The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
116
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structure length |
116
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Chain Sequence |
MVSTLPPCPQCNSEYTYEDGALLVCPECAHEWSPNEAATASDDGKVIKDSVGNVLQDGDTITVIKDLKVKGSSLVVKVGTKVKNIRLVDGDHDIDCKIDGIGAMKLKSEFVRKVGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Sequence Specific Resonance Assignment of a Hypothetical Protein PA0128 from Pseudomonas Aeruginosa
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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source organism |
Pseudomonas aeruginosa pao1
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molecule keywords |
phnA-like protein pa0128
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total genus |
15
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structure length |
116
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sequence length |
116
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2005-08-03 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF03831 | PhnA | PhnA domain |
A | PF08274 | PhnA_Zn_Ribbon | PhnA Zinc-Ribbon |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Beta | Single Sheet | N-terminal domain of TfIIb | N-terminal domain of TfIIb | ||
Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4NBA A; 1GBR A; 1RI9 A; 3C0C A; 1QWF A; 4HCK A; 3M3Y I; 2H8H A; 1U5S A; 2LJ1 A; 1DL6 A; 1SRL A; 1V1C A; 1UJ0 A; 2YUQ A; 3I9Q A; 3FKI I; 1GCQ A; 1WXB A; 1WX6 A; 2J05 A; 2RN8 A; 4LN2 A; 1JQQ A; 1X6B A; 2F2V A; 4OMQ A; 5GJW B; 1WXT A; 1TUD A; 3PO2 I; 2PK7 A; 2LQW A; 2K9G A; 1AVZ C; 2FEI A; 2KT8 A; 3S1N I; 1UUE A; 4A93 I; 2CSI A; 3VS0 A; 2PNI A; 2ED0 A; 1K0S A; 2AKL A; 2JMA A; 2NUZ A; 3EG0 A; 4CC3 A; 1WCM I; 2KYM A; 2F2X A; 1X43 A; 2K7A A; 1TWA I; 3VRY A; 1TUC A; 4F16 A; 4NOZ A; 5EC7 A; 3NGP A; 1Y1V I; 1QYP A; 4OMM A; 4QTT A; 2NVT I; 1GCP A; 2FRW A; 3EHQ A; 2JXB A; 1X6G A; 1VYT A; 1I3Q I; 2E2J I; 1M27 C; 1GL5 A; 2RBL A; 2EGA A; 3NHN A; 3VMG A; 3S1M I; 3EG1 A; 4J9I A; 4EIK A; 2DRM A; 5C3E I; 3GTM S; 1JEG A; 2JR6 A; 5IXF A; 1K76 A; 2L3Q A; 2CSQ A; 4Y52 I; 2FPD A; 3M0R A; 1BBZ A; 3FJ5 A; 2DM1 A; 5FWC A; 2KBT A; 2JTE A; 1Z9Z A; 2DL3 A; 4JJC A; 2D0N A; 1W6X A; 2JMC A; 1TWH I; 2A37 A; 2CT3 A; 3PO3 S; 4J9C A; 3VRZ A; 2XMF A; 1RUW A; 2ED1 A; 1S1N A; 2FRY A; 1NM7 A; 2DA9 A; 2BZY A; 1ABQ A; 4J9D A; 5L23 A; 2RNA