1WCSA

A mutant of trypanosoma rangeli sialidase displaying trans-sialidase activity
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
634
structure length
628
Chain Sequence
AASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYILVGSFNKTRNYWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDYNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQPDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPAACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Sialidase Mutant Displaying Trans-Sialidase Activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma rangeli
total genus 151
structure length 628
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2004-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wcsA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1wcsA01
4FOYA 2HT5A 5GZGA 2JDZA 5HCAA 4Y1XA 4J9TA 4YW5A 1S0FA 1MS9A 2CWSA 5HCFA 2C4AA 3B00A 3CYEA 1SLLA 2YA7A 3ZSKA 4KS4A 4LBMA 1N1VA 5CAZA 1WW4A 1G9AA 2R0HA 3WNXA 1KQRA 2GMPA 4YLZA 3A71A 3UJQA 2UWBA 2FMDA 2F26A 3O9KA 1NCDN 4YG0A 3I8TA 1E8UA 4KS3A 2QWEA 1V2IA 2YA8A 4ATEA 4FPFA 2DWRA 1Q8QA 2HTVA 1DQ0A 1CN1A 4SLIA 2PHRA 1DLLA 2UU8A 4MJUA 1AJOA 2DVGA 4UF7A 4DS0A 1N3OA 4LBLA 2PELA 1WBFA 1SLTA 4XYXA 4R9CA 4Q1PA 1MZ5A 1QKQA 1RINA 4P9YA 1F8EA 4U36A 2YDTA 3WG1A 4DGRA 1NMCA 3WOGA 2F0ZA 1R1ZA 1LOEA 4MWXA 1V6OA 5L73A 2ENRA 3ZVXA 4MWRA 1WW5A 4DPNA 3SH4A 4YZ2A 1V6KA 2AEQA 3GALA 2W68A 1LOFA 1N1YA 3QCWA 4BMEA 2W5OA 1LGCA 2D3RA 3JU4A 3H0OA 1S0CA 5JLVA 4MWLA 2HT7A 3MW3A 2W38A 5IK5A 2OVUA 3FUOA 3VUOA 2GNTA 3VKMA 1USRA 3V0BB 2ZGQA 1W8OA 1N47A 3VKOA 4C1WA 4QN4A 1KRIA 4TZDA 2SIMA 4FPOB 4CTEA 2ZHNA 1E8TA 4ITCA 2WSUA 3SH5A 3OY8B 2WJSA 1F8CA 3WDWA 4B7RA 3ATGA 1W20A 1W6PB 4FPLA 2AR6A 1INHA 1NCAN 3AP6A 1Q56A 1WBLA 1V00A 1DQ2A 