The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
79
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structure length |
79
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Chain Sequence |
AIDIKAPTFPESIADGTVATWHKKPGEAVKRDELIVDIETDKVVMEVLAEADGVIAEIVKNEGDTVLSGELLGKLTEGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the lipoyl domain of the 2-oxoglutarate dehydrogenase complex from Azotobacter vinelandii.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E2, THE DIHYDROLIPOAMIDE SUCCINYLTRANSFERASE COMPONENT OF 2-
|
| molecule tags |
Acyltransferase
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| source organism |
Azotobacter vinelandii
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| total genus |
6
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| structure length |
79
|
| sequence length |
79
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| ec nomenclature |
ec
2.3.1.61: Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase. |
| pdb deposition date | 1996-01-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00364 | Biotin_lipoyl | Biotin-requiring enzyme |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1EWH A; 3ND9 A; 3VR5 A; 2F1M A; 3D31 A; 1GHJ A; 3N6R A; 2A68 D; 1T5E A; 1V8Q A; 5C0X G; 1DCZ A; 1CI3 M; 1OXT A; 2NN6 H; 5K36 G; 1VCI A; 1B9M A; 3A8J E; 1Q90 A; 2BDO A; 1Q1B A; 2R6G A; 3LWU A; 3MFY A; 4GZY C; 3PUV A; 1OXU A; 2CW0 C; 1IYU A; 3BG3 A; 4IFD H; 4OO1 H; 1Y69 U; 2E76 C; 3A8K E; 3KLR A; 4TQU S; 3QJY A; 4G7Z C; 2JE6 I; 4G7H C; 2AWO A; 2EDG A; 3A8I E; 1LAC A; 3I72 A; 3M4Y A; 4KN4 C; 1Z7T A; 2D5D A; 5BN5 A; 2AUK A; 4KKS A; 4L8J A; 4KKT A; 1IW7 C; 1TU2 B; 5A35 A; 3OW7 A; 3PUW A; 3VR6 A; 2A68 C; 4LK1 C; 1Y8N B; 1H9S A; 5JEA G; 2O5J C; 4KHZ A; 1H9J A; 1PMR A; 1ZKO A; 4JBW A; 5K36 H; 3NE5 B; 4H44 C; 1CTM A; 3FMC A; 4IQZ A; 3H94 A; 1GHK A; 1B9N A; 1OXV A; 4KN7 C; 4OGQ C; 3AB9 A; 3RLF A; 3T53 B; 2DNE A; 2PCF B; 3FPP A; 4HR7 B; 1E2V A; 1GUN A; 2B8G A; 5BN4 A; 1FYC A; 3OPO A; 2K33 A; 2EJM A; 3QIA A; 4PV1 C; 1H9R A; 4RCN A; 3VA7 A; 1VDZ A; 2QF7 A; 3T56 B; 1G29 1; 1SMY C; 1VF5 C; 4XTC S; 1TKW B; 3PUY A; 1DXM A; 3M85 A; 2E74 C; 3PUX A; 4KMU C; 3GQB A; 3EQL C; 3W3A A; 3WDN A; 2DNC A; 2DN8 A; 2NN6 I; 3ND8 A; 2PNR C; 2V4D A; 5C0X H; 5JEA H; 1OXX K; 4DNT B; 1V43 A; 4KKU A; 3SDZ A; 2O5I C; 4JK1 C; 2B8F A; 1H9K A; 2EVB A; 1YNN