4BLAA

Crystal structure of full-length human suppressor of fused (sufu) mutant lacking a regulatory subdomain (crystal form ii)
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
742
structure length
730
Chain Sequence
EGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAPGLHAIYGECRRLYPDQPNPLQVTAIVKYWLGGPDPLDYVSMYRNVGSPSANIPEHWHYISFGLSDLYGDNRVHEFTGTDGPSGFGFELTFRLKRETGESAPPTWPAELMQGLARYVFQSENTFCSGDHVSWHSPLDNSESRIQHMLLTEDPQMQPVQTPFGVVTFLQIVGVCTEELHSAQQWNGQGILELLRTVPIAGGPWLITDMRRGETIFEIDPHLQERVDKGIETDGSNLSGVSAKCAWDDLPIRTRQLESVHLKFNQESGALIPLCLRGRLLHGRHFTYKSITGDMAITFVSTGVEGAFATEEHPYAAHGPWLQILLTEEFVEKMLEDLEEFKLPKEYSWPEKKLKVSILPDVVFDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Basis of Sufu-GLI Interaction in Hedgehog Signalling Regulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN, SUPPRESSOR OF FUSED HOM
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli
total genus 198
structure length 730
sequence length 742
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF05076 SUFU Suppressor of fused protein (SUFU)
A PF12470 SUFU_C Suppressor of Fused Gli/Ci N terminal binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1360.230 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Gyrase A; domain 2 Gyrase A; domain 2 4blaA06
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4blaA01
2O69A 3H4ZA 3CSGA 3IJXB 1MQDA 4IGTA 3TTNA 4IGRA 4NF5A 1TFAA 5I2KB 1B52A 4TQUQ 3O6HA 5LOMA 1VR5A 3OELA 3U93A 1UTBA 4PP0A 1N7WA 4PE5B 1Y1MA 3KEIA 1B9JA 5ELVA 3TEPA 5HPQA 5BUUA 2D3IA 5I59B 1OIBA 3TMGA 3TCGA 4U2RA 3JZJA 5F7VA 1URDA 1IIWA 3TPAA 1BP5A 3KJ7A 4X9TA 1LAFE 1MS7A 2I4CA 4Q30B 2DQVA 1ZKBA 1P1WA 3FXQA 2DE2A 3PMWA 3FVOA 3T22A 3SEUA 2ZYMA 4ISUA 3TODA 1QVSA 4KYSA 1MPCA 4F3GA 