The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
PFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGMDYWIVKNSWGTGWGENGYFRIRRGTDECAIESIAVAATPIPKL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Cathepsin C Inhibitors: Property Optimization and Identification of a Clinical Candidate.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DIPEPTIDYL PEPTIDASE 1 EXCLUSION DOMAIN CHAIN
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| total genus |
7
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| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| chains with identical sequence |
F
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| ec nomenclature |
ec
3.4.14.1: Dipeptidyl-peptidase I. |
| pdb deposition date | 2013-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | Cysteine proteinases. Chain C |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4CDF C; 1MHW C; 1ICF B; 4OEM B; 2DJG C; 4CDC C; 4CDD C; 1K3B C; 2DJF C; 4CDE C; 4OEL B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FF2 A; 1ASZ A; 5ELD A; 5ELE A; 1K8G A; 3BVZ A; 2EYO A; 1YHA A; 3K7A B; 5C0X J; 1TY0 A; 4JBK A; 3IRB A; 4GN3 B; 1O80 A; 1CHQ D; 2BE5 C; 4ME5 A; 4DR3 Q; 5IGG A; 3SVM A; 3FMC A; 3KF8 B; 5IOD A; 1V8Q A; 1IBL Q; 4KD4 A; 3HOY G; 4BY1 G; 1Y1V B; 2F0H A; 3GV3 A; 3HRZ C; 4JVZ A; 3T53 B; 2Q2H A; 4JI0 L; 2LXK A; 1Q8I A; 5EBD A; 4RKL A; 3GV6 A; 1LUZ A; 1MGS A; 3PUX A; 2F3I A; 1E22 A; 3QG1 A; 2NVT H; 1NNX A; 3J7Z C; 4PV1 C; 4WOR A; 2RKS A; 4RFB A; 3S14 H; 3X3M A; 3MHB A; 4PMB A; 3CRK C; 4X64 Q; 1PH2 A; 5COY A; 2HQE A; 3A7A B; 1C4Q A; 2E2H H; 1SRO A; 1PRT D; 5IWA L; 1A6X A; 2QDB A; 2SOB A; 1LTT D; 2C5C A; 2O2L D; 1EYD A; 1SND A; 1PYB A; 2EXZ A; 5DLQ E; 1YNN C; 4JBW A; 4ODG A; 2NVX H; 4QUF A; 4LFC Q; 5K36 H; 1EY6 A; 1HFN A; 4NMZ A; 2IY5 B; 3Q22 A; 2C9O A; 2F0D A; 3F8T A; 1EY7 A; 3J7A V; 1WD0 A; 4V0B A; 4HJ7 A; 5ELB A; 3KLS A; 1D7Q A; 1SFO B; 2ZJR A; 1DON A; 3CCL A; 3I4N B; 4CJ2 C; 4HSV A; 1FNV A; 1ILP A; 1CQV A; 2DUD A; 1VQO A; 3GTG B; 1PH5 A; 1RF2 