3SANA 1APNA 2A3WA 2EXHA 4M3MA 5T5LA 2QWHA 4BMBA 4F83A 4FVVA 2D6OX 4MWYA 1ULGA 3D12A 5F5QA 2F12A 2JJ6A 1DQ6A 1ULEA 4RA0A 3WDYA 2I2SA 4I00A 4XJWA 3ILRA 1LHVA 3V64A 1JUIA 1W1XA 1YYNA 4YM1A 1S0EA 3DUIA 2W52A 4AVTA 1ULDA 1AF9A 5F9TA 4XHXA 5KXEA 3PVNA 3TI3A 1NCBN 1BJQA 1AVBA 2PHTA 3V0BA 1S0IA 4ASMB 5IT6A 2X9MA 1UZYA 2NP0A 1UZZA 4ATFA 5JOZA 4AGGA 4JF7A 1ZM1A 1IVDA 1S0GA 3APBA 1OKQA 5H9PA 3ZXJA 3GNEA 4YM3A 2ZGRA 2DUQA 3AX4A 3WDUA 1VCJA 4AWDA 1F8DA 1TEIA 5EXOA 3TAYA 1W6PA 5DG1A 4BM8A 1ZA4A 1AXKA 2QWGA 3N7KA 4KS2A 1YRZA 2ZGPA 2JD4A 3AZYA 1GICA 4HZVA 4FPEA 3ZPYA 5JOWA 4CPYA 4YZ1A 2GALA 1IVCA 2AH2A 5E8AA 5B2CA 3UK9A 3OBTA 4GJTA 2A6VA 4I30A 3FLPA 2E6VA 1LU2A 1RITA 2LTNA 1IS6A 2CTVA 2ZKNA 2NMOA 3BTAA 1ULCA 3USUB 3V0AB 3QLQA 4XIKA 4BPZA 1V3BA 3TI4A 3ILNA 3PMEA 2YA5A 3WHUA 2HTYA 4R9BA 4XJQA 3WUDA 5DUUA 3WG3A 4X47A 4P14A 4HL0A 1Z4VA 1CIWA 2A5ZA 4DRVA 2DYCA 4CZSA 5GLUA 1L7FA 2QWIA 2VW0A 2P3KA 3W58A 1FAYA 4QNPA 2ZHKA 3WCSA 4GDIA 4WA5A 4GZXA 5SV8A 4DQAA 3D6EA 2CYFA 1EUSA 1MS0A 1QU0A 4WA4A 4B7MA 3BOPA 1FV3A 2VUAA 3DGTA 2D44A 5CNAA 1JXNA 4X6KA 2DUOA 1DHKB 4R9AA 4BLIA 1H30A 4M4NA 1QNWA 5DZEA 4YGBA 2C5DA 4WEGA 1DBNA 2ES3A 2ZMKA 5IK8A 1I1EA 2P34A 4XBQA 3R4SA 4XTPA 2RKCA 1U0AA 4MYEA 4XIOA 3USUA 5NN9A 3NV1A 2YROA 1JW6A 1PZ7A 1B9SA 4KS1A 3N7JA 1W21A 4GZTA 1UKGA 1ENRA 3N7MA 1LOCA 1EPWA 1S0JA 2QWJA 1WW7A 3OPZA 2EXKA 1DYPA 4HZYA 2NYYA 3B3QE 4RL7A 5KXBA 4K1IA 4H55A 1WLDA 1MACA 2SILA 2ZAAA 2CL2A 1SLCA 5T5JA 2DVBA 2V73A 3Q9OA 4XXAA 2ARBA 4GZOA 3B69A 3VKFC 1QGLA 4CPOA 2G4IA 1W6MB 3IM0A 3N35A 4M3CE 3T2TA 3GVJA 1FNZA 3SITA 1Q8VA 1XOEA 5EYYA 3H71A 1W6QB 4Y22B 4LBNA 2C9AA 4FPYA 4FVKA 5H9RA 4ISRA 1V0EA 1LEMA 1IVEA 1BKZA 4Q27A 1AX1A 4Q6KA 2ZZJA 3ALXA 4NN9A 3AJZA 2VW1A 4XHBA 2W39A 1NMBN 3T1EA 4Z8BA 2HTUA 3L2YA 