1SLLA

Sialidase l from leech macrobdella decora
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
publication title The crystal structure of an intramolecular trans-sialidase with a NeuAc alpha2-->3Gal specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE L
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1997-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 1sllA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1sllA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1sllA02
2AENA 3RMXA 2HTWA 2P2KA 3IM0A 3IPVB 4YM0A 5GZCA 2F26A 1AX1A 1DZQA 3FLPA 2A3XA 1G9DA 4B7RA 4FOVA 1U0AA 3AP5A 1YXWA 2OUJA 4FVKA 1E8UA 4K1YA 2C4AA 1LECA 2LALA 1MS8A 3B01A 1DYPA 1Z78A 1VIWB 2ZGQA 3VUOA 3PMEA 1A14N 4XZPA 1V3EA 1W6PA 5GZDA 4GKYA 5KXBA 1H30A 2KM2A 4D8SA 1LOEA 2F11A 2D43A 1USXA 1DIMA 1RITA 2WSUA 3CNAA 3TAYA 1E8TA 5EYXA 2PHXA 3V65A 3VKOA 2VSKA 4XE9A 5JMCA 1UZZA 3GVLA 4XTPA 4RL7A 1YRZA 3WDTA 3N35A 2LTNA 3R05A 1UKGA 2A6XA 2ZHNA 1DQ2A 1NXD1 2NM1A 1ONAA 4Q8LA 2WSVA 5F5QA 1MS3A 1LOFC 2NMOA 3ZYPA 3WHUA 2W5NA 5T5OA 3B69A 1NSBA 5GLVA 5E8AA 3B7EA 1AX0A 2DU1A 3WDUA 3I4IA 1WLDA 1DILA 5GALA 5H9QA 1NSCA 4FPYA 5GLZA 2VXRA 4XHBA 3POSA 5DUXA 2RHPA 3OYWA 4WV8A 5DUUA 2NMNA 2R1DA 3AFKA 1DQ0A 1PZ7A 4LBQB 1FYUA 2EXKA 3OJBA 3CL2A 5CAZA 1QDOA 3NN9A 1A4QA 3GNEA 1NCBN 4KBBA 4FJ6A 3GVKA 3FUQA 3B00A 4R9BA 2FHRA 5JLVA 4LBMA 4PCRA 3I8TA 3D11A 5GLWA 2ZMNA 1G7YA 2GNTA 1C1LA 4GZQA 1AXZA 5DZEA 3V0BA 4TYSA 4K3YA 3TI6A 2EIGA 1NN2A 2ZGRA 1LTEA 3AXEA 2HU4A 3SH4A 1F8EA 1O4YA 3BEQA 1QNWA 5H9PA 1CVNA 4ZKTB 1N1YA 4Q6KA 1LOFA 4BLJA 4YM1A 3OBTA 4DRVA 3AYCA 5HUMA 1Z4YA 1AF9A 3IKWA 4YG3A 1LOGA 3K37A 1OFSA 3ZXEA 5LK5A 2Q5TA 2W38A 4XJ8A 1INGA 4XMIA 1JOJA 1GZWA 1IVBA 3M3CA 1W6NB 4M3CF 4YFZA 3HMYA 2ZHLA 3K38A 4FQZA 4AGRA 4FP2A 1IS5A 2ZGOA 3H71A 4R9AA 2VK7A 1LHWA 1N1SA 3LSDA 4C1XA 3O0WA 1SFYA 1KDMA 4XBNA 3T1EA 2V5YA 2CYFA 3ATGA 3UK9A 3B9CA 3APBA 3AZZA 2AEQA 1LODA 1SLBA 