1MZ6A

Trypanosoma rangeli sialidase in complex with the inhibitor dana
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
630
structure length
620
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVATADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVMDATVIVKGNKLYILVGSFNKTRNSWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVGSNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDGNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQQDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRFIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPGAPTDSRVTVTNIVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis of sialyltransferase activity in trypanosomal sialidases
pubmed doi rcsb
molecule keywords sialidase
molecule tags Hydrolase, hydrolase inhibitor
total genus 161
structure length 620
sequence length 630
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2002-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1mz6A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1mz6A01
4JRAA 2VK6A 3TIBA 2R49A 1FV3A 1H9PA 4CZSA 4GWMA 5HCBA 4I30A 4WVWA 1Z4XA 4GZQA 1ZM1A 3ILFA 3RRDA 2QWAA 3ZXLA 3AFKA 1GKBA 1IS3A 4Q2FA 1OKQA 3U4XA 5FREA 2EXHA 1LU2A 1XOEA 1AX2A 4R9CA 3WG4A 2HU0A 1LTEA 4Y1XA 3FBYA 3UJQA 3BODA 2HTYA 3N7JA 4KS2A 2CMLA 4I00A 3A71A 4K1KA 5L73A 3DGTA 4BMBA 3APBA 2YA6A 3POYA 2A6VA 4JCKA 1A8DA 3PMEA 1L7GA 1WBLA 5IUQA 5HX0A 2BQPA 2AUYA 1JN2P 2HTRA 4F83A 1MS5A 2EXKA 5DZGA 3IKWA 1F5FA 1WW6A 3ALWA 2C4AA 2X9MA 1N3OA 3AP6A 4X6KA 2YA7A 1MS9A 1AVBA 4Y20B 1URXA 4YM1A 1SCRA 4MWLA 2CTVA 4MWVA 3O0VA 2LTNA 1S0DA 2LALA 4YM2A 2A75A 1HQLA 4XJWA 4MWYA 4P9YA 3A4UA 3RS6A 1DYKA 3T1MA 4KS4A 4D8SA 4M3MA 7NN9A 2D3RA 4GZTA 1IS4A 1DQ0A 4R9AA 3SNMA 4R9BA 4QN4A 1TEIA 1WW4A 5JDBA 3IN9A 2DURA 2WLQA 1CONA 2E6VA 4U2AA 2RHPA 