3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
3FXQA 3OENA 3OSRA 4NF6A 4LZ5A 2NUVA 3T9UA 4O9DA 4OVJA 1MY1A 1NFTA 1B7UA 3BBRA 2GHBA 1OLCA 5HBCA 1EZPA 2OK6A 5EAPA 3LR1A 4YKKA 4PBZA 2H6QA 5C9ZB 2HKMA 1EZOA 4D0KA 2O69A 3S2VA 3T66A 5CC2A 2H98A 5CMBA 1CB6A 2Z8EA 4PNKB 4GL8A 1JOFA 1Z7ME 3EHUA 3I7OA 4OETA 3A3CA 3EQ1A 5HYNB 3C31A 3RTWB 2W18A 3T96B 1MY3A 4FAVD 3T9HB 1L0QA 5K1CC 3SDFA 3EI4B 3PPPA 5CMMA 5K19A 5HE0B 3JB9L 2OJTA 3C32A 1RYXA 1FQBA 2B3BA 3CFZA 1NNFA 4MBPA 3MZLA 3SERA 2CE8A 2ZNUA 3MC2A 5DTBA 2UZXB 4ELOA 3RTFB 5H8FA 4IA9A 4BDLA 2AL4A 1B6HA 4NF4B 1B52A 3K1NA 4HCYA 4WEDA 2OK4A 1JW5A 3VVDA 1FTLA 4J86A 4ECFA 4E5ZB 3M3LA 1FQDA 2REGA 3CG3A 4O3CA 3JZHA 2I0BA 4Z7EA 3BG0A 2ANJA 3DM0A 4UI9R 3EI2A 5LOMA 4XEIC 3JZGA 2OWTA 3D4CA 4YKIA 4FA5D 5H8NB 2I3TA 4JXMA 5H17A 2CO0A 4U21A 3TDJA 4H8IA 4PFYA 2G29A 1B1XA 3T93B 4QSDA 1LBBA 3S4UA 5IJ7E 3C4MA 2DXRA 4BDMA 1MRPA 2HFBA 4MLQA 2GRVA 4K3FA 1Z7NE 3UN6A 1US4A 1DMBA 2ALUA 3S9NC 4TQUQ 5B7DA 3EN3A 1WODA 2V3UA 3VE1B 4MFIA 1UIVA 3TPAA 1II5A 3TKDA 1ZTYA 3C36A 1SW5A 4U4XA 4UACA 4XIGQ 5CM6A 4A09B 3DP4A 3NVNA 1I6BA 2QS4A 3U93A 2VHAA 1ZJLA 2FYIA 1MXUA 2F35A 4QFOA 4GQBB 1Y20A 1EU8A 3LSXA 5EM2A 1NMUA 1P1QA 2DWHA 4LG9A 2HZKA 4RNSA 4R6HA 2WKYA 2PM9B 4I9DA 3JYRA 3KRWB 2H9BA 4Q8RA 4OWDA 3W15A 1QUJA 4F2QA 4NSXA 5ITOA 2AQ5A 3OKYB 4NF4A 5SXMA 3RN1D 1MQDA 4NF8B 3AFCA 4EF1A 2YPNA 2ONSA 3C35A 2H9LA 1B0LA 3RFHA 3H6VA 4H6DA 2D21A 1FTOA 4H1XA 5AA4B 5FKQA 1B5JA 1B3EA 3OL2B 3BG1A 5CMKA 5ITPA 2DE2A 4KPTA 3GBBA 4U1EI 3PUWE 2AGLA 4OZUA 1PC3A 1MM7A 2REJA 5CMCA 1PB8A 3CR9A 2P1SA 4FWWA 2QMWA 1ZBMA 2OJYA 4U23A 2NOOA 3R26A 4YB6A 5TPAA 2HQ0A 4CC9A 3SESA 3OO9A 3KJ7A 1FWXA 1B4ZA 5FQDA 5TEEA 4ZE9A 3NVQA 