1MZ6A

Trypanosoma rangeli sialidase in complex with the inhibitor dana
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
630
structure length
620
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVATADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVMDATVIVKGNKLYILVGSFNKTRNSWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVGSNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDGNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQQDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRFIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPGAPTDSRVTVTNIVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis of sialyltransferase activity in trypanosomal sialidases
pubmed doi rcsb
molecule keywords sialidase
molecule tags Hydrolase, hydrolase inhibitor
total genus 161
structure length 620
sequence length 630
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2002-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1mz6A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1mz6A01
1Q8OA 3AJYA 1ULFA 1NN2A 3K37A 1FV2A 3OBTA 4X47A 5HX0A 3RS6A 4LBQA 2DTWA 1VCUA 3POSA 2JDZA 3HN1A 4GKXA 3T2TA 5HUKA 1MWEA 4L8QA 2HT5A 1UAIA 3D4KA 1SLLA 4XHXA 3R4SA 4JCKA 3WNXA 3N3HA 1KRIA 4GDIA 1S0JA 1MZ6A 4Q8KA 3CNAA 3OY8A 1W21A 4H52A 2ENRA 5HCFA 3V0AA 4XJQA 3LSDA 3AJZA 4M3MA 4YW2A 3M3EA 2R0HA 4Z8BA 1Q8PA 3V0BB 1JHNA 1H9WA 5E88A 2ZMKA 2ZGRA 2VK7A 4PF5A 2AENA 4ZXKA 1BQPA 2D6OX 3AYDA 1EUSA 3WV6A 2CTVA 4WZFA 2D6NA 2HYKA 2HT8A 3KQRA 2UWBA 1Z4YA 1MS0A 3Q9OA 2SILA 1SO7A 1D2SA 4HANA 4YW1A 2QWCA 1QNWA 3RMXA 5GZEA 2GDFA 1AX2A 4XE9A 1SCSA 2F26A 2VW1A 3WG4A 3SILA 1VALA 3H71A 4I30A 1NNCA 1NSDA 3K36A 1D0HA 4PBOA 2PHTA 1Q8QA 3JU9A 4M3CB 2B7YA 2QWEA 3N7MA 3PVEA 2YA7A 2ZGLA 3K3AA 5DXDA 2EIGA 1DLLA 1BJIA 1AXKA 1NMCA 2GNBA 1KDKA 2H0BA 