1SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with dana
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal structure of an intramolecular trans-sialidase with a NeuAc alpha2-->3Gal specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
total genus 183
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 1sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1sliA02
1ENSA 3AX4A 3LSEA 2DTWA 4YW2A 1SNTA 2AEQA 2DUOA 4L8QA 2R1BA 3VUOA 1LEMA 2WT2A 4CTEA 4M3MA 4P9WA 4YGBA 4MJVA 2PHXA 3KQRA 5GLUA 3D4KA 2WJSA 3RRDA 2JDZA 4MZAA 4FP3A 3JUUA 3PJQA 2Z42A 1IS4A 4M3CB 4KBBA 4FQ4A 2ZMKA 3VV1A 3O9JA 2YA6A 5JLVA 5E8AA 5KXDA 2NMNA 2A6VA 1LHNA 2ZGSA 1W6QA 4MZEA 1QMJA 3ZXEA 1Z4XA 2ZHLA 2F11A 4GWNA 3ILRA 5DZFA 5DZEA 2YA5A 2Q5TA 1SCSA 1DYPA 4FOWA 5DXDA 1SLTA 2D7FA 2VH9A 2F0ZA 3AZZA 2A3WA 1UZYA 3V64A 4YFZA 3WG1A 1G8WA 1QNYA 3O0WA 2KM2A 2WLQA 2ZGTA 3RS6A 2ZGQA 1YXWA 2F25A 2NMOA 3K37A 4XYXA 1DFQA 2NN8A 3SNMA 2BERA 3V0BA 4XTMA 1Z50A 4PCRA 2ZACA 1C4RA 3D11A 1WW5A 4ITCA 4I00A 3GNEA 3MW2A 1USXA 3TI5A 2XZJA 5GZCA 2OUJA 4GZXA 3USUA 1YYNA 2JE7A 4P9YA 3ZXFA 4QN7A 4XTPA 4YGCA 1Q8OA 4R9BA 2OUHA 3BTAA 1AX0A 1ULGA 4ISRA 3H73A 4XOGA 3V0AB 3ZSMA 5CNAA 2VSKA 1DLLA 1JOJA 1GZWA 1MZ5A 2W5OA 5JOZA 1N3PA 2SBAA 2P3JA 3NV1A 4P9XA 1S0IA 1I3HA 1Z78A 1ZM1A 3TIAA 1H9PA 4GZTA 1MZ6A 3K39A 1LCLA 3H72A 2YZ4A 3BIWE 2EXIA 1DGLA 5NN9A 4BM8A 1AXZA 5GZGA 1E8TA 3WZ1A 1YO8A 5T54A 2ZB6A 1WD4A 3TI4A 2NYYA 1NMCA 4MWLA 2LTNA 3WDVA 4ATFA 3JU4A 1GLHA 3SLIA 3OBRA 3B01A 3N7LA 4OZXA 1Z4ZA 1CESA 4GKYA 1AX1A 2CWMA 2C4AA 3ZSJA 5GLTA 3JU9A 1V00A 1IVBA 1V0ZA 3T1EA 1FX5A 1GZCA 1MS4A 2E51A 4I30A 3TB0A 1AF9A 2VXRA 2UU8A 4FJ6A 5GJ6A 1V0FA 4FVVA 4Y1YA 2C5DA 4BPZA 1LOCA 3BEQA 2V73A 1W6NB 2ZGOA 1I1EA 5KXBA 1NMBN 1V3DA 3LCPA 1Q8SA 3ZVXA 3IPVA 4BLIA 1G9CA 1MVQA 1W6OB 1NN2A 1WBLA 2F26A 5HX0A 1S0JA 1QGLA 1A8DA 2AENA 2ZGRA 2I2SA 4FPJA 1L7FA 4W65A 1WLDA 2UWCA 3UJOA 