1WCSA

A mutant of trypanosoma rangeli sialidase displaying trans-sialidase activity
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
634
structure length
628
Chain Sequence
AASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYILVGSFNKTRNYWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDYNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQPDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPAACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Sialidase Mutant Displaying Trans-Sialidase Activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
total genus 151
structure length 628
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2004-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wcsA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1wcsA01
1S0IA 5HUGA 3RS6A 4QN6A 4H52A 2GDFA 3M3EA 1SLCA 4WVWA 4DGRA 2GN7A 4NOTA 1QKQA 3IM0A 1ENSA 1NCDN 4ASMB 4FPOB 2HTVA 3OPZA 1G9BA 4CTEA 4M4NA 3OY8B 2XCYA 5GZFA 4X47A 1W6PB 1O4YA 1KJLA 3RMYA 5KXCA 4YZ5A 3B3QE 1LU2A 2HT5A 4YW1A 2EIGA 1IS6A 5M1ZA 2ARXA 2QWDA 4XIKA 4FP2A 1H9WA 4R9AA 2ZGQA 3AXEA 4FPYA 1MS8A 4XXAA 5GZGA 4QN4A 3A71A 1NSBA 2RKCA 4MZEA 1GZ9A 3SILA 2GNMA 4Y20A 3OJBA 4ITCA 1QNWA 3HMYA 4CPLA 1LGBA 1V3DA 1MACA 4B7MA 3UJOA 4AVTA 4UW3A 2ZA9A 1BKZA 2VW1A 1S0JA 1MZ5A 3USUB 1C4RA 2JE7A 2F26A 3TI4A 1W20A 2ZB5A 1VLNA 2ZAAA 1GNHA 3WG3A 3O9JA 2XZKA 1Q8SA 3VKMA 4Y1ZA 1CN1A 2WSVA 2VUAA 3W58A 4Y24A 1LOFA 2DVFA 4PQ9A 3WOGA 1F9KA 4FP3A 1L7GA 1WD4A 4Q8KA 3K37A 1RITA 3IN9A 4MWXA 1V0ZA 4LBKA 2JKBA 4GA9A 4DPNA 1RIRA 2YA7A 4XIOA 2ZGKA 1BXHA 4HZYA 3V64A 1V6KA 2YXSA 3WCRA 4B7JA 4ATFA 2CYFA 3ILNA 3O12A 2A6YA 1V6MA 2VK7A 2E7TA 1USXA 2B8HA 1UKGA 3A72A 1WCQA 5CB7A 3K39A 3UJQA 3N7KA 1W8NA 4I00A 3OYWA 4GZSA 3SISA 4GZPA 4Q26A 