IFD H; 2QIL A; 5E7N A; 5I9P A; 1ENC A; 2NZH A; 2B2U A; 5IE8 A; 4DV2 L; 3CQZ B; 4IPG A; 2ZXP A; 4P72 A; 2EQS A; 1SYB A; 1R4P B; 1Q1B A; 3U58 A; 3UE1 A; 4QUF A; 1H9R A; 4PQX A; 5LMU L; 4FXD A; 4XIG S; 1FVI A; 4QIW E; 3EIV A; 1ASZ A; 1Q46 A; 3E0E A; 2I5L X; 3VR4 A; 1EY9 A; 2K01 A; 3RD4 A; 4IUP A; 4LF7 L; 3QWN A; 3M4Y A; 1E7Z A; 4KKU A; 3VDY A; 5FKA C; 3NXW A; 3PO3 H; 3AYH B; 4O0A A; 4C2M B; 1QZH A; 1RJT A; 1SYC A; 3M4Q A; 1SNQ A; 1JQY D; 4IOA A; 2P5Z X; 2J0T D; 2XRQ D; 2XWB B; 3H3V H; 3K59 A; 4IUR A; 3CME A; 2K52 A; 4OX9 L; 4DV2 Q; 1C9O A; 5CBA E; 1I6V C; 4A3I G; 1S40 A; 4B3M L; 4NXM L; 2IY5 B; 3PSI A; 4GNX B; 4RA8 A; 1O7I A; 5C4H A; 2Q8R E; 4R4O A; 5JVG 3; 1UEA B; 4QMG A; 2LKV A; 3SXH A; 1K9M C; 1VQA A; 1A62 A; 4XQJ A; 2R92 B; 4JV5 L; 5CGK A; 1IBL Q; 3KF8 B; 1I4P A; 5C44 B; 4HAE A; 5LMU Q; 5JJK A; 4CDE C; 1HQR D; 1V8Q A; 5GAE C; 5K36 G; 2CHB D; 2SOB A; 3P75 A; 3HOY B; 2B2U C; 2PQE A; 3J80 i; 3HGB A; 1GHK A; 3CC7 A; 4LUV A; 1LT5 D; 4LF7 Q; 2AQ1 B; 4CJ2 C; 3BG3 A; 4A75 A; 3VYR A; 2F1M A; 1QUQ A; 2F4I A; 2DN8 A; 2MHV A; 2YTV A; 4L63 B; 1Y1V H; 4KN7 C; 3A8K E; 4Y52 H; 1X55 A; 1E3P A; 3PO3 B; 4YCW A; 1A2U A; 1LT3 D; 2CWA A; 4OX9 Q; 3E3X A; 1HNW Q; 1TWA H; 1K0R A; 1LTR D; 3I56 A; 3HG9 A; 4I7A A; 4B3M Q; 4NXM Q; 4OHJ A; 2JA5 H; 5IP7 H; 1SAP A; 4DR6 Q; 4OO1 G; 3RLF A; 1KRT A; 5C5L A; 4HJ7 A; 4JV5 Q; 4O1N A; 1PYW D; 5EKL A; 3I72 A; 1SRU A; 4BBR H; 3GP7 A; 1C8C A; 2IHF A; 3CPF A; 4FXG C; 4ZRZ A; 3ND8 A; 5KIX A; 1B1Z A; 2UUB Q; 3A5Z B; 4ULL A; 2JA8 H; 2ZJP A; 4DV7 Q; 1D5X C; 4H44 C; 4IN3 A; 4XQQ A; 4IQZ A; 2NWG A; 3CU7 A; 5DM7 3; 3OIP A; 5I6W A; 2PCF B; 1Y1V B; 3N6R A; 2BDO A; 3MA2 B; 2F0M A; 1G6P A; 1UEB A; 3QOJ A; 4PZ6 A; 1UE6 A; 3HKS A; 5ELC A; 3HS0 C; 4KHZ A; 2MJ8 A; 1TWA B; 4MTN A; 2ALY B; 3P1H A; 1U4P A; 3NE5 B; 1JIC A; 1VQF A; 2BDN A; 4OEL B; 2JA5 B; 4X64 L; 2XVS A; 3PUY A; 2K75 A; 2K4K A; 3D6C A; 1DON A; 3KDF B; 2FXQ A; 2I5H A; 4POF A; 1V1P A; 4C3H H; 2QDB A; 3GTG B; 2XNA C; 3S2H