1VCJA 3AZWA 2EALA 4BBWA 1G86A 4QNPA 4U2AA 3NWKA 3WDXA 5BYNA 2W20A 2ZMLA 4PF5A 1ENQA 1G7YA 3FLRA 4Q1PA 4DGRA 2HT5A 5T5PA 4YZ5A 3WLUA 1MS8A 5JMCA 2A75A 1INHA 1LGBA 1CPNA 3K38A 3PMEA 2FMDA 3ZSKA 1EUTA 4Y1ZA 3INBA 1O4ZA 3WCSA 2QWDA 4J9TA 4LBJA 2R16A 4UW5A 5HUGA 3K3AA 3B9CA 4HL0A 2FHRA 3O5SA 2F24A 2AREA 3AJYA 2BZDA 2WKKA 3D5OA 1LESA 2C4LA 1F8EA 1KDMA 1VAVA 4XZPA 3AXEA 4YG0A 1RIRA 4Y26A 1GSLA 4RA0A 1J1TA 1XQNA 3MW3A 2CYFA 4AWDA 3W59A 1LEDA 2NZ9A 4C1WA 4M4UA 1MS0A 4Y20B 1QU0A 1C1LA 4Y1UA 4YG3A 2P3KA 3R05A 2YV8A 1LECA 5HUKA 1XOGA 2ARXA 1DQ1A 5EYYA 5JOYA 2QWIA 3UJQA 4M3CA 1LENA 2GN7A 1MR5A 4LBNA 2HTYA 1FV3A 1QDCA 2EXHA 4FP2A 4Y1VA 2E6VA 1V6MA 1QOTA 2R0HA 1BZWA 1F5FA 4UW4A 5HUNA 1GYKA 4FPCA 1UMZA 3AZVA 3WV6A 1MWEA 4CPOA 2G4IA 4TZDA 4LBQB 2DVAA 2PHRA 1IVEA 4LBMA 2D6LX 1BXHA 1BKZA 2DUPA 1NMAN 1DZQA 3WHUA 2R49A 2SILA 2GNDA 2EAKA 5DUVA 5EWSA 3T1MA 1UPSA 2YROA 4Y24A 3WCRA 1VCUA 4GDJA 1UX6A 5EYXA 3VKNA 3ZXJA 1LOAA 4B7RA 1DBNA 4CZSA 4AGRA 2AUYA 4F83A 1NCBN 2LALA 2JE9A 2PHTA 4ZXKA 4KS3A 3N36A 3WDWA 5T5OA 2ZGUA 5CB7A 2HT7A 1SLIA 1H30A 1SFYA 2GMEA 1N1TA 4YZ2A 4XJ8A 3U4XA 4Q26A 1IS6A 4WA5A 4GKXA 1NSDA 4CPYA 3ZYPA 1MS9A 1NCDN 4KS2A 1INGA 1H9WA 1NNCA 4WVVA 4JCKA 2JJ6A 4K1IA 3AYEA 3FUQA 4XHBA 1AXYA 4XJAA 3V0AA 4MYEA 3OYWB 2QWHA 3O12A 3AYDA 1HDKA 1A4GA 2ZABA 3R4SA 2ZGMA 4RL7A 3H6JA 1TEIA 4PQ9A 5DUUA 1FYUA 2JKBA 4Q27A 1OKQA 1FV2A 2UWAA 5CBLA 3WHTA 3QLQA 2CL2A 1DQ0A 3ASIA 5H9SA 4Y22B 2E7TA 1LHWA 1V6LA 1IS3A 2BF6A 2D6KA 1DIMA 1JW6A 4XXAA 3AZYA 1W8NA 5H9RA 1LODA 3POWA 4K1JA 4DQAA 5JOXA 2VY0A 2WT1A 4YM1A 2ZHMA 2D6NA 3WNXA 2CNAA 1EUSA 1V0EA 1F31A 1MS3A 4GZQA 5M1ZA 1USRA 2TEPA 4K1ZA 5JOWA 3CKZA 2DU1A 5GALA 1WW6A 3OY8B 1IS5A 4YZ4A 1C1FA 1A3KA 4Q2FA 3PVOA 4WA3A 4K1HA 4FPHA 1E8UA 3M3CA 1NLSA 3AP4A 3N35A 2YA7A 1A14N 4MWYA 1INVA 1KRIA 4HIZA 2A6YA 3INAA 2ZHKA 1B09A 4FPEA 2RKCA 3A72A 3AXDA 2QWFA 4XMIA 4Q6KA 3ALXA 4LBQD 4XJ9A 5DG1A 2D3RA 