3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
source organism Escherichia coli
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
1LAFE 4FEDA 1OMWB 1B3LA 2ANJA 2G29A 4GWOA 4R2BA 2ZYKA 4PFUA 4NF4A 3OKYB 3IJ0A 2CO0C 3B6TA 3ECRA 2R6GE 2F6GA 4GM9A 3LC8A 5DVFA 4N14A 2E0SA 2Z2PA 2DVCA 4YICA 3EF7A 1OVBA 3TAJA 4IY6A 1XOCA 1FW0A 3GBAA 3TFLA 1B52A 4OEVA 2F97A 1XT8A 2V84A 3U94A 4DCYA 4CI1A 4FORA 3G3HA 2UZXB 1JETA 3TKDA 4IGTA 3EI3A 1JW5A 2HEUA 5EHSA 2ZNUA 2P9PC 5AA2A 4U23A 3V9FA 1XIPA 1JQFA 3SFZA 2P9UC 1MY3A 3ILTB 1ANFA 3I7KA 3KG2A 4GIZA 3ILUB 2QS4A 2O69A 1R9QA 3DXMC 1MQDA 4Q5TA 5A2Qg 3OD7A 2HCAA 4BDQA 4A2MA 1O63A 5SXMA 3S9LC 4I9DA 2H13A 1SHYB 3TCHA 1OLZA 4YKPA 1LCTA 4A11B 2UXAA 3Q28A 2OVQB 2HQ0A 5TEEA 5AFU3 3QYTA 3I8EA 3OENA 3VGZA 1UTHA 3DSMA 4GF8A 2GH9A 4LUBA 1O7TA 3HSTA 4JWYA 3LBSA 3CI8A 2DVZA 2GHBA 5DEXA 3MZLA 2P0SA 4LATA 1LFGA 1QUIA 4ELRA 5FHMA 2I3VA 2B5NA 5A5XB 3IIWA 1TFDA 2HZLA 3LSLA 4Z0IA 1UQWA 3VV5A 3NVQA 2O6AA 4EDPA 4RNSA 2AGZA 1P1UA 2B3FA 2XXQA 4KFMB 3U92A 3SETA 1RYXA 4CY1A 2UYEA 5H1MA 2H68A 4ERZA 2VD2A 2H9PA 4R72A 5IT9g 2H6KA 1D9YA 1XHYA 4YMBA 1SYHA 3OO9A 3I2NA 1OVTA 1MDAH 3W15A 1IXHA 3IB2A 1UIVA 4FAJA 4I79A 4J0XA 4DLDA 2RCBA 1TWYA 2PT2A 2ZMBA 4GGDA 1DMBA 4IGRA 1OMPA 3I7NA 3PU5A 4OERA 3MUQA 3CVGA 5EAMA 4ZS9A 2OVRB 1PB7A 3R26A 3H6WA 3CRBA 4ZZEA 4U1ZA 4U2RA 1A0RB 4QF9A 3O29A 3MP1A 2XXYA 1OQGA 1Y3QA 2YPNA 2P2AA 3DWLC 3N26A 4X60B 4XKPA 1JEVA 2XD2A 3IJCA 4FEBA 3M3KA 4H5GA 1B3HA 1L0QA 2DQVA 2HXWA 2D3IA 2VD3A 2XHDA 4A0AB 3C33A 4NE4A 4AB6A 1JW1A 1NKXA 1LFIA 4E54B 3O66A 4H65A 4OQOA 3OSRA 4YAHX 3BG1A 1MDQA 1QJMA 5H8SA 3AXFA 4LG9A 5FTHA 4FHLA 2IURA 2PMSA 4GFRA 4U1OA 1GR2A 2GC7A 2ZYMA 1VFDA 3SCYA 4OHNA 5CI5A 1AIVA 2F7AA 4YB7A 4FATA 4ZZAA 3E3KA 3JRPA 3BG0A 3PV0E 3JZGA 3FIRA 4X3EA 3PXTD 1BP5A 4JWOA 5I2KB 2XU7A 4CI8A 4QT8A 2I0CA 5ITPA 4JSPC 1NH7A 3I7LA 4JB7A 4U1EI 2HESX 2P9NC 