1MZ6A

Trypanosoma rangeli sialidase in complex with the inhibitor dana
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
630
structure length
620
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVATADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVMDATVIVKGNKLYILVGSFNKTRNSWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFVGGVGAAIVGSNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDGNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQQDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRFIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPACGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPGAPTDSRVTVTNIVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis of sialyltransferase activity in trypanosomal sialidases
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase, hydrolase inhibitor
molecule keywords sialidase
total genus 161
structure length 620
sequence length 630
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2002-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1mz6A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1mz6A01
4FPFA 1IKQA 3O0WA 2HTVA 2ZGRA 1L7FA 2R16A 1BKZA 3RS6A 4FPLA 3RSJA 1X50A 4KS3A 4HANA 4MWJA 3QLQA 1V6NA 1WD4A 4JF7A 1Y7BA 3AYAA 5GM0A 2FHRA 4M3CF 4R9DA 2QWAA 2A75A 3WLUA 3PVEA 1AX1A 1B9SA 4OZXA 1VAVA 1C4RA 1USXA 5CB7A 4YZ3A 4AYUA 2RKCA 1A78A 1S0EA 2QWGA 3AP4A 1Q8PA 2HTQA 1W6NA 2ZGOA 4K1IA 4RA0A 1D0HA 2P3IA 4K1JA 2ZGKA 3TICA 2BQPA 5E89A 2ZMLA 4X47A 1N1VA 3TIAA 4YZ4A 4M4VA 3AYDA 1R1ZA 1GICA 5DUVA 1C57A 2ZKNA 2WLQA 2C4AA 1VIWB 4YGBA 1F8CA 4GZQA 4TZDA 2DVGA 1NCAN 3DUIA 3N3HA 1V0ZA 1INXA 1AX2A 3B69A 2F27A 1QMJA 2ZGNA 2A6WA 1Z4ZA 1JYCA 3WCRA 3W59A 3UJQA 1V00A 3BTAA 3ILRA 1ONAA 2YA6A 5KXCA 3JUUA 2GNTA 1N3QA 4MWQA 5JOXA 1NCDN 1GV9A 3DGTA 4FJ6A 3PMEA 3OY8B 4LBLA 