2Z2SB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
193
structure length
182
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRDPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RpoE, ECF SigE
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
total genus 40
structure length 182
sequence length 193
chains with identical sequence D, F, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2z2sB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2z2sB02
2PA7A 2OZJA 2QCSB 4PJYA 3ZDSA 3TNQA 1CAUB 3UKTA 2OA2A 4LULA 5J7MA 4IEUA 2OZ6A 5FPXA 1RGSA 2CV6A 1GQHA 3RPQA 2GU9A 3DV8A 4ONUA 4Z07A 2XL7A 3WW1A 5LEKA 4IEWA 4AQ6A 3TNPB 1IPKA 2IC1A 4Q29A 1OMIA 5FDBA 2GC3A 4B29A 3EBRA 3FWEA 5BY5A 5C8WA 3U0ZA 1QY4A 2UYAA 1DGRA 3FHIB 3I54A 4ZU4A 4I02A 1UCXA 4I2OA 2ETEA 3RYKA 2Q1ZB 4Z82A 4IEPA 3KGLA 4XFCA 1VR3A 3O14A 3H3UA 3E6BA 4BYYA 1UW8A 5I8TA 4HZFA 5FCCA 1ZZCA 1NE4A 4IEYA 2D40A 3H7JA 4JVAA 4JV4A 1VP6A 2N7GA 2K9ZA 5J48A 3EJKA 3E97A 5C6CA 2IXIA 3USSA 4HVRA 1CAUA 4HLTA 4HBNA 1LB2A 2EVXA 1SQ4A 1LRHA 1SFNA 1JUHA 1J58A 5LEJA 4CYDA 4XFGA 2H0VA 3KGZA 4ZU7A 3PLQA 4MGIE 3H1YA 5KHKA 4YARA 4GULA 2QJVA 1DGWA 1NE6A 1OFNA 3FX3A 3VHRA 3HIFA 2GZWA 3M3IA 4XF9A 3G7DA 2MPFA 2D93A 2IXCA 2XL9A 5KBFA 4QX5A 1RC6A 1O7FA 5I8YA 3QOPA 1X8EA 4XEZA 1ZVFA 1G6NA 4EV0A 3C3VA 3LA2A 1J3QA 3BCWA 4I09A 2HKXA 1O3RA 3D0JA 4AVBA 3CLPA 2UY9A 4KWJA 1O3QA 3B02A 4JTOA 4N9IA 5HI0A 2Z2SB 4LUKA 4IEOA 5FLHA 1PM7A 2PFWA 3M70A 3H1MA 4E2GA 3RNSA 2PAMA 3GBFA 1ZZ6A 1ZNPA 2BGCA 2IXJA 4XFIA 4I0BA 3U11A 5KHJA 4XETA 1X82A 2BYVE 4QM8A 1IPJA 2F4PA 1FI2A 1FT9A 3SCHA 3UKNA 1H1IA 1OI6A 2HJIA 2WC2A 2PTMA 4DINB 1V70A 2BEOA 2CAUA 2ZKLA 4LUMA 2K0GA 2C0ZA 1YFYA 3E5UA 4NQWB 3H1WA 2B8MA 4QMAA 3U10A 5FPZA 3NVCA 4XFHA 2EA7A 4D7TA 1H1MA 5CU1A 4OLLA 3FE5A 5F1RA 5JCTA 2UY8A 4YYOA 4KU7A 4KL1A 2CGPA 3H9AA 1QXRA 2E9QA 4IETA 5JSOA 4O9GA 4P9GA 1J3PA 5KHGA 1YLLA 4YNIA 2Z69A 1J1LA 1Y3TA 1XRUA 3HT1A 5BXXA 1HW5A 4KWLA 2XLFA 3CF6E 1U12A 4Q0QA 4LEJA 1QWRA 3S0MA 3NJZA 3KCCA 4JTNA 4Q0PA 3MDPA 4BIFA 1CAXB 1YFWA 5I0TA 1X8MA 2B5HA 1ZRRA 1EY2A 1GQGA 3PNAA 2FQPA 3MZHA 4BH9A 3IBMA 4Q0UA 1CAVB 4TLFA 3LZZA 