1SLLA

Sialidase l from leech macrobdella decora
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal structure of an intramolecular trans-sialidase with a NeuAc alpha2-->3Gal specificity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
molecule keywords SIALIDASE L
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1997-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 1sllA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1sllA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1sllA02
4BBWA 4X4AA 1ULDA 1LHWA 1IS3A 4AVSA 1I3HA 1EPWA 2CWSA 2YROA 2JKBA 1LHOA 2WKKA 1NLSA 1GKBA 5H9RA 4BPZA 1MVEA 2D3SA 4YG0A 1F8DA 4K1HA 4WV8A 4FP2A 2D3RA 1GSLA 3D4KA 1QGLA 1HQWA 4K3YA 2ZHNA 4FQ4A 1INXA 1GNHA 4J9TA 1WW4A 1LOCA 5M1ZA 4XHXA 1F9KA 4NOTA 1RIRA 4LBQB 1WD4A 1EUSA 4YG3A 4P14A 5FREA 1AJOA 2ZMNA 1Q8VA 4CPYA 2NN8A 5HUGA 2B7YA 2AREA 1O4ZA 1NSBA 3FBYA 4LBQA 4XXPA 2QWIA 2F13A 3LSDA 1AXZA 4YZ5A 2A3XA 2HTWA 4Y24A 1AXKA 4NC5A 1TEIA 1UKGA 4MJUA 2OUJA 1WD3A 4GZQA 4GWMA 4Y1ZA 2ZA9A 3K36A 1S0GA 2G4IA 4ISQA 4YGCA 3V65A 1R1ZA 1KJLA 4LBMA 4AWDA 2HT7A 4BMBA 3M3EA 1S0FA 1W6NB 1V6MA 1INGA 1SACA 2R0FA 4HZYA 1V0ZA 2DUPA 2ZMLA 1W6NA 3O5SA 3H73A 1LOAA 2QWKA 3TI6A 1GLHA 3W58A 3R4UA 1DQ0A 1V6KA 4WEGA 2HTQA 1VAMA 3WG4A 2CL2A 2ZGKA 2XZJA 2WJSA 2DTWA 5H9QA 4DFSA 1B9VA 4MWYA 4P9YA 3TI8A 3CNAA 4DGRA 4GB1A 1DQ1A 4YW1A 2WNEA 4M3MA 3AP9A 4NN9A 2F11A 2ZB5A 2VK7A 2GALA 1KRIA 3AJZA 1GZ9A 5HUNA 1NCAN 1N1TA 1EUTA 4FP3A 3AZXA 5IUQA 3WDYA 1W6QB 4HIZA 1WW6A 5T5JA 4XJUA 4XJ8A 2AYHA 4AVVA 5CAZA 1NMCA 1IVFA 1W6QA 2E7TA 1V3CA 2OVUA 5IK4A 6NN9A 3UL2A 4U36A 4XILA 1N1VA 5GLWA 1KJRA 2A6WA 3WNXA 1A8DA 2PELA 1WBLA 1JHNA 2ZGMA 4MWJA 4FPGA 1UZYA 5GZGA 3OBRA 2R1DA 1ENRA 4XYXA 3A71A 2ZHKA 1XOEA 1ZM1A 1F31A 2W5NA 1JXNA 2D6MA 2HTRA 2DVFA 5JMCA 2JDZA 4JC1A 1IOAA 1XQNA 4XBQA 3CL0A 3TB0A 1NMAN 1XOGA 4YM0A 1CONA 5CA6A 4XBLA 1BJIA 1ENSA 4XE9A 3VKMA 2DU0A 4Y20B 2V73A 3IMNA 4B7QA 