2V4V | Genus

Total Genus 33

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	33
sequence length	129
structure length	129
Chain Sequence	QSAYSRIEAESYSNQSGIQTETCSEGGEDVGFVENGDYTVYNNVDFGDGVGGFQARVASATSGGNIEIRLDSSTGTLIGTCPVAGTGDWQTYTDAKCTVSGVTGKHDVYLVFKGDSGYLFNLNWFTFSE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
source organism	Clostridium cellulolyticum
publication title	Analysis of the Structural and Functional Diversity of Plant Cell Wall Specific Family 6 Carbohydrate Binding Modules. pubmed doi rcsb
molecule keywords	GH59 GALACTOSIDASE
total genus	33
structure length	129
sequence length	129
ec nomenclature
pdb deposition date	2008-09-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03422	CBM_6	Carbohydrate binding module (family 6)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.260	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Galactose-binding domain-like	2v4vA00

1JZ3A 2YC2A 3LE0A 1K12A 1EUUA 2VQUA 1GU3A 1W9WA 3I3EA 2C9KA 3NNGA 1JZ6A 2XONA 1O8PA 2QQNA 3C8XA 1YQ2A 3I2JA 3LQCA 3EYPA 3DYPA 2VJXA 2ORZA 5DQ0A 5LA0A 3OB8A 1JZ7A 3MUY1 4QDQA 4XZUG 3VDAA 1L7RA 2JKXA 2ZEYA 3MV01 4DEQA 1K45A 3CMGA 4CUAA 3MBWA 3CZJA 2QQIA 2W94A 5HXMA 1PX3A 3WNPA 1JZ5A 4ARYA 3D3AA 1XPWA 4CVUA 3U37A 5EJZB 2VCBA 1JU3A 1W8OA 3CZUA 2J7MA 1W8NA 2XOMA 5IHRA 1RYYA 5JXGA 3K75B 1ULOA 3PUHA 4QX3A 2WQ8A 2JD9A 2BGPA 1UWWA 1GUIA 3T0AA 5C71A 4MO3M 3WF3A 2J22A 1UXXX 1UYZA 5DPNA 1JI6A 2B9VA 2Y8KA 4QB6A 3EB7A 5J1XA 3K77A 4ZZ5A 4QDRA 4A45A 5IJRA 5EIYB 5DMYA 4DXTA 3OEAA 4BDVB 5B4XA 3IDAA 1IQDC 3C7FA 3GDBA 2J1RA 1OF3A 4QX2A 4E8DA 2CDOA 3I2KA 2X09A 3IIIA 4A41A 2VL4A 4OMCA 4QPWA 3ABZA 4BXSV 4QB2A 5IFPA 2VOTA 4QAWA 4P5YA 2WUHA 3OGSA 2J1SA 3WEZA 1T2XA 2Z4FA 3HN3A 3CKHA 1F4AA 2Y6HA 3ACGA 1XNAA 2QBXA 4UOJA 4QX1A 2WBKA 1D7PM 1OT5A 2ID4A 4MOAA 2ZEWA 4PQQA 3T2PA 4LKSA 4OMDA 2E26A 1EUTA 5JR2A 1JYWA 1NX9A 3OG2A 4DXRA 2QQLA 2ZEXA 4CU7A 1JZ2A 1CX1A 3MO4A 4RN5A 3CQOA 2VZ3A 4XUNA 3UESA 1OF4A 4D8MA 2VZ1A 1O8SA 2VZPA 5HPOA 2VZQA 2WZ8A 1UXZA 3IAPA 3T09A 1H6YA 2VMDA 3FN9A 5C7GA 2W1SA 4JX0A 3WNNA 3IB3A 2C26A 5LCWL 4MGSA 4CU8A 1UYXA 2W92A 3A21A 2J1VA 3F2ZA 5A1AA 4JKLA 5JXHA 4CU6A 4DUVA 2VZVA 3NJVA 1GQPA 2ORXA 2BERA 