3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
source organism Escherichia coli
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
2HCAA 5CRYA 1MQJA 1N7WA 2F7BA 4LG9A 2H3XA 5FTIA 3V83A 2O6AA 3LSWA 4JSOA 3UP9A 3GXAA 2F7CA 1B1XA 4Y7RA 4R2FA 5CXBA 4MLQA 5ITPA 4ESXA 5HYNB 3KEIA 3ODTA 3I8EA 3EQ1A 3TEPA 2UYFA 5H8QA 2OCUA 4GM9A 3K0VA 2D21A 1U4CA 2G9AA 1F9BA 4GGCA 2ZNUA 2F5XA 1AIVA 3K1MA 3SEUA 4CY5A 4IO3A 2F6PA 2QS1A 4ZDMA 3VE1B 1B3HA 2P0SA 3IB1A 2XYIA 4J8GA 4L1QD 4DCXA 3SEWA 4POWA 1QKAA 2RCAA 4ZEKA 3FJGA 3T9UA 2W18A 4DLDA 1CE2A 4ERZA 4UA8A 5L9SA 5TU0A 1VFDA 4ZOYA 2F7AA 4GLIA 1LGBC 3I89A 2HXWA 2Z23A 3CRBA 5TPAA 1SDXA 3FUZA 4ZOZA 2CNXA 3EI3B 4FE8A 2Y7RA 2AH0A 3I7OA 3MKSB 2THIA 3V5WB 3RTFB 2XL2A 2RKMA 2PM7B 3KJ7A 3SFZA 1SW4A 1LB9A 4FWWA 3KSXA 2Y7PA 2XX8A 2CZLA 4JWYA 5I84A 3KBRA 2IEEA 3N5LA 4DZ1A 4Z8LA 5HE3B 5K19A 3CI8A 4O3AA 1UTHA 5IJ8E 2YB8B 3OO9A 4OETA 3MVYA 4DIGA 5CMKA 1MH3A 2Y7WA 5DYHA 5F1QA 3FVKA 1SI1A 4FA9D 4G68B 1B3EA 3D4CA 1J1NA 2IUVA 3JROA 2O9KA 3K6UA 3M3LA 2O7IA 1GTKA 3TMGA 2OVPB 1LCFA 3N6TA 4DE8A 3UVLA 4LUBA 2H9LA 1IEJA 3G7WA 3EMHA 5I5MA 1URSA 3MPKA 3EI3A 3U92A 5K1CC 3GREA 5I58B 1N0TA 2XXPA 4KQPA 1OVBA 5HM4B 5I2KB 1B9XA 4X48A 4U2RA 4JT5C 4BDLA 4M1VA 4PNKB 5IJ7E 4KD5A 3F3PA 2OWSA 4O3CA 3HHFA 5DVJA 1MQIA 5FKSA 2V93A 3EN3A 5HPQA 4LQ5A 3SKPA 2Z8DA 3FD3A 3CG1A 4TLLB 4CY1A 4NWCA 1NNFA 4F31B 3MP6A 3U94A 4N6PA 1GV8A 2HAVA 2IWFA 4G68A 4QFKA 2QPQA 2F78A 5ELVA 4F29A 1UIVA 4A09B 1LLSA 1GGGA 2NOOA 4PC0A 2DE3A 2J55H 2DYXA 3R6UA 3SETA 3FVNA 4OFLA 1LBBA 3OO7A 3PMVA 3VLWA 3H6UA 2HJ4A 3JB9L 3EF7A 3K6VA 1MH4A 5AMSA 3JZGA 1B0LA 1MQDA 4FECA 5I58A 1MDAH 4U21A 4MH5A 1LAFE 3KFMA 4OVJA 3BKIB 4IO6A 3TTMA 4PE5B 1TFAA 3EHTA 3HHGA 3C9HA 3C9CA 3I7NA 1WVJA 3DXMC 1QVSA 4QFOA 3I7KA 3NVNA 3OL2B 2Q2CA 4NF5A 3RY3A 3IORA 2RC7A 5TEEA 4G56B 1B4HA 4OWRA 4GM8A 3VGZA 2HESX 3FV2A 2Q89A 3JV9A 2H25A 3JZJA 4OFJA 5GSAA 2YJPA 4JD2C 4A08B 1POY1 3PUZE 3OELA 2XL3A 3UK4A 3KOTA 