3GBBA 1MQGA 1Y9UA 2O7IA 5AA3A 3RTWB 2H6QA 4XYHA 3KJ7A 3HO7A 3SEVA 3C9CA 3K27A 3K0VA 2XXIA 5L9MA 1MXYA 4THIA 1B9JA 1MPCA 1Q35A 4RJZA 2YB8B 1Y4CA 4ZEFA 3TODA 3CSGA 2QS2A 4GM8A 3HV1A 4KFQA 3SDFA 1MY2A 4C1TA 1MG1A 1FQBA 3IOWA 5EM2B 4AOWA 3TTNA 4ZEKA 3TPAA 2O68A 3S2VA 1PBYB 3AL9A 1H43A 2OCUA 3FUZA 5DT6A 5TU0A 3JZHA 5TPAB 1PDAA 4TQUQ 3EPEA 2UVJA 3DXKC 4O3AA 2GNQA 5H8QA 4BDLA 3CG3A 4F29A 5H8NA 2YLNA 3LSWA 2Q9TA 3NVXA 4ERYA 3OELA 5BWJA 2A5TA 3T93B 1B32A 1Y4TA 1ZLQA 3EI2A 3EMHA 3DP4A 5CMBA 3RNNA 4IO5A 2H99A 3RLMD 3G7WA 3QIMA 4QSEA 3IOVA 1LLSA 4A0AA 4HCWA 2OWTA 4ZE8A 5GXHA 2YNNA 2O7UA 1MG3A 2GC4A 2V3QA 2HAVA 2PM7B 3K1NA 3IOTA 2GHAA 3SHFA 5IJ7E 1S50A 3TELA 4FWWA 4O3BA 3DLNA 4J82A 4WEPA 5I5IA 2KLFA 4JSVC 2HYEA 2I0RA 1A40A 3A3CA 4X9TA 5KDTB 3L4MD 1JNFA 2ESNA 4F39A 5I2KA 4AQ4A 1N7WA 4G8NA 1PB9A 4CI2A 4P0GA 3N6UA 4TOZA 1B40A 4F3SA 1B5JA 2DE3A 1A54A 4K3FA 1TBGA 4H1XA 5IGQA 3CFSB 3T22A 1P1WA 1B7UA 3VLVA 3PD8A 2XX7A 3VE1B 4NF4B 2PM9A 4GRKA 3TMGA 1FTMA 3SEXA 1AOVA 5AA1A 3KN3A 3G3JA 2B5MA 4X61B 4IO6A 3JPXA 1POTA 4Y7RA 2XXVA 4QRZA 2XYIA 4YMAA 4EQ7A 5AJAA 5KCJA 2Q89A 1MM6A 4HDJA 3PE7A 5TEFA 3CIKB 2XXTA 1URSA 4HTGA 2G9AA 1MXUA 3PPOA 4I1DA 5I56B 4HS7A 4NF5A 3VXCA 4FA5D 4JWXA 2DE2A 5AA2B 3KBRA 4PBYA 4JT5C 3C5MA 4TZ4A 1XKSA 5FLXg 2RCAA 2ZNTA 3FGSA 5FQDA 5LOMA 3BFUA 3Q27A 4O3CA 1N04A 3I6VA 2H9NA 5EALA 3QAXA 2V3TA 1R6ZA 4R74A 3RPWA 4U22A 3SVWD 5C9ZB 4NF8A 2OBGA 3EG6A 2QS3A 5L9SA 2P9LC 5K19A 2G93A 2O9KA 1Z7ME 2OK6A 3P4FA 3PSLA 5GSAA 4FA1D 4JSXC 3PPNA 2OJTA 2J56H 4JSDA 2F36A 2O1MA 3B7DA 3MMYA 4H5FA 4UACA 1LB8A 3QK6A 3PGFA 3I8CA 3KOTA 2Q8JA 1UTHB 1XHMA 4C0RA 3PSCB 1B7HA 3DELB 1II5A 3SBQA 4CC9A 2AIXA 5DEXB 3V5WB 4WEDA 5I57A 2HJBA 5DVJA 4RA1A 3T9XB 1I6AA 2I4BA 5B70A 4OFLA 4DCXA 3I3VA 4ZOXA 3ODTA 3E9XA 1B0HA 2B5LA 4A0BA 3USDA 1IXCA 1M5BA 4FAND 3QUJA 3SEYA 4H0WA 5K2YA 5TP9A 4EUOA 5GMKn 4FECA 3SKPA 4PXWA 3W9VA 