3A7QA 2VCCA 3T0BA 3C7GA 1CZVA 1LNSA 1GNYA 4JHZA 3E1F1 1JYNA 4GWIA 2W46A 2YB7A 3UNPA 4QX0A 2WN3A 3P6BA 4A44A 1BHGA 4P00B 3LEIA 2W1UA 3WNOA 1UMIA 4KMQA 2W1QA 3WF1A 2HLEA 1CZSA 2VZUA 4TTGA 2WO2A 5B4NA 5JXJA 1L7QA 3MUZ1 2RJ2A 4XUQA 4W50A 1SHWB 4UI9L 4HG6B 1UY4A 3T2OA 4A4AA 2WDBA 4Z2AA 2V72A 3HEIA 3ACIA 3IAQA 3ACFA 1UY1A 1JZ4A 5IFTA 1US2A 4W8JA 2W1WA 3GM8A 1SDDB 3OGRA 1NKGA 2VMEA 3MV11 1WKYA 2WO3A 2R7EB 4W4ZA 3VD5A 4XUPA 3I3DA 2WABA 1HN1A 4A6OA 3NQHA 1O59A 4QB1A 2DDUA 4QDSA 3A22A 1CIYA 2B4KA 3J7HA 2W3JA 5JMOA 5LA1A 4DUWA 2V4VA 2VZOA 3WF4A 2VO5A 3WNMA 2RV9A 5EJ1B 2PQSA 4TXWA 5G04L 2J1UA 3C7EA 1UZ0A 2W95A 3VDCA 1JHJA 4D0QA 3K4ZA 2WYSA 3WNKA 2Y6KA 2J1TA 3DYOA 5I0DA 4P08A 1DLCA 3OGVA 2EIBA 3DECA 3BN6A 2VC9A 1K42A 1UY2A 4ZZ8A 1XNTA 3ECQA 2Y6GA 4MADA 2QQOA 4CUCA 3VD9A 3A23A 3SKJE 3LPFA 4LHSA 1TVGA 4A42A 1ULPA 1OH4A 3LEGA 1KGYA 2V5DA 4FI9A 2CDPA 3WSOA 2OKXA 3HNYM 2YFZA 2YFUA 3CIHA 3PUIA 2W5FA 2VZRA 3I2FA 3P1IA 3W5MA 4AAXA 4ZY9A 1JZ8A 3LPGA 2E33A 3AC0A 2WAOA 1PMHX 4M4RA 4P02B 3THCA 3VD7A 1UMHA 2EIEA 4XUTA 1PX4A 1UY0A 4CU9A 1CZTA 2QQJA 2VTFA 3T08A 1KEXA 1GOFA 1NUKA 2WN2A 1J83A 2VR4A 3I2HA 1F4HA 3SKVA 4BK5A 1US3A 5CZKA 4DUXA 4BJ0A 2QQMA 3DYMA 4OUEA 2VM9A 1W0NA 1J84A 3HNBM 1I5PA 3K4DA 2JE8A 3ACHA 3GXUA 3FL7A 1UX7A 2J1EA 1H6XA 2DCKA 2LS6A 3C7HA 2W91A 4DXSA 5JXIA 1GMMA 5CYYA 2W9XA 3I3BA 3NRUA 3CDZB 4AG4A 5LA2A 4A3ZA 4IUGA 3T0DA 4RYDA 1UY3A 3K4AA 4LPLA 3ZM8A 2DCJA 3UETA 5IYYA 2KD7A 2VCAA 4XURA 3W5NA 3C7OA 5DN2A 2VMFA 3LEKA 4GWJA 1K3IA 1P8JA 1XC6A 2E32A 1GOGA 3SEPA 3OBAA 3I2IA 1TG7A 2Y64A 4KI5M 3T2QA 1JU4A 2HYXA 2BGOA 3HPNA 1MPXA 3THDA 2X10A 2EIDA 2ZXQA 2BZDA 4PT6A 1NAEA 4XUOA 3K46A 5FUIA 4PF1A 2W47A 1JYXA 5C70A 4ARXA 3HJRA 2YC4A 3WQBA 1WCQA 3JXSA 2JDAA 4JKKA 4BK4A 5JUVA 2E31A 2VMCA 4UAPA 4KWUA 3FHQA 3FHAA 2J1AA 2ZEZA 3WNLA 2VZSA 3I2GA 3BGAA 2Y6LA 2QQKA 3WF0A 1JYVA 3VD3A 2WZEA 1SG3A 1DP0A 2XQXA 4JKMA 2W87A 4DEVA 3HNMA 2XHNA 3GGLA 1DYOA 1R64A 2C4XA 5G05L 4MGQA 1W9SA 2WO1A 1UYYA 1W9TA 3OEBA 3WF2A 3VDBA 2VQTA 2Y6JA 1PMJX 1W99A 3I97A 2RVAA 1OD3A 2WAAA 2VZTA 4YPJA 4ZXEA 3SEEA 2BBAA 2X05A 4OYUA 4CUBA 2YG0A 1GOHA 2LW8A 4XVHA 4ET7A 5F7UA 3ETPA 4M4PA 3VD4A 3NJXA 4LQRA 4GZ9A 2EICA 4OZOA 4E8CA 3HOBA 2L9LA 