1S0JA

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with munana (michaelis complex)
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
632
structure length
623
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFANSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
molecule keywords trans-sialidase
total genus 174
structure length 623
sequence length 632
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2003-12-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1s0jA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1s0jA01
4M4NA 1N3QA 1YXWA 1JW6A 1LODA 2E53A 2E7QA 3IPVA 3RMXA 2D7FA 2SLIA 4W65A 5DUVA 5GLTA 1W0OA 4C1XA 1V6IA 1IOAA 5DZEA 4ATFA 1SBDA 1G9CA 3CL2A 5IUQA 5EYYA 1W6QB 3QCWA 4FOWA 5KXCA 1MS5A 1QDCA 4CPNA 1KJLA 5KXDA 2EXIA 5T50A 4XYXA 1LEDA 5HUKA 3R4UA 5GLVA 1XOEA 2UWBA 2F11A 2D3RA 3JUUA 3H0OA 3AP6A 2P37A 2P2KA 1QNYA 3AYEA 1USRA 1LECA 1JBCA 3WDUA 2GN3A 5DUXA 4QN6A 3ALWA 2JE7A 2YY1A 1G9BA 1QF3A 4XZPA 1KDMA 4GZQA 1A8DA 3AFKA 1KITA 4K1HA 3ILRA 1N3PA 3PMEA 1CJPA 1OQ1A 1QKQA 1V00A 2HT5A 4M01A 4XJ9A 4LBQD 1C1FA 4ZXKA 4FZHA 1W0PA 2WT1A 4UW6A 5B2CA 3HMYA 1FX5A 5IT6A 2QWEA 4YG6A 1SLCA 4H52A 4M3CE 3TI5A 1AXKA 1JXNA 1TEIA 2D3SA 2YA8A 1EUSA 3BOPA 3MW3A 5SV8A 1INXA 1J1TA 1DYPA 4XBQA 3W59A 1SLLA 4YLZA 1YYNA 5EYXA 4FJ6A 1A3KA 4PBPA 4GZSA 2QWHA 1UX6A 3A72A 4FPJA 2W5OA 4LBJA 4Y1UA 2D6KA 2ARBA 5FRAA 5JMCA 4DS0A 1LCLA 4XIKA 4ISRA 5GZGA 3CL0A 2GDFA 2GALA 1INYA 1LOAA 2ZACA 5E88A 4X47A 4GDJA 2YDPA 5T52A 1S0IA 4P9XA 4JC1A 1UZZA 1F8CA 1V6JA 5GLUA 4H53A 3T1EA 3WLUA 1GICA 1CQ9A 4ASMB 4Q8LA 2NMOA 3NWKA 2OUHA 4LBQB 2NZ9A 2R0HA 2OVUA 4GKXA 3WDTA 2YXSA 1APNA 3MW2A 1VIWB 4QN7A 4K21A 4H55A 4AGRA 3FUQA 3OGGA 3GVKA 2QWFA 1NNCA 4R9AA 4XIOA 2OUJA 2HU4A 4K1IA 2ZZJA 5HUNA 1Q8VA 2A3WA 2QWKA 1VAVA 1G9AA 4TYSA 4XJZA 1S0CA 3AP7A 1IKQA 4BM8A 4B7RA 5EXOA 4U2AA 3WDVA 1MZ5A 2F27A 2VH9A 1HQWA 1NMBN 2LTNA 3BEQA 2F29A 2I2SA 4YGCA 4P14A 5JLVA 1NMCA 3ZSMA 2DU1A 1KJRA 1Q8QA 4Y1ZA 1HQLA 1N47A 2AENA 1JYCA 3ENRA 1VALA 1LU2A 2VK6A 4K1YA 3WV6A 4M3CB 4Q6KA 1LHOA 1SCRA 3V0AA 3VKOA 3NV4A 2Z42A 4K3YA 3TAYA 3W58A 3POWA 3RMYA 4D8SA 3AZYA 4XILA 3IN9A 4XJQA 2E6VA 