1KITA

Vibrio cholerae neuraminidase
Total Genus 176
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
757
structure length
757
Chain Sequence
ALFDYNATGDTEFDSPAKQGWMQDNTNNGSGVLTNADGMPAWLVQGIGGRAQWTYSLSTNQHAQASSFGWRMTTEMKVLSGGMITNYYANGTQRVLPIISLDSSGNLVVEFEGQTGRTVLATGTAATEYHKFELVFLPGSNPSASFYFDGKLIRDNIQPTASKQNMIVWGNGSSNTDGVAAYRDIKFEIQGDVIFRGPDRIPSIVASSVTPGVVTAFAEKRVGGGDPGALSNTNDIITRTSRDGGITWDTELNLTEQINVSDEFDFSDPRPIYDPSSNTVLVSYARWPTDAAQNGDRIKPWMPNGIFYSVYDVASGNWQAPIDVTDQVKERSFQIAGWGGSELYRRNTSLNSQQDWQSNAKIRIVDGAANQIQVADGSRKYVVTLSIDESGGLVANLNGVSAPIILQSEHAKVHSFHDYELQYSALNHTTTLFVDGQQITTWAGEVSQENNIQFGNADAQIDGRLHVQKIVLTQQGHNLVEFDAFYLAQQTPEVEKDLEKLGWTKIKTGNTMSLYGNASVNPGPGHGITLTRQQNISGSQNGRLIYPAIVLDRFFLNVMSIYSDDGGSNWQTGSTLPIPFRWKSSSILETLEPSEADMVELQNGDLLLTARLDFNQIVNGVNYSPRQQFLSKDGGITWSLLEANNANVFSNISTGTVDASITRFEQSDGSHFLLFTNPQGNPAGTNGRQNLGLWFSFDEGVTWKGPIQLVNGASAYSDIYQLDSENAIVIVETDNSNMRILRMPITLLKQKLTLSQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of Vibrio cholerae neuraminidase reveals dual lectin-like domains in addition to the catalytic domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Vibrio cholerae
total genus 176
structure length 757
sequence length 757
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 1996-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09264 Sial-lect-inser Vibrio cholerae sialidase, lectin insertion
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1kitA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1kitA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1kitA02
