1WCSA

A mutant of trypanosoma rangeli sialidase displaying trans-sialidase activity
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
634
structure length
628
Chain Sequence
AASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYILVGSFNKTRNYWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDYNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQPDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPAACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Sialidase Mutant Displaying Trans-Sialidase Activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
total genus 151
structure length 628
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2004-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wcsA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1wcsA01
1LU2A 3O0WA 3C2UA 3ZSLA 1S0BA 1U0AA 3L2YA 4FOVA 1F8CA 4AGVA 2XG3A 2F13A 2ZB6A 4FZHA 1Q8OA 2HU0A 4GWMA 2QWGA 1ULGA 3A0KA 2AR6A 3UK9A 5FREA 3ILNA 2YA7A 1NSCA 4GZSA 1PZ9A 1Q8VA 1W0OA 2YY1A 2CTVA 2BATA 2QWFA 4BPZA 4YZ2A 5EWSA 2YDTA 1KITA 2A3YA 4KBBA 4Y22A 5JOXA 3SITA 1NNBA 1J1TA 3ATGA 1HKDA 1W6MA 2BZDA 2ARXA 4YW5A 4DRRA 1INYA 3TI4A 1MVQA 2AENA 3V64A 2JECA 2RHPA 3VKMA 3R05A 1N47A 1DIMA 5DUWA 2VSKA 4K1ZA 4CPYA 2JD4A 5GALA 2DUOA 2HTWA 3GNEA 1NCDN 3O9JA 1USRA 4FVKA 3WHUA 5GLUA 5JOWA 4UF7A 1YRZA 2NZ9A 2A6XA 2OUHA 3VKOA 4GZWA 4Q8LA 4GKYA 4XMIA 3H71A 4XHBA 4K1KA 3WCRA 1VCJA 4QN4A 1F8EA 2F10A 2WLQA 1RIRA 2LALA 1ZM1A 5DUXA 1NMCA 1NNAA 5GZFA 2D6LX 3USUB 4R9BA 2ENRA 1MZ5A 3ASIA 2DUPA 2D44A 4ZKTB 1CONA 4UW4A 4RL7A 2VW2A 3WHTA 2WNEA 1DQ2A 1H9PA 5LK5A 4SLIA 1NNCA 1V3EA 4WVWA 3QCWA 4FPLA 3KQRA 1OQ1A 4XBQA 1BZWA 1FAYA 4GZOA 1IKPA 3AP7A 5GLTA 1JW6A 2I2SA 4AVSA 2AUYA 3VV1A 1FATA 1A78A 3MW3A 4CTEA 1AXZA 5IK4A 4FVVA 1G8WA 