4FHLA 1TFDA 2UVGA 2UVJA 3TYHA 4ZE9A 4NF8B 4ESGA 3MPLA 1PBPA 4R6YA 3RLFE 5I5JA 5EHSA 4XYIA 4HTGA 4J79A 1MXWA 4FB1D 4F39A 3I7PA 1B7UA 4A09A 1OLAA 1B5HA 1TWYA 3PPQA 4R9GA 2RINA 3FXRA 4MFIA 1MQGA 3C36A 5I59B 2GRVA 1QULA 4O1QD 1DSNA 3I7HA 4TZ4A 1LFGA 3SERA 3DSMA 1A54A 4GM3A 2I0CA 2X7QA 4GOTA 1SYIA 3K6XA 4YMBA 3MZ1A 3I2NA 1FQDA 4U22A 3T22A 2H6NA 1I6BA 2UVHA 4CY2A 2YNOA 3PSLA 2ZNTA 3THIA 2V3TA 5ICTA 1A0RB 3IAZA 3OL2A 1NNKA 3EU7A 2XHDA 3PVWB 2NVUB 4P11A 4H6DA 4ELQA 2CO0C 1YPNA 5H8FB 4OTEA 2B5LA 2CE9A 4NF8A 3RTWB 1RYXA 1MG3A 3A09A 4ECFA 5LOMA 4JDFA 3SBQA 2G93A 3H03A 4D0KA 3MKQA 4MLVA 1Y20A 2H14A 3MZLA 2I3SA 3RN8A 3OEKA 4RPOA 4YB7A 3H6VA 4R72A 4GZ8A 4RK2A 4YB5A 2V84A 4NF4B 1TYQC 4FA1D 1ZTYA 2HXCA 4BL0A 2Q9TA 5THAA 4AQ4A 1ATGA 5I59A 2P9KC 3SXTD 5CM6A 2CN3A 5HQGA 4OMBA 4U1EI 2PT2A 4AEZA 1FQCA 1WODA 3O6IA 1LB8A 3BG0A 1TT1A 3VXCA 4IA9A 3WAFA 4I79A 3RT8A 3K2DA 3MZBA 3TTNA 5J1DA 4OESA 5GMKn 2UZYB 4O3TB 2FYIA 1XVYA 4Y5RD 1Q35A 3CFZA 2QS2A 3JAMg 2I4CA 1P1QA 3PUWE 2GH9A 5I57A 1MPBA 4HCWA 2MTAH 3G3KA 4ND9A 1MS7A 4FAVD 4OERA 1QUKA 4AB5A 3L4MD 4O45A 3KRXB 3WAEA 2H6KA 1GP2B 5A5XA 2PM6B 1D4NA 1N84A 3VDFA 1MG1A 4H5FA 4Q8RA 2J57G 1A40A 4RA1A 3MBPA 4NF4A 4EF1A 5FXYA 2V25A 1EZPA 3N94A 3W15A 4ZE8A 4R2BA 2ONSA 2HKRA 5TP9B 3SESA 1Y1ZA 3G3IA 4A2MA 3OTTA 4EQBA 4JBZA 3EG6A 3RMZD 3RNNA 3R26A 4CI1A 1FQEA 1PC3A 1M5DA 5SXMA 4OXVA 1SQ9A 4O3BA 4PFYA 3AL9A 4J0WA 1MY4A 1VE4A 2P9IC 1XIPA 1MXXA 2R6GE 2CN2A 4LQ2A 4QF9A 1U2VC 2I3VA 3D4GA 4WXJA 2H4IA 3HFQA 1FQBA 3MC2A 3B6QA 4D6VA 3MW0A 1R5MA 3R7XA 3TODA 4GQBB 4CZVA 4H8IA 4EXKA 1FWXA 5TDHB 4BDMA 5F7VA 4PETA 2AL5A 3PPNA 3IIWA 4KI0E 5EMMB 4I8CA 3E4RA 4QHQA 1IXGA 2CE8A 5CXBB 5H8NA 3TTRA 3B7DA 4GL0A 3RFHA 3UGWA 1NNPA 3PPPA 3QAXA 2P2AA 4NMYA 3T96B 1SBPA 3FATA 3OMBA 3RSEC 3I7LA 3A3CA 5TP9A 3RQTA 2AGXA 2QS4A 3O6GA 2I0TA 3MAMA 1DPPA 1IXCA 1SW1A 3UVNA 4XKNA 4G8HA 2XXVA 4ERYA 1US4A 5AA2A 4YKJA 4I9DA 2G99A 5KDOB 3T93B 3CFLA 3I3VA 2IWKA 1ZLQA 4IO5A 