1KITA

Vibrio cholerae neuraminidase
Total Genus 176
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
757
structure length
757
Chain Sequence
ALFDYNATGDTEFDSPAKQGWMQDNTNNGSGVLTNADGMPAWLVQGIGGRAQWTYSLSTNQHAQASSFGWRMTTEMKVLSGGMITNYYANGTQRVLPIISLDSSGNLVVEFEGQTGRTVLATGTAATEYHKFELVFLPGSNPSASFYFDGKLIRDNIQPTASKQNMIVWGNGSSNTDGVAAYRDIKFEIQGDVIFRGPDRIPSIVASSVTPGVVTAFAEKRVGGGDPGALSNTNDIITRTSRDGGITWDTELNLTEQINVSDEFDFSDPRPIYDPSSNTVLVSYARWPTDAAQNGDRIKPWMPNGIFYSVYDVASGNWQAPIDVTDQVKERSFQIAGWGGSELYRRNTSLNSQQDWQSNAKIRIVDGAANQIQVADGSRKYVVTLSIDESGGLVANLNGVSAPIILQSEHAKVHSFHDYELQYSALNHTTTLFVDGQQITTWAGEVSQENNIQFGNADAQIDGRLHVQKIVLTQQGHNLVEFDAFYLAQQTPEVEKDLEKLGWTKIKTGNTMSLYGNASVNPGPGHGITLTRQQNISGSQNGRLIYPAIVLDRFFLNVMSIYSDDGGSNWQTGSTLPIPFRWKSSSILETLEPSEADMVELQNGDLLLTARLDFNQIVNGVNYSPRQQFLSKDGGITWSLLEANNANVFSNISTGTVDASITRFEQSDGSHFLLFTNPQGNPAGTNGRQNLGLWFSFDEGVTWKGPIQLVNGASAYSDIYQLDSENAIVIVETDNSNMRILRMPITLLKQKLTLSQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Vibrio cholerae
publication title Crystal structure of Vibrio cholerae neuraminidase reveals dual lectin-like domains in addition to the catalytic domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE
total genus 176
structure length 757
sequence length 757
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 1996-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09264 Sial-lect-inser Vibrio cholerae sialidase, lectin insertion
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1kitA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1kitA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1kitA02