4FPHA 1WD4A 2PHUA 3T1LA 4K1JA 1URXA 1H30A 4ATEA 1L7FA 2LALA 2PHWA 1G9CA 2E7TA 3MW4A 4H53A 2A75A 1LODA 2C4LA 5EWSA 1QOOA 1QOTA 2PHRA 2WT0A 2XZIA 5GJ6A 2WT2A 2VVZA 3ZXEA 1FATA 1W0OA 4RL7A 1ENSA 3POYA 1QU0A 1INYA 1IS4A 2YZ4A 3USUA 1NCBN 4M01A 1LCLA 1LGNA 5T55A 5T50A 1F8EA 4YZ2A 5T5PA 1HDKA 3OGGA 4Q2FA 2CYFA 2JKBA 4Q8LA 3ZSKA 3AP6A 1HLCA 3HMYA 3OY8B 4GZSA 2A6VA 4ATFA 3V0AB 2F10A 4QN3A 4GXLA 2UURA 2F25A 1GNZA 4NOTA 2W38A 3NN9A 2X9MA 3M3OA 5H9RA 5GM0A 4YGDA 2UU8A 4YGCA 3UJOA 5EYXA 2A7AA 2DVFA 2JECA 1AJOA 4AWDA 3N36A 1A4QA 3WVJA 4P9YA 3VKMA 1WCSA 2VK5A 4CRQA 1BKZA 1W6MA 2A6XA 4R9DA 2ZGUA 2OW4A 4MZAA 3TAYA 4M3CE 3UJQA 7NN9A 2SIMA 2A5ZA 3GNEA 2WQZC 4YFWA 2BQPA 3WLUA 5IK4A 3O9KA 1LEMA 1FV3A 2VSKA 5FREA 1IOAA 3H0OA 1E8UA 1W6PA 1NMBN 1IKPA 4X4AA 4K1KA 1I1EA 4FQ4A 1ULDA 4FPCA 4XTPA 4XJAA 3ALXA 3AYCA 1SNTA 1N1YA 4Y1VA 2R0FA 1GYKA 1OKQA 1KJRA 3ZSJA 2OVUA 1LOAA 1AX1A 5JMCA 1O4ZA 1F31A 2ZGTA 2D3RA 1AVBA 3D5OA 1LOFC 1C1FA 1LECA 4BMEA 4K1IA 1MZ5A 2AEPA 4QN6A 3FFZA 3CL0A 4GZXA 2VXRA 2ZGMA 5DUUA 5GZCA 4FP2A 4XJ9A 3A0KA 3A4UA 2DU0A 4Y1XA 4Q1PA 5DUXA 1GLHA 4WVWA 4NCSA 2HTRA 1JYCA 3USUB 2YA6A 3NV3A 1W6OA 4Q27A 1EUTA 2VW0A 2KM2A 4IQPA 2EF6A 1GANA 1UMZA 1A14N 4B7JA 1MS9A 1QF3A 1L7HA 1W6QA 1WBLA 3D12A 3ATGA 4Y1UA 4FPGA 1U0AA 4KBBA 3M3CA 4DRRA 1S0IA 5H9SA 4WA5A 3V0BA 2V5YA 4YW4A 1A8DA 5CBLA 2WJSA 4K1HA 4MWYA 3ENRA 2ARBA 2NMOA 2AREA 4GDJA 1CPNA 5T52A 1S0EA 1KITA 3SH5A 1WW5A 3MPPG 4D69A 2CWMA 5GLTA 1W6NA 1G9DA 3IKWA 5T5OA 4GZOA 4K3YA 1AJKA 1UPSA 1WD3A 5IT6A 4MYEA 4HZZA 4GZQA 3IM0A 2Z42A 5GLUA 3WHTA 3SISA 5BYNA 4FPOB 1IVDA 1GICA 1LULA 3TI3A 4XJWA 1Z4VA 3QCWA 2ZA9A 2EXKA 1INGA 2DVBA 1X50A 1BJQA 5KXBA 4YZ1A 3ILNA 3SANA 2ZZJA 4YM2A 5KXCA 1JN2P 4LBKA 4XJ8A 3WHUA 3RG0A 1V0EA 1ULGA 3V65A 2YA8A 3SH3A 1DYPA 2F28A 2HTUA 2Q5TA 1INHA 5JOZA 3IPVB 2HTYA 4WA3A 