3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
source organism Escherichia coli
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
3SERA 3B6WA 2PBWA 3DELB 4ZEIA 5HE0B 3RNNA 3KZGA 3A0FA 1MY2A 3VVFA 1Y3PA 2B65A 1DPEA 1D9VA 1URGA 1OIBA 3G3FA 1US5A 4GLIA 4BH6A 3G3KA 1SW2A 4HCWA 3TZAA 1YTVA 1DTGA 2IURA 3S9NC 3OO7A 3OD7A 5DYHA 3N0EA 4L3HD 3PV0E 3O6HA 3MZ9A 3IKOA 5EM2A 4AB6A 4GQ2P 4XKPA 2Y7WA 3KJ7A 3EI4A 3SEXA 4F3BA 1B3HA 2Q9TA 3UN6A 4FA4D 1QVSA 3KEIA 1FTLA 3TQLA 2AH1A 3KN3A 4DCXA 3SESA 3MKSB 2Z8FA 5CMBA 3EI3B 3EI1B 4E5ZB 1GOTB 4LZ5A 4NWCA 4GRKA 3JAMg 5HYNB 1S4UX 4H5IA 3IB1A 4GIZA 4KPTA 4J77A 3EHUA 3OKYA 4E0WA 4BDQA 1I6AA 4I62A 3TCFA 5AE4A 1DSNA 1N6DA 5BUUA 3K6XA 4F39A 2H14A 5ISUA 3KG2A 3RN8A 4MF3A 3ILTB 2XXYA 4R7AB 3C32A 1M5FA 3CFVA 1KWHA 4A09A 3UA8A 2OCUA 1B5HA 3JZGA 3C33A 3S9MC 4DE8A 1S7YA 1TYQC 3MQ9A 2QPQA 1SQJA 3PPQA 2IUPA 3OELA 4Q0CA 1B7HA 4EDPA 2PT2A 2R71A 2RC8A 3MW0A 3LR1A 3HO7A 1O7TA 5GMKn 1OQHA 3BG1A 4JDFA 4LG8A 4NWDA 4OWDA 4ZEBA 3RT8A 3MWBA 4A11B 3BWSA 1PC3A 2PYYA 4A0BB 4BDMA 2VOZA 4FORA 1JEUA 5HPQA 3K6WA 3TELA 1OVTA 5AA2D 5EMJB 2HKMA 1O63A 2CE9A 1B46A 5CMCA 2ZYNA 1PEBA 2F78A 3IAZA 3S2VA 4U2RA 3VV5A 4L1QD 1K8KC 1B4HA 3FUZA 5FHMA 1I6BA 2P2AA 5TEEA 3IOWA 4H5GA 4YKJA 1Y20A 4XYHA 4DXUA 1RYOA 4PP0A 4JSNC 3IOUA 3E0CA 4CI2A 3R7XA 1B6HA 5H8QA 4F1UA 3CG3A 4BUJC 3E9XA 1B3LA 1LFGA 2PMSA 3OO9A 2W18A 3DP4A 5IKBA 2F6PA 4KYDA 1LGBC 4NF8A 5IAIA 2IEEA 3QK6A 3E13X 2UVIA 1SQ9A 5FHOA 1VFEA 3Q29A 3TTNA 4F19A 4Y7RA 2IUQA 3ULEC 4ELRA 2HJ4A 5HBCA 2RCAA 1EZOA 4O3BA 2F97A 3C35A 4UACA 2I6EA 2DWAA 4LONB 1K32A 3EN3A 3ZWLB 3KSJA 5TP9A 3MZKA 1SQYA 2H9BA 2XL3A 4DXCA 4RK9A 5I59A 1B05A 1P1OA 1QUJA 2B3BA 2F35A 3RMZD 5H8HB 4KR5A 1EZ9A 5CRYA 5DVIA 2HCAA 2YNNA 3V7DB 1SHYB 4GF8A 5A5XB 1P1QA 2F7BA 1RI6A 4I1DA 4I9DA 3TQWA 1WVJA 5H14A 3PMVA 2GRVA 1LB9A 3L6GA 3I5OA 4YVDA 4NF6B 1LCTA 2AIXA 2CN3A 1YFQA 