4CY3A 1DPPA 3SBQA 3SBPA 2RCBA 5EYFA 5TF2A 4A2MA 3PPNA 3SN6B 3UK4A 1NNTA 3K6WA 4F31B 4HS7A 4EF2A 4RA1A 5HE1B 1LAHE 1LB9A 1T0KA 2OLBA 3VVFA 3G3KA 3TZAA 4YB7A 1SI1A 3H6WA 1LAXA 4ES0A 3C99A 3AL9A 4PQJA 1QW0A 4Y5RD 1NH8A 4NTLA 4R7AB 3G3GA 3P7IA 1H44A 2IURA 3IIWA 1QVSA 3LUYA 5I59B 5GXIA 1N7WA 4Y7RA 4IO2A 4NF8A 4XYIA 5I57B 1B51A 3E0CA 2H25A 4G68A 4AB5A 2CMOA 1YPNA 3ECRA 3ZSFA 2I3WA 1EH3A 1MG3A 5TDHB 3UVLA 4J82A 2ZXTA 2IUVA 1IITA 2XXYA 1B3FA 4JXIA 1B3LA 3I7KA 4YZZA 3SLED 3OOAA 4ZEFA 4F39A 2Y7WA 2YBAA 2UZYB 2O7UA 2XXRA 4R74A 3RLMD 3G3HA 3RRMC 2R6GE 5I56A 4IGTA 1BIYA 2XXHA 2O1LA 4I1DA 5C2VB 3IJCA 5EMLB 1ELJA 1D3KA 1NL5A 4GOTA 4Z8LA 3OEMA 1MY4A 2HJBA 3UVNA 3QAXA 4KYEA 2Y7PA 3GZGA 2V3QA 1H45A 5FKRA 3TQLA 1JEVA 2P9NC 3GFCA 3RUMA 5IGQA 1TYQC 4IMMA 3MKQA 4QFPA 3CIKB 3OTTA 4QF9A 3TODA 1SYIA 1QULA 3OELA 3O66A 1MQIA 3EMHA 2I6EA 2RC8A 3VGZA 1MXVA 2ZYMA 5IKBA 3FGBA 2O1MA 3JZJA 2QS3A 1PBQA 2XL2A 2Q88A 1J1NA 3BWSA 1XKSA 2B65A 1FW0A 4QRJA 3H3GA 3VXBA 1QNIA 3KGCA 4IO5A 2DE4A 4J81A 4A0AA 1MXZA 4FATA 1URDA 5HPQA 4EQ7A 2H5YA 3EHSA 4ESWA 2M8CA 2YJPA 2F7CA 2F5XA 5AA1A 4A08A 4GZ8A 2Y7KA 1Q1KA 3QXMA 5CXBB 4FE8A 3VFJA 2UVIA 4E54A 2Y7RA 3NVXA 3RY3A 2F97A 3CVGA 2CZLA 4R6YA 3WAEA 3MXXA 1JNFA 5A2Qg 3IR1A 4R2BA 3MVWA 2DWIA 4A0BB 3V7DB 3RPWA 1JJUB 1LBCA 3TMGA 1B46A 4WXJA 5I84A 3VA6A 5I2KA 4H5FA 4F1UA 3LC8A 4ZZEA 3P4FA 3CFLA 2R9JA 2P2AA 3UVOA 1NH7A 3HFQA 3KOTA 1N0TA 5EALA 4NMYA 4MLVA 3SEVA 2EBSA 2R71A 4H0WA 4PETA 2XXTA 4IB2A 2I58A 3VH0A 1MQHA 3O97A 4KQPA 3TTKA 1S4UX 1PB9A 3O6GA 3TQWA 4U1ZA 3T9VA 4Q5TA 3LSFB 3O2AA 4AEZA 4DLDA 4H8JA 3CSBA 3QYTA 5CYKB 1MY0A 4G8MA 2H47A 1D9VA 4J87A 2O9KA 3RN8A 4C1UA 1MQJA 1FQCA 3HN0A 2P9KC 2I0SA 2CN2A 3QSLA 