2A75A

Trypanosoma rangeli sialidase in complex with 2,3- difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
634
structure length
632
Chain Sequence
MASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVMDATVIVKGNKLYILVGSFNKTRNSWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFIGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDGNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQQDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPATPKGGCGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
publication title Structural and Kinetic Analysis of Two Covalent Sialosyl-Enzyme Intermediates on Trypanosoma rangeli Sialidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords sialidase
total genus 181
structure length 632
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2a75A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2a75A01
4GKYA 2JECA 1F8CA 1ENQA 4NOTA 1AX2A 4YZ4A 3AZZA 2GMMA 1CPMA 2R0FA 3WDXA 2VY0A 5F9TA 3WG1A 4XBNA 1USXA 1F8DA 4XHBA 4R9CA 1CONA 2EXIA 3N7LA 2VK7A 1W6MA 3VV1A 3JU4A 1AXKA 5CB7A 1S0JA 2PHXA 3M3EA 2HT5A 4KS5A 2YY1A 1UZYA 3UJOA 1SBDA 2OVUA 4RL7A 3A0KA 3V64A 4X47A 3L2YA 2QWKA 1KITA 2AGSA 5B2CA 2SLIA 3TI3A 3QCWA 1VAMA 3O9JA 2NYYA 5HCBA 2R0HA 4YZ5A 4B7RA 1MZ5A 2UURA 1F31A 2HTQA 5GALA 3ZVXA 1S0CA 3WG3A 3CL0A 3NSSA 3C2UA 4GJTA 3TI5A 3POWA 4I00A 2ERFA 2V5YA 1LEMA 2GN3A 4XJZA 3CNAA 1C4RA 2GNTA 2R1BA 2W38A 1GNHA 4MWXA 3POYA 1LOBA 2ZGOA 3WUCA 3GVLA 1WBFA 1LGBA 4LBQA 1GBGA 3GVKA 3SANA 4DS0A 4YGBA 4KS4A 4YW1A 5BYNA 1AJKA 3SNMA 4C1XA 2NM1A 1SACA 5JOWA 2NP0A 1S1AA 1JN2P 4P14A 4YM3A 4ATFA 4BM8A 1E8UA 2KM2A 4UW3A 1KJRA 4F83A 1H9WA 2ARBA 1DZQA 1E8VA 2F26A 3VKMA 2ENRA 3R05A 1G8WA 4XXAA 1W6OA 4R9BA 1GICA 1I1EA 4ATEA 1W20A 1VIWB 4ASMB 5GZEA 1CESA 2GNMA 1WCSA 