1WCSA

A mutant of trypanosoma rangeli sialidase displaying trans-sialidase activity
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
634
structure length
628
Chain Sequence
AASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYILVGSFNKTRNYWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDYNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQPDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPAACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Sialidase Mutant Displaying Trans-Sialidase Activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
total genus 151
structure length 628
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2004-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wcsA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1wcsA01
3V0BB 4B7NA 1LGNA 4Y24A 1QMJA 4Y1UA 1NSBA 5DZEA 2D6OX 5DUVA 2YXSA 3AZXA 2DVDA 3SH4A 4C1WA 3AP5A 5JDBA 2AYHA 1EUSA 3N35A 4GJTA 5CNAA 1S0GA 2PHXA 3RQ0A 3LCPA 4FQ4A 1G8WA 2C4AA 2R0HA 1F9KA 4LBMA 1IVGA 4GKYA 2AEPA 1NLSA 2CNAA 4B7MA 4Q1RA 1N3PA 4ISQA 3A72A 4PF5A 2F0ZA 3POSA 2ZABA 1BZWA 1CVNA 3CNAA 4M3MA 1UX6A 3GNEA 3TAYA 4YW3A 1L7FA 3V64A 1FV3A 2WJSA 5HUKA 4Y1XA 4K21A 4M3CF 2HU4A 1V6OA 1LCLA 4YW4A 2Z42A 2LALA 2WLQA 3MEPA 2HT5A 4FPGA 4NC5A 4DFSA 3OYWB 5KXDA 4FPYA 1VALA 4FP3A 3BTAA 2ZB5A 4Z8BA 3NV2A 1LTEA 1W6OB 2D3PA 4M00A 1QNYA 5L73A 1IS4A 1V3DA 3H0OA 4BPZA 5JLVA 2AREA 1USXA 1LOEA 1MS0A 4K1ZA 4YZ4A 1Z50A 2D3RA 2ZGPA 4XOGA 4MWVA 3T1LA 2DTWA 1SLAA 2ZBJA 3APBA 2AR6A 2ZKNA 3POYA 1YIFA 2GALA 3PJQA 2DWRA 1IS6A 3AP7A 4XJ8A 2A6VA 1VIWB 1WLWA 3PMEA 1LHVA 4NOTA 4YG6A 4ASMB 2VK7A 1W6PB 1SLCA 3A4UA 4H52A 4FPCA 4YLZA 1GNHA 1Z0HA 2D44A 3SALA 3SNMA 1W8OA 4KBBA 4Y1VA 3AZVA 1Z4YA 3MW4A 2NMNA 3FBYA 1HKDA 2OVUA 4R9CA 3H72A 