3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
source organism Escherichia coli
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
4CI3A 1P22A 3KGCA 4XKQA 1SBPA 5H8NB 3OKYA 3CR9A 4J73A 3VV5A 4GRKA 3OL2A 1II5A 2P0SA 3O28A 2GRVA 4JWYA 4GM3A 4PNKB 2DWAA 2AL5A 3HV1A 5CXCB 3UGWA 2QS3A 3GZGA 1OMWB 3QK6A 1VFDA 4QFOA 4A08A 5HE1B 1DSNA 1HSLA 3O6HA 3SEVA 5EM2A 2REGA 1LBBA 1POTA 2B5LA 4Z7EA 4OVJA 2AGXA 4R73A 4D6VA 1N6EA 3PE7A 5H8NA 4ZOYA 4WEDA 4NE4A 3MJNA 4EF1A 2HESX 1TYQC 4ZECA 4FA5D 3CIKB 2OWTA 3QUFA 5EMJB 2OJYA 1M5EA 4OFLA 2Z8FA 4GXSB 1ZTYA 4PFYA 4GGCA 4CI2A 4L3GD 4XKNA 1LCTA 2I3SA 3MVYA 3LSXA 3I6VA 2XXQA 4J78A 5H8HB 4ELOA 1DOTA 4GGAA 3SJLD 5F1QA 2B5NA 5I58B 3EI1A 1B0LA 5A5XB 1US4A 5HE2B 1IEJA 4N6PA 4ZS9A 4GL8A 3RMZD 1XHMA 3W15A 3FD3A 3O6IA 3UVKA 1N76A 2NUVA 4KI0E 4C0RA 2CO0A 1P1UA 4IGRA 3R26A 1YTVA 4Y7RA 2HKRA 4G68A 3FZVA 5I57A 3MVZA 1OIBA 3EHTA 4YMBA 4P11A 2UYFA 5L9SA 3U4YA 1K32A 1US5A 3VE1B 5SXMA 3EMHA 4FEDA 5DVFA 2NVUB 3CSGA 3LBSA 5JTYB 3JZGA 5CMBA 3GFCA 4GM8A 3C9HA 4O3TB 4OWRA 2G93A 4FORA 3Q26A 3C99A 3OEMA 2QMWA 1MG1A 4ERZA 3KOTA 1N7WA 1QUIA 5FTIA 5H8HA 2I58A 1T0KA 4LGNA 3FGBA 4UA8A 2DOJA 1FQDA 2GH9A 2PMSA 1AL3A 4L1QD 2OZZA 3PPRA 4R2FA 4NF8B 4QFLA 5ELVA 3PUZE 4ELPA 1BKAA 1J1NA 2OBGA 1B1HA 3TCGA 1NR0A 1L5TA 3U1OA 4LQ5A 3DWLC 2HJ4A 2OVRB 2F6PA 2QC5A 1JJUB 3K6XA 1GV8A 2XXRA 1NH7A 2YB8B 1ZU0A 3W9WA 5JTYA 2AGWA 1K8KC 3SFZA 3I2NA 2XXPA 1B3HA 4GLIA 2D5WA 3A0FA 5CBSA 3PUXE 3SBRA 3ZSFA 4ZE9A 2AH1A 4XIGQ 4H5FA 4E54B 4YB6A 1OLCA 4MH5A 3MP8A 1XVXA 2O84X 1JVXA 2F6GA 3IOUA 2P9UC 3SCYA 3IKOA 2O1MA 3CFZA 3U72A 3QIMA 2V93A 4IMMA 3H6UA 1FTLA 5CYKB 3I7HA 4Q8RA 4A0BB 3S9NC 3TTRA 4C1UA 2PM6B 1EZPA 1JOFA 5F7VA 2XXTA 3IJOB 3OXNA 2F35A 4E0WA 2IWFA 1XC1A 3MZ9A 1D9VA 