2HTQA 2A3WA 4JC1A 4FJ6A 1I1EA 1L7GA 2VU9A 2YMZA 3WOGA 1CPMA 2GMMA 3MPPG 3SLIA 2XCYA 1TEIA 3RQ0A 1MZ6A 1V0FA 3K36A 2FMDA 3INAA 3WLUA 1X50A 2ARBA 4FP3A 2DU1A 5DG2A 3B00A 1LULA 2DUQA 1QOOA 1CESA 2W38A 4Y22B 1MWEA 1S0IA 1WCQA 1KRIA 1WD4A 1GLHA 4AWDA 5H9PA 5T5OA 3K39A 2SILA 1S1AA 4K20A 1W6MB 1FV2A 4Q26A 1LTEA 2DV9A 3POSA 1GKBA 3ZSMA 2CL2A 2P3JA 1LGBA 3WDUA 3QLQA 3CYEA 1SNTA 5DZEA 2VK6A 4XIKA 1N1VA 4XHXA 5NN9A 1V6NA 2PHFA 1GZCA 4W65A 4XJRA 3B9CA 3B7EA 3AFKA 1INFA 4JCKA 3TAYA 1ZA4A 2QWBA 1INVA 2R1DA 3JU4A 2AGSA 5F9TA 5GJ6A 5BYNA 2E7QA 4MWLA 1GBGA 3CL2A 1G9CA 3O12A 5T5JA 3JUUA 4J9TA 1V6IA 2P3IA 2YV8A 2W5NA 4Y1YA 4YLZA 1W8OA 1A3KA 3O5SA 4B7RA 1AJOA 1W0PA 4GZQA 1F9KA 4HANA 1QU0A 2ZB5A 3K3AA 3ZXFA 1MVEA 4NCSA 1MS9A 5HX0A 4KS5A 2C4AA 4FOWA 4AGGA 1HDKA 1AXKA 2ZGQA 4ITCA 2C4LA 4LBQA 5B2CA 2DU0A 5T54A 2R0FA 2C5DA 2CNAA 1W1XA 1Q8PA 4FQZA 3AP9A 2A70A 2D7FA 2JKBA 1G9FA 4GXLA 3OBTA 4M3CA 3BODA 3OY8A 2DWRA 4XYXA 1S0EA 1LOBA 4MWWA 2EXHA 1LEMA 1C4RA 3R4UA 3V65A 2F24A 1W6QA 2DVGA 1LODA 1SCRA 3AYDA 1R1ZA 2W52A 1SBFA 1V3DA 3FUOA 2XZIA 3AYAA 4HZVA 3ZXEA 4B7NA 4R9AA 4LBLA 4B7QA 3ZXLA 2ZHLA 4YZ3A 2HT5A 2ZGLA 3N7KA 1SFYA 3VUOA 2R0HA 2HTYA 1H30A 4Q27A 4H52A 3ALWA 5DZGA 4LBKA 4DS0A 5CBLA 2F0ZA 4KS2A 2OW4A 3IM0A 3MW2A 4FPKA 1NSBA 3DGTA 1NCAN 4AVTA 1UX6A 5KXBA 1AX1A 1QGLA 3I4IA 4UW3A 1NMAN 4YW1A 4DQAA 2UWBA 1UZZA 1IVBA 1VAVA 1SCSA 3A0NA 2ES3A 3WDVA 4XTPA 4K1YA 4Q1PA 5EYYA 3OJBA 1Q8QA 4QNPA 1GNHA 1VCUA 4FPJA 4I00A 4GEZA 1EUTA 4XBLA 1W6NA 1ULCA 3LSEA 3WVJA 4CPOA 5IUQA 4MWRA 5AVAA 4KS1A 2ZHKA 4M3MA 2EIGA 3LCPA 4MWUA 2ZHMA 1NSDA 3NV4A 2HYKA 4YM2A 2V5YA 2P34A 1YIFA 4MJVA 1LOEA 4LBQB 2W68A 1ENQA 4ATEA 1GV9A 2UWAA 2ZMLA 2KM2A 4P9WA 2GNBA 1B09A 3ILRA 4P9YA 1XOGA 4YGBA 2ZA9A 2D6OX 1WLWA 2XZJA 1DBNA 1MACA 1USXA 