4R9AA 4MWWA 1SLAA 4JRAA 1KITA 2ZB5A 2PHFA 3NN9A 2ZKNA 1NCAN 4YM0A 4IQPA 5EXOA 4QN6A 1W6NA 1W21A 4WA4A 1WCSA 3ZXKA 1UZZA 4GA9A 5DG2A 3SALA 1N47A 2XB6C 1A78A 1LOGA 1CIWA 1W6OA 4XBQA 3N7MA 2W39A 2W5NA 3APBA 5AVAA 2ZGKA 1VIWB 3BODA 3TI3A 2C9AA 2SIMA 1UN1A 5T5LA 2W38A 1AZDA 4Z8BA 1F8CA 2D44A 1LGCA 4XDQA 1VAMA 4H55A 1QKQA 4NC5A 5H9QA 1IKPA 2HU0A 2PELA 4MWVA 1DIWA 3N7KA 2QWBA 4DS0A 2UURA 3PVEA 2D6OX 4DPNA 4GJTA 3CL2A 1N1VA 4K3YA 3A4UA 3A0KA 3USUB 4HZWA 3WOGA 1LHVA 1CJPA 1RITA 1UL9A 4XJWA 4UF7A 3SH4A 2DVDA 1G9FA 1MACA 4GZOA 4WVWA 1Q8QA 1NCCN 4Q8LA 5FRAA 1JXNA 2P37A 3M2MA 3D6EA 2F29A 4XIKA 1SBEA 4YW5A 4XBNA 2ZBJA 3ZPYA 4YM3A 3NSSA 3QCWA 4NOTA 2VUAA 2HTWA 4FPFA 4KS5A 1GNZA 3Q9OA 1AJKA 5T5JA 4K1YA 1NSCA 3W58A 1PZ8A 2QWAA 5JYYA 5IK7A 5DZGA 1V6KA 4ATEA 4FPOB 2AYHA 4Y20A 2E53A 1QDOA 2B8HA 1S0BA 3M3QA 1O4YA 1LULA 4XHXA 2QWKA 2XZKA 1UAIA 1W0OA 2DWRA 1GV9A 3HN1A 4NN9A 3OPZA 3N7JA 4CRQA 1DILA 2YDTA 2OW4A 3A0NA 3I4IA 2DURA 1W6MB 5DUWA 2F10A 2VW2A 4KS1A 1LOBA 2D6MA 3PVNA 4XMAA 1YI7A 4XE9A 3B3QE 1AXKA 5HCBA 1ZA4A 1S0GA 1W6PB 1QOSA 4GB1A 3O0VA 2JECA 5GLVA 4CPZA 1PZ9A 3I8TA 2R0FA 3IN9A 4LBQA 1B9SA 3DGTA 5B2CA 4SLIA 2XG3A 4MWUA 1G9AA 1YIFA 4MWQA 4FZHA 2AEPA 1N3QA 4BMBA 1JHNA 1LU1A 2GMMA 2F27A 1NNBA 2RHPA 2DV9A 4Q1RA 3GVLA 4YFWA 2ERFA 4AVSA 2SLIA 1VLNA 3CNAA 3IM0A 1Z4YA 3TI6A 3TAYA 3GALA 2NM1A 3NV3A 4QN4A 5L73A 1DQ2A 2WSVA 3L2YA 3AJZA 2WQZC 4GZWA 4P14A 1NNAA 1Q56A 2A3XA 3DUIA 1DQ5A 1N1YA 2DU0A 5FREA 5JDBA 1N3OA 4DRVA 2ENRA 1RINA 4FOYA 2VK6A 1DQ4A 1SLLA 2P3IA 1W0PA 7NN9A 2DUQA 1JN2P 1HKDA 3OYWA 1XOEA 4FQZA 4DFSA 5CA6A 1KJLA 2NP0A 1B9VA 1HLCA 2DVBA 5GZEA 2D43A 4YZ3A 4HANA 3RSJA 5JVVA 2GNMA 2X9MA 4Y22A 2HTUA 4ASMB 2ZMNA 4FVKA 3HR9A 2BQPA 1LHOA 3WG3A 2E7QA 4K20A 3WG4A 1PZ7A 5IK8A 3WUCA 4LBLA 4XXPA 3M3EA 3VKOA 2F12A 1ULCA 1G9BA 2YA4A 1JYCA 2VWDA 3GVKA 3LSDA 3SISA 5F5QA 4AVVA 1UKGA 3RMYA 1KJRA 2ZA9A 3M3OA 4YM2A 4XJRA 4UW6A 