4GZSA 4XIOA 5BYNA 3A72A 1WCQA 3WNXA 3N36A 1JBCA 3ILRA 1G9AA 4YZ3A 3SANA 1DQ1A 5CA6A 1W6QA 2E7QA 3M3OA 3AYCA 2XCYA 2P2KA 1S0BA 2A70A 4WA3A 1QU0A 2X9MA 5HX0A 4MWXA 5GLTA 1W6NB 1ENRA 2LTNA 4YGBA 2HYKA 4FVVA 4XTPA 1INHA 2TEPA 4FVKA 4GALA 1OFSA 2ZMKA 4WVWA 1ENSA 3GVJA 2DU0A 2AREA 4GZPA 2VK5A 3AYDA 4CTEA 1HDKA 1V6JA 1UX6A 1WLDA 3IM0A 2SILA 4B7QA 2BQPA 3POYA 1LOGA 3ENRA 4CPZA 3UJQA 5IUQA 2GMEA 2VWDA 5T5OA 4PBPA 4YM2A 3B69A 4MWWA 1LHVA 2F29A 1QKQA 1USRA 3B3QE 2BZDA 4YG0A 3NV3A 2SIMA 4HZYA 4AVVA 2GDFA 5E8AA 2DU1A 2HT8A 2YA5A 4CRQA 2UWAA 4PF5A 4XBNA 3AP9A 3FUQA 2DVBA 1DQ4A 3N3HA 3O5SA 1VAVA 3TIBA 2ZHMA 4CZSA 3I4IA 4SLIA 1V00A 2DURA 2OUJA 4FPEA 3JU9A 5IT6A 1N1SA 1FNYA 1Z4YA 1NXD1 1L7HA 1IS3A 1N47A 3INBA 2AYHA 3R4SA 2W68A 3Q9OA 3JU4A 4NCSA 1S0CA 1H30A 3PVOA 1A8DA 1VAMA 4WA4A 3T1MA 2UWBA 4NC5A 5EYXA 1PZ8A 2OUHA 1E8VA 5F5QA 2EAKA 2V73A 1AX1A 2JKBA 4TYSA 1CR7A 2DTYA 2JDZA 2R0FA 1OQ1A 2QWIA 2ZABA 3AZVA 1QNYA 4FJ6A 1YXWA 1N1TA 1A4GA 1SO7A 3RMYA 1DQ6A 4GZQA 1VCUA 1LOAA 4FPFA 1Z4WA 2ZGLA 4R9BA 1IVCA 3OYWA 3FLRA 2ZGOA 1C57A 1V6NA 1LOFC 3VKMA 4K1JA 2ZHKA 1W6PB 5EYYA 4FPGA 3WDUA 2PHTA 3USUA 4R9AA 2A75A 2ENRA 1AVBA 4M4NA 2WSVA 1UAIA 1KJRA 1QDOA 4ITCA 4DRVA 5JYYA 3GALA 1V6IA 4LBQD 4BLJA 2KM2A 1BJIA 1B9VA 1USXA 2E7TA 4Q27A 3NN9A 5IK4A 2AGSA 4LBNA 3TI5A 1R1ZA 5GZCA 4YG6A 4YZ1A 1JOJA 1W6OA 2D3SA 3ZYPA 1IKQA 4Z8BA 3O0VA 1YRZA 2G4IA 2ZMLA 3V64A 1GKBA 1S1AA 3IKWA 5DG1A 4BMBA 4ATFA 1SLAA 4BBWA 2ZGQA 1AX0A 4Q8KA 3AJYA 5KXBA 2VK6A 5T54A 1NNBA 3QLQA 4GXLA 1H9WA 4AVTA 1ULGA 3AZWA 3O9KA 4YGEA 1EPWA 2HTUA 4BM8A 3H0OA 4MZEA 3VKNA 3UK9A 5KXCA 1NSBA 2A6VA 5T5JA 4Q2FA 1VCJA 1F5FA 5T50A 2DTWA 1MZ6A 2W5OA 2EXHA 3OGGA 4DRRA 1Z4XA 4GKYA 1EUSA 2AEPA 2YA8A 2GMPA 4M3CF 2NMNA 4KS4A 1MS8A 5H9QA 4K1YA 1H9PA 4XXAA 3FUOA 3OBTA 1V2IA 2C5DA 3CNAA 3MW3A 3TI6A 4KS2A 5B2CA 2EALA 4QN3A 1YI7A 2DUQA 4FQZA 5DZFA 2HU4A 4FOQA 1FV3A 2ZAAA 3D11A 2ZGMA 1V6KA 1NNAA 1WCSA 1CIWA 3B7EA 5DUVA 3VKLA 4UW6A 4XHXA 3AJZA 4M3CB 4KS3A 1W6NA 