2BATA 2LALA 2DTWA 3M2MA 1ULDA 2VY0A 3V65A 4BLJA 3ZSKA 4DPNA 1LOFA 1JW6A 2CMLA 1AJKA 1GKBA 4MWUA 3IKWA 3INBA 1SACA 4GWMA 3A0KA 4YZ5A 4FP2A 4Q1RA 4MWWA 2AUYA 2DV9A 5GLUA 3Q9OA 1EPWA 2CWMA 5JYYA 2VK6A 4QN7A 3VKLA 1IVBA 1W1XA 2BZDA 1SCRA 4M3CB 4DFSA 2R0HA 2QWIA 3AXDA 3A72A 1ENRA 2H0BA 3MEPA 2AH2A 1URXA 7NN9A 3RMXA 3AX4A 2ZHMA 1LOEA 1YI7A 4XE9A 2NYYA 3KQRA 1GLHA 4Y1XA 5CNAA 4YG3A 1S0DA 3IN9A 4AWDA 2ZB6A 3AP6A 1FV3A 1CR7A 2E7TA 1NMBN 4R9CA 1F9KA 4AVVA 5T5JA 1WLDA 3WG4A 1VALA 1DHKB 2DVBA 1LOFC 2WT2A 4ITCA 4GZOA 2PHWA 3MW4A 1W6MB 5JOWA 1CESA 2YDTA 2QWEA 1XOEA 3USUA 1IVDA 1AVBA 3R4UA 4Q8LA 1JOJA 2QWCA 1N3OA 2F13A 5T5PA 4XBNA 1A14N 1DGLA 2NN8A 3B01A 2YY1A 1CPMA 1VLNA 2ZACA 3R05A 2XZKA 5JMCA 3GVJA 2QWBA 4HZZA 1NN2A 2OVUA 4BQ1A 5T55A 3RQ0A 4LBJA 3JU9A 5GZGA 4BOWA 5CA6A 2A6XA 3ZPYA 4XJWA 4YG0A 1FYUA 2ZBJA 5DUXA 5CBLA 3NV3A 1W6QB 1NCBN 2P34A 3V0BB 2WJSA 3AYCA 3WOGA 1DYKA 1Q56A 2A6VA 1C1LA 5T52A 2VWDA 3PVOA 2QWHA 4CZSA 1BZWA 1WUVA 4FPYA 3IPVB 1BQPA 4PBPA 1IOAA 5HUGA 4YGCA 2XZJA 3OYWB 1W6PB 1Z4WA 1V6MA 1LCLA 4K1YA 1SLTA 4WVWA 2ENRA 2HU0A 3AJZA 3JU4A 1AJOA 2ZZJA 4H53A 3AXEA 1INYA 5EWSA 4MZEA 3WVJA 1W6OB 2C5DA 3SALA 1QOTA 2HTYA 1WBFA 1V3EA 1UKGA 1VCJA 2AGSA 3TB0A 3VKFC 3NV2A 4QN5A 1YRZA 4Q2FA 3H0OA 1MACA 3WG3A 5FREA 1W8OA 5JLVA 3TIBA 2VSMA 2DUQA 2W52A 4Y22B 3WDTA 2D6OX 3LSDA 1AXKA 1V6KA 1U0AA 3B9CA 1UZYA 1MS4A 4MJUA 1IS6A 1Z50A 5E8AA 2RHPA 2ZABA 3N7KA 1CPNA 3AP7A 5M1ZA 2EXIA 3O12A 2JD4A 4XXPA 4LBQB 5F5QA 1QDCA 1KJRA 1SBEA 1BJIA 4KS1A 2DWRA 3N7JA 4GXLA 2GDFA 1FNZA 3OBTA 1CIWA 2DVAA 2WQZC 1ZM1A 2F28A 2D3RA 3FFZA 2V73A 1ULGA 1LENA 3MPPG 3N36A 1E8UA 4FQZA 2GNBA 3W09A 1B09A 3SISA 2AEQA 1MVQA 4CPOA 4KS2A 1NNAA 4ISRA 1Z4XA 1QOSA 5B2CA 3D11A 1EUSA 1RINA 1SLAA 1GZWA 4KS5A 2WKKA 3TAYA 5T5LA 3T1EA 4GB1A 1NSDA 2D6MA 5IK4A 2F24A 3NN9A 5T5OA 1WCSA 1S0JA 4Y1UA 3FUQA 