D; 1I50 B; 2RCN A; 1KD1 C; 1AZQ A; 4POG A; 4APV A; 4L63 B; 3RZO H; 4H44 C; 1LV9 A; 1O78 A; 2F0L A; 2UXD Q; 1IKM A; 4A3D G; 5C5L A; 5H1S E; 2JK8 A; 4KHP Q; 1D5Z C; 1KDB A; 2ZM6 L; 4BY7 B; 1EYA A; 3JAM L; 2OCE A; 5CYU A; 4LUV A; 4LF5 Q; 4KHZ A; 3HOU G; 5LL6 X; 1YHQ A; 2WKD A; 1GXD C; 3NBH B; 4JOI A; 4UHV A; 1DOM A; 4UAI A; 1PH4 A; 1PLF A; 1JOK A; 3MXP A; 2R92 G; 3D3R A; 2BDN A; 1WTO A; 1KLU D; 1K83 H; 4LUZ A; 4N8X 1; 3VR6 A; 5IGF A; 3HOY H; 1D6E C; 4BY1 H; 2A8V A; 3ER0 A; 3I72 A; 1HNW Q; 1EY9 A; 2EYP A; 4YCU A; 1PMR A; 5G3L D; 1STH A; 3C2P A; 3FPU B; 1HQR D; 1IYU A; 1ILQ A; 3S1Q B; 1LYL A; 2UXB Q; 4P2C B; 2JA8 G; 1GUS A; 4X3U A; 4WJ3 M; 5GAD C; 1H9S A; 3I8Z A; 1EIH A; 1QCB D; 1I4H A; 2JA7 B; 2HHH Q; 2EDG A; 4C1N K; 4K0K L; 4R9W A; 4B3M L; 3KDF B; 3NSW A; 2R7Z G; 3GQB A; 3NE5 B; 4KN7 C; 4MNO A; 4PZ6 A; 4A76 A; 4NXM Q; 4A93 B; 1YBY A; 4BBS B; 5M5W H; 1TVX A; 1N9W A; 4YHH Q; 3KJP A; 3R8B A; 3EN2 A; 4RHR A; 2Q8T A; 1BCP D; 3EVQ A; 3TS2 A; 4NPS A; 1GUN A; 2JA5 B; 4IN3 A; 4KY6 A; 3K5O A; 3G4S A; 4KKT A; 3QOJ A; 5IP7 G; 3PO2 B; 3TS0 A; 5C5M A; 3PO3 B; 1UNS A; 1EQT A; 1QUQ A; 3F1Z A; 1LT4 D; 3FVQ A; 2I5H A; 3ERS X; 5LMU L; 5IYD H; 3M4O B; 1KXL A; 1Z47 A; 1LAC A; 4K2L A; 4JI3 Q; 2E2J B; 3K0X A; 1SBB B; 1WCM B; 2WAQ B; 1LTR D; 3U4Z A; 3H15 A; 3CKI B; 3H6M A; 1K8M A; 4KY7 A; 4GN4 B; 2K03 A; 1CSP A; 2PO4 A; 2NVQ B; 1EUJ A; 5M3M B; 5HUR A; 5I4D A; 1Y8P B; 1OXS C; 3DMU A; 4LFB L; 5LMN L; 1X54 A; 1EL0 A; 4QIW E; 3L2P A; 2EIF A; 1NAP A; 3KBX A; 3OWE B; 4A3D H; 2A1A A; 2IWH A; 1Q1E A; 5C3X A; 5I2Y A; 3VR5 A; 1EY8 A; 1X32 A; 1G6P A; 1T5X D; 4X66 L; 4DNT B; 1Q3L A; 3EA6 A; 4RH6 A; 1IYV A; 4OWX B; 3HOU H; 5IYB G; 3T1Y L; 5ELC A; 3MXN B; 1FJG L; 1K0S A; 3S16 B; 1VQI A; 1A3T A; 1AN8 A; 1H9M A; 3LWE A; 2F0I A; 2R92 H; 3E0E A; 1JJ2 A; 2A69 C; 2Z8L A; 2E2I B; 3I56 A; 1RDP D; 1CI3 M; 3CW2 C; 1CM9 A; 1YNN D; 1R4Q B; 3GTK B; 1ENF A; 2IX0 A; 1WVL A; 1I4R A; 3PIO 3; 1UAP A; 1SE4 A; 3UDG A; 3A8K E; 2NN6 G; 1HTL D; 1X3Q A; 2Q8R E; 2JA8 H; 4RHS A; 2DNE A; 4OL7 A; 1SYF A; 2ICI