1V6OA 4XMAA 1ULEA 5JVVA 1OFSA 1PZ8A 1DBNA 4QNPA 1WW4A 3PVEA 2F0ZA 3ZYPA 1DHKB 2NYYA 4LBQA 2UWCA 2RKCA 2XZKA 5T5LA 4YGEA 3POSA 2R0FA 1KDKA 3APBA 3LSDA 4MZEA 3T1LA 2DVAA 3AXEA 2C4LA 3WUDA 4XJWA 3TI6A 2WNEA 1V3EA 4YW1A 4GKYA 2ZHLA 4YZ3A 2DYCA 3SANA 4UW4A 2XB6C 2D6MA 3SH5A 1B9SA 5JOYA 3GVLA 2A6WA 3VUOA 5H9PA 3M3QA 2WSVA 1G86A 1GNZA 4Y26A 4AVVA 2W5NA 2EXHA 1GYKA 4JF7A 4GZTA 1W6MB 1QDOA 4MJVA 2R49A 1GBGA 4K20A 1SLIA 1L7HA 2EF6A 4XJUA 3A0KA 3H71A 1AF9A 5T55A 2CWMA 3NN9A 4HANA 3T1MA 4Q2FA 4WVVA 3ZSLA 4KS4A 3ZSJA 1V2IA 2ZA9A 4AWDA 2AR6A 2ES3A 2Q5TA 3OY8A 1F31A 3CKZA 2PHTA 4UF7A 4DRRA 4XHXA 2BZDA 4HZXA 3SLIA 1I3HA 1V3BA 2WLQA 2GNBA 4LBKA 2JE9A 1IS3A 5E8AA 1SLAA 2VK5A 2YMZA 1Q8SA 1WLCA 1FATA 2WKKA 5HCBA 1MZ6A 2DTWA 1S0GA 1UMZA 2SIMA 3R4SA 2W52A 3WNXA 3SH4A 4NO4A 1ENRA 1SLTA 1H9PA 4K1JA 4Q1RA 2LALA 4BMEA 1F8BA 3OBRA 2YROA 1VAMA 5F5QA 3AJZA 1CONA 2DUPA 2ZMLA 4YM1A 2PHUA 4WZFA 4YM3A 4FVVA 3WUCA 3BIWE 5DXDA 1E8VA 4WA5A 1V3DA 2DVDA 1ENQA 3ZPYA 1AJKA 2VUAA 2GMEA 1LHVA 1S0DA 1W6OA 1SFYA 1AZDA 2GMPA 2ENRA 1G7YA 2ZGSA 4HZWA 4GJTA 3UL2A 3GALA 2HTYA 4OZXA 3ASIA 2XCYA 2VW1A 3O5SA 5DG1A 2VVZA 3N36A 5HCAA 3VV1A 3NV3A 1W6MA 1B9TA 1SBEA 3Q9OA 4IQPA 4NOTA 1GZWB 3IKWA 5KXBA 4Q8KA 2CNAA 1IVCA 4MYEA 4XJRA 1E8UA 2VU9A 3CYEA 1BKZA 3M1HA 5T5OA 2R16A 2ZMKA 2ZGTA 4FPLA 5FREA 1UN1A 3LCPA 4SLIA 3ZXJA 3N7KA 2HTUA 4Y1VA 2QWBA 4WA4A 1DQ2A 1Z4WA 4R9DA 4X4AA 4L8QA 3V0BB 3VKNA 1GZCA 1V0EA 2A6YA 3BTAA 3V65A 4YFZA 3DUIA 4DGRA 3PJQA 1ULDA 3D4KA 1EURA 2DV9A 3B3QE 4FP3A 3M2MA 2ZGOA 2D43A 1AX1A 4CPOA 2A75A 4QN4A 4FP2A 1Q56A 2EAKA 1VCUA 4UW5A 1NSDA 3SITA 4CPMA 1MS3A 2AYHA 2C5DA 3USUB 4D69A 3O0XA 4CPZA 1DQ6A 3NSSA 4M3MA 1JYIA 4YW3A 3AK0A 5GM0A 5T54A 3A71A 4CPYA 1S0FA 1HDKA 1RINA 2ZGMA 1N1YA 4M4UA 5GALA 1H9WA 1DQ5A 3QLQA 4P9WA 2TEPA 3I8TA 5GLZA 2CL2A 2ZBJA 4MJUA 4MWJA 1WLDA 4XXAA 1DIWA 3OYWB 2WQZC 1W20A 4ITCA 1CIWA 2AGSA 2VXRA 1C4RA 4MC7A 1MACA 2E51A 4FQ4A 4RA0A 2AH2A 4JCKA 3VKFC 2UU8A 2AEQA 1W6QA 3H6JA 3D11A 5T5JA 1GZWA 4FPGA 3SNMA 3WG1A 3AZVA 1FNZA 5L73A 3W09A 2PHFA 2DUOA 4BOWA 2E7TA 1VCJA 1LGCA 2A71A 1LENA 5HUGA 3L2YA 4YG0A 2WJSA 3AYDA 3VKLA 3C2UA 1DLLA 3UJOA 4P9YA 5CB7A 2PHWA 