1A78A 3FLTA 2QWFA 4FOVA 1DQ2A 2HTQA 2YMZA 2DWRA 2ZGKA 4CPNA 4R9DA 1WD3A 3AZYA 2DVDA 4Y1XA 3SNMA 4HANA 3R05A 1C1FA 3RQ0A 1XQNA 4YW1A 4Y26A 4XIKA 4UF7A 2PHFA 4MWRA 4WEGA 1RINA 4XXPA 1CPMA 3BEQA 1VLNA 4OZXA 2WT2A 3CYEA 4GEZA 1GSLA 3FFZA 1W6MB 3TB0A 3MEPA 2ES3A 1DBNA 2ZHLA 2QWGA 1LEDA 2WLQA 3AFKA 4LBQB 1CPNA 2FHRA 4FZHA 1LOFA 1CQ9A 2NP0A 3W58A 3SH5A 1FATA 4JC1A 5H9PA 5T5PA 1UMZA 1G9FA 4MWJA 1LESA 4XJRA 3AP4A 2ZA9A 2HTVA 3A0KA 1L7GA 1IOAA 4DQAA 2QWBA 2YA4A 1AF9A 3A4UA 4MWQA 1JUIA 1DIMA 2W52A 2QWHA 2WSUA 1V0FA 4Y20B 1MS9A 1G7YA 3WUCA 3HR9A 4YW2A 4U2AA 3O12A 4I30A 1B09A 5KXEA 4HZWA 5DG2A 4AVSA 3WG2A 1WLWA 2EXIA 3MW2A 3ZVXA 3M3QA 1INXA 4CPYA 1WBFA 4GWMA 4YM1A 1IS5A 1HQLA 1IVBA 3O9JA 5GLVA 4JRAA 3CL0A 1Z4ZA 2ZZJA 3OY8B 3IMNA 2PHUA 2VH9A 2BERA 3SILA 1ONAA 2GMMA 4C1WA 1EUUA 4FP2A 3M1HA 2GALA 2SLIA 1IVGA 4QN4A 2WKKA 1W6PA 4XTMA 2ERFA 1NCCN 5L73A 1F9KA 3T1EA 1HLCA 3NSSA 2C9AA 4MJVA 2CMLA 1BQPA 4XMAA 4WEFA 4LBJA 4XBLA 3BIWE 1SLIA 1INWA 1KQRA 1F8BA 3ZXFA 5JOYA 1XOGA 2VXRA 4QNPA 1QOOA 2ZGPA 4GZWA 1NCAN 4XILA 1MVQA 2SBAA 3ZXJA 3ZYRA 1ZM1A 1GV9A 4Q1PA 4X47A 3ALWA 2DYCA 3AP5A 3APBA 3N7LA 1NCBN 2P37A 3D6EA 5CB7A 3SISA 4GB1A 2HT5A 4BMEA 1LEMA 5LK5A 1GNHA 3K39A 1IVDA 3O0WA 2YROA 1YIFA 5GZDA 4X49A 4PCRA 4ASMB 3AK0A 3DUIA 2ZGUA 1WW4A 2D6MA 3HN1A 3KQRA 2DUOA 1V6MA 1V6LA 1S0GA 1CJPA 7NN9A 2F11A 4B7MA 4K20A 2DVGA 1WW6A 1JN2P 1ULDA 2W20A 3RRDA 4AGRA 1JW6A 2EXKA 1BZWA 1D2SA 4PQ9A 1DQ5A 4XE9A 2YA7A 1X50A 1B9TA 4FOYA 1W8OA 4UW3A 5GZGA 1B9SA 4Y1YA 2HT7A 3ALXA 5HUNA 4Y1UA 1A3KA 2UU8A 2B8HA 2GN3A 1GZCA 2C4AA 2D6PA 2VW1A 2GN7A 4X6KA 5JLVA 5DXDA 1WBLA 3ZXEA 5GZEA 4YGDA 5T5LA 2R0HA 3KM5A 3D12A 1DHKB 1MS0A 1SLBA 4DS0A 3D4KA 5GLZA 4M3CA 4Y1ZA 5GLUA 4Q26A 2CTVA 4YW3A 1LHOA 1JHNA 1F8CA 1AXKA 1IVEA 1BJQA 1ULEA 4B7JA 4MYEA 