5I8SA 4YSFA 1WA4A 3QACA 4O9EA 4EROA 3ST7A 1NXMA 5FQ0B 4I01A 4KWKA 2MNGA 5JSPA 2ATFA 3KMHA 1O5UA 4MUVA 4Q0SA 3NW4A 1WLTA 2VECA 5JSRA 1RL3A 4R52A 1LKNA 2Q4SA 3ES4A 2PHLA 4X6QB 1EPZA 3I7DA 3SXWA 4QGMA 4ORFA 1YFXA 3WW4A 3R6SA 4N9HA 3FJSA 2PYTA 3MYXA 4ZU5A 4HVQA 3IDCB 4Q0VA 5I0UA 3ES1A 2D5HA 1XE7A 4X6RB 5CVRA 1OD5A 4J1XA 1CAXA 1ZZ9A 5KHIA 3BPZA 4IESA 3N4MA 4E2QA 3PVBB 2OYZA 4FBFA 4IEQA 2QNKA 1CAVA 3E5QA 2VQAA 4PIYA 1CAWB 4UBGA 3JZVA 1ZRDA 2QDRA 3SHRA 3ROUA 5FQ0A 4WBBA 4IEXA 2B9UA 4XF0A 3CJXA 3RYPA 3CO2A 2ET7A 3H8UA 4XF1A 3E6CC 3I59B 4HSLA 4UXAA 4E2SA 3CEWA 1RTVA 3IDBB 4OFGA 1Q5OA 1Q3EA 4EWEA 5K8SA 1NZCA 4XFBA 5KHHA 4QXKA 2BNOA 3DL3A 3D82A 5E16A 4AXOA 5LRSA 5I0RA 3OD0A 1SEFA 5BV6A 2GC1A 4MH0E 4PIXA 4J1WA 5FLIA 5T3NA 1RUOA 2IXLA 4MZUA 1UIKA 3RYRA 2KXLA 4FAGA 5JAXA 1Q43A 5BPXA 1YUDA 2V09A 3HT2A 3HUGB 2H6BA 4K8FA 3CL1A 1CAWA 3H7YA 2Q0AA 4FT8A 2XHKA 3NSTA 3OGJA 1CX4A 4NVPA 1X7NA 5EFUA 1ZZBA 2FMYA 3OCPA 3I59A 4UBHA 5D1IA 2I45A 3FFQA 4F7ZA 1PMIA 3E5XA 2Q30A 4XFAA 1QXJA 5CADA 2XKOA 2GC2A 3S7IA 4WVZA 1UIJA 1EP0A 4EWAA 1I6XA 4HVOA 1ZX5A 4I3PA 4EWDA 2GC0A 1DZRA 3LWCA 3SCFA 3BALA 3BU7A 5I0SA 2XLAA 4IERA 2MHFA 4MX3A 4L2NA 2O1QA 2GAUA 3IIAA 4IEZA 4LTAA 3E6DA 2DCTA 2EAAA 1O3SA 4YRDA 1O4TA 3SCGA 1ZREA 4FAHA 1TQ5A 1ZZ8A 1EYBA 1J3RA 3ACLA 3UKVA 3EQEA 3H50A 4HN0A 5LRRA 1UPIA 4R8HA 4PIZA 4KU8A 4RD7A 3S7EA 5BUVA 4QM9A 4HSJA 4QGLA 3LAGA 2QVSB 5EZWA 2PAEA 3IWZA 2PQQA 3LA3A 3D0SA 1L3JA 4HN1A 4QGNA 1LR5A 3H3ZA 1ZRCA 5E1RA 3GYDA 4D7SA 4HMZA 1NYWA 2OPKA 3WW2A 3EHKA 2CAVA 3NKTA 2XLGA 1XE8A 1O5LA 2BNNA 2GH2A 2P17A 4AQ2A 1ZRFA 5I93A 3DN7A 2XGXA 4LA3A 4LA2A 4XFFA 2Y0OA 2BNMA 4H7LA 4XF3A 4I0AA 4MV2A 3HQXA 4A2UA 3EO6A 4MGKE 2PAKA 4BHPA 3LOIA 1J59A 2ET1A 2O8QA 5I91A 3BB6A 1ZZ7A 3RZZA 3LA7A 2ZCWA 4LLOA 1I5ZA 2XKPA 2IXKA 3DKWA 2H6CA 1WGPA 3KSCA 3WW3A 4META 5JR7B 2UYBA 2IXHA 1DZTA 4IEVA 2D5FA 1O3TA 1CGPA 1RUNA 4XF4A 4AVAA 4WZCA 3ETQA 3FZ3A 4L11A 5AVPA 3RDIA 3NL1A 2WFPA 4MGYE 1UD1A 1Y9QA 4AVCA 3L2HA 3OF1A 4F8AA 1YFUA 2PHDA 1FXZA 5FLJA 1YHFA 4MGZE 1YWKA 3ELNA 3MPBA 3OTFA 5J3UA 1VJ2A 3SMHA 2VPVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JQRA 