A; 1JIC A; 1M90 C; 1SYE A; 4IJH A; 5C3E G; 1T9H A; 4DV1 L; 4CDE C; 3HKZ E; 3MFG A; 4RGO S; 2A6H C; 2WB1 G; 2AWN A; 3TN2 A; 5JEA J; 2F0Q A; 2EY1 A; 3HKZ G; 4IUV A; 2R7Z H; 1DM0 B; 1CSQ A; 2L4N A; 5L37 A; 2A19 A; 3A8J E; 1N34 L; 2PQA A; 2EJF C; 4C3I G; 1X3F A; 4DUZ L; 5CR3 A; 5CV8 A; 3S1N H; 1JB7 A; 4CDC C; 4GS3 A; 4DAY A; 4ZAI A; 4Y7N B; 1C48 A; 2A5H A; 5IP7 H; 3G71 A; 3BZK A; 2OTL A; 4JYA L; 1JCK B; 1VQK A; 1X3E A; 5ELN A; 2Z1C A; 1T5E A; 3TQY A; 1KAA A; 4TSS A; 4WRD A; 1WTX A; 2E76 C; 1KAW A; 5ISR A; 4RGT A; 4DR2 L; 4HED A; 3CMA A; 1LAB A; 2V4D A; 2FXQ A; 4QJF A; 4FXD A; 2OQ0 A; 3ERQ A; 4K14 A; 4DF7 A; 4JCV E; 5IT9 L; 1I4X A; 4C2M B; 3LX0 A; 5JEA G; 4A3F B; 1JT8 A; 3BVM A; 1NR4 A; 4ILW A; 3M4Y A; 4R4T A; 2HUG A; 5IGE A; 2CWA A; 3STB C; 5T1I A; 1ENC A; 3JC6 6; 4Y52 H; 4KMU C; 2NZO A; 1F9Q A; 2K33 A; 4IAL A; 1YI2 A; 1LT5 D; 3GTQ H; 1TWG B; 4DR5 L; 5FO7 B; 4BWG B; 5KND A; 4RMF A; 3GTM H; 3KK7 A; 1NE3 A; 3V05 A; 4JI6 Q; 4C56 C; 2WII B; 4IQZ A; 3D6W A; 5C44 G; 2ZXR A; 2CKZ B; 3VR3 A; 2YTY A; 1QNK A; 3ERO A; 3D8G A; 1LTL A; 5LL6 S; 2KHI A; 1AZP A; 1VQJ A; 4TVA B; 5J39 A; 1IBK Q; 3PUY A; 2Q2I A; 3L3O C; 2NN6 H; 3V96 A; 4A3K B; 4GN5 A; 4DR6 Q; 1K8A C; 2BCO A; 4GKK Q; 1PYS B; 4JI8 L; 1N36 L; 1V1P B; 3HOW B; 2Q2U A; 5C3E H; 5EKI A; 2C35 B; 4ZLT F; 4H13 C; 2EPB A; 3HOZ B; 4XTC S; 1YNX A; 4R4I A; 4JBJ A; 2RDH A; 3T56 B; 3EFX D; 3RN5 A; 1ZEQ X; 3OTO L; 1JJG A; 5BN5 A; 5M5X H; 3CD6 A; 2UXC Q; 1JJC B; 3T1H L; 3H0G G; 1SSO A; 4A3G H; 4C3I H; 4DV3 Q; 4P75 A; 1SNO A; 4IUN A; 2QEX A; 2ENB A; 3F2U A; 1B8A A; 1I3Q B; 5CV6 A; 2F0K A; 5I6W A; 1S5B D; 4GOP B; 2R93 B; 3CC2 A; 4KV6 A; 4DV6 Q; 4DR4 Q; 1BBU A; 3NXW A; 4ZQ3 A; 2K75 A; 3UDF A; 1FVI A; 4A3J G; 4DKA C; 3S24 A; 3SXH A; 1TY2 A; 4GOP C; 1EOV A; 1MD2 D; 2A69 D; 3F2C A; 1SMY C; 1NR2 A; 4BXX G; 4DXF A; 1QOH A; 1B4O A; 2I07 B; 1KIX A; 5KGU A; 1VQD A; 2NZH A; 3U4V A; 3KF8 A; 2VQE Q; 4FF3 A; 4ZKC B; 2CFM A; 1JC7 A; 5JEA H; 4C3H G; 2DNC A; 4AQY L; 3CF5 A; 2OTJ A; 1IBM Q; 2K5V A; 1HZ9 A; 1AFP A; 4DV5 L; 2VZA A; 2EVB A; 