3VV1A 1JBCA 4MWQA 2W5NA 4XJAA 1MVQA 3JU9A 3NWKA 4M3CA 1IS3A 2F12A 4GZTA 1EUUA 4P9YA 3ZXKA 1WBLA 1KDMA 4U2AA 4DS0A 4PBPA 5GZGA 3M2MA 4GDJA 3OBRA 5H9RA 3CYEA 5HCFA 1QF3A 3AZZA 2YDTA 2XB6C 4CPNA 4K1KA 1AF9A 3QCWA 2R1BA 3M1HA 3WG4A 3AFKA 3D6EA 4FJ6A 2WSVA 1DLLA 4QN3A 2CWMA 4MC7A 5KXCA 2HTYA 2OUJA 2NYYA 1BQPA 2YY1A 2YMZA 5GLUA 2YA5A 2YA6A 1LESA 1X50A 1DYKA 5H9PA 1W6QB 2WT1A 3M3CA 4XBNA 2W20A 1DYPA 1LEDA 1C1FA 2GNTA 1N3OA 4WV8A 1A78A 4MWWA 1WLCA 1R1ZA 4MWLA 4AWDA 5FRAA 1Y7BA 1F8BA 2QWHA 3RMXA 4LBQD 1FAYA 3WG2A 4Q8LA 4Y26A 1ULGA 4HZZA 1ZA4A 1W6MB 3DUIA 2UWCA 2V73A 5T50A 1AJKA 2ZGMA 1LGBA 1Q8OA 1LJ7A 1ULEA 2VVZA 1A4QA 2A6WA 2ENRA 1V0ZA 1LGCA 3HN1A 3B3QE 1SBFA 2KM2A 1H30A 3USUB 1LOAA 3SITA 1U0AA 4UW6A 2BERA 5T5LA 1IS5A 4DRVA 3FUOA 2DV9A 3ZSMA 2YA7A 2W68A 2CY6A 3TI5A 2JECA 4U36A 1LHOA 3SANA 2JE7A 5JOYA 3UK9A 4XBLA 2QWCA 5CA6A 3I8TA 1WBFA 4WEGA 1NCDN 2H0BA 4BMBA 1L7HA 1RINA 4CPYA 4BM8A 2F13A 3V0BA 4R9DA 2CL2A 2WNEA 5T55A 1H9WA 4M4VA 4BMEA 4KS3A 3TICA 1AXKA 1WW5A 4AGGA 4GXLA 4FP2A 4FZHA 2WT2A 4LBLA 2ZGRA 1VAMA 5HX0A 2QWGA 4AGRA 4B7RA 1E8TA 4XJUA 4RL7A 1W0PA 1FYUA 2ZGSA 2ZB6A 4X6KA 1N1YA 3L2YA 2P3IA 2B8HA 2UWBA 3HMYA 3WLUA 3A71A 3V65A 5EXOA 1SBDA 1GZWB 3WDXA 4BQ1A 2ZGOA 1V3CA 4XZPA 1S0JA 1AJOA 3AYAA 4IQPA 3OBTA 3OYWA 3WDVA 4Q1PA 2DURA 1EURA 5T5JA 4HZVA 3VKFC 1B9VA 1W6OA 5JOZA 2R49A 3IKWA 2CMLA 5GZEA 3TIBA 3UJOA 2HT7A 4PCRA 1WD4A 4YM1A 1LENA 2W38A 1FX5A 4D69A 2SLIA 1LOFA 2R0FA 3AYDA 5H9SA 1BYHA 2JKBA 1MS1A 5T5OA 1KITA 4XHBA 3K38A 2F24A 2YA4A 1JYIA 3H73A 3KM5A 4YG0A 4TZDA 4PBOA 3ZPYA 4QN7A 1DIWA 4XJ9A 2P3KA 4X47A 1GKBA 4FVVA 2A6ZA 1W6PA 4AVTA 2AUYA 1WCSA 2HYKA 4P14A 1QGLA 1INYA 2VUAA 1N3QA 3VUOA 5JOWA 4FPHA 2YV8A 5JYYA 3ZSJA 1CPMA 3ILRA 5DUXA 1ZM1A 4SLIA 5GZDA 1WUVA 3ZVXA 4UF7A 3WNXA 