4WZFA 3FBYA 4FPYA 3OY8A 4FPGA 4MWRA 3SILA 4HZXA 2VW1A 2A6ZA 1ULFA 3WDTA 1HQLA 3AFKA 4X6KA 1S0FA 2DVGA 1AJOA 2ZHNA 5IUQA 4NO4A 1EPWA 1WLCA 3FFZA 5HUMA 2F13A 1KDKA 4B7NA 6NN9A 3AZXA 1Y7BA 4QN3A 1V6OA 1A4QA 5IK4A 2EXKA 5F9TA 1IVGA 1V3CA 3T2TA 2CY6A 1W20A 4C1XA 4FOQA 1IVFA 3AP6A 3A71A 1KQRA 1V6IA 2WSUA 4JC1A 4B7QA 1CONA 2GALA 3MW4A 1BQPA 1V6JA 3M1HA 3ATGA 1R1ZA 3R4UA 4H52A 4KS4A 4B7MA 2CTVA 4X49A 1ENRA 5GZFA 2BATA 2A5ZA 1INFA 2XCYA 3UK9A 4LBOA 1WBFA 2QWCA 3KM5A 2OVUA 2YDPA 2QWJA 4GZPA 1MS1A 3ILNA 3RMXA 5DUXA 1DHKB 2AR6A 1DQ6A 1GZ9A 4YW1A 1LJ7A 2VK7A 3TICA 2GN3A 4WEGA 3WVJA 3IKWA 4YGDA 3POSA 2EF6A 2P34A 2ZGLA 5T52A 4Q8KA 3SITA 1W6QB 5HCAA 3AYCA 2EXJA 3VKFC 4YW3A 4B7JA 1S1AA 3AP5A 5E88A 3B69A 1SLBA 4AYUA 3D12A 5H9PA 1V2IA 2D6PA 2PHWA 3AK0A 2JD4A 2YY1A 5LK5A 2D3PA 3MEPA 5T55A 4MC7A 4YG6A 1FNYA 1V6NA 1GKBA 4YW4A 1SCRA 2GNBA 3K36A 1OFSA 2P2KA 4D69A 3FLTA 4QN5A 3FLPA 1U0AA 4YZ1A 4XJZA 4LBKA 3WDUA 1Z0HA 1INXA 2EIGA 3RQ0A 2VK5A 2VSMA 3TI8A 2VU9A 4R9DA 4GALA 1GBGA 3V0BB 3OBTA 4NCSA 5SV8A 4R9CA 1QOOA 5B2DA 2V5YA 4U36A 4FPLA 4CPNA 3TIBA 2ZGNA 5IK5A 2WT0A 4JF7A 1W6MA 4GWMA 1C57A 1SACA 1URXA 3ZXLA 2XZIA 2HTRA 4PBOA 1CN1A 1V3BA 3OGGA 1B9TA 2YXSA 3V65A 3WUDA 4BOWA 1W1XA 3ALWA 3AYAA 1WLWA 4AVTA 2A6WA 2B7YA 4GDIA 1MS5A 2AGSA 1W6PA 4TYSA 3VKLA 4K21A 2F28A 3RG0A 1E8VA 1F8BA 5KXEA 2R1DA 1FAYA 1S0DA 1GZWB 5GLZA 1CR7A 4XBLA 4CPLA 1S0CA 1LU2A 3IMNA 4YLZA 1BJIA 1MVEA 1SBFA 4AGVA 4WEFA 4MWXA 1ONAA 4AGGA 4UW3A 1NSBA 4YGEA 1W8OA 1WW4A 2HTQA 1IVDA 3CL0A 1YRZA 1WW7A 3VKMA 4XJQA 4CPMA 4XJUA 1INYA 2D3SA 2ES3A 4PBPA 1IKQA 5GLWA 4Y1XA 2W52A 1IVCA 2CMLA 1GICA 3OJBA 3ZSLA 1JYIA 1IOAA 4HZZA 4M3CF 4M00A 4D8SA 1N1SA 3BOPA 4BMEA 4DRRA 2YA8A 5KXCA 3AP7A 3H71A 1WUVA 3FUOA 2HYKA 2PHUA 1BJQA 1LTEA 4X47A 4GXLA 3POYA 1APNA 4H53A 5HCFA 3MPPG 1SO7A 2GNTA 1AVBA 1QNWA 4MJUA 2GMPA 2HTVA 2QWGA 5IT6A 2YMZA 1D0HA 4MWJA 1WD3A 2W08A 1Z4WA 1BYHA 4ISQA 1LHUA 