5E8AA 4ISQA 4P9WA 5GZDA 3ZSMA 3M3CA 2NM1A 2PHFA 1VLNA 3WOGA 1CESA 3M1HA 3NWKA 5GLVA 2CWSA 3A72A 2BZDA 2VY0A 2F27A 4YW5A 1LESA 2YDPA 4BPZA 1QNWA 3LSEA 3V0BA 3D11A 2B7YA 3RQ0A 5IK5A 2D3PA 1D0HA 5M1ZA 1W1XA 4FPEA 5T54A 1LOCA 4GEZA 4RA0A 3INAA 5JOXA 2F28A 1Y7BA 5HUMA 3AYDA 2ZKNA 4NN9A 1Q8PA 3B7EA 4CPOA 3V64A 3D6EA 3HMYA 3JU9A 5H9QA 1BZWA 1KJLA 4KS1A 3I4IA 3GVLA 3B69A 3VKMA 1NSCA 1X50A 4FP3A 2F29A 2EALA 2NZ9A 4D69A 2ZHMA 4XBNA 4DRVA 5DUWA 4MWJA 2CL2A 5KXDA 4OZXA 4HZWA 4YW3A 3FLTA 1HQWA 2C5DA 1W21A 1SLBA 1B09A 2HTVA 2ZB5A 1C4RA 4X47A 1W20A 1WCSA 5GZEA 2A6WA 1INWA 1V6MA 3O9KA 1GZWB 1QGLA 2AREA 1F8DA 3PVEA 2Z42A 2OUHA 3SISA 1F8CA 1NMCA 2ZGQA 1DIWA 4Y24A 4M00A 1J1TA 2A7AA 4HANA 3WDWA 4QN3A 2BATA 2VW0A 1KRIA 4M3CF 1IVEA 4YZ2A 1LGBA 3OY8A 1XQNA 3VV1A 2HTUA 1NMAN 2F13A 5JVVA 2VXRA 2H0BA 5JLVA 1NCCN 1WBFA 1NNBA 1W0PA 4SLIA 1S0GA 2XZIA 1F9KA 4Q1RA 1DYPA 6NN9A 1V6JA 1DQ1A 1FAYA 2R16A 1GNHA 4MX0A 1SBDA 1W0OA 3SH3A 1SNTA 2GN7A 1S0EA 5HCAA 1WLDA 4FPGA 3IPVB 4GZOA 1FNYA 2DUOA 2XCYA 3KQRA 1UAIA 4CPMA 4GJTA 1Q56A 1ZA4A 4MYEA 1EURA 2HT8A 3AZYA 1OQ1A 1I3HA 2QWGA 2UWCA 2DUPA 1DBNA 3K38A 4MZEA 2DU0A 5DXDA 3VKFC 3OBTA 2A6YA 1CR7A 2ZABA 3AZXA 1G9BA 1EUSA 2DUQA 2XZKA 3O12A 5JYYA 3FLRA 4P9XA 4TYSA 4WEFA 2R1BA 2ZHNA 4FPKA 5T5PA 2ZGLA 3OY8B 2GNDA 2WNEA 3Q9OA 1VIWB 2QWFA 3RMYA 3AYCA 3IM0A 3TIAA 2GNMA 1DQ2A 1W6OA 3IMNA 4FPLA 4K1IA 4UW4A 3ZXFA 5LK5A 5E88A 2PELA 1WW7A 1SO7A 2OW4A 1ONAA 2I2SA 1S0FA 4JF7A 1LEDA 4BLIA 1PZ8A 1INGA 4XJRA 1A78A 1Z4WA 4Q1PA 4PCRA 5F9TA 1NSBA 4B7QA 1WUVA 1WLCA 4LBKA 4K21A 2JECA 3INBA 1LOAA 4K1JA 3TI8A 2ZGRA 4CPNA 3QLQA 4FPJA 3ZPYA 1VAVA 1B9TA 3WDYA 4H53A 2R0FA 2D7FA 2DU1A 1BKZA 1Q8OA 4QN5A 1GZCA 3AX4A 3WZ1A 1MS4A 2SLIA 4LBQD 3K39A 1E8TA 2JKBA 3WHUA 4M4VA 4YFWA 3N7LA 4YM3A 3W58A 2WT2A 1BQPA 3WV6A 1SLCA 4QN6A 2ZMNA 2D6NA 4TZDA 