1WCSA

A mutant of trypanosoma rangeli sialidase displaying trans-sialidase activity
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
634
structure length
628
Chain Sequence
AASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYILVGSFNKTRNYWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDYNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQPDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPAACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Sialidase Mutant Displaying Trans-Sialidase Activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
total genus 151
structure length 628
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2004-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wcsA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1wcsA01
3H0OA 1MR5A 2NMNA 1F8BA 4MWJA 5IUQA 3LCPA 3VV1A 1MACA 4M3CF 3WV6A 2F0ZA 2QWHA 1ENRA 5GZCA 1LOBA 1MS0A 4FPHA 1JHNA 3IN9A 1W6PB 3OYWB 2LTNA 4M3MA 3O9JA 4MZEA 1F5FA 2ZGOA 1FX5A 1A4QA 1NCCN 1WW4A 2A5ZA 1SLAA 4P9YA 5LK5A 4GXLA 2HTQA 4GJTA 5JOXA 2AEQA 1DQ5A 1SLLA 2F27A 1AXZA 2W5OA 2EALA 3IM0A 3PMEA 4ATEA 5HCBA 1LOAA 4NN9A 1O4YA 4AGGA 2F11A 3VUOA 1V6JA 4FP2A 4JRAA 3VKLA 2AYHA 4U36A 1QOOA 2XB6C 1Z78A 1S0DA 3WLUA 4DRRA 1E8TA 4HZWA 3AZWA 2OUJA 1SBDA 3V0BB 1CONA 3WZ1A 3IPVA 1ULCA 1Z4WA 1FYUA 4HIZA 2D6LX 4HZZA 1I1EA 1UL9A 4AWDA 4Y22B 1S0JA 4FPOB 1W6MB 1IVEA 5HCAA 1AVBA 4B7QA 1IOAA 2AENA 3WG1A 3ZXLA 1QU0A 2DUOA 5H9PA 2WT0A 2R16A 5IK7A 2ZHNA 3NN9A 4Y1UA 4YG0A 4K1YA 5GZFA 4IQPA 1CR7A 2DU1A 4Y1VA 2VK6A 1YO8A 1XOEA 2CY6A 1VALA 3O0XA 5EYYA 1LOFA 4Q6KA 1H9WA 1KQRA 5DZEA 2F12A 1C4RA 3N7LA 1G9AA 4AYUA 4QNPA 5H9RA 4QN3A 4PBPA 2ZMKA 1CVNA 3PVNA 4FVKA 3AZYA 3WOGA 4ITCA 1Z4ZA 2F28A 5E88A 4YLZA 2G4IA 3KM5A 3O5SA 4SLIA 4LBMA 