1MZ6A

Trypanosoma rangeli sialidase in complex with the inhibitor dana
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
630
structure length
620
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVATADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVMDATVIVKGNKLYILVGSFNKTRNSWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVGSNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDGNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQQDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRFIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPGAPTDSRVTVTNIVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis of sialyltransferase activity in trypanosomal sialidases
pubmed doi rcsb
molecule keywords sialidase
molecule tags Hydrolase, hydrolase inhibitor
total genus 161
structure length 620
sequence length 630
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2002-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1mz6A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1mz6A01
3SH4A 1QU0A 1BJIA 3M3OA 5HCBA 3FUOA 4XBLA 3VKOA 1G9BA 5EYXA 3FBYA 2ZBJA 3WG1A 3W58A 3RG0A 3NSSA 2D6PA 5CA6A 5KXDA 3QLQA 2VSMA 1MWEA 1V0EA 3BEQA 5KXCA 1JW6A 3VKLA 3MW3A 5E89A 2WT1A 4UW5A 3UK9A 2JE9A 1F8EA 1L7FA 2YA6A 2YZ4A 4UW6A 5JOWA 5T52A 2PHRA 4FQ4A 2DVDA 5H9PA 1NNAA 5L73A 2SIMA 2ARBA 4K1KA 2UWAA 1WBLA 4M00A 2AR6A 3ZSKA 3K36A 1W8OA 3I8TA 4JCKA 5DG1A 1LECA 4MWYA 3WG3A 2HYKA 4XHXA 2HTWA 2GMEA 4XE9A 5T5PA 4XJUA 4FPGA 2ZGNA 3SALA 4HZWA 1AX0A 4LBJA 1N1VA 1S0IA 3FLPA 2W38A 4HANA 5CB7A 2NMOA 4FOVA 5KXEA 2YDTA 1S0GA 4KS3A 1E8UA 1ULFA 2F24A 4ISRA 4MYEA 3AZWA 3JUUA 1SCSA 3KM5A 1QKQA 1LESA 4WA3A 2W08A 3WV6A 1SO7A 1C4RA 4K21A 5GZFA 2YA7A 5CAZA 1CIWA 3R4UA 4QN5A 3ALWA 1O4YA 2NN8A 3O5SA 4AYUA 3UJQA 3TB0A 1Q8SA 1KJLA 3GALA 2VWDA 