4UF7A 3V0AB 4YM2A 1CIWA 2P34A 1E8VA 4Y1VA 4K1JA 1S0DA 2UU8A 4X47A 2F0ZA 2F13A 1QOTA 4YZ4A 2ZACA 4ATEA 2GNMA 2G4IA 3SITA 2D3PA 2YA8A 4Y1YA 2DWRA 2SLIA 1QMJA 3MEPA 2HTYA 3NSSA 1WBLA 2ZGMA 2ZBJA 3POWA 1W20A 1VCUA 4I00A 3FLRA 4K1ZA 1LJ7A 4UW3A 2A6YA 1USRA 2ARXA 4LBLA 4BLIA 1W6MA 3C2UA 4BPZA 3D6EA 1V00A 2W5OA 2DURA 1MR5A 5KXDA 3M2MA 2YMZA 5GJ6A 2V73A 3AP7A 4XJ9A 4FPGA 3ZSKA 4MWYA 1N3PA 2P37A 4KS3A 2ZHMA 3N3HA 2ZGUA 4GA9A 1LGNA 2JECA 3W59A 1MWEA 2CWSA 1WW5A 1VALA 4GXLA 4MJVA 4FPKA 4CPOA 3M3OA 4XTMA 3JU4A 1N1VA 4CPNA 2HT8A 2F25A 2RKCA 5DUVA 1WD3A 1W21A 4TZDA 2HTQA 2DUQA 4KS5A 4B7JA 4NN9A 2B7YA 4M4VA 4BQ1A 4YGDA 2DYCA 1SLLA 1D0HA 1CN1A 5E88A 4U36A 1GZ9A 7NN9A 2AEPA 4GJTA 3TIAA 1CR7A 1WLWA 3AJYA 4Z8BA 4GEZA 3USUB 3R4UA 2DVAA 2HTRA 1F5FA 3ASIA 3R4SA 4GZXA 3UJOA 4WEGA 5KXCA 2A70A 2PELA 2D6PA 3ZVXA 4QN5A 1B9SA 3U4XA 3ALWA 4QN4A 1Q8QA 5HUNA 1NMCA 4MX0A 2VU9A 1LESA 1OQ1A 3UL2A 4XJRA 1L7FA 3WLUA 3A71A 2A3YA 3SH5A 3AJZA 2ZHKA 1WCQA 4ITCA 2VK6A 1ULCA 2ZB6A 1Q8PA 4D69A 1G86A 4FPJA 1EUSA 1I1EA 4PBPA 5IT6A 3O5SA 1LCLA 2JD4A 4X4AA 1V0EA 2R1BA 2P3IA 2HTVA 1S0CA 4KS1A 5FREA 2HTUA 3WG3A 5B2DA 2R0FA 4SLIA 4GZPA 1GZCA 1KJLA 1MACA 3SILA 2SBAA 2A71A 2F10A 3M3QA 1JYCA 4P14A 2A3WA 4MJUA 3T1MA 2VUAA 4XBQA 2B8HA 5DUWA 2XZKA 3TI5A 4M3CE 3AP6A 4HZXA 3LSEA 3ZYRA 4YG0A 5DG2A 1F8DA 1SACA 2UWAA 5IK7A 3ZXJA 2C5DA 1SBEA 4LBNA 3AZWA 2DTWA 4GZTA 5L73A 1V3DA 2AR6A 1SLIA 2P3JA 3DUIA 1HKDA 5CBLA 2NP0A 1LOAA 4LBQA 1DLLA 1BZWA 1LOCA 1NNAA 4FPCA 2ZGLA 2XZJA 1MZ5A 2W39A 1F8BA 2NZ9A 2DU0A 4NOTA 3O0XA 2CTVA 2YXSA 5B2CA 4W65A 1Z4XA 3AZYA 2ZZJA 2E6VA 2ZGNA 4XMAA 1CQ9A 2PHTA 1INVA 2NN8A 2XG3A 3WDVA 4P9XA 1H9PA 2TEPA 3SANA 4B7MA 1L7HA 4FPHA 2YA4A 1S0JA 2EXJA 1PZ8A 1FAYA 2XCYA 5T52A 3QLQA 1SCRA 4QN7A 2WT0A 3D12A 3INBA 2BQPA 1ULFA 1INXA 5BYNA 1DQ4A 1FNZA 4YZ5A 2VW1A 3RS6A 3WG2A 1Z4WA 2WKKA 4GDIA 3SNMA 3ALXA 3KM5A 3M3EA 1KRIA 4RA0A 1WCSA 1ENSA 4YG6A 1V3CA 4H52A 4HL0A 1B9TA 