1MVEA 3AP4A 1TEIA 3WG2A 2UWBA 3W09A 3SANA 1QOTA 2QWIA 6NN9A 3TICA 3B7EA 3U4XA 4QN4A 3AYAA 2P37A 5GLVA 5T50A 5HUKA 4XMAA 1WW7A 1W8OA 1HDKA 4R9DA 4GZSA 2ZBJA 4YM3A 4XE9A 2YA7A 1CJPA 4NO4A 1EUUA 4LBJA 4Q27A 1WUVA 1BKZA 1W0PA 4YW3A 1MS5A 4Q1RA 3AJZA 1IVFA 2WLQA 3AZVA 1GNZA 4X4AA 2VWDA 1C1LA 3O9KA 1YXWA 1DYKA 2YDTA 1GBGA 1SCRA 3AYEA 5CB7A 3N35A 1SCSA 2ZB5A 4KS1A 4MWQA 2V73A 4LBQB 2ZHLA 5GLTA 1DLLA 1KDMA 2ZACA 2VUAA 4XIOA 1NNCA 2CWMA 4UW3A 4X6KA 1IVCA 4TZDA 3ZXFA 3T1LA 3AJYA 1SBFA 4LBKA 1S0GA 3V0BA 2ZKNA 2VSMA 1CPNA 4WEFA 4M00A 1VIWB 2ENRA 4Z8BA 3R05A 4P9XA 3USUB 1QNWA 1WD3A 1F8CA 4Y22A 1B9TA 4FOWA 4YFWA 4WA4A 3OBTA 1UKGA 2BZDA 2B7YA 3GVLA 1LU1A 2SILA 5JYYA 2JECA 5SV8A 2YA4A 1V3BA 2GALA 2NMOA 4CZSA 4H55A 1QMJA 1QKQA 4FPGA 1G9FA 1Q56A 2YZ4A 5JOZA 4AVSA 2EF6A 2E6VA 1PZ9A 4J9TA 2DTWA 5NN9A 1SNTA 4XTMA 1ULFA 1A8DA 4XZPA 3BIWE 4ASMB 1LTEA 3SILA 3WG4A 3INBA 1WCQA 2Q5TA 2OW4A 1BXHA 4YZ4A 3I8TA 4FOYA 1V3EA 3CL0A 4ZXKA 3WDUA 2VH9A 2WT2A 4GZTA 2YA5A 3FLPA 5E8AA 1N47A 1HQLA 2ZGSA 1LJ7A 3IPVB 1H9PA 3VKFC 1GLHA 1LHOA 2UURA 4GA9A 4DRVA 4XJQA 2F25A 3ILFA 5JOWA 3POYA 5CBLA 4GZQA 4XJ8A 3BEQA 1NN2A 2VVZA 3VKOA 2ARXA 1AX1A 2QWEA 4GZXA 5DZFA 1PZ8A 1L7HA 1V00A 3TAYA 1SBEA 4W65A 1YRZA 2FMDA 4YM0A 3AZXA 1W1XA 2SLIA 2NN8A 2HTYA 4XXPA 5HUNA 1DYPA 1WLCA 2JDZA 2BERA 4XMIA 1ULDA 2OUHA 5F9TA 2DVDA 3RRDA 2AUYA 2QWFA 1AXKA 4FP3A 1IVBA 1UX6A 1EPWA 1LHNA 4NOTA 1V0FA 4K1IA 2GNMA 3N7JA 2HTWA 2GMMA 3UK9A 1NMAN 2CYFA 2DVFA 1GV9A 1VCJA 3W58A 4YGCA 1G9BA 1WBLA 2YROA 4AVTA 1G8WA 1E8VA 3GNEA 4CTEA 1INYA 3B3QE 3D6EA 1DIWA 1URXA 1LHUA 3HMYA 5HX0A 1F9KA 5KXBA 3CYEA 2ZGMA 1V2IA 3AP5A 1NCDN 2E51A 4GKYA 4XJ9A 4MWWA 2WNEA 1EURA 4MJVA 1GANA 1PZ7A 2AR6A 4U2AA 2XG3A 1H30A 1FNYA 1LOCA 2QWKA 1GZCA 1SLCA 3GVKA 2Z42A 2VW0A 4YGBA 