4XMIA 3OJBA 1LOAA 1C1FA 1DQ2A 2EF6A 2A71A 4AGRA 1ULCA 4XJQA 3V0AB 1HLCA 1Q8QA 1LHNA 1MZ6A 1AX0A 4CPNA 4K21A 3SITA 1E8VA 1G9FA 4BLIA 2P37A 4BBWA 4FOYA 4YFWA 1KQRA 4WA4A 2F12A 1WLCA 3L2YA 2ZGLA 1WW7A 1WD3A 1AF9A 4H52A 4XOGA 2ZGUA 3RG0A 2R0FA 1BJQA 2DU0A 2EAKA 3AZWA 2V5YA 1A3KA 3OBRA 1IS5A 1Z4VA 3LCPA 1LHVA 1QU0A 4P9WA 3ZSJA 1OKQA 1Q8SA 1OQ1A 2G4IA 2W5NA 2QWKA 2VXRA 1USRA 4LBMA 2B8HA 1FX5A 2PHFA 2UWBA 2A6YA 1DYPA 2DUOA 1INVA 2E7QA 1G8WA 1H9PA 3APBA 3VKOA 4FZHA 2F11A 2HU4A 1H9WA 3RMYA 4U36A 2F25A 4AGVA 2JKBA 3CNAA 1QNYA 5CAZA 5FRAA 4UW6A 3RRDA 4WA3A 1DLLA 3SH5A 1YIFA 4M3MA 4MZAA 4YM3A 4C1WA 5HCAA 4B7RA 2HTWA 4P9YA 2Z42A 1N1SA 4XJAA 2ZMNA 4B7JA 2ARXA 1I3HA 1LEDA 4QN3A 1H30A 2AYHA 1SLCA 2F10A 4FPHA 4MWLA 1HKDA 1LU1A 1LOCA 3ZSMA 2YDPA 4XTMA 1WW5A 4MX0A 2VUAA 4DQAA 5IK8A 3AFKA 3ATGA 4XIOA 4K1ZA 4AVSA 1EUUA 3T1LA 3B3QE 2D44A 2ZAAA 1DQ4A 3ZXJA 2YZ4A 4K1HA 1SBDA 4FPJA 1DIWA 4XTPA 2PHRA 1IKPA 2HTRA 4MJVA 1PZ9A 3NWKA 1UPSA 2X9MA 1LEMA 3ENRA 1N1YA 1O4ZA 2A3WA 4GZTA 4Z8BA 2YXSA 5KXEA 4GA9A 5EYYA 1F8BA 5GZCA 4YW4A 3AZVA 2AR6A 2OW4A 3FLRA 2CTVA 1KDMA 1G86A 2YA5A 2DVDA 4Y26A 5F9TA 1V0EA 1QOOA 4Q6KA 2VK7A 1LODA 4UF7A 5JOZA 3WUCA 3AP9A 2LTNA 5H9SA 1MZ5A 4GJTA 2XCYA 2Q5TA 3WDWA 4FVVA 1SO7A 2GN3A 1DBNA 4GKXA 1N1TA 3KM5A 3AP5A 1NNBA 3TI3A 3WHTA 1W0PA 4LBOA 1ULEA 3A4UA 4GZXA 3ALWA 2JE7A 1G7YA 1HDKA 1A8DA 5DZFA 1G9AA 5IK5A 4X49A 3GALA 2NP0A 2GMEA 4MWXA 1NMAN 1GZCA 2TEPA 4X6KA 4XJ8A 4X4AA 4Q26A 1XQNA 5HUKA 2P2KA 3I8TA 3WZ1A 5B2DA 1RITA 5HX0A 3GVKA 2WT0A 1YXWA 2W38A 4QNPA 3M3CA 2AREA 1LULA 4YW3A 4FP3A 1S0GA 3POWA 3WNXA 2EXJA 1E8TA 1SLIA 1V6OA 4M3CA 2GMMA 1DQ6A 1V3BA 4GWNA 2AENA 5BYNA 2ZHNA 4WV8A 4GDIA 2PHXA 2R1BA 5H9RA 3K36A 3GVLA 1KDKA 4DGRA 2P3JA 4NO4A 5T54A 2NZ9A 3LSEA 1G9DA 5DZGA 1BYHA 2NMNA 1D2SA 2BF6A 4PBOA 4Q1PA 2D7FA 1BXHA 4YW1A 5JDBA 5T50A 4Y20B 