3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
source organism Escherichia coli
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
3U92A 3U94A 4NF8A 3IORA 4ISUA 3RSEC 4ZEIA 4IO6A 4PFWA 1P1NA 4ESGA 1MG2A 3U8QA 2DYXA 1Y3NA 4QSEA 1MY2A 5FKQA 3N6UA 4E0WA 3H6WA 2AH0A 2X26A 1FQBA 3VFJA 2AQ5A 1NNTA 3I5OA 1QVSA 4GXSB 1DPPA 3ORVD 1B58A 2RCBA 1SD3A 4O3BA 4QFLA 1MY4A 4F3PA 1TYQC 4DXBA 2F36A 4A11B 2PMSA 4H8IA 4E0XA 2XXVA 5EMKB 2PYYA 4EWRA 4LQ2A 2OWSA 4MFIA 5I58A 2UVIA 3RN8A 3UN6A 3EI4B 4WEPA 4H1XA 3KN3A 1LFGA 1SVXB 1N0TA 2OVQB 1USYE 1P1UA 1S4UX 3CFVA 2UVGA 5TP9A 1I6BA 2Z2NA 1NNKA 3EHTA 2DE4A 1B4ZA 3N0EA 2H9BA 5EAMA 3V9FA 2PM9A 1JW4A 1XKSA 5A5XB 3G3KA 5TU0A 1WVJA 1JJUB 2UYFA 3SETA 2Q2CA 1YAEA 2O84X 5LOMA 1LCTA 5CXCB 4J78A 2F34A 2J57G 4KQPA 4LZ5A 5I2KB 2HEUA 1B5JA 3P7IA 2Q8JA 3IJ1A 5TEFA 3OL2B 3GXAA 1KWHA 1B0LA 3O6GA 4I62A 5KDTB 3SXTD 3VDFA 3R6UA 4IGTA 4AQ4A 2DXRA 1IXGA 1N84A 5TPAA 2CNXA 3ODTA 2CN3A 5FKTA 1PBQA 4OWDA 3O29A 4OVJA 3QSLA 2ANJA 3MVYA 3MQ9A 3HHGA 3PXSD 3MZKA 3FRXA 5H17A 2H9NA 2O6AA 4PC0A 2H25A 5H8FA 2I49A 3CVGA 1D9YA 4J8BA 3MPKA 4MK0B 3IX1A 2I0TA 1PEVA 4NF5B 1BKAA 4M4GA 4POWA 4P11A 1S7YA 2UYEA 3PMXA 2HKRA 4F3SA 1B9YA 3SDFA 1MM6A 3TQLA 4A0BB 4QSCA 3SLED 4OFJA 3UVKA 4YB6A 1UTBB 2HYEA 1ERJA 3KBRA 2ONKE 2A5TB 3GBAA 1QJMA 1M5BA 1ZLQA 2Q9TA 2V3TA 4H65A 3UA8A 1H3DA 4KCCA 4YU0A 4FORA 3LSFB 3MP8A 1SW5A 3I7PA 3UKRC 3D4CA 3IO6A 4LZ8A 5F1QA 3JB9L 1SW4A 3L6HA 3P4FA 4ZEKA 1CE2A 4U4XA 2DE3A 1FQFA 2ONRA 1D3KA 4GM9A 1B51A 4OERA 4NMYA 3UR4A 1DTZA 1MXWA 3G3HA 3KRXB 2I58A 2XYIA 3MVZA 3Q29A 3C5MA 2H3XA 2GC7A 2F8DA 4G2ZA 3V89B 3PUVE 2Y7WA 4OFOA 2I6EA 3O6IA 1JETA 3QK6A 3TCFA 1J1NA 3RUMA 4FE8A 3IAZA 5H8SA 4P0IA 4EQBA 2Y7KA 1R9LA 3MP1A 3TTNA 4WEDA 1PGUA 4J0WA 4NTLA 4XKPA 5CYKA 3N5LA 3B7FA 3EI3A 3EN3A 4OHNA 2XU7A 4F2QA 3OMBA 3SCYA 2XXRA 3KJ7A 4F22A 4BDRA 1NKXA 1I69A 3BG0A 1IZ1A 4JSDA 5ITOA 