1SLLA

Sialidase l from leech macrobdella decora
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal structure of an intramolecular trans-sialidase with a NeuAc alpha2-->3Gal specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE L
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1997-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 1sllA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1sllA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1sllA02
3O9KA 3NV1A 1A3KA 3GVJA 3NSSA 3WDUA 4H55A 3MW3A 4FPHA 5KXCA 3RS6A 1MWEA 4AVTA 2JE7A 4XJRA 3LSEA 5CB7A 2A3WA 4JCKA 3SANA 1QNWA 1ULEA 1INHA 4QN4A 1LOAA 1G9CA 4FP3A 1MS0A 5GLTA 1SBDA 5HUGA 1LHOA 1LU1A 3RQ0A 1OKQA 1BQPA 1MACA 5GLZA 1IVEA 4L8QA 1H9WA 1OQ1A 4XBNA 4FZHA 3TI5A 1WUVA 3A72A 1O4ZA 2WT0A 1F8CA 1NSBA 5HUKA 1V6JA 1GICA 1V3BA 5HUNA 2GMPA 3VKFC 2XZIA 4Q2FA 2CYFA 2SIMA 4M00A 1GNZA 4NO4A 5DXDA 1ZM1A 2HT5A 2ZMKA 1JYIA 4GXLA 4Y1ZA 3M3OA 1KQRA 1Z4VA 1W6PB 3D12A 1KRIA 1INWA 2QWIA 5KXEA 1DILA 1HQLA 2GNDA 1Q56A 1FNZA 4UW6A 3R4UA 3ILFA 5NN9A 4MWRA 4XBQA 4FPEA 3W59A 1W6OA 2HTRA 4XJQA 1CPMA 3OY8B 3V0BA 3BODA 4YW5A 2QWJA 4UW4A 1FNYA 4ITCA 5T5JA 3K37A 4AGRA 3M3EA 4Q1PA 1CIWA 5T5PA 4B7RA 2YROA 3B9CA 4YZ3A 1U0AA 1QNYA 4D69A 5IK4A 3OGGA 1EURA 3M3QA 3USUB 1JHNA 4FPYA 2QWBA 4Q1RA 4XJWA 4K21A 1L7GA 2A71A 3SISA 3ENRA 2ZMNA 1F8EA 1SLCA 1INXA 3SH3A 2E53A 1MZ6A 4NCSA 2A7AA 4BLIA 1YXWA 2D6KA 1Y7BA 2W20A 3RG0A 3WG3A 4YGEA 2OW4A 1MS5A 5DUVA 2CWSA 2XB6C 5JOWA 1V6OA 1F31A 4M4NA 3A71A 1AX0A 3NV4A 5FRAA 4CPOA 3TI4A 1B9TA 1CQ9A 3ZXEA 1W0OA 1SLBA 1FV3A 3INBA 2ZGRA 4JF7A 3LCPA 2ZB6A 3V0AA 4KS2A 3FLTA 4B7NA 1CN1A 3RMXA 3TB0A 2F13A 3D5OA 4KS5A 3IPVB 4XIOA 2F0ZA 1PZ9A 2F26A 4FVVA 1DZQA 4K1JA 3SLIA 3AXDA 2F10A 4X6KA 2VWDA 1XOGA 1Q8OA 1APNA 4KS1A 2YA5A 4CTEA 1GLHA 2A6ZA 2VK7A 4XBLA 5JVVA 2ZHKA 2VH9A 2GALA 2P34A 2WT2A 5CBLA 1N3OA 1DYPA 1ULCA 4YW1A 3RMYA 2D6PA 1FV2A 1UZZA 4H52A 4Y1UA 