3H36A 5JXJA 3BP8A 5FWEA 4WM8C 3RFRA 5J7MA 2V4AA 2ZHMA 1RGSA 4A3FJ 2JUCA 2WN3A 4AHYA 1UMHA 5BNOA 5GLWA 1RVF3 5DCMB 5T5OA 3TOAA 3J80Z 3KT4A 2ES3A 1XQNA 1CF7B 2RS53 2K4JA 1HQWA 2H8RA 3VFZA 2R6QA 3VDDA 4AYUA 3PM1A 3WG3A 5JZGA 2Q1ZB 2QA4I 5EF6A 3KGLA 2BW3A 1XMKA 2KL4A 5L9VA 2D98A 2ZGOA 3GNEA 4CCMA 5FCCA 2ZEXA 4FI9A 5K7PA 2BBYA 1XB4A 2V5DA 4BCUA 2OKXA 2JJ6A 5A7WB 3AYDA 3JBG1 3S16J 3EUHC 1LB2A 2B39A 2W39A 3LAJA 1OR7A 3M3CA 2M7BA 4CH7A 2L4AA 3BR3A 4GJZA 2HWF1 3LSHA 3HKZN 2Y69H 5FZLA 1VQ5I 2QJVA 2FNAA 3BG3A 1HXS1 4YZ4A 1UYZA 4F83A 2DPUA 3USUA 1MD0A 4WXCA 2H27A 3LIHA 5CVVA 4IL7A 1TWFJ 3ESWB 3HJEA 1RUH2 1NCRA 4U87A 2EXKA 2X6XA 1UYPA 2ICWG 4A6DA 4RGKA 4B1RA 4ARYA 1IW7F 1QOTA 5C8CC 5E79C 5KC6A 4UHTA 4AHZA 4U88A 5A3LA 4HNUA 1GQPA 5GPAA 1ZQ3P 4YVWC 4PQ9A 2MC3A 4C2TA 1S2KA 3TW6A 3K1MA 3LOCA 5EDNA 1JN2P 2G7HA 1FV2A 1QVUA 5H20A 5FB2A 5CVUA 1D8JA 2DK5A 5FPZA 3VBFA 3WEZA 3FLTA 3K10A 5JXGA 3CQOA 3OMYA 1Z7S1 2JG8A 5FKLA 5KHGA 1X2MA 3UJQA 4UOJA 1QNWA 2V6EA 2XQXA 4ET7A 1Q8SA 4BIFA 4GWJA 1TVGA 2JD9A 3VLBB 4LXLA 3PNAA 4M00A 4CXFA 1MNDA 3LSPA 1IAWA 3LZZA 2VTXA 2FMDA 5CEHA 3QD6A 4LBLA 1C1FA 5ICFA 4WM8A 2MNGA 3JQWA 1BVVA 3KMHA 1MGTA 4MUVA 1M4WA 2VECA 1H9WA 2EFOA 1GLHA 5LCWL 3OEAA 5LK5A 1WFXA 3O8HA 3GX4X 1OQDA 2RG4A 3EB7A 2ZGLA 5F6KA 1FAYA 3SKJE 1ZZ9A 1O8PA 4Y1YA 1AL23 3L2CA 1B59A 3OJBA 2FOKA 3B73A 1D8KA 1WCMJ 1ZARA 2QUFA 3BJ6A 5D6FA 1PZ7A 2HWD1 3EUHA 4H2AA 4Y7NJ 4MO3M 2VMGA 2A68F 3ZYHA 3K48A 2WY8Q 3UETA 3OYIA 3OYKA 4NRPA 2VZ1A 4QXHA 2WQZC 4IKFA 4PDWB 1RRJA 4LK6A 2JG9B 2LFBA 1C28A 1RI7A 1XMAA 1RUE3 5CQGA 5FZIA 2RR11 3RYRA 3RZDJ 4L92A 4URAA 2H6BA 2AHQA 1KJRA 1OLMA 1VBD3 3F3XA 5C8CA 3OUJA 2O14A 3NSTA 3KFWX 3OGJA 5LA2A 5CQEA 4C90A 1NA1C 2ZGKA 1TNSA 4PGGA 2X48A 4YVWA 1O7LA 1A8MA 3LEGA 1DP3A 4WZFA 3AYEA 4WVZA 2DN0A 1VALA 1NLQA 2PN5A 1TTYA 3LB9A 1R082 3IPVB 5ILSA 1FMD2 2MHFA 2VOKA 3IIAA 1HRV1 1OFCX 2YU3A 2DCTA 4A6SA 4YRDA 3ZFEC 1O4TA 1TQ5A 2HTSA 3ZKUA 3FXJA 2BW8A 4KNYA 4HPQA 1T0FC 4LKSA 2WNVC 4E4SA 4OMCA 2C4XA 1XGSA 3Q9VA 1DBNA 4BISA 4JX5A 3BGAA 3BTIA 4NWVA 3TEYA 1DP7P 2XRNA 4C1WA 2HWC1 4EGZA 2GMPA 1HCRA 1Y56A 2RV9A 1LEMA 1XE8A 2DFBA 5FMOL 