1WCSA

A mutant of trypanosoma rangeli sialidase displaying trans-sialidase activity
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
634
structure length
628
Chain Sequence
AASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYILVGSFNKTRNYWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDYNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQPDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPAACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Sialidase Mutant Displaying Trans-Sialidase Activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
total genus 151
structure length 628
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2004-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wcsA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1wcsA01
4GKYA 1HQWA 2UWAA 2SLIA 4GZXA 5DUWA 5SV8A 3BTAA 3AYAA 3INAA 1JYIA 1KJRA 1AF9A 4FQZA 1W6QB 1DQ1A 2A70A 2DTYA 1ZA4A 1IS4A 4R9DA 4BLJA 5GM0A 1SFYA 1QDCA 3B9CA 4J9TA 4KS1A 1NCCN 2I2SA 3W58A 1G8WA 4XBQA 3SALA 4M4NA 4FOVA 2FMDA 4XILA 1LOEA 5JOXA 1WLWA 5IK5A 1INYA 2B8HA 1YO8A 2QWEA 4LBNA 1W0PA 3WNXA 4Y24A 1LHVA 2EIGA 1U0AA 3D11A 4UF7A 1V6OA 3LSDA 3ZXLA 5EXOA 2YDTA 3VKLA 5EYXA 4KS5A 3ZSKA 2HT8A 4XBLA 2ZGKA 3CL0A 4HZWA 4YZ5A 4ZXKA 1SLLA 1GKBA 4GKXA 3KM5A 4XJ8A 1NCBN 1QOOA 4YM3A 1V6JA 1B9SA 2CY6A 4XXPA 3WUDA 3ZXJA 4M00A 1VCUA 3VKOA 4LBQB 2XZIA 1S0GA 2JE7A 1EUUA 3WDYA 4P9YA 2VVZA 5NN9A 2D6PA 4ITCA 1FYUA 1JOJA 4MWQA 4XJWA 4CPMA 2E53A 2P34A 4YZ3A 4YM1A 4MZAA 4AVVA 4C1WA 2ZHLA 2AH2A 4AYUA 3ZXFA 4HZYA 1Z0HA 4YFZA 3WCSA 5JDBA 3N36A 2D6NA 4X49A 1NCAN 2NZ9A 1SLAA 3A71A 5GZEA 3UK9A 3NN9A 3RSJA 3N7KA 2NN8A 2D6KA 2GNMA 2HT5A 1AX2A 4KS2A 2JE9A 3BIWE 4WA4A 2EF6A 1F8BA 1HDKA 4ATEA 4BM8A 2D3PA 4X4AA 2F26A 1C1LA 1JUIA 1QGLA 