1MZ6A

Trypanosoma rangeli sialidase in complex with the inhibitor dana
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
630
structure length
620
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVATADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVMDATVIVKGNKLYILVGSFNKTRNSWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVGSNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDGNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQQDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRFIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPGAPTDSRVTVTNIVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural basis of sialyltransferase activity in trypanosomal sialidases
pubmed doi rcsb
molecule keywords sialidase
molecule tags Hydrolase, hydrolase inhibitor
total genus 161
structure length 620
sequence length 630
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2002-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1mz6A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1mz6A01
3POSA 4MWYA 2QWDA 3FFZA 2DVDA 1QOTA 3D6EA 1L7GA 4GKXA 5GALA 2P37A 4Y20A 4I00A 3AYEA 1G9AA 1NLSA 2D6MA 1EURA 3POWA 3ZSJA 5JOYA 1AXKA 5AVAA 3NV2A 1LOFA 1GBGA 5DG1A 2I2SA 3T1EA 1LECA 4NO4A 2UU8A 1LHWA 1DIMA 1INWA 1S0BA 1O4ZA 2JECA 1LCLA 5HUMA 4M3CB 4NN9A 1GLHA 1DQ1A 1UZZA 1NNAA 5GLVA 1NCBN 1G86A 3H0OA 1J1TA 1WBLA 1W1XA 5B2DA 4XJ9A 1IVBA 4Y1ZA 1ULCA 2QWFA 2NMOA 2DU0A 5H9SA 3AK0A 4K1ZA 5HUGA 2F28A 1JW6A 1Q8SA 2YZ4A 4B7JA 1MWEA 3POYA 3NV3A 5GZGA 4KS2A 1W6OA 1WCQA 1IS3A 2WKKA 3QLQA 4QNPA 7NN9A 1UAIA 3ZSLA 1WW7A 2KM2A 3A71A 4ATEA 4BPZA 3T1LA 1AJKA 2A5ZA 3M3EA 2W68A 4U36A 3WNXA 1WLCA 5IUQA 4XJRA 4X4AA 1UMZA 2UURA 1YYNA 3O5SA 4GWNA 5T52A 2H0BA 1F8CA 4Q1PA 3ZYRA 4Q8KA 4PCRA 4AVTA 3WCSA 4YZ1A 2F0ZA 2V5YA 1FX5A 2A6ZA 4X47A 