2JD4A 4MWUA 4XDQA 4KS3A 4UW6A 2OUHA 2CWSA 4U2AA 2ZABA 2WT1A 4HL0A 1W20A 2NYYA 2NP0A 1CJPA 1V6KA 3VKLA 2G4IA 2NN8A 3AXEA 1IS3A 3TI5A 2BF6A 1W8NA 1WW6A 4AVTA 4YGEA 1G9BA 3AXDA 3RRDA 4BM8A 1W6OB 2B8HA 2DUPA 1JW6A 1RINA 1S0FA 1WW4A 1SCRA 4B7RA 1V6IA 3VUOA 2EXIA 1MS5A 3PJQA 3IMNA 4F83A 1B9VA 1W6QB 3SLIA 5M1ZA 4TZDA 2F13A 5JLVA 1N1VA 1F8DA 3WDWA 1V3EA 4MJVA 2VU9A 3SNMA 1JOJA 2SBAA 4Y22A 1ZM1A 5GZFA 2QWBA 1FNYA 3DUIA 1IVCA 4K1YA 4YZ5A 4XXAA 2FHRA 1F9KA 1LEDA 4YW5A 1W6NB 1INWA 1USXA 1A3KA 3WDVA 3N7KA 1ULEA 1SBFA 2GNMA 3ZXJA 1Y7BA 4B7NA 5IK8A 1NXD1 4YZ3A 3L2YA 1DIMA 5SV8A 3RQ0A 5H9PA 5IUQA 2EALA 4FPJA 3D11A 3RSJA 3MW3A 3B01A 5HUNA 3BEQA 1WW7A 5T5LA 3TB0A 4WVVA 1LOGA 1QDCA 3UK9A 1V00A 1BYHA 2DTYA 1NLSA 1JBCA 1S0BA 4LBQD 4FPLA 1NSCA 3WDXA 1AF9A 3TI6A 1YYNA 4YM3A 3I4IA 3PMEA 3ILFA 4AGGA 2ZACA 1A4GA 2D6PA 4FOYA 4X49A 1G8WA 1F8CA 2ZGKA 4P14A 4M4UA 4HZXA 2P3IA 4K20A 5DUWA 5AVAA 1MVQA 4XJZA 1J1TA 4AVVA 3LSEA 2CL2A 5DZEA 1F8BA 3A71A 1H9PA 3AZXA 1F5FA 4HZYA 4M4VA 2P37A 2R1BA 1W8OA 1LHOA 3AP4A 2QWAA 4MC7A 3ZYRA 5GZGA 2VH9A 4R9AA 1UZZA 3O0XA 1IS5A 1ZA4A 1LHNA 5E8AA 2YDTA 1DQ6A 1LGBA 1N3QA 4Y22B 2P3JA 3CL2A 4XBNA 1ENQA 4YG0A 4C1XA 4GKYA 1Z4WA 6NN9A 2JJ6A 4FZHA 1G86A 5B2CA 4XTMA 2PELA 2ES3A 5CA6A 2GMEA 1XOGA 4JRAA 4QNPA 2D6KA 1LJ7A 2GMMA 1NCAN 1JXNA 2D44A 3ZXLA 3TIAA 1B9TA 4ASMB 1RIRA 1IKQA 2VW2A 1LTEA 4U36A 2ZBJA 4LBOA 1Z78A 4WEGA 2XG3A 3MW2A 2D7FA 3U4XA 4FOQA 1LHVA 2CY6A 4AGVA 4NO4A 1QGLA 1EURA 4DQAA 1SBDA 1ULCA 1QMJA 2SLIA 2A71A 1AZDA 4ISRA 1V6MA 4QN5A 3R4UA 2HU4A 3M2MA 3HR9A 3H73A 1ENRA 2P3KA 2ZMLA 2QWJA 3SALA 1LOFA 2HTVA 1IVFA 2A3YA 1UL9A 3RMYA 2P34A 4KS5A 1LENA 1YO8A 3WG1A 4GEZA 1Z4ZA 2CNAA 1LHWA 4NN9A 2ZGSA 3IPVA 1Q56A 2DVAA 1GZCA 5GLVA 2GMPA 5GLWA 1TEIA 2QWKA 3IN9A 1XOEA 4FOWA 5F5QA 5JVVA 2BERA 1RITA 3N7LA 4FJ6A 1NSBA 3FLPA 4MWRA 