3AP7A 3A72A 1NLSA 3GVLA 3R4UA 1LHOA 1IKQA 3HR9A 3ENRA 2HU4A 4UW6A 4FP3A 1V6NA 3O0XA 1A4GA 4Y26A 2W08A 3LSEA 2E7TA 2NZ9A 2AEPA 3PJQA 3K39A 1UPSA 3SALA 3BEQA 4P9XA 1PZ8A 4H52A 1Z4WA 2F10A 1DIMA 4MZAA 2HYKA 1AXZA 2YV8A 1CESA 3SILA 2YY1A 3HMYA 1W6MA 1LU1A 1LOBA 2LALA 2DTYA 4XJ9A 3ZSLA 2GNDA 1MZ6A 4QN5A 5HX0A 1A14N 1SBEA 1PZ9A 1W6QA 4Y22A 2ZB5A 2NM1A 3B01A 4XJRA 4GWNA 5IK7A 2HU0A 1FNYA 1C4RA 2VWDA 3A4UA 3TI5A 1GSLA 5GLWA 3M3EA 1G9BA 1Z4YA 5HCBA 1H9WA 3TI8A 3TB0A 3WCRA 4Y1ZA 2ZGSA 3WUCA 1ONAA 2JE7A 2ERFA 3C2UA 2P2KA 1F5FA 1X50A 1MR5A 2WNEA 2SBAA 1Z4XA 4M4VA 1S0BA 4Y24A 4WV8A 1GKBA 5FREA 2H0BA 5HUGA 5JDBA 3INAA 4M4UA 2F29A 3HN1A 5GJ6A 2CWMA 4ZXKA 1VCUA 1JBCA 4GZSA 2QWAA 1BZWA 1OFSA 3AZZA 5EWSA 3T1LA 4K1JA 5HUMA 4XBNA 3AZWA 5E89A 4HZWA 1XQNA 1G7YA 1LHWA 3AJYA 2RHPA 3NV2A 3AYCA 4Y20B 3TI6A 3AFKA 5GALA 5H9SA 2PHFA 2WT1A 5AVAA 3VKLA 2ZMLA 1LOFC 3MW2A 2ZABA 1LEDA 2NMNA 1Q8OA 4XBLA 1CJPA 5KXDA 3CL2A 3AP4A 2DTWA 1UAIA 4DFSA 2ZGLA 1INVA 3AYEA 1IS4A 4B7QA 2CY6A 1GZWB 1SLBA 1A4QA 2VU9A 1V6IA 4FPCA 3N36A 4JCKA 1HKDA 4MWQA 3WHTA 4UW3A 3AZXA 4HANA 1LULA 1NSDA 4YW4A 2WLQA 1YI7A 4XTMA 5JYYA 2R16A 1S0DA 3I4IA 1B9VA 1AX0A 3IN9A 1A78A 1OQ1A 1NSCA 4LBQB 3AP5A 4Y1UA 1ENSA 3POYA 1O4ZA 4FOWA 2AREA 2B8HA 2GN3A 1NNCA 4YW1A 3RS6A 3ZYPA 3BIWE 4GKXA 1QOTA 4Q8LA 4Y20A 5BYNA 2VK7A 2SLIA 4PBOA 2A75A 1W6NB 2YXSA 1Q8SA 1VLNA 3KM5A 2A7AA 2BERA 1FV2A 2UWAA 5GZEA 4WA3A 1LESA 2UURA 2VH9A 1C1FA 5E88A 3VKNA 1NNAA 5GZDA 4Q8KA 1KJRA 3O0WA 4JC1A 2YMZA 1GZWA 1QOSA 2D6KA 3NWKA 1S1AA 2GN7A 4H53A 1L7HA 1L7GA 2PHUA 1BXHA 4DRRA 1USXA 4P9WA 4B7JA 3K3AA 2A6YA 2XB6C 4LBKA 2QWFA 3OBRA 2WKKA 3ZXKA 4LBQA 1MVEA 4C1XA 4CPZA 4YZ3A 1SBFA 1GLHA 5DZGA 1LGBA 4FPJA 4X4AA 1G8WA 5CA6A 2AYHA 4K1ZA 1INYA 1UN1A 1VAMA 3W09A 2DVDA 1LOGA 1GNHA 