1LULA 4XILA 1B9SA 1F9KA 4WA3A 5GZEA 3WDVA 1MS1A 4MWWA 2ZGNA 4F83A 1WW4A 1NMAN 4WA4A 1W6PA 1E8UA 4M3CB 2ZABA 3L2YA 2AUYA 1C57A 1V6LA 4XJ9A 1SLAA 4R9AA 1SLIA 3AP9A 4LBMA 1SCSA 2DUPA 4R9CA 4MWQA 4FVKA 3SH5A 4WZFA 1GSLA 2F27A 1F8BA 3UJQA 1NCAN 3AX4A 1RITA 4GZOA 1DQ1A 2NM1A 4HZVA 1UKGA 2YMZA 2W08A 1UL9A 4GWNA 1B09A 4M4VA 1WW5A 2D3PA 1AXKA 3ZVXA 1W20A 5GZFA 2PHXA 4UW5A 1LGCA 2QWDA 3USUA 2C9AA 4PF5A 2BATA 2ES3A 5IK5A 1WW6A 4MWJA 3RRDA 2LTNA 1BKZA 4M01A 1FAYA 2YA6A 3GVLA 5M1ZA 3SNMA 5F9TA 2PHWA 1N3QA 2B8HA 4MWXA 1V3CA 4DRVA 3WUDA 3JU4A 4YFWA 2A6YA 4XHXA 3I4IA 1DHKB 2ZAAA 4WV8A 3TI8A 3TI3A 4FPLA 1W0PA 1G9FA 3SITA 1LHUA 3U4XA 3MW2A 1USXA 1LHWA 1LCLA 1QOOA 1C4RA 4LBLA 1BXHA 1Q8PA 3NWKA 4YM0A 1S0GA 2ZA9A 5E88A 1WD3A 3WCSA 3WG4A 4WA5A 1S0DA 2R1DA 5CA6A 1FYUA 3Q9OA 1AXZA 1UMZA 3DGTA 1OFSA 1PZ8A 2EF6A 3IPVA 4FOVA 2Z42A 4XMAA 2XZKA 3GALA 2HTVA 3VKOA 2DYCA 3AYEA 1A14N 2BZDA 1V6IA 2CWMA 5KXBA 2EXKA 3OJBA 5GJ6A 2GMMA 2QWEA 2D3RA 3K36A 1XQNA 4AVVA 3SALA 1QMJA 1LESA 2JJ6A 1HDKA 1QKQA 3H72A 3D6EA 4SLIA 3HN1A 3O0WA 1R1ZA 3B3QE 4HL0A 2VW2A 1S0FA 2B7YA 4GA9A 4M3CA 1V6NA 5KXDA 1DGLA 4GZPA 4P9WA 2ZHNA 5T50A 3LSDA 2G4IA 4HZWA 1JUIA 4Y20B 1V0EA 4K1KA 2YDTA 1GZCA 3AJYA 3BTAA 4DGRA 3TICA 5GZCA 1O4YA 3V0AB 1DQ5A 1YIFA 4CZSA 2AH2A 2ARBA 2CNAA 4HIZA 1GZWB 1G9AA 4XXAA 1N1VA 3VUOA 2CTVA 2OUJA 1C1LA 2X9MA 1LU2A 2PHTA 3AP5A 3GNEA 1LOFA 3B00A 2AEQA 1Z4WA 2D44A 4XZPA 4MJUA 3TAYA 4HANA 2GNMA 4BLJA 4K1HA 4GKXA 1AZDA 3ZSMA 4FQZA 1A4GA 3AK0A 1Z4YA 2W39A 4U2AA 2HTQA 3N7KA 1D2SA 5HUMA 3T1EA 3VV1A 3QCWA 1WLDA 2YA8A 3ZSJA 4XJUA 1WD4A 1SACA 3BIWE 1AJKA 2I2SA 2DVGA 2ZHLA 2DTYA 1USRA 4FOWA 1JOJA 1FATA 5H9RA 2ZGMA 4Y26A 4QN3A 4BM8A 4XOGA 1JXNA 3TIBA 4MZAA 6NN9A 4DS0A 3NV3A 4ATEA 4UF7A 4K20A 4Q27A 2YXSA 2JE9A 5T52A 4MWVA 1Z4ZA 3H71A 3IN9A 5F5QA 2A6WA 4OZXA 5SV8A 4M4UA 4MWUA 1KJLA 2AREA 2RKCA 3N7MA 4P14A 2GNTA 4K1ZA 1V6KA 1AXYA 1LOEA 4XYXA 1VIWB 2PHFA 3A4UA 1LGBA 1IS6A 