1VAMA 1JOJA 4FOVA 4XJRA 2YDPA 4B7RA 1S1AA 4PBOA 1MWEA 4R9AA 4Y20A 1GICA 2VXRA 4KS4A 2A71A 3TIAA 1MZ5A 5GZDA 1Z50A 3W59A 4XBQA 3MEPA 3WDWA 3TI3A 2VSKA 1IS4A 2DVBA 2WKKA 1C1FA 1Z4YA 1MS3A 1SLIA 1DQ1A 3VKNA 4XJWA 1MZ6A 3SH5A 3NV3A 1LOEA 4XOGA 4XHXA 1LESA 3FFZA 1W20A 4FPYA 2D3SA 2GMEA 4GZWA 5DXDA 5AVAA 2ZGPA 3ATGA 3IMNA 1IKPA 1F8DA 3OY8A 4GKXA 4CPZA 4YM1A 2F13A 2DYCA 2W08A 3N36A 4QN7A 1V3DA 1S0FA 1CN1A 4K1JA 4MYEA 5GALA 1ZM1A 3PJQA 3ZPYA 1NCBN 4UW5A 2QWGA 3FBYA 1INWA 4CPNA 1SO7A 4YZ2A 2VW2A 2E7QA 2ZABA 4K3YA 1OQ1A 3SH4A 1SLBA 4D8SA 2DUPA 5CNAA 2PHRA 1ONAA 3V0AA 4YM2A 1DQ0A 2SIMA 2ZHKA 4YGDA 4FPKA 4YZ5A 2QWJA 1INGA 4MWVA 2EXHA 3GVJA 4K1HA 4XJAA 1RINA 1INVA 3INAA 1BQPA 2VK5A 2D6PA 4F83A 3FUQA 1JW6A 5JVVA 1A78A 2CMLA 3T1EA 1FATA 1S0EA 1AF9A 2ZGKA 3OBRA 4WA3A 1WW5A 4XJUA 3RG0A 4ISRA 2EIGA 2VW1A 4BOWA 1UPSA 2E7TA 2DU0A 1JN2P 2AEPA 3ZSMA 2GNTA 1A3KA 5GJ6A 4BMBA 3ENRA 2HU4A 2E53A 1WW6A 4Q8LA 5DG2A 5GZGA 2W20A 5EYXA 4YW4A 4KS3A 2QWCA 3AZZA 3MW4A 1Q8PA 4ISQA 4KS5A 1CESA 1E8UA 1DZQA 1X50A 2HTVA 3ILRA 4B7JA 2JJ6A 3ALWA 2YY1A 5KXDA 4YW5A 2DUQA 3Q9OA 2NYYA 5GM0A 1S0IA 4HL0A 2YXSA 4GEZA 2ZGLA 2D6NA 3A71A 3K3AA 3TI5A 1DBNA 1Q8SA 1NSDA 4CPYA 2A6YA 1MS4A 1L7FA 3TI4A 3SITA 4MWYA 2EAKA 3UL2A 1WD4A 3H73A 1INHA 4GDJA 1EUTA 4YG6A 4H53A 1F8EA 1LEDA 4M4UA 1Z4VA 3OPZA 4MZAA 4P14A 3IKWA 3ILNA 2GN3A 3FLRA 5JMCA 2ES3A 1WCSA 1VCUA 5KXEA 2DTYA 2A3WA 5DUUA 3D4KA 3WNXA 4WVVA 2A7AA 3K38A 1A14N 3AP6A 1Q8VA 2GNBA 4HZYA 2ARBA 1VLNA 5DUXA 2HT7A 2DWRA 4BBWA 5H9QA 2GDFA 4FPLA 3V65A 1W6NA 1G7YA 3D5OA 1KRIA 1UAIA 1NSCA 2I2SA 2D43A 1KJRA 5E89A 3M3EA 2D6OX 3FUOA 5IK4A 2VU9A 3MW2A 4QN6A 4Y20B 1V6IA 5CA6A 5CAZA 4JF7A 2C9AA 2OVUA 4ATFA 2YA6A 3RS6A 1QF3A 1LENA 4GZOA 4BMEA 4PCRA 1GNHA 2ZGUA 3POSA 1HLCA 4XBLA 5EWSA 3D11A 