1CESA 1V0ZA 1V6OA 5T54A 3AZZA 4Y24A 1GZWB 2HTWA 3ZPYA 4Q6KA 1UN1A 4MWLA 1FNZA 4SLIA 1IVEA 2RKCA 2V73A 5CNAA 1INFA 4YZ4A 1N3OA 4XBLA 4BOWA 3CYEA 3PVOA 3LCPA 4LBLA 2GN7A 5IK7A 5HUGA 3AYEA 2F11A 1DGLA 3AK0A 4D8SA 1BZWA 1CPMA 1SBEA 1YIFA 3AP7A 1R1ZA 1VAVA 2NZ9A 4R9BA 3FBYA 1C1LA 1Z50A 3TI8A 1IVBA 3BTAA 2F29A 1APNA 1NNAA 2ZB6A 4ZKTB 2ZMNA 3BIWE 4DS0A 2ZAAA 2ZHNA 2EAKA 3N7JA 1SACA 4UW4A 1NMAN 1CONA 3R05A 4Y20A 1V3BA 2BZDA 4XIKA 2ARXA 4GZWA 3O9JA 2WKKA 3WUDA 1MACA 1YI7A 2ZGOA 2WLQA 2D3PA 1N1TA 1IS6A 1V6JA 1UKGA 2EXJA 1CQ9A 3NV1A 3AP5A 2EXHA 2WSVA 4C1WA 1DQ4A 2XB6C 4FPEA 3INBA 4UW5A 1A78A 1MS8A 5EYYA 3VKNA 3TICA 4FP3A 4DPNA 4MX0A 3INAA 3GVLA 3A0NA 3H72A 2YDPA 4GA9A 2ZHKA 3ASIA 2A6WA 2ZB5A 1AX0A 2A3XA 4FPFA 1I3HA 4P9WA 2E7QA 2AGSA 4YM1A 5KXDA 1GKBA 2DUQA 4Q26A 4CPYA 1VAMA 1V6NA 5JDBA 3NV4A 1LGCA 3SH4A 1HKDA 1Q8VA 4X6KA 5CAZA 3VV1A 2DVGA 4XMIA 2XZKA 1GV9A 3D6EA 4KS4A 1KDMA 1EPWA 5L73A 2NM1A 1DILA 3OJBA 2F0ZA 1CVNA 4H55A 4CZSA 2UWAA 2P2KA 1WCQA 1QOSA 5DG2A 2I2SA 4AYUA 4I00A 4MZEA 1V3CA 3C2UA 2A6YA 2W68A 1DQ1A 2F12A 4J9TA 2E6VA 1CN1A 2D3SA 3JUUA 3NSSA 4GZPA 2FMDA 4PQ9A 4YFZA 1DQ5A 3FUQA 1PZ8A 4YLZA 1Z0HA 1MS1A 4BMBA 4HIZA 4BPZA 3K39A 1OFSA 3VKFC 2W5OA 1G9AA 3VKOA 3W58A 1VCJA 4UF7A 2XZJA 2AYHA 5IK5A 4GZTA 3AZVA 4Y1ZA 4Y20B 2DVDA 4YG6A 2GALA 1V2IA 4TYSA 5GLZA 4MJUA 3WZ1A 2R1DA 3B7EA 2GN3A 2NMNA 1LOCA 4M3CF 1XQNA 2ZGNA 1B09A 4GALA 1KJLA 4GWMA 1BXHA 2VUAA 1FAYA 3B9CA 4CPLA 5H9QA 2VK6A 3BOPA 4CTEA 4BLIA 5FRAA 3DGTA 2W5NA 4MWXA 4XJRA 2W08A 5GALA 2A3WA 1WLCA 4ISQA 4HZVA 4PCRA 1S0CA 1N47A 1O4YA 4YW3A 4XHBA 1G7YA 1MVEA 2ZHMA 1NCDN 2RHPA 4GJTA 4Q1RA 1DIWA 4W65A 1PZ7A 3ZSLA 1GZWA 3APBA 1INXA 3OPZA 1DYKA 1YRZA 4CPOA 1S0DA 4R9CA 2PHXA 4AGRA 1SLAA 1Q8SA 4LBQB 4QN4A 1KQRA 4CPNA 1LHUA 3I8TA 3O12A 2OUJA 3ZVXA 1N1SA 2PHFA 4BLJA 1ONAA 4MWQA 1MS3A 