2X9MA 2GMPA 4YFZA 1PZ7A 1ONAA 2NMNA 3ILRA 1YI7A 4XOGA 4JC1A 4XBNA 2JKBA 3D11A 1LEMA 1Z4XA 4XXPA 3NV2A 2BZDA 1DFQA 1W21A 1N1YA 1DQ1A 3H0OA 4XTMA 1W1XA 1CN1A 1Z4ZA 3M3CA 2CY6A 4YZ4A 5H9RA 1I3HA 1H30A 2DURA 2R1BA 1W0OA 2XZJA 1W20A 1NMAN 4LBKA 4M3CE 4YW3A 2ZKNA 4QN3A 4RA0A 1CONA 3AZXA 1GZCA 3AP4A 1LHNA 4LBNA 2KM2A 2F13A 3WDVA 1AF9A 2D6KA 3LSEA 5B2DA 3JU4A 4CPYA 2RKCA 5GZCA 3ZXFA 1L7GA 1QF3A 5GZDA 4XBQA 3RS6A 2PHXA 4XYXA 5JOYA 1BKZA 2JD4A 3UJOA 2WT0A 1Z78A 4GKXA 4MWJA 1LJ7A 2DYCA 2WQZC 5DUUA 4YW5A 1U0AA 3WUCA 2AENA 2EIGA 1F8DA 3WG4A 1SACA 4Y1YA 2YA8A 3D5OA 1BXHA 3USUA 2GALA 2QWKA 5GLWA 1GNZA 2D3PA 2P3IA 4KS1A 2YROA 5HUKA 3A0KA 4MWLA 1KQRA 1W6QA 3BIWE 1GYKA 1WW6A 3K3AA 3ZSLA 4D69A 2ZGOA 5DUVA 5DUXA 2D6NA 2ZA9A 4MZAA 4HL0A 4H55A 5JDBA 3V0BA 1DBNA 1UMZA 4YZ5A 2FMDA 4YFWA 1MS9A 3NV4A 3AJZA 3N7JA 1EUTA 2ZHKA 1Z0HA 2VXRA 4XDQA 4GZSA 1VLNA 2A6YA 3BODA 2WSUA 3AP6A 3SISA 2ZGMA 1B09A 3VKMA 1KRIA 5IK5A 2ZZJA 4FPHA 3PVOA 3ZXEA 2SBAA 4HZZA 1GBGA 4Y1UA 1O4ZA 1Q8VA 2A6VA 4U2AA 2HTYA 4XJ9A 2F11A 2A75A 2ZHMA 2P3KA 4KS5A 2QWJA 4FJ6A 1W6NA 1HDKA 1UN1A 2R1DA 1LOCA 4FOWA 4AGRA 2YDPA 1V6LA 3IKWA 5BYNA 4P14A 1LOEA 2WKKA 2GNTA 3INBA 3RMXA 4J9TA 1B9TA 4XMIA 2JE7A 2VK7A 2QWDA 3SH5A 4AVTA 3V0BB 4DRVA 1HKDA 4BMBA 2A70A 4BLIA 1LOGA 7NN9A 2FHRA 2UWCA 4FOQA 4RL7A 1HQLA 1W6MA 1Q8PA 2GNMA 4MWQA 1S0BA 4Q8LA 4K1ZA 2ZGPA 3TIAA 1J1TA 3FUQA 2AEQA 3LCPA 3U4XA 2RHPA 4WA4A 2B8HA 2VUAA 1WLWA 1VCJA 1DILA 5DUWA 3JU9A 5CNAA 1S1AA 2W5OA 1W6NB 2A6WA 4UF7A 5FRAA 1RIRA 1IVEA 4DPNA 5F9TA 1MVEA 1LHWA 4Q6KA 4XZPA 5AVAA 5EWSA 3AFKA 3AJYA 2D3RA 4FPJA 4XIKA 4AVSA 2HU0A 3B00A 1SLCA 5DXDA 2ENRA 3H73A 1GV9A 1XOEA 5EXOA 3T1MA 4DQAA 3M2MA 3NV3A 4H52A 4BLJA 2QWEA 1PZ8A 4WZFA 4BPZA 2WJSA 1W6MB 1Z50A 3N7MA 3AZYA 2PHWA 3Q9OA 4FPFA 1IS6A 1IS3A 3HN1A 2GMMA 2HTUA 1VALA 2JDZA 1LULA 1DQ6A 