A; 1PWT A; 4GBQ A; 4HXJ A; 1TFI A; 3S14 I; 4DEX A; 4LUE A; 4BY1 I; 2YUN A; 1WXU A; 4KRT A; 4AG2 C; 2E2H I; 1SHG A; 2EKH A; 1ZLM A; 4OMN A; 4NB9 A; 2YDL A; 3M0Q A; 2MCN A; 4CC2 A; 1AWX A; 4RTY A; 3S2H I; 3VS5 A; 2AZV A; 2CUB A; 3GKQ A; 4BBR I; 1LQL A; 1SPK A; 1Z9Q A; 2D8J A; 3S1Q I; 4XX2 A; 1NLP C; 4A3D I; 2W10 A; 2JNY A; 1NG2 A; 2JT4 A; 1IO6 A; 2NVX I; 2ROL A; 1EFN A; 1AZE A; 2LZ6 B; 2YUO A; 1JXM A; 3ESW A; 2LP5 A; 3VS4 A; 4A3K I; 4Z8A A; 2AZS A; 1BU1 A; 3TSW A; 1H92 A; 3D6W A; 1KJW A; 5IP7 I; 4A3M I; 1U06 A; 2VVK A; 1NYF A; 1SSH A; 4LNP A; 3GTG I; 2RMO A; 3O5Z A; 4RTZ A; 4AFQ C; 1RLQ C; 3VMH A; 2PTK A; 4NBF A; 4JJD A; 4FSS A; 2EPD A; 2R93 I; 4JZ4 A; 3HOY I; 1KFZ A; 1X2Q A; 2QDL A; 4Z88 A; 2CUD A; 4DEY A; 2DF6 A; 3S15 I; 2JA8 I; 5I22 A; 1USP B; 2J6A A; 2KRN A; 2KGT A; 1WLP B; 1GCQ C; 3S1R I; 5IH2 A; 3VS1 A; 2J6K A; 2DIL A; 1ZBJ A; 4NBG A; 2KEA A; 3M4O I; 4CC7 A; 1ZUY A; 2DBM A; 1OPK A; 4J9B A; 5GJV B; 4QTU A; 2GGR A; 4ZNX A; 2L2P A; 3CQZ I; 1VYU A; 2KXC A; 1VLA A; 2I0N A; 1W1F A; 2ROT A; 2DL5 A; 2J06 A; 1FMK A; 3VS7 A; 5FW9 A; 3M0T A; 2BZX A; 3GTL I; 2O31 A; 1CKA A; 1UDL A; 2EYY A; 2RQW A; 2KRO A; 1L1O C; 1USP A; 3I07 A; 1AOJ A; 1XOV A; 3M0S A; 4QT7 A; 1SHF A; 2CDT A; 3UA6 A; 2D8H A; 3I4M I; 1WFW A; 3REA B; 2HCK A; 1LCK A; 3ULR B; 1GBQ A; 3GTJ I; 3H0I A; 4LE9 A; 4A63 B; 2JS2 A; 1OV3 A; 1UEC A; 2GNC A; 4NBD A; 1OPL A; 2VWF A; 1MUZ A; 3I5S A; 2A08 A; 1HD3 A; 1Y57 A; 2DL4 A; 2P3Y A; 1HSQ A; 1QWE A; 2JA7 I; 3GTM I; 2D1X A; 4F17 A; 2EBP A; 1T3L A; 2KE9 A; 4J9F A; 2JA5 I; 2DE0 X; 4HVW A; 1YCS B; 1ABO A; 2SEM A; 2VUM I; 2J6F A; 1RLP C; 1SRM A; 1UGV A; 3VS3 A; 3H0F A; 2DLP A; 5C44 I; 2HEQ A; 2LX7 A; 4J9G A; 4K11 A; 3H3V J; 1T0H A; 2E5K A; 2O2O A; 2GTO A; 1M3C A; 2JM9 A; 3PO3 I; 2EVR A; 1UJY A; 5CM2 M; 1ZB8 A; 2DMO A; 3HOW I; 1E6G A; 2KPI A; 1ZX6 A; 1X3Z A; 3A98 A; 2BJO A; 1PKT A; 2ENM A; 3TSZ A; 2B63 I; 4RTU A; 1U3O A; 1Y0M A; 2PZ1 A; 4NB8 A; 2HBW A; 1YUA A; 1TWC I; 2R92 I; 3I4N I; 1QKW A; 4OMP A; 1AWW A; 1SFO I; 2C0O A; 2NWM A; 1CSK A; 2DYB A; 1G83 A; 2W0Z A; 1WI7 A; 2FPF A; 2FPE A; 3CQT A; 1E6H A; 2KRM A; 1AEY A; 1PKS A; 4MH4 A; 1AZG B; 1X2K A; 1VYV A; 4A3E I; 1QCF A; 4CC4 B; 2DX1 A; 4OML A; 1B07 A; 2M51 A; 2KT1 A; 2RQU A; 2VKN A; 4WCI A; 1TWG I; 2GBQ A; 2M0Y A; 2LCS A; 2EYW A; 3U50 C; 1AD5 A; 3VMI A; 2P4R A; 4JJB A; 1ML8 A; 1N5Z A; 2V1R A; 1M30 A; 1TG0 A; 4RTX A; 1Y1W I; 3EER A; 3JV3 A; 1AWO A; 1G2B A; 3HOU I; 