4L9OA 2GNQA 1LSTA 3UVKA 5H8FB 1FQAA 3PXWD 1NKXA 1EZ9A 1SHYB 2DYXA 3IJ1A 2DWAA 5L9SA 1BTJA 1R9QA 5CXBA 2I48A 3MZBA 5B70A 1DPEA 4EQBA 3PPOA 2P0SA 4JDFA 3PV0E 3PD9A 1M5BA 4G56B 1XOCA 5DYHA 2AGXA 4XYHA 3IB0A 3K1MA 5FHNA 4BDQA 3PXTD 3EI2B 2F7AA 3PVUB 3IAZA 1PDAA 1PI6A 5FHOA 3M3KA 3ODTA 1P99A 2I0CA 3IJ0A 4J84A 1R1NA 3CG1A 3O6IA 3VLWA 3VDFA 2A5SA 2AGZA 5KCJA 1YCJA 2B3FA 4G4PA 5M2VA 4FAJA 4KR5A 1ZLQA 1P1OA 4YICA 3IL1B 4H65A 4ZZAA 3FXRA 2I3VA 3IK6B 4ZEDA 3W9VA 4X63B 2DVCA 4BDRA 3C9CA 3U1OA 1I6AA 3MWBA 1S50A 1YTVA 3AL8A 2NWJA 4N6PA 2OIZA 3PMWA 3K1PA 4RPOA 3H03A 1N3WA 3N0DA 4E0WA 5CYKA 1IXIA 1P22A 4O3TB 3FD3A 1FQEA 5TEFA 5EM2B 4EDPA 4J8BA 2ABHA 2CO0C 2DP8A 3HV1A 3F3GA 3F11A 2PVUA 4JSDA 5CRYA 1LFIA 4N14A 3MZ9A 4GQ2P 1Y3PA 4CY5A 3H06B 2B5LA 4LGNA 2XXVA 5IGOA 5ELVA 4LP2B 1POTA 4BL0A 4KFMB 4ESGA 2RINA 5FHMA 3FJGA 5CBRA 2UXAA 3B7FA 4R73A 1TBGA 5EAMA 4X61B 4LZ7A 3SCYA 1GTKA 1R5MA 4KFQA 4X60B 1H3DA 5K2XA 2O6AA 3FASA 4KD5A 4XKRA 3V89B 4ZEKA 1GP2B 2OK2A 3V5AA 3FVKA 1JVXA 2V3TA 3V83A 4PSXB 4ESXA 5FLXg 3KJTA 3PGFA 3F3PA 1Q35A 2HZLA 4L3GD 4X1BA 2OWSA 1MDAH 5TPAB 3IO6A 5GSAA 1M5EA 4HW8A 4QRZA 4ZOZA 2BJJX 1P1NA 3DWLC 2FNCA 1B9XA 2DS9A 2E1SA 3Q27A 4F18A 4OHNA 1VSOA 5EARA 2X7QA 2P9PC 3PMVA 5GXHA 3ILUB 1WVJA 4FEBA 1Y1ZA 4GGCA 3ULEC 1MG1A 2H14A 2ONKE 3N5LA 3FRXA 3L4MD 4J8GA 2BBKH 4CI3A 1ATGA 5AA2B 4R9GA 2Z22A 1P1UA 3OO8A 2Q9TA 3THIA 4CZYA 3PSCB 2UYFA 4DXUA 1SQJA 4LQ2A 3KFMA 4IO4A 1R9LA 3U4YA 4LVQA 1QUKA 2RKMA 1PEVA 1FTJA 4F1YA 1R6ZA 4GVOA 3H6TA 3HPIA 3LSWA 2A5TB 3FATA 3BKIB 4PSWB 1B9JA 2HESX 3FVGA 4G68B 1B0HA 3KSJA 2VD3A 3EI3B 2GC4A 2I0RA 1QJMA 2PM6B 3N94A 3OO6A 5DT6A 3KN7A 1WDNA 2XU7A 3PPQA 3KRXB 3LSLA 3IJXB 2XXQA 4J77A 4N07A 1B5HA 