1SLLA 2HTWA 1Q8SA 1NMCA 3ZYPA 1Z4XA 4Y1YA 2QWFA 2GN7A 2HT8A 2HTYA 2W5OA 2VU9A 2YY1A 1BJQA 1VLNA 1LTEA 1WLCA 1NNBA 2VXRA 1VAVA 5E89A 1DBNA 1G7YA 4GDIA 5JYYA 3INAA 2P2KA 2D7FA 4X47A 1AJOA 1HQWA 2ZGOA 4ASMB 5HCAA 2GMEA 5B2CA 2WSVA 2A6VA 4LBNA 1IVCA 1ENRA 4FPKA 1G8WA 1UN1A 1NCDN 5GLWA 4Y20A 5EXOA 2WT1A 1TEIA 3N35A 4ZKTB 1NSDA 2VY0A 4PBOA 1VAMA 5IUQA 1V2IA 4Q6KA 2FMDA 2LALA 1LOFC 3AZWA 1GZWA 1CVNA 4YGBA 2GNBA 3WHUA 1JYCA 1N47A 1NCBN 2WNEA 1SO7A 1UPSA 2BQPA 2PHUA 4AVSA 2YZ4A 1VCUA 1QDOA 4YGDA 4B7MA 1EUSA 4YLZA 5L73A 2SLIA 4FQ4A 3M3CA 4XXPA 3WDTA 1G9DA 4FOYA 1S0CA 5IT6A 4WEFA 1F8DA 3B7EA 5T54A 4TZDA 4FPCA 2WLQA 3A0KA 3WHTA 2ARXA 3V64A 5BYNA 2HT7A 4DPNA 3UK9A 3GVKA 2YA4A 4U36A 1LJ7A 3ILRA 3B69A 2SBAA 2QWGA 2JD4A 4DFSA 5DUWA 4YM3A 3PMEA 3SILA 1QOSA 3ZSLA 5DUUA 1KDKA 2DWRA 5GALA 4B7QA 1GKBA 4Z8BA 2EXHA 4GEZA 2P3KA 2GDFA 1QOTA 2QWAA 4M3CE 2UWCA 4Y22B 4K3YA 2DURA 5DG2A 1Z78A 1E8TA 3I8TA 1A78A 2DUOA 2W38A 1KJRA 3ILNA 1CR7A 1D0HA 4CPYA 1GBGA 1DLLA 2H0BA 1NNAA 2HYKA 2AEPA 5DUXA 1MS4A 3AZYA 4C1WA 1VALA 5H9PA 3AXEA 5GLUA 1RIRA 1BZWA 3APBA 2F11A 4HZYA 1QDCA 3AJZA 5JMCA 1ENQA 1W21A 3CKZA 2QWHA 1WW7A 3KQRA 2ZZJA 4IQPA 5GZGA 3PVEA 2ZACA 4QN5A 4YZ5A 3IKWA 1LEMA 2ZMLA 1INYA 1SBFA 2W68A 1V0ZA 1A8DA 3ZXLA 3FUQA 1Z50A 1W6NA 5E8AA 3K38A 4MJVA 2HU0A 3D11A 4K1IA 1X50A 3WVJA 1YYNA 4PBPA 1NXD1 2ZGPA 4UW3A 3WG1A 2P3IA 2DTWA 3POSA 2YA7A 3FUOA 3POWA 3ZPYA 3DUIA 2EXJA 4Q8KA 3A0NA 4FJ6A 1MS3A 1GNHA 1QU0A 2VSMA 1SFYA 4FOQA 4W65A 1HKDA 1LHNA 1UX6A 5H9QA 3ALXA 4YZ4A 1ENSA 1I3HA 1MZ5A 5DZFA 4R9BA 2A3YA 1JN2P 3WDXA 1IVFA 1YO8A 4BBWA 2OUHA 4GZQA 1WLWA 4AGVA 4LBQD 2DVBA 3UJOA 3ZYRA 3MPPG 4C1XA 1W8OA 4LBQB 2C4AA 2R0FA 4GZTA 4ATFA 1W6MA 5GM0A 3K3AA 1JBCA 2C5DA 1A4QA 3N36A 2XZJA 4GZWA 1INFA 4TYSA 5T5LA 3AZVA 2E7TA 1L7FA 4I30A 4D8SA 3FLRA 1EUTA 3T2TA 3OBTA 4KBBA 2ZKNA 2V73A 1V00A 4YG6A 4NC5A 1NSCA 3VKMA 4WEGA 3TIAA 1NNCA 2D6OX 2FHRA 4XE9A 2F28A 3CL2A 1NMBN 