2VK6A 4K20A 4MYEA 1DIMA 2P2KA 4GALA 4LBQD 3AYAA 2D6NA 4HZWA 1W0PA 3HN1A 1HLCA 2VXRA 2BF6A 3O9KA 1QNWA 4XMAA 4XOGA 3ATGA 1JBCA 1CPNA 4XILA 4Y20A 5HUMA 1G9FA 3PJQA 4XMIA 2PHFA 5GLUA 5KXEA 4JCKA 4XJQA 3MEPA 3WLUA 2PHTA 7NN9A 5KXDA 3T1LA 3TAYA 3OY8B 2QWDA 4Y22B 4M4NA 4R9AA 2AH2A 2F27A 3ILNA 3N35A 3ZXJA 1MS4A 2ARXA 3ENRA 3AZWA 1V2IA 4WEFA 3RRDA 2DU0A 4K1JA 2P3JA 5JOYA 1WUVA 5EYXA 1SFYA 4U36A 3K37A 1C1LA 3IMNA 1LOAA 2EIGA 1G9AA 4XIKA 4AVTA 4M3CE 2P34A 1QDCA 4Y1VA 4AVVA 4M3MA 3ZXEA 2YDPA 3W09A 4NN9A 4WA5A 2GN7A 4XJWA 3WDTA 2HU0A 1WW5A 2NMNA 1A14N 4D69A 5GLTA 1S0GA 1WLWA 4RA0A 5T52A 2HYKA 2CMLA 3B00A 4GWNA 4CTEA 2ZZJA 1YIFA 3AZYA 2F24A 4WA4A 1L7GA 2OW4A 2DUQA 3D11A 1MS3A 1V00A 1Z0HA 1G9BA 4ZXKA 1UKGA 1LESA 4XTPA 1FNYA 3N7MA 1NCBN 5E89A 2XZJA 2JE7A 4Q8LA 3IKWA 4XZPA 3JUUA 5IK7A 1GZWB 2D7FA 4XBLA 2WSUA 2CTVA 4NCSA 1LJ7A 1FATA 1Q56A 2D43A 1IVEA 4X4AA 4YW2A 4YGDA 1SLIA 2VW2A 1IS4A 3QLQA 4Y1ZA 4YZ1A 2G4IA 4Q26A 4ZKTB 1OFSA 2YMZA 2DTWA 1BXHA 4MWYA 3T1EA 3NWKA 1DILA 4MWVA 4JC1A 4WEGA 1B9VA 1SO7A 3V0AB 2BATA 4GDJA 3NV1A 2WSVA 2YROA 4FVVA 5JOXA 1LOGA 1W8NA 3PVEA 1INFA 4PCRA 2DYCA 5GM0A 2HT8A 1NNBA 4H53A 4GZOA 3WG2A 4K3YA 1CQ9A 1JUIA 5GZDA 2SILA 4XJ9A 3HMYA 1BJIA 3LCPA 3AXEA 4Q1RA 5IT6A 2A6XA 2QWAA 4QN4A 2JJ6A 1XOEA 2OUHA 2XZKA 2ZB5A 4GZQA 4FPCA 3T1MA 2QWCA 3VKOA 1V6LA 1EPWA 1NCCN 1A3KA 1ENSA 5GZFA 3BOPA 2DVBA 1YO8A 4M3CF 3B7EA 1LCLA 3OGGA 4QN6A 1S0EA 5T54A 3AZVA 2OUJA 2HTYA 4YW4A 3CKZA 1APNA 2TEPA 4Y24A 4U2AA 3FFZA 4YM0A 4D8SA 5DUUA 2RHPA 1RINA 2Q5TA 4LBMA 2XZIA 4Y1XA 4ITCA 1QMJA 1NMBN 1Q8PA 2DVFA 1DQ4A 2JDZA 1S0BA 1Z50A 3MPPG 4FP3A 2E7TA 4YGCA 4SLIA 1A78A 1HDKA 2ZKNA 4MWWA 4H52A 3O0VA 4XYXA 1LODA 3H73A 4WA3A 3DGTA 4CPZA 3OY8A 1V3EA 2CWSA 1NSCA 2YA4A 4FPKA 2A7AA 3M2MA 3RSJA 2Z42A 1LGNA 3M1HA 1QOTA 1Q8QA 