4YGDA 1INHA 1IVFA 4HZYA 2UWCA 1MS8A 3WDXA 5LK5A 2CNAA 4DS0A 3SNMA 3IM0A 4CTEA 2DUPA 2W08A 2ZA9A 1IS3A 4D8SA 3SH4A 4JCKA 4XYXA 2WNEA 4PF5A 5DXDA 4PQ9A 3WV6A 2C9AA 1DQ1A 3VKMA 4I00A 5EYXA 1MS9A 4GEZA 5SV8A 5GLZA 4M4NA 1LGNA 2UURA 4YW2A 2YA7A 1OFSA 2E51A 1GZWB 1TEIA 2CL2A 1NSCA 3O9JA 2FMDA 4DRRA 1SNTA 5DG2A 3WG2A 2OUHA 1W21A 4NCSA 1V6IA 5EXOA 1LECA 4UW5A 4ATFA 1W6QA 2GALA 2NM1A 5NN9A 4QN4A 2QWFA 4AGGA 3UK9A 1ULFA 4LBNA 3AJYA 2PELA 5DG1A 5HUNA 1DZQA 2W5OA 3ZVXA 1LOGA 1RIRA 4CPZA 4CPMA 3IPVA 4K20A 1HQLA 4FOQA 2D6LX 4HZWA 2UWAA 3UL2A 1WW4A 4UW4A 2OUJA 4R9AA 3POSA 4W65A 1V3CA 1W6NB 4FPGA 3ASIA 4M01A 2VSKA 3ALXA 4MWYA 2B7YA 4YM1A 1F31A 1N47A 2VW2A 2ZB5A 1F5FA 3R4SA 2ZGSA 4Q27A 1QNWA 2P3KA 3FLTA 4WA5A 1QKQA 4LBQD 4GDJA 3HN1A 2CYFA 3M3QA 4YLZA 4YG6A 1PZ8A 2NMOA 1L7GA 4JRAA 1INGA 4M3CE 1FNYA 1V0FA 1S0IA 3BEQA 4GALA 3TI5A 3M3EA 3WG1A 3AZZA 5JOYA 3C2UA 4GZPA 2R49A 4XJUA 5DUWA 2JJ6A 1MS0A 3HR9A 3N7LA 2PHUA 1F8DA 1W8NA 4Y22A 1UMZA 3O5SA 1GSLA 3MW2A 3K38A 4WVVA 3NV1A 4GZSA 2SILA 1NLSA 3T1MA 2WT1A 2YA4A 2YMZA 3ILFA 3B7EA 1NSBA 6NN9A 1S0FA 2XB6C 4RL7A 4BPZA 4LBQA 1MS3A 3W58A 4QN6A 4YZ1A 3D12A 4HL0A 4Y24A 2D6KA 2DVFA 3O9KA 4K1KA 1GBGA 2HYKA 1JN2P 2VW0A 1A4GA 1LHUA 5H9PA 5GLTA 3BIWE 3TI4A 3NSSA 3FLPA 4CPYA 1WLWA 3ZYPA 1IVCA 1LU2A 4XJZA 2D3PA 5E88A 5DZEA 3I4IA 4XJ9A 1SLBA 4Q8KA 1QDOA 1VCUA 4FOWA 1AZDA 4FVKA 1VAMA 1MWEA 5H9QA 4XHXA 1FV2A 4FOVA 4C1XA 1LGCA 3SH3A 1V3DA 1CQ9A 1GZ9A 4P9XA 3V0AA 1I1EA 1CN1A 4B7NA 3M3OA 2QWDA 3ZXEA 4JC1A 2VH9A 2EIGA 2CY6A 1LGBA 2SIMA 1ENSA 3HMYA 2WSVA 1HQWA 4XILA 1MVEA 4FPKA 1JXNA 4HZXA 3NV4A 2ERFA 2R1DA 2VU9A 1V6LA 3TI6A 2JECA 1A4QA 1S1AA 4MWRA 3H6JA 4WZFA 3A0NA 4YM2A 3ZSLA 2A70A 4ZKTB 1G9CA 1CONA 2ZMKA 5KXDA 4CRQA 1Z4YA 2VK5A 1KITA 2ARBA 4XZPA 3K39A 3WDYA 2JE9A 2SBAA 4HZVA 1YO8A 4NN9A 4ASMB 2EXHA 4MC7A 1UX6A 5L73A 3USUB 1FAYA 