4HANA 4KS3A 5HCAA 1INXA 4MC7A 3WUDA 1IVEA 5EYXA 2XB6C 1ENRA 2ZMNA 1DIWA 2YA8A 2PHTA 2F25A 3PVEA 1HDKA 2ZGTA 2WSUA 2QWEA 1IS3A 1KRIA 2ZZJA 5T52A 2AREA 2W52A 4GALA 3AJYA 4FPGA 1CESA 2YZ4A 3A0NA 1LTEA 3V0BA 2VXRA 4DQAA 1IVFA 3MW3A 3QCWA 4CPYA 5DZFA 2CMLA 3WG1A 1WW5A 3ZXFA 3TAYA 2C9AA 2ZGMA 1UN1A 2AH2A 4MWWA 4D69A 2WJSA 4YG6A 4XMAA 3AZYA 1SLAA 1E8TA 4P9YA 4Y26A 5HX0A 5F9TA 4XBLA 3RSJA 3W09A 3V65A 4XJZA 2PELA 1A78A 4J9TA 4YM0A 2TEPA 3AJZA 2D6KA 4M01A 1LCLA 5GLTA 1W6OA 4XJQA 3A4UA 1YYNA 1APNA 5IK4A 4B7NA 1BQPA 5KXEA 1V6OA 3T1EA 3AYDA 2DU0A 4YM1A 4FPHA 4Q8LA 2D3PA 5H9QA 4XOGA 4UF7A 1URXA 3MW2A 2AGSA 4YW3A 1B9SA 3O0WA 3N35A 3WDXA 1QOSA 5B2DA 2P3JA 1LOAA 3CL2A 5JVVA 1Z0HA 3V0AB 2V73A 4MWYA 3PVOA 4Y20B 4X49A 4JF7A 2OVUA 4HZZA 1V0EA 1UMZA 2RHPA 3D12A 1W0PA 4B7QA 4MWUA 3L2YA 3SH5A 4NCSA 4X4AA 4LBJA 1IVCA 1LHNA 2A3XA 5DXDA 1GZCA 1AJOA 2R16A 4CPOA 4NC5A 4HL0A 5GLUA 1Z4XA 3AYEA 1V0FA 2ZGLA 4DRRA 1D0HA 2YA6A 4TYSA 2DVBA 2FHRA 4Q1PA 3TI3A 1A8DA 4PF5A 3SNMA 1WCSA 1MS5A 1IOAA 1L7HA 1BYHA 2WT1A 4DS0A 2EXHA 3W59A 3BODA 3LSEA 4QN5A 3N3HA 2ZB6A 1UAIA 2R0HA 1DYPA 5DZGA 2UWBA 1INYA 4K3YA 2P3KA 3ATGA 3OYWB 3AYCA 2WT0A 1EUUA 1QOTA 2DVGA 3HN1A 1LU1A 3ALXA 5T54A 1ZA4A 2QWKA 2G4IA 2YDPA 1FNZA 2NMOA 1IVDA 1JOJA 2YMZA 3OGGA 4FVKA 1YXWA 4FPJA 2VSKA 2EXKA 1MS1A 5HUMA 3WDUA 2B7YA 5BYNA 3O5SA 1WLCA 4I30A 1MZ6A 3H6JA 4XTPA 1SBEA 2ZKNA 5GLZA 3V0BB 2JJ6A 2JDZA 4BBWA 2V5YA 1FV3A 1FYUA 1Z50A 2AYHA 3APBA 1A4GA 3I4IA 3IKWA 3M3OA 3AZXA 4XJAA 2F29A 1NCAN 3GALA 1NNAA 1F8DA 4FOQA 2SILA 1DZQA 1FAYA 1V6IA 1KITA 1G9CA 1F8EA 3N7LA 2WQZC 4ZXKA 1JYIA 4CPZA 2VH9A 2OUHA 3CL0A 4QN3A 3WLUA 2W68A 2A6VA 3CKZA 4KS4A 2QWIA 1W6OB 4MX0A 4K21A 5AVAA 3ZXKA 5JOYA 5JOWA 1W6MA 4AGVA 1W0OA 2BF6A 2A70A 4YZ2A 4X6KA 3OBRA 2F0ZA 2I2SA 1NXD1 