The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
105
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structure length |
105
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Chain Sequence |
MDLNRMGKDEYYVQITVDGKEVHSKADNGQKYKDYEYKLTGFDKDGKEKELEFTAQKNLRKEAFLRVYHSDKKGVSAWEEVKKDELPAKVKEKLGVKLEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR solution Structure of Membrane associated protein from Bacillus cereus: Northeast Structural Genomics Consortium Target: BcR97A
rcsb |
| molecule tags |
Membrane protein
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| source organism |
Bacillus cereus atcc 14579
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| molecule keywords |
Hypothetical Membrane Associated Protein BcR97A
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| total genus |
14
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| structure length |
105
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| sequence length |
105
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-06-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF06486 | DUF1093 | Protein of unknown function (DUF1093) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K5W A; 2K5Q A; 3NPP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EE1 A; 4BY1 B; 2VUM B; 4R8N A; 1NSN S; 1KD1 C; 1PFB A; 4KHZ A; 2NUC A; 3G6E A; 2Y0S E; 3I7F A; 3GTK B; 1HFG A; 1Y1W H; 4IO9 A; 4Y52 H; 5FLM H; 2UXC L; 1B1Z A; 3BVZ A; 3EIV A; 2K01 A; 5KNC A; 4DV4 Q; 4FXG C; 3RZO H; 2WAQ G; 3G48 A; 1LAB A; 3W1G A; 3RMH A; 1Q8K A; 1DJR D; 1YJW A; 1QVC A; 3D6C A; 4L8J A; 4X64 L; 1YVC A; 2WKD A; 1YJ9 A; 3T16 A; 4DAM A; 3AFP A; 3WOE A; 3M7N A; 4I7A A; 1HZB A; 5CV8 A; 2HDL A; 4V19 0; 5G3L D; 2NZ1 D; 3KBX A; 4E6I A; 3OMC A; 3ZYY X; 4F8M A; 3CME A; 4GKJ L; 4LW1 A; 3TP8 A; 3HOX H; 2JYO A; 4LFB L; 3E0J A; 3HOU B; 2MO0 A; 4PQX A; 5C3E B; 3J80 i; 4MHE A; 4X66 L; 1KDC A; 4IUV A; 5KIX A; 3HOZ B; 2BDO A; 3QIA A; 2RVL A; 4KY6 A; 3VA7 A; 1MSG A; 2Q8R E; 2NVX H; 5T1G A; 1EUJ A; 3A7A B; 1C8C A; 2XVS A; 3NUC A; 4C2M B; 5IYB H; 1HJP A; 1WTH A; 