1I1EA 1MR5A 3VKOA 3TI3A 5DZFA 2RHPA 2ERFA 2W5OA 4HANA 5T55A 4ATEA 3M1HA 2A6VA 4Y20A 4B7JA 2EXIA 4CZSA 4U2AA 2HU4A 2WLQA 5KXDA 4KS1A 4XJAA 3OPZA 1DIMA 3UK9A 4WA4A 1DGLA 2F10A 5T50A 3KQRA 1O4YA 2ZB6A 2E51A 1E8TA 2XB6C 2FMDA 4GJTA 3Q9OA 1IVCA 4DRRA 3ATGA 1UN1A 1G9CA 2HYKA 1W21A 2SLIA 5HUMA 1S0EA 1QKQA 3A0NA 3IN9A 1LESA 3TAYA 1QNWA 3N7JA 4ASMB 4AGGA 4PF5A 5GLVA 2ZACA 2P34A 4L8QA 4I30A 1D2SA 4GZXA 2P37A 1CPMA 2QWFA 5EWSA 1AZDA 2YXSA 1MS9A 3O0WA 3H72A 2ENRA 1APNA 4JCKA 5KXEA 1AX1A 1OQ1A 2YZ4A 2CTVA 3RMXA 3RG0A 4BLIA 2D7FA 4BM8A 1V2IA 1DQ5A 2A75A 1HDKA 2GDFA 4FOQA 1A4GA 3POSA 1G86A 1V0EA 1LGBA 4M4VA 5NN9A 5HCFA 1WW7A 4H53A 3VV1A 3GVKA 3INBA 4FQZA 1FNZA 4X6KA 3W59A 1OKQA 2D6NA 2F0ZA 2VK5A 1Y7BA 4GXLA 1H9WA 1NSCA 5JOWA 3USUB 3B00A 3NSSA 4Q6KA 1INYA 5BYNA 4MWWA 1NCDN 3WG2A 1YYNA 4M4UA 1Z78A 4CPLA 3M2MA 4AGVA 2AEPA 3TI4A 2DU1A 5GLUA 1V3BA 4KS2A 2ZGLA 4M3CF 3USUA 3AX4A 1J1TA 3INAA 2DV9A 5KXBA 1AF9A 3TICA 4XOGA 3TIAA 2VW0A 2E7QA 4FPKA 2UURA 1A4QA 1GICA 7NN9A 1SBFA 4GALA 5T5LA 2UU8A 1LOFA 1DZQA 1MWEA 1HQLA 1FV2A 2SILA 2ZMKA 4FPHA 3N7KA 5E88A 1C1FA 3GALA 1INFA 4MWRA 1VIWB 1G9AA 3MEPA 2ZGTA 5DUUA 1IKQA 2D6PA 3ILFA 2HT8A 2W39A 3WDTA 4JRAA 4CPMA 5AVAA 4YLZA 4PBOA 1B09A 1EURA 2VH9A 2ZHLA 1CVNA 2VUAA 3SALA 1JUIA 2PHWA 1MS0A 4HZZA 1KDKA 4XIKA 5EXOA 2GN3A 1G9FA 2ZZJA 4TYSA 4XHBA 1IS4A 3V64A 3K38A 2DUQA 4YGEA 4Y1XA 4FPYA 2VXRA 2F12A 3WUDA 3NV3A 3SILA 4GKYA 5L73A 2QWDA 2AENA 1QOOA 2V5YA 3CKZA 4Y26A 1NNAA 1IS5A 2BERA 3N3HA 2VK6A 3PVNA 5JOXA 1FV3A 4NCSA 1HKDA 1DILA 4I00A 3O12A 1WUVA 3MW4A 5DZEA 3N7MA 3AXDA 3TI5A 1Q8OA 2NMOA 2ZGSA 2WT0A 4FJ6A 4WVWA 3OY8B 1USRA 2XCYA 1BKZA 4GDIA 2NYYA 4Y1VA 3OY8A 2WT2A 1V0FA 2C9AA 5HCAA 1N1SA 2DWRA 2ES3A 3WCSA 3CYEA 3AK0A 1X50A 3A0KA 1ULEA 5GZDA 1MS8A 4LBNA 1ZA4A 3I4IA 3WOGA 4XTPA 4YZ3A 3AYEA 4UF7A 3IKWA 4F83A 2PHUA 4XXAA 4BQ1A 2AUYA 1MZ5A 4MWUA 4YM2A 3O0VA 1NSDA 1Q8PA 2GNBA 1Z4YA 3AP6A 1QDCA 1CPNA 3PVOA 4FOVA 