5E8AA 3B3QE 1NMCA 1MZ6A 4UW3A 2F28A 3RRDA 4PBPA 1N3PA 1B9VA 2BERA 2DUQA 1ZM1A 1JHNA 4MWWA 1JN2P 4PCRA 4W65A 2DU0A 5NN9A 2ZHLA 4FZHA 1KJRA 2ZGQA 3SITA 1D2SA 2A6XA 1LOFA 1DIMA 3K38A 1ENSA 5SV8A 1V0ZA 4Q1PA 4X47A 2VY0A 3WNXA 3AYCA 1MS4A 3VKNA 3SNMA 2AUYA 2XG3A 3TIBA 2DV9A 4QN4A 2EALA 1LCLA 1MS3A 3D6EA 4Y20A 3M3QA 2ZGLA 3T2TA 2LTNA 2DU1A 4ISQA 2P37A 4F83A 1W6PB 1IKQA 1SBDA 5T5JA 5GZGA 2ZGSA 3WG2A 3ALXA 5T5LA 2HT5A 4B7NA 1A3KA 4XJWA 2EF6A 1N1TA 1F9KA 3ZPYA 4M3MA 2C4LA 1WBFA 4GDJA 4XHBA 1Z4WA 3NV1A 1IVFA 4Q27A 1X50A 2VK6A 1CESA 5DZGA 1PZ9A 1C57A 1WCSA 5DZEA 1INVA 5HCFA 2E51A 1NSCA 1IS4A 4JF7A 4K1YA 2EXKA 1VCUA 2TEPA 4ASMB 3N7KA 2YA5A 4AVVA 4MWVA 4Q1RA 2A71A 1F5FA 4MWRA 1JOJA 2UWBA 2VH9A 2UURA 1LENA 3V65A 4K20A 3TICA 2ZHNA 5GJ6A 4Y20B 1JXNA 4GJTA 3WDXA 4AWDA 3OJBA 3NN9A 1LHUA 4CPOA 1G8WA 3INAA 4GZWA 3R4SA 5T5OA 2PHUA 4ATEA 3A0NA 2A3YA 2GN3A 2D43A 3ILFA 5JYYA 1V3DA 2D6MA 1NSBA 2CTVA 4LBQA 1AXKA 1AX1A 3WDYA 4LBQD 5GZEA 2VK5A 1DQ2A 2E53A 3AZZA 2QWIA 1NCAN 3TI5A 2OUHA 4OZXA 1MVQA 1VAVA 4YGBA 4FOYA 4YG0A 1FNZA 2DTWA 3SLIA 2E6VA 3ZXJA 4FQZA 4MJUA 1E8VA 1N1SA 2A6ZA 3POSA 2F12A 4FP2A 4M4NA 1NCDN 3O9KA 1G7YA 2QWHA 1INHA 1FV3A 2F27A 2ZMKA 3APBA 4GWNA 1WCQA 3N36A 4Y1XA 4NC5A 1SCRA 1Z4YA 2R0FA 2WLQA 4M4VA 5KXBA 1INYA 3H71A 2NYYA 3WCRA 3VV1A 1LGCA 1GZ9A 2BQPA 4NO4A 1R1ZA 4HZVA 3WHUA 4B7MA 5T55A 2DWRA 4LBQB 1B9SA 4MWUA 2SILA 4YZ3A 2F0ZA 4XXAA 4Y26A 1IVCA 2W20A 5H9SA 1BQPA 4K1JA 3OGGA 1USXA 2QWBA 1QGLA 1CQ9A 2WSVA 3OBRA 1BZWA 3N35A 3W09A 2DUOA 1Q56A 4CTEA 3GVLA 3ZXLA 1I1EA 3MW2A 1JBCA 1FNYA 2C5DA 4R9BA 2W5NA 5JOZA 1YXWA 2PELA 5B2CA 1DQ5A 3VUOA 1MS8A 3A4UA 1E8TA 1SLTA 4B7JA 3L2YA 1CPMA 1AJOA 1QNYA 3N3HA 3FLRA 2D6OX 3SANA 2YY1A 3V0AA 1ENRA 3DUIA 5GALA 5M1ZA 1LGNA 4FPEA 4FVKA 4MJVA 2HT8A 4YM0A 4ZKTB 1DYKA 3ILNA 4L8QA 1UL9A 4BBWA 1TEIA 3USUB 