2QWBA 2WNEA 3H71A 1S0DA 3W58A 2ARXA 1GZ9A 2ZMLA 4R9AA 1AJOA 4M3CF 2I2SA 3ZXEA 2VU9A 3H73A 2W38A 3AZWA 1N1YA 3O5SA 5E8AA 5HCBA 4YM3A 1SNTA 2HTVA 3UL2A 4DFSA 3ZPYA 4FPHA 1A4GA 1W6NA 5JVVA 2D6LX 4P9YA 1UN1A 3WG3A 4FP2A 4XXPA 3BODA 5DUVA 1N3QA 5IUQA 2E7QA 4XJQA 3FFZA 5EYXA 1LEDA 3O9JA 1JYCA 1YO8A 4PQ9A 3VKMA 4XJWA 4WZFA 3N3HA 3W59A 3A4UA 2R0FA 3D11A 4YZ2A 4Y22B 1Q56A 1NCCN 3PVEA 4UW4A 3VKOA 4FOVA 1G86A 2VK5A 4Y20B 3TIAA 2C4LA 3FLTA 2P3JA 3B69A 3AZVA 3WG2A 2VSMA 2D3RA 4B7QA 2WQZC 4YZ4A 1O4YA 3PMEA 4Q8KA 3V0AA 1A4QA 4LBMA 2SBAA 1IS5A 1V3BA 2VK7A 4XJ8A 2W52A 4LBJA 4ASMB 2YA4A 3ILNA 3N36A 1JOJA 4FVKA 3GVKA 2HTUA 5DG1A 2F13A 5GZFA 1INWA 3SNMA 2WLQA 3R4UA 3ALWA 1MS0A 3PJQA 3CKZA 1NNBA 4K1HA 4FPLA 4X49A 1RITA 4XMIA 5GZDA 2TEPA 2NM1A 1GYKA 5B2DA 1BKZA 5GLUA 2P34A 3N7JA 1GICA 2ZAAA 2XZIA 2DTWA 2UU8A 1DQ1A 4NC5A 5IK8A 2F10A 3ZYPA 3R4SA 3RMXA 1INXA 5F9TA 4FPCA 1CPNA 1V6MA 3SH5A 1G8WA 1SBEA 3N7LA 1QDCA 2HU0A 4P14A 3SLIA 4WVVA 4K3YA 2F28A 1SCRA 3BIWE 4PCRA 5DUUA 5JMCA 1LOCA 1Z4YA 1E8TA 4WV8A 1V6JA 4IQPA 2CTVA 2UWAA 2D43A 1LENA 1LECA 1W0OA 5GLZA 4YGEA 2E51A 3WUCA 1UX6A 5T5OA 2D6MA 2PHWA 3ZXLA 1ENSA 2PHRA 2DYCA 2A7AA 1GNZA 3AP6A 1INVA 2X9MA 1CN1A 1W20A 1KJRA 1B9VA 5E88A 1V6NA 2D6PA 3RG0A 1G9AA 1DIWA 2UURA 3USUB 4Y1UA 3TI5A 4U36A 2DUQA 3A72A 1IKPA 1WD3A 4B7JA 1GKBA 2VW1A 4XXAA 1GV9A 1QGLA 5CAZA 4GXLA 2A70A 3A0KA 3K39A 4MX0A 1AXKA 3AZXA 4ISRA 2HT7A 2DUOA 2VSKA 2WT2A 2GNMA 4YM0A 1LOGA 4MWYA 3K37A 3ZSLA 5GLVA 2SLIA 1H30A 3WDUA 1A78A 1YIFA 3ZYRA 3H6JA 4LBQB 1F31A 4RA0A 4BPZA 2ZABA 4M00A 3AP9A 4FPEA 1AXZA 4CPOA 3SH3A 1DYPA 5HX0A 1WW4A 2R16A 5EWSA 3WOGA 1LULA 4Y20A 4FPFA 5T50A 4FPJA 1LGCA 2NMNA 1UPSA 4XE9A 4XBQA 1WCSA 3OJBA 2WT1A 1G9BA 2XCYA 5E89A 4GDIA 1QOOA 4CPLA 2D6KA 3NV4A 2NYYA 4XDQA 3B3QE 3OYWB 1FYUA 3LSDA 2LALA 1W8OA 4JF7A 3L2YA 2GMEA 3WCSA 2F0ZA 3H0OA 2DVAA 4MC7A 4XBNA 1VCUA 1ENQA 3TI4A 2A71A 1BYHA 2HYKA 1CQ9A 2SIMA 5M1ZA 4HZVA 1S0CA 4WEFA 5HUMA 4ZKTB 