1LTG D; 5IGB A; 5I4D A; 5FO7 B; 3DUZ A; 2QEJ C; 2CH4 A; 2B2Y C; 1MSH A; 2N55 A; 3E9I A; 4YHH L; 2K52 A; 4P71 A; 3SK4 A; 4DK1 A; 4N9T A; 1VMC A; 1K83 B; 2DY8 A; 1U4L A; 5EPJ A; 4AYB E; 3CPF A; 2KA7 A; 3RUZ A; 5JAV A; 3MFG A; 3J7A F; 1GUO A; 4OIK A; 1YHQ A; 4EGV A; 2K5W A; 3HOW B; 1RD9 D; 1WTW A; 2E2H B; 2UUC L; 2IPK D; 3GO5 A; 3RR5 A; 4DF7 A; 3OW2 A; 2K7V A; 1IYU A; 4KKT A; 1PRT B; 2EYH A; 1H9K A; 1IW7 C; 1K0R A; 1K8M A; 4JV5 L; 1Z47 A; 3SGI A; 3BVG A; 1HZA A; 2K75 A; 3G7L A; 4K2K A; 4PZ6 A; 4V0B A; 1OTC A; 1TWG H; 1EYC A; 5CGK A; 3EFX D; 4C3H H; 4DR5 L; 4C3J B; 3KFU A; 3GD7 A; 4IUP A; 2FMM A; 1E0B A; 1QOH A; 3G4S A; 2L1B A; 2K32 A; 3K7A H; 1V9P A; 2BE5 C; 4J6H A; 4HIM A; 3S14 H; 4MNO A; 5I2X A; 2NVQ B; 1SAP A; 1A62 A; 1AE3 A; 1HNZ L; 2UU9 L; 4LNQ A; 4DK3 C; 4C1N I; 3NWT A; 1XMQ Q; 2KOL A; 1D5M C; 4L63 B; 4UP8 A; 4YCU A; 2R61 A; 3FVQ A; 1K8G A; 1Q90 A; 1HNW L; 1L0W A; 1K9M C; 2V4D A; 3A8I E; 2F0N A; 3C1E A; 1Q82 C; 2A73 B; 2VB3 X; 1JJC B; 1MJE A; 4C3I G; 1CHQ D; 1SNM A; 3U4Z A; 4B3R Q; 3VR5 A; 4KJN A; 5JEA G; 4X3S A; 3MTS A; 3T1H Q; 1WJJ A; 1JC7 A; 2A69 C; 3Q23 A; 5CV5 A; 4HMJ A; 2DGY A; 1PRT C; 1PTO D; 2PQE A; 1TU2 B; 4LF4 Q; 3EN2 A; 1JWS D; 4K6L A; 3CW2 C; 1PXU A; 1VCI A; 4JI0 Q; 1TR5 A; 1ROD A; 3AFQ A; 5E4W C; 4MZ9 A; 3STB C; 4XDX A; 2GVA A; 2JA6 B; 5C6A A; 4IUU A; 1IZ6 A; 4AIM A; 2RHS B; 4R4O A; 5LHY 1; 3ULL A; 1BCP F; 1O7Z A; 1J9O A; 3M4P A; 4H02 A; 4XQJ A; 3QR8 A; 1BUV T; 1NNX A; 1RIP A; 5JVH 3; 4IFD H; 2UXD Q; 4KY7 A; 2MGS A; 1I94 Q; 2DN8 A; 5AJ3 L; 1FJG Q; 3PF4 A; 2B2W C; 3BYY B; 3AYH B; 3RN2 A; 1II3 A; 1JOK A; 4A75 A; 1N33 Q; 3HOY G; 4L5T A; 3CCM A; 3BZD B; 3TP6 A; 3K6O A; 1N8R C; 4JI2 Q; 3H3V I; 2PZW A; 1M8A A; 3M7G A; 4DPG A; 5J1Z A; 2TMP A; 5K5P A; 1P8L A; 2NVY H; 2ZTC A; 4FYD A; 2EZV A; 1G6P A; 4GOP A; 1CKN B; 3GTO H; 3S1R B; 3I4N H; 4X62 Q; 3RNU A; 2RF4 A; 3ERO A; 3QOJ A; 2ZT9 C; 3VYU A; 4DN4 M; 3HRZ C; 3ND8 A; 1F9Q A; 2DJG C; 2B2U A; 2OCE A; 2VQF L; 5IYD G; 1SYB A; 3A0J A; 4NP5 A; 2PI2 A; 1SE8 A; 5JPN C; 2GA4 B; 4GZY C; 4JI8 Q; 4R4C A; 5CV7 A; 4WJW A; 1GD7 A; 1NR4 A; 3AU7 A; 4X65 Q; 1KNE A; 