2DTYA 2CWSA 2A71A 1L7GA 3ENRA 2GDFA 4HZYA 2ZZJA 4BQ1A 5GM0A 1INWA 1V3EA 1G9DA 2VW0A 1F9KA 1DYKA 3IPVB 3CYEA 2UWBA 3WG2A 1SBDA 4HZVA 1Z4VA 3AP9A 2HT8A 3SH5A 4M4VA 3WDYA 2QWEA 1LOFA 1OQ1A 4FPKA 1NXD1 3B00A 1EURA 1CVNA 2DYCA 4ZKTB 2A3YA 4K1KA 3NV4A 2A6XA 2W68A 4GZSA 1LGNA 2AH2A 1FATA 4M3CE 2WNEA 1L7HA 4M4NA 3W09A 1JBCA 1JUIA 1Q8PA 5T50A 2HU4A 1WCQA 2A7AA 2DVFA 2ZAAA 3ILFA 1SLCA 1F8DA 3H0OA 3SH3A 5GZDA 3O9KA 1S0EA 2H0BA 4MX0A 4WV8A 3ZYRA 3HMYA 1GNHA 1FNZA 1GANA 1ULDA 2A70A 1AX2A 1Q8VA 1VALA 1QF3A 3B7EA 1CPMA 5CAZA 3O0XA 2ZGPA 4FOVA 1LOFC 2VVZA 1LOEA 4XILA 3N3HA 1ULEA 4X4AA 1CQ9A 3C2UA 4GEZA 3SANA 4M01A 1EUUA 3GVJA 1D2SA 1X50A 4XIOA 3T1LA 3NV2A 3UL2A 1HQWA 4BLJA 5E89A 2ARBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ENSA 5BNPB 3AX4A 3LSEA 4L9BA 5CFDC 2DTWA 3ZXDA 1H4GA 1D4M2 4NAOA 3H8RA 4YW2A 3HVDA 3J7MA 1SNTA 2AEQA 1YFUA 3CEWA 2DUOA 4GMP1 5F3GA 4L8QA 4NIDA 2R1BA 4K8FA 3IDEA 4QGLA 3VUOA 1X2RA 1FPN3 1PNFA 3CZUA 3KQ4B 5C8WA 1LEMA 1JU4A 2LM3A 3NNLA 2WT2A 4CTEA 3S5AA 2RS53 4M3MA 4P9WA 4YGBA 5EP9A 4HT1T 2ADDA 4MJVA 1RUF3 2PHXA 2VVDA 4FCAA 2DBNA 3KQRA 1IGOA 2VVFA 2HBUA 5GLUA 4JKMA 3D4KA 2WJSA 3RRDA 3UKNA 2DBIA 1UMIA 3I54A 2JDZA 1VBE1 1T6BX 4TLGA 4MZAA 2AEYA 4FP3A 2ET7A 2QZ3A 3JUUA 3LIHA 5K9YA 4CDWC 3PJQA 2GVVA 5JXGA 2Z42A 1IS4A 4A6SA 2X5IB 1H6XA 3DL3A 4KMQA 3DPRC 3TNPB 4M3CB 4FSJA 2JDMA 3NJVA 4KBBA 5GX3A 4FQ4A 5FXZA 2G8SA 4CDQB 4DMIA 4IV1C 4PHZA 2JWPA 1ZZ7A 3TN91 5FNSA 5A7WA 1STMA 2ZMKA 3VV1A 4LIVA 4W4ZA 3O9JA 2VQUA 3C3VA 2QQVA 5F2SA 1NCRA 4QKBA 1JYWA 5FWEA 1PK6C 2YA6A 3T08A 1QJY1 1RUH1 2EIDA 3TIBA 3VBUC 1E5HA 5JLVA 4IEXA 1NUKA 3N9PA 3GJBA 4OUEA 5E8AA 1E5IA 5KXDA 2NMNA 2VBBA 2W0XA 2YGMA 2A6VA 3MLLA 5IVCA 4AK3A 1LHNA 4BK5A 4WVZA 2RG4A 1O8SA 2ZGSA 4Q4V3 1W6QA 4MZEA 1QMJA 3ZXEA 3UV9A 2ZHLA 1Z4XA 5FMBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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