1MS3A 1LGNA 3IPVA 4UW5A 1W6PB 1SLIA 4BPZA 2QWGA 2ZGMA 5GZGA 4M4UA 1B9TA 4YW2A 3O12A 4BMBA 4M4VA 5IT6A 1V2IA 2DVDA 4CPYA 5F9TA 3ZYRA 5GZCA 5EYYA 1G9BA 3K37A 5GZFA 3OGGA 3V65A 2PELA 4AVSA 1V00A 3OBRA 2F24A 3TIBA 1SBEA 4YGEA 3OJBA 3AZXA 3K39A 4M3CE 4FOQA 4K20A 2A6ZA 2DVGA 3NSSA 3WDTA 2Q5TA 4MJUA 3U4XA 3V0AA 4GJTA 1YXWA 4Q8LA 4HIZA 2NMOA 3AP5A 3POWA 3CYEA 2EALA 3IMNA 3UJOA 3ALXA 2ENRA 2EXHA 1MVQA 1GBGA 1SCSA 1ULFA 4XJQA 4QN5A 1J1TA 1ULDA 5GLUA 5DUUA 1DQ6A 1W6QA 1ULGA 4LBOA 1CESA 2W38A 4MYEA 2F27A 2EAKA 1CJPA 2CNAA 1LESA 4HL0A 3AXEA 5H9RA 1A8DA 4WA3A 4AGGA 2AENA 1WCSA 1GLHA 4FP3A 1N3PA 1B9VA 4MWYA 3O0XA 4CTEA 1HQLA 1GSLA 3LCPA 1EURA 4QN4A 2D7FA 3AX4A 2VW0A 4DQAA 4JC1A 4XYXA 3B3QE 2P3IA 5DZFA 1LU2A 2F11A 2GALA 3W59A 2PHXA 1CVNA 1AX1A 4WZFA 4UW6A 5IUQA 5CAZA 2YA6A 3IN9A 2QWAA 3AJZA 3WUCA 3WZ1A 3O0WA 4Q26A 2ZGNA 5DZGA 1USXA 5HCBA 1FATA 1PZ9A 1INFA 1MS4A 2GNDA 4LBMA 2E7TA 1Z50A 4ISQA 4ISRA 1XQNA 3ZSMA 1FX5A 1O4ZA 3ZPYA 1QNWA 4WA5A 4UW3A 1NSBA 2ZGLA 3WG1A 4PQ9A 1S0IA 1A4GA 1WBFA 5EWSA 4LBQA 1VAMA 3FLTA 1W8OA 1V6NA 3UL2A 3T1MA 5T54A 3WCRA 1E8UA 2ZKNA 1UZYA 2WJSA 2VK7A 2D6LX 2XG3A 3WHTA 1INXA 1W1XA 1BKZA 2EXKA 4Y1UA 1L7HA 4FPHA 1S0DA 5B2CA 4FQ4A 2WQZC 3BODA 4ATFA 2PHRA 2ZHNA 2W5OA 3T2TA 3NWKA 2QWJA 2NYYA 4NCSA 1LU1A 2A3XA 2OW4A 1IS3A 5DG2A 4MWRA 1A14N 2WT0A 4UW4A 1LODA 1E8TA 2JJ6A 4GZWA 4YG6A 4QNPA 1JYCA 3IPVB 1NMAN 5DUVA 1WBLA 4XTMA 3USUA 2CWSA 4PBOA 1FAYA 2PHFA 3BEQA 1Z4XA 4K1YA 1V3BA 1W6PA 3PVEA 2JD4A 2WT1A 5T5JA 1W6NB 3NV2A 4BQ1A 1Y7BA 1LJ7A 1N1TA 4HZZA 2W5NA 2YDPA 4MWJA 1LHNA 1A78A 2ZBJA 2YA4A 4P9XA 4Y26A 2DU1A 3SILA 1DQ5A 2V5YA 2VW1A 2WLQA 4GXLA 4NOTA 1JW6A 5HCFA 5L73A 2UWBA 4PBPA 4M3CF 4B7JA 2D6MA 1QOTA 2UU8A 3VKNA 4AGVA 1QKQA 1Q8OA 2A6VA 4FPGA 1H9PA 1O4YA 2W68A 3L2YA 2VH9A 