1Z0HA 2ZHMA 2DURA 1W6NA 4FPGA 3H73A 2OUHA 4MC7A 4YZ4A 4UW4A 4L8QA 1QDCA 3K36A 2GDFA 4KBBA 4GDJA 4FQZA 2A3XA 2ZACA 5T55A 3M3QA 1DGLA 3VV1A 2YDPA 1IKPA 2B7YA 2HT8A 1SCRA 4YFZA 3AYDA 2ZGNA 4MWUA 1N3QA 3RG0A 3WDVA 2V5YA 4YGCA 1Z50A 1BYHA 1CR7A 1F9KA 2QWKA 5DG2A 2W20A 1QDOA 3ZYRA 4FOVA 1SACA 4BLJA 4XJAA 2D6NA 2E7QA 2WT2A 3D11A 3SLIA 5DXDA 2WT0A 1CPNA 1QOOA 3OJBA 1V6MA 3WDTA 1BJIA 4XJZA 3FUQA 1B09A 2EIGA 1GZCA 5JOYA 4YG3A 1QMJA 2PHXA 2Z42A 1N1TA 4FPKA 4D69A 4BBWA 2A6WA 3RMYA 1INXA 4XJ8A 1V3CA 4XMAA 5CB7A 2EXJA 3LCPA 4NOTA 4WZFA 1Q8PA 3SISA 4Y1VA 1GZ9A 2BQPA 1IS3A 1MS5A 2OW4A 3ILFA 3IMNA 4PQ9A 2EALA 1NN2A 1KJLA 3AK0A 2VK5A 4YM2A 4PBPA 3WVJA 2WSVA 3O5SA 1LJ7A 5KXCA 2FHRA 2A6XA 5GLZA 3UL2A 2GNBA 1GV9A 3ZSJA 3NSSA 4GKYA 5JOXA 3BODA 4LBOA 4K1KA 5HUKA 3NN9A 3K37A 4XILA 3N7LA 1W0PA 4YG6A 2A6ZA 3FLTA 3INBA 1CVNA 4GA9A 2D3PA 2VSKA 4WVVA 1Y7BA 4IQPA 4K3YA 3WG2A 2W5NA 1KDMA 3M3CA 1FX5A 2EAKA 2ZHLA 1B9TA 4LBJA 3D4KA 1Z78A 4BOWA 1QF3A 1V6JA 2DVFA 2BATA 5GLTA 3O9JA 1LGNA 4QN7A 1I3HA 4M01A 5GM0A 5FRAA 2R1DA 4AYUA 2F27A 4QN6A 3SNMA 3H6JA 2EF6A 1WW6A 1INFA 2C4LA 1V0FA 1Z4ZA 1V3DA 3U4XA 1UX6A 2HTRA 4XZPA 2HTWA 4YM0A 2D6MA 4NCSA 1SLIA 3ALWA 4MWWA 3POSA 6NN9A 4X49A 2EXIA 4FQ4A 4GZWA 1LODA 3MW4A 4BQ1A 1JYIA 3RSJA 2BZDA 2D43A 4M3CB 3FLRA 1JN2P 4ZKTB 3RRDA 1MS8A 4FPHA 4K1HA 4GEZA 1J1TA 1D0HA 5GZCA 2XZJA 4GZQA 4HZXA 4HZZA 1GANA 1SNTA 3V65A 4MZEA 1DQ5A 1IS5A 3AXEA 1W6OB 2CNAA 1SLAA 4UW5A 2ZGKA 1F31A 3H72A 2D6LX 5T5OA 1HQLA 2KM2A 1DFQA 1DQ4A 4YFWA 2F24A 4PF5A 4FOQA 2F11A 1G86A 1VAVA 1VIWB 4K21A 1W8NA 5T5PA 2VY0A 2P3JA 1CQ9A 3TIAA 1CONA 3IPVB 2HTQA 4ISQA 2GMEA 1JYCA 2ARXA 4YZ5A 4W65A 2VW2A 1LECA 2AUYA 3O0VA 3AXDA 3OYWB 2GMMA 2R1BA 1WD3A 1V3EA 1FATA 1JHNA 4GWMA 4FZHA 5B2DA 1NXD1 3FFZA 2D6PA 1E8VA 3FBYA 2WQZC 