3D6W A; 5LMU L; 4DR6 Q; 5IY0 A; 1KL9 A; 4UP9 A; 1Q8I A; 4LWC A; 4ALP A; 1C48 A; 4H13 C; 4IPD A; 5ELC A; 1I3Q H; 2X69 A; 4PZ8 A; 1Y69 U; 5GQO A; 1PH2 A; 1UEB A; 1YNN C; 3I70 A; 4WRD A; 1EIH A; 4HN7 A; 1KRT A; 1HH2 P; 3HOX B; 1F2L A; 4ABN A; 2EYM A; 1DGS A; 2VS1 A; 4IUQ A; 1ICF B; 2K5N A; 2JA9 A; 5ELB A; 3UE0 A; 3QOL A; 4H0L C; 1PFS A; 2X6G A; 3KJP A; 1B7Y B; 4UPA A; 3TME A; 5I6W A; 4JI6 L; 3WOF A; 4KLK A; 5IGC A; 3J81 L; 1EYD A; 4HED A; 2JK8 A; 2JA7 B; 3PUW A; 1EY8 A; 1QCB D; 4DR1 L; 2E76 C; 1XTC D; 4JI4 L; 4LF6 Q; 1VQA A; 3ONA B; 4OXP A; 4JC0 A; 5FKA C; 3PUV A; 3U9S A; 2WKC A; 1PH1 A; 3CP0 A; 4IJH A; 5IWA Q; 4JBJ A; 3JAM E; 4LFC L; 3K81 C; 3S15 B; 1H9M A; 4WJ4 A; 4QGU A; 3CC2 A; 1ZEQ X; 3I4M H; 4BA2 I; 1X3Q A; 1HTP A; 2F4I A; 2PCF B; 1BVS A; 2F0M A; 2AQ1 B; 3DHQ A; 2K5Q A; 3S1N H; 1PTO H; 1STY A; 3TZD A; 3D0F A; 1KAW A; 1EQT A; 2ICE C; 3M3Y H; 2X6L A; 1JWM D; 2AWN A; 1SEB D; 1N9W A; 1PTO F; 4DAV A; 4DV5 L; 1O7I A; 1BKB A; 1K8O A; 3IKJ A; 4YCW A; 1M4V A; 4MTN A; 2F0V A; 3VDY A; 3HOY H; 1BBU A; 2F0H A; 2K5D A; 2IL8 A; 3HGB A; 2A6H D; 1YBY A; 1CKO A; 5C3X A; 1RKN A; 3FEW X; 4QUC A; 1CT1 D; 4DR7 L; 1U4R A; 2K04 A; 2XSC A; 1QE6 A; 4XQN A; 1LTI D; 1T5E A; 3A54 A; 3K5L A; 4DXG A; 4RFB A; 1U9R A; 2R7F A; 4DV1 Q; 1KAA A; 1XMO Q; 2B2T A; 1XWE A; 1D7Q A; 2FJ2 A; 1FGB D; 3IRB A; 4RWS C; 4X6A H; 5D14 A; 3MXU A; 1Y1V G; 5C4Z A; 3KF8 B; 3J7A 5; 4JI1 L; 1WI5 A; 2A6E C; 2SDF A; 4Y7N H; 4C56 C; 3FP9 A; 5FK9 C; 4LF8 Q; 2I46 A; 4KJO A; 5EBC A; 4B08 A; 3RZD H; 1BNZ A; 3CKI B; 3H6M A; 4YWK A; 4AYB G; 4IOA A; 2WAQ B; 2QCP X; 4QL5 A; 1M90 C; 2KJX A; 2E74 C; 3KF6 A; 4KTA A; 4N8X 1; 5C0X I; 4CKB A; 1GHK A; 3PO3 B; 2AWO A; 1Y8P B; 4TSS A; 3KLS A; 2C35 B; 2GN5 A; 3F2U A; 1E2Z A; 1PFN A; 2NBF A; 2WAC A; 3W2D A; 4DR3 Q; 2VZA A; 1VF7 A; 1CZW A; 2VW9 A; 5KNB A; 4ODG A; 4YCV A; 2F0L A; 3F8T A; 1EWI A; 3K57 A; 1X3G A; 3CPW A; 4A3E B; 3BG3 A; 1DOM A; 4JOI A; 2E2I B; 4MN3 A; 2PMZ B; 4LUZ A; 1JE4 A; 2J0T D; 4DNI A; 2KEC A; 5ELE A; 2PNH A; 1CM9 A; 3W3A A; 2DJF C; 2K5H A; 3BVM A; 1I5F A; 1Y8N B; 4IZ8 A; 1R9T H; 1LTS D; 2HQE A; 1FGU A; 1LTA D; 