5C4Z A; 3J7A F; 2BDO A; 3WOE A; 1VQ6 A; 1CFM A; 2WV6 D; 2HCC A; 2A6H D; 2X6G A; 1RD9 D; 1VF7 A; 4DV4 L; 3ND8 A; 3FKI G; 4MTN A; 1Y1V G; 3HOX B; 4FXK C; 1VDZ A; 2ZTC A; 3H3V H; 2RDG A; 3W1G A; 1TU2 B; 2VB2 X; 3FDT A; 4X65 Q; 5C44 H; 3K8A A; 4ABN A; 2JEA I; 2EOT A; 4FXG C; 1HCZ A; 4HMJ A; 3KYH C; 1XTD A; 1STA A; 2K5W A; 2K32 A; 2KHS A; 3U50 C; 2E8G A; 1SE8 A; 4DK6 C; 1TWF B; 5K5P A; 4DR7 L; 4JI1 Q; 1JWU D; 1Y1W G; 1RCV D; 2I0Q A; 3B6Y A; 1VQG A; 1F9P A; 4YCV A; 2K6A A; 4R4O A; 1LM0 A; 4C3J G; 1PZI D; 5JJL A; 4L8J A; 4LFC L; 4BA1 I; 5JJZ A; 2B2Y C; 2MFI A; 1ET6 A; 2IX1 A; 1S4Z A; 4BBR B; 2VUM B; 3O13 A; 4DK1 A; 4OXP A; 3H0G H; 3K7U C; 3VR2 A; 2ZXO A; 4PMW A; 1JWM D; 4YIJ A; 1KLG D; 2MNA A; 4JV5 Q; 1ZXT A; 1F2M A; 3VA7 A; 2GA4 B; 1ESR A; 1Z6H A; 4FYD A; 1WTV A; 3C3L A; 2KEC A; 4QB4 A; 1HNX Q; 4LF4 Q; 3BDO A; 3GTP B; 3NQI A; 1TWC B; 4O42 A; 4OX9 L; 4NXN L; 1FR3 A; 1XMO Q; 1VQF A; 3TZU A; 3RLO A; 3NBH A; 1S40 A; 4TQU S; 2PW5 A; 2ZXP A; 4BXX H; 2N55 A; 3DLL A; 2EE1 A; 2YU9 H; 4LF5 L; 1BOS A; 3BZC A; 1XPR A; 2AQ1 B; 4HCE A; 1A8V A; 2KJX A; 1C9O A; 4BY7 G; 2L55 A; 4JI7 L; 1SYC A; 2F1M A; 4FF4 A; 4XT3 B; 4C3H H; 3SK5 A; 5FLM G; 4WJW A; 3BDL A; 3OWF A; 4M1U B; 1FGB D; 4B3T Q; 3J7A 5; 2BA0 A; 3GTJ H; 2DGY A; 2EXD A; 3BYT B; 3EBE A; 2JA9 A; 3FKI H; 1I94 Q; 2B39 A; 2ATW A; 2UU9 L; 1Y1V H; 1F2L A; 1LTA D; 4ULL A; 3KDF A; 3K59 A; 1SR3 A; 3KBG A; 1CA6 A; 3D31 A; 3L9A X; 3CC7 A; 2CVR A; 4DV0 Q; 4MIU A; 3OYY A; 5COR A; 5E1F A; 3HZX A; 1BXT A; 3L7Z C; 4KK7 A; 4JBM A; 2JA7 G; 4NXM L; 5AJ3 L; 4A3E H; 2IPK D; 2F0G A; 3LNN A; 1NSN S; 1Y1W H; 4A93 G; 2XGT A; 1G8Z D; 4BBS G; 1SMY D; 3AB9 A; 2RCF A; 4A75 A; 1QIL A; 4C3J H; 2SNM A; 1L0Y B; 3PIO A; 4B3S Q; 2TMP A; 3OMC A; 2KOL A; 1WTP A; 1CKN B; 3C1F A; 2JA5 G; 3Q0A A; 2K14 A; 2EY2 A; 3E9H A; 5EAY A; 3PO2 G; 1NJI C; 1X3P A; 3PO3 G; 2VQF L; 2N3S A; 1Y14 B; 3CXC A; 2WAQ E; 2EYF A; 1A62 A; 3PF4 A; 4ZRZ A; 1QNU A; 2GVA A; 5LHY 1; 4LF6 Q; 1PH6 A; 1WCM G; 1RJT A; 1SFO H; 5CV7 A; 1PH1 A; 1HRJ A; 1B9N A; 4Q0F A; 1VQH A; 5F2D A; 2UUB