2RF1A 4MBPA 4F2OA 4OXVA 1B32A 1US4A 1B46A 1USYH 2O51A 1B3LA 5AA4A 1MXZA 4QSDA 3OOAA 3DP6A 4WEDA 2I3VA 3BFTA 2GHAA 1MM6A 2E0SA 1ELJA 3S9EA 3B7DA 1ZU0A 2OZZA 2A5TA 4P0IA 4KD5A 1AH5A 3TYHA 3SESA 1S50A 4LQ2A 1XC1A 2XXXA 1VE4A 2ZNUA 3MBPA 3IL1B 3O2AA 3A3CA 1P1NA 3OEKA 3CFLA 2LAOA 4KR5A 3KOTA 5F1QA 1PBPA 2ZYNA 4KMDA 3HV1A 2YJPA 1VSOA 4H65A 3IJOB 2QMWA 4ZE9A 1D9YA 1B40A 5TP9B 3PMVA 3G3HA 3KN7A 1Q35A 4QSCA 3B6TA 3UN6A 3H6UA 4PFWA 1QKAA 3H6TA 1B0LA 1XVXA 2QMXA 5DT6A 2E1SA 1AOVA 1ZBMA 3VVEA 2Q2AA 4GD5A 1HSLA 2DP8A 1ANFA 4LATA 2XX8A 2XXRA 4LZ7A 4IO2A 1NH8A 1LAHE 4RK2A 1PBQA 4Z0IA 2OWTA 4KYEA 2HQ0A 1H45A 3WAFA 1UTHB 2DYXA 4XKNA 4OENA 1WDNA 1Q1KA 5I56A 4F39A 3S4UA 4IO3A 5M2VA 3CG1A 4U1OA 4G2ZA 1L5TA 2ZNTA 2OWSA 3EN3A 2Z8FA 3OMBA 4BLAA 4GRKA 2DE4A 3CG3A 5TPAA 2QL3A 2IA4A 3PUWE 2I48A 2XXQA 3LBSA 4ZEFA 4EQBA 4ECFA 2DXYA 1MRPA 5H8SA 3GBBA 4OZ9A 3G3FA 4ZEBA 1KWHA 2QS4A 1MPBA 3AXFA 4G8MA 3K6VA 3PPPA 3IO4A 4EXKA 1IXGA 4BDOA 3VE1B 1NMUA 3HPIA 5AA2B 3FGSA 1DTGA 1VFDA 4M4GA 3L6GA 4F3PA 1QJMA 3K6XA 5I84A 4G77A 1HSEA 4X1BA 4LVQA 5EHMA 2F78A 3KOSA 3PMXA 3S9MC 1FTJA 2OJTA 5H8QB 2HXWA 1EU8A 1Y3QA 1A40A 1O7TA 5CM6A 4X1DA 4NWCA 4QFPA 3T9XB 1JQFA 3K0VA 1LB9A 1ZTYA 2NVUB 2PMSA 1F9BA 3C36A 1OQHA 3C34A 4ZS9A 2Y7RA 1B7UA 4YU0A 1CE2A 4BDRA 1MY0A 4RPNA 3VXBA 4F1UA 1A99A 4YAHX 4UACA 2ONKE 4R74A 3MP1A 3IOVA 2V3UA 2GH9A 2ALUA 4F3SA 4FATA 2V25A 2XD3A 5L9MA 2XXYA 5K2YA 3TCFA 3KG2A 1AIVA 4O3AA 4GXAA 3SKPA 1XOCA 1JVXA 3K1MA 4G4PA 4DDDA 4FAJA 1RYOA 1SW4A 1QULA 4MF3A 4R6HA 1PEBA 4YKPA 2HZLA 1RYXA 1XVYA 1FQEA 3KJTA 2Q89A 4FIMA 3SEVA 2FA7A 2Z22A 5L9OA 2W7YA 3S9LC 2DWIA 3HSTA 4I8CA 1OLAA 3FD3A 1SW1A 3GBAA 3O66A 1BTJA 4E0XA 3EHSA 2UVJA 4IO4A 2ONSA 2OBGA 3I6VA 4ELOA 4L17A 2HFBA 1MQIA 4IB2A 3EPEA 3B6QA 4JSOA 3Q29A 2KLFA 