2HJ4A 3VVEA 1WODA 1IXHA 4A11A 1T0KA 1B6HA 1PBYB 5H8HA 2GHAA 4H5FA 1MXXA 2UVJA 1SHYB 2WKYA 4U2RA 5CMKA 4X60B 3S2VA 1UTHB 3TCHA 4ZOZA 1B7UA 1DOTA 1A40A 3R7XA 2DOJA 3EI4A 1R6ZA 3PD8A 2QJEA 1YTVA 4THIA 4R6KA 1XHYA 4KPTA 4EF2A 1M5CA 3VLWA 3IJCA 4X1DA 4NF6B 4OMBA 2AL5A 3SEYA 3M3LA 4FB1D 1UIUA 4CZYA 4R6YA 3JZJA 2I48A 4KHZE 2YPNA 2BCJB 1M5EA 2X7QA 5AA1A 2ZYOA 3KFMA 4J77A 2OCUA 2REGA 2XX7A 1IITA 3I7LA 2Q2AA 3CSGA 3HPIA 4E5ZB 4EQ7A 2NXOA 4R9FA 3USDA 2GH9A 2ESNA 5I2KA 4MF3A 4Q8RA 2H6KA 3OKYA 1RI6A 2DWHA 4F2OA 3FXQA 5KDTA 5HQGA 4OYVA 1GOTB 3RN0D 3TODA 1EZOA 4Y5RD 4MH5A 4NWDA 2V84A 3RLMD 1ZKBA 2DVZA 1II5A 3UIFA 3PUZE 4O3CA 3AXFA 1JEUA 1EU8A 1SYHA 4PFUA 3BG1A 2XXQA 3O97A 2I0SA 2FNCA 3U72A 3KOTA 3EI2B 5AFU3 4R9GA 4J73A 5CI5A 4KR5A 4BDNA 2OJTA 4NF5A 2R71A 4G4PA 4BDMA 4U7AA 4CI8A 2QPQA 2I0BA 1B7HA 1B3HA 2UZYB 2XXHA 3HN0A 2H14A 4A0BA 2VOZA 4PFTA 2XX8A 4FHLA 1MDP1 4PXWA 3S4UA 1HSLA 3PSCB 1N6DA 3OO8A 2A5TA 1OMWB 4GRKA 4QFKA 1A7LA 4DZ1A 3C9CA 4XKNA 2DXYA 4YAHX 4H0WA 3JZHA 2F7CA 4L9OA 1TFAA 2XXIA 3S9LC 4QRZA 2P9SC 5CXBA 3J80g 1US5A 4DDDA 3G3JA 4LA9A 3KRWB 1TT1A 3CSBA 3DM0A 4H8JA 1ATGA 3EHSA 5HE2B 3V8XB 1GTKA 5IC7A 2XL3A 4KD5A 1BLFA 1VYHC 4D0KA 1GGGA 1U4CA 3IOWA 2ZNSA 3MVWA 1D9VA 4XTCQ 5JEIA 1LFIA 3MXXA 1LLSA 3VXBA 1Q1KA 4LGNA 4DXCA 3A09A 2F35A 3Q25A 4ZOYA 3OW8A 2CE8A 4I8CA 4ONYA 4CY3A 3S9EA 1XS5A 2CO0C 3IB0A 3U4YA 1MY1A 4A2LA 4ELOA 3SERA 5C2WB 4R7AB 4ESWA 3CI8A 2OK4A 3ZWLB 2VGQA 4A2MA 3ODBA 3EWEA 4FA1D 3A0FA 4OFLA 4A09A 1Q35A 4TQUQ 1M5DA 2OK2A 3EPEA 3ZS6A 3SFZA 4GL8A 1MH4A 4RXLA 5FKRA 4LONB 2HZLA 4YMAA 4X61B 1B4HA 4OENA 4I9DA 5EMJB 2CMOA 3T9VA 2ALUA 2Y7IA 3C35A 1QUJA 4ERQA 4GIZA 1VE4A 4FA5D 1LSTA 2PT2A 2GNQA 4OETA 2MTAH 1B3LA 5DEXB 3FXUA 2E1SA 2Q7QA 1Y1MA 3JZGA 5I5JA 3CIJA 5L9SA 3Q27A 5IJ8E 1DTGA 3K4UA 3L6GA 4ERYA 2V93A 2F5XA 1BIYA 3EF7A 4QHQA 1ANFA 3FASA 2HZKA 5GXIA 4TLMB 3IJOB 4E5ZA 4QFOA 1GR2A 