1OQ1A 4Q2FA 2CWMA 1EPWA 2UU8A 5H9QA 1EUUA 2OW4A 1EUSA 2W68A 4C1XA 3R05A 3B01A 1W6QB 3TI4A 1H9PA 1H9WA 3SH3A 2ARXA 2D6LX 3PMEA 3I4IA 4LBOA 4QN7A 3NWKA 2OUJA 2ZGTA 4XJRA 3MW4A 2AH2A 3ZVXA 1V2IA 4M4UA 4M3CA 2C9AA 2R0HA 2VW0A 1VIWB 1W0PA 1FX5A 4XILA 2A7AA 3ZXKA 4CPZA 1V3BA 4MC7A 1HLCA 1AX2A 3V0AB 2YV8A 4YW2A 2WNEA 2F10A 4MWXA 1Z4VA 4M3CF 2R49A 3TI6A 1UZZA 1BJQA 2C4AA 4B7RA 4CPLA 1DGLA 3OBTA 1INFA 1A14N 3GVKA 4KBBA 3AYEA 4D8SA 1HQWA 2CL2A 4UW4A 1W8NA 3AP5A 3WDUA 4XIOA 4HZXA 1WW4A 4WVWA 1MS0A 4Y1VA 1INWA 2F25A 1NN2A 1GKBA 3OY8A 3WOGA 5HCAA 3AYAA 4GZQA 4FPCA 1WD3A 3OYWA 3AP9A 2DVGA 1RINA 2ZB5A 1Y7BA 1YO8A 2HT7A 3A72A 1GLHA 2JJ6A 2DVAA 2ZMNA 4KS2A 2AREA 2PHFA 1AJKA 1URXA 2EXJA 2LALA 3POYA 1UZYA 1F8CA 1JUIA 4AGGA 1AZDA 2DVBA 1W6OA 3IPVA 1LTEA 2DUPA 1SLBA 1SBEA 3HMYA 4FVVA 4X49A 2NP0A 1NXD1 4R9AA 4CRQA 1LU1A 2DVFA 2ES3A 5F5QA 1DQ0A 3HR9A 4ZXKA 1S0CA 4CPNA 1IVBA 3T1LA 1V6OA 4GXLA 1LODA 2V5YA 1NSDA 1CR7A 1G86A 3ZSJA 5GLUA 2XCYA 2E7QA 5DZFA 4P9YA 4KS4A 3OYWB 3O9JA 2QWFA 3LSDA 5GLTA 3WDTA 1V00A 1GICA 3O12A 4K3YA 3WLUA 1QDCA 2GDFA 5HX0A 2AGSA 4GZPA 3H6JA 4FPKA 1ULDA 4FPLA 1OKQA 1JYCA 3AZVA 2PHTA 1NNBA 1W6OB 3D4KA 4NN9A 3O0WA 4YW1A 3B7EA 3IPVB 4YW4A 1GSLA 1MR5A 4FP3A 3ZYPA 4PF5A 3ZYRA 3K39A 2VW1A 3POWA 1V0FA 3CYEA 4YLZA 5JLVA 4Q8KA 2EXHA 4XTPA 5FREA 4BOWA 1ULEA 2E7TA 4TZDA 4HIZA 4DFSA 3OPZA 1IKPA 2XZKA 1APNA 4GDIA 1A78A 2HTVA 5DG2A 4GZTA 1C1LA 1VAMA 2QWGA 2CNAA 1NMBN 2HU4A 3K37A 3ATGA 3GNEA 4DRRA 1QOTA 4CPMA 1AXZA 1V6NA 1WW5A 4M01A 2ZGKA 2AYHA 4ATFA 5HUMA 3T1EA 1DIWA 3TI8A 2ZABA 4PBOA 3PJQA 1DLLA 4DGRA 4I30A 4P9WA 1UX6A 4QN6A 3GVJA 1AVBA 1QDOA 1GNHA 1OFSA 4LBMA 3H72A 2ZACA 1UAIA 5JMCA 1KDKA 1CJPA 5T50A 4AGVA 1FATA 3C2UA 2XZIA 3IM0A 1BYHA 4X4AA 1V6MA 1AXYA 1LU2A 1FAYA 5E88A 3WUDA 4Y22A 4B7QA 1GZWA 2CYFA 1QMJA 3TAYA 1N3OA 3AXEA 3CL2A 