4AWDA 3OYWB 1LGCA 3ZXKA 4GZTA 5H9PA 1DILA 4WVVA 3WG4A 1INWA 4CPLA 5DG1A 1XOGA 3AYEA 3I8TA 1MS1A 2F0ZA 2ZACA 4YLZA 1V0EA 1D0HA 4ZKTB 2AGSA 1DQ4A 4GEZA 3WDVA 1IS5A 2QWFA 2ZGUA 4GZOA 1ULEA 2ZGOA 4JRAA 1PZ7A 2V73A 4YG3A 1SBFA 2VSKA 1IS6A 5T50A 1LOFC 2WSVA 1FV2A 1AZDA 1LOBA 1SCRA 1F8CA 3FLPA 1BZWA 1UX6A 3B69A 2XCYA 5GLWA 4LBKA 5T5PA 3GVLA 4OZXA 4FOYA 1VLNA 2ZHMA 2W52A 3DGTA 3FBYA 2DUOA 1W20A 2R16A 1F8EA 2QWHA 4FVVA 2AEPA 1JHNA 2QWCA 2YXSA 1SBDA 2HTQA 2GN7A 4FPJA 4MC7A 1YI7A 3HN1A 1IVGA 4QN7A 3HMYA 2VWDA 1ZM1A 4Q2FA 1N3OA 2AEQA 5JOZA 3K36A 2P3KA 1LENA 4YW1A 1IOAA 3Q9OA 4SLIA 1GNHA 3OY8B 3NV1A 1EPWA 1MS9A 2D44A 4HZXA 3WOGA 4AVTA 4KS4A 2CL2A 4RA0A 4XJAA 2JECA 5GJ6A 1GYKA 5JMCA 3WG2A 1GANA 3GNEA 4R9BA 2ZMNA 1SNTA 1CR7A 2EXIA 5DUXA 3SH3A 2F29A 1INGA 2ZGSA 1SLCA 5KXCA 1NNBA 2P3JA 3FLRA 1G86A 1F8DA 2ARBA 2AYHA 2HYKA 1KDMA 4I00A 4F83A 4Y1ZA 1MR5A 2C5DA 1RITA 3SH4A 3RMXA 3USUB 2LALA 1V6LA 4W65A 4XE9A 1Q8PA 4GDIA 3NV3A 4FPLA 5DZEA 1WD4A 4FPEA 1OQ1A 3TI6A 3M3EA 3GVJA 2TEPA 1V0ZA 2CMLA 3WV6A 2WT2A 1URXA 1MZ5A 4C1XA 1W6NA 5IK4A 4XHXA 1LHOA 1YIFA 4B7RA 1SO7A 4FPYA 2NMNA 2ZMLA 1VAVA 2B7YA 3WHUA 4K1JA 1NN2A 4DPNA 1ONAA 2GN3A 1N47A 1OFSA 4Y1XA 1LTEA 3PMEA 2BZDA 5IK7A 5T52A 1YYNA 1VALA 5H9SA 1S0FA 4TYSA 1MACA 5AVAA 3AFKA 5E8AA 5CB7A 4U36A 3N7JA 4NC5A 1A3KA 3QLQA 4XBNA 2HTUA 1QNYA 1NMBN 3MW3A 1S0BA 2F13A 3FUOA 3OYWA 1CONA 3N7MA 1MS0A 3W09A 3TI5A 5IK8A 4Y22A 4MWWA 2A5ZA 3MW2A 1SLBA 3AP9A 2YA5A 4GA9A 4QN6A 2D3RA 3SANA 1LOGA 1W21A 4FZHA 2DWRA 1GNZA 4HZVA 1OKQA 4XJZA 2BATA 3N35A 1LCLA 1EUSA 2R0HA 2P37A 3AYDA 3FFZA 2ZGPA 3LSEA 4PCRA 4WVWA 2GNBA 2VK6A 1S0JA 1V6IA 1WD3A 1KDKA 2SILA 1DFQA 4YGBA 1TEIA 4MX0A 2DU0A 2Z42A 3C2UA 2GMMA 4FPOB 1XOEA 4H55A 3O0VA 5HUGA 2F25A 3WDXA 1DYKA 2F28A 4YZ4A 4CRQA 2CYFA 