2D21A 3NVNA 2BBKH 4JDFA 1TFDA 3B6WA 5H8NB 2YLNA 4OEVA 1LB9A 3TKDA 3RTFB 1H44A 3AL8B 1VFEA 3OELA 4J82A 3IJXB 2F7AA 5IAIA 3WAFA 4NE4A 3K1PA 3Q28A 1QNIA 5EM2B 3F11A 3OENA 3PMVA 4EXLA 3R26A 5CRYA 2YJPA 4E54A 3EQ1A 5I59A 1QUIA 3FGBA 1Q47A 2PM7B 4WXJA 3JROA 5IT9g 2P9PC 3PXTD 2F97A 4X63B 1QKBA 4U23A 4QRJA 4O3UB 3SMRA 2GHBA 3EI2A 4C1TA 2THIA 1B9JA 2IA4A 3TTRA 1DSNA 1USYH 3K1MA 2O1LA 2YNOA 2Y84A 4OESA 2ABHA 3I3VA 3MUQA 4QL1A 1MY0A 2XXTA 1IIWA 1ZBMA 3DLNA 3A3CA 2V25A 3FVKA 1ZIUA 3K02A 4DLDA 2H68A 2Z2PA 2HJBA 3MC2A 4GOTA 5EHMA 4F3BA 3HSTA 1Y3QA 3UVMA 5ICTA 1LB8A 4F39A 4H6DA 3OSQA 5KCJB 3DXKC 1NNFA 2PBWA 3T93B 3PVWB 1HSJA 3QXMA 1NH8A 3CFLA 3PD9A 1FTKA 3K6VA 2H13A 4J79A 4NF4B 3PPPA 2QS4A 4YVDA 2CN2A 2NOOA 4PETA 4I79A 5DVJA 1H43A 1NNPA 3EI1A 2GC4A 3FV1A 1PBPA 3DSMA 3T66A 1K32A 3W15A 3A3UA 2PX1A 3RPWA 4DCXA 5HE0B 4FIMA 3QUJA 2XXPA 2RKMA 1PI6A 4JWOA 4EXKA 3JPXA 1Y3PA 4OXVA 3OXNA 3K00A 5CM6A 5HM4B 1OLCA 3MVXA 4DXUA 3ZSFA 3H6VA 4D6VA 2H6NA 4NEDA 5ICQA 4JSVC 2H6QA 4IO5A 4U1EI 4MLVA 1URDA 5IGQA 3VXCA 1B1XA 4J8GA 4OQOA 3TDJA 2I3VA 1PB8A 3HO7A 3MZLA 2J55H 1OVTA 3K6UA 4RY1A 3E9XA 3VA6A 3DP8A 4WKMA 4U4SA 5EARA 5H8QB 4IB2A 5M2VA 3O6HA 1N7WA 2PT1A 1TWYA 1UQWA 3FATA 4A08B 4BDLA 1FWXA 4M1VA 4ZEFA 4FATA 4A0AB 4UI9R 4DCYA 4QFNA 5IKBA 4GVOA 3FJGA 5TDHB 4OEUA 1ZJLA 3MZ1A 1QW0A 3I89A 5JWZA 3K6XA 2XHDA 4BL0A 5K2XA 4ELQA 4J87A 3VLVA 3CG1A 2I0RA 2CZLA 1I6AA 3OEMA 5B70A 3OO9A 3TYHA 4G68A 5IGOA 4Q5TA 2G29A 3LSLA 1VSOA 1OQHA 4OZ9A 3C31A 2O51A 1POTA 3C32A 4GQ1A 3DP6A 4KFMB 3I7NA 4QFPA 4RPNA 3IKOA 3AL8A 4R2FA 4QF9A 4ZN4A 2F6GA 2UZXB 4L17A 4YB7A 2Z8DA 3G3GA 2DWIA 4X9TA 3WAEA 5EM2A 3CIKB 1XIPA 3NVXA 1YFQA 2GRVA 4GMBA 3TUSA 3FM0A 4Z0IA 2RF1A 3PMWA 3F3PA 3B6QA 1P99A 4U22A 5HE1B 2H9PA 3IOTA 4MLQA 1AMFA 4RK2A 1N76A 4AEZA 3MJNA 1B2HA 3FJ7A 5FKSA 2ZYMA 2ZMBA 3UVLA 2I4CA 3OO7A 3TAJA 1RYXA 1H76A 4F31B 1IXIA 5EMLB 4Y7RA 5TEEA 