4M01A 1W6OB 1USRA 2UURA 2A6ZA 5GLWA 4Y20A 1BXHA 1L7FA 3WNXA 4MWUA 3TI4A 4C1XA 1LECA 3V0AB 4IQPA 4Q27A 1LU1A 3CL2A 3B3QE 2ENRA 1APNA 1NXD1 5GLZA 1DIMA 4NCSA 3NV1A 3SH5A 1KDKA 2QWJA 1FX5A 2ZB6A 2D6LX 1V2IA 1IS5A 4AVTA 1FV2A 2WQZC 4XJZA 3K36A 4AYUA 1V0FA 2R0HA 1YIFA 4GZSA 1V0ZA 3AYAA 5DG2A 3H0OA 1EUTA 4CRQA 1G7YA 4BOWA 1ULCA 2V73A 1EPWA 3AJZA 1USXA 2YA8A 2QWKA 4YGCA 2ZHLA 4M3CB 2SBAA 2YROA 4P14A 4Y1UA 2DYCA 1NMBN 1SLIA 4XBLA 3QCWA 3PVNA 4FPYA 2YZ4A 3WG1A 2GNBA 3WVJA 1UMZA 4UW5A 2F26A 4FOVA 2EXIA 4Y1VA 1AXZA 3RSJA 4Z8BA 5T50A 3TI3A 1LGNA 1UPSA 3AK0A 1KJRA 1QDCA 4FOQA 3K3AA 1AJOA 1GNZA 2ZMKA 3N35A 1GV9A 3T2TA 5IK7A 2A3WA 2ZGKA 2F24A 2QWIA 3DUIA 1ULEA 1R1ZA 3VKOA 3D12A 4Y1YA 5T5LA 2VSMA 2VH9A 4XXPA 3NSSA 1O4YA 1CPMA 1WD4A 4YZ5A 4L8QA 2ZHKA 3VKNA 2HU4A 1JHNA 4LBMA 4XZPA 2DTWA 1NN2A 4GXLA 4GKXA 3USUA 1LOEA 2ZZJA 4WA3A 4FVKA 2HTQA 5GLUA 5NN9A 1LHOA 2D6OX 4RL7A 1UN1A 1JYIA 1W6MB 4PQ9A 2FMDA 3AXDA 3WDXA 4BMEA 4GDJA 2B8HA 1G9FA 1MS0A 3W59A 1GZWA 1MS1A 3AP4A 3CNAA 2F11A 1GZ9A 5JOZA 1QOOA 1DZQA 2AYHA 3MW3A 5CBLA 1N1YA 1INFA 3AJYA 4XDQA 1QMJA 1F8BA 2UU8A 1LOFC 2JD4A 3POSA 5JMCA 4KBBA 3ZXKA 4DS0A 1RINA 2A70A 4H55A 3PVOA 5CB7A 1G9DA 5IK4A 1NNAA 1S0JA 3N7MA 2D44A 1ENQA 4XJUA 3FFZA 2AEPA 4DRRA 2PHTA 4FOWA 4GA9A 1NCAN 3USUB 4WV8A 2W5NA 1G86A 1V6LA 1EUUA 3NV4A 4Q8LA 3LSDA 4AVVA 2CYFA 3N36A 3IPVA 3NN9A 1E8VA 2F10A 1SLLA 2P3JA 2ZGPA 4XBQA 4GB1A 5EWSA 4FOYA 4XOGA 5AVAA 2W20A 1ULDA 2G4IA 4MWXA 1N47A 2JJ6A 1MR5A 3FUOA 4GALA 3ZXJA 4XHBA 3R4UA 1CJPA 5JOWA 3WLUA 3PJQA 1A4GA 1LHNA 4CPYA 4FPFA 4Y1ZA 1YXWA 4KS3A 3BIWE 1G9CA 1SFYA 1V3CA 2DVDA 2YV8A 5GLTA 2ZAAA 3AP9A 1AX0A 1YO8A 4FVVA 4FZHA 1O4ZA 2ARBA 2A5ZA 4WA5A 1VALA 2ES3A 3R4SA 5HUNA 1G9AA 3OJBA 5T5JA 4YM0A 3BOPA 1JBCA 1NCBN 5IK8A 4MJVA 4R9DA 2D3SA 2E7QA 3UL2A 2PHUA 1S0CA 1S0IA 1FYUA 3I8TA 2DVAA 