2A6XA 3SH3A 1BZWA 3RRDA 4U2AA 4XMIA 2BATA 1QU0A 1CPNA 1UX6A 1SNTA 4CRQA 5KXBA 2R1DA 1PZ7A 4MJUA 1MR5A 5T5LA 1W1XA 4FPFA 1S0FA 3AZVA 2EXIA 1LHWA 1GZWA 4C1WA 4QN7A 4UW5A 2W5NA 4GEZA 3WHTA 2HTWA 1EPWA 1Z4VA 2C4LA 1DILA 1ULFA 1J1TA 5GZDA 1LECA 1D2SA 3AP7A 2ZHLA 3JUUA 1L7FA 2W39A 1G8WA 5JOZA 1X50A 1UPSA 4XE9A 3PJQA 1NNBA 1ULCA 2LTNA 3WDVA 3ZXLA 1H30A 4HIZA 1VAVA 1EURA 5DUXA 3D4KA 3INBA 4AYUA 2DYCA 3FBYA 5FRAA 2VSMA 4FOVA 2ZGNA 5JDBA 3MEPA 1FNYA 1E8VA 1GV9A 4NN9A 1LODA 4XYXA 2ZGUA 1QGLA 3N7MA 2A6WA 3BEQA 3RMXA 1SLTA 1JYCA 3ZVXA 4IQPA 2ZHNA 2ZGSA 2HTRA 1ULGA 2SIMA 2DU1A 2EAKA 1HLCA 4WA3A 1F31A 4HZVA 2A5ZA 5GJ6A 4MWJA 4TZDA 1N3PA 1Z4ZA 3SANA 1W6QA 4R9BA 4P14A 4AVVA 1NSCA 2KM2A 5IUQA 1LULA 4F83A 5GLVA 1GICA 3I8TA 3ZSJA 4GZOA 4KS2A 4XJ8A 1WW4A 1V3EA 1FATA 3T2TA 1LEDA 5KXDA 1AZDA 3ASIA 1SBDA 2DUPA 1USRA 4Y1VA 5EWSA 4GKXA 1IS4A 2F13A 1W6NA 3O0VA 1BJIA 1G7YA 2F28A 5T5PA 2ZGOA 1WW7A 3ZSKA 1SLLA 3RQ0A 3AK0A 3WG2A 1IVBA 4DRVA 2NYYA 4WEGA 1KDKA 1AXYA 3DGTA 4XILA 2QWAA 2ZHMA 1HQWA 1NLSA 1INFA 1MWEA 2DWRA 4MYEA 1Q8QA 3FLRA 2CWSA 3Q9OA 2UURA 4BPZA 4YW2A 3M3CA 3R4SA 1UZZA 1V00A 3FUQA 2VVZA 4YG3A 1AX2A 1GANA 1G86A 2Q5TA 4WZFA 1DYKA 1IKQA 1DGLA 2QWCA 4MJVA 4M3CE 3IPVA 5GZEA 1F5FA 5DUUA 4LBNA 1B09A 2BERA 2CWMA 4XZPA 4LBQA 2EXJA 1Q8PA 5IK7A 4B7RA 4Y22A 1INWA 5L73A 2PHWA 4K1YA 1KJRA 4M3MA 4FQZA 1LHUA 1W6MB 3VUOA 1XOEA 3MPPG 4WEFA 2R49A 1KDMA 4XHBA 4UW4A 1DIMA 4Q2FA 3ZYRA 1QNYA 5GZCA 4GZQA 1GBGA 2NZ9A 1SBFA 4YGEA 1SFYA 2EALA 1W6PA 2C5DA 3WG4A 1MS9A 4KBBA 1VIWB 4BOWA 1GZWB 4YG0A 2QWJA 4U36A 2A3YA 3AYAA 3AXDA 2D6LX 4K1ZA 1VALA 1JXNA 4CPNA 1QF3A 1N3OA 4P9WA 5GLWA 1CQ9A 2QWBA 1SO7A 1IKPA 4GKYA 3H72A 3AP5A 1HKDA 5H9SA 3K36A 5CBLA 4H55A 5E88A 4FPEA 2PHRA 3POSA 1NNCA 2ZBJA 4XTMA 4ZKTB 1GKBA 4K1KA 5JMCA 