2ZGQA 3O5SA 3QLQA 1AX1A 5JLVA 4GJTA 4YM2A 2ENRA 2DV9A 4Y22A 1S0IA 5FREA 1BYHA 4Y24A 1S0BA 3PJQA 2NP0A 3KM5A 2VUAA 3O9JA 5HX0A 4PCRA 2ZGTA 3ZXKA 2F25A 4KS3A 4CPZA 4AWDA 1WCSA 4JC1A 4XJAA 2ZGKA 2DVFA 3MEPA 2PHRA 4LBKA 2DU1A 4FP2A 4Y1XA 1Z0HA 1IKQA 2UURA 4P9YA 4BMEA 2YDPA 1JW6A 4HZZA 3C2UA 3BOPA 4X4AA 2UU8A 4MWYA 2WSUA 2PELA 1IOAA 5JOYA 1PZ7A 1EUUA 2WQZC 2HTUA 5T55A 3BEQA 4LBJA 4YM1A 5GLVA 2EALA 5AVAA 2ZHMA 4XTPA 1MR5A 1C1FA 1DQ0A 4GKYA 1DYKA 2E6VA 2D6NA 2DVAA 4Q26A 1KDMA 4ISRA 3M2MA 1DIMA 4GALA 5B2DA 2YV8A 4ISQA 2P3JA 1W6QB 3R05A 3W58A 5CNAA 1MVQA 1N3PA 2QWKA 1QF3A 3TI6A 3AYAA 3VKLA 4XDQA 2V5YA 5T5OA 1W8NA 3R4SA 1LODA 1LENA 1LGNA 1IKPA 4GZSA 4ZXKA 2UWAA 1ZA4A 1I1EA 5EYXA 2W52A 2HU4A 3OYWB 3AYCA 4MC7A 5GZDA 3H6JA 3OBRA 4QNPA 2E51A 4XHBA 1V0FA 2EAKA 1RINA 4AYUA 4YZ1A 1G9BA 5JOXA 5IK7A 2A75A 1IS5A 2CL2A 7NN9A 1DFQA 4M3MA 3V65A 4LBQA 4MX0A 3O12A 3POYA 1SCRA 3FBYA 1G86A 3PVOA 3JU9A 3AFKA 2R1BA 1IVDA 5DG1A 3IM0A 4B7JA 1N1YA 3AYDA 1MS9A 4GDJA 1KITA 3ASIA 1DIWA 2XCYA 1WCQA 1W6NB 1GANA 2CY6A 5CAZA 2ZBJA 1HLCA 1SLTA 1LOGA 2A3XA 3RSJA 4FPOB 4XJ8A 3JUUA 3WZ1A 1Q8VA 4GZXA 4YW4A 4YG0A 4BPZA 1AVBA 1S0JA 2A6XA 3M1HA 2JDZA 3W09A 3FLPA 1DQ4A 3WLUA 2E7QA 3AP6A 1SNTA 3N7JA 3UL2A 1V6MA 2AR6A 2WKKA 4WVVA 1F5FA 5DZEA 4XJZA 1GYKA 2NMNA 4WVWA 1CJPA 4M3CF 3OPZA 4MZEA 3WCRA 1IS4A 3AZXA 1NLSA 3PVNA 4YFZA 3ZXFA 3N7LA 1GZ9A 4FPGA 1W6MB 3CNAA 3O0VA 1CPNA 3WNXA 1QGLA 2NMOA 5JDBA 3B01A 4RL7A 3IMNA 3ZXJA 2TEPA 1N1TA 2ERFA 1EPWA 3WUCA 3H0OA 4RA0A 4XMIA 2A5ZA 1L7HA 2QWCA 2VW1A 1ULGA 4BMBA 4XTMA 1W1XA 1IVGA 2D43A 1UAIA 3ATGA 1MVEA 3CYEA 1WBLA 4FPJA 4YZ2A 2OVUA 2A70A 3AP4A 3N3HA 1W6QA 2AYHA 2WJSA 4NOTA 1DQ6A 2JKBA 4JRAA 4H53A 1INGA 1ULDA 3T1MA 2CMLA 3OY8A 2D6MA 4LBOA 4BQ1A 4J9TA 2KM2A 3K39A 2R49A 1CESA 1B9VA 2W5NA 3NN9A 2BF6A 2NYYA 1BJIA 4R9DA 3OYWA 2F12A 1XOEA 5EWSA 2EIGA 2C4LA 5HCFA 2SILA 2VSKA 1LOCA 2VW0A 4HZXA 3NV2A 2F24A 4MYEA 4GB1A 1AX2A 4QN6A 1ONAA 