C; 5KNB A; 2BA0 A; 2IT1 A; 2KCC A; 2YYZ A; 1GUG A; 1HQM C; 4OO1 G; 3OOC A; 2PPB C; 4IFD G; 1E2W A; 1DD2 A; 1O7L A; 4KI0 A; 4I7Z C; 1FR3 A; 1VF7 A; 2K32 A; 1O78 A; 4H0L C; 2EJF C; 1H9M A; 3TZU A; 2BE5 D; 3U9S A; 3VR2 A; 1Q12 A; 3SE0 A; 1Z6H A; 3PV0 A; 3VR3 A; 4DK0 A; 2JEA I; 1CFM A; 1K8M A; 2A69 D; 2L5T A; 4DK1 A; 1Y8O B; 1GUT A; 2LMC B; 3PUZ A; 2Q8I B; 3CRK C; 3I73 A; 3T51 B; 1K8O A; 1BDO A; 2D2C C; 1ONL A; 1H9S B; 1Q1E A; 3BDO A; 1ZYR C; 3QG1 A; 3MXU A; 4XIG S; 2E75 C; 2EJG C; 3CRL C; 3LNN A; 4BA1 I; 3P20 A; 3VR4 A; 1HTP A; 2NN6 G; 3IKJ A; 2A6E D; 2A6E C; 4BA2 I; 1IYV A; 4TKO B; 3DXJ C; 3IFT A; 4LJZ C; 5KND A; 1HPC A; 2BA1 A; 2D62 A; 1GUO A; 1LAB A; 2JEB I; 3L7Z C; 2K7V A; 2ZT9 C; 4DNR B; 5BN3 A; 1GJX A; 1HCZ A; 3M7N A; 2KA7 A; 3A7A B; 1E2Z A; 4H13 C; 1A6X A; 1GUS A; 2AUJ D; 2JXM B; 1OXS C; 3D4R A; 3I4L A; 1YNJ C; 1QJO A; 3A7L A; 3HGB A; 5KNC A; 2BE5 C; 2A6H D; 2A6H C; 1Y8P B; 4G7O C; 3GD7 A; 2A69 C; 1I6V C; 1IW7 D; #chains in the Genus database with same CATH topology 4X65 Q; 2VL6 A; 1TS3 A; 3D31 A; 1X65 A; 1PH2 A; 3V2T A; 5K5P A; 1FVI A; 5KYL A; 3DUZ A; 3J7A 5; 1C4Q A; 5C4Z A; 2B63 B; 4JOI A; 4DK6 C; 4GN3 B; 3RLO A; 3BJU A; 4MIU A; 4A3M B; 4DR4 L; 1LV9 A; 2LY7 A; 1VQF A; 3I8Z A; 3HOV B; 3HOZ B; 2AWO A; 3L3O C; 2A74 C; 4JI3 Q; 1RL2 A; 1QOH A; 1E0B A; 1QVC A; 2D5D A; 1EIG A; 4ULL A; 3M9B A; 2ID0 A; 3HG9 A; 2KCN A; 1PXU A; 3KLW A; 4R9W A; 5M3M B; 2NZ1 D; 1JCK B; 5KYI A; 3HOU H; 2F0U A; 3CXC A; 1KNE A; 1IL8 A; 4DR5 L; 5JOB A; 4IQZ A; 2B63 G; 2WIN B; 1PYW D; 2N78 A; 3TS2 A; 3T53 B; 3OWE B; 2XWJ B; 3HOX G; 4IUQ A; 5D65 A; 3NPP A; 2DUD A; 3HOZ G; 4R4I A; 2PW7 A; 1KAA A; 1MIU A; 3RZD B; 1DXM A; 1GOZ A; 3OYY A; 3K7U C; 5IYC G; 3KK7 A; 1VQI A; 1WD0 A; 4C3I H; 5M3M G; 4JC0 A; 4K14 A; 4KHP L; 4C56 C; 3SDZ A; 3B6Y A; 4K5W A; 4A93 H; 2EVB A; 4G57 A; 3UE1 A; 3CC7 A; 2R7Z H; 2BA0 A; 4DA2 A; 2N55 A; 4YY3 L; 4NMZ A; 4IPH A; 4A3B G; 2RSO A; 1L0W A; 3NWT A; 1FR3 A; 4LFA L; 2KEN A; 1E22 A; 2MP1 A; 5J39 A; 3RNU A; 2UUC Q; 4DK1 A; 4DR3 L; 1A15 A; 4QUC A; 2HD3 A; 3NEL A; 2R93 B; 1TWF H; 1ESF A; 2IW3 A; 1ONL A; 2RSN A; 1AE2 A; 1L0X B; 1XTC D; 4G4K A; 3RR5 A; 1YIT A; 2D0O A; 1JB7 A; 4BA1 I; 5KEE A; 4BXX H; 5DNF A; 2JSO A; 2MPM A; 4L5T A; 4ME3 A; 2OTL A; 4NXN L; 4TVA B; 3MAQ A; 1E2Z A; 2FJ2 A; 3W1B A; 1A0I A; 1I50 B; 5KGU A; 5KNC A; 2NTS A; 4DAY B; 3KF8 B; 1IKM A; 3T1H L; 2R93 G; 1I4R A; 