5IK7A 2HTQA 3MEPA 3RMYA 4GKYA 1FV2A 3AK0A 1NCBN 2A5ZA 3AX4A 2NZ9A 4SLIA 4GALA 1N3QA 2VSKA 4BM8A 1IOAA 4GA9A 2I2SA 4CZSA 1UKGA 4DS0A 3N7LA 1SBFA 3KQRA 2HTRA 1MZ5A 1IS5A 3W59A 4P9XA 1ENQA 1KITA 2F29A 5T54A 5IUQA 1G9CA 2P2KA 2NM1A 5HUNA 2W39A 1Q8QA 3RQ0A 2EXIA 3IMNA 4YZ1A 5CBLA 3B69A 4I00A 1WLDA 2Z42A 1G9AA 2CMLA 2V73A 1LOAA 5EYYA 4Z8BA 1Q8OA 4Y22B 4YM1A 1LGBA 4YGCA 1GZWB 2QWAA 1G9DA 4XMAA 1LHOA 2B7YA 1N47A 4FPYA 1INXA 5IK4A 4PQ9A 4BQ1A 2YMZA 1USRA 1NLSA 3B9CA 1MACA 1CPNA 1DYPA 1IVGA 2ZAAA 4YGDA 1JYIA 1LOFC 2ZGRA 3WCSA 4FPOB 4K1HA 3QCWA 1NCCN 1ULCA 1NNCA 2BATA 2JECA 5IT6A 4LBLA 4XJAA 4YG3A 4YGEA 4GWMA 4GZXA 1L7HA 1WD4A 1ZA4A 4C1WA 2A3XA 3SILA 2G4IA 1CVNA 1S0FA 1QOOA 1YYNA 4Q26A 3AYDA 2ERFA 1D0HA 2F26A 1C1FA 4IQPA 4NCSA 4HZYA 1SLIA 4XJ8A 3FFZA 2EAKA 1IVDA 6NN9A 1S0EA 2ZMLA 1QOSA 1S0DA 4MX0A 4XJQA 1V3CA 2VVZA 3O0VA 3IN9A 4QNPA 4WEGA 2GN7A 3CL0A 1V3EA 4YG6A 4JRAA 5GLZA 4WV8A 4TYSA 3MPPG 4Y24A 1A8DA 4R9CA 1XOGA 1YRZA 3PVNA 1F8BA 4WA5A 3AXDA 4GZOA 1UPSA 3DGTA 1F31A 5GLVA 4BMEA 4YM2A 3BOPA 5HUGA 3UL2A 2P3JA 1GANA 1A4GA 2P34A 5JOXA 1KDMA 2XB6C 3WHTA 2A3WA 1EURA 1QNWA 3D12A 3WDWA 1YIFA 3FLTA 1G9FA 2ZGUA 1WLCA 5IK8A 1DHKB 4WVVA 2CWSA 3CNAA 4WEFA 1S0JA 3V64A 1ULGA 4XJZA 3ZSMA 2DTYA 2OVUA 1SLAA 4GEZA 1V6KA 1MS5A 2W52A 2WT2A 1MS1A 1INGA 4H53A 2VW2A 2BF6A 3A71A 4NOTA 4R9DA 3ENRA 4Y1ZA 2QWCA 2GNDA 1WUVA 4K1IA 1LHVA 2YXSA 3TI3A 4ITCA 4M3CB 2YA4A 3BTAA 3M1HA 2R16A 1WW7A 2SLIA 4YM3A 3CKZA 4MZEA 1SLLA 1SFYA 3PVEA 3AP7A 4YZ2A 3WZ1A 1FYUA 3RSJA 4X6KA 1V6IA 2VU9A 3WVJA 5LK5A 1LEDA 1V6JA 1DZQA 5JVVA 1DQ4A 4GB1A 2D3SA 1W6PA 3M3EA 2D7FA 3O0XA 3VKFC 1RITA 2ZB6A 2Q5TA 2D44A 1LOBA 5GM0A 2H0BA 2GNBA 2AEPA 4U36A 3ASIA 3OY8B 1A4QA 1XQNA 1SNTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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