4R9DA 2FHRA 1F31A 3FLTA 1DQ5A 3SITA 5JOWA 2P3JA 3NN9A 3BIWE 3AXDA 3NV4A 4XJUA 4Y1VA 4CPZA 2ARBA 2W38A 3IKWA 1Z4ZA 1DILA 3WG1A 3PVEA 2DTYA 4XYXA 1F8BA 2OVUA 3V0BA 1S0JA 2LALA 1Q8QA 5JDBA 1C4RA 1EUSA 5IK8A 2F11A 1N1YA 1DZQA 3N7MA 1MZ5A 3M2MA 4WA5A 4X6KA 1USRA 1CR7A 5E8AA 1W6MA 2DVFA 1C57A 4YM3A 2C4AA 2PHRA 2VSMA 2YDPA 1LHUA 1JOJA 5H9RA 1KITA 2X9MA 2F13A 1UZYA 4MZEA 2ZGQA 2D3PA 1VAMA 1QOSA 2Q5TA 1GNHA 1LOFC 2ZAAA 2AENA 3IPVB 2VU9A 2XG3A 3WHUA 4FQ4A 4AWDA 4YZ4A 4YFWA 4FPFA 1NMBN 4KS5A 4KS4A 2WJSA 3IMNA 2EXKA 4J9TA 1RIRA 2D44A 4RL7A 1C1LA 3AZZA 3RRDA 3O0WA 4UW4A 4M3CE 2F29A 4R9AA 1MS8A 1JBCA 1I1EA 2EIGA 2EAKA 3ZXKA 5GLWA 3AP9A 1GZCA 3AP5A 3BEQA 1W6QB 1MR5A 5E88A 1NXD1 3PMEA 4XJAA 4C1WA 3D11A 4MWQA 4B7RA 3Q9OA 3V64A 3O9KA 2W20A 2BATA 4K1YA 4XE9A 2ZACA 3VKNA 4M00A 3WV6A 2VW2A 2A71A 3LCPA 4ITCA 4IQPA 3MW3A 3AZXA 5KXDA 4WVVA 4TYSA 5CA6A 2WSUA 1W0PA 4Q8LA 2HU0A 5JOXA 4FOWA 3SH5A 3AP7A 2A3WA 4I30A 1L7FA 5T5LA 1LODA 4WEFA 4P9YA 1W6MB 4JRAA 4GKYA 1SLTA 3SH4A 3TI3A 2XZIA 2C9AA 2ZGSA 2XCYA 3ZSKA 3LSEA 2CWSA 4FOYA 1GSLA 2HTQA 4K1IA 3ALWA 4FVKA 1E8VA 3FLRA 2OUJA 5FREA 2YMZA 2VSKA 3B7EA 3OPZA 3ASIA 4WA3A 2XB6C 3K37A 2D6NA 2F27A 1NCAN 5DZEA 4PF5A 2R1BA 3N7JA 1HKDA 1DBNA 4RA0A 1LGNA 4HZWA 3OY8B 4ZKTB 4H52A 4FPJA 4YG0A 2SILA 2ZGNA 3M1HA 4M3CA 4AGVA 4UW3A 2E51A 2NYYA 1RINA 4WV8A 2JDZA 2D6PA 2ZB6A 4HZXA 5IT6A 1KJRA 3VKOA 1BJQA 3W09A 3UL2A 1JN2P 5HCBA 4DS0A 2EXIA 4XZPA 2P34A 4BLJA 2E7QA 2GMPA 3A4UA 1N1VA 3OJBA 5CB7A 4MJUA 1ULGA 4GALA 3TAYA 2DVGA 4MWRA 2CNAA 4MC7A 3RG0A 3TI5A 2A6YA 2AGSA 4B7MA 4M4NA 1IKPA 1V6IA 2C5DA 1BYHA 4XXAA 4FP2A 1W21A 1IS6A 1V0ZA 4LBQB 1IS5A 3WUDA 3UJOA 1BKZA 1LHNA 2ZGRA 2WQZC 3AJYA 1I3HA 1ULEA 3PVOA 4YLZA 2HT7A 3UJQA 1V0EA 1V6OA 4YG6A 2QWBA 2F26A 3M3QA 4GZQA 2DV9A 3IM0A 1KDKA 1E8TA 1SNTA 3WG2A 1SBDA 2D3RA 5IK7A 4YZ5A 