2EGE A; 1OEB A; 2E2I I; 1B3Q A; 2ESW A; 4HVV A; 2EGC A; 1CKB A; 1PHT A; 2L3P A; 3RBB B; 4NBB A; 3GTK I; 2EQI A; 2DRK A; 2DE7 A; 1QKX A; 2LJ0 A; 1NEB A; 2OAW A; 3U23 A; 1UG1 A; 3I35 A; 4X1V A; 1WW9 A; 2JM8 A; 3NPF A; 2KYB A; 3RNJ A; 1N2F A; 2G6F X; 4LUD A; 3UAT A; 5IXB A; 1MV3 A; 3EG2 A; 1MV0 B; 2J7I A; 2X3W D; 3GTQ I; 5C4J I; 2RPN A; 2X3X D; 3LUS A; 2GQI A; 1JXO A; 2K2M A; 1WYX A; 1K1Z A; 3HOX I; 2FO0 A; 4OMO A; 1BK2 A; 4A3C I; 3QWX X; 1WIE A; 2A36 A; 3UA7 A; 1UHC A; 2CH4 W; 2L0A A; 2V1Q A; 1I0C A; 3VB9 A; 1H3H A; 2K79 A; 3I5R A; 1E7O A; 3S2D I; 2K5R A; 1I1J A; 1K83 I; 4AFS C; 1UTI A; 3S16 I; 1PRM C; 3EHR A; 3Q87 A; 2GTJ A; 3PVQ A; 4J9H A; 3ZL7 C; 1NEG A; 4RTT A; 1JU5 C; 4M4Z A; 1WA7 A; 2FG0 A; 3KFV A; 4RUG A; 2O9V A; 1VA7 A; 1PFT A; 2LMJ A; 2AKK A; 4NBC A; 1YN8 A; 2DL8 A; 4A3J I; 2RQV A; 4E6R A; 4Y92 A; 4NBE A; 3GTO I; 2C0T A; 1M3A A; 2CH4 A; 2DJQ A; 2LJ3 A; 2DE5 A; 2J6O A; 3SEM A; 2ECZ A; 1I50 I; 4R0K A; 2JW4 A; 3TVT A; 1M8M A; 1X27 A; 1NYG A; 3H0G I; 2RQT A; 1YWP A; 2BTT A; 3GTP I; 1FYN A; 2EYX A; 2YT6 A; 1Y1V S; 4AG1 C; 3PE0 A; 3RZO I; 1YP5 A; 2O9S A; 1HJD A; 1JO8 A; 1J3T A; 1UE9 A; 2AK5 A; 3VS2 A; 3VS6 A; 5FLM I; 2DBK A; 5FWB A; 4AFZ C; 1GRI A; 5IP9 I; 3EGU A; 4JPB W; 2C0I A; 5IHN A; 1PNJ A; 1W70 A; 4GLM A; 1WDX A; 2R7Z I; 2EW3 A; 1PRL C; 1ZSG A; 1KSW A; 1K0X A; 1YNZ A; 3SHW A; 1I6H I; 2DL7 A; 1T0J A; 2F2W A; 1TWF I; 4A3I I; 2KRS A; 2NVQ I; 2DE6 A; 4Y7N I; 2JS4 A; 2NVY I; 2O88 A; 4BBS I; 3H0H A; 1ARK A; 1ZUK A; 2MOX A; 3HOV I; 4A3L I; 3RZD I; 4F14 A; 1ZB9 A; 1H8K A; 4HVU A; 3K7A I; 1SEM A; 3GBQ A; 5HCK A; 3REB B; 4A3G I; 1X3W A; 2KR3 A; 3LH5 A; 2A28 A; 3NMZ C; 3UF4 A; 4A3F I; 2YUP A; 3M0P A; 1X69 A; 1I07 A; 1RO4 A; 2HSP A; 2ABL A; 2YSQ A; 3H41 A; 3R6N A; 2RF0 A; 2HDA A; 4RTV A; 1T3S A; 1GFD A; 5I11 A; 2JS0 A; 1K4U S; 2MIO A; 1A0N B; 3IQL A; 1K9A A; 4J9E A; 2LNH B; 2SRC A; 4A3B I; 1RLY A; 4D8D A; 1YWO A; 1UHF A; 1QLY A; 2F4M A; 2K3B A; 2LQN A; 2JA6 I; 1UFF A; 2F4O A; 2BZ8 A; 2CRE A; 2DNU A; 2K6D A; 2RQR A; 4RTW A; 1ZUU A; 1NLO C; 2EYZ A; 1OOT A; 4Z89 A; 4BY7 I; 1M3B A; 1KIK A; 1R9T I; 2IIM A; 5C4X I; 4NBH A; 4IIO A; 4AFU C; 1AWJ A; 4JZ3 A; 2L3S A; 4BXX I; 5IHI A; 2DVJ A; 3EG3 A; 4X6A I; 2KXD A; 4ORZ A; 3GCF A; 2CT4 A; 1NUI A; 5ECA A; 2OJ2 A; 3PVL A; 2HF1 A; 1BB9 A; 2KNB B; 5IHK A; 4IIM A; 3M0U A; 4D8K A; 3S17 I; 3QWY A; 3THK A; 3HOZ I; 2B86 A; 1GFC A; 4ESR A; 2YU9 I; 2OI3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4NBA