1NNAA 4R9BA 3AFKA 4FPJA 3PVEA 3TB0A 4XILA 4YW1A 4DQAA 2B8HA 1YYNA 5DG1A 2GMPA 3ZSLA 2UWCA 1GZWB 3WHUA 1EUSA 2JE7A 3OY8B 4R9CA 3WVJA 2R1DA 1OFSA 1XOGA 3NSSA 1VAVA 5T5LA 4Q8KA 2VK7A 3B01A 1JYIA 3WHTA 1AJOA 2C5DA 4FPEA 3MW3A 1RIRA 4MWXA 3R4UA 1HKDA 4UW4A 4LBLA 2UU8A 4UW6A 5GLWA 3A4UA 5T5JA 1V0EA 1LU2A 4PF5A 3RQ0A 4CRQA 3K37A 2W5NA 3V0AB 1UMZA 3K36A 2RKCA 3JUUA 3UJQA 2HTUA 1SFYA 1N1SA 1WLDA 3TIBA 1USXA 2LALA 2W52A 4Y1XA 3CKZA 3POWA 4BM8A 5H9SA 3ZSJA 1DFQA 5B2DA 2X9MA 2XZKA 4MWUA 2CTVA 4Q26A 3T2TA 1USRA 4Y1YA 2ZGTA 2NZ9A 4L8QA 1UZYA 3JU4A 2ZA9A 4YZ3A 1G9DA 7NN9A 4I30A 4FOQA 3AXEA 4FJ6A 2AREA 1DQ2A 3AX4A 4M01A 4TYSA 1DIMA 3SLIA 4XIKA 5T5OA 1JUIA 1J1TA 1NLSA 3B69A 3B9CA 4OZXA 4BLJA 1QDOA 3GALA 4XDQA 3MPPG 1V6NA 1NCAN 1D0HA 2EXKA 2P2KA 1LEMA 5L73A 1N3OA 1GZ9A 2JE9A 3H71A 1W6QB 2A6ZA 2DVGA 5FRAA 3WDXA 1Z4XA 4AVVA 1BZWA 3A0NA 4GWMA 4ZKTB 4DPNA 4MWRA 2ZGQA 2D6KA 2F10A 1AZDA 1B9SA 2P3IA 4Y1ZA 3C2UA 3ALXA 1LECA 2A6WA 1CIWA 4K1KA 3H72A 2TEPA 2PHXA 3NV4A 2YV8A 1ZA4A 3SNMA 5JOYA 1CPMA 1S0BA 2A3XA 4HZXA 1N1VA 3O12A 3M3OA 4C1XA 3CNAA 3A0KA 1GZWA 3ASIA 2JD4A 4MWLA 1CQ9A 3WDTA 3QCWA 4FPFA 2VY0A 3K39A 2EXIA 2WSUA 4DGRA 1IS6A 4HANA 3BTAA 4YW2A 2HT5A 1SACA 4KBBA 1GKBA 2F24A 1W0OA 1C57A 1JYCA 1W6NB 2ZMNA 3LSEA 1LGNA 1Q8QA 4GB1A 3RSJA 2BATA 1Q8OA 2P34A 4M3CB 4K20A 4WZFA 2AH2A 4QN5A 2HU0A 2CNAA 4PQ9A 1APNA 1Y7BA 4JCKA 3B00A 5DUWA 1AJKA 3NV2A 1LHWA 2BQPA 2DV9A 2UWAA 3O0VA 1V6OA 3LSDA 1YIFA 1UN1A 2H0BA 2R0HA 1NXD1 5T54A 4WEGA 1LGBA 3AP9A 1NSBA 1A4GA 2QWAA 4YG3A 4I00A 1W6OB 1LGCA 1LOFC 2R1BA 1ULEA 1AXYA 5FREA 2CWSA 1S0CA 4LBQD 3N3HA 4M4VA 2W68A 2NM1A 4Y24A 2AGSA 2F29A 3TI8A 1U0AA 3WCSA 1LOGA 1NMBN 4JC1A 4B7NA 3M2MA 2F26A 4C1WA 5T55A 1KDKA 1SLTA 2FHRA 4M3CE 4DFSA 2YMZA 3JU9A 4NC5A 1INFA 4CPLA 4GWNA 