3TIBA 1Z78A 1WBLA 4M3CB 3OY8B 3OPZA 4FOQA 4ISQA 2D6KA 1LGCA 1W6OA 2D43A 2ZHNA 5T52A 3WDTA 1WW6A 5JVVA 1YO8A 2CY6A 1N3OA 3WG3A 1W6QB 3M3OA 1S0JA 1QDOA 1INHA 4MZAA 3B3QE 1LGNA 3WUDA 4B7MA 2YA5A 4AYUA 1MR5A 1XQNA 1WBFA 1V2IA 3KM5A 5GZCA 4CPMA 4Y20B 4PQ9A 2ZGRA 2HT7A 7NN9A 4DGRA 1VAMA 2NYYA 1N3PA 5EYXA 3FLRA 2E53A 1SACA 2SIMA 1PZ8A 4YZ1A 2F27A 2OVUA 4F83A 3UJQA 5HUGA 5JYYA 4PBOA 4XILA 3SH3A 2NP0A 4BOWA 4WEFA 4C1XA 1VIWB 3ZVXA 1JYIA 2NN8A 4XJ9A 2ZGTA 1KQRA 1VALA 4Q1RA 5HCFA 3T1MA 4B7JA 4ASMB 1V3BA 1PZ7A 5HUKA 4FPEA 2QWKA 2F26A 2GMEA 4HZWA 3O0XA 1YYNA 4MJUA 2VVZA 1EUUA 4GWNA 4K21A 3RMYA 3K38A 4Y1VA 5HCAA 1AJKA 2PHWA 2H0BA 1HQWA 1W6NB 1G7YA 2QWJA 3HN1A 5DXDA 1DGLA 2JDZA 1LHUA 3AZZA 1DLLA 3SNMA 2GN7A 4I30A 3N7LA 5E88A 1C57A 1IVCA 1NMBN 4WA4A 4M3CE 1LHNA 3ALXA 2A5ZA 3NSSA 4MX0A 2QWAA 4K1IA 1CR7A 5IK7A 1LENA 3W09A 2GNTA 2YZ4A 2QWDA 2B8HA 3D5OA 3M3QA 5DUVA 4WVVA 1UZYA 3IMNA 1V6OA 2F29A 1LOAA 3AZYA 3D4KA 1ENRA 1DILA 1Z50A 3NV2A 1W6OB 3BIWE 4QN3A 4CPNA 2VK5A 4M01A 5JOYA 3PVNA 4M4NA 1JN2P 4Y1XA 3B01A 2A7AA 1JHNA 1JUIA 3AP5A 5JMCA 4QN7A 1BYHA 3R4SA 1DIWA 4XDQA 4IQPA 3WNXA 2VK7A 1Z4YA 4XJZA 2YROA 2QWCA 3UJOA 3IKWA 1SLIA 1DYPA 2ZMNA 5JLVA 2HU4A 1DQ6A 4GZPA 4LBOA 3AXDA 1Z4VA 3POWA 1DQ5A 2ZACA 2WSUA 3RMXA 4BLIA 1W6PA 1F8DA 5T50A 3NV1A 3D11A 4X49A 1FV3A 1JXNA 6NN9A 2P2KA 2EXJA 2OUJA 4Q2FA 1GSLA 1WCSA 4MWYA 2A71A 1V6MA 3T1LA 1V3CA 1L7FA 2GNDA 1V00A 1Z4XA 1Q56A 4GZTA 2VW0A 1MS4A 1LU1A 4WV8A 1NCCN 2F28A 1GANA 1KDKA 1KJLA 4HZZA 3PMEA 1QNWA 5E89A 5IK5A 4FOYA 4GKXA 1QMJA 2VUAA 3BEQA 4FP2A 3AZWA 4R9CA 1F8BA 4GJTA 1BXHA 2PHUA 2PHTA 1DFQA 1BJQA 2B7YA 4YW3A 3CL0A 1H9WA 2G4IA 1BQPA 1WLCA 2R49A 1AXYA 2BF6A 2UWCA 3PVOA 4XMAA 4WA3A 2V73A 2JJ6A 1L7HA 1JOJA 1SLBA 4FPOB 3TI5A 1SBEA 2VWDA 4Y1UA 2DVFA 5SV8A 