1X55 A; 2B39 A; 2B2W C; 4KD4 A; 2JA5 H; 5ELC A; 3BDL A; 2RDH A; 3CAM A; 3LWE A; 4O2D A; 1L1O A; 3PUV A; 5A2Q L; 2GVB A; 2K5N A; 3BZC A; 4RFB A; 2JE6 I; 4L5S A; 2ICE C; 3A8I E; 4V0B A; 2JA9 A; 1HFN A; 4LF4 Q; 5GAG C; 5H1S E; 5FLM G; 3PUW A; 2F0P A; 4MN3 A; 2MNA A; 3BYT B; 2F0F A; 5JEA G; 2NTT A; 2QKI C; 1XPU A; 2AQ2 B; 4C1N I; 5K36 H; 1YI2 A; 3IFD A; 1CTM A; 1ZEQ X; 3S2H H; 1ENA A; 3EBE A; 4OGQ C; 3QO2 A; 4F88 A; 1PFM A; 4ZAI A; 4JG2 A; 4ZYS A; 3KLS A; 1KAW A; 3H15 A; 2QDB A; 4DXG A; 1V1O A; 2DJF C; 3T56 B; 2RHQ B; 4B3S Q; 2RVL A; 5A2Q E; 2L1B A; 3EJI A; 4UP9 A; 3GQB A; 2YTV A; 4LF9 L; 2PW5 A; 1VQD A; 1B2T A; 4F8M A; 2IJ0 A; 1HNX L; 1AEX A; 1SR3 A; 3HOU B; 4J8Q A; 1HH2 P; 5T1G A; 4OXP A; 4WJ4 A; 5IP9 H; 1A3V A; 1EQV A; 4FXK C; 4I7Z C; 2CQA A; 2EJF C; 3STB C; 3U9S A; 2K28 A; 1Z6H A; 3PQI A; 5M5X H; 1J6Q A; 2UXB Q; 4JI1 Q; 4C3I B; 3RN2 A; 1BR9 A; 2XGT A; 1XYI A; 5C5L A; 2C5C A; 4KY7 A; 4HIK A; 3DM3 A; 4HCS A; 4IPD A; 4A93 B; 5IGE A; 4N8F A; 1CK1 A; 1X3E A; 4K8J A; 1F9S A; 2WKC A; 3FVQ A; 1JC7 A; 1K8A C; 4JOI C; 1I6H H; 2R7Z B; 4LF7 L; 4ID6 A; 1D8L A; 2GVA A; 2JEB I; 4BY7 H; 1IBM L; 3NTI A; 3K5N A; 5FO7 B; 3GV6 A; 2LXJ A; 3OIP A; 5IGB A; 1C0A A; 4IOC A; 1PYB A; 1QJO A; 4RCO A; 2L12 A; 2UUA L; 1R4Q B; 1TWF B; 4LUV A; 4LUZ A; 2PMZ B; 2SDF A; 4QB4 A; 1SRU A; 1I94 Q; 2WV6 D; 2YTX A; 1TS4 A; 3I4O A; 2N3S A; 4RGM A; 1ICF B; 3W1G A; 3J81 i; 1HNZ L; 1B9M A; 3JAM c; 1CKN A; 2A1A A; 3CCQ A; 1X3Q A; 3TME A; 1II3 A; 3C1E A; 1A62 A; 1EFI D; 3FKI H; 2ES2 A; 2PMZ E; 1AP0 A; 1NUC A; 4C2M H; 1O7Z A; 1LAC A; 1AZQ A; 1B44 D; 4QL5 A; 1TT2 A; 1XNQ L; 5FO8 B; 3NQI A; 1SDF A; 2R61 A; 2JA5 B; 1H9S A; 1MJE A; 1JB3 A; 1RDP D; 1ASZ A; 4H44 C; 4POF A; 4P71 A; 4EGV A; 1N36 L; 1VQO A; 3I90 A; 1D6E C; 4A75 A; 1WTW A; 4B9X A; 4KN7 C; 5DLQ E; 3ERS X; 1ESR A; 2EOT A; 4EQO A; 2PQA A; 4DUY L; 2UUB Q; 5HGQ A; 1E2V A; 1IZ6 A; 1R9T H; 3MXN B; 1NJI C; 1H9R A; 4GOP A; 3CKI B; 4B3M L; 2FHT A; 2XWB B; 2VB2 X; 4N9P A; 1STN A; 4R4C A; 4UP7 A; 5CV9 A; 3K0X A; 5C0X H; 2EYL A; 1G6P A; 5EPL A; 1MKH A; 1V43 A; 1XX8 A; 5C3X A; 4DUZ L; 3W5O A; 3HZX A; 2B8F A; 3S2H B; 2SOB A; 3MEF A; 4FXG C; 1WTO A; 3FPU B; 3PO2 H; 2DY8 A; 1IYJ B; 4KI0 A; 1CHP D; 4DPG A; 1O78 A; 4HMJ A; 3FRP B; 1RTO A; 3CCV A; 2F0J A; 2JEA I; 1RKN A; 4WJW A; 4JI8 Q; 1S5D D; 4DAV A; 2HDL A; 2RKS A; 5COY A; 4X64 Q; 1G8Z D; 1KLG D; 2K5Q A; 2F0T A; 1FL0 A; 1HXY