5DZGA 1USRA 4LBJA 2UWCA 4CPMA 4XMAA 3WOGA 2AUYA 3WG3A 4JF7A 2LTNA 3FLTA 1QNYA 2YMZA 3AZYA 1GNHA 3TIBA 1IVGA 1V6LA 4WV8A 1B9SA 4OZXA 2QWFA 1DFQA 3NV2A 3T1MA 3OYWA 2DYCA 1HQWA 5NN9A 3GALA 1SLBA 3GVJA 2E51A 1N3PA 4MWJA 4KS2A 2ZHLA 4M4NA 5HUMA 1VLNA 4DRVA 1Z4XA 4FQZA 2VSMA 1QKQA 3AX4A 4XIOA 4XJUA 3ILRA 1S0GA 3M3QA 1INVA 2W39A 1DBNA 4NC5A 1GBGA 3ZYPA 1UX6A 2YA4A 5E89A 4P9XA 3QLQA 4K1ZA 1DZQA 3WDUA 1NCCN 2DU1A 2YA5A 5DG1A 1DHKB 1DQ2A 2VY0A 1LOEA 4WEFA 5JOWA 2QWGA 2JE7A 2GNTA 5JOYA 2D6MA 4GWNA 1DQ0A 2AEQA 4FPKA 3AP9A 2VWDA 1W0PA 4UW3A 4BBWA 4AVSA 5GZDA 1SLIA 5T5JA 3A72A 4HZWA 1CR7A 2BATA 2W20A 4Y1YA 2ZGQA 5JOXA 2R49A 5HCBA 2YROA 3GVKA 4XZPA 5HCAA 1EUUA 4JC1A 2E53A 1AXYA 5JYYA 3MEPA 2C4AA 4CPZA 2W52A 3ZXKA 2QWHA 2QWIA 1L7GA 2F24A 1WUVA 2DV9A 4QN7A 3AZWA 4FPYA 3O0WA 4M00A 3NWKA 3ZSMA 3JU4A 1MS4A 1LESA 1QDOA 4KS1A 1SLCA 3B3QE 4LBMA 3B69A 1SLTA 3H6JA 4LBNA 2YXSA 1W1XA 3TI4A 2D43A 1C4RA 3WCRA 5LK5A 1CIWA 4DGRA 1PZ9A 2ZGPA 2C5DA 3W59A 3V64A 4DFSA 2ERFA 4FOVA 2HTQA 1YXWA 4RA0A 3WCSA 5KXEA 1WBFA 3OYWB 3AYAA 4XOGA 2DWRA 4YM0A 1UZYA 2JE9A 3SITA 1JYIA 1NNBA 3WG2A 3PVNA 3B00A 2TEPA 3ZXFA 3FUOA 1S1AA 1WLDA 1E8VA 3W09A 1W6MB 3OBRA 1E8TA 4FVVA 2HT7A 2C9AA 2F27A 1OQ1A 4MWVA 3WDYA 2WNEA 1C57A 1V3DA 3K38A 1FYUA 3O5SA 3N35A 4XBQA 3O0VA 2DURA 3KM5A 3WDTA 4GB1A 2XCYA 3UL2A 1LOBA 4M3CA 1W6PB 1WLWA 2QWDA 4XILA 2D6LX 4FVKA 2A70A 3CKZA 4PBPA 3WUCA 5DUVA 4WA4A 3AFKA 1GSLA 1LU1A 4YGBA 5F9TA 4Y26A 4B7MA 4K21A 1FX5A 4XYXA 2YV8A 2WSUA 3T1EA 3POWA 3FLRA 1MR5A 1AXZA 1JUIA 2ZKNA 3M1HA 5DZFA 5B2DA 1VIWB 2R16A 1V0FA 2AH2A 1SFYA 2GNDA 4XXPA 4BQ1A 1HQLA 2YY1A 3ALWA 1LU2A 1G9FA 3BODA 5EXOA 1GZ9A 4YG3A 4B7QA 2AR6A 4MWWA 2HU0A 2A6ZA 4ITCA 2DUOA 5CB7A 2CMLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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