3HN1A 2F12A 4K20A 4GZTA 3BEQA 2HTWA 4SLIA 3O9KA 4GA9A 1SFYA 3WLUA 2YA6A 4YW5A 3D12A 5HCAA 4XJUA 1PZ7A 1SACA 5BYNA 1DGLA 1MACA 3M3CA 1NCBN 1IS3A 1LOBA 1APNA 2GN3A 1FV3A 3IMNA 3ZXJA 3GVJA 2R49A 2EIGA 1Z4VA 1H9PA 4X6KA 1AJKA 5DZFA 2ZACA 1A14N 3FLRA 5GM0A 1MS3A 2C4AA 4D69A 4X47A 1WD4A 1INYA 4L8QA 2ZBJA 2R1DA 2ZGSA 3V0BA 4B7RA 1JW6A 2RHPA 1Q8VA 1W6OA 5JYYA 4LBOA 1BQPA 3WDXA 3MW3A 5T5LA 1N1VA 2EXIA 1MS1A 1SLBA 4FOQA 1AXYA 3A71A 1VLNA 5JLVA 4M3CB 1WBLA 2FMDA 3USUA 1LJ7A 1LHVA 4YG3A 4FJ6A 4KS4A 4FPGA 4R9DA 4HL0A 2F27A 2VVZA 2VH9A 4YZ1A 1R1ZA 1ENRA 4NCSA 2HU4A 4XJZA 2XZKA 1LODA 3WNXA 1NMBN 3ZSJA 4YG0A 3T1LA 1QDOA 3UK9A 3RMYA 1BJQA 1B9SA 4ITCA 4GDJA 4Q8LA 5DUWA 2D3PA 1DHKB 3SH4A 1NMAN 2C5DA 4Q1RA 1WCQA 2G4IA 2QWCA 2JD4A 4Q26A 4FPKA 2PHXA 2VK6A 4YW1A 1YI7A 3IKWA 3R05A 3SALA 5F5QA 3U4XA 4GB1A 2OW4A 1CESA 1LESA 2QWEA 1ULCA 1LHNA 1FX5A 2YMZA 3POWA 3WHUA 4X4AA 1MS9A 1PZ8A 4LBNA 2R1BA 1V0FA 4YGDA 1MS4A 3GNEA 3ZSKA 4BOWA 1TEIA 4BMBA 3Q9OA 5CB7A 1JHNA 2WJSA 4Y1VA 4YZ3A 1OFSA 2D7FA 2GNDA 1SLLA 3WZ1A 3D4KA 2AEQA 1UZYA 2JDZA 4DPNA 1UAIA 3MPPG 5CNAA 4XOGA 3NV1A 2ZGTA 3VKNA 3JU9A 1Q8OA 4Y24A 5GALA 1CJPA 2GALA 1GLHA 3AYEA 3W09A 3O0VA 2YDTA 5CA6A 1C57A 4HZXA 1WLCA 1HDKA 1Q8QA 1I3HA 4YGBA 2AUYA 4CPNA 2JKBA 1IOAA 2QWFA 1NSDA 5H9RA 3D5OA 1IVEA 4YFWA 2CY6A 2YXSA 1UMZA 1Z4ZA 2LTNA 4YGCA 3INAA 2VY0A 1CR7A 2W39A 4XMAA 4MJUA 1MZ5A 1N47A 2D6NA 1N1TA 3QCWA 3POSA 1S0BA 2SILA 1G9DA 1GZCA 1W6QB 4GALA 1EUSA 4NOTA 4H52A 2GN7A 4GZSA 1J1TA 2BATA 4XZPA 5IK4A 3OPZA 1FAYA 2YY1A 1SCSA 1IS4A 4QN4A 2Z42A 3DGTA 2NN8A 2W5NA 1LCLA 2D44A 4CZSA 3FUQA 4ATFA 4Y1ZA 4XTMA 2W68A 1QF3A 2PHFA 3SISA 1NN2A 2YV8A 3KQRA 4HZYA 5FRAA 1QOSA 2PHTA 4FOYA 4MWWA 2HTYA 4XJRA 3UJOA 1GZWB 2AGSA 3KM5A 4M3CA 1E8UA 3ALXA 4YM1A 1IS6A 3SILA 4RL7A 3IPVB 1N3PA 1B9TA 1WBFA 