3NV2A 2F13A 1LJ7A 3V0BA 2F12A 3WDXA 2BF6A 2WT2A 1JUIA 4B7QA 1DILA 4Y1XA 3VKMA 5JOXA 1V3CA 1CN1A 4R9CA 3AZWA 1D2SA 1G9FA 5T5PA 1N3OA 1SBFA 3WZ1A 4XHBA 2W08A 2G4IA 3HN1A 1A14N 2ZGNA 3USUA 1Q8OA 3TI8A 4Y22B 1DQ4A 1RITA 2WSUA 3ZXFA 2YDTA 1UZYA 4X49A 2JJ6A 1W6PB 1NNBA 2A3YA 4FPYA 3K39A 2PHRA 3GVJA 3TI4A 4Z8BA 4CPLA 1WW5A 2DVGA 1LTEA 3IM0A 1F8EA 1V6MA 1ULGA 2ZAAA 1Z50A 3ILNA 4AGGA 1BXHA 4LBMA 1Z4YA 3WDWA 1WLWA 4J9TA 1WBLA 3AX4A 4ISQA 1LULA 1LHUA 1FYUA 2XG3A 4GXLA 1LOBA 4K1ZA 3SALA 4Y24A 3D12A 4YZ4A 4GA9A 1YO8A 2UURA 1URXA 2P3KA 3B01A 2NP0A 1R1ZA 1F5FA 1GNHA 2W20A 2ZGPA 4QN3A 1IS4A 1ENSA 4HZVA 4M4VA 1V6LA 4M00A 1WW7A 2B8HA 5JOZA 1Y7BA 5JOWA 1DZQA 4AGVA 2UWAA 1QMJA 1CESA 4BBWA 2ZB6A 4XTPA 3WHUA 3IMNA 1N1TA 3CNAA 1G9DA 4MWXA 1NNAA 1MS4A 3I4IA 3DGTA 4CTEA 2EALA 4B7MA 1NLSA 1Z4XA 1W6PA 3AZZA 4YGDA 2ZGUA 4Y1YA 1BZWA 2EXJA 1INWA 3SILA 2D6OX 3A4UA 4FPEA 2P3JA 5M1ZA 4BLIA 3RS6A 3TICA 3AYAA 4GZWA 3BODA 2CMLA 3TIAA 1NCBN 1AX0A 2HTRA 4MWVA 3INAA 5DUUA 1GANA 1MVEA 1QU0A 3H72A 2NMNA 4DPNA 4WEFA 3UK9A 3WCRA 4XJAA 3B69A 4GEZA 2W68A 2A6VA 1INVA 2W39A 4M3CA 5GZCA 1W21A 2HT7A 5KXEA 4YZ2A 4B7JA 2ZKNA 2JKBA 1W8OA 1PZ9A 2PELA 1B9VA 2DUQA 2A3XA 1JOJA 2PHXA 4CZSA 1UPSA 2SILA 3PVNA 1B09A 4FVKA 4ATEA 4WV8A 4BMBA 4MWWA 2F26A 1SACA 5CNAA 1BJIA 2BQPA 2C9AA 1IKPA 1FV3A 1WBFA 1NCDN 3O0VA 2XZJA 1WD3A 1NXD1 1LOEA 3MPPG 1E8TA 5GZFA 4Y20B 3K38A 1FV2A 3N3HA 5GZEA 4WEGA 4DFSA 1WCSA 2FMDA 1IVDA 4LBLA 4NCSA 1S0JA 3TIBA 2H0BA 1U0AA 1ZA4A 4KS3A 1DIMA 3ILFA 2YA5A 3FUOA 4RL7A 2ZGQA 4YZ5A 3K37A 5IK8A 3OBTA 2F28A 2CTVA 4XE9A 2DVFA 4YZ1A 3INBA 3N35A 1ZM1A 4HL0A 2HT8A 2WT0A 2XZIA 1A4GA 2GNTA 5DZGA 2YZ4A 1LOFC 5GJ6A 1LGNA 1V6KA 4R9BA 3AP9A 5HX0A 4BQ1A 1NMAN 1V6NA 2QWAA 2RHPA 2HTQA 1C1LA 1L7GA 1S0EA 1USXA 2YV8A 3B9CA 3MEPA 3WCSA 2R1DA 3FFZA 2EIGA 2ZMNA 3M3OA 2DWRA 2ARXA 4MZAA 5GZDA 1Q8PA 2GMMA 1BQPA 3TI3A 4YW4A 1S0BA 1Z0HA 3HR9A 4Q26A 4BLJA 1ONAA 4GALA 2P34A 2QWIA 3OJBA 1NCCN 2NN8A 1W6NB 2VWDA 4NC5A 3ZVXA 2V5YA 4GZPA 4DQAA 1S1AA 1MS9A 4I00A 2AUYA 1IVGA 3WVJA 1INHA 4Y20A 3K36A 3B00A 2ZHKA 2D44A 2ZGRA 2F25A 3FLPA 4C1WA 4AVTA 4GWMA 4I30A 2F10A 1MWEA 2HYKA 2AREA 1DFQA 1DYKA 3ZXKA 1X50A 