5GLVA 5IK4A 3WDUA 1V6LA 1SLBA 4CZSA 2UU8A 3H71A 6NN9A 3AZYA 1OQ1A 1NMCA 2GNDA 3I4IA 1QOOA 4FQZA 4L8QA 2HU0A 1UN1A 2C5DA 1GZ9A 3N7MA 4P9WA 5HCAA 3K3AA 2DVBA 2PHWA 4QN5A 1W8NA 1OKQA 2BATA 1V6KA 1S0BA 1ULFA 2A7AA 3RSJA 1INFA 5T52A 1FNZA 4XE9A 2GMPA 2D6KA 3AP6A 1IVFA 4BLJA 3C2UA 2A5ZA 3B00A 2F25A 2AH2A 1IKQA 1B09A 4MWYA 4NO4A 2C9AA 1BJIA 2OUHA 3ZXFA 4K20A 1HLCA 1IVDA 2ZMKA 1WD3A 2UWAA 4R9AA 4AVVA 4GB1A 3UJQA 3ZSLA 3AP4A 3IPVB 1W6QA 4P9XA 1INWA 3CKZA 1OFSA 2X9MA 1MZ6A 2A71A 3VKLA 3BIWE 5F5QA 1IKPA 1SO7A 3ATGA 4ZKTB 3UL2A 5SV8A 4BBWA 3A0NA 1WLDA 2QWBA 3AJZA 2G4IA 5IK7A 3WUCA 1AXZA 4LBJA 5CBLA 4XBQA 2QWEA 3TB0A 3QLQA 2BZDA 4QN4A 3INAA 3WG1A 5FREA 1DGLA 1W6MA 3WG3A 1QOSA 4ATEA 2F29A 4GWMA 2GDFA 2CTVA 4K1IA 1BKZA 1B9SA 2VK5A 2D6LX 1SLIA 3ZYPA 4XJWA 3USUA 2A3XA 2HT8A 2WT0A 4JC1A 3N7KA 4Y1ZA 1TEIA 2VH9A 2P2KA 4C1XA 2Q5TA 1V3EA 4WEFA 3NV1A 1AVBA 2D6NA 4YFZA 4LBKA 1Z4ZA 1GV9A 4FPEA 1LHUA 2GNMA 5BYNA 5E89A 1NCAN 1H9PA 4GEZA 2GMMA 2HTQA 3M3QA 1LEMA 1S0IA 3KQRA 4YW5A 1NCBN 3WDTA 2GN3A 2VY0A 5DZFA 3R05A 1MS4A 3FLRA 2VW1A 1DQ5A 5DUUA 1CJPA 2D6MA 4HZYA 4Q6KA 3AYCA 2ZMNA 5DUWA 4XILA 2QWFA 2LTNA 4MJVA 5E88A 2EXHA 1JYCA 5T54A 1NSDA 1FNYA 2EXIA 1INGA 3T2TA 2VSKA 5CAZA 4BLIA 4Q8KA 1AX1A 3N7LA 2DVAA 2NN8A 4B7JA 1KJRA 1MZ5A 4RA0A 4XTMA 4WVVA 4YGBA 4YGCA 1YO8A 5H9QA 3WHUA 2SIMA 1GICA 1C57A 4LBQB 5EYYA 1GZWA 2TEPA 1C4RA 3RG0A 1IVEA 2HTUA 4YM0A 4DRRA 4WA3A 2B7YA 5GJ6A 2A75A 4YZ1A 5T5PA 2DYCA 3GVKA 2OW4A 4MWXA 1F31A 3OY8B 1S0EA 1F8EA 1QU0A 4KS4A 3TI4A 1WCQA 1G7YA 3FLPA 1Z4XA 4FPKA 4ITCA 1F8DA 5CB7A 3ENRA 3ALWA 2D7FA 1RIRA 3SH3A 1VAVA 1WW4A 4YM3A 1B9TA 3ZYRA 5IT6A 2D43A 5M1ZA 2SBAA 1G86A 1MS5A 4XMAA 2PHRA 5GM0A 2WSUA 1YXWA 1Q8VA 1V3BA 1ULDA 2VXRA 4MWUA 1DIMA 1MS8A 1APNA 3RS6A 2YROA 4K1JA 1G9CA 2VWDA 