2RKCA 3WVJA 1S0GA 4GKXA 1W21A 1LEMA 4HZWA 3VV1A 4P9XA 3TI8A 4GKYA 2ZGKA 1DFQA 1DQ2A 4Y1YA 4XJ9A 4YM2A 1XQNA 2ZGUA 4MWLA 1MS5A 5FREA 3LCPA 1ULGA 2EAKA 3V65A 2R0HA 1SO7A 1V0ZA 7NN9A 3BOPA 4JCKA 1BXHA 4YW4A 1JYIA 1LOAA 2HTQA 2BZDA 4K1ZA 1VIWB 4FP3A 4WA4A 2A6VA 5HUGA 2ZHMA 3H72A 1WW5A 3INBA 1AX0A 1LOEA 1NSBA 5HUKA 2V5YA 3QLQA 1G7YA 1Q8PA 5IT6A 2ZGQA 1EUTA 3WG1A 1VALA 5GLWA 4XTPA 2B7YA 4MWVA 3AP7A 1QOTA 4Y22A 1KDMA 4GZQA 3M3EA 2A6XA 1D0HA 4FPOB 5EXOA 1QKQA 1F8EA 1DQ6A 1S0JA 4KBBA 1NNCA 2DVBA 1VAVA 2ZGNA 2F24A 4M3MA 3JU4A 1Z0HA 2EXKA 5EYYA 1MVEA 4NO4A 3O12A 4CPYA 4BLJA 1V3DA 2DVDA 1INGA 1UL9A 2QWIA 1BZWA 3HR9A 4WVWA 5H9QA 2A3WA 2ZHKA 2VW2A 2PELA 3HMYA 1Y7BA 1Z50A 2ZB6A 4HIZA 5GZEA 3AK0A 1DLLA 1MWEA 2AREA 1OKQA 3O0WA 3VKLA 4U2AA 2OUJA 3OBTA 4JRAA 3OY8B 1IVGA 3GALA 5AVAA 1G9FA 3O0XA 3IM0A 5JDBA 2DVFA 1GSLA 1ZM1A 4C1XA 2F29A 4MYEA 3ILRA 2ARBA 1JUIA 4FOWA 4J9TA 3V0AB 5GJ6A 1SBDA 1L7FA 1USXA 1ULDA 1RIRA 3NSSA 4DRRA 4MWRA 5H9SA 5IK5A 3OGGA 1AF9A 1FATA 1ULEA 2QWAA 3ILFA 4GZPA 4PF5A 1GZWA 1SLIA 2ZMKA 4Y26A 4DGRA 4FQZA 1W6PB 4WEGA 2JE9A 6NN9A 4BMEA 1DQ5A 3M1HA 4C1WA 2ZA9A 4YFZA 3FLPA 1KDKA 4HZZA 4ISQA 3POYA 3WHTA 4MJVA 2EXJA 4Q6KA 2W20A 5B2CA 1A3KA 1V0EA 4BQ1A 1DQ4A 1ZA4A 2VW0A 3NWKA 4QN6A 2BQPA 4JC1A 2ZB5A 3WG4A 2UWCA 4LBKA 1LU2A 5GZCA 1HQWA 4D8SA 3WUDA 4MWXA 1KRIA 4LBQD 2YA7A 3AZYA 2DWRA 1QNYA 2F25A 1EURA 2ZHNA 4MWUA 1KJLA 3K36A 4KS5A 4BBWA 2D6OX 1W6MB 3PVNA 4QN7A 2DURA 3ATGA 1X50A 5DZGA 4CPMA 2ERFA 4XHBA 4CRQA 4K1KA 4F83A 1S0EA 1XOGA 2YROA 4DRVA 1O4ZA 2YZ4A 2ZGOA 4Z8BA 4LBQA 3WDYA 4AGRA 3RSJA 3RS6A 1JBCA 5CBLA 1AVBA 4UF7A 4W65A 2A6ZA 1PZ9A 1IVCA 4XILA 2A3XA 4UW3A 4AGVA 1QU0A 3VKFC 4QNPA 3ZXFA 1LHWA 2EF6A 2WSVA 2CWMA 1JXNA 2A5ZA 3OYWA 4AGGA 4PBOA 2E53A 2W08A 4MWQA 2V73A 1V3CA 1AX2A 2W5OA 1SLCA 4MWJA 5GZGA 