4ZEIA 3U1OA 1B4HA 4C0RA 5JK4A 4IY5A 1Y20A 1A54A 3DLNA 4RK9A 3SEYA 1MPDA 2UVIA 2Y7IA 2F7AA 3BBRA 2ZXTA 1JW4A 2G29A 2PX1A 1GGGA 3IAZA 2H25A 1SW2A 3TQLA 2DWHA 4R6KA 5H8HA 3K4UA 2XXHA 1B4ZA 2NOOA 4E0WA 3IOTA 3OO9A 4H6DA 1MQGA 3MZ1A 5FHMA 1NNFA 4YB5A 3JYRA 1I6QA 5KZTA 1B51A 3RTWB 4KPTA 4DLDA 4FORA 4NF6A 3TAJA 5ITOA 4GVOA 4NMYA 1B1HA 2RC8A 3EHUA 2O7IA 3M3FA 1BLFA 4U22A 2DE3A 2GFEA 3E13X 5I57B 3PD9A 5KDTB 1H43A 1H76A 3I3VA 1B5JA 3W15C 1Y3NA 1XHYA 1B1XA 2X7QA 1FQDA 5A5XB 3RPWA 1P99A 3O6GA 4XXUA 3CR9A 2ABHA 5B7DA 2P0SA 2QS3A 4FEDA 1T0KA 4M1VA 2XD2A 1R6ZA 2F7CA 3B6WA 2HAUA 2AIXA 3KSJA 4O3BA 1IQ7A 1URGA 2RC7A 5HM4B 4RA1A 3RNNA 4OHNA 4PFTA 4PQJA 5AA1A 4OERA 2F8DA 3GLBA 3EQ1A 5I59A 3Q26A 5CC2A 4IO5A 2UVHA 3O28A 1USYE 2REGA 4N07A 4R6YA 1B05A 3K01A 1POTA 5CMCA 4AB6A 1WVJA 5AA2D 4GOTA 5EYFA 4ND9A 4ELPA 3RQTA 2DVCA 3OEMA 4KCCA 1CB6A 3HHGA 1DOTA 3RGYA 1LCTA 2Y7PA 3FVKA 2THIA 5H8FA 1ZMGA 2RKMA 1JEVA 2Z8DA 1QUIA 1URSA 1FW0A 4F31B 3SEXA 1A7LA 2XXVA 4BDNA 3IOWA 4H1XA 4BDMA 4WEPA 1PC3A 3UP9A 4QSEA 4X48A 1M5CA 1B7ZA 1N0TA 2ONRA 2B3BA 3K6UA 2OK2A 1MH4A 1NFTA 2QS1A 2Y7KA 4BDQA 2A5TB 5I2NA 3K02A 4GQOA 2H5YA 4JXIA 4OWDA 2F6PA 3MJNA 5ICTA 2HEUA 3C31A 1BKAA 2D5WA 4R75A 1M5EA 4G68A 2XX7A 1NKXA 1LSTA 4DIGA 3DELB 2F35A 1SVXB 1LB8A 3T9VA 3VVDA 5FHOA 4TLMB 4R9FA 3G3IA 4ZEDA 4ESXA 2A5SA 1Z7NE 3FXRA 3R7XA 3QXMA 2OLBA 2Q9TA 4THIA 4G8HA 1NNTA 4N6PA 4AQ4A 3G7WA 3ZS6A 1B7HA 3FZVA 1LCFA 3FASA 1IXCA 2I0CA 1SI0A 4NE4A 2I58A 3UORA 4OTEA 1FTKA 1MY3A 4R2FA 3MUQA 4QHQA 1LBBA 2GHBA 1UTHA 1A55A 1DMBA 1MXVA 4JWXA 3BKIB 3MPLA 3W9VA 2PBWA 5CMKA 4N13A 2FNCA 4OESA 1LFHA 3KFMA 5DVIA 3MQ9A 4K3FA 1OVBA 3PU5A 2I49A 1Y1ZA 4TOZA 4YB6A 4NF4A 3KBRA 1MXWA 5TPAB 1JVYA 3OD7A 3OSQA 1B3EA 5K2XA 3UGWA 3MVWA 1MQHA 4GF8A 4EUOA 1SBPA 4OETA 