4KS5A 1YRZA 5EYYA 2VW2A 3NSSA 1JW6A 1ENQA 4PBOA 4W65A 2QWHA 2D6NA 4WVVA 4YGCA 3IMNA 3WZ1A 3R05A 1UZYA 3POWA 3UK9A 5CA6A 1V6NA 2GALA 4BLIA 3TIAA 3TIBA 3NV3A 2E6VA 3GNEA 4LBOA 4ISQA 4MWQA 2CL2A 3WDTA 2VW0A 2AENA 1QDOA 1YIFA 4PCRA 1AXZA 2YA5A 1JUIA 2ARBA 5DG2A 4MZAA 2YROA 1N1VA 4RL7A 3AX4A 4YGDA 2EF6A 1CJPA 2W38A 2BQPA 1SCSA 3AZZA 1QMJA 1LOGA 4LBMA 4GZXA 4AGGA 2HTQA 5E8AA 4K1IA 1AVBA 3OBTA 3BTAA 3D6EA 4RA0A 4XHXA 5E89A 4ATEA 1W6NB 2BZDA 1NMAN 4BQ1A 2NP0A 3WNXA 3B01A 2ES3A 4QNPA 4GXLA 2ERFA 1Q56A 1ULDA 2HU4A 2HT8A 3AZWA 2E53A 2AR6A 3AP9A 2UWAA 1G9FA 2P2KA 1AX1A 3M2MA 5F5QA 5DG1A 3FUOA 1LGNA 2PHUA 3CNAA 1N47A 4R9CA 5CNAA 1B9TA 1WUVA 1JN2P 1DQ2A 3B69A 5IK8A 4XJWA 3GVKA 4XJRA 2D7FA 1I1EA 2SBAA 1WD3A 1GYKA 1C57A 1Q8VA 4BM8A 1DQ0A 3R4UA 4FJ6A 2X9MA 1Z78A 2CY6A 2D3RA 2JD4A 1ZM1A 4LBQB 2ZGRA 4K20A 2FMDA 4Y22B 1RINA 2A6ZA 1AX0A 4H53A 1YI7A 3PMEA 2XZJA 4FOYA 4HZXA 4XDQA 3NWKA 3ALWA 3NV1A 4GWNA 1N1TA 1AXKA 2HYKA 3AP4A 3GVJA 2F24A 2GNTA 4GZWA 2HTYA 1S0GA 1INHA 1IVGA 2A7AA 1CPMA 5DUVA 1Z4WA 3MW4A 1PZ9A 1S0CA 2A3WA 4GZTA 1C1FA 4YW4A 1MVQA 5T5OA 4MWLA 1CONA 4M3CA 3H73A 3SALA 2UWCA 2DVDA 1N3QA 2HT7A 1WBLA 2OUJA 4ISRA 4MWRA 1LHOA 4L8QA 3JU4A 4LBQD 1V3CA 4CZSA 3FFZA 3V0AA 3ILRA 4GB1A 4K1JA 3C2UA 3VV1A 3WHUA 3ILFA 3M3QA 2D6MA 1XOGA 3GVLA 4Y1UA 1NCBN 3NV4A 1AF9A 1SCRA 1Z4YA 1LGCA 1F8CA 2F11A 5GALA 2ZGPA 2NMNA 3WDWA 1LOBA 3H0OA 3ZXEA 1LENA 3H71A 3TB0A 3ENRA 2D6PA 2SLIA 4YZ4A 1SACA 2R0FA 2F12A 3SH4A 5JYYA 5T5JA 2ZHKA 1N1SA 3BOPA 1XQNA 1NMBN 2ENRA 1OKQA 3WUCA 1VAMA 4UW6A 2UU8A 4BLJA 2VWDA 4WV8A 1QOOA 4Q1RA 5DUWA 3UL2A 2WLQA 4D8SA 3D11A 1WLWA 1OFSA 1NMCA 4LBLA 2CTVA 1TEIA 2GMMA 3T1MA 3B7EA 1LHVA 1CR7A 2VU9A 1VCUA 2F10A 2GNDA 2P37A 2CNAA 5HUKA 2AUYA 1DBNA 2LALA 2XZIA 3VKOA 2VK6A 2PHFA 2ZMLA 1SLIA 