2PM9A 2O1MA 3SVWD 5AMSA 2Z2NA 3AL8B 3H6WA 3ZKLA 5I2NA 4XKRA 4RA1A 1LFIA 2P9KC 3VE1B 2AYSA 3T9VA 1B3EA 4A08B 1AL3A 3Q25A 4GXAA 5EHMA 4FECA 1I69A 1Z7ME 4KD5A 1EZPA 2ALUA 2ONSA 3PSCB 1MXVA 2QS2A 2XYIA 4PC0A 4TZ4A 2F7CA 5B4WA 1USYH 4JWXA 4GGCA 1A8FA 1Y1ZA 3IB2A 4O3TB 5ELVA 4KI0E 2P9NC 3LSXA 3P7IA 3O29A 3VLWA 4AQ4A 2FNCA 1P99A 3H6TA 3JZHA 1H45A 5IC7A 4I8CA 4QRJA 1Y4TA 4F2QA 4J0WA 1UTHB 5I84A 4CY2A 2YMUA 4O45A 4A0AA 4FJPA 4XTCQ 5TEFA 1MXYA 4R6KA 1QW0A 1ELJA 3H06B 4CC9A 5I2KA 2ONRA 1XVYA 4ND9A 3EI1A 4E5ZA 1IUDA 1HSJA 1XC1A 1MY0A 1XVXA 1N0TA 4N14A 4ERYA 2GH9A 3ONMA 3KFMA 1UQWA 3PPNA 1B9YA 4EUOA 3TTKA 1NNTA 3I8EA 5CMMA 1UTBA 3MZ1A 3OL2A 3TODA 1B3GA 5JK4A 3ZS6A 3DXMC 2DXYA 2O1LA 2UYFA 5SXMA 4TOZA 2UZYB 1ZKBA 1DMBA 4PFTA 3B6TA 1MQJA 5J1DA 4IA9A 3T9HB 3OKYB 4ZEDA 4JSVC 5I5IA 4XKNA 2XXWA 4YICA 2AGXA 3CIKB 4CZVA 5TPAA 3BFTA 3HN0A 5CM6A 1MXUA 3FV2A 5L9MA 1US4A 1GTKA 2I0BA 2H4IA 3MJNA 4ESWA 3SEWA 2P9LC 3OKWA 4JD2C 3QIMA 4A0BA 2UVJA 1GGGA 4FHLA 1IITA 3MBPA 3RLFE 4CY5A 4QF9A 1MQDA 3CG1A 3F3PA 3TTLA 3UVLA 4IO7A 2FYIA 2DYXA 1U4CA 3B7FA 1NKXA 5ITPA 3PXSD 4FEBA 3W9VA 2R6GE 5IGOA 1A40A 4BLAA 3LSFB 3OOAA 2H9NA 3EMHA 3T66A 3G3JA 2J55H 5JTYA 2RC9A 4OTEA 2Q8JA 2I3SA 4G2ZA 4GL8A 1XT8A 1L5TA 2OZZA 2V93A 4IO6A 2PVUA 1DTZA 2NOOA 4OMBA 4QFPA 3ODBA 5I58B 5CYKA 3MPKA 2OJTA 5H8QB 4J8GA 1R5MA 1NH7A 3RFHA 2CO0C 4MK0B 2DE4A 3H03A 1B0HA 4OZ9A 3F11A 4PSWB 1P1NA 2H6NA 3FXRA 1QKBA 3K01A 1GV8A 1LSTA 3EF7A 4LP2B 4IY5A 3VLUA 3HPIA 3JRPA 1D9YA 1LCFA 1HSLA 2RCBA 1B0LA 1M5DA 1MS7A 3OW8A 2OLBA 3QSLA 2H13A 5H8HA 2PM7B 3V9FA 3ECRA 1ZU0A 2I3WA 1FQFA 2OVRB 3AL9A 3PXTD 4G8NA 4QSDA 3UR4A 5TP9B 4JT5C 4KYSA 3SDFA 5I57B 3O9PA 1O64A 4G68C 3RQTA 2O7IA 3RPWA 4TQUQ 4TLMB 2IAAA 5TF2A 4IB2A 2VP1A 4P0GA 3OEKA 3IIWA 1N3WA 3EI2B 3FVNA 3EPEA 3SXTD 4OVJA 2D21A 4A08A 1MY3A 3NVQA 4CI8A 2G93A 2OIZA 2XXUA 4OQOA 2HESX 3T9UA 3K1NA 4X60B 4G8MA 2DWJA 