4BOWA 4GWNA 4GDJA 3R05A 1L7FA 6NN9A 3ZSJA 4Q1RA 2FHRA 5HX0A 1QOSA 4Y20A 5JVVA 2F10A 3K38A 1GZWB 1Z4WA 3OY8A 1PZ8A 3M3CA 4M01A 1CQ9A 2A6WA 1WLCA 1MS8A 4BBWA 1FV3A 3AK0A 5GLTA 3PVOA 4QN3A 2R1BA 2EXJA 1DHKB 2NP0A 1UPSA 2W20A 1UN1A 1FNYA 2X9MA 4YW3A 1DLLA 4XZPA 4WEGA 4FPCA 1LEMA 1V6KA 1LOCA 1VCJA 4XJ9A 4GZQA 2ES3A 1DBNA 1AJOA 1IKQA 1NNCA 2ZABA 3RQ0A 3WDUA 4DFSA 1F5FA 3RMYA 4CPOA 3GALA 4M3CA 1E8VA 4YGCA 3POYA 2YA7A 1G9CA 5HCAA 3R4UA 1GZ9A 2C4LA 1ENRA 2HTVA 3ALWA 4XOGA 2ZGQA 3D12A 2WSUA 1DIMA 3ZXEA 5F5QA 1INVA 3TI4A 2DTWA 1AXZA 1JBCA 1UZZA 4K1KA 1MZ6A 3IM0A 2BQPA 3O9KA 1KQRA 3JUUA 3TI3A 3H72A 4B7MA 3V0BB 4MWLA 3PJQA 3VV1A 4I30A 1G7YA 1UMZA 1BJQA 2VU9A 2XZKA 4WV8A 2A71A 3MEPA 1EUTA 1MS5A 4R9CA 1W8NA 2ZA9A 1NXD1 2DV9A 4L8QA 2D43A 5DXDA 4Q8KA 4NO4A 2VSMA 4PF5A 4X6KA 4XIOA 4JCKA 3ZVXA 4TZDA 1S0CA 1FNZA 5HUNA 1F31A 2E51A 2YV8A 2HTYA 2OUHA 3KQRA 5HUKA 3WG3A 3APBA 1L7GA 3B00A 3B01A 4Y22B 1RIRA 1Q56A 4MWVA 2JKBA 2WKKA 2QWBA 1DQ2A 1Z4YA 1W6OB 3N7LA 3A72A 1N1SA 3NV4A 4K1ZA 3TAYA 4D69A 2YA8A 3MPPG 1CIWA 2R0FA 1F9KA 3T1EA 1WW7A 4DRVA 5LK5A 4YFWA 4YG0A 1AVBA 4XMIA 4Q6KA 3FUQA 1UL9A 2AUYA 2CWMA 4YZ1A 5GZDA 2PHTA 3AP4A 3M3QA 1HKDA 3I4IA 2DVFA 2QWKA 1LOAA 1C4RA 2R49A 3O5SA 4KBBA 1GICA 3JU9A 1IVFA 1DQ0A 3ATGA 1WUVA 3M1HA 3TI8A 2VK5A 1IVEA 3BOPA 3A0KA 1V3EA 1AXYA 4K1IA 1UAIA 1IVCA 2GDFA 1LHUA 3ILRA 4R9AA 3INBA 1QDOA 1YRZA 4Y20B 3SLIA 5GLZA 5FREA 3AJYA 1Z78A 2F12A 3HR9A 4FPFA 7NN9A 2OVUA 1GZWA 2HU0A 4MWXA 2ZHKA 4FP2A 4GZSA 2DURA 3ZYPA 3DUIA 3V64A 1X50A 4B7NA 2GMPA 3AP7A 1V0FA 4X47A 1WCQA 2W39A 2YZ4A 4XJUA 2KM2A 4XMAA 4U2AA 1UKGA 2YROA 1BJIA 1I1EA 2ZGRA 3ZSLA 2R1DA 1V3DA 1IKPA 2RKCA 4M3CB 3B7EA 4JF7A 1WW4A 2PHWA 2BERA 2VW2A 4XJRA 2P2KA 4H53A 2HU4A 4MWUA 4Q27A 1CN1A 1R1ZA 4ASMB 1N1VA 1MVEA 1G9FA 