1W8NA 3SILA 2OUHA 3A72A 3ZXJA 1IKQA 4HANA 4GEZA 1SCRA 1LENA 3A0KA 1VAVA 1SLLA 1AXZA 3TI6A 4XXPA 5EWSA 3C2UA 5KXCA 2GMEA 2W39A 4AVSA 5CBLA 3VKLA 1Z78A 1LEMA 5DZFA 4FPOB 4M3CF 3ZYPA 2AUYA 2SIMA 2R1DA 3U4XA 2BERA 1FV3A 3TB0A 1KJLA 5JYYA 2QWCA 5DUUA 2HTUA 1AXYA 1LGCA 4Q27A 4GB1A 4UW5A 1H9WA 4CPOA 3BOPA 4XDQA 1V6MA 1V6LA 1FYUA 1NCDN 4AGRA 4DRRA 2W08A 2CYFA 2PHTA 4YGBA 3ALXA 2QWAA 3O0XA 2HTWA 1NCCN 2YXSA 1S0GA 2Z42A 3AZYA 2HTYA 1AVBA 4CPNA 4B7QA 1VLNA 3IPVA 4FPKA 4TZDA 2A3YA 5GLUA 3M3OA 5T5PA 1LHOA 3OYWB 1NMAN 2QWEA 1LOAA 2ZHNA 4DPNA 2F12A 3H6JA 1A3KA 4CPMA 1D2SA 3VKFC 3VV1A 5T55A 2DUOA 1Z50A 2AEQA 1G9BA 1GZWB 2HT5A 3AJZA 2CTVA 1VCUA 2XZKA 3RMYA 1GNZA 2DYCA 3IN9A 3WG3A 3RQ0A 2VVZA 3K36A 4YGCA 1JYCA 1ULDA 1W6QA 3WDUA 4R9BA 5GZDA 4AYUA 3WZ1A 1H9PA 4DQAA 1N3OA 4MZAA 4AVVA 2CMLA 1JHNA 5JOZA 5T5JA 2PHWA 2GDFA 1UL9A 1WCSA 4Q2FA 1XOGA 4WA4A 4PQ9A 1OQ1A 1Y7BA 3SNMA 1R1ZA 2ZGKA 3CL0A 2P3IA 4LBJA 1W6NA 2D6LX 3N3HA 4BMEA 2EALA 1USXA 1A4QA 1IVDA 2VW0A 4P14A 2B8HA 1GZ9A 1FV2A 1W0OA 2XZJA 3TI4A 3WHTA 1AJOA 4WEGA 1FNYA 3MW2A 4ZXKA 5JLVA 5EYXA 1GANA 5JVVA 1QKQA 1Q8VA 4XMIA 1DQ4A 1LOEA 1LU2A 3KQRA 1PZ8A 3JUUA 1LJ7A 2WT0A 1S0DA 1BQPA 5DUWA 1KRIA 2UWBA 4HIZA 1A78A 5B2CA 1NNCA 3AXEA 4YW5A 4MWJA 4XBLA 3OBRA 2C4LA 1DLLA 1DHKB 2SBAA 3AP4A 3I8TA 2BQPA 1MVQA 1SBEA 4P9WA 2R0HA 2ZBJA 4D8SA 5T5OA 1DFQA 1V6KA 1JUIA 1G9CA 2VK5A 2QWGA 1A4GA 1A8DA 5FRAA 1LU1A 4M01A 3OY8A 3A0NA 1Z4WA 1MS0A 2YROA 1V6JA 2W5NA 3USUA 3D4KA 3ZXEA 2AREA 1HQWA 4ISQA 3MPPG 5KXBA 4QN6A 1QNWA 3AFKA 4YGDA 3L2YA 2QWIA 2HYKA 2ZHMA 4NC5A 1V3EA 2PHUA 5SV8A 2GNBA 1A14N 2ZHLA 3DGTA 3D12A 3N36A 3W59A 3SANA 1KQRA 4K20A 5DG2A 1B9SA 4HZVA 1CN1A 3SISA 4ISRA 1LESA 5F9TA 4FPLA 4M4VA 1W6NB 4LBQA 1NMCA 5L73A 3VUOA 3O0VA 1KDMA 3AX4A 2ES3A 3H72A 4K21A 2UWAA 4K1KA 2RHPA 1Q8OA 4H53A 1MS9A 4YM1A 1ULFA 