A; 3C0C A; 2C06 A; 1QWF A; 2FYK A; 1YHQ T; 1V1C A; 3ZFJ A; 3I9Q A; 1WXB A; 5GMK h; 2JJ9 A; 4A4G A; 4F7U B; 3CCQ A; 2EJG A; 2J05 A; 4HT9 A; 1VQO Z; 5IT9 b; 3CCU T; 3CCM T; 2NUP A; 3EG9 B; 3RER A; 5GAM j; 3PO2 I; 2KQW A; 3URG A; 2K9G A; 5GAO m; 1UGS B; 1UUE A; 4ATO A; 1RAA B; 2CGH A; 2PNI A; 2ED0 A; 2F5K A; 1K0S A; 5I21 A; 2LRQ A; 4HH4 A; 2F2X A; 3LX7 A; 2K5L A; 4HCZ A; 3I55 T; 2ZPF B; 2NLU A; 2E3I A; 1B7T A; 5LJ3 e; 4M78 C; 3EAE A; 1Q86 R; 4OMM A; 3BDU A; 3GLX A; 1N6A A; 2QXF A; 3HP9 A; 1C1A A; 3HRU A; 5CQX A; 2YWW A; 3JCM h; 4RG8 A; 4OB1 B; 2EGA A; 3EG1 A; 4J9I A; 4BDZ A; 4XTW A; 5C3E I; 2OTJ A; 4E7Z A; 1VQ7 1; 2V3V A; 5KCO A; 4Y52 I; 1YJW A; 2CP2 A; 3EGD A; 1VQ4 A; 1BBZ A; 3FJ5 A; 1NPP A; 5LJ3 j; 3SWN C; 1M90 U; 3JB9 H; 1VQP 1; 5FWC A; 3CCL Q; 1QVG S; 1Z9Z A; 4JJC A; 2R58 A; 2D0N A; 2WSE E; 1MGQ A; 2JMC A; 3RKY A; 2VPW A; 2CT3 A; 4J9C A; 3VRZ A; 2XMF A; 3V8K A; 5GAM d; 1JWH C; 1M1K C; 3OYN A; 3CME Z; 2DA9 A; 2BZY A; 1M1K 1; 2RNA A; 1PWT A; 4GBQ A; 4HXJ A; 1N8R U; 5D6Y A; 4LXC A; 4DA4 A; 1D0X A; 1AT1 B; 2E64 A; 1SHG A; 2PVD B; 4PKC C; 3OY9 A; 3CC4 1; 4ELY C; 4HCC A; 4NB9 A; 2RHI A; 4GLK A; 3M0Q A; 5AYF A; 4CC2 A; 1YI2 Q; 1ZH1 A; 4XTY A; 1AWX A; 3VS5 A; 4IUV A; 5GAO l; 4BBR I; 2EYQ A; 1LQL A; 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4C92 A; 1SHF A; 4PJL A; 3OYH A; 2Z0W A; 4DBF A; 4QVD A; 3CXC S; 2GTH A; 3REA B; 4J7I A; 1VQN Z; 4PJO D; 1KHI A; 2HCK A; 2LX9 A; 4PFP A; 1YJ9 T; 3GTJ I; 3H0I A; 2KAF A; 4LE9 A; 2ZPE B; 4A63 B; 5GAN 6; 1VQO A; 1OV3 A; 1UEC A; 1VQ6 1; 1B34 B; 4FYV B; 4FU6 A; 1M2V A; 4ELZ C; 4DBH A; 4D6W A; 4OP0 A; 2X4W A; 1N9R A; 2P3Y A; 1HSQ A; 1PCX A; 2KSS A; 2DTH A; 2EAY A; 2OTJ 1; 1MNE A; 2EBP A; 9ATC B; 3CC2 1; 3T9N A; 4M75 A; 4FW1 A; 1ABO A; 2VUM I; 1K8A 2; 3NTH A; 1YJW 1; 4E32 A; 3HKZ A; 1RLP C; 3O8V A; 1FX7 A; 1SRM A; 3OMG A; 5C44 I; 1QVF Y; 2HEQ A; 3FQQ A; 4K11 A; 1N27 A; 3H3V J; 3H8Z A; 2E5K A; 1K9M U; 2XG8 D; 4OB0 B; 3PO3 I; 4NS5 A; 1UJY A; 3G71 1; 1VQP Q; 5CM2 M; 5CKD A; 2DTI A; 3ME9 A; 1X3Z A; 3OMC A; 3J81 E; 4MD7 A; 2B63 I; 1VQ5 Z; 1U3O A; 1N9S A; 2R5A A; 3QHS A; 2QTX A; 1TWC I; 4C8Q G; 1UGP B; 3V8L A; 3CCE Z; 3G1J A; 4PJO B; 1KC8 U; 3NH8 A; 4MZP A; 3M56 A; 2FPF A; 1E6H A; 4JRI A; 2KRM A; 1NJI U; 1AEY A; 2VYT A; 1RAF B; 1VYV A; 1WJS A; 1W2B Y; 1OYX A; 3CC4 Q; 2FB7 A; 3FEO A; 4J8O A; 3U50 C; 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