4DXCA 3WAFA 2IA4A 2UVGA 3TCGA 4F29A 4FAND 1B4HA 3SFZA 2E0SA 4WEPA 4OERA 1MXWA 4UA8A 5TU0A 3SHFA 5L8DA 4TZ4A 5I5IA 4OYVA 3GREA 5EMKB 4ERZA 4JSXC 3SVWD 1FCKA 3SJLD 5I56B 4JD2C 1Y4CA 2X7PA 3O29A 2HXWA 1UIUA 2H6NA 4MH5A 4F3BA 1I6QA 1CE2A 3UKRC 3MPLA 3KBRA 2H99A 4U1OA 3BFUA 3K2DA 2IEEA 4O1QD 2F34A 4POXA 1B40A 3DXKC 4GL0A 3K6UA 2KLFA 3OO7A 1VYHC 2QSXA 4FA9D 2HYEA 3S9LC 4DIGA 4X9TA 1Y1MA 2I49A 3B6QA 4NE4A 4OQOA 4DCYA 4ISUA 1O63A 5AA2A 4G77A 1IXHA 3VVEA 4ONYA 1QKAA 2O84X 5HE2B 3L6HA 1ZKBA 4OFOA 5FKTA 1QUIA 4DXBA 2OBGA 2HXCA 4QL1A 3GLBA 3OSQA 2P9LC 4O45A 3J81g 5A5XA 2H9PA 2A5TA 4GWOA 1TFAA 4R6KA 2V25A 3RFGA 4A0AB 4TOZA 2QXVA 4FJPA 2XX7A 1TFDA 3EWEA 2PYYA 3EI3A 3CI8A 3G3JA 3GBAA 1GVCA 2OVPB 4AOWA 1N6DA 2IUPA 4R9FA 3SBRA 4EQ9A 4A08B 1N6EA 1JQFA 2P9SC 1UTHA 2PX1A 1LCTA 3K01A 3K00A 1OLZA 4L3HD 4E54B 3MQ9A 4YAHX 4M1VA 5H1MA 2QS2A 3FV2A 2F6GA 2PT2A 4Z0IA 1DTZA 1LFGA 1XVXA 2B5MA 2UVHA 1OVBA 4GMBA 1YAEA 5I2KB 3I8CA 1A40A 2ZNSA 2QS1A 3KZGA 3UGWA 4OFLA 2Y7IA 1KWHA 3HO7A 4BDOA 1HSLA 3CSGA 3CRBA 4LZ8A 4L1QD 5H8SA 3E3KA 3U94A 2VOZA 3MMYA 4FA4D 3AH8B 3E9XA 4JT5C 4A7JA 1SDXA 3TUSA 3TFLA 3TCFA 1NEXB 4E0XA 4JSNC 1K32A 2F36A 5CI5A 2Z8DA 1IUDA 1XT8A 3I5OA 2D5WA 3JPXA 3TTNA 3Q26A 2YLNA 4C1TA 3DP8A 3IOVA 4GXSB 3LBSA 5J1DA 4J79A 3MP6A 3SEUA 4DE8A 2V84A 2Z2PA 4M4GA 1USYH 3MBPA 3FIRA 4POWA 5H8HB 4ERQA 4H67A 1GG2B 1S7YA 4A2LA 3A09A 2XYIA 4FHLA 4IO7A 1U4CA 4YMAA 1JMZB 1VFDA 2AGYA 3DELB 2PT1A 4JWYA 1MG2A 2G9AA 4NWCA 2I4BA 2RCAA 2ESNA 3EI1B 2F78A 1OQGA 2AH0A 3UVMA 1LAFE 1AIVA 4QFKA 3JV9A 5KDTA 3HHGA 4U4SA 5EHSA 5HQGA 1IXCA 3V9FA 5KCJB 4JBZA 4THIA 2Z2OA 1FTMA 3VLUA 1A8FA 4X48A 3Q25A 1B1HA 3IB1A 5EHMA 3FJ7A 3HSTA 3EHTA 4F1VA 4EWRA 2QJEA 