4FQ4A 4AGRA 2F27A 1NN2A 1DQ6A 2OW4A 1NCCN 1QDCA 1NSDA 1DQ4A 2R1BA 2D43A 3B9CA 3TI5A 2NN8A 2DUQA 2PHXA 2P34A 1V6LA 4BMBA 2W5OA 4WA4A 1MS0A 1KQRA 3LSDA 1DHKB 5SV8A 4YLZA 4WA5A 1VCJA 5H9RA 1G9DA 1BJQA 1O4ZA 4FOWA 3WCSA 1WLDA 3U4XA 4GDJA 5NN9A 3D5OA 5HUNA 2AEQA 1G9AA 4P9XA 1JBCA 1DLLA 3SLIA 5GM0A 1A4QA 4KS1A 5JOXA 5FREA 4Q27A 4Y1YA 4M00A 1SLBA 4FPKA 2E51A 1EUSA 3ZSMA 3SITA 1I3HA 1CIWA 3K3AA 4AWDA 2DVAA 1WW6A 3OY8A 2YY1A 1E8UA 2NM1A 1S0EA 4GWMA 4Q6KA 5HCBA 4Y1XA 4YGBA 1GSLA 1Y7BA 3DUIA 4BMEA 1LESA 2WNEA 4M3CB 4R9DA 2DURA 4Z8BA 1OQ1A 3LCPA 4FVVA 5CAZA 1V2IA 2QWFA 4FZHA 1DQ5A 2VK5A 3NN9A 1ONAA 4YW5A 3FLPA 1W8OA 1PZ8A 6NN9A 2A71A 1EUTA 5JLVA 1WBFA 2HTUA 3ZYPA 3TICA 3B00A 3INAA 3ZXJA 2Z42A 4M3CF 1INGA 3AP6A 4GJTA 4YZ1A 2E7QA 3USUA 2JE9A 1S0DA 3O9KA 1LOEA 5T50A 3M1HA 3A0KA 4JC1A 3POYA 4XJ9A 1LOFC 1UL9A 4XBNA 2P3IA 2ZACA 2DTWA 4YM3A 4YZ3A 2D3SA 2GMEA 3TI8A 4M4UA 1IS5A 4YFZA 1CVNA 3KM5A 3QLQA 2D6OX 4SLIA 2GMPA 3FLTA 1B9VA 1V6JA 4M4VA 3NV2A 3WDYA 1DFQA 3N36A 3WV6A 1A14N 2HU0A 1LOCA 1INVA 5HCFA 1F8BA 2GNBA 4NO4A 1W6QB 2W08A 3O0XA 4DFSA 2AEPA 2DUOA 5B2CA 2DTYA 4AVSA 2GN3A 2JECA 4OZXA 2DV9A 3TI6A 4C1XA 1MS3A 3VKLA 1AJKA 3WVJA 1GLHA 1ULEA 1YO8A 5IK5A 1LEMA 4YM2A 1JHNA 3ZPYA 4JCKA 4XXPA 4GDIA 1DQ1A 2VY0A 2ZABA 3KQRA 4XJUA 4FPCA 2W20A 2ZMKA 1MVEA 2WT2A 1LJ7A 2YA4A 3PVNA 4YFWA 1S0BA 3HR9A 3AFKA 4PBPA 3T1LA 1FV2A 2YDTA 2YV8A 4JRAA 1S1AA 3VKNA 1HQLA 1Q8OA 5T55A 2QWGA 1A3KA 4K1HA 4FPLA 5DZEA 2H0BA 3K38A 2C4AA 2A75A 1U0AA 4MWVA 1R1ZA 2XG3A 1C1LA 1W21A 1MS4A 4XBQA 7NN9A 1N1YA 1H9PA 1GNZA 5LK5A 4HZWA 3RG0A 5IT6A 3IPVB 3N7JA 3JU9A 2WKKA 3VKFC 1FX5A 3CYEA 4CPMA 2D44A 5EXOA 5H9PA 1V3BA 3ZSLA 3BIWE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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