1YXWA 1JYCA 4K1IA 2F26A 3A4UA 2W38A 5GLTA 1QDOA 4Z8BA 4K1YA 2C4AA 2UWCA 1LHVA 1LEMA 3WDXA 4MJVA 2VW1A 1N47A 4KS4A 1S0JA 2UWAA 3SH3A 5GZFA 3ZXEA 3AP4A 4CPNA 5H9SA 1LODA 3HN1A 4YW3A 3D11A 4MZEA 3ZSJA 1SCRA 1QNYA 5F9TA 4M3CE 5T52A 3AZWA 3AYAA 2NMNA 2XZIA 1AJKA 1WLCA 2RKCA 5GM0A 2SBAA 5T54A 4M01A 2ZGRA 1Z4XA 2W08A 4CRQA 3B69A 5GZEA 1NNBA 4YG6A 2P3JA 1GNZA 3JUUA 1YIFA 3ZXKA 4XZPA 2F25A 5DXDA 1PZ8A 4YW5A 1LGNA 4QN5A 3MW2A 2XG3A 3SITA 5IK5A 4LBJA 5JYYA 1E8VA 3QCWA 4FPOB 1IVBA 3BEQA 3SLIA 4K1KA 2VVZA 3RSJA 4R9BA 1S0BA 3WVJA 1LULA 4KBBA 3AZVA 4ZKTB 3ASIA 4R9CA 1L7FA 5DUVA 4FPCA 3AYCA 3WLUA 5DUXA 1DLLA 3WHTA 2QWCA 4X49A 1JW6A 1DYPA 1BJQA 5E89A 2WQZC 2ARBA 4GKXA 2WSVA 5IT6A 1W6OB 1INVA 2DVGA 3FLPA 3ENRA 4QN6A 2YA8A 2HTYA 1G7YA 2R0HA 3OGGA 1LOFC 3M3CA 4LBLA 4R9AA 3IPVB 1W6OA 2WT1A 2EF6A 2W20A 2NP0A 2YDPA 1UAIA 3IPVA 2ZHMA 1FYUA 4XMAA 2EALA 2QWGA 4GA9A 1SLAA 3VKLA 3ILRA 3GVLA 3NV2A 3L2YA 3RMYA 4Q26A 3O9JA 1F5FA 3B3QE 3ZSLA 1G8WA 4B7RA 1V6JA 2WSUA 1C57A 2DYCA 2GNDA 3ZVXA 3BODA 3I8TA 3K3AA 2E6VA 3D5OA 1GYKA 1GZCA 1DIWA 5EYYA 3T1LA 1LU2A 3T1EA 2F29A 2VSMA 2GMMA 1VALA 4FOWA 1V6IA 1V6LA 1JN2P 4XJRA 2P3KA 3GVJA 1LECA 1N1YA 3DUIA 3M3OA 2ARXA 2NM1A 2XZKA 4FPFA 4C1XA 2GNMA 3AJYA 2ZGNA 2VU9A 2A3WA 3B7EA 4MC7A 1WW5A 4K1JA 1LTEA 4K1ZA 4C1WA 3PMEA 3RQ0A 4XTMA 1GANA 2BQPA 5GJ6A 4FPLA 5DG2A 4RL7A 4YGBA 3B9CA 1SFYA 2DUOA 3V0AB 3SH5A 2F28A 1A14N 2R1BA 3A72A 2YA5A 1NMBN 3SH4A 2AEQA 1A3KA 4UW6A 2ZBJA 3ILNA 1W8OA 2ZGOA 2YY1A 2YV8A 4B7MA 3H71A 4YGDA 4XJQA 1HLCA 1FX5A 1C4RA 2DVDA 1DQ4A 4MZAA 3WG1A 3WDVA 3WG3A 3FLTA 3SANA 1YO8A 5JOZA 4MWXA 5CB7A 1FAYA 1CESA 2A6ZA 1UPSA 3HR9A 1WCQA 1NNCA 2QWJA 3WHUA 5JOYA 2GMEA 3H0OA 1Q8QA 5LK5A 5DG1A 1YRZA 1PZ7A 2ZABA 1L7GA 1W8NA 2A70A 4KS3A 3WZ1A 1B9SA 2JECA 1W0PA 2KM2A 4D69A 1NCCN 1ULFA 2CYFA 1DHKB 2D43A 4WA5A 1LHNA 3ALWA 1QOSA 4QN3A 1KQRA 1RINA 3DGTA 1N3PA 2CMLA 2E53A 5B2DA 5B2CA 2EXJA 4XJ9A 4M00A 3K39A 4Q8LA 5E8AA 4LBQD 