2CMLA 5GLWA 4GALA 1FX5A 5DZFA 1W8NA 1YI7A 5KXCA 1B9SA 3V0AA 3NN9A 2A3XA 2A6YA 3OYWA 3Q9OA 4AVVA 3M3EA 3RRDA 1IS6A 3N35A 3TICA 1Z4WA 3D6EA 4XZPA 1WW5A 5JDBA 5IT6A 1V6LA 4YG0A 4M4UA 3GVJA 2DVDA 1UMZA 3IPVA 1A14N 4Q8KA 4HZYA 1Z4ZA 3AP6A 4MYEA 1Z0HA 3TIAA 2ZGSA 4DFSA 4K1JA 1N3QA 2UU8A 1URXA 4M4VA 1AVBA 4XXPA 3MEPA 2QWHA 1W6PB 3WDWA 1HQLA 1S0FA 3UL2A 3RG0A 2AREA 1V6JA 4YZ5A 3TI3A 1W21A 1EPWA 2ZGOA 3K37A 2D6PA 4X6KA 2ZGPA 1B9VA 2WT1A 4Y26A 4P14A 3CKZA 1UL9A 4BMEA 1A4QA 2DTWA 1KDMA 5FRAA 5EXOA 4WEGA 4DPNA 3V0BA 2F25A 2P37A 1CVNA 1W20A 3VKLA 2W20A 3SH5A 2Z42A 4BM8A 1S0GA 2RKCA 3O0VA 1MS0A 2VH9A 2ZBJA 1ULDA 1CQ9A 4XOGA 2DYCA 4LBQD 1MS3A 1WUVA 1YXWA 4CPZA 1DQ1A 3RSJA 3WDXA 2VXRA 4OZXA 3AK0A 4XJ8A 1INGA 2TEPA 4YGDA 3H72A 2WSVA 4XIOA 1QDCA 3VKFC 1B9TA 1KJRA 1ENSA 2ERFA 3U4XA 1LCLA 1IS5A 1A8DA 4GDJA 5HUNA 3FFZA 1S0DA 5T55A 2GMPA 2AEPA 1NLSA 4XJQA 3T2TA 1MS8A 3BOPA 1ULFA 1OFSA 1E8UA 5DUUA 2EXIA 2QWEA 1AZDA 4KS4A 3NV3A 4UW5A 4YM0A 2DTYA 3V0AB 1G9BA 3OYWB 5CNAA 2ZAAA 4XBNA 2AEQA 4YFWA 1VLNA 2ZMKA 2ZGMA 1EUSA 3CNAA 4TZDA 1S0CA 4MWQA 5IK8A 3SILA 5GLVA 3AYCA 4GA9A 1QOTA 2ZABA 1LOCA 1N1YA 4HZXA 3AX4A 4K3YA 3SANA 3FUQA 3I8TA 3ZSJA 2YA8A 2EF6A 5H9RA 3GALA 2F11A 2YA6A 3IPVB 1A4GA 3H0OA 4Z8BA 4YFZA 4YW2A 2F12A 4LBJA 1DZQA 1SLAA 4NO4A 1INXA 1CPNA 3A72A 4XE9A 4KS3A 4WA5A 2E6VA 4FPYA 3AJYA 4GB1A 5GZGA 2E7TA 4JRAA 1CIWA 1JYCA 2AH2A 4CZSA 3OGGA 3LSDA 1CN1A 4MC7A 1LHVA 2PHXA 4MZEA 3JU9A 3N7MA 2GALA 3RS6A 1DYKA 2DVAA 1IS4A 3ZXKA 5B2DA 2WKKA 4TYSA 3H73A 2C9AA 1FNZA 1NCBN 3AZXA 1QKQA 2X9MA 4XJWA 2BERA 2NMOA 4FQ4A 2ZZJA 1V6KA 4M3CF 2VSMA 3GVLA 4D69A 2CWMA 3V0BB 2A6VA 1XOEA 2GDFA 4HIZA 1LOFA 2CWSA 3WZ1A 1IS3A 3WG1A 1UPSA 1N1TA 4FPCA 3DUIA 2ZGUA 3M2MA 4XXAA 1LJ7A 4YM1A 1O4ZA 2XZKA 4Q6KA 4GZXA 2DURA 2ZGNA 