2XL2A 1MXUA 2DP8A 5AE4A 4R75A 4G8NA 3K26A 5I5IA 2D5WA 2Y7PA 4RPOA 4ELRA 2IURA 3RY3A 3GZGA 3N26A 2G93A 2OVPB 3PUYE 4GLIA 4YMBA 1DMBA 3C36A 3ECRA 1MQJA 3C4MA 2DVCA 1FCKA 4CI3A 5SXMA 4TLLB 5KCJA 1B40A 4CZXA 4FAJA 2HAVA 3H3GA 4JT5C 3IJ0A 3THIA 3SEVA 4H5JA 4CY1A 2QL3A 5A5XA 1SYIA 2NVUB 4NF4A 1L5TA 4ES0A 4LUBA 5DT6A 3PUXE 3K6WA 1FW0A 3PPOA 1JMZB 4CI1A 5CXCA 4GGCA 1BTJA 1LBBA 2G99A 3ONMA 2HXCA 4CZVA 4BH6A 3UVOA 1JEVA 4BDOA 2AH1A 5B7DA 1SW2A 3OL2A 1BP5A 5L9MA 4IA9A 2A5SA 1EZ9A 2AYSA 5C2VB 2OVRB 2PBIB 3RQTA 3TQWA 4RK9A 5HPQA 2XD3A 3E4RA 5HBCA 1MQHA 3RTWB 2V3QA 1R9QA 3MPLA 3MBPA 3N0DA 4N14A 4GGAA 4NF8B 2G9AA 4PBZA 2V3UA 2HKMA 1MH3A 2RC9A 4YZZA 5J1DA 4XKRA 1XVXA 3I2NA 4R6HA 4LP2B 2B3FA 2H5YA 4L3GD 1FTLA 5AJAA 4ZOXA 5AA2B 1WDNA 3FZVA 4HCYA 4RJZA 4HDJA 2YNNA 2B5LA 4J84A 4ZOVA 3OTTA 4G8MA 3LUYA 4A0AA 1UTBA 4AB6A 3ULEC 2UVHA 1NL5A 1JW5A 4I1DA 1P1WA 3IIYA 1XC1A 3HFQA 1EZPA 4UACA 1IQ7A 4F1YA 3FVGA 3QUFA 1MPCA 1O64A 5CBRA 1GP2B 3S9NC 4JSXC 3NVQA 4Z8LA 4N07A 3T9HB 5CBSA 1B1HA 1NFTA 1JOFA 1XVYA 3FD3A 5TP9B 3RT8A 3FUZA 1MXYA 1PB9A 4FWWA 1RKMA 3V83A 1POY1 2QSXA 4FA9D 3MAMA 1GXRA 4GGDA 3JAMg 3EU7A 1NH7A 4LATA 1P22A 1VFDA 4PSWB 3MZ9A 5DYHA 5GMKn 1LBCA 5C9ZB 1GG2B 1OVBA 2H4IA 4L3HD 2O7IA 2IAAA 4NWCA 3GFCA 3BWSA 3MZBA 3PPQA 3F3FA 3BFUA 4ZE9A 1RYOA 1LGBC 3T9XB 3B6TA 3VVFA 3DWLC 2DWAA 3DP4A 1FQAA 1OQGA 5AA4B 2H47A 1P1OA 3JV9A 1SQJA 3UP9A 4GQOA 5TPAB 1MDAH 3SHFA 2RCAA 5JTYB 3KSJA 3CRBA 4XXUA 4UA8A 4JSPC 3K27A 2P2AA 3FV2A 5GXHA 2XX9A 5HYNB 1UTHA 1N04A 4ZZEA 3SVWD 4U21A 4IGRA 4X48A 4KYDA 4R74A 2DQVA 1M5FA 4QQEA 1ZMGA 4IO7A 5GSAA 3OOAA 5EHSA 3KN7A 3I7OA 3QIMA 2RC7A 4NF6A 1B5HA 3IB2A 2QS3A 5FTHA 1N6FA 2ZYKA 5KZTA 2QS1A 3V5WB 1XOCA 5EAPA 4RNSA 3H6TA 1Y4TA 4L1QD 5TF2A 3EMHA 2E0SA 4EUOA 3IOVA 2QS2A 3E13X 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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