1JYCA 1W6PB 1NN2A 4K1HA 1NMAN 2W68A 1L7HA 3N3HA 4Q8KA 3VKNA 2XCYA 4XE9A 2ES3A 4YW3A 4KS3A 4MWJA 2QWJA 4XDQA 3I8TA 4CPLA 3WZ1A 3D6EA 1INWA 1DLLA 4YG0A 4YFZA 3RMYA 1N1SA 4MZAA 1GLHA 5IK4A 2NZ9A 2SBAA 2UWCA 3AP5A 3AFKA 4NO4A 3FLTA 4DPNA 3TI8A 4XJRA 2DURA 3NV3A 1F8BA 4M3CB 3TIBA 3ZSLA 2NN8A 4B7QA 4FOYA 3O5SA 1LOFA 1NNCA 4AGGA 1WBLA 3N7KA 1GZWA 5HCFA 5JOZA 2ZGUA 3AX4A 1VLNA 3PVNA 2CNAA 1NLSA 3NN9A 2ZHKA 4MZEA 2P3IA 1DQ5A 1LHOA 1VCJA 3D4KA 2ZHLA 2VSKA 3AXDA 2WJSA 1HQWA 4GA9A 3A72A 4BBWA 4DRVA 3WCSA 2HTUA 2AENA 4WV8A 3LSEA 1LECA 1NNAA 1MR5A 1A4QA 2W5OA 1VALA 3AZXA 2CWMA 4J9TA 3OYWB 3USUB 3V0AA 4FJ6A 2VK5A 2QWGA 3B01A 3WHUA 1SLLA 4FPJA 1MZ6A 2A70A 2A3YA 2PHUA 3LSDA 2XB6C 3UL2A 1UN1A 5M1ZA 1SLCA 1HKDA 3ILFA 1U0AA 5H9QA 3AP4A 2C4AA 3GALA 4GKXA 1G7YA 2EAKA 1LU2A 3W59A 2A75A 2ZABA 4FPLA 1W6NB 3AYCA 1ENRA 5T5PA 4B7MA 1DQ6A 1EUSA 1W8OA 1QF3A 2ZGQA 4Y1YA 1G9CA 3V0BB 4BOWA 1N3QA 5HUGA 1MVEA 3O0WA 5IUQA 2AR6A 1LHVA 4P9YA 1V0EA 2F12A 3TIAA 2HTRA 4Q1PA 4LBOA 1WW6A 4YM2A 1INGA 1AVBA 1FNZA 2GNDA 1JYIA 1JHNA 4HIZA 4CPMA 3ILRA 1OKQA 3NV2A 3WVJA 4YGEA 4AYUA 5DZFA 1FV2A 4B7JA 4X6KA 1C57A 3ZYPA 1GV9A 1MACA 3TI6A 3OBTA 1YXWA 4KS2A 1VAVA 4MJUA 2F0ZA 3KQRA 1DYKA 1B09A 1LTEA 4GEZA 1C1FA 2ZGKA 3B69A 4YG6A 2YDTA 4Q2FA 3APBA 2YA7A 2CY6A 1LEDA 2HTWA 2DUOA 1XOGA 1SLAA 1KQRA 4FQZA 5DG1A 1V6JA 2DTYA 4GZPA 4M4UA 1URXA 2F10A 1NCDN 1N3OA 3RQ0A 2W08A 1BYHA 3ZYRA 4CZSA 1FX5A 4OZXA 1D0HA 2W20A 4MJVA 4WZFA 1SNTA 3W58A 4BLJA 2WNEA 1ZA4A 4AGVA 4Q27A 1FV3A 1W6PA 1MWEA 4XJ8A 1DHKB 2ZB6A 1NSDA 4DFSA 1IS3A 1W21A 2PHWA 3BTAA 4FOQA 1LULA 2A6YA 4GZTA 2ZGMA 3K39A 1YYNA 2ZHMA 3RMXA 3SH5A 3BEQA 3OJBA 2AREA 1V3BA 4FPYA 1SBEA 5KXBA 3A4UA 4GZSA 1B9SA 1N3PA 5F5QA 1I3HA 3CL2A 1WD3A 1H9PA 3WG4A 3O0XA 1O4YA 4LBQB 1Z4YA 1ULGA 5JYYA 3SILA 1ONAA 