H; 1CA5 A; 4JI0 L; 1HZA A; 2VS1 A; 3GQB A; 4DAP A; 1TWF H; 4BBR B; 2PYK A; 5J39 A; 1WTQ A; 1QVG A; 4HJA A; 1IYU A; 3J7A 5; 4G7Z C; 5CV4 A; 2ZXO A; 2VB3 X; 4A3G H; 1UUP A; 1EU3 A; 2EYF A; 5T1I A; 3S2D H; 5D3I B; 2N8N A; 5EQ0 A; 2L0C A; 1WTP A; 3NBH B; 1Y8O B; 4OWT B; 2IT1 A; 2E74 C; 3K8A A; 1W3S A; 4IUU A; 5DEH A; 4A3E H; 4B9X A; 2QEX A; 4JPB W; 4CJ1 B; 4A3K H; 2JSO A; 2L4N A; 2ICE C; 4IO9 A; 2KUM A; 4DV6 L; 1L1O A; 1II3 A; 2M9V A; 1XNQ L; 1EY0 A; 3CCV A; 1SYD A; 3V2T A; 1BBX C; 2EIF A; 1V1O A; 1ROD A; 2R93 H; 1EL0 A; 1S5C D; 2K33 A; 2L15 A; 2R7F A; 5IT9 L; 4IOC A; 4C3H B; 3S2H B; 5KNB A; 3I4N H; 3J81 L; 1EY6 A; 1KRS A; 2RCF A; 4XT3 B; 4BA1 I; 2OWO A; 5LHY 1; 1JJG A; 1PFN A; 3A8J E; 1PHJ A; 4A3G B; 5LMN W; 4CDC C; 2Q8T A; 2UXB L; 1O80 A; 3S2D B; 4C3I G; 2CQA A; 2K1B A; 1HUM A; 2EY1 A; 2MUY A; 1LAC A; 1J9O A; 4R4T A; 3TDQ A; 5JVH 3; 3G4S A; 1RF2 D; 3CP0 A; 3H3V C; 1STY A; 1EIG A; 3K6O A; 2BA0 A; 4RGN A; 3H6M A; 4A3E B; 5FOB B; 1RKN A; 2RKS A; 4RG1 A; 2QF7 A; 3CCM A; 1VQ5 A; 2OTJ A; 1JOR A; 3L7Z C; 1ENA A; 1PH4 A; 4A3K B; 1IL2 A; 1Q86 C; 1JCK B; 4FF1 A; 1OXV A; 3E9I A; 2RBM A; 2KCN A; 3AB9 A; 5IT9 c; 4LFA L; 5J22 A; 1HUN A; 3OTO L; 3J81 c; 2KCT A; 2H5X A; 2K6A A; 3W1B A; 2PI2 E; 2VZA A; 5BN4 A; 2DGY A; 4JI2 L; 3SEB A; 1HR0 L; 2K04 A; 1LYL A; 3GTO H; 1NJI C; 3I4N B; 4DKA C; 5C4X B; 2Z0S A; 2UXD Q; 3UDX A; 4UP9 A; 2NN6 I; 5IGD A; 2OQK A; 4LFC Q; 2R92 G; 3T1Y Q; 2LMC B; 1J6Q A; 2WFW A; 5C44 G; 1F2M A; 1VQI A; 3CMA A; 5IT9 E; 1VQP A; 2EYO A; 5FLM G; 2HCI A; 1I6H H; 3HOY G; 3S1Q H; 3J81 E; 4DR3 Q; 3HOX B; 3VYU A; 5M5W B; 2CFM A; 1SJH D; 2I5M X; 1EOT A; 2B3G A; 3CCU A; 2AHO B; 1SE8 A; 4ZK9 B; 4V0B A; 1WTO A; 3V96 A; 3CW2 C; 4BWG B; 3CCQ A; 1H9S B; 4DUY L; 2RA4 A; 3IL8 A; 3KUP A; 1N9W A; 4MTK A; 4APV A; 4P74 A; 3CXC A; 1CTM A; 4DR7 Q; 1K28 A; 1UAP A; 4JG2 A; 5ELO A; 1KIX A; 3PO2 H; 4ILW A; 4R4C A; 3PO3 G; 2LY7 A; 4NPS A; 4DR1 L; 5ISR A; 1ET9 A; 4QJF A; 1SRO A; 3PV0 A; 3TP8 A; 4ZKC B; 5D14 