2YDPA 1SNTA 4MZEA 4AYUA 4WZFA 4CPZA 1QDOA 4XYXA 2F26A 1A4GA 3D12A 4NN9A 3O9JA 3N7JA 1LOBA 1QNWA 1INVA 3WCSA 5HUGA 5GLWA 1JHNA 2HTVA 2A3YA 1MWEA 3Q9OA 7NN9A 1YYNA 2ZHMA 1BXHA 1SLTA 3AJYA 2XZJA 1VLNA 2WKKA 4CTEA 4X4AA 1KDKA 1W1XA 3BODA 3NV4A 3SISA 1C1LA 1Q8QA 1GYKA 3M3OA 2ZZJA 1S0FA 1G9DA 5GLTA 1GANA 3WUDA 3JUUA 3BOPA 3WOGA 1LOGA 1UZZA 4MX0A 1V2IA 2ZGUA 2R16A 2BF6A 1V6MA 4Y22B 4FPLA 2EALA 4GWNA 4GZWA 1E8UA 2DU0A 1I1EA 1NNBA 1NMAN 3DGTA 1DQ0A 3OPZA 3PVNA 3GVLA 1DQ6A 4HZWA 2QWDA 4GZXA 2EAKA 4YM2A 3IPVA 3B7EA 4FPOB 1QDCA 1N47A 5HUNA 4YZ2A 2QWIA 1N1SA 4CPMA 2JD4A 3PVOA 1YI7A 4TYSA 3FFZA 1AZDA 4Q26A 5JVVA 5JOXA 4JRAA 4WA5A 3O5SA 3RRDA 3AXDA 3IM0A 1KJLA 1Q8PA 4DGRA 4KS1A 1DZQA 2QWKA 1JOJA 2ZMLA 5IK5A 2BQPA 5GZFA 1ENRA 2W5OA 3O0XA 4DQAA 3MW2A 1NXD1 3VKNA 1KRIA 5KXBA 4HL0A 1ENQA 1GNZA 2ERFA 1A14N 4CPLA 2DTYA 1S1AA 3AX4A 2D6PA 1LHNA 3CL2A 1O4YA 2DU1A 4MYEA 4B7QA 1CESA 1SCRA 2C4LA 4FVKA 3ZSKA 5IK8A 3JU4A 4UW3A 2FMDA 2HTRA 4XJZA 1HDKA 1VCUA 3W58A 1IVCA 1EUTA 4YW2A 1DFQA 2NZ9A 2VU9A 5GALA 1XOGA 2ZGTA 1WW7A 3K36A 3WCRA 3TI8A 1Z78A 1FV2A 4Q27A 5E8AA 5B2DA 4M4NA 1INHA 1D0HA 1V0FA 2PHFA 1Q56A 5AVAA 1SFYA 4YGDA 4GZSA 2HTWA 4HIZA 1W6NA 1JXNA 1SACA 5IUQA 3R4UA 2E53A 4LBQA 3N36A 1NCCN 2A6XA 1D2SA 1DILA 4MWJA 3WV6A 3RMYA 2JJ6A 4Y20B 4MJUA 1CIWA 1S0CA 4F83A 2XZKA 4ZXKA 3T1EA 1SLLA 2ARXA 3O0WA 1VCJA 3B69A 1LHWA 3AP9A 2A6YA 5EWSA 1G9AA 3OY8A 4GDIA 5EYXA 4HZXA 1XQNA 2PELA 3IMNA 4X49A 4J9TA 1GLHA 4XXAA 1SCSA 1V0EA 3H6JA 2ZA9A 4WA4A 1CPNA 1CONA 5HCBA 1JW6A 1GSLA 2XG3A 4CPOA 1PZ9A 4HANA 5LK5A 1AX0A 3AYEA 1ONAA 2DVGA 1G9BA 1USRA 4FOVA 3FUQA 1V6NA 1KQRA 5DG1A 2NMOA 3K39A 4FOYA 4Q2FA 4WVWA 3GALA 3O0VA 3SILA 2FHRA 4M3CE 2P37A 3A0KA 1DBNA 3T1MA 2EF6A 3V0AA 4I30A 3W59A 1AXYA 3ZXJA 1FATA 3ZXLA 1EPWA 1CR7A 