5H9QA 2VY0A 1FYUA 4FPFA 4U36A 1LHOA 1F31A 4RA0A 5DG1A 4UW6A 2E51A 3WG4A 3N3HA 3TI8A 4XJAA 2HTVA 4JF7A 3M3CA 3AYEA 3ENRA 4PCRA 2SBAA 2WQZC 2D3RA 3N36A 4YG6A 1FNYA 1QF3A 4K1HA 1D2SA 2HTRA 1AF9A 1F5FA 5HUMA 2D3SA 1IVFA 2D6NA 1GZ9A 1CJPA 3OBRA 2R1BA 2EAKA 3GVKA 1GNZA 1IKQA 1IOAA 2A75A 1WW7A 4GDIA 1RINA 2W39A 5F5QA 1GYKA 4H55A 1ONAA 3POYA 1QNYA 1RITA 1MS1A 3FLTA 5GZEA 1LOGA 3HMYA 2W08A 2UURA 4LBNA 4YGCA 5E8AA 2SLIA 4L8QA 4ZXKA 4D8SA 5T5LA 1LESA 3FLPA 2A6WA 3MW4A 2NMNA 3AZVA 5CB7A 1I3HA 1G86A 3A71A 3FBYA 3N7JA 1Q8SA 1INWA 4YZ4A 4YG3A 4QN6A 4QN5A 3B69A 1IVDA 3O9KA 2BQPA 3AP4A 1GZWA 3HR9A 4H53A 2VW1A 4MWVA 2LTNA 3SALA 1DHKB 3ZPYA 2A6ZA 3WDYA 1SLLA 3PJQA 3H6JA 2WT0A 2HT8A 2ZGKA 4DRVA 5HCBA 5CA6A 2YDPA 1LECA 3INBA 3W58A 1AX0A 2YXSA 1V0EA 4X4AA 4BMBA 1APNA 1OKQA 2EXKA 4PF5A 1AX2A 5L73A 1LHWA 4CPLA 3AJZA 2PHRA 4YGEA 2W5OA 1ULEA 4YW4A 2ZKNA 4MWJA 3W59A 2PELA 1G9DA 2D6MA 3WV6A 1E8TA 4M00A 2FHRA 4XTMA 3ZYPA 3SH4A 4BQ1A 5GLZA 4U2AA 3ILFA 1EURA 2QWIA 4LBMA 1E8VA 4FPGA 3NWKA 1WD3A 1N1SA 3PVEA 1O4YA 3ZSKA 3SISA 3IN9A 1LEDA 3WCSA 1DQ0A 4NN9A 1HLCA 2GNMA 1IVEA 3D12A 3APBA 4Y1ZA 1QOSA 3TB0A 4FPHA 4PBPA 1WLDA 3ZXJA 1BJIA 4Y20A 1C1LA 2XB6C 3WUCA 4WZFA 2GN3A 4NOTA 4ATFA 1UAIA 5JOZA 5M1ZA 2WJSA 2JE9A 3WG2A 2DVBA 1BKZA 4AGRA 1MS5A 5CAZA 3VKNA 2D3PA 3BTAA 3TI6A 5KXEA 3T1EA 2JE7A 1SLCA 1NXD1 1Y7BA 2CYFA 2HTUA 1UKGA 2NM1A 4NC5A 5T5PA 4R9DA 4HL0A 5GM0A 1GICA 2EALA 4BBWA 2Q5TA 3AXEA 5H9SA 3USUA 4BLJA 4Y24A 4C1WA 1GZWB 4YM3A 4X47A 2YA4A 2P3KA 4XJUA 2R16A 1C1FA 1SLTA 1G9AA 4CRQA 1DQ4A 4MWXA 3M1HA 1D0HA 1SBDA 1NN2A 2WT2A 4ISRA 1JBCA 1SO7A 1V0ZA 1UN1A 1LOFC 5GZDA 3A4UA 1IVGA 1WW4A 2AYHA 4P9XA 3ZYRA 5KXDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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