1G86A 2JKBA 3RMXA 4CPOA 1WBFA 1LODA 5T5PA 1W6QA 2GN7A 2W39A 1LULA 1KITA 1F31A 1R1ZA 4GZPA 1GYKA 4Q2FA 3SISA 4K1ZA 3N7KA 1N1TA 3ZYPA 4D69A 1AX0A 4MJUA 1BYHA 5T52A 2HT8A 5HUMA 4MX0A 3BOPA 2XZIA 2WSVA 2HTRA 2GNDA 2P3JA 1FV3A 3FLTA 1V6LA 1JXNA 1QOSA 2RHPA 1FAYA 3AP7A 1I3HA 4LBOA 3CL2A 1FNZA 1W6PA 5IK5A 3OYWA 1MS9A 3WDVA 2R0FA 3WDYA 4YGEA 2A75A 3H6JA 2DURA 4XJZA 3AXDA 1MVQA 3T1MA 3OJBA 4K21A 2SBAA 3ZVXA 4FPCA 3APBA 4M4NA 4XXAA 4DS0A 1MS1A 5M1ZA 2A6VA 4FVVA 2ZMLA 4AGRA 4XYXA 4XHBA 3D12A 2ZGNA 1N1YA 4YFZA 4XBNA 3RMYA 3QLQA 3NWKA 1LCLA 1NNBA 3HR9A 1IS3A 1DGLA 5DZGA 1V0ZA 1OKQA 4GALA 3HN1A 4M3CA 1FV2A 2DVAA 2V5YA 3ZXJA 5KXCA 3R4SA 4Q1PA 3WUCA 1HQWA 5HCFA 1ENQA 4BLIA 1DQ4A 1XQNA 1DQ6A 1V6MA 3M3CA 2PELA 1W6MA 5EXOA 4BQ1A 2A3YA 4WVWA 1AX2A 3WUDA 2C4AA 1IS5A 4NCSA 2WT1A 1W6OA 5BYNA 4Y26A 4UF7A 1QDCA 1B9VA 3UJOA 3SALA 3PVOA 1BJQA 3N7MA 3DGTA 3OGGA 3L2YA 2R49A 3TI6A 3BODA 3KQRA 2NP0A 2ZGRA 4FQZA 5GLUA 1IVGA 2PHUA 3M3QA 2D3RA 4GDIA 1NMCA 2D3PA 2PHWA 4FZHA 2D6MA 5B2CA 2A6XA 5IK8A 1UZZA 5F5QA 1MS8A 1Z0HA 4BPZA 1L7GA 4LBNA 3M1HA 1W8NA 1DHKB 2ZB6A 2P3KA 1W21A 4HZVA 2D7FA 2CL2A 2ERFA 3ZSKA 3WCRA 1QNYA 1KJLA 4RA0A 3O0WA 2ZAAA 2PHFA 2PHTA 5IT6A 3NV1A 3I4IA 4X47A 1V3CA 3AYDA 2WQZC 4CPMA 4X49A 3ZXEA 1DILA 3A72A 1GSLA 2QWDA 5GZEA 1B09A 1BJIA 2ZHMA 2XZJA 2D44A 1QGLA 4XTPA 2YA8A 2W38A 3ZXKA 1V6KA 3WG3A 2BF6A 1N3PA 1G9CA 1INXA 4RL7A 4WV8A 1WLWA 5HUGA 4YZ1A 3SH3A 1O4ZA 4FQ4A 2WJSA 1ENSA 1N3QA 3V64A 4LBQA 2ZZJA 2HYKA 1ULGA 4KS2A 2XCYA 5JLVA 2C4LA 3ZYRA 4B7MA 3DUIA 1IKQA 1YI7A 4WA5A 1IVDA 4MC7A 5JDBA 5DUVA 4AGVA 1LHVA 2A70A 4H52A 2KM2A 2EXJA 1JBCA 3VKMA 1D2SA 3AK0A 4P9WA 1RITA 3AYCA 3USUA 5GLZA 2QWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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