2AS5F 1ZRFA 4RR3C 3ZXAC 2K5CA 3N7KA 2Z3YA 1B35B 2ADUA 2XG3A 1TC3C 4LKFA 3B69A 2AQEA 5K1YA 1RB8G 3ZYIB 3SDBA 1IUFA 3RPUA 4AM3A 2R30A 3H42B 4H55A 3IWFA 1ZZ7A 1U5TB 3IKTA 1H6YA 5E8AA 1RESA 3N35A 1W6NA 3WW3A 1K6YA 2DMPA 1YIJI 5C5TA 3PIGA 3UESA 1UXZA 4OAZA 4IHSA 1X1BA 1OUSA 3ERMA 2E1MC 3NL1A 3CMMA 2XR4A 2KRFA 1MS9A 5A3MA 1TWHJ 3DYPA 1T6BX 3NO8A 2VN2A 3SMHA 2VPVA 5IP6A 1L7RA 2PMHA 4LULA 1UNBA 2OZ6A 5T5PA 3PJYA 4IXLA 4CDWB 1LAJA 1FYKA 5ABJB 2JIGA 2PJRB 4AQ6A 3L2QA 3HRMA 5DUVA 1MSEC 1H2MA 2CUEA 1MQTC 4L9BA 1OLQA 1TNRA 5LGTA 2UYAA 2JX9A 3KF3A 4YIRX 2MBFA 1MIJA 2GMEA 4XJ8A 3RI9A 4LKEA 1G4DA 1NA1A 4MXWB 2CGOA 5FPBA 4XJZA 2B7EA 2JMWA 3VKMA 4A0YA 2PMZA 1X1AA 2OCCH 3MLJA 3GYHX 3L2UA 2XB5A 4QX7A 4NUBA 1SFNA 1OQEA 4BJTA 2V73A 1DQ0A 1AR92 2KDZA 4CDXC 1UJ8A 1OFNA 1F4HA 4HDVA 4Q26A 2K9LA 2XXZA 3LDRA 5DV5A 3ZFEA 4E70A 2HQAA 4KN7X 1EUUA 1LE8A 1HOMA 4CU9A 2CG4A 5I8YA 3VKLA 1T0FA 2ZJ2A 2WNVA 4LT5A 3AKZA 5D8AC 4XIOA 4I09A 1G9BA 3D0JA 4BZ4A 5CVIA 2LTNA 1AXZA 1A6CA 2L9LA 3TDUC 5JXHA 1ZBE3 2GM4A 4AHWA 2ZS6B 5IYYA 2MC4A 3RNSA 5EYYA 5GZDA 2Z16A 1YQ5A 3JTGA 4RR3A 1LHUA 1X82A 1YI2I 5T50A 4MQ9F 3UKNA 2R7DA 4ZS3A 1UN1A 4KBZA 2K0GA 1VBE3 4R9DA 2YDEA 4N43B 1VIWB 4AR2A 2OCEA 3TL4X 2B63J 2L01A 3H5NA 2MYSA 4K20A 5FYUA 3CF2A 2CMPA 2K9MA 1RJ7A 5FTTC 1BK0A 4G4FA 4BNCA 2VCAA 1ETWA 1V6NA 4L18B 1IOAA 4BLJA 1Q1HA 4V2VA 4FVVA 3WUCA 5FMOS 1HB4A 1K4SA 3MW2A 1RIRA 2AYHA 1JYCA 3ZXFA 2JDNA 3WUDA 3FMQA 2VOOA 5A7NA 1FMD3 1CWPA 1NXMA 1MJAA 3B9IA 3WD5A 1W8WA 1TG7A 5FIXA 3JSPA 4SLIA 1UB9A 2VBZA 3C1DA 4OIPF 1MQTA 1GZ9A 3I7DA 4ZZLA 5F04A 4XOPA 3NQHA 3QLQA 2VQTA 3POBA 1QJX3 3LPFA 5FYVA 5I0UA 2D5HA 3L2VA 5D8LB 4XBFA 3K4ZA 4QB6A 1P2FA 4DEVA 3B3QE 4AFAA 3ISPA 2OYZA 2ZBJA 2A6WA 2FZ1A 3K6GA 4PIYA 3AFGA 1Z7S2 2EBIA 1RNLA 4XF0A 4ARXA 5LY1A 3DPLC 2ET7A 3OYGA 2LSOA 4UXAA 2XV4S 2WUHA 2ZHNA 2CU5A 1PDNC 4CDXA 4IV3C 3BYWA 3LEKA 3GVAA 2PEXA 3KP3A 4NBQA 5FJHA 1DP0A 3LSKA 4ZXEA 2OX0A 2R7VA 4NIAA 3HN1A 2WBKA 5BV6A 3DU6A 1SFPA 1MVEA 1AYM2 5D8AA 1K42A 5IVFA 2BERA 1V6IA 4CZSA 4RAFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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