4JT6C 1SQYA 2NWJA 4L3HD 4H1XA 4EXLA 2XD2A 4GMBA 2VGQA 3BG1A 4GF8A 3U1OA 4ZEDA 2HJBA 1N6EA 4GIZA 3TCFA 5FHMA 3L4OD 2A5SA 5DT6A 5KDTB 5AJAA 4OEVA 5TPAB 1GOTB 5FLXg 1FW0A 3OO8A 3IK6B 4EWRA 2QC5A 2F35A 1B9YA 2ZYOA 4R6HA 3TTLA 1A55A 3P7IA 2V3QA 1PBQA 3JRPA 2F36A 2O69A 3H06B 3LR1A 4RK9A 1K8KC 3RRMC 3DP6A 5K2YA 4CZYA 4XKRA 2EBSA 1N04A 2XX9A 3ONMA 3MVXA 1B9JA 1UTHB 1SW2A 3GBAA 3N6UA 5ICQA 2XD3A 4ELOA 5IKBA 4QFNA 5EM2B 2A5TB 4Q5TA 4F3PA 1O7TA 4RY1A 2P9UC 3UA8A 3OD7A 3T9HB 1D9VA 1UQWA 1MPDA 2GC7A 3S9MC 2QRYA 4ZEBA 2VHAA 4IMMA 1JW4A 3PV0E 4BDRA 1USYH 5KDTA 3C34A 1R9QA 4CC9A 3SEYA 3C32A 3O29A 1GXRA 1MDQA 4IY5A 3VXBA 2VP1A 4OWDA 1MQHA 4FEDA 4WKMA 1H44A 4FIMA 4KYSA 3ZKLA 2PYYA 2H99A 3KG2A 1LAHE 2GHAA 2WKYA 4N14A 4TQUQ 1MY0A 5HE0B 1Y9UA 3MUQA 2KLFA 5FKTA 5C9ZB 1XOCA 2OWTA 2Z2PA 2QMXA 2Q2AA 1OIBA 3PUXE 1SYHA 1II5A 5EM2A 1NEXB 2A5TA 1S50A 3KN8A 1H76A 3DP8A 3K26A 4XTCQ 4HS7A 3FRXA 1VSOA 2PX1A 3I5OA 3USDA 4QSCA 3G3FA 4CI8A 3AXFA 1B1HA 3UIFA 3S9EA 5EYFA 4L17A 5IGQA 3TQLA 5CMCA 3NVQA 3O28A 2Z8FA 4IGTA 1Z7NE 5KZTA 5I5IA 3ORVD 3CR9A 5CBRA 4G77A 1MXZA 1HSJA 1XKSA 3KRWB 3GBBA 3QXMA 4P0IA 4ZOVA 4NF6A 2B65A 2Y7IA 3SCYA 4G68C 4KR5A 3ZKKA 1VR5A 4ESWA 2H98A 4G2ZA 4NF5B 4H67A 3PXTD 4F3GA 3I8CA 5CMMA 1HSEA 2H47A 3SEXA 3CFSB 3UR4A 2QXVA 3MP8A 4YAHX 4XIGQ 5CYKB 2ZXTA 4H0WA 1QKBA 4IGRA 2Z2OA 5H17A 3U72A 4GXSB 3GLBA 3CFVA 3HN0A 4YMAA 2DVZA 3RN1D 4A11A 2ZMBA 4LATA 2UYEA 2DQVA 1OLCA 1YCJA 4X63B 2ZYNA 4R9FA 2HEUA 4U7AA 5B70A 3OKYB 1N7XA 1QW0A 3IJXB 4PXWA 3PD8A 2HZKA 4OYVA 1K32A 3W9WA 2QS3A 2I3TA 4WEDA 3FGBA 2GHBA 4OQOA 1ERJA 4FA5D 1OQHA 4EDPA 2IURA 4U4XA 4X1DA 3OKTA 4H5IA 1BP5A 1FTOA 4JSDA 1NH7A 1ANFA 4N13A 4KFQA 2QL3A 1NNTA 1SW5A 5AA4B 1NH8A 4XEIC 4OEUA 1L5TA 3CSGA 3A0FA 3SLED 3MJNA 4KYDA 1ZJLA 1B5JA 3TDJA 4KYEA 4ERQA 5GXHA 5CYKA 4YVDA 3QUFA 3TTKA 2DXRA 2DS9A 4L9OA 2UVIA 1P22A 4Q30B 1FTKA 2PT1A 4OZUA 3M3KA 3V9FA 1Y1MA 3VLVA 4GVOA 1PI6A 2HFBA 4C0RA 4F3BA 4KFMB 3VFJA 3PMXA 1IQ7A 