4LF7 L; 1JJG A; 4IPC A; 4K5W A; 1J5E L; 5C4H A; 4NXM L; 4A93 H; 5FJ8 G; 4Q0F A; 2H4O A; 1GXD C; 3PIP 3; 2BH2 A; 2F52 A; 1PMR A; 1N36 Q; 1F9P A; 1H9S A; 2YU9 H; 2A68 D; 1KQS A; 4KN7 C; 1UE6 A; 3PO2 G; 4UY8 C; 5CV6 A; 3MHB A; 1IKL A; 2E75 C; 1JT8 A; 4IFD I; 1LAC A; 3N52 A; 4IUN A; 4NKL A; 4GNX A; 4JI3 L; 2HQL A; 1D1I A; 5DLQ E; 4PV1 C; 4OON A; 3R2I A; 1J8I A; 1UE7 A; 1VQN A; 3Q22 A; 4ID6 A; 3OSO A; 4ZRZ A; 1KAB A; 4A3K G; 1E1T A; 1PZI D; 3GTQ H; 5M5X H; 2F0U A; 4WFN 3; 3FDT A; 1ML0 D; 3UDX A; 4DV3 L; 1IL8 A; 3BYT B; 2A5H A; 2OT2 A; 1CK1 A; 1H9J A; 4HSP A; 4EQO A; 5JEA J; 1YIT A; 4P74 A; 2UXB Q; 3P7J A; 1FNV A; 1Q86 C; 2K4K A; 1VQ7 A; 3ICE A; 1XPO A; 1K73 C; 3T51 B; 4JI5 L; 1LTB D; 5CYU A; 1MD2 D; 4OGQ C; 4RMF A; 1NTG A; 2WB1 B; 2A74 C; 2EQS A; 1ZKO A; 2VXW A; 4GOP B; 2YTX A; 1VQ6 A; 3ITP A; 5KGU A; 4QB4 A; 3G71 A; 2PO4 A; 3NTH A; 4K5V A; 2CWP A; 3J80 L; 1SLJ A; 1PH4 A; 5ISR A; 5IYB G; 3FKI G; 5D3D A; 1TWF H; 3P20 A; 3PQI A; 2MPM A; 3T1Y L; 1Y1V H; 2DNE A; 5KYL A; 3KLR A; 2EPB A; 1HXY D; 2LXJ A; 2MJ8 A; 1GM5 A; 1QNK A; 3H94 A; 2EY5 A; 3NQT A; 5M5W H; 1NY4 A; 4C3I B; 5ELN A; 4EX5 A; 4OX9 L; 3CD6 A; 3IAY A; 2VL6 A; 1EZ6 A; 2ZXO A; 4A3C G; 2KEE A; 4DV0 L; 4ILW A; 1QZH A; 4G7O C; 3S1Q B; 2CVR A; 3H3V H; 2Z6B A; 5ELD A; 2NZO A; 5BN4 A; 2E5L L; 2B39 A; 1VDZ A; 4QIW B; 1JOR A; 2RCN A; 4DR2 L; 3SXH A; 4BBS G; 3EQL C; 2PQA A; 3E9H A; 5IGE A; 4A3M H; 1BQQ T; 4MTK A; 1X3F A; 5LL6 S; 2O2L D; 1HRJ A; 1YHB A; 2F4V L; 2F3W A; 1WTQ A; 5M5Y B; 1KIX A; 2Z4H A; 3BZK A; 4MIU A; 1ZYR D; 3TBI B; 3M3Y B; 5JJZ A; 1MHW C; 3P1H A; 4LAA A; 3ULP A; 1WCM B; 1D1K A; 3NWS A; 1PV4 A; 3GTP H; 5C0X G; 4NXN Q; 1EY0 A; 4GOP C; 1TY0 A; 2EDG A; 5FJ8 H; 4JK1 C; 2JA8 H; 5JJI A; 3HOY B; 4A3I H; 3B6Y A; 2B2U C; 1LT6 D; 4CDD C; 1SNP A; 3K0X A; 1IHZ A; 4HJA A; 4B3S Q; 2PPB C; 1KDB A; 3PO2 H; 1Q81 C; 2KCT A; 3CHB D; 2M2L A; 3QO2 A; 3WDN A; 4GKK L; 4CBV A; 3I8Z A; 3TP7 A; 1AZP A; 2H5X A; 5I6Y A; 5DEH A; 1A63 A; 2EYF A; 4CHT B; 1BCP D; 2N78 A; 3BDC A; 4J1M A; 1XXG A; 5C3W A; 4KV6 A; 2BA0 A; 3OIQ A; 2OQK A; 5IWA L; 4A3K H; 1K3B C; 4CJ0 B; 3LWU A; 3Q24 