2HAVA 1JW4A 2IAAA 5HE3B 4ERYA 3PE7A 1JEUA 3D4GA 3TYHA 1O7TA 2O7IA 3G3FA 1M5DA 3TTRA 3TTLA 4GQ1A 3AL8B 1GGGA 1Y3QA 3BFTA 2HJ4A 3RGYA 2XHDA 5I2NB 3V8XB 4P11A 2B4EA 1PBPA 3IOUA 1MPDA 3FV1A 1M5CA 3EG6A 1B5IA 3I89A 4ZECA 3F3FA 2XXPA 3K6XA 4OTEA 1JMXB 1LGBC 3HCQA 1N7XA 5IC7A 4QT8A 3K27A 3OD7A 4ELQA 4K3ID 3MAMA 4HTGA 4ZE8A 1BLFA 4ELRA 2DWJA 1SQYA 3N26A 5H8HA 4G2ZA 2AGWA 4IO3A 3ORVD 4QQEA 5BWJA 3JZNA 4GQOA 1FQFA 1MDP1 5ISUA 4GIZA 3SEXA 1RKMA 2P9UC 3SKPA 4QSEA 3E13X 3EI1A 4PE5B 3K6VA 3GXAA 2DXYA 1MH4A 2HEUA 3HHFA 1O64A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3FXQ A;  3OEN A;  3OSR A;  4NF6 A;  4LZ5 A;  2NUV A;  3T9U A;  4O9D A;  4OVJ A;  1MY1 A;  1NFT A;  1B7U A;  3BBR A;  2GHB A;  1OLC A;  5HBC A;  1EZP A;  2OK6 A;  5EAP A;  3LR1 A;  4YKK A;  4PBZ A;  2H6Q A;  5C9Z B;  2HKM A;  1EZO A;  4D0K A;  2O69 A;  3S2V A;  3T66 A;  5CC2 A;  2H98 A;  5CMB A;  1CB6 A;  2Z8E A;  4PNK B;  4GL8 A;  1JOF A;  1Z7M E;  3EHU A;  3I7O A;  4OET A;  3A3C A;  3EQ1 A;  5HYN B;  3C31 A;  3RTW B;  2W18 A;  3T96 B;  1MY3 A;  4FAV D;  3T9H B;  1L0Q A;  5K1C C;  3SDF A;  3EI4 B;  3PPP A;  5CMM A;  5K19 A;  5HE0 B;  3JB9 L;  2OJT A;  3C32 A;  1RYX A;  1FQB A;  2B3B A;  3CFZ A;  1NNF A;  4MBP A;  3MZL A;  3SER A;  2CE8 A;  2ZNU A;  3MC2 A;  5DTB A;  2UZX B;  4ELO A;  3RTF B;  5H8F A;  4IA9 A;  4BDL A;  2AL4 A;  1B6H A;  4NF4 B;  1B52 A;  3K1N A;  4HCY A;  4WED A;  2OK4 A;  1JW5 A;  3VVD A;  1FTL A;  4J86 A;  4ECF A;  4E5Z B;  3M3L A;  1FQD A;  2REG A;  3CG3 A;  4O3C A;  3JZH A;  2I0B A;  4Z7E A;  3BG0 A;  2ANJ A;  3DM0 A;  4UI9 R;  3EI2 A;  5LOM A;  4XEI C;  3JZG A;  2OWT A; 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