1A55A 1YCJA 1M5BA 4C0RA 4J86A 1OMWB 3P4FA 3ZSFA 4Q30B 1II5A 1R9QA 3H6VA 2BJJX 4FA9D 5DEXB 1GR2A 3FRXA 2IWKA 3JB9L 3JZNA 3L6HA 1B9JA 5KDOB 2DP8A 2NVUB 1JOFA 4IO4A 4GQOA 3T22A 4KHZE 2XD2A 1B7UA 1TFDA 1RYXA 4R72A 2P9PC 4IO5A 4L3GD 4RK2A 3FXUA 3EG6A 1NEXB 1UTHA 1LAHE 3SEYA 2HYEA 3L4OD 5AFU3 2AL5A 2H98A 4X63B 1FW0A 4YKKA 1POY1 3F3FA 4O3CA 3M8UA 5TU0A 3CFZA 4U23A 3R6UA 5AJAA 4A0AB 4U4SA 1SBPA 2GFEA 3BFUA 2O7UA 1TBGA 3G3HA 2H3XA 2ZNTA 4GL0A 2I3VA 3B7DA 3G3GA 3IX1A 2B5LA 4OEUA 3I7KA 2ZXTA 3M3LA 4PBZA 3VXBA 3VA6A 5I2KB 2X26A 2EBSA 4WKMA 1IIWA 3CFSB 4U1ZA 5K2YA 3S9EA 5FKSA 3V5WB 3RRMC 3O66A 1Q35A 4RJZA 5AA1A 4JSXC 3H4ZA 4MBPA 3RGYA 2O68A 3Q26A 4LATA 1UTBB 4NF5B 3OL2B 3OO6A 2Z22A 3ODTA 4CY3A 5H8FA 2XX9A 2XD3A 3U4YA 4IGTA 3SFZA 1NNKA 3I2NA 3QXMA 4M1VA 1ZLQA 3VVDA 2KLFA 1DOTA 2M8CA 5TPAB 2E1SA 1R6ZA 1XHYA 5ITOA 5EMMB 1ZJLA 2V3UA 5CBRA 4FA1D 1ATGA 2H9LA 3RFGA 3U92A 1JETA 3K2DA 1MDAH 4J82A 2YLNA 2HXCA 5CXCB 1MPDA 4ZOYA 2CMOA 2AGZA 3ORVD 2O6AA 2J56H 3KJTA 4MLVA 5EYFA 1PDAA 2Y7RA 3PXWD 2O9KA 2XXQA 1A54A 4LQ5A 1JW5A 3VGZA 1ZTYA 3PPPA 3U93A 1AOVA 2I4CA 1B51A 1OMPA 3BG0A 2QS4A 3FM0A 5A2Qg 5GXHA 3I7HA 1H44A 1LBBA 1B5IA 3IO6A 2I3TA 4PE5B 3UVKA 5I58A 1XOCA 3VXCA 4OFOA 1ANFA 3OTTA 1M5CA 4THIA 5JTYB 4R6HA 3FASA 3IR1A 4MH5A 1MY1A 4EF2A 2P1SA 4ESXA 1L0QA 3TUSA 2Q7QA 4NE4A 3RT6B 5CYKB 5IT9g 2OWTA 1OLZA 1IZ1A 3C31A 1GXRA 2ONKE 2UVGA 2I58A 4EQ9A 1LLSA 3K26A 3CSBA 3HHGA 2Y7KA 5H1MA 3SJLD 3RTWB 1MG1A 3RN0D 3OO8A 2I0TA 4L9OA 3A3CA 3MPLA 3TCGA 2AQ5A 4LZ7A 2Z2PA 2P9SC 4O3UB 1MH3A 3IORA 2AGYA 5I57A 2X7QA 3K6VA 3FGBA 4ECFA 3HFQA 4F1VA 1FQDA 1H43A 4AB5A 4OZUA 2OJYA 1B1XA 1EU8A 2PX1A 4G4PA 4POWA 3FXQA 3Q27A 4EWRA 4A2LA 1JW1A 3KGCA 3EI2A 3OENA 5K1CC 3C36A 4BL0A 4H65A 4PXWA 2RINA 3MUQA 3RTFB 3L4MD 3I7PA 5FKTA 1LAFE 4POXA 3MP6A 3THIA 4OWRA 3G7WA 4G77A 4K3FA 1GG2B 1FQCA 4FB1D 4OHNA 2XHDA 1TT1A 3DP6A 4H5JA 5L9OA 2HXWA 