3G7WA 2UVJA 1VSOA 4BH6A 3KFMA 5I56B 3CG1A 4IB2A 3PU5A 3IO6A 3EHUA 4DCXA 3H6WA 4CY3A 4H5GA 2H47A 3MWBA 1Y3PA 3HPIA 3TELA 1NKXA 3MC2A 3K1MA 5IT9g 1Y20A 3PPOA 2G29A 1N84A 1MPDA 3FASA 1SYIA 1HSJA 3F11A 5C9ZB 2A5TA 5AE4A 3H06B 3KRWB 2GHBA 5FKQA 4ZE8A 5IGQA 4PFWA 3OSQA 3ECRA 3UKUC 5CBRA 4FJPA 3FUZA 2P1SA 3SN6B 1QUJA 3OELA 4JWOA 5CMMA 5TU0A 2I48A 4P0GA 2YLNA 2QXVA 1DPEA 4IY6A 4GD5A 3MXXA 4JSPC 1JW5A 2I4BA 1UTBB 4DE8A 3C32A 2R71A 2CN2A 1MXXA 5AA4A 2Z23A 1R1NA 3B6TA 3CI8A 4MK0B 2DE3A 4F3GA 3B6WA 3P7IA 4GL0A 4G56B 3BWSA 4L17A 3BG0A 1UTHB 3T9XB 3SXTD 3SWSD 5JEIA 3DXMC 1YAEA 5I2KB 5H8SA 4EWRA 2HYEA 4O3UB 4F3BA 4OQOA 3IJ1A 4EF2A 3UVMA 2O6AA 1DTGA 1FTKA 3VH0A 4LG9A 3OO6A 4YMAA 3JZHA 1FCKA 1OMPA 1JVYA 4ZEFA 2Q88A 1PDAA 4AB6A 4GGDA 4ZZAA 2F78A 5KDTB 4G8MA 2VOZA 4TLLB 3RSEC 4KFMB 3TEPA 4JXIA 3RGYA 4F2QA 2KLFA 4LZ8A 1NMUA 4J84A 3BBRA 1YFQA 4U1EI 4LONB 5EALA 2LAOA 2H68A 3NVQA 1UTHA 2XX8A 3C4MA 4QSDA 3JV9A 2DP8A 1GGGA 4KD5A 4ZDMA 3SHFA 2H99A 1B7UA 1H45A 2M8CA 1SW1A 2FYIA 3Q29A 5HE0B 1MDAH 1NNPA 3IJXB 2XD2A 3A3CA 4J0WA 1FTJA 3S9LC 1OQGA 3QYTA 3SKPA 1MY1A 2I0CA 4RA1A 3F3FA 2H9PA 1B46A 1RYOA 4F18A 1D4NA 3K0VA 4QRZA 2HJBA 1H43A 3UKRC 2ABHA 4QRJA 4E5ZB 4GQOA 3PD8A 1QKAA 4ZEIA 3TYHA 5CC2A 4EXLA 3KSJA 4NF4A 1QJMA 2THIA 3B7FA 2BBKH 4GOTA 1Y1ZA 1UIUA 5TDHB 3C9CA 5I5IA 4FAND 5M2VA 1A54A 2DE2A 2ZXTA 3VLUA 4IO2A 1LBCA 2ONSA 5DEXA 4H6DA 3TODA 4GM9A 2Y84A 4KCCA 4A09B 2HQ0A 4U4XA 2X26A 3AL9A 4MLQA 3SEUA 4K3JB 5EHSA 1PBPA 4KHZE 1MXZA 3N5LA 1B3GA 1BLFA 1B5HA 4PFUA 1CB6A 1B3LA 1EH3A 1P1OA 1IXCA 2F7CA 4R7AB 3FJGA 4C1TA 3J80g 2ZMBA 5B70A 1OVBA 1I6BA 3B6QA 4QFKA 1S4UX 1Y4CA 3M3LA 3OO8A 3PV0E 5HYNB 3V9FA 1USYH 3T9VA 2ZNTA 4GFRA 3RRMC 1H3DA 4OXVA 2H6KA 2PYYA 4OWDA 4U22A 1IXGA 1AIVA 3K00A 3MZLA 