D; 4UHV A; 1PRT C; 2JYO A; 3X3N A; 4B3T Q; 2F4V L; 3OMG A; 3HKZ B; 4KY5 A; 5IWA L; 3D6W A; 3ERQ A; 3MVV A; 1S5C D; 3NEM A; 4APV A; 2A6E D; 1L1O C; 2PI2 E; 1E1O A; 3L7Z C; 4EQN A; 1QUQ B; 4DNR B; 1J5E L; 3A7A B; 1FJG Q; 2JXM B; 2B29 A; 3NEN A; 4FDB A; 1M1K C; 1A3T A; 2QIL A; 3OHX C; 5M5X B; 3I91 A; 3ULL A; 4RHR A; 3C1F A; 3T16 A; 4CKB A; 1A2U A; 5JVH 3; 2KEC A; 1STH A; 2ZXO A; 1SJE D; 4IJH A; 1DCZ A; 3HKZ G; 2NN6 H; 2RA4 A; 1I6H B; 3CQZ H; 1TR5 A; 3Q8D A; 1STE A; 4BY7 B; 2CQO A; 1EY5 A; 4ZUI A; 1JJ2 A; 4IFD H; 2VQF Q; 2ZM6 L; 4TRD A; 4M8A A; 2Q8T A; 3J7A V; 4OIJ A; 5M5W H; 5JJL A; 2F0V A; 1KHI A; 1BUV T; 2M00 A; 2ZTC A; 1HR0 W; 3K80 C; 4OX9 L; 5LL6 X; 5DM7 3; 3GTP H; 4NB3 A; 4L8J A; 4J15 A; 1H9J A; 1AN8 A; 1H95 A; 2ZXR A; 3J80 L; 4EQP A; 1I4P A; 3FP9 A; 1Q82 C; 1F9Q A; 1YVC A; 3O13 A; 4BY7 G; 1STA A; 1WTH A; 4KV6 A; 3KLS X; 2K75 A; 1DM0 B; 1XPR A; 1EIF A; 4C2M B; 5GAH C; 1BF4 A; 1G29 1; 3NTH A; 5CC4 A; 1YNX A; 1UE5 A; 2NB0 A; 3HS0 C; 2MO1 A; 2EYF A; 2B2Y A; 3W3A A; 4K6D A; 1V9P A; 1HNW L; 2EPB A; 1PZI D; 1WOC A; 1YNN C; 2E2D C; 1A8V A; 1GUG A; 3R8B A; 5C4X H; 1R9T B; 3F1Z A; 3W2D A; 3NXW A; 5C4J H; 3A0J A; 4GLA C; 3J80 E; 2VQE Q; 2EY2 A; 3H3V C; 2F0O A; 1HRJ A; 4B3R L; 4AYB B; 4JI5 L; 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2KCC A; 1VQA A; 4GNX B; 5ELD A; 5IP7 H; 2A8V A; 3GTM H; 2HDM A; 4IFD G; 2V1C C; 2ZJQ A; 1RF2 D; 2YTY A; 2NZH A; 1EU4 A; 1EUJ A; 4F7X A; 1K8M A; 3TS0 A; 2YV5 A; 3I56 A; 1L0Y B; 2JP1 A; 1I4Q A; 1CA5 A; 2SNM A; 1HTP A; 5CR3 A; 4TKO B; 3D0F A; 4PZ7 A; 1HCZ A; 2MFI A; 5C4J B; 5C3E H; 4CKC A; 1N34 Q; 1KDC A; 3RMH A; 4DAP A; 1KC8 C; 4OIK A; 3TN2 A; 1HJP A; 2O2L D; 4Q0F A; 3VR5 A; 1V8Q A; 4K0K Q; 3SK5 A; 1Z47 A; 4S3S A; 3ER0 A; 3NBH B; 3K7A H; 1M90 C; 4RG1 A; 4ABN A; 3PSI A; 3LWU A; 3KUP A; 2JA7 B; 2AKW B; 4JI7 L; 1SYB A; 3U50 C; 4KJO A; 4ZK9 B; 2D9U A; 4PZ6 A; 1MI2 A; 3PCO B; 3I55 A; 1LTB D; 1Y69 U; 2OTJ A; 4G7Z C; 1S72 A; 4DAY A; 1PVO A; 1Z7T A; 2B2Y C; 3AQQ A; 4ZKB B; 4IZ8 A; 4LFC L; 1TU2 B; 4RGT A; 5CV8 A; 2LKV A; 4A3D H; 2A68 C; 4X65 L; 2Z0S A; 1YNN D; 4QY7 A; 4IFD I; 4UP8 A; 2UXC Q; 1YZ6 A; 2QCP X; 2JA7 G; 2XTI A; 1QVG A; 3KBX A; 2DNE A; 1BCP C; 1VQ6 A; 1GUN A; 3G71 A; 4LF8 Q; 1MD2 D; 2EJM A; 4ZQ3 A; 2KJX A; 2KCM A; 1VDZ A; 1ML0 D; 2ASB A; 4IUV A; 1SYF A; 4Y7N B; 3ULP A; 1TKW B; 4DR6 Q; 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