4DRVA 1UAIA 1LHOA 3ZXLA 2W68A 4KBBA 2XG3A 1GNZA 1S0BA 1MS1A 1S0CA 4F83A 4P14A 4XHBA 2ZHKA 2AEPA 3CKZA 3OGGA 4ZXKA 4L8QA 4ATEA 4BMEA 1MS5A 2D3SA 1IVGA 2ZGMA 4AVTA 2DU1A 1WBLA 2F0ZA 2E6VA 2BERA 3IMNA 4WEGA 1SCSA 3N35A 1W0OA 3MW3A 4YZ2A 2YA8A 1KJLA 3OY8A 1XOGA 3INAA 2HT5A 5KXBA 2DYCA 3UJOA 3OPZA 4LBKA 2A3YA 4KS4A 1SBFA 1DQ5A 1DILA 1CJPA 2YROA 3WDVA 1SFYA 1SLLA 4ISQA 3A71A 4I30A 5HCBA 5AVAA 4XXAA 1F8EA 1INFA 4YGEA 4M4UA 4XIKA 4D69A 1G9BA 2EXKA 3BODA 2A5ZA 1LESA 1CVNA 2W20A 3D6EA 1NXD1 1V6JA 1LHWA 4IQPA 1WCQA 2DTYA 3CL0A 3CYEA 3PJQA 1PZ7A 1UZZA 2A7AA 3WDUA 3ZYRA 2E53A 2GN7A 2PHTA 2CWSA 5GZFA 1IVEA 1JBCA 3SLIA 4NC5A 4XMAA 4HIZA 1W20A 2F29A 3CL2A 3V64A 1LOBA 5GZDA 1NMCA 2VVZA 4YFZA 3AZXA 1IS4A 1INWA 1DFQA 4PCRA 3K37A 5DUUA 3POYA 3QCWA 4XBQA 1EURA 1QGLA 4FPOB 1Q8OA 2ZHLA 5IUQA 2GMPA 1AXYA 1B9VA 3AK0A 3K3AA 2DURA 1AXZA 1JYIA 1W6MA 3VUOA 2HT7A 1EUTA 1DQ0A 4B7MA 4MWVA 4UW3A 2ES3A 2QWJA 2EALA 4FPCA 3AYEA 3ZXKA 2D6PA 2KM2A 3O0XA 5HUMA 1JUIA 1JHNA 3AZYA 4WEFA 3WHUA 1QF3A 3WCSA 4TYSA 3SILA 2F26A 4XBLA 1ENQA 1LJ7A 1O4YA 3T2TA 1V2IA 3VKNA 4SLIA 4YW5A 2JDZA 2XZIA 3PVNA 2A3XA 2GNDA 2SLIA 1ZA4A 4NOTA 5HCFA 1N3PA 2VW1A 2WSUA 3VV1A 4J9TA 3H73A 4XJRA 1Q8VA 1DIMA 5IK7A 4FPEA 3ILNA 4K3YA 4YM0A 4FQ4A 2YV8A 2D43A 5IT6A 3BOPA 4CPLA 1L7HA 4H55A 5JVVA 3D4KA 3V0BA 4Y1ZA 1NCCN 3D5OA 1J1TA 2GNMA 2HT8A 3N7MA 4XDQA 1GNHA 1APNA 4Y1VA 4Y20A 2ZGQA 3SANA 3M1HA 2UU8A 2C4LA 1GYKA 4BM8A 1MR5A 3U4XA 3OYWA 2I2SA 1B9TA 1W6PA 2W39A 1GANA 3FBYA 3GNEA 3ZXFA 4GKYA 4Y1YA 3FUOA 1KRIA 2ZGTA 2D6NA 5GLVA 2A6ZA 5GJ6A 1FATA 4U2AA 5GZEA 2HTUA 1W6OA 1Z78A 1UN1A 3WUDA 4GZWA 5GALA 3TI8A 2ZGPA 1LTEA 1Z0HA 3B00A 4B7QA 4R9BA 3H71A 4M00A 4MYEA 1YYNA 3O0VA 1UL9A 4BMBA 3H72A 5GLWA 1WW6A 1NNCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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