4XXUA 2VD3A 3O97A 4LUBA 2ZYKA 1AH5A 5I5MA 1B7ZA 3V5WB 3KJTA 2H98A 3IAZA 4YKJA 2YNOA 3K6WA 3M8UA 2CZLA 2RF1A 3RT8A 1ATGA 1I6AA 3T9UA 2J55H 3C33A 5AA2D 3TTLA 4IO4A 1HSEA 4J8GA 2UXAA 3KN3A 5ICTA 3FXUA 5J1DA 4Q0CA 3M3KA 3IB0A 1ZIUA 4ELRA 5EMKB 3ILTB 1A55A 2HZLA 2IUQA 3OL2B 1I69A 3USDA 4JWXA 4DXBA 3VVDA 3ODTA 2GC7A 3MQ9A 3BFTA 3QXMA 5TEFA 4OZ9A 1GXRA 4QFPA 2H5YA 4G2ZA 4PQJA 4FEBA 5HE3B 4NF6B 3AXFA 5DVJA 5EM2B 1URGA 3OOAA 3DP6A 4R75A 4KPTA 3HHGA 2PM7B 2GFEA 5KZTA 5K1CC 3FVKA 3I7KA 3HO7A 4TOZA 2G99A 3UK4A 4BDMA 2H9BA 1N3WA 3LSLA 2H14A 1SDXA 1FWXA 2V3UA 3GBBA 2ESNA 3NVXA 3EHSA 1S7YA 1MQIA 2IA4A 3CG3A 4TQUQ 3MW0A 4A11B 4F31B 2B3BA 4KQPA 3TDJA 4FAVD 2DWIA 3RY3A 1LAXA 3GLBA 1MY2A 5CXBA 3VFJA 1MM7A 3MVXA 4NF6A 2MTAH 3MPKA 4F1UA 4CC9A 3MVWA 2YMUA 2ONRA 3EN3A 4G4PA 3EI1B 3SBQA 4U1OA 4WKMA 4LQ2A 4IY5A 5FTHA 2H6QA 5HM4B 2O7UA 1MQGA 1ZMGA 1H76A 3MZKA 3EPEA 1N6DA 4D0KA 1N3XA 2A5SA 5ITOA 4N07A 3U92A 5B4WA 4G68B 1B05A 2ONKE 5I57B 3U94A 4GQ2P 3G3HA 1PEBA 5JK4A 4BLAA 4H8JA 1O64A 3LC8A 3SEXA 3EU7A 3BFUA 4A11A 2AQ5A 2IAAA 1OVTA 5H14A 1SQYA 1SW4A 1NFTA 3EWEA 5IC7A 2AL4A 1JEUA 1JETA 4X1DA 3TQWA 3L6HA 4DCYA 3RLFE 3TQLA 1Y3QA 4AOWA 3PGFA 5H1MA 3H6VA 1P1WA 3ZS6A 5DT6A 3S9MC 3FXQA 3JB9L 3F3GA 3K6UA 4BL0A 1FQBA 1VYHC 1Q47A 3IIWA 1B2HA 4BDOA 1SYHA 1NNKA 4QSEA 3TFLA 2RC7A 4F3PA 1A8FA 1MXVA 4FA4D 4GZ8A 4CI8A 1VE4A 4U23A 1TFAA 2XXWA 4UACA 1FW0A 5FHOA 4RY1A 3MP1A 1SW2A 4FECA 1MQDA 3DXKC 3H3GA 1PBYB 1LAGE 3JPXA 2R9JA 1NEXB 3JROA 3PPNA 4ND9A 1XS5A 3RFGA 1M5FA 4QSCA 4GQBB 3G3IA 1PEVA 5A2Qg 2RINA 3SESA 3CVGA 3LSWA 1Z7NE 4ZOVA 4RK2A 3IORA 2DWHA 4CZYA 2FA7A 3TAJA 2AYSA 4Z0IA 4G77A 2P9IC 3A09A 1U4CA 2AGYA 4PBYA 4F39A 4ERQA 2AIXA 2O51A 5K19A 2CMOA 2HCAA 1Y3NA 2XXHA 4H65A 3VVFA 1MY3A 5GXHA 4O3CA 