4E0XA 4MFIA 3A3UA 3RN1D 2QMWA 3VVEA 1AH5A 3UK4A 4QFOA 4ELQA 1AIVA 5DEXA 1PBYB 2I0SA 2P0SA 5CC2A 3VH0A 4FE8A 3H7MA 1BTJA 2H9PA 4IGRA 3IJ1A 3SBRA 2P9IC 3D4GA 3TPAA 1URDA 1QUKA 2ABHA 4C1UA 3FJGA 4P11A 2NUVA 1LBCA 4U4XA 3AFCA 4RPOA 2OK2A 4ZOXA 5AA2B 3T93B 4U1EI 3FGSA 2F6GA 1NH8A 3TFLA 3GBBA 1P22A 4OERA 4PBYA 1B40A 1P1WA 3W9WA 1PGUA 2RC7A 1VSOA 2G99A 2OK6A 4NSXA 3W15C 2VGQA 5JEIA 1A8EA 3PUYE 4F31B 2GHAA 3OSRA 1XS5A 1JJUB 4RY1A 2AL4A 2DVCA 4GM3A 4R2BA 3K1PA 1VE4A 2DS9A 2YJPA 2YB8B 1B3FA 3FD3A 1PB9A 5EAPA 4NF5A 4QT8A 2DQVA 3V5AA 4F29A 3IJCA 1PB7A 2HAUA 1MQGA 3KRWB 1MY4A 3C99A 4I79A 2I49A 3TAJA 1OLAA 4LG9A 5FKRA 5IJ7E 3KSXA 4D6VA 2RF1A 3SMRA 1DPPA 2XXXA 3U8QA 4FEDA 2MTAH 3I6VA 3SLED 1N7WA 3PU5A 3TDJA 2LAOA 4KCCA 1VFDA 4YMBA 4X1DA 5H8FB 2DOJA 3FATA 1Y1MA 1JMXB 1XHMA 3I7NA 5EARA 2V3TA 2DE2A 3UKUC 2ZNSA 4YKPA 4YB7A 4QFLA 5CXCA 1WODA 2V84A 3DP8A 5TDHB 2Z8DA 2H9MA 5AA4B 3PD8A 1JEVA 1N6FA 4YAHX 4DZ1A 3G3IA 3C34A 4J87A 5H8NA 2CNXA 1D3KA 1R9LA 5HE3B 2RKMA 1IXHA 4QRZA 2YNOA 3A09A 3PUWE 2DWIA 1QULA 2Q2AA 3K0VA 1A7LA 2R9JA 5IJ8E 4QL1A 2CO0A 1MXZA 2G29A 3N6TA 3IB0A 4H8JA 5CI5A 4A7JA 5M2VA 5FLXg 3QAXA 2Y7PA 4NMYA 1JW4A 4ZOZA 2QC5A 5I56B 2HJBA 4RPNA 2DSFA 2V3QA 3DXKC 5HM4B 4DLDA 1FQEA 4EF1A 2OBGA 3FZVA 4PFWA 5FTIA 3K4UA 1VR5A 4FAND 3U94A 3OKTA 4JSOA 3UGWA 3PVUB 2OVPB 1B5JA 5B7DA 3UVOA 1YPNA 1B52A 5C2WB 5IGQA 4G68A 1NFTA 4F3PA 3MP1A 1SD3A 1T0KA 5ICTA 3I7OA 4GM9A 3PUVE 1UIVA 3M3KA 2ANJA 4AEZA 3I3VA 4F2OA 4F3SA 1R1NA 3V89B 5BWJA 2Q2CA 2VHAA 4ELOA 4H5FA 2I4BA 4X1BA 4LVQA 3CFXA 2OWSA 3OXNA 2AGLA 2O69A 1QUIA 3HHFA 1ZBMA 2F8DA 1MDP1 4E54B 4F22A 3HV1A 1BIYA 2Q89A 3IL1B 3TEPA 1MQHA 4J78A 4DXBA 2UZXB 3TTRA 1OLCA 1Y9UA 4RNSA 2A5SA 3CRBA 2W7YA 3GZGA 4OYVA 3VFJA 4Z0IA 2CZLA 1LB8A 3WAFA 1SDXA 1FCKA 3LSWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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