3PVOA 4M3CA 2AEPA 1UX6A 3A0NA 1DBNA 1KDKA 2NMOA 4K1KA 2DV9A 1IS5A 3H0OA 1V6IA 2UWAA 4MWRA 3WDVA 3RS6A 1LHNA 2WT1A 4TYSA 3WDUA 1WLDA 3M3QA 2ZHNA 5IK5A 2A6ZA 5GLWA 3A71A 4UF7A 1W6OB 1W6QB 1AX1A 1Y7BA 5DXDA 4CPYA 1N1TA 4FPHA 2D3SA 1R1ZA 4CPNA 3V65A 1W1XA 1ULFA 2JE9A 2GALA 4CRQA 4B7NA 2JD4A 3CYEA 1WW4A 2E51A 1USRA 1SCRA 4GXLA 5T5JA 4M01A 1Z78A 4HZVA 1N1YA 3SLIA 4Y20B 1LHUA 2QWFA 1ULEA 2BERA 3OYWA 3ZPYA 4DRRA 1IVFA 3USUA 2FMDA 4FVKA 4UW6A 5FREA 3IN9A 1AJOA 2PHRA 3IPVB 2ZAAA 5HX0A 1DQ2A 5B2DA 4BMEA 2UU8A 5CNAA 2DVDA 1MVQA 1VCUA 4GB1A 2YA5A 2QWBA 1S0DA 2W52A 4FPFA 4QNPA 4PF5A 3RG0A 4HL0A 3MW2A 2GNBA 4XBQA 5CAZA 2YXSA 2GMPA 1EUTA 4X49A 4QN5A 1V6MA 1EURA 2VW1A 1S0FA 4YZ3A 5JVVA 4GZXA 3WV6A 1W6NA 2WKKA 3UK9A 2YA8A 2QWIA 4XTMA 4ISQA 3R4UA 3ZSMA 2LALA 1BQPA 1L7FA 1ULDA 4R9DA 3ZXLA 2BZDA 3H6JA 2EXKA 1A4GA 1BZWA 4XJUA 3VKFC 3WOGA 3AK0A 4JRAA 4XHXA 4Y22A 1A8DA 1WD4A 1BKZA 1BJQA 3AP6A 4FPEA 2PELA 1GKBA 6NN9A 2F11A 2AEQA 1DFQA 1N47A 2X9MA 2QWEA 2VUAA 4ISRA 2CYFA 5NN9A 4XJAA 1GZCA 1F9KA 4FOVA 1INXA 4AVSA 5JMCA 3N7JA 2EXJA 2VSMA 3D12A 5L73A 1LOFC 5T55A 3IM0A 3SH4A 5GZGA 5GZCA 4GWMA 5CA6A 2W39A 4DQAA 2R49A 3JU9A 5EXOA 1MS9A 1INHA 2DWRA 4MWUA 3N36A 2R1DA 5SV8A 1HQLA 1QDOA 4P9XA 4KS1A 2A3WA 1QGLA 1ULCA 3FUOA 1UL9A 3WHTA 1CN1A 4YFWA 1LENA 5H9SA 1Z4WA 1EUUA 2E53A 1KJLA 2A6WA 1Q8OA 4TZDA 1GSLA 1JXNA 2C9AA 1IKQA 1QNYA 5JDBA 1E8TA 1IVDA 1SBFA 4MC7A 3KM5A 1CIWA 2D3RA 3SISA 1SCSA 1V0FA 4BQ1A 2DVGA 5E88A 1V3CA 2C4LA 5JLVA 3VKLA 2D6MA 3INAA 4YG3A 1O4ZA 5LK5A 3R4SA 1Q8SA 1H30A 3BIWE 3HR9A 1G9DA 4NC5A 2EXHA 1GANA 1AXZA 1LGCA 4IQPA 4I30A 2WT0A 2P3KA 1KDMA 3DUIA 1LU1A 1AZDA 1N1VA 3AYDA 1Z4VA 1XQNA 3D5OA 5T50A 5DZGA 1UMZA 1UZZA 3H72A 2JKBA 5E8AA 3SALA 4AGRA 1ZM1A 1LHWA 4FP2A 1OQ1A 3SITA 1SLBA 4LBJA 1IKPA 1D2SA 2D6LX 2ZGRA 