1MY4A 3OO9A 4F19A 3PD9A 5TPAA 2VP1A 4X63B 1RKMA 1QKBA 3DELB 2O69A 3V5AA 4JD2C 4ECFA 3VLWA 4ES0A 3RLMD 4NF5A 3IOVA 2PM9A 3MP6A 3W15C 4UI9R 2V3TA 3V83A 3PUVE 2A5TB 4LG8A 2Y7KA 1S9TA 2CO0C 4YB5A 3RN0D 2XYIA 4JXMA 3AL8B 3N6UA 4LZ5A 1XVYA 3SBPA 5H8FA 3TMGA 2F7AA 1MDP1 4DIGA 4GXAA 5AA3A 1GTKA 3ZKLA 5C2WB 2J56H 3UVOA 4PXWA 5CMCA 5I59A 4DXCA 3JAMg 5AA4B 1QNIA 3DP8A 5FLXg 2I0BA 5H17A 1U2VC 2DVZA 1SVXB 3E3KA 1Y1MA 2QSXA 3QUJA 1ZLQA 4R6HA 4X60B 4R74A 1XHYA 4FAJA 1DTZA 3FJ7A 4H67A 2OJTA 4POWA 2YPNA 1A0RB 4ZOZA 3RFHA 3T9HB 3AL8A 2I3TA 5EARA 4MF3A 3VXBA 4K3ID 2PT2A 4XKPA 2R6GE 3T96B 5B7DA 2I3WA 4U1ZA 3S4UA 4H5JA 2QL3A 4TLMB 1EZOA 3UA8A 3HFQA 5KCJA 4XYIA 2EBSA 3K1NA 1IUDA 2ZYNA 3MAMA 1NH8A 2VD2A 4X48A 4PE5B 1B5IA 2CE9A 1MG3A 2F97A 3QAXA 4OZUA 2XXUA 4I9DA 4PETA 5ITPA 3EI2A 1B4HA 3Q28A 1QVSA 5I5JA 1JMZB 3KEIA 1XT8A 3E4RA 4HW8A 2RCAA 2HZKA 3K6VA 5EAPA 2UZYB 1R9QA 3E13X 3E9XA 3JRPA 4GVOA 4NMYA 3UVLA 1QW0A 1L0QA 3C5MA 1ZBMA 2OVPB 4XTCQ 4RPNA 2IUPA 3UORA 4EDPA 3PPQA 3PMVA 4QFNA 1RI6A 3MZ1A 2OIZA 4OHNA 2RKMA 1FTMA 2IWKA 1Q35A 3I89A 1MM6A 5BWJA 2Q2CA 3VGZA 1MG2A 2P2AA 3WAEA 3CFVA 4BDRA 1IZ1A 4NF4B 1PC3A 5HBCA 4CY2A 3G3FA 4NWCA 4ZEKA 4ZOXA 2UVHA 3T93B 5I2NA 4NSXA 1B9XA 4QHQA 3EF7A 3OENA 5DEXB 2I0SA 3I3VA 2OK2A 3OSRA 5FHMA 3RN8A 3FATA 4JSXC 1NNFA 2QMXA 1SI0A 3TZAA 3TTNA 4DDDA 1FTOA 4Y5RD 4AEZA 4N13A 3CRBA 4YZZA 1MH4A 2VGQA 3OTTA 4LATA 4X9TA 1YCJA 5FA5B 2F7BA 1VFEA 4EQBA 4JB7A 2E1SA 3IOWA 2NXOA 4DLDA 4EQ9A 4H5IA 1F9BA 4J8BA 2AH0A 2Y7IA 1FQCA 1MPBA 1ANFA 4RK9A 5KDOB 4LP2B 3I7OA 1Z7ME 5AA2B 4RNSA 3CFXA 3PPPA 4XEIC 1MXYA 2PBWA 1LB9A 3AH8B 5TF2A 1MXUA 3O29A 3OMBA 4FATA 2NWJA 2P9PC 1M5BA 2HXWA 1LFHA 4FWWA 1N7XA 3T66A 3V8XB 1VR5A 3IX1A 5I84A 2Q2AA 4QL1A 3EI3B 1TWYA 3I8CA 4OFOA 2P9LC 