1H9PA 1VCJA 2JECA 3HR9A 4NN9A 3WOGA 1V3DA 4YW3A 2F29A 2ZGUA 1J1TA 2XG3A 2D3SA 1SBEA 2VK5A 1INVA 4DRRA 4YGCA 5JOZA 2ZGLA 1H30A 5H9SA 5IK8A 1YI7A 2VVZA 3SH4A 1S0EA 4CRQA 1DQ2A 2ZB5A 1NCCN 2DVDA 1NN2A 3VKNA 4YW2A 1LECA 1E8VA 3WDYA 4QN7A 2AGSA 2GN3A 1CONA 1W6OB 1WBFA 4Q8LA 1S1AA 1LOBA 2ZGSA 4DQAA 3AZZA 3WG2A 4P9XA 3V0BB 3WDWA 2R0HA 2P37A 3CL0A 4KS4A 3O0XA 2NN8A 2NZ9A 1UZYA 2R16A 3MW4A 2Q5TA 1MS8A 4MWLA 3ALWA 4AGGA 2AENA 3HMYA 4PQ9A 3H73A 4FPFA 3AP7A 1LEDA 1IS3A 4X49A 4CPLA 5EYYA 2EXIA 4K1YA 4CPMA 1ULFA 4I00A 1GV9A 3T1LA 2BERA 5LK5A 1V3EA 1N1SA 3D4KA 2D6LX 4CPNA 4GWMA 3FFZA 4XIKA 2UWBA 4BOWA 2RHPA 4YG3A 2DUQA 4Y1VA 1Q8QA 5DZGA 1YRZA 3WV6A 1FX5A 5HCBA 1AF9A 1URXA 1LHVA 1IVBA 2VK6A 3ZSKA 2DU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BWOA 4E9KA 5C3SA 1YNAA 2D5FA 3K48A 4OUMA 3O9KA 3OD0A 3RZHA 4GN8A 3C7GA 3NV1A 3E1F1 1A3KA 4XFGA 5IYYA 4Z2AA 4OVEA 2IAUA 3DEMA 1RVF2 4XABA 3GVJA 3ROUA 2BYVE 3NSSA 3IAQA 2ZEYA 3S7EA 1JZ4A 1D7PM 3WW1A 3A21A 4CDXB 3WQ7A 3HPNA 3WDUA 4H55A 4AI3A 3MW3A 1FT9A 2P5BA 4FPHA 4GH4C 5A7WB 3ST7A 3SKVA 3VBFC 5KXCA 3KGZA 2IAVA 1DZTA 3RS6A 4KI5M 1MWEA 1C8NA 3HEIA 2VPVA 4LIVA 1BK1A 4AI9A 4AVTA 2QQPA 3SOVA 3N9NA 4IGQA 1QJX1 4QPYA 1IUCA 4N1BA 2JE7A 3T30A 2YC2A 4XJRA 3LSEA 3PNAA 2XONA 4LULA 5CB7A 2A3WA 1AYN3 4G4FA 1E1AA 1QJZA 1RL3A 2OQ6A 5FIXA 4SBVA 5BNNC 3C7HA 4CCMA 3N9MA 4JCKA 4GN7A 3SANA 4XDOA 1QNWA 1ULEA 4XFFA 3ZPOA 1INHA 1VPHA 2RDRA 4QN4A 1LOAA 1G9CA 4FP3A 2JDMA 3ZFGB 5A1AA 5HCHA 1MS0A 5GLTA 3RI9A 4UF0B 4HPKB 2R32A 3ZFFB 1CWPA 4QM8A 1SBDA 3UKVA 5FWWA 1LHOA 5HUGA 1LU1A 1PX3A 3RQ0A 5C8CA 1OKQA 4YVWA 3TN91 1BQPA 1MACA 3AVRA 5GLZA 1IVEA 1IZ3A 4L8QA 2PAKA 4XF0A 4N43C 2OZ6A 4ASCA 1H9WA 1OQ1A 4XBNA 3BPZA 3V56A 2Y8KA 4FZHA 3TI5A 1WUVA 2QE3A 1PGW1 1UOGA 1EV13 1UYYA 5FZDA 3U11A 3WP5A 3A72A 3K4ZA 1TVGA 1JYXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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