5HUGA 3WDWA 2GMPA 1QNYA 2ZB5A 3SLIA 3VKFC 3ZXKA 2CY6A 3V0AA 1W1XA 2A7AA 3OBRA 1FV2A 5GM0A 1Z4VA 3NV3A 1Q8OA 1MS1A 4UW4A 1IVFA 3NV2A 1NCDN 2XB6C 1NNCA 3WNXA 3A0NA 2QWJA 5IK8A 1SLTA 4XBLA 4R9CA 3CL0A 1G9AA 4MWWA 3MPPG 1YI7A 4H53A 1IVGA 2DV9A 2QWIA 1VCJA 2VH9A 5JOZA 4LBOA 1IKQA 4YW2A 1LGCA 4JF7A 3O12A 2A6WA 5T55A 1XQNA 1GICA 2WLQA 1W8NA 1IOAA 1V6LA 4MWXA 3TI4A 1MS9A 1WW4A 3ENRA 3POYA 1C4RA 3WUDA 3SISA 3K36A 1KITA 1W6PB 2ARBA 1FATA 1WD4A 2QWAA 5IK5A 2ZGKA 4LBJA 4WZFA 2W08A 5JOXA 1S0GA 2W52A 4MC7A 1DHKB 3BIWE 3INAA 4GZSA 2W20A 1Q8VA 3AP9A 4BOWA 1LGBA 4Y22A 2D3RA 3N7JA 1N3QA 5NN9A 1A78A 2CMLA 3TB0A 3DGTA 1G9BA 2YA7A 4YGEA 1UX6A 4XIOA 1ZA4A 3FBYA 2GN3A 5CB7A 1N3OA 3D4KA 3WDXA 1NSDA 1AXYA 3H0OA 1MZ6A 3SALA 2CL2A 4YFWA 2D6NA 2A6ZA 3BODA 1VAMA 3NV4A 3A4UA 3ZXLA 1INHA 5JOWA 2WNEA 3VKLA 1DQ6A 2ZGTA 1F31A 1V2IA 1AX2A 2VSMA 2QWBA 1IVDA 2DUOA 2AREA 2YDTA 2GNBA 1A3KA 3AP4A 2PHUA 3OYWB 1JW6A 5AVAA 5GZGA 4JC1A 3PVNA 1RIRA 4YZ1A 1DBNA 3T2TA 2JE9A 1F8CA 2EXHA 1C57A 2I2SA 4AYUA 2XZIA 1H9WA 1SLCA 2JDZA 4R9DA 4DQAA 4Y26A 3N36A 3ZPYA 3WOGA 5CA6A 2R49A 5T5JA 2PHFA 3NV1A 1G9FA 2D6LX 1V6KA 1SNTA 1N47A 1FX5A 1S0EA 2AYHA 3TI3A 3WCSA 1GLHA 4GB1A 2R0HA 1GSLA 1QU0A 3K3AA 4DPNA 1PZ9A 2WT2A 4XIKA 1JN2P 2SIMA 4UW6A 1DYKA 5GLUA 3ZSLA 3HR9A 2DUPA 1WW6A 1J1TA 1G8WA 1ENQA 4MZAA 1IKPA 1UN1A 3IPVA 4GZOA 3PVEA 4FQ4A 1I3HA 2DVDA 2F27A 5E89A 3H6JA 3HN1A 1GKBA 4YZ3A 1GZWB 1QOSA 5GZEA 1DIWA 3V64A 3MW4A 2WQZC 1HLCA 5DZFA 1UL9A 1W0PA 4XHXA 1QF3A 2GMEA 3IN9A 4BMBA 2YROA 2EAKA 1WLCA 1Q8SA 4MWLA 1BKZA 1LEDA 2OVUA 1NMAN 4BMEA 4MWUA 4K1IA 2ZMKA 5IUQA 1RINA 1GNHA 2DVGA 1Z0HA 2EF6A 2Z42A 3AYAA 3L2YA 3AZXA 1APNA 4Y1ZA 4CZSA 1Z50A 1W6QB 1S0IA 2E53A 4HZYA 4Q8KA 4M01A 1JXNA 4XDQA 4CPMA 3M1HA 1LHVA 2YDPA 3ZXFA 3D5OA 2ENRA 4NC5A 2VK5A 1DGLA 5M1ZA 3CKZA 4WA5A 1LHNA 2D6MA 2HU0A 2BERA 5T5LA 4DS0A 2D44A 3WVJA 3N7KA 4WA4A 1ULDA 2QWEA 4XXPA 2HT5A 4MWJA 1W6MB 2GNDA 4Y20B 1SLAA 1MS0A 1CPMA 