A; 2B29 A; 4RGM A; 4LF9 L; 2JA5 H; 1ENA A; 1QJO A; 1S40 A; 4R4T A; 1O78 A; 1B4O A; 1JR0 D; 2L5T A; 3LGJ A; 3OYY A; 1SRO A; 1ONL A; 1I4G A; 2NYZ D; 4M8A A; 4FNF A; 5M3F G; 1MKH A; 2EYP A; 4WOR A; 1B3Q A; 2JJQ A; 4PNY A; 3PIO A; 2PW5 A; 4G7Z C; 4DUY L; 1P16 A; 4RHS A; 4UP7 A; 2UUA L; 3PV0 A; 2NVT H; 4IFD G; 1EZ8 A; 1IYV A; 3FKI H; 4HIK A; 4RG1 A; 2L0C A; 1I6V C; 1OXT A; 5EKL A; 1JB3 A; 1OXS C; 2RDH A; 4DV2 Q; 2IHE A; 2QA4 A; 2IJ0 A; 3GTL H; 3HKZ E; 1VQK A; 1HPC A; 4LFA Q; 1UUP A; 2E2D C; 1AP0 A; 3DMU A; 5I9O A; 5C4J H; 1EY5 A; 4KHP L; 1F2Y A; 4A3C H; 2I5M X; 2FXQ A; 1S5E D; 4FF2 A; 3OWF A; 4HCS A; 1HNX L; 3GTG H; 1WD0 A; 3NHH A; 5FLX c; 1SMX A; 3I4N G; 3SHL A; 4QUF A; 3J81 E; 2CH4 W; 3GTJ H; 1EU3 A; 5EJW A; 5CBA E; 2H1E A; 4BBS H; 1V1Q A; 5IT9 c; 2D62 A; 3CCQ A; 1IBK Q; 1VF5 C; 1KHI A; 3MA2 B; 1B50 A; 2RDG A; 2LS0 1; 2XIW A; 1EOT A; 1QUQ B; 1KTK A; 1YZ6 A; 1VQB A; 3R2T A; 4AQY L; 4NB3 A; 4RH6 A; 1TWC B; 3OOC A; 2KED A; 5AFW A; 2OF1 A; 5C0X H; 1Q1E A; 5M5X B; 2B2T C; 3GTM H; 1SYG A; 4R8I A; 4HID A; 4POF A; 1XNQ L; 1VQP A; 1H9S B; 1I50 B; 2ENB A; 1IXR A; 1A8V A; 2F0O A; 1JOO A; 1ICW A; 2E2J H; 2Q2I A; 1TWA B; 4R4Q A; 2D0P A; 3KBG A; 5EAY A; 1NUC A; 2G9H D; 5DM6 3; 1BBX C; 1E1O A; 4JI7 Q; 3JC6 6; 3OIP A; 2ICI A; 2MQH A; 4U68 A; 1LLR D; 1XNR Q; 1PZK D; 2SNM A; 4DV7 Q; 3S2D B; 1ASY A; 3CMA A; 4DUZ Q; 2EJM A; 2YV5 A; 1Y1V B; 4K0K L; 1EFI D; 4QQB X; 1Y14 B; 3I3C A; 5IT9 L; 2AQ2 B; 2HIV A; 4AYB B; 5TSS A; 3I72 A; 5M5W B; 3W5O A; 4JVZ A; 3E5S A; 3SDZ A; 1W2B A; 4P73 A; 1X9N A; 5COR A; 3I4M G; 4J15 A; 4JOI C; 4A3F H; 2F0I A; 1SMY D; 3KJO A; 5M3F H; 3TDQ A; 3H09 A; 5K36 G; 1W3S A; 1CQF A; 1U5K A; 2C5C A; 5EPL A; 3RLF A; 3HZX A; 2Z6K A; 2DUD A; 1SYE A; 4A3B G; 4ME3 A; 1IBM L; 1KXL A; 1HR0 Q; 2B2V A; 4TQU S; 4S3S A; 4ZK9 B; 2CQA A; 1F2Z A; 2TSS A; 1IBL Q; 4POG A; 3I56 A; 1AW7 A; 3SR1 A; 1AEX A; 1IYJ B; 4ZLT F; 3S2H H; 5J39 A; 2EVB A; 3LX0 A; 1EL0 A; 3DEP A; 1LO5 D; 3L2P A; 3V96 A; 4LK1 C; 3KDF B; 4ZQ3 A; 4LF5 L; 3KOJ A; 2ID0 A; 4B3M L; 2KEN A; 5C44 H; 2R7Z H; 5BR8 Q; 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