1V3BA 3M3CA 2AENA 3N7KA 4BLIA 1MS4A 4MWYA 5DUWA 4YZ5A 2P34A 1VIWB 3VV1A 3SLIA 1DZQA 4ISQA 4CPLA 1GYKA 1WW7A 1APNA 4FPCA 1Z0HA 3WCRA 3AP7A 4NN9A 1GANA 1LHUA 4XZPA 1W6MA 1W0PA 3AX4A 1Q8OA 4ATEA 2NN8A 2ARBA 4HZZA 3H72A 3V0AB 4XJQA 1G86A 4LBQA 1EUTA 2VW2A 1QNWA 4GZXA 3WDTA 2GNMA 1AJKA 2YV8A 1LTEA 4HZXA 1AXYA 1C1LA 2B7YA 4NOTA 3WOGA 5HUGA 1WW5A 5JOXA 1W1XA 1N3QA 2PHRA 4FPLA 1LHNA 3ZPYA 2F12A 1DFQA 4WVVA 2EF6A 2WJSA 3M2MA 4GDJA 2GNTA 1GLHA 3WG3A 3ZSLA 4MZAA 4B7RA 4Y20A 3AYAA 4H55A 1F8EA 1SBEA 1NCDN 1N3PA 3JUUA 4MC7A 5CBLA 3SALA 4M3CE 1NSCA 3RMXA 2YDTA 1N1YA 2Q5TA 4GKXA 1N3OA 3WG4A 2I2SA 1EURA 3OPZA 3ZXLA 3NV2A 4FPYA 3OY8A 3RS6A 3WV6A 3U4XA 5M1ZA 1DYPA 1FNZA 4XJZA 2ZKNA 4MX0A 3AYEA 2AH2A 4GJTA 1Q8QA 3T2TA 1LHWA 4F83A 2QWAA 2JE7A 2QWEA 5T55A 2ZACA 5HUKA 3M3EA 1L7FA 2CYFA 1UZZA 4Y22B 1U0AA 2NMOA 2A3YA 2CWSA 2WQZC 5CAZA 1GZ9A 4LBMA 2OVUA 1S0JA 5DUUA 2W5NA 3K36A 3WUDA 1KITA 1LGBA 2AR6A 2FMDA 2P3JA 2A3WA 1NSDA 2D6LX 4HZVA 1ULCA 1MACA 4K1IA 4H53A 3VKFC 3OJBA 1V0EA 4DPNA 1KDMA 3W59A 2AEQA 1RIRA 2NM1A 1LGNA 4QN5A 1MS5A 2ZMNA 4YG3A 1SACA 1QF3A 2C4LA 1INFA 4AYUA 4HIZA 3IPVB 4RA0A 1LOEA 4YFWA 1DGLA 2JECA 3WLUA 1GNZA 4KS5A 1LCLA 3ZSMA 5GJ6A 1F31A 4GA9A 3WDWA 4XJ9A 4C1XA 2R16A 4CPOA 1IS4A 5IK5A 3O0XA 1Z78A 2D44A 1DILA 2DV9A 4L8QA 3SITA 1RITA 2XG3A 2QWCA 3AZXA 3NV1A 1MWEA 4P9XA 2A6ZA 3V0BB 2VVZA 2A71A 1UZYA 3AXEA 1FV2A 3NWKA 4UW5A 2F27A 1URXA 1AZDA 1SCSA 2R1DA 1SFYA 1INYA 1O4ZA 3WVJA 1NMCA 2YY1A 1W20A 2YXSA 4B7NA 4I00A 2D6OX 3MPPG 3MW4A 3OBRA 4X4AA 3A71A 2F26A 4M00A 3HMYA 4FPOB 1LODA 4GZOA 3V65A 2XZKA 4MWUA 4MJUA 1WD4A 5IK8A 3NV4A 4ISRA 4AWDA 2R1BA 3H6JA 2PHXA 1JXNA 4ZKTB 1Q8VA 3N35A 4NO4A 4ZXKA 4QN7A 3PJQA 1I1EA 1GZWB 4M01A 1VALA 2VK7A 2UWCA 4YM3A 2F24A 2W38A 2VUAA 3H73A 1LJ7A 4D8SA 4YLZA 4FQ4A 1YYNA 2ZGNA 