3I7LA 1JNFA 2YBAA 3SMRA 2QRYA 4KCDA 3R6UA 3O2AA 2UVIA 2H13A 1TFDA 1B40A 3C75H 4A0AB 1P99A 4IO3A 4KYDA 1RYXA 3HHFA 3BG1A 3VLVA 2Y7RA 4IO5A 1M5DA 1DPPA 3FGSA 3D4GA 1URSA 5AA2A 4L3HD 3AFCA 1PB8A 4U2RA 4RYAA 3LUYA 4JSVC 2Z22A 1D3KA 4PP0A 1FQAA 3RTFB 4R9FA 4QT8A 4O45A 2CNXA 4DXUA 4MLVA 1TXFA 3SERA 4EUOA 5BUUA 1GOTB 3LSFB 3EI3A 1N04A 2V84A 2RCBA 3KN7A 3RNNA 3FVNA 3RPWA 3HSTA 2DYXA 4IO6A 3KSXA 4A0AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5CMK A;  1O6F A;  4A7J A;  2B4E A;  3FIR A;  3N6T A;  4BDN A;  3MUN A;  1IXH A;  5I2K A;  3TUS A;  3IB2 A;  1SI1 A;  1B4Z A;  1PBQ A;  5ET6 A;  1BIY A;  4RPO A;  5IAI A;  4U7A A;  3EG6 A;  4GX4 A;  4LA9 A;  5FQD A;  4ESW A;  4Z7N A;  5TEE A;  1LAH E;  3O6G A;  1I6Q A;  4WXJ A;  2VDK A;  3FVG A;  1R6Z A;  3FVO A;  3RQT A;  3CHG A;  5KDT A;  3N0D A;  1GOF A;  3EI4 B;  4YB7 A;  1JW1 A;  4OVR A;  4E0X A;  2HXC A;  3G3G A;  2HAU A;  3SEY A;  3FCU A;  3I8E A;  2VHA A;  4LZ7 A;  4PDD A;  2ZYO A;  4ESX A;  1GG2 B;  1KWH A;  3IO4 A;  5AMS A;  2Z2N A;  4AQ4 A;  3O66 A;  5EAM A;  3H7M A;  5LOM A;  3ZKK A;  1MXW A;  2DWJ A;  2F8D A;  4CY5 A;  3I7P A;  1KZ8 A;  4BCB A;  3DM0 A;  4NF0 A;  4CZV A;  3IB1 A;  1B51 A;  3H4Z A;  4ELQ A;  3PXW D;  3A3U A;  3RUM A;  1YPN A;  2YNN A;  4H1X A;  4HE0 A;  3OKT A;  1Y9U A;  3TPA A;  2KR0 A;  2XXI A;  4JBZ A;  1IIT A;  3FV2 A;  1MY0 A;  2QR5 A;  5EMM B;  1R5M A;  3EI4 A;  1B32 A;  5CM6 A;  3N0E A;  4M1V A;  5DVI A;  4E5Z A;  3S9E A;  2F36 A;  3PXT D;  4GF8 A;  2DQV A; 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 5M5V A;  3FXR A;  2X7Q A;  3N94 A;  1SQJ A;  1IMC A;  2GC4 A;  1B3E A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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