5T5JA 1Q8SA 2DVGA 2KM2A 1C4RA 3ENRA 3TICA 4P9WA 1INFA 1NXD1 1GNHA 1HLCA 5H9PA 2ZKNA 3OY8A 2QWHA 3AXDA 2F26A 3BTAA 3M3OA 1W1XA 1IVFA 1CVNA 1IVBA 2A6YA 4DS0A 3VUOA 4M4UA 4R9CA 2AENA 3TB0A 3WCRA 2CMLA 3M2MA 1YYNA 1WLDA 2DUPA 2AYHA 2ZZJA 4QN5A 2AH2A 1V6LA 1BJIA 1Z4WA 1V2IA 3FUOA 4Y1XA 2GNBA 1W0PA 1DQ0A 4UW6A 5DG2A 3CL0A 1LGNA 2CWSA 4B7NA 1LGBA 3NN9A 3AYDA 2ENRA 4K1JA 2HT5A 4FZHA 4CPZA 4GEZA 3T2TA 1V6IA 4GZOA 1W6PA 2GMMA 4BM8A 1E8VA 2C9AA 2CYFA 3CL2A 3WDWA 2VWDA 1F8DA 5SV8A 3WDTA 2YA5A 2Q5TA 2F11A 2ES3A 4XIOA 4DQAA 1Z78A 1D2SA 3ASIA 2XG3A 3AX4A 2OVUA 1N3OA 2A6WA 3K3AA 5JOWA 4YG6A 4Q1PA 2DU0A 3AJZA 4K1YA 2QWDA 1C1FA 4HANA 1F8CA 1RINA 2FHRA 5JOZA 1LHOA 5T52A 1CONA 1S0FA 2WT0A 3APBA 3MEPA 4UW5A 4AVSA 4MZAA 3MW2A 3WDVA 3M3QA 3NV2A 4ATEA 5KXEA 1DBNA 1W6MA 4GWNA 2JJ6A 1QMJA 4WA5A 4Q27A 4XBLA 1LU1A 3IN9A 3V0BB 1CPMA 4YW3A 2EXHA 1DZQA 1UZZA 1NMCA 1SLTA 1W6OB 1INHA 2ZHLA 4OZXA 2CL2A 1QNWA 5LK5A 5DUXA 1I1EA 1U0AA 4R9BA 2GMPA 5NN9A 4AWDA 3AYCA 2E6VA 1URXA 2XZJA 1MVQA 1C1LA 4XJAA 3B00A 2JECA 4KS2A 5HCFA 4FVVA 2JE7A 3TAYA 1H9WA 1IKQA 1LOFC 2A3YA 3FBYA 1S0IA 4H53A 4GWMA 3PVOA 3ZXKA 4M3CE 3AJYA 3B7EA 3N35A 3TI3A 1ULFA 2E7TA 1NCAN 2P37A 1F5FA 4B7MA 1KQRA 4AVTA 1WUVA 4AVVA 3K38A 1NSCA 2WKKA 2WSUA 5DZEA 3AP5A 3RRDA 4YLZA 1NNAA 1FNZA 1NLSA 1MS8A 4K21A 2NMOA 1W6NB 2P3IA 3CYEA 4XIKA 1EUUA 3CNAA 5KXCA 5JOXA 3B9CA 4M01A 3JUUA 1YXWA 3A0NA 1LOFA 3I4IA 5KXDA 1GBGA 3T1EA 2QWKA 1CIWA 1V00A 4Q2FA 3AP4A 2ZMNA 1KITA 3AYAA 3GVLA 1W8NA 2B8HA 2HT8A 5T5PA 2BF6A 2AEPA 3MW4A 3B01A 4ZXKA 1XOEA 1B09A 3AXEA 1DYKA 2NZ9A 2ZGPA 4M4VA 2GDFA 1Z4XA 1FV2A 5HUNA 4MZEA 3N7KA 1V6OA 2P2KA 3OBRA 4PBPA 1W6QA 5T54A 3C2UA 2EALA 2ZGRA 4I30A 2DV9A 3AZZA 4FPYA 1G9CA 4GZWA 1DIMA 1V3EA 1NCDN 1LTEA 2H0BA 2YDPA 3SANA 5JOYA 4GZXA 2QWJA 1V6KA 3ZSMA 1DILA 4TYSA 