5IK7A 4LBLA 4DGRA 4CPMA 4PBOA 2ZB6A 2QWJA 1INVA 1G9BA 4LBOA 1AJOA 1LECA 3ASIA 2GNBA 1G9CA 3BOPA 1AX2A 1LU1A 2HTYA 3WZ1A 3WHUA 5JMCA 2P3KA 2ZGRA 5EWSA 1MVEA 3TICA 1W0OA 1Q56A 3N7JA 3V0AA 1FYUA 1ZA4A 1LU2A 3K37A 3SH3A 1MZ5A 1O4YA 4M4VA 3T1LA 1FAYA 2YA6A 4H52A 3B00A 1SLLA 2QWDA 1SLTA 1BYHA 2V5YA 1MR5A 2A5ZA 4XYXA 1S0FA 3FBYA 4WV8A 3VUOA 2A6WA 1TEIA 4GWNA 4FPKA 5HCFA 4Y24A 4WA5A 1Z4VA 5DZEA 3INAA 1D0HA 5B2DA 3FLPA 1BKZA 1W8NA 2BF6A 4XMIA 1YO8A 1QOTA 2NYYA 2RHPA 4K21A 3I8TA 2GNDA 4MWVA 2DVFA 1DQ0A 2A7AA 4D69A 2R49A 3WDYA 5SV8A 3TIAA 1Y7BA 2PELA 5HCBA 4P14A 1V3CA 6NN9A 2F25A 2E53A 2D7FA 1SBFA 2DVAA 2A3XA 5GLWA 2VSKA 1NMBN 2WNEA 4YW5A 3WDXA 4TZDA 5JVVA 3PMEA 1SNTA 1QGLA 2LALA 2WT1A 1W6QB 2JE9A 2HU0A 4K1ZA 2P3IA 3PVNA 3TI8A 1ENQA 2QWKA 2EIGA 2W39A 5GZFA 2CL2A 5E88A 1CVNA 4Y22A 3GVKA 1DLLA 5CNAA 4R9CA 5H9SA 4XOGA 2VU9A 1Q8SA 2ARXA 2DUPA 2D6KA 2CWMA 5HUMA 3A0NA 4YW4A 5F9TA 3QCWA 3CL2A 4KBBA 1INGA 1DYKA 1LULA 3LCPA 3K38A 1IS6A 3K3AA 5JOZA 3L2YA 3AZZA 1Q8PA 4FPJA 1QDCA 3ATGA 4Y1VA 1N1VA 2F0ZA 2NZ9A 2WT0A 4MWLA 2BATA 1A14N 1XOEA 2A6XA 1V6OA 1V3EA 4XJAA 5GM0A 3IPVA 1JYCA 1CN1A 1KDKA 2D3RA 3RSJA 3LSEA 1W21A 4P9WA 5JDBA 2UURA 4UW4A 4KS1A 1CESA 3GVLA 4Q6KA 3ZSKA 1UPSA 2ZB5A 1SLCA 2VSMA 1PZ7A 1OKQA 1FX5A 1IKPA 2HTWA 2H0BA 1HQWA 1WLCA 5NN9A 3TAYA 2VY0A 5HCAA 3B01A 3ZSJA 3WCSA 3WHTA 3V0BA 3ILNA 2CNAA 4BQ1A 3H71A 4XJUA 1SBDA 3IN9A 1LOBA 4Q1RA 3PVEA 3UL2A 2W08A 2ZGSA 4FOWA 5DZGA 1V0ZA 4JF7A 4BOWA 1J1TA 2ZBJA 4YGCA 1Z50A 4AGGA 1C4RA 1PZ9A 1KJLA 3R4UA 3ILFA 2E6VA 1S0EA 3BODA 4WZFA 4YM0A 4FP3A 1GZWA 2F13A 1G8WA 2YZ4A 4LBKA 4JCKA 1E8UA 3OYWB 2OW4A 2A6YA 1QOSA 5AVAA 2AUYA 3AXDA 1I3HA 3TI3A 1DIWA 1AXZA 1UL9A 3C2UA 4IQPA 3TI4A 2CY6A 1UN1A 3USUB 1NN2A 4XJ8A 3ZXKA 2YDPA 2EXJA 2RKCA 1ULFA 3LSDA 4YZ2A 4K3YA 1NLSA 4M4UA 