4M00A 2W5NA 1W6QA 1Z4XA 4XIOA 1YI7A 4Y1UA 3TI4A 1INVA 1NXD1 5DUWA 3BODA 2B7YA 4PBPA 4MWLA 3PMEA 1V3DA 5DZEA 4GZWA 3TICA 2ZA9A 1JOJA 4AWDA 1V6KA 1J1TA 2D3PA 1UPSA 2A5ZA 1PZ9A 1B9TA 3FBYA 3ZSKA 3K38A 2AYHA 3ZSJA 5HCAA 2GMEA 4PQ9A 3Q9OA 3POSA 2BQPA 2C5DA 2ZBJA 2LTNA 2VH9A 2FHRA 4LBLA 1G86A 2QWHA 1DYPA 2UWBA 1PZ7A 4K1IA 3IPVA 2ZGPA 4FOWA 2HU4A 4HZXA 4XXPA 4K1ZA 1QOSA 2D6OX 2F29A 4HZYA 3AP9A 1CVNA 2F13A 3OBRA 2YV8A 3TB0A 2RKCA 2XG3A 2DUPA 2CL2A 2ZGTA 2DVAA 4QN3A 4KBBA 2D6KA 3H71A 5GLZA 5HUNA 1W6MB 1FAYA 3M3OA 4UW4A 3K3AA 4W65A 1MS1A 4BPZA 1WLCA 5H9PA 2WT2A 4K21A 3FUQA 1AF9A 2WLQA 1GYKA 1SLTA 2VWDA 3ALXA 2V73A 3K36A 1X50A 4FPOB 3AYEA 1WCQA 2YZ4A 4JF7A 3MW4A 2ZMKA 1DGLA 1IVGA 4UW5A 5AVAA 1RITA 2I2SA 1WW7A 1S0IA 1MS0A 4FZHA 4YW5A 3B3QE 2E6VA 1Q8VA 4PBOA 2DU1A 4WVVA 1F8EA 4YLZA 2ZGNA 1IVBA 2P37A 3VUOA 3GVJA 3U4XA 3WDYA 1V6OA 5GJ6A 4WVWA 1IVCA 4MWQA 3O12A 4BLIA 5GLVA 4CPOA 2D6PA 2R16A 3WUDA 1NSBA 2E7QA 2HTVA 1PZ8A 1QOOA 1CJPA 1QU0A 5IK8A 2VW0A 3AP7A 4P9WA 3INBA 2VVZA 2A71A 4LBNA 2AUYA 4FPGA 4Y26A 3T2TA 5DG2A 1DQ0A 5DUXA 1GZ9A 2EF6A 1NCAN 3AJZA 3ZXFA 4YM1A 2ZMNA 1YRZA 1V6NA 4M4VA 2YA6A 3SH3A 1Z4ZA 2H0BA 1DQ1A 3M3CA 2ZGLA 1UAIA 1NMCA 3NV4A 1MS5A 1AX0A 2GDFA 3B9CA 4Q6KA 1JW6A 5EWSA 4QN7A 4HZZA 2B8HA 5T5LA 5T5OA 2A3XA 3WDWA 2SIMA 2ZGSA 2HT7A 3ZXKA 2ZMLA 1AXYA 4GDIA 4H55A 4YZ2A 1KRIA 3OPZA 2A6VA 1V0ZA 1QKQA 1RIRA 5HUKA 4BMBA 5CBLA 3WNXA 3ALWA 5DUVA 1INYA 5H9RA 5KXCA 4FQ4A 4C1WA 3AJYA 3I4IA 2F25A 1TEIA 5EYYA 2F28A 4MX0A 4K1YA 4Z8BA 3V0BA 1MS8A 2VU9A 2ZACA 1IOAA 3FLRA 4LBKA 3FLPA 2D44A 4DGRA 2EALA 3UJQA 3WCRA 1DIWA 2WQZC 4HANA 1FYUA 1CR7A 1F5FA 1LOEA 3MW3A 1LOCA 1W0OA 1GNZA 3ASIA 1IS6A 5FRAA 4L8QA 3GNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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