5DYHA 2BJJX 3A09A 4J77A 3IK6B 2G99A 1IXIA 1GG2B 3I7HA 4POWA 1ATGA 3K1PA 1BKAA 3RFHA 4QL1A 1CE2A 4ZOVA 3N0DA 1SBPA 3D4GA 4MH5A 3RRMC 1YTVA 5DVIA 3IJ1A 3T9HB 2AQ5A 4OENA 1SW4A 1LCFA 1USYE 2DWAA 4OVJA 4P0IA 1QNIA 1DSNA 1JOFA 5B4WA 2PBWA 4GXSB 5I56A 3DP6A 2HKRA 2R9JA 3N5LA 3CFVA 3KSJA 2XXUA 3N94A 5EYFA 4GVOA 3T96B 2XXWA 3W15C 3MPKA 3IOUA 3LR1A 2XD3A 2DYXA 4G8HA 3TTLA 4KCDA 4ZE9A 1GVCA 4NSXA 1ZU0A 4OYVA 1B1XA 4J84A 4EXLA 5KDOB 5JEIA 2I0BA 3UVKA 2XL3A 1MY0A 1DPPA 2DSFA 1P1NA 1NR0A 3AL8A 4PNKB 1Y20A 1LAHE 1QKBA 2A5SA 4J79A 3MJNA 4F2QA 1A7LA 3PMVA 3T66A 3VXBA 2P1SA 4ONYA 4BDMA 1H45A 5K2XA 1FTOA 1NNTA 3BWSA 1LBBA 4F18A 2H25A 1FQFA 4CZVA 5I84A 3EI4A 1NNKA 1UTBA 1N6FA 2VP1A 1JVYA 3FVGA 4O9DA 4Z8LA 3TTRA 1P1QA 1N6EA 4MBPA 1NMUA 4BDNA 4FAVD 5FA5B 4NEDA 4ZEBA 4A09A 4O3TB 3VLUA 4KR5A 1SD3A 4KYDA 3OKTA 1PBQA 4ZOYA 2DOJA 2B3BA 1FQDA 2W18A 1MRPA 1LBCA 5ICQA 2UVHA 3Q25A 3F3GA 3AFCA 2NXOA 2Y7IA 1SDXA 1MDP1 2NUVA 4DXBA 5H8HA 2DS9A 3CIJA 4IO2A 4PFYA 2UYFA 2I48A 2HAUA 3OOAA 4NTLA 4JD2C 3MAMA 3B7FA 2ONSA 3UIFA 1M5FA 3EHSA 4PP0A 3RT8A 4IMMA 1DOTA 2X26A 4QRJA 2O1LA 2IA4A 1R5MA 3FXRA 4EQ9A 1QUJA 3CFZA 3IO6A 2QPQA 2H6NA 2HJ4A 2RF1A 4OFOA 3WAFA 2REJA 4MLQA 4J87A 4JSNC 4BL0A 4MLVA 3UN6A 3WAEA 3BKIB 4IO7A 2I3TA 3FGBA 3MVXA 3IB1A 4FA9D 3O6GA 3LSXA 1EZOA 5H8QB 3TTKA 1M5DA 5H8NB 3CG1A 3H6UA 2A5TB 1K8KC 1BTJA 4ZN4A 3HPIA 3PUXE 2E1SA 2RC7A 4ES0A 1XC1A 1B58A 2J55H 1K32A 3EI2B 2NOOA 4N6PA 4GGCA 2QJEA 4E0WA 3FATA 3PUVE 5H14A 5CM6A 1GOTB 4Y5RD 5DTBA 3U1OA 2DWIA 4POXA 2H3XA 1B05A 3A0FA 2DXRA 2NVUB 4A2LA 3IL1B 4GQ2P 3PPRA 3HN0A 3EHUA 3QUFA 4ESGA 5FTIA 3K6VA 2X7PA 1B6HA 3VLWA 1NEXB 4XKNA 2RC8A 3ODBA 1PEBA 1FWXA 3MC2A 2YMUA 4ND9A 1CB6A 1MS7A 3BFTA 5EMJB 2O84X 3IJXB 2Z2NA 1S4UX 1A8FA 2H14A 2DE4A 2HZKA 2ZNSA 1Y1ZA 4KD5A 1MG2A 2YNPA 1NL5A 4OWRA 3SERA 1OQHA 1I6QA 1H3DA 1A55A 3RGYA 3B6WA 4GQ1A 4GL0A 4X63B 2H9BA 3LUYA 3FVOA 