1FTLA 3QUFA 1YAEA 2QS2A 2X26A 4LP2B 1IITA 3U94A 3CVGA 5AA2A 3N6TA 4I1DA 1TWYA 5H8NA 3IX1A 2VGQA 4KM9A 1N7XA 2UXAA 3RUMA 1SQYA 1US5A 3LSXA 1QKBA 3PV0E 3BFUA 5KCJA 1FQAA 3P7IA 1EZPA 3T93B 2GRVA 4GLIA 1SW5A 2F36A 1OQGA 2H99A 5I58B 4RNSA 1M5BA 1MH3A 1A8EA 2V93A 3KZGA 4F18A 3CI8A 1H3DA 4GIZA 1SYIA 3UK4A 3C33A 3OO7A 3K1NA 1OLCA 2O84X 3MVZA 4KHZE 4FE8A 1S9TA 2RCBA 4WXJA 4MH5A 4H8IA 5DEXA 2CMOA 3KGCA 3K6WA 4FEBA 5CRYA 4POXA 4GWOA 4FJPA 3KN8A 3V83A 4ELQA 4I9DA 2I3WA 3FIRA 1XS5A 3ONMA 4DXBA 4ESWA 5CBRA 1LAXA 3R6UA 2AYSA 4EQ7A 3O97A 3CFZA 3N94A 4HS7A 4PETA 2O1LA 4QRZA 5DVJA 1LAGE 2B65A 1MG1A 4F29A 1DPEA 2Z8EA 5CMBA 4P11A 3GZGA 3O29A 4JSDA 3MZBA 3UA8A 3OSRA 4YKJA 1IEJA 3VLVA 3ZKKA 1PB7A 3A09A 4LZ8A 3O9PA 1D4NA 3N5LA 2X7PA 3I5OA 1MY1A 2RINA 2R9JA 4O3CA 3RLFE 3SERA 1IXIA 1MY2A 2V3TA 3LSLA 1O63A 1JNFA 4KQPA 1GTKA 3T96B 1FQBA 3HN0A 3PPNA 1JEUA 3ILTB 2R6GE 4HTGA 3Q28A 5L8DA 2NXOA 4YKIA 2ZYOA 3IB2A 3N26A 4Q0CA 4RYAA 4C1UA 4F1YA 4KMAA 2Q88A 1B2HA 1Y3PA 1EZOA 3VVFA 4OFOA 2IEEA 5CBSA 1NNPA 2I6EA 3QIMA 3E3KA 1H44A 1UIVA 3S2VA 4XTCQ 4H8JA 3H7MA 3O6IA 4YKKA 4DXCA 2B3FA 4NEDA 2CZLA 3VLUA 3FV1A 2Q8JA 4YICA 3CIJA 3R26A 2FYIA 2HZKA 3C35A 1ZJLA 3K2DA 4GL0A 3SETA 4NWDA 5H8HB 1B5HA 3QAXA 3OO6A 4R72A 1GVCA 4OVJA 5J1DA 4NF8A 3RN8A 3IO6A 4MFIA 4U23A 2ANJA 3H06B 1MDQA 3TUSA 3KN3A 2YPNA 4DCXA 2PT2A 1I6AA 1I69A 4NF6B 5EHSA 2RCAA 1FCKA 3D4CA 4EXLA 5JTYA 5KDTA 1SDXA 3MWBA 3CFXA 2O1MA 2Y7WA 3IB1A 2DWJA 3EHTA 4F2QA 3TTLA 5L9SA 4G68C 1II5A 3MW0A 2F6GA 3FJGA 1TT1A 4G8NA 1SI1A 4KMHA 3E9XA 1IZ1A 3PGFA 5I2KA 1Y4TA 4R9GA 2XXTA 4H5GA 4NF5B 3N6UA 4XKQA 2P1SA 3CRBA 4OYVA 3CSBA 1J1NA 4LQ5A 1UTBB 1DTZA 3IK6B 4EQ9A 5AA3A 1MQJA 3MVYA 1MY4A 3LUYA 4ZZEA 3PD8A 2DWAA 3PPRA 4GXSB 3PUYE 4DE8A 1IUDA 4TLLB 4LZ5A 3GXAA 3H3GA 3ODBA 3IORA 