4L0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1JZ3A 3AFKA 2ARAA 4XIOA 3LE0A 3H8OA 4INDA 4XDQA 5KWRA 1GU3A 1H2NA 2XONA 3A4UA 5DG2A 5DUVA 1EYBA 3AX4A 4NRMA 1K5MA 4N7UA 5AVAA 1VBE3 1RUJ2 3SCGA 3RWNA 1KXGA 4KL1A 1W2AX 2IFRA 3GHMA 2QNKA 3S5AA 2O14A 2Z5WA 5LBEA 2FDGA 1ASJ1 4AFDA 4MHUA 3U14A 1W0PA 2VU9A 3VBHC 1GNHA 4QMAA 2LRPA 2FQPA 5FJKA 1W9YA 5I0TA 3VKOA 1ENXA 3RSJA 3N3HA 4V2WA 4XZUG 5A70A 1L7RA 4DIQA 1Q8QA 4CCMA 3MV01 5BNNA 4CTEA 3ZN6B 4NOTA 4EN8B 3QLQA 4ES9A 1SCRA 4Q5OA 3ZYGA 4BQ5A 4IEXA 3N9QA 4AEDA 4QGNA 2QQIA 1AZDA 1RL3A 2W94A 3IMMA 5J37A 1NA1B 1NCQA 3VHNA 1PX3A 1YIFA 3WNPA 1TNRA 4Q4X1 4Q0PA 1AL0G 1K5JA 2D6LX 1Y7BA 2ZX2A 3D3AA 3INAA 1BK1A 3KV9A 3QH7A 2Q8CA 1SLIA 5I93A 2ZX3A 3U37A 3GZUC 5FYYA 1FOD1 2GC3A 4J1WA 5GZEA 1JU3A 5HV0A 4J1XA 5EV7A 1F35A 3BU7A 4Z8BA 1RUI2 1N1VA 2HBUA 2WQ4A 1SLCA 4S2FA 4MGTA 2SBAA 5F39A 1YUDA 2WKKA 4K20A 1ULOA 1ZZ7A 3GHNA 4XMAA 3MIHA 4QX3A 1RUH1 1UF2C 5H9RA 3JU9A 1HQLA 4QXBA 5A7SA 3KHCA 1O3SA 3K3NA 3RMXA 4CEWB 4CXWA 3DL3A 3CJIB 1GUIA 3S5QA 2A6YA 4Q1RA 5FYBA 3P3NA 4K8FA 1W2NA 4L8QA 1H9PA 2RMU3 2J22A 2RHPA 2Q8OA 3SCHA 3RZMA 1JI6A 1MVEA 1D0HA 4TSVA 2PTMA 4CCOA 1DZQA 2Y8KA 4D94A 1HQNA 5J1XA 3D0SA 4LK7A 4P9JA 2A75A 3WUDA 3VKMA 1O3RA 4QDRA 2X5IA 3JBG2 1NG0A 3N4MA 3KD4A 4XABA 4OHVA 5EIYB 1R1A1 1V6JA 2V4AA 5GLWA 3ZSEA 3H8RA 4GULA 3R6SA 1IS4A 4TYSA 1RUE1 1ZBA1 2Z2SB 2R043 4YW3A 4CDQB 4I2OA 4AZZA 1CR7A 4DXZA 1B35A 4PJYA 2CDOA 1PO13 3SLIA 3O1RA 2DWRA 1HB4A 2VBBA 3KMHA 2YDEA 4A6SA 5C8WA 4E9KA 4QPWA 2Q30A 2HWD3 4Q2FA 5FYZA 3FBMA 3M4FA 5IFPA 5HCAA 3MW2A 4QAWA 5C9AB 3HVDA 2P6CA 2J1SA 3C3VA 3FC0A 3OGSA 2E51A 4JGZA 3IDCB 3HN3A 5A33A 3CKHA 3WUCA 3SNMA 3U4SA 3RZHA 1OPMA 1HV0A 1XNAA 3S57A 2D40A 5IK8A 1LCLA 1RJ8A 1HB3A 2FDHA 4IE0A 1PM4A 2BEOA 2WBKA 1OT5A 2OX0A 1C28A 3M3QA 3VUOA 4XBNA 1JOPA 3SHRA 3WG4A 4CCCA 1XSRA 4PHZA 4YW7A 2HYKA 5A32B 3WQ1A 5DAQA 1EUTA 3WD5A 5AVPA 5CEHA 1O3QA 3EMRA 3OG2A 1JZ2A 2V09A 2ZHKA 3K2OA 4YG3A 1UU5A 3TBDA 2RMU2 4IV1B 1HJGA 3CQOA 2R1DA 1QQP2 3I59A 4LLFA 3FMGA 4PDWA 2AEZA 4RN5A 2VOKA 2XUMA 3DXUA 4Y5TA 3AVSA 4K7JA 5FZ3A 2JIJA 4D8MA 2VZ1A 3PHMA 5BY5A 5C8CC 1HXS1 2IXLA 3POIA 4XAEA 4XF9A 4CCLA 2I2SA 2BDRA 2VZQA 2WZ8A 3I4IA 3IAPA 2VXJA 1YEWA 4JQTA 3T09A 