4LZ8A 3OKYA 5HE1B 4L3GD 3IO6A 1AH5A 2F8DA 4J8BA 1GR2A 3C75H 4XXUA 5CBSA 3EI1B 1H45A 2I58A 1S7YA 4ZZAA 2OBGA 3N0EA 4FAJA 4JWOA 3UKRC 5K2XA 2B4EA 1PEVA 5HE2B 4E0XA 1VFEA 4FA4D 2UZXB 3OO6A 3VLUA 5AA4A 3BFTA 3GZGA 3ECRA 4P0GA 2DWAA 1MM7A 4OFOA 3SWSD 2OJTA 2I0RA 3C4MA 4RNSA 5I57B 2B5MA 1OQGA 4PFUA 5B4WA 2B3BA 5IAIA 4FORA 1CB6A 2YNNA 3TCGA 3EHUA 1B58A 2J56H 2Z2NA 3DM0A 2ZYMA 5A5XB 1FTMA 3ZWLB 1QNIA 1Y3QA 4X60B 2H13A 4E5ZB 4J78A 3B6WA 1OMWB 4AOWA 4CZXA 3IIYA 2Q88A 1AOVA 2OLBA 4ZN4A 3MP1A 5L8DA 2XXQA 1O64A 3OKWA 1PDAA 5H8HA 3EI1A 5DVFA 3IJOB 1AMFA 2OK2A 3H7MA 4C1TA 3KJTA 4HDJA 1MPCA 3S2VA 4PSWB 1B3FA 4CI2A 3QIMA 4BH6A 3EWEA 4QRJA 1PEBA 4IO7A 3O66A 4MK0B 5H1MA 3HPIA 3W15C 2Z22A 1A99A 5KCJA 5BUUA 1ZIUA 2AL4A 4GQOA 4YZZA 3UVOA 4F18A 2OJYA 3TPAA 5DTBA 4YKPA 3C99A 4JSPC 1QUJA 3UVMA 1B5IA 3CIJA 4JWXA 1PGUA 1WDNA 1NMUA 5H8NB 4EQ7A 4RJZA 1EZOA 3IKOA 4E5ZA 3MZ9A 1MRPA 5EAPA 1DTGA 1JEVA 3DWLC 4QRZA 2UXAA 2B5NA 4FAND 2QSXA 1SVXB 3E9XA 2HKMA 3IB2A 2ANJA 3V5AA 5C2VB 5FA5B 3IJ1A 2H9BA 4NTLA 4PBZA 4BDQA 1P1NA 4DXBA 1QJMA 3E0CA 1MXVA 2ZYKA 3DELB 5AA2B 2E0SA 2XXTA 1YFQA 2CMOA 4E0WA 4F2QA 1SHYB 2QJEA 2PBIB 4RPNA 2ALUA 3F3FA 3FVOA 2YPNA 3IB0A 4M4GA 4ZS9A 5HBCA 3RN0D 2O7UA 4EQ9A 2OK6A 4QFLA 3QK6A 2H9PA 1TBGA 3CG3A 3C31A 1MY1A 3IOUA 4JSVC 2VD3A 3MMYA 4H5JA 3KOSA 3IOWA 3SJLD 2YBAA 4G4PA 1BKAA 3UVKA 5EMJB 3JPXA 2X26A 1AL3A 2P1SA 4GGAA 2R9JA 1UIUA 2R71A 1B52A 4ZZEA 2PMSA 3CFXA 2HAUA 1NL5A 3KGCA 1S9TA 3DLNA 4NSXA 1EZ9A 4K3FA 3FASA 2XU7A 1M5BA 4BDNA 1Y3NA 4ES0A 4RXLA 1XS5A 1FTJA 4KPTA 4LG8A 1EH3A 1JETA 3EHSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1I69 A;  3PUV E;  4QSD A;  3TAJ A;  1Y4C A;  3D1R A;  4MAG A;  2PBW A;  3JZH A;  3E79 A;  3ZSF A;  4U1O A;  1FRP A;  4Z7O A;  1K9Y A;  3JYR A;  3EPE A;  1IZ1 A;  3IO4 A;  4DNV A;  3U65 A;  3H6T A;  3O9P A;  4PC9 A;  1LCT A;  3IOV A;  1JMX B;  4UI9 R;  2Q8M A;  1A8F A;  1URG A;  4Z7E A;  2WEF A;  3GYY A;  2LAO A;  4IB2 