3MAMA 3RTFB 3U92A 1B0HA 2PYYA 4ZDMA 3C9HA 4XIGQ 5DTBA 3DP4A 3V5AA 4EDPA 1M5FA 2I4BA 1MXYA 4ONYA 4WKMA 3RT8A 3TTKA 2M8CA 4QFLA 3Q27A 2XXUA 4OFJA 4F19A 3QUJA 2AL5A 3IB0A 5FTHA 2H98A 4FECA 2O6AA 1SYHA 1FTOA 3PPQA 5H8FB 4OMBA 3MZ9A 5AA4B 4XKPA 2DOJA 3LR1A 3TTRA 3LSWA 2XXPA 2XXIA 4PFYA 5CI5A 4DCYA 3FUZA 2QSXA 4ZE8A 5DVFA 1YCJA 1YPNA 4POWA 3FVGA 3G3JA 3FJ7A 4IO7A 1FQCA 1P1UA 3UIFA 2DS9A 5I2NB 4YMAA 4HCWA 3ZKLA 1VFEA 4OFLA 4EF1A 4LONB 1ATGA 2R71A 5TP9A 4Q8RA 2WKYA 3PPOA 4G68B 1Y9UA 1BIYA 4QFKA 3ECRA 5AE4A 5BWJA 2UYFA 4F1VA 1N84A 2F5XA 5ISUA 5CMMA 3VV5A 1QUKA 3OENA 4DZ1A 1TXFA 4IY6A 3T9HB 2F34A 3MC2A 3G3GA 3QSLA 3FATA 2VP1A 2VD2A 5FHNA 1Y4CA 4MLQA 3TKDA 4KM8A 1PB9A 2O68A 3K00A 4GL8A 2VOZA 3DP8A 3C4MA 1JETA 4KI0E 3U8QA 3H6VA 5I56B 4KYDA 4PFUA 3QYTA 4BDLA 2NWJA 4EF2A 3IR1A 4HW8A 1Z7ME 1LFIA 4YB7A 3E4RA 4U4SA 3HCQA 3M3LA 3OXNA 1NH7A 2BJJX 4YZZA 3PUVE 4U1ZA 1MXUA 1AL3A 4NF4B 2UYEA 1RKMA 1XT8A 1NL5A 3EF7A 3V8XB 2ESNA 4JWYA 4JBZA 3TDJA 4ELRA 3LC8A 2G93A 4R2BA 2ZYKA 4YMBA 1FTMA 3USDA 1MXXA 2DVZA 4ZZAA 1B3GA 1N3WA 1HSJA 2V3QA 4H67A 1SD3A 3D4GA 3QK6A 1DSNA 1OMPA 4DXUA 1I6BA 4AB5A 3VFJA 3RY3A 5H8NB 4QFNA 3Q25A 5H8QA 1B6HA 4I62A 1PDAA 1JW5A 3FJMA 2DXRA 2ZMBA 5KCJB 1WODA 4RJZA 3IOUA 5I58A 3PUZE 1P1OA 2XX9A 3DM0A 3ILUB 2DSFA 2P2AA 3PUXE 2HCAA 3W9WA 1R9LA 3TFLA 3HO7A 2PVUA 3SDFA 2I0BA 5IKBA 3VDFA 1MM7A 1TFDA 4H0WA 1M5DA 5HBCA 3WAEA 3K1PA 3G3KA 2NUVA 1R9QA 4F3BA 1B3FA 3M3KA 4NTLA 2H9BA 3F11A 4RY1A 1D3KA 5DEXB 3H03A 2QRYA 3JV9A 3MPKA 4JB7A 2O7UA 3FXUA 1LFGA 5B70A 4OQOA 2REJA 1S7YA 3VLWA 4HCYA 1YTVA 3HHFA 2VHAA 5ITPA 1AMFA 1N04A 3FV2A 4UA8A 1A8FA 1MDP1 2PT1A 1UIUA 4U4XA 1N76A 1POY1 3M8UA 4LA9A 1LLSA 4RPOA 4OEUA 2XHDA 3MP8A 5JEIA 1IXHA 4P0GA 2RC9A 3ZSFA 1NNKA 2V84A 1DPPA 2OCUA 3T9UA 2Y84A 2VD3A 