4AYUA 2DU1A 2HTRA 1F9KA 1AZDA 3AFKA 5DXDA 2GNTA 3DUIA 4H55A 1EPWA 3ZVXA 4KS3A 3I8TA 1VAMA 1YRZA 5T55A 1AX1A 1MR5A 3V64A 3IPVA 3WV6A 4KS1A 1VCJA 2YA8A 1JN2P 1WLWA 4BLIA 2BERA 4YW2A 1GANA 2UWBA 3TI6A 1FNYA 1SBFA 2NP0A 5IK7A 5GLTA 1HKDA 1MZ6A 2QWGA 1L7GA 3LSEA 4XHXA 4K1IA 1ONAA 2DTYA 1WW6A 4CTEA 2VXRA 3RQ0A 2XB6C 1OQ1A 2OUHA 1N1SA 4TZDA 4FQ4A 2AR6A 4YZ5A 4LBLA 1IVDA 1WW7A 3NV3A 1LHUA 2D3SA 4NN9A 4XYXA 1SLAA 4QN3A 3TIBA 1F8BA 4WA3A 1A8DA 4M4NA 3UJQA 1HQLA 1UKGA 3N7MA 2A75A 2CNAA 4GJTA 3T1MA 1S1AA 2PHUA 3SITA 4I00A 5KXBA 5L73A 2ZGLA 3D6EA 1USRA 2ZGMA 2VUAA 2P3KA 1L7HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K48A 3U14A 2QWBA 1YI9A 4OULA 4HSLA 4IL7A 5K0UC 2WNEA 3MUZ1 3H71A 3JB4C 3A21A 1S0DA 4IETA 5FZCA 4L7CA 5C5TA 2HBTA 3IIAA 3S7IA 4GIQA 3W58A 1X7NA 3MDPA 4NHLA 2ARXA 1GZ9A 2ZMLA 4R9AA 4HBNA 1AJOA 3E5UA 4GJZA 4Q0PA 4YRDA 4DEVA 5BNNB 4PHZA 3GYDA 4IV3B 4M3CF 4KNCA 5IVEA 2I2SA 3ZXEA 2VU9A 2VVEA 1D0GA 4I02A 3H73A 1FOD3 2W38A 1QH7A 3JQWA 4MXVA 5M0TA 1PM7A 4YPJA 3RZMA 3IMMA 3AKQA 5BNNA 3AZWA 1N1YA 3O5SA 4UFJA 5FK7A 5FYMA 2JDKA 3PURA 3VBUA 3VBRA 1R64A 3POJA 5E8AA 5HCBA 4YM3A 4AI8A 2XLAA 3UL2A 4WM7B 3UT0A 3CZUA 3UV9A 4DFSA 1SNTA 2HTVA 2K46A 2P3YA 5FYBA 2GVWA 3ZPYA 4FPHA 4N53C 1A4GA 4QXBA 2WWUA 3MFAA 1W6NA 2XJTA 4XFBA 5JVVA 1F8VA 2D6LX 2XR4A 4P9YA 5I0UA 2VNOA 1UN1A 3VHPA 2E31A 3WG3A 3BUCA 4FP2A 1Q43A 4XXPA 2PMWB 3BODA 5DUVA 2VC9A 1N3QA 5IUQA 4PDWB 2B42B 2VMFA 1UY2A 3R6SA 3MICA 1KFXL 2E7QA 3AM2A 3JXSA 3QH7A 4RN5A 2BRTA 4QHOA 3VBSB 4XJQA 4AI3A 3O1UA 1UW8A 5FBJA 3JD73 3FFZA 4QX8A 5ERLA 5EYXA 1LEDA 3I1CA 4MH0E 3O9JA 1JYCA 5FBZA 4IUGA 1YO8A 5GX5A 1AYN2 1B35C 3FWEA 3MLJA 4KWUA 3ZFGC 5C3QA 4PQ9A 4X6RB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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