1Z4VA 2GN7A 2NP0A 2DUPA 5DXDA 2VW0A 1NNAA 3K37A 2ZACA 5B2CA 1UKGA 4GZOA 1UL9A 4KS5A 1Q8SA 5NN9A 2E51A 4BOWA 1CN1A 1WW6A 2EXKA 1INXA 3U4XA 4MWRA 1LODA 4QNPA 1ULCA 4JF7A 1AX2A 4Y22A 1W6NB 2VW2A 4ATFA 3LSDA 2P3JA 2JE9A 2VSMA 4YGEA 4LBNA 1QOTA 2PHUA 1DQ1A 5GZCA 1UAIA 2F28A 4XXPA 3D4KA 3VKMA 2AGSA 1HQWA 3HR9A 1PZ8A 2CYFA 1L7GA 1GBGA 1UMZA 4OZXA 2GMEA 3FLTA 2YZ4A 1N1VA 4XTPA 3ASIA 2AENA 2RKCA 1PZ7A 3ZXEA 4GKXA 1V00A 4XDQA 3WDYA 2ES3A 3MPPG 1MR5A 4FPFA 4XJRA 3ILFA 4K1HA 1IOAA 4AVSA 4H53A 4YFWA 4GALA 2WQZC 1J1TA 3TI3A 2JDZA 1JN2P 2QWJA 3GVJA 2ZHKA 3POWA 2ARBA 2DVFA 4XMIA 4M01A 1XOEA 5DG2A 2P34A 3NV3A 1UPSA 3AXEA 3V0AB 2DUQA 1LOFC 1A8DA 1W0OA 4GZPA 1DHKB 1F5FA 4UW4A 1LULA 3N3HA 3O12A 2E7TA 2W52A 2SILA 1A3KA 1E8VA 1DQ4A 2E7QA 4PQ9A 3WDWA 3R4SA 5KXEA 2V5YA 4M3CB 4ISRA 4FOQA 4YW1A 4FPJA 2XZIA 4XIOA 2GNBA 1LECA 3AK0A 1ENSA 5JMCA 2PHTA 2NM1A 2ZGLA 4YZ3A 1CQ9A 4R9BA 2EXJA 2I2SA 1RITA 4KS2A 1MVEA 2ZHLA 5DZGA 3WHTA 2F11A 1JUIA 1I3HA 3SH5A 2YA8A 3IN9A 3AZWA 1N1TA 4YZ5A 3CL0A 1DQ2A 4YG3A 3D11A 3B01A 4CRQA 2ZAAA 4FOWA 1LOCA 3MW3A 4QN6A 1MS3A 2D3SA 1F8CA 1UZYA 4Y20A 4M4UA 4XHXA 2E6VA 4LBOA 4DPNA 3VKOA 4MZAA 4UW5A 1GZCA 3W09A 3SLIA 1Z4WA 2F10A 1YRZA 3D5OA 4H55A 4XIKA 2RHPA 4Y1YA 2ZHNA 1IVBA 4K1YA 3O9KA 4JCKA 1S0DA 3NN9A 3OJBA 2W39A 1URXA 3TIAA 3M3EA 1O4ZA 2CWSA 4AGVA 5HUMA 2R1DA 1NSCA 1W21A 1V6JA 2XCYA 3ALXA 3WVJA 4NCSA 2F27A 4XJQA 4GZQA 1NN2A 2VK6A 1SBEA 1W20A 3ILNA 1HQLA 3LSEA 3INBA 3WZ1A 4D8SA 3OGGA 4W65A 2DUOA 2ZGKA 1LU1A 1NNCA 1NMBN 4GA9A 2ZGQA 1G9FA 2A70A 2UURA 2W08A 3B9CA 3NSSA 1V6IA 1LU2A 1MS9A 1QKQA 3BEQA 2EIGA 4I00A 2A3WA 3PVEA 5F9TA 1MACA 3TI6A 4K3YA 5GLZA 2AEQA 1BJQA 2QWAA 2ZGNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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