4W65A 2E51A 4M3MA 1F8DA 3RG0A 3BTAA 4GZTA 5DUXA 1GICA 3D5OA 3WDVA 4DFSA 1QMJA 2Z42A 1HKDA 1BXHA 5GALA 3W09A 1V3DA 1W6OB 4BPZA 3VKOA 4AGVA 5EXOA 3POSA 3SH4A 1CONA 2JJ6A 5FRAA 5FREA 3GNEA 5H9RA 3DGTA 1UKGA 1MS3A 2F28A 4P9YA 1SCRA 4GDIA 1S0DA 3AP6A 5E89A 1A4QA 1E8TA 2XB6C 3N7MA 4XHBA 3WG1A 4QN6A 1G9DA 4XBQA 4K1KA 1NNCA 1MS1A 2D6NA 3POWA 4RL7A 4U36A 1WUVA 4XDQA 2XZJA 1JYIA 5JOWA 2VW0A 1NMAN 1LGCA 4XJWA 2D43A 4FPHA 4J9TA 1S0IA 3CKZA 5T52A 1LENA 1KRIA 4HL0A 2XZIA 2D3PA 2ZGTA 2F10A 2HTRA 2ZHNA 4YZ4A 2PHWA 1LOCA 3UJOA 5KXDA 4YFZA 2JD4A 4K1HA 3B9CA 4Q8LA 1IVFA 1GBGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GZSA 4XIOA 5ABJC 4FTBA 5BYNA 1OOPC 2IFRA 2VMFA 3ZDVA 1RWLA 2Z32A 1WCQA 4RR3C 3A72A 3WNXA 3N36A 2VZSA 2XR4A 5FPUA 1UXZA 1VBB1 1TMF3 1ENXA 1JBCA 2IAPA 3ILRA 5FWJA 2G8SA 4K3UA 1OPMA 2LRPA 4ZS3A 1G9AA 2OX0A 3LF7A 4OUMA 4YZ3A 3SANA 1ULOA 1DQ1A 1HRI1 4MX3A 5FZNA 5CA6A 4FTSA 4CU6A 1RUF1 2RS11 1UY1A 1W6QA 2YPJA 1UYZA 2E32A 4UFMA 1UNBA 1UX7A 2E7QA 2RM21 3AYCA 1ND3A 3M3OA 1F2NA 2VGDA 4PLMA 3RJ2X 3VBSB 5K7PA 5BY5A 2XCYA 4DG6A 2HWF2 2P2KA 1S0BA 2A70A 3V64C 2XVKA 4WA3A 1QU0A 3N9PA 1A34A 2X9MA 1K5MC 3LPFA 5HX0A 4MWXA 5JZGA 5GLTA 3B7MA 1W6NB 3AFGA 4IFLX 2WNVB 3KF5A 3RDIA 1ENRA 4XDPA 2BW8A 5FIXA 2LTNA 4AQ6A 1HV0A 1XU1A 1NXMA 2OS2A 1OC1A 1R081 1ULPA 1W2TA 2E9QA 3VBRA 4YGBA 4K40A 4CDXC 4NE9A 2IAVA 2HYKA 3NVCA 2QFEA 4FVVA 4Q4Y2 3NNLA 4XTPA 2YBKA 5FYIA 2TEPA 3AKRA 1INHA 3ACLA 4NPMA 3KGLA 4TN7A 3C8XA 3MFCA 4FVKA 3GGLA 4CUAA 4GALA 4R4XA 1EAH1 4CCJA 5D8AA 4OHYA 1OFSA 3HT2A 1CZSA 2ZMKA 2LW8A 4KGQA 4WVWA 1ENSA 4G4FA 5CZKA 1YC61 5DDJ3 5LA1A 4AEDC 3GVJA 3II7A 5F5AA 3ACIA 3VDAA 1CD3G 2RDRA 3NNJA 3PUSA 4HN0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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