2JJ6A 4M3CB 1QMJA 1SO7A 4P9WA 1W6PB 4Y1UA 4UW4A 1V6OA 1VLNA 4M3CA 1ENQA 2TEPA 4YM3A 1W6MB 4Q8KA 4PCRA 4IQPA 4GWNA 3ZXFA 2A3YA 3POWA 4BLJA 1MS1A 1LJ7A 2YMZA 1W6MA 2VSKA 4LBOA 1D0HA 2P3IA 3MW3A 1EUUA 1H9PA 3AFKA 3H6JA 2QWBA 3D12A 5HUKA 1AX2A 3WDWA 4GZSA 3W09A 3WDUA 5FRAA 5EYXA 4HZVA 2AH2A 2A6YA 1UL9A 1BYHA 1Z0HA 4WA3A 1IS6A 2W68A 3PJQA 4UW5A 2ZGQA 4YW2A 2GMPA 4HZWA 4XJZA 4H55A 4QN7A 3RRDA 1AX0A 1B9TA 5CBLA 1LENA 1V00A 1BXHA 4ZXKA 1MS5A 5SV8A 2R49A 3PVEA 4YFZA 4GDJA 3B01A 5GALA 4DRVA 1SLIA 4Y22B 1INWA 1GZWB 2DVAA 3ZXLA 1N3QA 4DS0A 4Y22A 4Q2FA 1GZWA 2D6KA 2A7AA 2D3PA 3C2UA 2EIGA 2BZDA 4Q1PA 2A71A 5H9PA 3D6EA 2YA7A 1ULGA 1FATA 4XIOA 1GV9A 2D44A 3K37A 3FUQA 1QF3A 1UMZA 3POYA 2PHTA 1Q56A 1C1LA 4X47A 4GZPA 1UZZA 4MX0A 1LOEA 2CY6A 1LOGA 4MYEA 3MPPG 2VWDA 5GZCA 3VKFC 1LU1A 4GEZA 2X9MA 1WLWA 1W1XA 3JU4A 4YW4A 2Q5TA 5JLVA 4FOYA 3JU9A 1IVGA 3UJOA 4KS5A 4OZXA 2DTYA 3NV1A 2F24A 5GLZA 4WZFA 3ZPYA 2YDTA 3AYDA 1V6NA 4K21A 2DVBA 3SNMA 4YM1A 2YA4A 1SCSA 2ZGPA 1MS4A 1S1AA 2F27A 2Z42A 4DPNA 1W0OA 2HT5A 1QU0A 1AXYA 4UW3A 4QN4A 4R9DA 4AYUA 4FPJA 3WUCA 2QWHA 1IKPA 4GZWA 1Q8SA 1JBCA 2I2SA 3RS6A 1URXA 2H0BA 1BZWA 3O9KA 1PZ9A 4WEFA 1SLLA 3NN9A 4PQ9A 4P9XA 4YZ4A 2A5ZA 2CNAA 2ZKNA 4MWLA 1NXD1 3BIWE 2YA6A 2ZGUA 5HCBA 3AP7A 3O0XA 1MACA 3N35A 2ZAAA 3HMYA 3V0BB 3AZZA 5DUWA 4Y1YA 3APBA 1WLDA 1A78A 1DQ2A 3ZSKA 3AZYA 2D6OX 3V0BA 2GNTA 5KXCA 4HZXA 1Z4ZA 1ULCA 2D6LX 1DBNA 4ATFA 1LHUA 3M3QA 4XMIA 3FUOA 2FHRA 1SBDA 1RITA 1MZ6A 1SBEA 4CTEA 5JVVA 1L7HA 2PHRA 3T2TA 3T1MA 4Q27A 5IK8A 1QOTA 4BMEA 1IVDA 3ZYRA 3FLRA 4MWVA 3OYWB 3WV6A 1DQ6A 1G9BA 2EAKA 4BOWA 1Z4VA 4GZTA 4LBKA 1V3DA 2R16A 4WVVA 3OYWA 3FFZA 1WBFA 4TZDA 1U0AA 2BATA 4FZHA 4HL0A 1V3EA 1S0DA 1SLCA 1MVQA 3N36A 4M4NA 3N7LA 1G9DA 3AXEA 1USXA 3BTAA 2CWMA 3LCPA 3NV4A 5HX0A 4K20A 1NN2A 1SNTA 4XDQA 4ISRA 1VCJA 2JE7A 3QLQA 2QWAA 4NO4A 3OJBA 5IK7A 2C4LA 3VKNA 4RA0A 3AP5A 1SLTA 3R05A 2C5DA 2EXHA 1VAVA 1LGCA 5DZGA 1F8CA 