3OPZA 4MJUA 2Q5TA 2CWMA 1V3EA 2ZGOA 4M4NA 2WJSA 4MWQA 4WVVA 2TEPA 1G8WA 5EYYA 2P3KA 2QWDA 4J9TA 1V6OA 5BYNA 1IVDA 3BTAA 2ZBJA 2W39A 1W6QA 1N3QA 1W6NA 2JE7A 3AP7A 3POWA 2GN3A 3JUUA 3WDUA 3VUOA 2A6XA 1CQ9A 3WG3A 2GNTA 2XB6C 3WDVA 5B2CA 2V5YA 4XJQA 4FPOB 2VVZA 1NSDA 3O0WA 2C9AA 4AWDA 1V3DA 1QF3A 2YMZA 2PHRA 2WSUA 1KQRA 4MZAA 2WKKA 2E53A 2D43A 4B7NA 2AEQA 3V0AA 1WCQA 1N1SA 3TAYA 5KXCA 4K1ZA 1C1LA 2R1DA 2PHXA 1LOGA 1AXKA 2NMNA 2VU9A 2YA4A 3CL0A 3ZSKA 4DPNA 1UZZA 3NV3A 4X4AA 1L7HA 1LOBA 1CPNA 4CPZA 1DQ4A 1BJQA 4FQZA 3ATGA 1MVQA 1V6KA 3A0NA 1DLLA 2ZGNA 3AXEA 3SLIA 1HKDA 3WG2A 1ULGA 2AH2A 4BQ1A 1LGCA 3D5OA 3W09A 3WUCA 3B00A 1W6QB 1W6NB 4M3CA 4NC5A 1CVNA 2AR6A 3LCPA 2ZACA 5DG1A 1IVCA 2OUJA 1IKPA 1LHVA 2VW2A 3SILA 1GSLA 4AGGA 4YG0A 5HCFA 1RIRA 1NCDN 1DILA 3SITA 4K1HA 4QN7A 4YZ1A 5DZFA 4K3YA 3A0KA 4ATFA 5IT6A 4NOTA 4HZXA 3M3QA 1LHUA 4FPHA 4YW1A 4Y22A 1S0BA 5CAZA 3SALA 1V6IA 3HN1A 2ZGMA 1D2SA 1MZ5A 4ZKTB 1W8NA 1INXA 2JE9A 1LODA 2DV9A 1BYHA 1UX6A 5GZGA 2VSKA 1AX1A 1DQ6A 3SANA 5GZCA 5KXBA 1MWEA 2YY1A 4XTMA 1WW5A 1DFQA 4XILA 1B9VA 2P34A 1MVEA 1IOAA 4Y26A 4DQAA 4XIKA 2VK7A 2QWCA 1YI7A 2W38A 1S1AA 2WT0A 3ENRA 1W6MA 2EIGA 4MWRA 1H30A 1MS3A 4JC1A 2ARXA 4Q8KA 3RG0A 1IS6A 3ASIA 1HLCA 4XHXA 5GM0A 3MW2A 2A3XA 2RKCA 3M2MA 2A3YA 2JDZA 4MWWA 2HT7A 1V3BA 3UJOA 5FRAA 4NO4A 1BJIA 1C1FA 1QKQA 4XJAA 4XMIA 4H52A 4FQ4A 1QOTA 4XE9A 2ZGTA 3SH4A 1V0EA 2XZJA 2E7TA 1N1VA 1LEMA 4B7JA 4ZXKA 2HTWA 4W65A 3C2UA 4Y22B 1Q8QA 2D6PA 4CPLA 2KM2A 3JU4A 4DFSA 1N1TA 1U0AA 4XJ8A 1IVBA 1IVGA 3L2YA 1QU0A 1N3PA 3H71A 2NYYA 2SIMA 1Q8VA 1KDMA 4XTPA 5DUVA 2EXJA 1GYKA 2CY6A 4ISRA 4PBPA 4HIZA 1PZ9A 4YZ4A 3TI6A 1F8EA 5DZEA 1IKQA 1INHA 5CNAA 3GALA 3FUQA 5DUXA 4YG3A 1VCUA 1I1EA 1UKGA 3N7KA 2C4LA 4UF7A 1H9WA 4YGDA 1E8UA 2HYKA 1FNZA 1SLTA 1Z0HA 4AGRA 4YGEA 4M3CE 1GBGA 1YRZA 4GZWA 