5H8FB 3RQTA 2PM9B 1JJUB 3SBPA 5FHNA 1VE4A 1EH3A 1XVXA 4OFJA 4F1VA 4JXIA 3UKUC 3R7XA 1VFEA 4FB1D 3SBRA 5EMMB 4F3BA 3IORA 4HW8A 4OZUA 4RXLA 3KOSA 5AA2D 1Q47A 5IAIA 5KCJB 2CE9A 1N6DA 2I4CA 4YVDA 4GQOA 3JZJA 4GM3A 4PETA 1TFAA 3UVNA 1SW5A 1MM7A 3MKSB 5I59A 4NF5B 4HCYA 5CYKA 2F8DA 3GREA 4I8CA 3RUMA 2CE8A 1O64A 4BLAA 2DP8A 1SW1A 5B7DA 5HE2B 2ONRA 2DWJA 3G3IA 1MXZA 3Q29A 2PYYA 3V89B 4DIGA 1JEUA 3SXTD 3SJLD 4F1YA 5F1QA 4U21A 4FJPA 4YKKA 4NF8B 1JVXA 2AH0A 2ALUA 3VDFA 3IR1A 3HFQA 2J57G 4UI9R 4KHZE 2Y7WA 2YJPA 5HE0B 3DP8A 4E5ZA 2H4IA 2F6PA 1US5A 3CFLA 2IUPA 1FTJA 5THAA 5HYNB 4L1QD 2QMWA 2I0TA 3FZVA 2EBSA 2Y7RA 4G8MA 3UVOA 1SQYA 3KN8A 3PUYE 3TQLA 1DPEA 3C4MA 2XX9A 4QSCA 4J0WA 3L4OD 3FVKA 4K3JB 5F7VA 3VVFA 4JT6C 5I57B 3JB9L 3EQ1A 3IKOA 4OMBA 4IB2A 3M8UA 1ZJLA 4ELQA 1JMZB 3OL2B 3RLFE 5CXBA 3K01A 3HCQA 4G77A 1RI6A 4QFLA 3AH8B 4G2ZA 3H06B 3K00A 3IAZA 2QL3A 4A0BB 3OEMA 4R9FA 5TP9B 1GV8A 3MZ9A 1N76A 1DTZA 5H8FA 4DXUA 3K1MA 2CZLA 1Y1MA 4ZEDA 3UA8A 3PMWA 5I58A 4BDOA 4G56B 1OIBA 2AGWA 3RN0D 1QW0A 4Q30B 1FCKA 1XVYA 5J1DA 2OIZA 5I2NA 5CXCA 1UIUA 2GRVA 3H6TA 2UZYB 4X1BA 1GGGA 4ZOZA 1A99A 3FJMA 3FVNA 3P7IA 3UGWA 2OK4A 3SESA 1U2VC 3O28A 3HHGA 2Z8EA 1P1OA 4QHQA 4XIGQ 3OTTA 4M1VA 5TF2A 4R7AB 3T9UA 3SMRA 2MTAH 3C31A 4RPOA 4IO3A 5AE4A 4NF6B 3EHTA 2P9SC 4L3GD 3K6UA 3KEIA 1AL3A 2GFEA 3J81g 1MPBA 1R9LA 3S4UA 1SI1A 3GLBA 4G68A 5CC2A 3IB0A 4YZZA 1JW4A 5JK4A 3AL8B 1H44A 3UKRC 2IUQA 3TYHA 4F22A 4LP2B 5CRYA 3O97A 3CFXA 3UORA 2ZXTA 1FQCA 3JZNA 1B2HA 1D3KA 1ZIUA 1B3FA 2THIA 2X7QA 3I7PA 3J80g 5FKQA 1SW2A 3KRWB 3OMBA 4N07A 4PFTA 3SEUA 4A08A 1YPNA 3MBPA 3T9VA 4P11A 3EI4B 1UTBB 4LZ7A 1WODA 1LSTA 2RC9A 1VYHC 3KSXA 3PVUB 2DXYA 4R2FA 5FKSA 4F2OA 5HE3B 4A09B 3VA6A 4PC0A 1Q1KA 3C35A 3OL2A 3K6WA 2CMOA 2R71A 4E0XA 3N6TA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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