4HZYA 1NCAN 1IS5A 2P3IA 4FPFA 1A78A 5DG2A 2V73A 1HLCA 3OPZA 5HUMA 2DURA 1OKQA 1QNWA 3R05A 4GWNA 4GZXA 3V64A 1L7FA 4QN5A 4XJ8A 4MWRA 4AVSA 1SCSA 4FOVA 3M3EA 4KS2A 1CVNA 1JHNA 2CY6A 4HIZA 2BERA 2D6NA 5IK5A 3O0WA 1AJOA 3NV1A 3KM5A 3AZXA 1QOOA 4PQ9A 2NM1A 1LOGA 3FLTA 2QWGA 4HZZA 2ZABA 5GLWA 5IK4A 2HU0A 4LBOA 3V0AB 2YA6A 2DTYA 7NN9A 1C57A 4FPKA 1BYHA 1G8WA 1W6NA 3RRDA 3PVOA 1W1XA 1CPMA 4B7NA 4WA3A 2KM2A 1D0HA 2AEPA 3WG3A 4F83A 4KS5A 2ZGKA 3T2TA 3FLRA 3H73A 2HTWA 3POYA 3ZXEA 1NSCA 2VSKA 2F24A 4XBLA 1DQ0A 1GLHA 4CRQA 1SNTA 2JECA 2A6XA 3WDYA 4MWLA 2VW2A 2GNDA 4XDQA 1YRZA 2BATA 1GV9A 1QGLA 5AVAA 1CR7A 3UJQA 1W8NA 4GDIA 1F9KA 3OYWA 4XXPA 4YW5A 2ZHNA 5H9SA 4BPZA 1NN2A 1V0FA 3LSEA 3K3AA 1UAIA 5DUWA 1O4ZA 1AVBA 2B7YA 3A0NA 1WCQA 5JYYA 4TZDA 1WUVA 1DGLA 5CA6A 1Z4VA 1JN2P 2A6ZA 2JD4A 1I1EA 1XOGA 2FHRA 2GNMA 3ZSKA 2ZHMA 1Z78A 2CYFA 4PCRA 1V0ZA 3N7MA 3O9KA 1H30A 3OY8B 1FNYA 6NN9A 1SO7A 2DU0A 1DQ1A 3RQ0A 4FPCA 4YM2A 2X9MA 1MS8A 1BJQA 3AJYA 5B2DA 4U36A 4PF5A 2ZB5A 1UKGA 5F9TA 4K1KA 3O12A 2VY0A 2D6LX 4FOQA 1IVBA 1IVEA 1LOCA 3FBYA 4JRAA 4XMIA 3ZYRA 4YG3A 3WOGA 2A7AA 3RG0A 5CAZA 1GSLA 4FPOB 2A70A 1O4YA 3AXDA 2ZGLA 4Y22A 4WVWA 1ULCA 3ALXA 4FPHA 5DZFA 3O9JA 3GNEA 1N1SA 5H9RA 1LGBA 1UL9A 4NN9A 4FQZA 4YFWA 4FOYA 5BYNA 1LEMA 2QWCA 1YI7A 1LHWA 3RSJA 1W6OB 1EPWA 5JDBA 1N1VA 2HTVA 1HKDA 3AP5A 1F8DA 2OW4A 3TB0A 2ERFA 1EUTA 1INGA 1VLNA 2DVBA 4AYUA 1IVFA 1RIRA 1MS1A 3IPVB 5EWSA 5H9QA 3ZXLA 5CBLA 3SISA 5IK7A 1A4QA 5LK5A 1AXYA 1GKBA 3AP4A 1INFA 1XQNA 4MWYA 4Q27A 5NN9A 3ATGA 2SBAA 1LESA 1PZ7A 4UW3A 2D3PA 1LOFA 3KQRA 1EUUA 1QOTA 2VSMA 5E89A 3SH3A 2VW0A 1MS0A 2EXKA 1WW6A 1YIFA 2R1BA 2YA4A 4KS1A 2VK7A 4PBOA 4Q1PA 2W38A 3N7LA 2JDZA 1KQRA 1LHNA 1Z4ZA 1NSBA 4LBNA 3JU9A 5HCFA 2QWJA 1KRIA 1AX2A 1GZ9A 2D6PA 4M3CF 2QWDA 4XBNA 4YW2A 3WG2A 3WG4A 4YGBA 4KBBA 4XTMA 3JU4A 3WHTA 1SLBA 1QOSA 3D5OA 2A5ZA 1FAYA 2GN7A 1IS6A 1LU1A 3AYCA 3D6EA 2C4AA 4GB1A 1ULFA 1MVQA 2CWSA 3N7JA 4GZOA 1CPNA 4X6KA 1WD4A 4XOGA 4MWUA 4MWQA 3MW4A 2YA7A 4DRVA 4MX0A 1MR5A 4YM0A 3B7EA 3U4XA 1AXZA 3M3CA 4ZKTB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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