1V6NA 3ILRA 1LCLA 1JYCA 2P37A 2ERFA 2HT5A 1JOJA 3T1EA 5H9SA 4QNPA 3AYEA 4WA4A 4GKYA 5GJ6A 2VW1A 3ILNA 3O9JA 4K1YA 1HDKA 1JUIA 5DUUA 1VAMA 4WEGA 1GANA 5EXOA 2WSVA 4B7RA 4AVSA 1QOSA 2BF6A 2QWBA 4FP2A 3TB0A 4LBLA 2AGSA 3N3HA 2YDTA 1NLSA 5H9RA 3OBRA 3ZVXA 1W6PA 1QDOA 4B7MA 2P2KA 4M4UA 1MZ6A 2PHWA 3ZYRA 3KM5A 2YXSA 3ZSLA 2OVUA 3B01A 2QWEA 3WCRA 1KITA 2A71A 3O5SA 4UW3A 5T5OA 2ZA9A 5F5QA 3CKZA 3OYWA 1RITA 4LBQA 5JOYA 5HUGA 2NP0A 3O0XA 4AGVA 1INVA 4YW4A 4Q6KA 4BM8A 3CYEA 2W08A 1WD3A 3NV2A 1AZDA 3V0BB 4LBOA 1SBEA 3WDTA 2DVFA 4GDIA 3UK9A 4PBOA 1C57A 2NN8A 1LJ7A 4HZYA 5EYXA 5HUKA 1AXYA 4YLZA 1DHKB 1MACA 2DVBA 1A3KA 1ENSA 1Z4ZA 2DWRA 4MC7A 1QNYA 4ATEA 4YFZA 1ULFA 2AENA 1XOGA 1LULA 1W6PB 4FJ6A 3H73A 3GNEA 1CIWA 3WUDA 3MPPG 4DGRA 3TICA 4XXAA 3AZWA 5KXEA 2ZGUA 4LBNA 1VCJA 4XJ9A 3K37A 4CTEA 1AF9A 4U36A 1Z50A 5H9PA 1V00A 2DTYA 2GMMA 1LENA 3B9CA 1Z4VA 5CA6A 4XIOA 3OYWB 1YYNA 4LBQB 1SLAA 2YA5A 3D4KA 3VKLA 4GZXA 4PF5A 3ZXEA 1UZYA 1DGLA 1A4QA 4FPCA 3AP5A 2SILA 2VUAA 5GZFA 1SACA 4WZFA 2W5OA 4YW2A 4BLJA 2GDFA 3ZYPA 4UW6A 2CNAA 3MW4A 5GALA 5T55A 2F25A 1SCSA 4YG6A 3GVJA 3MEPA 1CN1A 1PZ7A 2VK5A 2P3IA 2F0ZA 1SBFA 5SV8A 3AZZA 3T1LA 3M3OA 1LHWA 4XYXA 3RMXA 1FATA 4YZ3A 1Q8SA 4X49A 2D6KA 2GALA 2XG3A 3WCSA 5B2DA 4C1WA 4YGBA 2DVGA 2FHRA 2D6MA 3R05A 1B9SA 2UWAA 1INYA 5T52A 1GLHA 2W52A 3WHTA 4GZPA 1Z4YA 2EAKA 2GMEA 1Z78A 2F12A 4Q26A 2BERA 4KS5A 1AJKA 3ZSJA 1WLWA 3ALXA 2W68A 1IVFA 1GICA 1OFSA 3HR9A 3V65A 2UWBA 4HZZA 3M3EA 4GWNA 5E89A 1ENRA 1F31A 4ITCA 3H72A 1W8OA 4BBWA 2NMOA 1A14N 1MS8A 1JW6A 1DQ5A 4XMAA 2GMPA 3FLPA 4HL0A 2QWHA 2EF6A 3TI5A 4K20A 4ASMB 3H6JA 3OGGA 2VWDA 1NNCA 4HZVA 3BEQA 2E51A 2ZGSA 1UL9A 1LOFA 3GVKA 1JXNA 4LBJA 2ZMLA 2WT1A 3AZVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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