4CTEA 1IVGA 4X49A 2ZGLA 3GNEA 1H30A 4BMBA 3AZVA 1UN1A 3ZVXA 2QWJA 2YA6A 2WT1A 1AF9A 4WZFA 1IVCA 2GNTA 2DVAA 1CPNA 3B3QE 1PZ9A 4DGRA 2YA8A 2NM1A 3FBYA 2F24A 3R4SA 1CVNA 2DTWA 4Q1RA 2D6KA 2AR6A 1N47A 4XHXA 2ERFA 1O4YA 2EXJA 4GZPA 4MWLA 1CPMA 3TI8A 1QOOA 1G9FA 2W52A 1QNYA 2HU4A 2ZABA 1W8OA 2ZGUA 3GALA 1NNBA 1IOAA 1AX1A 4YZ2A 3USUB 4Y22B 5KXEA 3T1MA 3GVJA 1DYKA 4YM2A 2ZGOA 3TICA 3TIAA 4YW4A 2NZ9A 3AYAA 2ZMLA 2WNEA 2R16A 1SLCA 2HT8A 1S0EA 3HN1A 4WVWA 3WDYA 3B69A 3ILRA 1LHVA 4SLIA 4YW1A 4XTPA 4ASMB 3HMYA 1SACA 1WD3A 4ATFA 1LOGA 1WW4A 4UF7A 5GLTA 3OYWA 5JMCA 3WDTA 1YXWA 1SO7A 4LBNA 3SH3A 1U0AA 3OBTA 3PJQA 2A70A 1W20A 1GZWA 4BOWA 1LEDA 1INXA 2NN8A 4FOVA 2GALA 4FZHA 1QU0A 4QN7A 2R49A 1G9DA 1GV9A 4M3MA 4LBLA 2OW4A 4KS3A 1ZM1A 4GWMA 5GM0A 1V6NA 1WLDA 4P9XA 1EPWA 3NV1A 2DUQA 1WW6A 2LTNA 3ZXFA 4XOGA 2NP0A 4XJQA 2EXHA 4CPLA 1MS5A 5DXDA 5T54A 3NWKA 2UWCA 2QWHA 3TIBA 3I4IA 4XTMA 1CONA 1QDCA 5LK5A 4BM8A 1QDOA 1Z0HA 2HTVA 2PHXA 4Q6KA 3K39A 1FAYA 4W65A 2VUAA 1URXA 4FPCA 2D43A 1LULA 1S0CA 2E6VA 4XJ8A 2ZKNA 1SLBA 3ZXLA 1W6PB 1Z4YA 1IS4A 4KBBA 4MWUA 4H55A 1NSDA 1OFSA 3AZWA 3GVLA 3V0AB 2FMDA 1F8DA 1TEIA 2JJ6A 3RS6A 3SLIA 1VIWB 2A6WA 1V2IA 5GJ6A 4MWXA 1ENQA 1LOBA 1G8WA 3N7KA 4DRVA 1Q8PA 4JC1A 4XBQA 4XILA 4LBKA 2SLIA 2ZZJA 1Q56A 4K1JA 3JU4A 2D3SA 4YGEA 3WLUA 4YG3A 4FQZA 4FPYA 3WVJA 2NMNA 2GMMA 2VH9A 2RKCA 3OGGA 4AGGA 2CY6A 1QF3A 1IVFA 4JCKA 2ZMKA 4HZYA 3CKZA 4UW6A 2WT2A 4XJZA 6NN9A 1YIFA 3R4UA 3B00A 1INVA 3W58A 2E7TA 3BODA 4BLIA 4M4UA 5DUXA 4GZWA 1CIWA 4YM0A 1VALA 4Y1YA 4FP3A 1BZWA 4Y1XA 4YW2A 2JD4A 1X50A 1FNZA 3M3CA 3GVKA 1SLAA 5CAZA 4Y20B 5HCFA 2ZMNA 1V00A 1F5FA 1NSCA 1LOCA 4FJ6A 1INFA 3SALA 4Y1UA 1FATA 4GJTA 3MW4A 5DZGA 1N1SA 3ILFA 1N1TA 4QN3A 4U2AA 2A6VA 1XOEA 2A3XA 1OKQA 5NN9A 1B9VA 2AYHA 3T2TA 1MZ6A 1WBFA 2GNDA 2YA4A 2G4IA 3CNAA 3WCRA 