1S0EA 1V3CA 1VIWB 1N1YA 5KXEA 3R4SA 1G9AA 1LOFA 3VKMA 1W6MA 1NNAA 3GVKA 3D5OA 1AXKA 1DGLA 4YM0A 1BYHA 1N3QA 1ENSA 2DVAA 3K3AA 4Q1PA 3WDWA 3POSA 4LBQD 5E88A 2AREA 2JDZA 2ZB6A 3TIAA 3SH5A 4BMEA 2VY0A 3V0BA 2SIMA 1SACA 4FJ6A 4XIKA 4YW4A 4K1HA 2QWIA 2A3WA 2NM1A 4YM2A 3RRDA 2CTVA 4XTPA 3M2MA 1LEDA 4K3YA 3WLUA 4DRRA 1C57A 4MZEA 5GALA 3SNMA 1CPMA 3D4KA 3VUOA 3ILFA 2C9AA 1A4QA 3OBTA 3JU4A 1B09A 3UJQA 1CPNA 4FOWA 3N3HA 1WW5A 4GB1A 2A75A 4IQPA 2OUJA 1I3HA 3RG0A 1DYPA 3ASIA 1DZQA 3CNAA 3AZWA 3A0NA 1BXHA 3M3OA 5JYYA 3SITA 5JOYA 1H9WA 2GMEA 2HT7A 4CZSA 4WEFA 2VXRA 1D2SA 1Q8QA 3AYCA 5B2DA 2YMZA 1QMJA 1W6OA 5CBLA 1SLTA 3T1LA 2GNTA 5M1ZA 4GZPA 1JXNA 4KS3A 2QWDA 2W08A 1V6MA 1IVDA 4D8SA 1QU0A 5T5LA 5GLVA 2XB6C 4XXAA 2DYCA 4M3MA 2A3YA 3PVNA 1NLSA 1LECA 3H73A 2G4IA 2ZZJA 4BLIA 5BYNA 3AZVA 4MJVA 4P9WA 1S1AA 2ERFA 4P14A 4B7QA 4YW5A 1MWEA 1WW6A 1W0OA 4GWMA 4XHBA 3SISA 3H71A 2PHUA 1Z4ZA 5CNAA 4LBJA 1LULA 4XDQA 4Z8BA 1ULCA 2A7AA 2ZAAA 4Y1VA 4GALA 4DS0A 2XZJA 4DGRA 3QCWA 3TICA 3H0OA 2RHPA 1IVBA 5E89A 1INHA 3AXDA 1KITA 3AZYA 2AR6A 3WVJA 5HUMA 2HTWA 5JOWA 2ZGTA 1NCDN 5CA6A 1LHWA 4CPNA 3O9JA 2DUPA 4RL7A 3ILNA 3RS6A 1JN2P 3D6EA 1DIWA 2E7QA 3MW4A 4NN9A 2ZMKA 1GV9A 1USRA 1GZCA 4YZ2A 4HANA 2UURA 3VKFC 1WLDA 1KRIA 2UWCA 4FPKA 4AGRA 1NSCA 3OPZA 5H9QA 2BF6A 1Q8VA 2A6XA 5T55A 4FVKA 2ZB5A 5T5OA 2VUAA 2DVBA 1W6MB 1Z4VA 2HTRA 1BQPA 5KXDA 5FRAA 2LTNA 2YY1A 1APNA 3ENRA 4K21A 4LBLA 2A6YA 1AJKA 2D3SA 1G9DA 2SBAA 1LGBA 1RINA 3CKZA 1HLCA 4Y1YA 3A4UA 4H52A 3IKWA 1QF3A 3TB0A 4CPZA 4YGDA 5JLVA 2E6VA 1AX0A 3AZZA 3CL2A 2C4AA 1NMCA 5KXBA 3H6JA 1NSDA 1C1FA 1ENQA 2WNEA 1Q8SA 2ARXA 2D6OX 1KJLA 1H30A 3AP6A 3V0AB 2H0BA 2DUQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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