L; 3GTG H; 2L12 A; 3QWN A; 1A2T A; 5M3M G; 1I50 H; 1HH2 P; 2B2T C; 3DWP A; 3NWT A; 1AP0 A; 1I6H B; 3MXN A; 4DV2 Q; 4JI5 L; 1ESF A; 5JJK A; 1TKW B; 4YWL A; 1G51 A; 1W6K A; 4O2D A; 1VQB A; 1WD1 A; 2XRS D; 4LF7 Q; 2HIV A; 1O7Z A; 4CJ0 B; 1VQA A; 3CAM A; 1UEA B; 4BY7 H; 2F4V L; 5FLM H; 3TBI B; 3CCS A; 4ID6 A; 5FO9 B; 4QMG A; 1EFI D; 4JC0 A; 4MHE A; 2PZT A; 2ES2 A; 3SK8 A; 1FNW A; 3I4L A; 4U67 3; 3BS1 A; 2K04 A; 4MTK A; 4F8M A; 4JI2 L; 3H09 A; 4RA8 A; 2O5I C; 2N49 A; 3CQZ B; 5NUC A; 1IL8 A; 1K3B C; 2JQO A; 1B9M A; 2E5L L; 1XNR Q; 3J81 c; 3NP8 A; 1TII D; 1IW7 C; 1CK1 A; 5CGK A; 2JA6 B; 1F2Z A; 1ET9 A; 2X6L A; 4UY8 C; 2PNH A; 1KC8 C; 2JA7 H; 5BN4 A; 5M3F B; 4FO2 A; 2NVY H; 3J80 c; 4PQX A; 2EJG C; 2H1E A; 2QF7 A; 1VF5 C; 2NN6 I; 3U9S A; 4IOA A; 4A93 H; 2B2W C; 1AE3 A; 2R7F A; 4CHT B; 1VQN A; 4O0A A; 2PW7 A; 4HTH A; 2RA4 A; 4BBS H; 3RR5 A; 1HR0 W; 3CHB D; 1H9R A; 1KNE A; 3QR8 A; 1C7Y A; 4CKE A; 1G2S A; 1W2B A; 2F3V A; 1K73 C; 2JA5 H; 3AEV A; 4YY3 L; 3TME A; 4JI4 Q; 3AYH B; 3WOF A; 1E1T A; 1G91 A; 3PO2 H; 5EPK A; 3W1B A; 3PO3 H; 1NTG A; 2LXJ A; 4JG2 A; 4QQB X; 1KNA A; 3NBI A; 3KF6 B; 5M9O A; 3EQL C; 2CHB D; 4POF A; 1I6V C; 4DGZ A; 3M4O H; 2XWB B; 3T16 A; 1XMQ L; 1WCM H; 5EPJ A; 5FLX L; 3I3C A; 5I6Y A; 3Q23 A; 2AKW B; 4P73 A; 2KCM A; 1WTW A; 1JMC A; 1Q1B A; 4LF8 Q; 4GKJ L; 2NVQ H; 1TT2 A; 5M3M H; 4FNF A; 4M8A A; 4H0L C; 1J8I A; 4A3F G; 1J6Q A; 4X62 L; 3PIP 3; 2JP1 A; 3A0J A; 4JW0 A; 2YYZ A; 4KJN A; 3TP8 A; 3W5O A; 1ICF B; 2NTT A; 1OXV A; 2NTS A; 3OHX C; 4ME3 A; 4EQ5 A; 1Q8K A; 2O4X A; 2AUJ D; 3HOV B; 4AYB E; 3EIV A; 3G6J B; 1PTO B; 1TS3 A; 3A54 A; 4LWC A; 2BOS A; 2D0P A; 3GTO B; 5A2Q E; 1E0B A; 1SNP A; 2KHJ A; 1PH8 A; 1Q7Y C; 4Z9C B; 2MO1 A; 1MI2 A; 2PNR C; 1U4P A; 3PV0 A; 5GQO A; 3N52 A; 1PTO C; 4E6I A; 3KFU A; 5EBC A; 3UE0 A; 5IYC G; 4QY7 A; 5KIX A; 1R9T H; 4K2K A; 2CW0 C; 3NPP A; 3HGB A; 1U4R A; 1HJP A; 3VYU A; 1MIU A; 1J5E Q; 3MTS A; 2TSS A; 3OMG A; 4ALP A; 4GNX B; 3Q8D A; 4A3K G; 3RN2 A; 1I4G A; 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