A; 1N33 Q; 1A8V A; 1VCI A; 2X69 A; 1BBU A; 1HRJ A; 1HR0 Q; 5ELN A; 4DGZ A; 3M7G A; 3CRK C; 1HPC A; 1YNX A; 3TP7 A; 2N3S A; 1WTH A; 5C5M A; 1KDA A; 2EYL A; 3K57 A; 3GTO B; 1KNA A; 2M00 A; 3NHH A; 1CZW A; 1YVC A; 2HIX A; 4UHV A; 2MO0 A; 4LF4 L; 1XNR L; 1DM0 B; 1QE6 A; 2N49 A; 3WOE A; 4A3L G; 1VQ4 A; 1M8A A; 1U5K A; 2ES2 A; 5KYL A; 4YIJ A; 3VYS A; 4A3M H; 3LX0 A; 2HUG A; 1XPU A; 3S1Q B; 3EJI A; 4Y7N H; 4EQP A; 4DF7 A; 5M5X H; 4ODG A; 4DUY Q; 1G6Z A; 3T4A C; 4GLA C; 4RH6 A; 1VF7 A; 2Q2T A; 1ESR A; 2HCC A; 1A3T A; 1QNK A; 2RDH A; 1FR3 A; 2EJG C; 1L2F A; 1STG A; 1B9M A; 1E2W A; 2UU9 Q; 4DR1 Q; 1KQS A; 4NDX A; 1GXD C; 1TII D; 1NBW A; 3PO2 B; 3RMH A; 2HT1 A; 2NVT H; 2Z6K A; 4DR5 L; 4YWM A; 5IGE A; 2QW7 A; 2FFK B; 3IRB A; 3MXP A; 2HD3 A; 2JA5 G; 4NXN Q; 3STB C; 3HOZ H; 4GS3 A; 4C3J G; 2D2C C; 3MWY W; 1F2L A; 2VQF L; 1XNR Q; 1VQB A; 4KHP L; 1UE5 A; 1LUZ A; 4OO1 H; 2AWN A; 2N78 A; 3F8T A; 3K0Y A; 3QG1 A; 5I2Y A; 2EXD A; 1JC7 A; 4BBR G; 1VQ9 A; 3C1E A; 1VQN A; 1KLU D; 1PXU A; 4UDU C; 4PMW A; 4A3M B; 3EA6 A; 3CPW A; 3RUZ A; 1SMX A; 3VR6 A; 1EFW A; 5JPM C; 4ZQ3 A; 1IBK L; 2YU9 H; 1DOK A; 2ZTC A; 4Y7N B; 4X65 Q; 5M5X B; 4R4I A; 4JI7 Q; 3G7L A; 3SK8 A; 4XYQ A; 5C4Z A; 3S15 H; 1VQ8 A; 1C0A A; 2F4V Q; 2K14 A; 2HHH L; 1ICF B; 2MP1 A; 1AW7 A; 3K5L A; 5I9O A; 1PRT F; 2MNA A; 1DXM A; 2E75 C; 3VA5 A; 2NVT B; 1PRT B; 1KL9 A; 3NP8 A; 3A8I E; 2KOL A; 4JW0 A; 1NY4 A; 3JAM L; 1F77 A; 1K3R A; 1PH5 A; 3Q6S A; 1TS5 A; 1U0L A; 5M3M H; 2F0O A; 3HOZ B; 4KHP Q; 4BY7 H; 2F0J A; 3HOU G; 1B8A A; 2XSC A; 2EY2 A; 2SNS A; 4IPC A; 3MXU A; 3MFY A; 1O7L A; 4C3H G; 2Z6K C; 3BS1 A; 2LXJ A; 4ZYS A; 3BYY B; 1EY5 A; 1JE4 A; 4C1N I; 4DK6 C; 4LUO A; 3GTM H; 3KF6 B; 2YU9 B; 3HOV G; 2ENB A; 3OHX C; 1TU2 B; 3G48 A; 2VW9 A; 2HIV A; 4CJ0 B; 3M4O H; 3S15 B; 3GTQ H; 4ID6 A; 5C4J B; 5BR8 L; 1Q7Y C; 4HIK A; 2VUM H; 3AMU A; 1Z7T A; 2UUC L; 3I70 A; 2RSO A; 4K0K L; 2F0U A; 1PH3 A; 1A3U A; 2HDM A; 4JK1 C; 2D0O A; 3S16 H; 4A3K G; 2PW7 A; 