A;  1R1N A;  4GWO A;  5H8F A;  4KCC A;  3IJC A;  1R6Z A;  3G3H A;  1BLF A;  1POT A;  1LFI A;  4DCY A;  3E3K A;  1ZMG A;  1Y3P A;  4D9S A;  3ILU B;  3PU5 A;  2Y5L A;  2DXY A;  2OIZ A;  5EAR A;  4J81 A;  3ULE C;  5ITO A;  2BKL A;  4A7J A;  3NOH A;  2DSF A;  4LP2 B;  2F6G A;  3B6T A;  2I49 A;  5ISU A;  1LBW A;  4PFW A;  3DXK C;  2OVR B;  4G8N A;  4YIC A;  4F2O A;  1UTB A;  1NR0 A;  3M3F A;  3O4J A;  4E54 B;  3AL8 B;  1B32 A;  1DK4 A;  4XKP A;  4BDO A;  4OAN A;  5AA2 D;  4GBV A;  3JZN A;  1QFS A;  2Q8J A;  3PVU B;  2X7P A;  5L9O A;  5BWJ A;  4NC4 A;  3PPO A;  1VZ3 A;  1QUI A;  3RFG A;  4ELR A;  3RLM D;  2RCB A;  5FHN A;  3TKD A;  2OWZ A;  5C2W B;  3PPR A;  5CMB A;  3K27 A;  3P4F A;  3QMF A;  5FHO A;  5M2V A;  1Z7M E;  5EYH A;  3J81 g;  1D9Y A;  4JXM A;  2L5V A;  2JJK A;  3ISP A;  2XXI A;  3C33 A;  1G0I A;  2ABH A;  2GNQ A;  3IFC A;  1M5C A;  3PGF A;  5EQ9 A;  4J82 A;  1MG2 A;  1NFT A;  1H43 A;  4IO2 A;  3E13 X;  2BCJ B;  2YNP A;  3OEN A;  3FJ7 A;  2D5W A;  1M5E A;  2ZZW A;  3K1P A;  3O6H A;  2CZH A;  4OEN A;  3H3G A;  1JMZ B;  4KHZ E;  4RYA A;  4K3I D;  4J0X A;  2V4C A;  4X1B A;  3TZA A;  3MVW A;  1O63 A;  2EIB A;  4LZ7 A;  3TQW A;  3PMW A;  5AA3 A;  4F1U A;  2DOJ A;  3HO7 A;  1CNQ A;  5TF2 A;  1FPB A;  1DCU A;  4OZ9 A;  3MYU A;  1B4Z A;  4GL8 A;  5H8Q B;  3CVG A;  3AL8 A;  1A7L A;  2AQ5 A;  4QFP A;  3LC8 A;  5IGA A;  4PFT A;  3FGS A;  4HW8 A;  2I3W A;  4R74 A;  2DP8 A;  4OA4 A;  3SBR A;  3OSQ A;  4I1D A;  1IMF A;  3T9X B;  5EAM A;  1O6G A;  3MVZ A;  4J73 A;  3QUJ A;  3W9V A;  1VE6 A;  3OXN A;  4CY3 A;  1JP4 A;  4O94 A;  1IUD A;  2DE4 A;  2F97 A;  4XKQ A;  1NV1 A;  4O9D A;  4C1U A;  3LSX A;  4G1E A;  1YAE A;  3L6H A;  3O4G A;  3VH0 A;  5TEF A;  1KA1 A;  2HQ0 A;  3KN7 A;  3IL1 B;  1I6Q A;  1GOG A;  4WEP A;  3V8X B;  4EUO A;  1FCK A;  3MXX A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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