1UPSA 2C4LA 2PHRA 1GNZA 1DFQA 2AUYA 4XJZA 2R16A 1JYIA 4JCKA 2DTYA 1SBDA 4FZHA 3QCWA 4B7QA 4M3CB 2QWKA 3TICA 4HZVA 5F9TA 3ILFA 1BJIA 4FPLA 1AXKA 1XOGA 4UW5A 1S1AA 4K1HA 3O9JA 4XYXA 4Q1PA 5HUKA 2UWBA 1S0BA 2QWDA 2FMDA 2PHWA 1IS4A 1B9VA 3RG0A 4IQPA 3NWKA 1XOEA 1YIFA 1FV3A 2BATA 3VV1A 4Y1UA 2QWCA 2QWFA 4YGCA 1R1ZA 4GALA 4NCSA 4Q27A 5JDBA 1CONA 4XJUA 2ZMLA 3T1LA 1W6OB 3K39A 1LOBA 3W09A 4CPLA 5CNAA 1A8DA 3MW3A 1C1FA 4AVVA 1GYKA 1L7GA 2HYKA 3VKMA 4AGVA 5JOYA 1WBFA 4CPZA 5H9RA 4LBKA 4J9TA 5FRAA 1WUVA 2AGSA 3JU9A 4AVTA 5DG1A 5GLTA 1F9KA 1SO7A 2CWMA 1V0ZA 1Q56A 1W6NA 1ULEA 4K21A 1MS4A 1HDKA 2UURA 3FLTA 4P9WA 1INFA 2GALA 2OUHA 3RMYA 4HANA 4FPOB 5EWSA 2JE7A 1SCSA 2VW0A 4ZXKA 1BQPA 4B7NA 4ISRA 3PVOA 3KQRA 1NLSA 2F12A 1GV9A 1CESA 3TI8A 4XILA 2GMMA 4AGGA 1VLNA 1MVEA 4YM3A 1ENRA 4JRAA 3OY8B 2ZAAA 1V6JA 3WDYA 1UMZA 2GDFA 1LENA 3AYDA 1BJQA 1EURA 1AJOA 1DQ5A 5EXOA 2YA6A 1ZM1A 1G9CA 3AX4A 5JYYA 1JUIA 3AZVA 5HCBA 2ES3A 3WUCA 1X50A 1V6MA 3SH3A 1KDKA 2HT7A 3GVJA 2A5ZA 5SV8A 5T50A 1BXHA 2A6VA 4M4UA 5DXDA 4XJQA 4BBWA 1YO8A 4WEFA 1V6OA 5T54A 3AXDA 4LBQD 2E7TA 4CTEA 3JUUA 3MW2A 4ISQA 1CPNA 3OGGA 4K1KA 2E7QA 4HZWA 4H55A 1Y7BA 4FPEA 1QOOA 4M00A 3BOPA 1LULA 4CPYA 3WG1A 2X9MA 5IK4A 1O4ZA 2P3KA 1AVBA 1INWA 2F29A 3WHTA 1ULGA 2VY0A 4MWQA 1UAIA 4FVVA 4DFSA 4MWVA 1W8OA 1INYA 4QNPA 1EPWA 3AK0A 2CNAA 5HX0A 2YA5A 1NCCN 1QKQA 3USUA 3FFZA 4Y1XA 4U2AA 2OW4A 4WA3A 1GANA 2ERFA 4GWNA 1IVEA 1IS6A 4PQ9A 3A72A 2A75A 4K20A 3WV6A 4MWRA 2VW2A 4CRQA 2DVFA 4C1WA 1A4GA 3ILNA 2WJSA 1OKQA 3PJQA 4QN6A 5JVVA 1W6QA 3FUOA 4BM8A 4YGBA 1V0FA 1MVQA 1IVCA 4F83A 5HCAA 4OZXA 2WT1A 4X49A 1FNYA 1Z4ZA 2BF6A 1MS5A 2QWGA 3ILRA 4DGRA 2D6OX 2JKBA 4WVWA 1AJKA 3WZ1A 4XJWA 1URXA 4DRRA 4YLZA 2UWCA 2D3SA 3RQ0A 1KJRA 3AYEA 4HZZA 1GBGA 5HCFA 4YW1A 3V0BB 1SBFA 5GZFA 1LU1A 3WG4A 3O0VA 4Y20A 4XOGA 4L8QA 2YV8A 1WW7A 1BYHA 4XJAA 6NN9A 3O9KA 1V6IA 1V6NA 4Q26A 3CYEA 1N1TA 3ZSMA 2E51A 1NNBA 1YYNA 3Q9OA 