1UNS A; 4HCS A; 3SHL A; 2RDG A; 3BDC A; 1W2B A; 1N32 Q; 4DK0 A; 1EYC A; 5EGT A; 5CYU A; 3VA7 A; 1O7Y A; 1Y14 B; 3I4O A; 5M3M B; 5HY6 A; 4BY7 B; 1NR2 A; 2J4X A; 1Z6H A; 2CCZ A; 4ZCK A; 5KGU A; 1B7Y B; 1ASY A; 3WDN A; 1TXY A; 2A73 B; 3EVQ A; 1N34 Q; 3PGZ A; 3NQI A; 4C1N K; 4DV4 L; 1CZG A; 3I4N G; 1KLG D; 5C4X G; 1CQV A; 3MC0 B; 3JAM E; 3CCE A; 2WAQ B; 4F88 A; 3BVG A; 1KAW A; 4DFA A; 1EUJ A; 1BO0 A; 4J1M A; 3GTM B; 4JI3 L; 1D1I A; 3S24 A; 4FP5 D; 5BR8 Q; 4KTA A; 5H1S E; 3HOX G; 3SE0 A; 2UUC Q; 3DWP A; 2NUC A; 3GTQ B; 2VNU D; 4C3I H; 5CBE E; 4HED A; 2VUM B; 3I3C A; 2A6E C; 1TKW B; 2E2H H; 3KF6 A; 2WP8 J; 4G57 A; 2TSS A; 3RR5 A; 3RZD B; 5LL6 X; 2RVL A; 5E1F A; 4H0L C; 4K14 A; 3S16 B; 4XT1 B; 1R4Q B; 4MIU A; 1A15 A; 5A2Q L; 2KHJ A; 3NTI A; 3KJO A; 5GRO A; 4L5Q A; 4X66 Q; 1MBY A; 2FIN B; 3L2P A; 1N8R C; 1FJG L; 3HKZ B; 5FJ8 H; 1YNN C; 2Z8L A; 4N9T A; 4DV4 Q; 3W1G A; 3QR8 A; 4BA2 I; 5COY A; 1BCP F; 5EPJ A; 3KBG A; 2GVB A; 2D9U A; 4F7X A; 4JOI A; 1VF5 C; 3C46 A; 1HTL D; 4JI5 L; 3NTK A; 1VQO A; 1K8G A; 3W3A A; 3RLO A; 1WOC A; 2EDG A; 2NTT A; 1J5E L; 2ZXR A; 1Q3L A; 1SLJ A; 1HNZ L; 2EY6 A; 3VR5 A; 1R9T H; 3OPO A; 3TP5 A; 3M9B A; 3I8Z A; 1RHP A; 1WYD A; 4EQ5 A; 4R1J A; 1HQM C; 1PRT C; 5IGG A; 2R92 H; 4CKE A; 2V1C C; 3SR1 A; 2PW5 A; 5C44 H; 4C3I B; 4KD3 A; 5FLM H; 3CC4 A; 1A63 A; 3HOY H; 2E2H B; 1LTB D; 1KHI A; 2YTY A; 2CQO A; 2X6L A; 4NB3 A; 1CQF A; 1JWS D; 4DV5 L; 3S1R H; 5IIF A; 1QWY A; 1VQE A; 4FF2 A; 2MO1 A; 3ERO A; 3PO2 G; 3OSO A; 1YIJ A; 4B9W A; 3TZD A; 3ONA B; 4L6T B; 3J81 i; 4KMU C; 3P7J A; 1AZQ A; 3TBI B; 2ID0 A; 5C0X I; 3I2Z A; 2A68 D; 2TMP A; 4X62 L; 1IBM Q; 2R3Z A; 1CK1 A; 4JI5 Q; 1K0S A; 3TME A; 1HNZ Q; 5A2Q E; 1PYS B; 3A55 A; 5D65 A; 2B2W A; 1R9T B; 2DJF C; 3R2I A; 1SSO A; 5BN5 A; 4WFN 3; 4A3M G; 1LLR D; 1PMR A; 4A3L H; 4QGU A; 4OIK A; 4A3F H; 5IGB A; 4JOI C; 4XQN A; 4GLX A; 1B44 D; 4X3K A; 1SE4 A; 1EYG A; 3T56 B; 2ICI A; 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