4AGRA 1LEDA 3V0AA 3ZYPA 3ALXA 2UWBA 3IM0A 3VUOA 1BQPA 4W65A 2HTVA 2NZ9A 2BF6A 1KDMA 1SLBA 4D8SA 1S0IA 3BOPA 1OFSA 1CJPA 4B7NA 2QWEA 4JF7A 4PBPA 1N3OA 1JOJA 1LOBA 2VY0A 2HTUA 4YFWA 5F5QA 2VW2A 5JDBA 3SISA 2HU0A 1CR7A 2B8HA 4MWQA 4AVTA 1NCBN 4XBNA 2AR6A 2LALA 4CPOA 2LTNA 2SIMA 1JYIA 5CNAA 4Q1RA 2OW4A 1Z50A 5T5PA 4H52A 1AVBA 1Z4WA 1GBGA 1VCUA 4FVVA 2W52A 2GN7A 1DYKA 1WCSA 4XJWA 2PHXA 1CIWA 2A6XA 1IVEA 5T5OA 1S0CA 1MS3A 3GNEA 1E8UA 3NWKA 2JE9A 3LSEA 4SLIA 2P2KA 4GZOA 4DQAA 1DFQA 3TIBA 4CPZA 1F8BA 3OBTA 1CQ9A 1CN1A 3WCRA 1LCLA 3ZXJA 2JD4A 2OUHA 4QNPA 4ITCA 4FVKA 1YI7A 3UJQA 3R4SA 3U4XA 1W20A 2PHFA 4FPEA 1FNYA 1W6PA 1H30A 2DURA 1KITA 4YZ2A 2AGSA 1INHA 4YZ1A 3KM5A 3CL2A 1ONAA 1UX6A 2EXKA 3ZSMA 1F8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3URFA 4BBWA 4X4AA 3QACA 4EYUA 1ULDA 1LHWA 4FTBA 4W6YA 5J09A 1AR83 1IG0A 1IS3A 2C6SA 3LWCA 2AZ5A 3ABZA 4LLFA 2VTXA 2JXAA 4P5HA 4AVSA 3ECQA 2VQ0A 3FL7A 5IFPA 1I3HA 4LKEA 1EPWA 2BOIA 3OB8A 2CWSA 2YROA 2JKBA 1LHOA 3FHQA 5BNNC 4LO5B 4NE9A 2WKKA 1BK0A 1NLSA 1TG7A 1GKBA 5H9RA 4BPZA 1OSGA 5F7UA 5M0TA 1PX3A 1MVEA 3AVRA 4Q4W3 1PIV2 2D3SA 3O14A 3IZOA 5FZFA 4YG0A 5K9YA 4ZHNA 3O1UA 2XJUA 1OPMA 1YJKA 1UY2A 3VL9A 3RZHA 1VBC3 1JYTA 1F8DA 3ZKYA 1YEWA 4K1HA 1UIKA 1HB4A 4WV8A 4JKLA 1OD3A 4FP2A 1UY0A 3JB4C 2D3RA 1GSLA 4JHZA 4PT6A 3UKTA 2VGDA 3U78A 4XUPA 4A4AA 1E5IA 5A7WB 3VLBB 2GH2A 4COUA 4QGMA 3H8RA 3D4KA 5LCWL 2F10A 1QGLA 2H6CA 4JGZB 1HQWA 1RUJ1 5DPNA 1TNFA 4K3YA 4AEJA 1ZI0A 4NPRA 2ZHNA 2Z5WA 3IDEA 3L6VA 3ZXGA 3WN7A 4FQ4A 4GNAA 4QPWA 1INXA 4H7MA 4KI5M 1GNHA 4HW6A 3A7QA 1WW4A 3I3EA 3ZFGC 4J9TA 2AC1A 1LOCA 2OS2A 5A7WA 5M1ZA 4AZZA 1O3SA 5EO8A 2P4EA 4XHXA 4JGZA 2HEWF 5FMOS 2WFF1 1NSBA 5FZ0A 2BEOA 1F9KA 2X53S 4ORFA 4OI0A 1PVC2 3NO8A 1XE7A 4NOTA 1GZTA 1BBT1 1AYN2 1V0AA 1RIRA 2X10A 2FPBA 4LBQB 1WD4A 1EUSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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