5AFBA 3ZYHA 4CXYA 1B09A 5FWEA 1PGSA 1CAXB 3FN9A 1VMHA 1RIRA 2XJSA 4JX0A 2GN7A 1UIJA 4M3CE 4GH4B 1LR5A 2XR4A 1A8DA 3K3OA 1AF9A 2HWC1 2YU2A 3PL0A 1PO12 4QU2A 1HJFA 3H3LA 4BQ4A 3AMNA 1PVC2 4LBOA 3WXPA 3FJSA 1RMU1 1C1LA 3W59A 4YGBA 5FP9A 2IZWA 1QJU3 2BERA 1Y4WA 4AVCA 3ZDSA 5FXZA 4QX7A 2BVBA 3ZN6A 4QX5A 3ZXGA 4EZHA 3LDBA 5FLIA 4UW3A 3QCWA 1HN0A 2WN3A 4Q8LA 1Y9MA 4AVTA 1OFSA 5GLZA 3NNMA 1FMD1 2ZHNA 4DZGA 5BNPC 1NA1A 4XJAA 1IPJA 1RVF3 2A6VA 5BXXA 4LE4A 1ND2C 4P00B 4PQ9A 4YLZA 5A3MA 3AKSA 3N36A 3TEWA 1UMIA 4FVVA 4KMQA 3KM5A 4JGYC 1OA3A 3IT8A 2W1QA 4Y1YA 1DZRA 1N3OA 3WF1A 1CAVB 4LLOA 4CRQA 4OHYA 4JRAA 4AHXA 1X9TA 1BBT1 2ZBJA 3U4XA 1QJY3 4GWMA 5FZ4A 1FAYA 3PVBB 2CY6A 1RUC3 5FKBA 5J36A 4FSJA 2GNBA 4AE2A 4CPBD 1WGPA 1LOCA 5JXJA 3BTYA 1V00A 3GZAA 3WW2A 5E6HA 2ZX1A 4RGKA 4X6RB 5CFDC 3B93A 3VN4A 3ZMOA 5J96B 2HH9A 3VBOB 1OFNA 2HWB1 4XHXA 3SISA 5DAPA 4HG6B 4CEWA 4P9YA 3CJIA 1UY4A 3T2OA 5IK7A 3PJQA 4XILA 1PGL1 3POFA 4N90A 2WDBA 2V72A 2B5HA 3HEIA 1XOYA 3ACIA 2C6SA 4AWDA 1UAIA 1UY1A 3A0NA 4WVZA 2NP0A 1W0OA 1JZ4A 1US2A 2XPJA 2A6WA 3MW3A 3CLPA 3POJA 2XL9A 1AYN3 3S6PA 2VOWA 3OGRA 2AYHA 1R082 3QACA 3MV11 5E8AA 3NKTA 1HV1A 2R7EB 2I74A 5FPVA 3VD5A 4NAMA 1GZCA 2CAVA 3NL1A 1HN1A 3J26N 4U36A 2OUJA 2EXJA 1Y9GA 4QB1A 3LA2A 1MQTB 4Y1VA 5LWBA 1FNZA 2BNMA 1FXZA 5JZGB 4CDQA 2WFF3 1G9CA 3FBYA 2BFUS 2QCSB 1IPSA 4XFHA 3ZXKA 2IC1A 3WF4A 4BE3A 1J3QA 5C3RA 3GZEA 1ULFA 2D43A 2JB8A 3CU7A 1YQ5A 4XEZA 5DG1A 3AKRA 1DZTA 1LGCA 3J8F1 1MACA 5C9AA 4QXKA 1PMIA 1LECA 1QJY2 1W2OA 3L2HA 2R062 2D3RA 4TXWA 4C0BA 4PLMA 4LNVA 2JG8B 1OPOA 2OQ6A 4XF3A 1HW5A 1D2QA 1A78A 1FATA 1HIXA 1KFUL 2ZGNA 2HJIA 2D93A 4GQ7A 2WYSA 2WWJA 2J1TA 4H55A 5I0DA 2AGSA 1WCSA 2VQ0A 4HXCA 4EN0A 2EIBA 4UF0B 3DECA 3BN6A 4JCKA 4L97A 3B9IA 4ISRA 2HWF2 3ZOIA 4COZA 3OSDA 5A32A 4HVOA 1UY2A 2YGMA 3BTZA 4IV1A 4PI2A 2QZ3A 5FKCA 5L7OB 3KF3A 5EPAA 1V0AA 3O1MA 1OH4A 1W8WA 2R32A 3OD0A 3VZLA 3VZMA 1CPNA 2CU5A 2PHXA 2RS31 1AYN2 3H50A 5FY0A 4AI9A 5IVJA 1LHVA 2WA4A 5K4LA 1C8M3 2R49A 2CDPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2V4VA

Total Genus

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Chain Sequence

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