1IVFA 3UJOA 4XJUA 2YA4A 5DZFA 4MWVA 1BQPA 4AVVA 4M3CA 1SBDA 1URXA 2Q5TA 1AXYA 3M2MA 4LBQD 3M1HA 4MJVA 3OGGA 3JU9A 1AJKA 2ZGUA 1NCCN 2QWBA 1IVGA 3IKWA 1LHUA 2A70A 1EURA 2VXRA 1HLCA 2YZ4A 1W6OA 1DYKA 2ZGTA 1F8BA 3ZXEA 4NC5A 2DUPA 2XZIA 3MEPA 1IVBA 4PCRA 1EUTA 1JOJA 4FP2A 3W59A 2CMLA 1DILA 1W0OA 4QN3A 1G9CA 1MWEA 1KDKA 4AGRA 1MS3A 4GALA 1MS1A 1YXWA 1V0ZA 4JRAA 5IUQA 3IPVA 3A0NA 1G9DA 1GBGA 1WCQA 3GVKA 1CPMA 1SCSA 5DUXA 1DQ1A 3OYWA 2ZGMA 1WLCA 4GB1A 4KS5A 2R0FA 3OY8A 4CPMA 1LTEA 2XZKA 2D7FA 4XE9A 2JKBA 3K38A 1MS4A 1INGA 2JECA 2QWDA 1YIFA 2D3SA 4YGEA 3CL0A 1MVQA 2YA6A 3WDXA 4D8SA 1H9PA 2AGSA 2ZBJA 5GZFA 3D5OA 2JE9A 2UWCA 4K1YA 2ZGOA 4WEFA 5T54A 1NMAN 2XCYA 1UMZA 2A71A 1WCSA 3POWA 5M1ZA 4M00A 2F13A 3TICA 4Y1YA 5IK4A 4YW2A 3R05A 3O12A 3WG4A 1ULFA 1SFYA 4B7NA 3CKZA 4FJ6A 5H9QA 1LENA 3KQRA 4TYSA 1WLWA 2BF6A 1LCLA 5CBLA 3ZXFA 1WD4A 4MX0A 5GLVA 1VALA 2DU1A 4GXLA 3B7EA 2XG3A 4OZXA 1NNBA 4CPLA 1GNZA 4M3CF 1V6LA 2R49A 3AZVA 3JUUA 1INWA 2PHWA 1LOAA 4R9DA 4CPNA 3ASIA 4MWJA 4Q26A 2NN8A 5DUWA 3A0KA 2TEPA 2ZB6A 1D2SA 5LK5A 3TIBA 1UL9A 3WLUA 3MPPG 1N3PA 3ZXLA 1NSBA 1DZQA 2VSMA 4AGVA 2VK6A 3NV3A 1ENQA 3SH3A 1G9FA 3CNAA 4Q2FA 1EUUA 1C57A 1HDKA 2GNMA 4WVWA 2DU0A 2E51A 4XXPA 4XMIA 1LHNA 1SO7A 1IOAA 3PVEA 4AVSA 5HUNA 5EYXA 5DUVA 1AZDA 3M3OA 3RMXA 2E53A 3AP9A 2ZMNA 2AENA 4XOGA 2OUJA 1A3KA 3B9CA 3RQ0A 3T1MA 2QWCA 2DV9A 3ZSMA 5JMCA 1DIWA 3V0AA 1QNYA 1XOGA 4YW3A 1YO8A 2F28A 4XDQA 3N3HA 2ZA9A 2DVAA 3PVOA 4U2AA 5T52A 1A8DA 3WV6A 5JVVA 1AX2A 4CRQA 2P3IA 1C1LA 1GYKA 7NN9A 1N1SA 3NV4A 4Q1RA 4HIZA 3LSDA 2A3YA 2P37A 1KITA 3AYAA 2F25A 3WZ1A 1RIRA 4GZPA 4NO4A 1FYUA 4K20A 1HQWA 5T50A 1WUVA 1O4YA 4YGDA 2VVZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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