4DFSA 1WLWA 3WDVA 1DGLA 2E53A 1F9KA 1INYA 1JXNA 1HDKA 1DQ0A 2HTRA 2A75A 4HZZA 1ENRA 4HL0A 5GZFA 3V65A 3APBA 4XBNA 1BJIA 2QWKA 3INBA 4NCSA 5T50A 2DWRA 1CESA 2ZB5A 5E89A 5M1ZA 1HLCA 1N3QA 4FPHA 3QCWA 5HX0A 5H9PA 3FUQA 4GDIA 5GZCA 4C1XA 2W5OA 2BZDA 3ILNA 1W6OB 4PBPA 2VK6A 3N35A 4Y22A 3R05A 2VK7A 5EYYA 4FPGA 3CYEA 3ATGA 1MS1A 1Z4VA 5IK5A 2WLQA 1B09A 1EUUA 1GICA 1V0FA 2JE9A 2ZHKA 1NN2A 4FVVA 2P3KA 4GXLA 1UX6A 4CRQA 3K3AA 1D0HA 5HUNA 3ZPYA 3WOGA 1QMJA 1INHA 3FUOA 4GDJA 3ZSMA 2VWDA 3N7LA 2JE7A 1DQ2A 3RSJA 2GNMA 1S0FA 4K1HA 2AH2A 2VXRA 2D6OX 5HCAA 4XMAA 1AZDA 2GN3A 1RITA 1ENSA 2YDTA 1APNA 4LBOA 1VCJA 2ARXA 4GZSA 1V3CA 2AEPA 5DUVA 1ZA4A 2YY1A 2PELA 3HR9A 1C1FA 1CJPA 4QN4A 5GZEA 4GZOA 2GN7A 4MX0A 3V0BB 3KM5A 3NSSA 2P2KA 1L7HA 3K38A 4D69A 2R0FA 2V73A 1AX0A 4MJVA 3H71A 3B9CA 2D7FA 4LBMA 4XIKA 3B01A 3VKMA 1UKGA 5BYNA 4BBWA 1F8EA 4B7NA 4CPYA 4YW3A 1DIWA 5GLZA 2A6XA 1MVEA 4OZXA 4YZ3A 2ZA9A 5F5QA 4L8QA 2ZGPA 3WG4A 1YO8A 2JKBA 1E8UA 3FLPA 1V3DA 3JU9A 4QN5A 4XJWA 4Y26A 2VW1A 4PBOA 1CQ9A 4Z8BA 4BQ1A 1V3BA 1UPSA 1BXHA 1DYPA 5IK4A 1LGBA 1MS3A 2YV8A 2DURA 1AX2A 4XIOA 1WUVA 4MWWA 1LTEA 1GKBA 1S1AA 1S0IA 4NOTA 1W6PA 2BF6A 3ENRA 3WDWA 3PVNA 2CL2A 3O12A 1YI7A 1MS4A 1G7YA 3V0AA 3RMXA 2WSVA 1B9TA 3DUIA 4XHBA 1YRZA 5H9QA 1WW5A 4YFZA 1EUTA 4JF7A 2ZGMA 1IVEA 1ONAA 1GYKA 1WD4A 4GA9A 4FOQA 2TEPA 4Q26A 3UK9A 2A7AA 4R9CA 3AYCA 1HQLA 3CL2A 1SBFA 4GZTA 2PHFA 3AYDA 1MACA 1SLIA 1XQNA 5EXOA 2VY0A 2F25A 5HUKA 2CWMA 3WDXA 2ENRA 3D5OA 3AP6A 1QGLA 4F83A 3H73A 4LBQD 2B7YA 2DUPA 2EF6A 2F10A 4FPEA 3WUCA 4K3YA 1DQ6A 2ZGTA 4MWVA 3O9JA 1PZ7A 1SFYA 3BTAA 4CZSA 4Y24A 1INGA 2YA5A 4GZXA 3MEPA 2YA7A 4KS1A 4MYEA 1JYIA 2DU1A 5CNAA 1SCSA 3LSDA 1NSBA 1N3PA 3INAA 2DVBA 1Z4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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