4Q2FA 3N7MA 4GDJA 1EUTA 5T5PA 4M3CA 1CJPA 1D2SA 5DZGA 4M4NA 3LCPA 4PBOA 4Y22B 1W0OA 4FOQA 1KQRA 2JJ6A 4M3MA 2ZA9A 5KXEA 4YW3A 4ATFA 4QN3A 4YW5A 3IMNA 4MYEA 3GALA 4AWDA 4Q1RA 2ZGPA 3H73A 2QWHA 1S0FA 1JBCA 2W68A 4FOYA 2F24A 2F28A 4KS2A 4ASMB 4FP3A 3RRDA 3TIBA 1DQ1A 2BZDA 1TEIA 4WVVA 3BTAA 3VKNA 2DVBA 1EUUA 1W6OA 4P9YA 1V3BA 5EYYA 3RSJA 4KS4A 2VVZA 4GKXA 3W58A 2SILA 2VWDA 1HQLA 2D7FA 2YY1A 1QDCA 2C9AA 1B09A 1IS3A 2ZGSA 4MZEA 3UJQA 4AVSA 4XXAA 3N7LA 2YZ4A 1UZYA 2GN7A 4Y24A 1AZDA 3A0KA 3B3QE 2D6KA 1LU2A 1HQWA 4PF5A 4I30A 4NO4A 4FOWA 3WCRA 2H0BA 2AH2A 4GWMA 5H9SA 4FPFA 3H72A 1VAVA 1NCAN 2NYYA 1JHNA 1QGLA 2EALA 3OY8A 2ZABA 1NMBN 3OPZA 4YW4A 2EXIA 3ZSJA 1LHOA 1LEMA 4HIZA 4X6KA 4GZWA 4YZ2A 1LHUA 2ZKNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2AENA 3RMXA 3VGIA 4E2SA 2HTWA 2P2KA 2IZWA 2VTXJ 3IM0A 3IPVB 4YM0A 5GZCA 2F26A 4OQ9A 3A9GA 3SOBB 1AX1A 2VUDA 1DZQA 5FQ0B 1BEV2 1YQ8A 3FLPA 4J1XA 2A3XA 2WFF1 3IAQA 1LNSA 1G9DA 4IFLX 4MXWB 4B4QA 4B7RA 4KU8A 4FOVA 2VECA 1U0AA 2OXBA 2VO5A 5J98B 3WEZA 3AP5A 1YXWA 2OUJA 4KGGA 1VBC1 2XJSA 3LWCA 5I91A 4FVKA 1VB4A 1E8UA 1E1AA 4GH4C 2WZR3 4K1YA 2XVKA 3K46A 4LHLA 3NRUA 4URAA 4CP9A 1IZ3A 2C4AA 1RUI3 1XNCA 2VZOA 1LECA 2KXLA 2LALA 5F32A 4QPIB 1UOFA 1MS8A 3B01A 1W8WA 5CGJA 1DYPA 1Z7S1 1Z78A 1VIWB 4JDOA 2ZGQA 5FPZA 3HD8B 5FCCA 3VUOA 1YQ5A 3PMEA 4KGQA 1A14N 1J3PA 3CIHA 4HSLA 4XZPA 1K32A 1V3EA 4I0WB 5FZCA 1W6PA 5IAXA 5GZDA 4UOJA 5FZNA 2IXIA 4B3NA 4BIOA 1KS4A 3JCIA 4IERA 4MH0E 4GKYA 1VR3A 5KXBA 1HXS3 2XBO2 3OBZA 2HWD2 5FNRA 1H30A 2KM2A 5CVRA 5A6ZA 4IEUA 1PVC2 3LE0A 3TNQA 4D8SA 4OI2A 5FMCA 4AEJA 1LOEA 4LITA 4LXLA 3GBGA 5HV4A 2F11A 3NMBA 1AL0G 5C9AB 2D43A 1R1A1 5C7GA 1USXA 1NCQC 3MIBA 3ZO0B 1DIMA 1RITA 1ZVFA 4MVTA 4OHZA 4WVZA 1IUCA 4HZFA 2WSUA 4CA9A 2EIEA 5A3PA 1RUD3 1V70A 2XVLA 4HKLA 3KV9A 2EICA 3ORJA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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