4MLVA 4Q5TA 2Z23A 3H6WA 1FQFA 3LSFB 4QFOA 5TU0A 1O64A 4U21A 1EZ9A 1JW1A 3VXCA 2Q2CA 4R73A 1QW0A 3V89B 3KSXA 4OEVA 3S9NC 4Z7EA 1ZLQA 4GFRA 5DYHA 1QUJA 3U72A 4JWOA 2ZNSA 4IO6A 1LGBC 4LUBA 2YLNA 1D9VA 1GV8A 2F7BA 1B5IA 3TELA 2UVGA 1B3HA 3RT6B 2QPQA 3SEWA 3TQWA 3A3UA 4KCDA 1LBCA 1UQWA 2HAVA 2QJEA 1B58A 4NF8B 4KFQA 4C1TA 4F22A 1PB8A 3T66A 4ZECA 4JDFA 4H5FA 1R1NA 4XKRA 3OO8A 2F97A 5ICQA 1ZIUA 5FTIA 1GR2A 4BLBA 3FVNA 1N3XA 2H4IA 3THIA 3L6HA 5I57A 3TCHA 1OVTA 4ZEKA 3TZAA 5IAIA 3TTMA 1P1QA 4RXLA 5A5XA 3C32A 2AL4A 2D21A 1EH3A 2XXWA 4QF9A 5JTYB 3MP6A 3MVXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O69A 1FPBA 3RPLB 3H4ZA 2FQTA 3CSGA 4QXDA 3IJXB 2VT5A 1JOEA 1PJ5A 3FOEA 3S2HK 1MQDA 4IGTA 3TTNA 4IGRA 2NVYA 4NF5A 1TFAA 5I2KB 3AH5A 1B52A 4C2MC 2ZZWA 4TQUQ 3O6HA 2R93A 5LOMA 1VR5A 3OELA 3U93A 4PF6A 1UTBA 3A29A 4PP0A 1N7WA 4PE5B 1Y1MA 3KEIA 3SZZA 1B9JA 2GQ1A 1USMA 5ELVA 3TEPA 1YZ0A 5HPQA 1SPIA 5C3EK 4BXXC 5BUUA 3I4MC 2D3IA 5I59B 3G4CA 1OIBA 3TMGA 3TCGA 4U2RA 3JZJA 5F7VA 1URDA 1IIWA 3TPAA 1BP5A 3MYUA 3KJ7A 1JVIA 4X9TA 1LAFE 1MS7A 2I4CA 4Q30B 4C3HK 3GTMC 4NGUA 5C4JC 2DQVA 3GTQC 1ZKBA 1P1WA 3FXQA 2DE2A 5C44C 4O7IA 3B50A 3PMWA 4MEXA 3FVOA 1INNA 1LEVA 3T22A 1TWFK 1G0HA 3SEUA 1WQGA 2ZYMA 2WBDA 4ISUA 3TODA 2OX3A 1QVSA 4KYSA 1MPCA 4F3GA 2RF1A 4MBPA 4F2OA 4C45A 4OXVA 2CEYA 1B32A 1US4A 1B46A 1USYH 2O51A 2B4LA 1B3LA 5AA4A 1MXZA 4QSDA 3OOAA 3DP6A 4WEDA 2I3VA 1NUXA 3BFTA 5DW8A 5C4XC 4OANA 5IYDK 3OPFA 5TMFA 1K9ZA 2GHAA 5IZZA 1NV3A 1MM6A 5JVOA 4FZBA 3GYYA 2ZUEA 2E0SA 4WJ3M 1ELJA 3S9EA 3B7DA 1ZU0A 2OZZA 2A5TA 4P0IA 2Q74A 4KD5A 4A3BK 1AH5A 3TYHA 4KARA 3SESA 3M3YC 5M3MK 3GTKC 1S50A 2RGRA 4LQ2A 3LV0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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